Particularités de la cardiomyopathie du péripartum en Afrique: le cas du Togo sur une étude prospective de 41 cas au Centre Hospitalier et Universitaire Sylvanus Olympio de Lomé

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Pio, Machihude; Afassinou, Yaovi; Baragou, Soodougoua; Akue, Edem Goeh; Péssinaba, Souleymane; Atta, Borgatia; Ehlan, Koffi; Alate, Amouzou; Damorou, Findibe

2014-01-01

Introduction La cardiomyopathie du péripartum (CMPP) est une défaillance cardiaque dont l’étiologie demeure encore méconnue. Méthodes Il s'agit d'une étude prospective descriptive réalisée dans le service de cardiologie du CHU Sylvanus olympio de Lomé du 1er janvier 2010 au 30 avril 2012. Elle a concerné 41 patientes ayant présenté une insuffisance cardiaque entre le 8eme mois de la grossesse et les 5 premiers mois du post-partum. Résultats L’âge moyen des patientes était de 31,47 ans (extrêmes 21 et 44ans). L'incidence de la CMPP était de 1/362 grossesses. La parité moyenne était de 3,07 (extrêmes 1 et 6). Les symptômes étaient apparus dans le post-partum dans 90,24% des cas. Un retard important de diagnostic était observé. L'insuffisance cardiaque globale était le mode de décompensation dans 65,85%. Les signes électrocardiographiques étaient essentiellement la tachycardie sinusale (97,56%) et l'hypertrophie ventriculaire gauche (97,56%). L’échographie cardiaque a montré dans tous les cas une cardiomyopathie dilatée. Quatre cas de thrombus intraventriculaire gauche étaient notés. La FEVG était sévèrement altérée. L'HTAP était importante dans 56,09%. Conclusion La cardiomyopathie du péripartum est une complication cardiaque grave de la grossesse de cause inconnue, fréquente dans la population africaine. PMID:25309645

Causes de décès des patients infectés par le VIH dans le Centre tunisien

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Chelli, Jihène; Bellazreg, Foued; Aouem, Abir; Hattab, Zouhour; Mesmia, Hèla; Lasfar, Nadia Ben; Hachfi, Wissem; Masmoudi, Tasnim; Chakroun, Mohamed; Letaief, Amel

2016-01-01

La trithérapie antirétrovirale a contribué à une baisse considérable de la mortalité liée au VIH. Les causes de décès sont dominées par les infections opportunistes dans les pays en voie de développement et par les maladies cardiovasculaires et les cancers dans les pays développés. L’objectif était de déterminer les causes et les facteurs de risque de décès des patients infectés par le VIH dans le Centre Tunisien. Une étude transversale auprès des patients infectés par le VIH âgés de plus de 15 ans suivis à Sousse et à Monastir entre 2000 et 2014. Le décès était considéré lié au VIH si la cause était un évènement classant SIDA ou s’il était la conséquence d’une infection opportuniste d’étiologie indéterminée avec des CD4 < 50/mm3, non lié au VIH si la cause n’était pas un évènement classant SIDA, et de cause inconnue si aucune information n’était disponible. Deux cents treize patients, 130 hommes (61%) et 83 femmes (39%), d’âge moyen 40±11 ans ont été inclus. Cinquante quatre patients sont décédés, avec une mortalité de 5,4/100 patients-années. La mortalité annuelle a baissé de 5,8% en 2000-2003 à 2,3% en 2012-2014. La survie était de 72% à 5 ans et de 67% à 10 ans. Les décès étaient liés au VIH dans 70,4% des cas. Les causes de décès les plus fréquentes étaient la pneumocystose pulmonaire et la cryptococcose neuroméningée dans 6 cas (11%) chacune. Les facteurs de risque de décès étaient les antécédents d’infections opportunistes, la durée de la trithérapie antirétrovirale < 12 mois et le tabagisme. Le renforcement du dépistage, l’initiation précoce de la trithérapie antirétrovirale, et la lutte contre le tabagisme sont nécessaires afin de réduire la mortalité chez les patients infectés par le VIH en Tunisie. PMID:28292068

Tumeurs Stromales Gastro-Intestinales «GIST»: état des lieux et actualités à travers notre expérience portant sur 54 cas et une Revue de littérature

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Taoufiq, Nezha; Naim, Asmaa; Bouchbika, Zineb; Benchekroune, Nadia; Jouhadi, Hassan; Sahraoui, Souha; Benider, Abdelatif

2017-01-01

Les Tumeurs Stromales Gastro-intestinales « GIST » sont une forme très rare de cancers du tube digestif appartenant à la famille des sarcomes. Le but de ce travail est d'établir le profil épidémiologique et évolutif ainsi que les difficultés diagnostique et thérapeutique de cette pathologie maligne prise en charge dans un pays en développement. Une Etude rétrospective étalée sur 8 ans de Janvier 2002 à Mars 2010, a été mené au Service de Radiothérapie et d'Oncologie du CHU de Casablanca (Maroc) ayant colligée 54 cas de tumeurs stromales gastro-intestinales. L'âge moyen de nos patients était de 55 ans. Le délai moyen d'évolution était de 11 mois (0-72 mois). La biopsie a permis de confirmer le diagnostic dans 14 cas et la chirurgie dans 40 cas. La principale forme histologique était fusiforme (92,6%). Les GIST dans notre série avaient une taille tumorale moyenne de 12,5 cm avec un C-Kit positif dans 52 cas. Le risque évolutif a pu être établi dans 47 cas dont 39 avaient un risque élevé. La chirurgie était le principal traitement des patients de notre sérieAprès un recul moyen de 31 mois, la moitié des patients évaluables de notre série (n=19) est en rémission complète maintenue, le tiers (n=13) est décédé alors que le quart (n=8) présente une récidive locale et /ou métastatique. Quoique les recommandations soient éditées pour la prise en charge de ces tumeurs, ces dernières soulèvent encore de nombreux problèmes aussi bien diagnostiques que thérapeutiques dans notre contexte. PMID:28904693

Textilome abdominal, à propos d'un cas

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Erguibi, Driss; Hassan, Robleh; Ajbal, Mohamed; Kadiri, Bouchaib

2015-01-01

Le textilome, également appelé gossybipomas, est une complication postopératoire très rare. Il peut s'agir d'un corps étranger composé de compresse(s) ou champ(s) chirurgicaux oubliés au niveau d'un foyer opératoire. Ils sont plus souvent asymptomatiques, et difficile à diagnostiquer. En particulier, les cas chroniques ne présentent pas de signes cliniques et radiologiques spécifiques pour le diagnostic différentiel. L'anamnèse est donc indispensable pour le diagnostic vu que les signes cliniques ne sont pas concluants. Le cliché d'abdomen sans préparation est peu contributif, l’échographie est fiable. La tomodensitométrie permet un diagnostic topographique précis, mais ce n'est pas toujours le cas. Certaines équipes proposent des explorations par IRM. Nous rapportons un cas de textilome intra abdominal, chez une patiente de 31 ans opérée il y a 8 ans pour grossesse extra-utérine, chez qui la TDM abdomino-pelvienne a évoqué un kyste hydatique péritonéale sans localisation du foie. Traitée par extrait d'un petit champ de 25x15cm et adhérant au sigmoïde. Le but de ce travail est de mettre en évidence le problème de diagnostic de cette pathologie et l'importance de la laparotomie exploratrice. PMID:26523184

Anoplastie périnéale simple pour le traitement des malformations anorectales basses chez l'adulte, à propos de deux cas

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Echchaoui, Abdelmoughit; Benyachou, Malika; Hafidi, Jawad; Fathi, Nahed; Mohammadine, Elhamid; ELmazouz, Samir; Gharib, Nour-eddine; Abbassi, Abdellah

2014-01-01

Les malformations anorectales chez l'adulte sont des anomalies congénitales rares du tube digestif qui prédominent chez le sexe féminin. Notre étude porte sur deux observations de malformation anorectale basses vues et traitées au stade adulte par les 2 équipes (plasticiens et viscéralistes) à l'Hôpital Avicenne à Rabat. Il s'agit d'un homme de 24 ans avec une dyschésie anale l'autre cas est une femme de 18 ans avec une malformation anovulvaire Les caractéristiques cliniques combinées avec les imageries radiologiques (lavement baryté, et la manométrie anorectale) ont confirmé qu'il s'agit d'une malfomation anorectale basse. Les deux cas sont corrigés par une reconstruction sphinctérienne, réimplantation anale avec anoplastie périnéale. Les suites opératoires étaient simples, pas de souffrance cutanée ou nécrose, avec changement de pansement gras chaque jour. Le résultat fonctionnel (la continence) était favorable pour les 2 patients. La présentation des MAR à l’âge adulte est rare, d’étiologie mal connu, elles apparaissent selon le mode sporadique. Les caractéristiques cliniques, couplées à l'imagerie (lavement baryté, IRM pelvienne), l'endoscopie et la manométrie anorectale, permettent de confirmer le diagnostic et classer ces anomalies en 3 types: basses, intermédiaires, et hautes. Les formes basses sont traités d'emblée par une réimplantation anale et anoplastie périnéale simple tels nos deux cas, elles peuvent être traités dans certains cas par un abaissement anorectale associé à une plastie V-Y permettant ainsi un emplacement anatomique correct de l'anus; alors que les formes hautes ou intermédiaires relèvent d'une chirurgie complexe avec souvent une dérivation digestive transitoire. Contrairement aux autres formes, Les formes basses ont un pronostic fonctionnel favorable. PMID:25667689

Les ruptures traumatiques du tendon quadricipital: à propos de 3 cas

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Benyass, Youssef; Chafry, Bouchaib; Koufagued, Kaldadak; Bouabid, Salim; Chagar, Belkacem

2015-01-01

Les ruptures traumatiques du tendon quadricipital sont rares, elles surviennent préférentiellement après 40 ans, suite à un traumatisme indirect chez le sportif (flexion contrariée du genou) ou traumatisme banal chez le sédentaire. La tendinopathie préexistante est fréquente. La rupture est le plus souvent totale et siège au corps du tendon 60% des cas ou décallotement quadricipital au bord supérieur de la rotule (40% des cas). Le diagnostic est essentiellement clinique. Les examens complémentaires (échographie et imagerie par résonance magnétique) sont utiles et appuient le diagnostique, mais sont souvent faussement rassurants hormis la radiographie qui montre une rotule basse. Le traitement essentiellement chirurgical associé à la rééducation fonctionnelle donne des résultats largement meilleurs. Le délai d'intervention est un facteur pronostic très important. Les auteurs rapportent 03cas de rupture de tendon quadricipital. L’âge moyen est de 50ans. Ils ont été traités chirurgicalement et revus régulièrement, avec un recul de 16 mois pour apprécier l’évolution. Les résultats ont été très bons chez 02 cas et bon chez 01 cas. L'amélioration a été très nette selon les critères: marche, douleur et reprise d'activité physique. PMID:26985261

Le cancer différencié de la thyroïde chez l’enfant et l’adolescent: à propos de 22 cas

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Anajar, Said; Tatari, Mohammed; Lakhbal, Adil; Abada, Reda; Rouadi, Sami; Roubal, Mohammed; Mahtar, Mohammed

2017-01-01

L’obectif était de mettre en relief les particularités du cancer de la thyroïde chez l’enfant et l’adolescent, et d’évaluer nos résultats par rapport à la littérature internationale a travers une série de cas la plus représentatif au Maroc: 22 cas. C'est une étude rétrospective descriptive des patients atteints de cancer différencié de la thyroïde, hospitalisés au service d’ORL et de Chirurgie Cervico-faciale de L’hopital 20 Août de Casablanca-Maroc, sur la période qui s’étend de Janvier 1995 à Mars 2015. Nous avons recueilli les données relatives à 22 cas, qui répondaient à nos critères d’inclusion. L’âge moyen de nos patients était de 14 ans, avec une sex-ratio 3,4, la plupart de nos patients ont consulté pour un nodule thyroïdien, associé dans 22,7% des cas à une adénopathie cervicale, et dans 9,1% à des signes de compression. L’ensemble des patients ont bénéficié d’une thyroïdectomie totale, suivie d’un curage ganglionnaire dans 31,82%. Le diagnostic de cancer thyroïdien a reposé sur l’examen anatomopathologique de la pièce opératoire, qui a objectivé un carcinome papillaire dans 95,4% des cas, et un carcinome vésiculaire dans 4,5%. Le traitement par l’iode radioactif 131 a été réalisé dans 100% des cas. Par la suite tous nos patients ont été mis sous hormonothérapie thyroïdienne. Une surveillance étroite et régulière a permis de détecter des métastases ganglionnaires chez 3 patients, et les métastases à distance chez 4 patients. Le cancer différencié de la thyroïde de l’enfant et l’adolescent est une entité rare mais agressive, son traitement se base sur la chirurgie, associée à l’irathérapie donnant un pronostic excellent. PMID:29255541

Traitement des séquelles de brûlures de la main dans les pays à ressources limitées ; notre expérience en république démocratique du Congo

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Kibadi, K.; Moutet, F.

2015-01-01

Summary Les séquelles de brûlures de la main sont encore fréquentes dans les pays à ressources limitées. Trente-deux patients, représentant 38 mains, ont été admis et traités, entre le 1er décembre 2010 et le 1er mai 2014 aux Cliniques Universitaires de Kinshasa en République Démocratique du Congo (RDC). nous avons observé 22 patients (69 %) dans le groupe de jeunes (patients âgés de moins de 18 ans), et 10 patients (31 %) chez les adultes (18 à 59 ans). Aucun patient dans le groupe de seniors (60 ans et plus) n’a été observé. Dans le groupe de jeunes, la tranche d’âge de 1 à 5 ans a été la plus atteinte avec 13 malades (40 %). l’accident à la maison était le plus fréquent (72 %). le mécanisme de la brûlure était le plus souvent thermique par flammes (51 %) ou par liquide chaud (34 %). les rétractions et brides sont les lésions le plus observées (84 %). la rétraction dorsale globale « main en griffe» est observée chez 40 % de patients traités, associée à des cicatrices hypertrophiques et chéloïdiennes dans 84 % de cas. Chez les 32 mains traitées chirurgicalement, des excision-greffes ont été réalisées dans 43,7 %, des lambeaux locaux dans 43,7 % et des lambeaux à distance dans 12,5 % de cas. A la sortie de l’hôpital, 84 % de « bons » résultats ont été observés. le suivi a été de 18 mois. le traitement des séquelles de brûlures de la main est possible dans ces pays, exemple de la rDC. Mais les défis à surmonter dans ces pays sont nombreux : la faible accessibilité aux techniques actuelles de la chirurgie plastique, la prise en charge initiale inadéquate des brûlures, la pauvreté. PMID:26668560

Cancer du sein au Cameroun, profil histo-épidémiologique: à propos de 3044 cas

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Engbang, Jean Paul Ndamba; Essome, Henri; Koh, Valère Mve; Simo, Godefroy; Essam, Jean Daniel Sime; Mouelle, Albert Sone; Essame, Jean Louis Oyono

2015-01-01

Décrire les caractéristiques épidémiologiques et histo-pathologiques des tumeurs malignes du sein au Cameroun. Il s'agissait d'une étude rétrospective descriptive portant sur les tumeurs malignes du sein, colligées, dans les registres des différents laboratoires d'Anatomie Pathologique publiques et privés repartis dans cinq régions (centre, littoral, Ouest, Nord-ouest, Sud-ouest), pendant une période de 10 ans (2004-2013). Les paramètres étudiés étaient la fréquence, l’âge, le sexe, la localisation, le type et le grade histologique, et les récepteurs hormonaux. Un total de 3044 cas de cancers du sein a été recensé, soit une fréquence annuelle de 304,4 cas en moyenne. Le sexe féminin était le plus représenté avec 2971 cas (97,60%) et les hommes avec 73 cas (2,40%), soit un sexe ratio (H/F) de 0,02. L’âge moyen des patients était de 46±15,87 ans, avec des extrêmes de 13 et 95 ans. Selon la localisation, le sein gauche était atteint dans 1244 cas (52%) et le sein droit dans 1115 cas (47%). Au plan histologique, on retrouvait essentiellement des carcinomes avec 96,50% des cas, des sarcomes 1,39%, des lymphomes 1,07% et la maladie de Paget du mamelon, 1,03%. Les tumeurs épithéliales étaient infiltrantes dans 2049 cas (84,46%), avec une prédominance du carcinome canalaire infiltrant (1870 cas) et non infiltrantes dans 377 cas (15,54%). Le grade histo-pronostic de SBR avait révélé une prédominance du grade II dans 66% des cas. Les cancers du sein restent une pathologie fréquente au Cameroun et atteignent principalement la population féminine en âge de procréer. Ils sont caractérisés par la prédominance du carcinome canalaire infiltrant. PMID:26523182

Performance du GeneXpert MTB/RIF® dans le diagnostic de la tuberculose extra-pulmonaire à Dakar: 2010-2015

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Diallo, Awa Ba; Kollo, Abdoulkader Issifi; Camara, Makhtar; Lo, Seynabou; Ossoga, Gedeon Walbang; Mbow, Moustapha; Karam, Farba; Niang, Mame Yacine Fall; Thiam, Aliou; Diawara, Awa Ndiaye; Mboup, Souleymane; Diallo, Aissatou Gaye

2016-01-01

Introduction Le défi des pays en voie de développement est la disponibilité de méthodes de diagnostic rapide et précis pour le management de la tuberculose. Des techniques moléculaires offrent cet avantage et nous avons utilisé le test GeneXpert MTB/RIF dans le diagnostic de la tuberculose extra-pulmonaire pour évaluer sa performance par rapport aux méthodes conventionnelles. Méthodes Entre 2010 et 2015, 544 échantillons cliniques extra-pulmonaires ont été recueillis et traitées par la microscopie, la culture et le GeneXpert. L'étude de la sensibilité aux antituberculeux a été effectué avec le MGIT 960. Le Génotype MTBDRplus a été utilisé pour confirmer les cas de résistance à la rifampicine détectés par le système GX. Résultats La population d'étude de 544 patients incluait 55,15% d'hommes et 44,85% de femmes. L'âge des patients variait entre 1 à 92 avec la majorité dans le groupe d'âge 18-45 ans. La sensibilité et la spécificité globale de la microscopie étaient de 43,86% et 98,36%, et pour le GeneXpert® 94,74% et 97,95% respectivement avec 95% IC. Deux résultats de résistance à la rifampicine discordants ont été trouvées entre le test GeneXpert et la méthode phénotypique. Les résultats du test MTBDRplus ont montré une concordance de 100% avec ceux du MGIT 960 pour les cas discordants de résistance à la rifampicine. Conclusion Cette étude a montré que le test GeneXpert a une plus grande sensibilité pour le diagnostic de routine de la tuberculose extra-pulmonaire et devrait être utilisé à la place de la microscopie. Les cas de résistance à la rifampicine détectés par le GeneXpert doivent être confirmés par d'autres tests moléculaires avant d'initier un traitement. PMID:28292091

La prise en charge du pneumothorax spontané: à propos de 138 cas

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Habibi, Bouchra; Achachi, Leila; Hayoun, Sohaib; Raoufi, Mohammed; Herrak, Laila; Ftouh, Mustapha El

2017-01-01

Le pneumothorax est définit par la présence d’air dans la cavité pleurale. L’objectif de notre étude rétrospective du pneumothorax spontanés au servie de pneumologie à l’hôpital Ibn Sina rabat (2009-2011) est de déterminer le profil épidémiologique, clinique, radiologique, thérapeutique et évolutif. Il s’agit de 138 patients: 128 hommes et 10 femmes (17 à 83 ans), un âge moyen de 44,5 +/- 17,4 ans; sexe ratio 12/8. Le tabagisme est noté chez 81,2%. La symptomatologie clinique est la douleur thoracique (92%), la dyspnée (60%). Et sur la radiographie thoracique: on trouve un PNO (pneumothorax) unilatéral total (110 cas); partiel (10 cas); localisé (6 cas); bilatéral (4 cas); à droite dans 51,4% et à gauche dans 45,7%. On a recensé 70% de pneumothorax spontanés primitifs et 30% de PNO secondaire à (BPCO 44%, et tuberculose pulmonaire 39%). La prise en charge initiale est l’hospitalisation de tous les patients : le drainage thoracique (95%), l’exsufflation à l’aiguille (1%). Le repos et l’O2 (4%). Le retour du poumon à la paroi a été obtenu avant 10 jours chez 63%. L’évolution est favorable chez 89%. Et les complications immédiates: l’emphysème sous cutané (5 cas); une infection (6 cas) et 3 décès (arrêt cardio-respiratoire); les complications à distance sont les récidives dans 11,6%; une 1ère récidive chez 13 cas (drainage thoracique chez 11 cas et oxygénothérapie chez 2 cas) et une 2ème récidive chez 3 cas (recours à la chirurgie). Ce travail montre l’intérêt du drainage thoracique et la surveillance dans la prise en charge du pneumothorax pour éviter les complications et surtout pour éviter les récidives avec un éventuel recours à la chirurgie. PMID:28533875

Quantification des besoins en intrants antipaludiques: contribution à l'actualisation des hypothèses pour la quantification des intrants de prise en charge des cas de paludisme grave en République Démocratique du Congo

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Likwela, Joris Losimba; Otokoye, John Otshudiema

2015-01-01

Les formes graves de paludisme à Plasmodium falciparum sont une cause majeure de décès des enfants de moins de 5 ans en Afrique Sub-saharienne. Un traitement rapide dépend de la disponibilité de médicaments appropriés au niveau des points de prestation de service. La fréquence des ruptures de stock des commodités antipaludiques, en particuliers celles utilisées pour le paludisme grave, avait nécessité une mise à jour des hypothèses de quantification. Les données issues de la collecte de routine du PNLP de 2007 à 2012 ont été comparées à celles rapportés par d'autres pays africains et utilisées pour orienter les discussions au cours d'un atelier organisé par le PNLP et ses partenaires techniques et financiers afin de dégager un consensus national. La proportion des cas de paludisme rapportés comme grave en RDC est resté autour d'une médiane de 7% avec un domaine de variation de 6 à 9%. Hormis la proportion rapportée au Kenya (2%), les pays africains ont rapporté une proportion de cas grave variant entre 5 et 7%. Il apparaît que la proportion de 1% précédemment utilisée pour la quantification en RDC a été sous-estimée dans le contexte de la gestion des cas graves sur terrain. Un consensus s'est dégagé autour de la proportion de 5% étant entendu que des efforts de renforcement des capacités seraient déployés afin d'améliorer le diagnostic au niveau des points de prestation des services. PMID:26213595

Profil anatomopathologique du cancer du sein dans le cap bon tunisien

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Sahraoui, Ghada; Khanchel, Fatma; Chelbi, Emna

2017-01-01

Le cancer du sein est le cancer le plus fréquent de la femme en Tunisie et dans le monde. Dans le Cap Bon tunisien, les particularités anatomopathologiques de ce cancer n'ont pas été précisées auparavant. Leur connaissance est nécessaire pour l'adaptation des systèmes de prévention et de soins dans la région. Le but de notre étude était de déterminer le profil anatomopathologique des carcinomes mammaires dans l'unique laboratoire d'anatomie pathologique publique de la région. Il s'agissait d'une étude descriptive rétrospective des carcinomes mammaires diagnostiqués chez 116 malades dans notre laboratoire sur une période de 5 ans de Juillet 2010 à Juillet 2015. Notre étude a inclus 116 patientes. L'âge moyen était de 51 ans. La taille tumorale histologique moyenne était de 31 mm. Le diagnostic initial était posé sur pièce de tumorectomie dans 83% des cas. Le carcinome infiltrant de type non spécifique était le type histologique le plus fréquent. Le grade SBR III était majoritaire. L'invasion lympho-vasculaire était présente dans 33% des cas. Le curage axillaire était positif dans 72% des cas. Les récepteurs hormonaux étaient positifs dans 73% des cas. Les récepteurs de l'Her2-Neu étaient surexprimés dans 19% des cas. Le ki67 était ≥ 14% dans 38%. Le sous-type moléculaire le plus fréquent était le luminal A. Le carcinome mammaire dans la région du Cap Bon se caractérise par sa survenue à un âge jeune, son importante taille tumorale et la fréquence de facteurs histopronostiques péjoratifs. PMID:28450990

Le diverticule de l'urètre féminin: à propos de 18 cas

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Statoua, Mouad; El Ghanmi, Jihad; Karmouni, Tarik; El Khader, Khalid; Koutani, Abdellatif; Attya, Ahmed Iben

2014-01-01

Le diverticule de l'urètre ou poche sous urétrale est une affection rare, d’étiopathogénie non clairement établie, le diagnostique est clinique confirmé par l'urétrocystographie et le traitement est principalement chirurgicale consistant en une diverticulectomie par voie transvaginale. Nous rapportons l'expérience de notre service dans la prise en charge de cette affection en présentons une étude rétrospective sur une durée de 14 ans (entre 2000 et 2014) où on a pris en charge 18 patientes qui présentait un diverticule de l'urètre, l’âge moyen était de 36 ans, une symptomatologie urinaire ramenait les patientes à consulter où le diagnostic de DU a été posé par examen clinique confirmé en précisant ses caractéristiques en urétrocystographie, la prise en charge était chirurgicale et consistait en une diverticulectomie par voie transvaginale. Les suites post-opératoire était simples, la sonde vésicale retirée en moyenne 5,8 jours après l'intervention, on n'a noté aucune complication chez toute nos patientes, hormis un cas de récidives repris. Devant des troubles mictionnels récidivants de la femme, il est indispensable de rechercher un diverticule uréthral à l'examen clinique. La diverticulectomie transvaginale est l'intervention de choix offrant les meilleurs résultats. PMID:25400845

Tuberculose pelvi-péritoneale pseudotumorale: à propos de quatre cas

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Saadi, Hanane; Mamouni, Nissrine; Errarhay, Sanaa; Bouchikhi, Chahrazed; Banani, Abdelaziz; Ammor, Hicham; Sqalli, Nadia; Tizniti, Siham; Benmajdoube, Karim; Maazaze, Khalid; Fatmi, Hind; Amarti, Afaf

2012-01-01

La tuberculose pelvienne pseudo tumorale est une maladie infectieuse curable. Son tableau clinique est souvent trompeur simulant une tumeur ovarienne ou tubaire. Le but de notre travail est de préciser les caractéristiques cliniques, biologiques et radiologiques de cette pathologie et sa prise en charge. Nous rapportons une étude rétrospective à propos de quatre observations. L’âge moyen de nos patientes est de 24 ans (16 ans, 40 ans), trois parmi elles étaient célibataires. Le motif de consultation est dominé par les douleurs abdominopelviennes chroniques. Les résultats des explorations radiologiques (échographie pelvienne associé à la TDM ou IRM pelvienne) ont été en faveur d'une tumeur ovarienne dans trois cas et d'un hydrosapinx bilatéral pour un cas. L'ascite a été présente dans tous les cas. Le dosage de la Ca 125 a été élevé. La prise en charge a été l'exploration chirurgicale soit par c'lioscopie ou laparotomie. Deux cas ont bénéficié seulement des biopsies et deux patientes ont eu une salpingectomie bilatérale devant l'aspect pseudo tumoral très suspect. L’étude histologique a confirmé des lésions graulomateuses avec nécrose caséeuse. Le traitement par les antibacillaires a été instauré selon le protocole 2ERHZ/ 4RH. La tuberculose pelvienne pseudo tumorale est l'apanage de la femme jeune. Son pronostic est lié à l'infertilité séquellaire. PMID:23330043

Nocardiose pulmonaire sur un terrain immunocompétent: à propos de 2 cas

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Rhofir, Yasmina; Zahraoui, Rachida; Tiress, Nabil; Naji-Amrani, Hicham; Soualhi, Mouna; Bourkadi, Jamal Eddine

2017-01-01

La nocardiose est une infection rare, mais sévère, causée par des bactéries du genre nocardia, qui appartiennent à l'ordre des actinomycétales. Si elles peuvent toucher l'adulte immunocompétent, les nocardioses restent des pathologies de l'individu fragilisé sur le plan immunitaire. L'atteinte pulmonaire reste la plus fréquente, sa prise en charge correcte est liée au diagnostic qui est souvent retardé par des présentations non spécifiques et des prélèvements non concluants. Nous rapportons ici deux cas de nocardiose chez des patients immunocompétents. Le premier cas est celui d'un homme de 24 ans, avec notion de tabagisme et d'éthylisme, hospitalisé pour des douleurs thoraciques et des hémoptysies de faible abondance, évoluant depuis deux mois, avec apparition d'abcès sous cutanés dorsaux fistulisés. L'exploration radiologique découvre une masse tissulaire médiastino-pulmonaire droite avec lyse costale adjacente et diffusion aux tissus para vertébraux droits. Les prélèvements bactériologiques restent négatifs motivant une biopsie scannoguidée de la lésion qui est revenue en faveur d'infection à nocardiose. Le second cas concerne un homme de 22 ans, aux antécédents de tuberculose pleurale traitée il y a 8 ans puis une rechute de tuberculose en 2011 (abcès médiastinal). Admis pour suspicion de rechute de tuberculose devant une toux chronique avec altération de l'état général et une hépatosplénomégalie. Le scanner thoracique montre des condensations alvéolaires avec pleurésie. Au cours de son hospitalisation, apparition de tuméfactions sous cutanées purulentes dont l'étude bactériologique du pus est revenue en faveur de nocardiose avec une souche résistante à tous les antibiotiques sauf colistine et bactrim. Les auteurs illustrent à travers ces deux observations, les aspects cliniques et radiologiques de nocardiose pulmonaire en mettant le point sur les difficultés diagnostiques et thérapeutiques surtout dans un

Tuberculose ganglionnaire: aspects épidémiologiques, diagnostiques et thérapeutiques, à propos de 357 cas

PubMed Central

Hamzaoui, Ghizlane; Amro, Lamyae; Sajiai, Hafsa; Serhane, Hind; Moumen, Nezha; Ennezari, Abdellah; Yazidi, Abdelhaq Alaoui

2014-01-01

La tuberculose ganglionnaire (TG) est la localisation extrapulmonaire la plus fréquente au Maroc. Elle pose encore un problème diagnostique et thérapeutique. Le but du travail est d’ étudier le profil épidémiologique, diagnostique et thérapeutique de la tuberculose ganglionnaire. Il s'agit d'une étude rétrospective portant sur les nouveaux cas de TG suivis au centre spécialisé de tuberculose de Marrakech, entre Janvier 2011 et Décembre 2012. Trois cents cinquante sept cas de TG ont été inclus sur l'ensemble de 1717 cas de tuberculose toute forme confondue, soit une incidence de 20,8%. La moyenne d’âge était de 29,1 ans avec un sex ratio de 0,6 (62,5% de femmes). Le diabète, le contage tuberculeux et l'infection VIH ont été retrouvés respectivement dans 9%, 14,6% et 3,6% des cas. Les adénopathies étaient cervicales dans 95%, médiastinales dans 5,1%, abdominales dans 3,7%, axillaires dans 2,8% et inguinales dans 0,3% des cas. La radiographie du thorax (faite dans 96,4% des cas) a été anormale dans 8,1%. Le diagnostic a été confirmé dans 97,2% des cas. Le régime thérapeutique était 2 RHZE/4RH dans 88% des cas. Dans les cas suivis, l’évolution a été marquée par la disparition des adénopathies dans 95,2% et par l'augmentation du volume ganglionnaire dans 4,8%. 1,4% des cas ont été perdus de vue. La rechute de TG a été notée dans 3,1%. La TG reste fréquente et occupe la 2ème place après l'atteinte pulmonaire et pose un problème diagnostique et thérapeutique. PMID:25767675

Etiologies des hypertensions artérielles endocrines: à propos d'une série de cas

PubMed Central

Bouznad, Naima; El Mghari, Ghizlane; El Ansari, Nawal

2016-01-01

Les hypertensions artérielles (HTA) d'origine endocrine restent une cause rare d'HTA, sa prévalence globale n'excède pas 4% des hypertendus. L'intérêt de la recherche des HTA endocrines réside dans la gravité de certaines formes parfois mortelles et le caractère potentiellement curable et réversible de ces HTA. Le but du travail est de déterminer le profil clinique, para clinique, étiologique et thérapeutique des HTA secondaires d'origine endocrine chez les patients suivis au service d'endocrinologie au CHU Mohamed IV à Marrakech. Il s'agit d'une étude descriptive prospective s’étalant sur une période de 4 ans incluant 45 patients ayant une HTA endocrinienne. La moyenne d’âge est de 44,89 ans, avec une nette prédominance du sexe féminine (sexe ratio de 0,49). Les étiologies des HTA endocrines étaient dominées par le phéochromocytome (17 cas), l'hypercorticisme (11 cas) et l'acromégalie (8 cas). L'HTA était paroxystique dans 24,4%. Elle était d'emblée sevère classée grade 3 dans 40% des cas. L'HTA a été compliquée de cardiopathie dans 24% des cas et de néphropathie dans 20% des cas. Le traitement curatif a permis une guérison de l'HTA chez 60% (27 cas). Le diagnostic des HTA secondaires endocrines est parfois difficile du fait de l'absence de spécificité clinique. Il n'est pas exceptionnel que l'HTA soit l'unique manifestation de la maladie. Dans notre travail nous notons le caractère paroxystique et sévère de l'HTA. Le caractère éventuellement curable des HTA endocrines, dans plus des deux tiers des cas, fait qu'il est important de la dépister devant toute HTA sévère, résistante au traitement, ou en présence de signes cliniques, biologiques ou radiologiques évocateurs. PMID:27303586

L'ostéotomie de scarf dans le traitement de l'hallux valgus: à propos de 19 cas

PubMed Central

Boussakri, Hassan; Bachiri, Mohammed; Elidrissi, Mohammed; Shimi, Mohammed; Elibrahimi, Abdelhalim; Elmrini, Abdelmajid

2014-01-01

L'ostéotomie de Scarf constitue une technique chirurgicale bien décrite, grâce à ses résultats excellents, elle est considérée comme un traitement de choix de l'hallux valgus. Le but de ce travail est de décrire le profil épidémiologique et radio-clinique des hallux valgus, ainsi qu’évaluer les résultats radiologiques et fonctionnels des patients traités par la technique classique d'ostéotomie de Scarf. Nous avons mené une étude rétrospective, concernant 22 ostéotomies de Scarf chez 19 patients, opérés d'hallux valgus entre mai 2009 et janvier 2013. Le recul moyen était de 22,5 mois (3-42 mois). L'âge moyen des patients au moment de l'intervention était de 49 ans, avec des extrêmes de 19 et 75 ans. Tous les patients ont bénéficié d'une évaluation clinique et radiologique préopératoire et postopératoire ainsi qu'une analyse statistique. Au dernier recul, selon des critères subjectifs, nos résultats étaient très satisfaisants dans 42%, satisfaisants dans 52% et déçus dans 6%, et en fonction du score de l'AOFAS, les résultats étaient nettement améliorée avec un AOFAS préopératoire de 57% à 84% en postopératoire. Concernant les résultats radiologiques, la déformation métatarsophalangienne (angle M1P1) a été corrigée (43,63 °-12,8°) avec une p très significative (p <0,001). D'autre part une amélioration de l'Angle moyen M1M2, passer de 18,18° préopératoire à 12,95° au dernier recul, avec une correction significative (p <0,001). Le valgus épiphysaire de premier métatarsien (AADM) a été statistiquement amélioré (p <0,001), passer de 24,45° à 7,91°. Concernant les complications nous avons noté un cas de sepsis précoce superficiel géré par une antibiothérapie adaptée, deux cas de névrome et un cas d'ostéonécrose. Par contre on n'a pas noté aucune fracture per opératoire du premier métatarsien. Nous concluons que l'ostéotomie de Scarf est une technique reproductible fiable, en pleine �

Le dermatofibrosarcome de Darier et Ferrand, une tumeur cutanée particulière: à propos de 32 cas et revue de la littérature

PubMed Central

Elamrani, Driss; Droussi, Hatim; Boukind, Samira; Elatiqi, Keltoum; Dlimi, Meriem; Benchamkha, Yassine; Ettalbi, Saloua

2014-01-01

Le dermatofibrosarcome (DFS) est une tumeur fibreuse de la peau, de croissance lente, à très haut risque de récidive locale, mais à potentiel métastatique faible. A partir d'une étude rétrospective étalée sur une période de 5 ans (décembre 2008 - décembre 2013), nous avons analysé les caractéristiques épidémiologiques et cliniques, le délai de diagnostic, le type de thérapeutique et le devenir de 32 patients présentant des tumeurs de Darier et Ferrand histologiquement prouvées. Parmi les 32 patients, 10 se sont présentés initialement au service pour une récidive tumorale. Une discrète prédominance masculine a été notée. Les DFS touchent préférentiellement l'adulte jeune. Le délai diagnostique observé est en moyenne de 4 ans. Le tronc est la localisation préférentielle (60%), suivi par les extrémités proximales (30%). Les 32 patients ont été traités par exérèse chirurgicale avec une marge de 5cm en surface, emportant en profondeur une barrière anatomique saine. La couverture de la perte de substance (PDS) a été réalisée après confirmation anatomopathologique du caractère carcinologique de l'exérèse, et a fait appel à différents moyens allant de la greffe cutanée aux lambeaux musculo –cutanés libres. L’évolution a été marquée par la survenue d'une récidive tumorale chez 8 patients (3 cas parmi les tumeurs vues en première intention et 5 cas parmi les tumeurs vues en récidive) et les résultats ont été jugés satisfaisants sur le plan esthétique et fonctionnel. Le DFS de Darier et Ferrand est une tumeur dont le pronostic et le risque évolutif sont principalement liés au délai diagnostic et la qualité de la première exérèse. Le diagnostic tardif, rend difficile la chirurgie d'exérèse et de reconstruction Les possibilités de guérison en cas de chirurgie primaire bien conduite sont significativement supérieures à celles d'une chirurgie de rattrapage. L'amélioration du pronostic passe par

Tuberculose ostéoarticulaire (mal de Pott exclu): à propos de 120 cas à Abidjan

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Gbané-Koné, Mariam; Koné, Samba; Ouali, Boubacar; Djaha, Kouassi Jean -Mermoz; Akoli, Ekoya Ondzala; Nseng, Ingrid Nseng; Eti, Edmond; Daboiko, Jean Claude; Touré, Stanislas André; Kouakou, N'zué Marcel

2015-01-01

Introduction La tuberculose ostéoarticulaire (TOA) représente 2 à 5% de l'ensemble des tuberculoses. Elle demeure d'actualité surtout dans les pays à forte endémicité tuberculeuse. L'objectif était de déterminer la prévalence, les aspects topographiques, radiologiques de la TOA en milieu hospitalier ivoirien. Méthodes Les auteurs rapportent une expérience de 11 ans, à travers une étude rétrospective de 120 dossiers de patients atteints de la tuberculose ostéoarticulaire (le mal de Pott est exclu de cette étude). N'ont pas été inclus dans l’étude les dossiers ne comportant pas d'imagerie. Résultats L'atteinte extra vertébrale représentait 09,2% de la tuberculose ostéoarticulaire. Il s'agissait de 54 hommes et 66 femmes, l’âge moyen était de 43,13 ans. On notait 123 cas d'ostéoarthrites, et 8 cas d'ostéites des os plats. L'atteinte des membres inférieurs prédominait dans 91,87% des cas. La hanche était la première localisation (45,04%), suivie du genou (25,19%). Les atteintes étaient multifocales dans 20% des cas. L'atteinte osseuse était associée à une tuberculose pulmonaire dans 05,83% des cas. Des localisations inhabituelles ont été rapportées: poignet (n = 2), branches ischiopubiennes (n = 4), atteinte sternoclaviculaire (n = 4), médiopieds (n = 2). Les lésions radiologiques étaient avancées (stades III et IV) dans 55,73% des cas. A la TDM, la prévalence des abcès était de 77%. Un geste chirurgical a été réalisé sur 16 articulations (2 épaules, 13 genoux, une cheville). Conclusion La TOA des membres est peu fréquente contrairement à l'atteinte vertébrale. La hanche est la principale localisation. Le retard au diagnostic explique l’étendue des lésions anatomoradiologiques. PMID:26587129

Les complications tardives de prothèse totale de la hanche: à propos de 42 cas

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Azarkane, Mohamed; Boussakri, Hassan; Shimi, Mohamed; Elibrahimi, Abdlehalim; Elmrini, Abdlemeji

2013-01-01

L'arthroplastie de la hanche est un moyen fiable dans le traitement des affections de la hanche. En lui rendant sa mobilité sa stabilité et son indolence. Cependant cette chirurgie prothétique expose au risque de la survenue des complications qui peuvent engager le pronostic fonctionnel. Nous avons réalisé une étude rétrospective sur une durée de 8 ans de janvier 2004 au janvier 2012 au service de traumatologie-orthopédie de CHU HASSAN II FEZ. Pendant cette période nous avons opéré 240 patients pour PTH. Après un recul moyen de 5 ans nous avons noté chez 42 (17,4%) patients une complication tardive. Nous noté 13 cas de descellement aseptique soit 5,4%. Cette complication a été survenue dans notre série sur une prothèse cimentée dans 8 cas et non cimentée dans 5 cas. Le traitement que nous avons adopté dans notre série a été une reprise de PTH sans greffe osseuse ni anneau de reconstruction dans 4 cas, reprise avec mise en place d'anneau de Kerboull dans 7 cas et reprise avec greffe osseuse et anneau de kerboull dans 2 cas. Nous avons trouvé 11 cas de sepsis tardive soit 4,6% des cas. Nous avons le diabète comme facteur de risque chez 3 malades. L'agent causal a été staphylococcus épdermidis dans 5 cas, colibacille dans 2 cas et association staphylococcus-BGN dans 1 cas. Les différentes modalités que nous avons utilisé pour traiter l'infection dans notre ont été un lavage simple, système d'irrigation-drainage et réimplantation simple en un seul temps ou en 2 temps avec couverture systématique par une antibiothérapie adaptée selon l'antibiogramme. Nous avons noté également 11 cas de fracture sur PTH intéressant dans tous les cas le fémur, nous avons traité ce type de fracture dans notre série par une tige fémorale prothétique longue dans 4 cas, une plaque vissée cerclée dans 3 cas et cerclage simple dans 4 cas. La consolidation a été obtenue chez 9 patients avec 2 cas de pseudarthrose. Nous avons noté 7 cas de

Impact de la varicocèle sur le volume testiculaire et les paramètres spermatiques

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Benazzouz, Mohamed Hicham; Essatara, Younes; El Sayegh, Hachem; Iken, Ali; Benslimane, Lounis; Nouini, Yassine

2014-01-01

Introduction La varicocèle est une pathologie masculine fréquente dont l'incidence est encore plus importante dans dans la population des hommes infertiles. Si ses mécanismes sont à ce jour incomplètement expliqués il semble acquis que la varicocèle peut être associée a une dysfonction testiculaire avec diminution du volume testiculaire et de la concentration en spermatozoïde de l’éjaculat. Méthodes Dans un premier temps nous exposons les résultats d'une étude rétrospective sur 5 ans (de Mars 2009 à Mars 2014), réalisée au service d'urologie A de l'hôpital Ibn Sina de Rabat et ayant comme objectif d’évaluer l'impact de la varicocèle palpable sur le volume testiculaire et les paramètres spermatiques. Tous les patients inclus dans notre étude avaient une varicocèle palpable. Dans un deuxième temps, et à travers une revue de la littérature nous discutons l'impact du traitement de la varicocèle sur la fertilité. Résultats 39 patients ont été inclus dans notre étude. L’âge moyen était de 29,71 ans et la varicocèle siégeait dans 89,74% des cas du coté gauche. Une atrophie testiculaire homolatérale à la varicocèle était retrouvée dans 7% des cas alors que des anomalies du spermogramme se voyaient dans 69,23% des cas. Conclusion L'impact de la varicocèle sur l'altération des paramètres spermatiques a été clairement établi bien que sa physio pathogénie ne soit pas bien élucidée. Le traitement chirurgical de la varicocèle semble indiqué chez les hommes infertiles présentant une varicocèle clinique et une altération significative du sperme. PMID:25918574

Le carcinome neuro-endocrine cutané primitif: à propos d'un nouveau cas et revue de la littérature

PubMed Central

Boukind, Samira; Elatiqi, Oumkeltoum; Dlimi, Meriem; Elamrani, Driss; Benchamkha, Yassine; Ettalbi, Saloua

2015-01-01

Le carcinome neuro- endocrine cutané primitif (CNEC) est une tumeur cutanée rare et agressive du sujet âgé, favorisée par le soleil et l'immunodépression. Elle est caractérisée par une évolution agressive avec un fort taux de récidive, une évolution ganglionnaire régionale et un risque de métastases à distance. Nous rapportons un cas de cette tumeur chez un patient âgé de 67 ans sous forme d'un placard nodulaire hémorragique mesurant 16 /14 cm. Le patient a bénéficié d'une exérèse chirurgicale large avec couverture de la perte de substance par un lambeau musculo-cutané du muscle grand dorsal, un curage ganglionnaire axillaire et une radiothérapie adjuvante. Après un recul de 2 ans et 2 mois, le patient est toujours vivant sans métastase ni récidive. La littérature étant pauvre, la prise en charge diagnostique et thérapeutique est controversée et donc hétérogène. Globalement le pronostic est mauvais, et certains paramètres corrélés au pronostic sont précisés. PMID:26185585

La ponction biopsie hépatique à Dakar: indications, complications et apport diagnostique - à propos de 70 cas

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Touré, Papa Souleymane; Léye, Abdoulaye; Diop, Madoky Maguette; Gueye, Mame Daouda; Léye, Yakham Mohamed; Berthé, Adama; Mourtalla Ka, Mamadou

2014-01-01

Introduction Les objectifs de notre travail étaient de déterminer les indications, les complications et l'apport diagnostique de la ponction biopsie hépatique (PBH) transpariétale. Méthodes Il s'agissait d'une étude rétrospective descriptive allant du janvier 2006 à décembre 2010, réalisée dans le service de Médecine Interne de l'hôpital de Pikine de Dakar. Etaient inclus, tous les malades ayant subi une biopsie hépatique, en ambulatoire ou en hospitalisation. Etaient exclus, tous les patients qui ont bénéficié d'une PBH dont les résultats n'ont pas été retrouvés. Les données suivantes étaient étudié: l’âge, le sexe, les indications, la taille du fragment biopsique, Le nombre de carottes, les complications, la comparaison des diagnostics pré biopsiques avec les comptes rendus histologiques. Résultats Ont été colligées 70 patients atteints d'hépatopathie chronique ayant bénéficiés d'une PBH. Il s'agissait de 46 hommes (65.71%) et 24 femmes (34.29%). L’âge moyen des patients était de 36 ans. Les PBH étaient réalisées en ambulatoire chez 58 patients (82.86%) et chez 12 malades hospitalisés (17,14%). Les indications étaient dominées par les hépatites virales chroniques dans 62,86% (44cas), suivi des processus tumoraux du foie dans 24.29% (17 cas). Les complications survenues chez 15 patients (21.43%) étaient représentées de 14 cas de douleur (20%) et d'un cas de malaise vagal (1.43%). Les 70 PBH effectuées ont ramené une carotte dans 35,71% des cas, 2 à 6 carottes dans 32,87% des cas. La longueur moyenne des fragments biopsiques était de 22 ±8 mm. Soixante-six résultats étaient interprétables et 4 non interprétables soit une performance diagnostique de 94,29%. Conclusion La PBH est de pratique sure, avec un respect des contres indications et une bonne maitrise de la technique. Son acceptabilité a été bonne dans notre pratique et sa rentabilité diagnostique excellente. Elle devrait être beaucoup plus

Forme pseudotumorale de la tuberculose : à propos d’un cas

PubMed Central

Salama, Tarik; Aghoutane, El Mohtadi; Fezzazi, Redouane El

2017-01-01

La tuberculose osseuse peut prendre l'aspect d'une tumeur maligne. Nous présentons le cas d'un enfant de 4 ans porteur d'une tuberculose osseuse ayant simulé un ostéosarcome fémoral. Le diagnostic a été redressé par l'étude anatomopathologique. Ce cas souligne l'importance de connaitre les des différents aspects cliniques et radiologiques de la tuberculose osseuse qui peut simuler une tumeur maligne. Afin d'éviter tout retard diagnostic, chirurgiens pédiatres et radiologues doivent savoir que la tuberculose peut revêtir les tableaux cliniques et radiologiques de nombreuses pathologies. PMID:28533858

Le contrôle des infections au cabinet du pédiatre

PubMed Central

2008-01-01

RÉSUMÉ La transmission des infections au cabinet du pédiatre est de plus en plus préoccupante. Le présent document expose les voies de transmission des infections et les principes sous-jacents aux mesures actuelles pour contrôler les infections. Pour prévenir les infections, il faut bien concevoir le cabinet et adopter des politiques administratives et de triage convenables, de même que des pratiques de base pour les soins de tous les patients (p. ex., hygiène des mains, port de gants, de masques, de lunettes de protection et d’une blouse d’hôpital pour des interventions précises; nettoyage, désinfection et stérilisation convenables des surfaces et du matériel, y compris les jouets, et techniques d’asepsie en cas d’interventions effractives) et des précautions additionnelles en cas d’infections précises. Le personnel doit avoir reçu les vaccins pertinents, et les personnes infectées doivent respecter les politiques de restriction au travail.

Nouvelles approches en theorie du champ moyen dynamique: le cas du pouvoir thermoelectrique et celui de l'effet orbital d'un champ magnetique

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Arsenault, Louis-Francois

Les applications reliees a la generation d'energie motivent la recherche de materiaux ayant un fort pouvoir thermoelectrique (S). De plus, S nous renseigne sur certaines proprietes fondamentales des materiaux, comme, par exemple, la transition entre l'etat coherent et incoherent des quasi-particules lorsque la temperature augmente. Empiriquement, la presence de fortes interactions electron-electron peut mener a un pouvoir thermoelectrique geant. Nous avons donc etudie le modele le plus simple qui tient compte de ces fortes interactions, le modele de Hubbard. La theorie du champ moyen dynamique (DMFT) est tout indiquee dans ce cas. Nous nous sommes concentres sur un systeme tridimensionnel (3d) cubique a face centree (fcc), et ce, pour plusieurs raisons. A) Ce type de cristal est tres commun dans la nature. B) La DMFT donne de tres bons resultats en 3d et donc ce choix sert aussi de preuve de principe de la methode. C) Finalement, a cause de la frustration electronique intrinseque au fcc, celui-ci ne presente pas de symetrie particule-trou, ce qui est tres favorable a l'apparition d'une grande valeur de S. Ce travail demontre que lorsque le materiau est un isolant a demi-remplissage a cause des fortes interactions (isolant de Mott), il est possible d'obtenir de grands pouvoirs thermoelectriques en le dopant legerement. C'est un resultat pratique important. Du point de vue methodologique, nous avons montre comment la limite de frequence infinie de S et l'approche dite de Kelvin, qui considere la limite de frequence nulle avant la limite thermodynamique pour S, donnent des estimations fiables de la vraie limite continue (DC) dans les domaines de temperature appropriee. Ces deux approches facilitent grandement les calculs en court-circuit ant la necessite de recourir a de problematiques prolongements analytiques. Nous avons trouve que la methode de calcul a frequence infinie fonctionne bien lorsque les echelles d'energie sont relativement faibles. En d'autres termes

Les tumeurs annexielles cutanées: étude anatomopathologique à propos de 96 cas

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El Ochi, Mohamed Réda; Boudhas, Adil; Allaoui, Mohammed; Rharrassi, Issam; Chahdi, Hafsa; Bouzidi, Abderrahman Al; Oukabli, Mohammed

2015-01-01

Les tumeurs annexielles cutanées sont des tumeurs primitives cutanées à la fois rares et hétérogènes. Elles sont le plus souvent bénignes et rarement malignes. Elles sont dominées du point de vu morphologique par leur polymorphisme lésionnel. Le but de cette étude est de relever le profil épidémiologique et les différents aspects anatomopathologiques de ce groupe de tumeurs dans une cohorte de population marocaine et de les comparer avec les données de la littérature. Il s'agit d'une étude rétrospective de 96 cas de tumeurs annexielles cutanées colligées au service d'anatomie et de cytologie pathologique de l'Hôpital Militaire d'Instruction Mohammed V de rabat durant une période de 6 ans, de Janvier 2009 à Décembre 2014. Le pic de fréquence est situé entre 31 et 40 ans. L’âge moyen est de 36 ans avec une prédominance masculine (63,5%). Le siège de prédilection est la région de la tête et cou (47,9%). Les tumeurs bénignes (97,9%) sont plus fréquentes que les tumeurs malignes. La différenciation est folliculaire dans 51% des cas, eccrine/apocrine dans 44,8% des cas et sébacée dans 4,2% des cas. Le type histologique le plus fréquent est le pilomatrixome (33,4%) suivi par l'hidradénome (12,5%) et le spiradénome eccrine (11,5%). Les tumeurs annexielles cutanées sont rares et très variées. Le profil épidémiologique et les aspects anatomopathologiques qui ressortent sont globalement superposables à ceux rapportés dans la littérature. Elles sont majoritairement bénignes, à prédominance masculine et dominées par le pilomatrixome et l'hidradénome nodulaire. Les tumeurs malignes sont rares, agressives et surviennent à un âge plus avancé. PMID:26185579

Blast pulmonaire primaire chez le brûlé. a propos d’un cas et revue de la littérature

PubMed Central

Siah, S.; Emane, A.; Bertin-Maghit, M.

2016-01-01

Summary Le blast est à l’origine de lésions spécifiques pour lesquelles une prise en charge spécialisée est nécessaire. Après une explosion on peut observer des lésions de blast primaire, liées à l’onde de choc, secondaire par polycriblage et tertiaire par projection du patient. Les blasts secondaire et tertiaire sont plus fréquents que le blast primaire et peuvent entraîner un polytraumatisme. Dans 5% des cas, on retrouve des brûlures pouvant faire partie du blast quaternaire, qui regroupe toutes les lésions d’autres mécanismes que ceux précités. La prise en charge des lésions secondaires et tertiaires de blast est comparable à celle des traumatisés graves. Le blast pulmonaire primaire aggrave le pronostic des blessés les plus graves mais impose rarement une prise en charge spécifique. La connaissance des particularités physiopathologiques et lésionnelles permet de mieux traiter les blastés et brûlés graves survivants. Nous rapportons une observation de blast pulmonaire primaire chez un brûlé. PMID:28149247

La connectivite mixte: prévalence et caractéristiques cliniques chez le noir africain, étude de 7 cas au Gabon et revue de la littérature

PubMed Central

Missounga, Landry; Ba, Josaphat Iba; Nseng Nseng Ondo, Ingrid Rosalie; Nziengui Madjinou, Maria Ines Carine; Malekou, Doris; Mouendou Mouloungui, Emeline Gracia; Nzengue, Emmanuel Ecke; Boguikouma, Jean Bruno; Kombila, Moussavou

2017-01-01

La littérature rapporte que la connectivite mixte semble plus fréquente dans la population noire et chez les asiatiques. Le but de l'étude était de déterminer la prévalence de la connectivite mixte (CM) parmi les connectivites et l'ensemble des pathologies rhumatologiques dans une population hospitalière au Gabon; de décrire ensuite les caractéristiques cliniques de la maladie. Il s'agissait d'une étude rétrospective des dossiers de patients suivis pour connectivite mixte (critères de Kasukawa) et les autres entités de connectivites (critères ACR) en rhumatologie au CHU de Libreville entre janvier 2010 et décembre 2015. Pour chaque cas de CM, les manifestations articulaires et extra-articulaires, le taux d'anticorps anti-U1RNP, l'évolution, étaient les paramètres étudiés. Sept cas ont été colligés en 6 ans parmi 6050 patients et 67 cas de connectivites soit une prévalence de 0,11% et de 10,44% respectivement. Il s'agissait de 7 femmes (100%), d'âge moyen de 39,5 ans. Les signes articulaires comprenaient: polyarthrite, myalgies, doits boudinés et phénomène de Raynaud dans 87,5%, 87,5%, 28,6% et 14% respectivement. Les 7 patients avaient un taux d'anti-U1RNP élevé entre 5 et 35N (N≤7 UI). Un cas de décès par HTAP était constaté. Il s'agit de la série de CM la plus importante rapportée en Afrique noire. La maladie semble rare chez le noir africain, la raison pourrait être génétique. Les aspects démographiques et cliniques paraissent similaires chez les caucasiens, les asiatiques et les noirs hormis une faible fréquence du phénomène de Raynaud chez les noirs. PMID:28904690

Tuberculose orbitaire: à propos d'un cas

PubMed Central

Khrifi, Zineb; Abdellaoui, Meriem; Alaoui, Abdellah; Benatiya, Idriss Andaloussi; Tahri, Hicham

2014-01-01

La tuberculose sévit à l’état endémique au Maroc, l'atteinte orbitaire est rare et peut se faire par voie hématogène ou par contigüité à partir d'un foyer de voisinage. Nous rapportons le cas d'une patiente de 42 ans qui présente une exophtalmie droite dont l'enquête étiologique révèle une tuberculose orbitaire. PMID:25018814

Notre expérience de méningiome intracrânien à Dakar: à propos de 50 cas

PubMed Central

Thiam, Alioune Badara; Kessely, Yannick Canton; Thioub, Mbaye; Mbaye, Maguette; Faye, Mouhamed; Sy, El Hadj Cheikh Ndiaye; Ndoye, Ndaraw; Ba, Momar Codé; Sakho, Youssoupha; Badiane, Seydou Boubacar

2015-01-01

Les méningiomes sont des tumeurs bénignes extra parenchymateuses développées aux dépens des villosités arachnoïdiennes. Ils tirent leur gravité de leur localisation dans des zones hyperfonctionnelles. Le but de cette étude est d’évaluer la prise en charge des méningiomes intracrâniens depuis la réhabilitation du service de neurochirurgie en 2007. Les auteurs rapportent une série rétrospective portant sur 50 patients admis et opérés d'un méningiome intracrânien d'octobre 2007 à Juin 2013 dans leur service. Ont été inclus les patients ayant un dossier complet. Les patients étaient âgés de 08 à 70 ans avec une moyenne d’âge de 47,3 ans, 68% avaient plus de 40 ans. La sex-ratio était de 0,76. Les manifestations cliniques étaient essentiellement l'hypertension intracrânienne (46%), le déficit moteur (30%) et la comitialité (48%). La tomodensitométrie cérébrale était réalisée chez 41 patients et l'IRM chez 23. Le méningiome était localisé sur la convexité chez 24 patients. L'imagerie postopératoire immédiate était réalisée chez 15 patients. L'exérèse a consisté dans 44% des cas à un Sympson II, et dans 30% des cas à un Sympson III. L'anatomopathologie a conclu à une prédominance du type méningothélial (38%) et 60% des méningiomes étaient de grade I selon la classification de l'O.M.S. Aucun patient n'a bénéficié d'une radiothérapie. La mortalité était de 16%. Les pays d'Afrique subsaharienne continuent d'accuser un retard malgré les efforts réalisés dans les domaines diagnostic et thérapeutique des méningiomes intracrâniens. Le pronostic s'est considérablement amélioré à mesure de l'amélioration du plateau technique dans notre pays. PMID:26185569

Appendicite aigue non compliquée: y a-t- il une place pour le traitement conservateur

PubMed Central

El Khader, Ahmed; Lahkim, Mohamed; El Barni, Rachid; Achour, Abdessamad

2015-01-01

Le but de cette étude a été d’évaluer l'efficacité de l'antibiothérapie seule dans le traitement des appendicites aigues non compliquées. C'est une étude prospective, intéressant 68 patients ayant eu une appendicite aigue simple, de confirmation radiologique, traités par l'amoxicilline associée à l'acide clavulanique pendant 10 jours. L'appendicectomie a été réalisée en cas d'aggravation ou en cas de non amélioration au bout de 48heures de traitement. Le traitement conservateur a été efficace dans 82,35% avec une résolution complète des symptômes chez 56 patients. Les 12 cas restants (17,65%) ont subit une appendicectomie. l'appendicite a été gangréneuse dans 8 cas et phlegmoneuse dans 4 cas. Cinq des 56 patients, qui ont bien évolué sous traitement conservateur, ont été réadmis et opérés pour récidive, soit 8,9%. Deux cas ont eu une appendicite compliquée. L'appendicectomie reste le traitement de référence pour l'appendicite aigue, mais le traitement antibiotique peut être proposé en première intension à des patients présentant une appendicite aigue non compliquée. PMID:26327981

Profil épidémiologique des brûlés à Marrakech: à propos de 152 cas

PubMed Central

Ibnouzahir, M.; Ettalbi, S.; Ouahbi, S.; Droussi, H.; Sousou, M.; Chlihi, A.; Bahaichar, N.; Boukind, H.

2011-01-01

Summary Cet article concerne une étude épidémiologique rétrospective portant sur 152 patients brûlés hospitalisés entre 2006 et 2008. Les brûlés avaient moins de 20 ans dans 65% des cas. Le sex ratio (m/f) était de 1,18/1. L’origine thermique est incriminée dans 84% des cas. L’atteinte par flammes représente 56% des cas. La surface corporelle brûlée moyenne chez nos patients était de 28%, et les brûlures de deuxième degré étaient de loin les plus fréquentes. Dans notre série, le visage et le cou étaient le siège le plus fréquemment touché. La prévention reste la meilleure arme pour lutter contre ce fléau, et pour cela plusieurs mesures sont proposées pour améliorer l’état actuel des choses. PMID:21991231

Rhabdomyosarcome paratesticulaire (RMSP) multimétastatique : à propos d’un cas

PubMed Central

Bennani, Hassan; Ziouziou, Imad; El Ghanmi, Jihad; Karmouni, Tarik; El Khader, Khalid; Koutani, Abdellatif; Andaloussi, Ahmed Iben Attya

2014-01-01

Résumé Nous rapportons, dans le présent article, le cas clinique d’un RMSP découvert à un stade tardif chez un adolescent, dans le but de confirmer l’évolution fatale de cette pathologie au potentiel métastatique « affreux ». Nous discutons aussi les causes du retard diagnostique, l’implication du sous-type histologique comme facteur pronostique et la place de la chimiothérapie dans le traitement des formes évoluées de la maladie. PMID:25295143

La tuberculose extra-ganglionnaire primitive de la sphère ORL: à propos de 15 cas

PubMed Central

Touati, Mohamed Mliha; Darouassi, Youssef; Chihani, Mehdi; Lakouichmi, Mohammed; Tourabi, Khalid; Ammar, Haddou; Bouaity, Brahim

2014-01-01

Les localisations ORL extra ganglionnaires de la tuberculose sont rares. La symptomatologie clinique ainsi que les examens paracliniques sont souvent trompeurs,posant ainsi le problème de diagnostic différentiel avec la pathologie tumorale. Nous rapportons 15 cas de localisations extra ganglionnaires de tuberculose, colligés au service ORL et CCF de l'Hopital Militaire Avicenne de Marrakech colligés entre 2009 et 2013. L’âge moyen de nos patients est de 33 ans. L’étude topographique a montré 6 cas au niveau du cavum, un cas de miliaire tuberculeuse pharyngée, 4 cas laryngés; 2 localisations auriculaires; 1 parotidienne et 1 localisation sous maxillaire. Le diagnostic était anatomopathologiquedans tous les cas. Tous nos patients ont reçu un traitement antituberculeux avec une bonne évolution. Mots-clés: Tuberculose, amygdale, rhinopharynx, larynx, glandes salivaires,Oreille moyenne. PMID:25815100

La tuberculose sternale: à propos de 2 cas

PubMed Central

Ouarssani, Aziz; Atoini, Fouad; Ait Lhou, Fatima; Idrissi Rguibi, Mustapha

2012-01-01

La tuberculose ostéoarticulaire touche surtout le rachis. L’atteinte sternale est rare, elle représente moins de 1% des ostéomyélites tuberculeuses. L’abcès froid compliqué par une fracture pathologique constitue le mode de révélation le plus fréquent. Le traitement chirurgical assure l’évacuation des abcès et permet le diagnostique histologique et bactériologique. On rapporte deux cas de tuberculose sternale âgés respectivement de 45 ans et de 10ans, colligés au service de pneumologie, l’examen histologique et bactériologique ont permis d’affirmer le diagnostic de tuberculose, et le traitement antibacillaire a permis une évolution favorable .A la lumière de ces observations, les auteurs proposent de faire une mise au point sur l’ostéite sternale tuberculeuse. PMID:22514767

Une cause rare de compression médullaire: kyste arachnoïdien épidural rachidien (à propos de 03 cas)

PubMed Central

El Saqui, Abderrazzak; Aggouri, Mohamed; Benzagmout, Mohamed; Chakour, Khalid; Chaoui, Mohamed El Faiz

2017-01-01

Le kyste arachnoïdien épidural rachidien (KAER) est une affection bénigne, de physiopathologie encore incertaine. Il est le plus souvent asymptomatique mais peut causer des séquelles neurologiques graves surtout quand le traitement n'est pas instauré à temps. Nous rapportons l'expérience du service de Neurochirurgie CHU Hassan II- Fès concernant la prise en charge du KAER à travers l'analyse rétrospective de trois cas. Il s'agit de deux patients de sexe masculin et d'une femme, d'âge moyen de 35 ans (Extrêmes: 16 et 56 ans), tous admis pour un tableau de compression médullaire lente. Tous nos patients ont bénéficié d'une IRM médullaire qui a mis en évidence une collection liquidienne de siège épidural, ayant le même signal que le LCR, comprimant la moelle en regard. Le siège de la collection était thoracique dans tous les cas. Tous nos patients ont été opérés par voie postérieure avec exérèse du kyste et ligature du collet dans deux cas et une plastie durale dans un seul cas. L'étude anatomopathologique a conclu en un kyste arachnoïdien. L'évolution postopératoire était favorable dans tous les cas. Ce travail a comme objectif de mettre le point sur cette pathologie tout en insistant sur la nécessité d'une prise en charge précoce, vu la tendance vers l'aggravation progressive en l'absence de thérapie adaptée et rappeler les particularités cliniques, paracliniques et thérapeutiques de cette affection. PMID:28533855

Ponction biopsies rénales dans le Service de Néphrologie de Fès: indications et résultats: à propos de 522 cas

PubMed Central

Mbarki, Houda; Belghiti, Khadija Alaoui; Harmouch, Taoufiq; Najdi, Adil; Arrayhani, Mohamed; Sqalli, Tarik

2016-01-01

L'apport de la ponction biopsie rénale (PBR) dans le diagnostic, le choix thérapeutique et l’évaluation pronostique des néphropathies est considérable. Aucune étude marocaine n'a évalué la pratique et l'apport de la PBR. Notre objectif est d’étudier les indications de la PBR, déterminer la fréquence des maladies rénales identifiées par PBR dans notre région et de faire une confrontation entre les données clinico-biologiques et le diagnostic historique. Notre étude menée entre Janvier 2009 et Décembre 2012, est rétrospective. Nous avons inclus tous les patients du service de Néphrologie du CHU Hassan II de Fès ayant bénéficié d'une biopsie de reins natifs. 522 PBR ont été réalisées. Nous avons exclu 8 biopsies devant le manque de renseignements et avons donc retenu 514. L’âge moyen des patients au moment de la PBR est de 39 ±17 ans (3-82 ans). Le sex ratio est de 0,9. Le syndrome néphrotique est le diagnostic clinique le plus fréquent à tous les âges (58,2%). Les néphropathies glomérulaires représentent 94,2% des maladies rénales diagnostiquées, leur distribution varie selon l’âge des patients. La PBR a confirmé le premier diagnostic suspecté cliniquement dans 40,65% des cas, alors qu'elle a révélé un diagnostic inattendu chez 22,5% d'entre eux. Le diagnostic syndromique permet d'orienter vers la maladie rénale la plus probable et de guider les thérapeutiques urgentes en attendant les résultats de la PBR. Mais il ne peut en aucun remplacer la PBR qui reste le gold standard. PMID:27583085

Les Brulures Electriques par Haut Voltage - A Propos de 10 Cas

PubMed Central

Belmir, R.; Fejjal, N.; El Omari, M.; El Mazouz, S.; Gharib, N.; Abassi, A.; Belmahi, A.

2008-01-01

Summary Les accidents électriques par haute tension (AEHT) provoquent des brûlures profondes par effet Joule le long des axes vasculo-nerveux entre les points d'entrée et de sortie, qui sont le siège de lésions délabrantes. Les Auteurs rapportent une série de dix cas d'AEHT admis au service de chirurgie réparatrice et de brûlés de l'Hôpital Ibn Sina de Rabat à travers laquelle ils étudient les caractéristiques épidémiologiques, cliniques et thérapeutiques. Tous les patients étaient des adultes de sexe masculin dont l'âge moyen était de 31 ans. Dans 70% des cas, ces brûlures étaient secondaires à un contact avec les distributeurs d'électricité avec une surface brûlée inférieure à 20%. Le traitement des lésions électrothermiques a nécessité des interventions itératives avec amputation des segments de membres nécrosés dans 70% des cas, dont les suites étaient marquées par des séquelles fonctionnelles invalidantes. La prévention des AEHT, en particulier pour les accidents du travail au sein des professions exposées, reste fondamentale. PMID:21991124

Profil épidémiologique des tumeurs malignes primitives des glandes salivaires : à propos de 154 cas

PubMed Central

Setti, Khadija; Mouanis, Mohamed; Moumni, Abdelmounim; Maher, Mostafa; Harmouch, Amal

2014-01-01

Introduction Les tumeurs des glandes salivaires sont des tumeurs rares représentant 3à 5% des tumeurs de la tête et du cou. La classification de l'OMS 2005 distingue les tumeurs épithéliales, les tumeurs mésenchymateuses, les tumeurs hématologiques et les tumeurs secondaires. Méthodes Notre travail consiste en une étude rétrospective réalisée sur une période de 10 ans allant de janvier 2002 à janvier 2012. Les critères d'inclusion étaient: l'âge, le sexe, le siège de la tumeur et le type histologique. Résultats L'incidence annuelle des tumeurs malignes primitives des glandes salivaires dans notre série était de 15 cas par an. Cent cinquante quatre cas de tumeurs malignes primitives des glandes salivaires ont été colligés sans prédominance de sexe (78 femmes (50,6%) et 76 hommes (49,4%)). La moyenne d'âge était de 60 ans avec des extrêmes de 4 et 83 ans et un pic de fréquence entre 51et 70 ans. Deux tiers des cas (65%) avaient une localisation au niveau des glandes principales avec 66 cas au niveau de la parotide (43%) et 34 cas au niveau de la glande sous maxillaire (22%). Cinquante quatre patients avaient une tumeur maligne des glandes salivaires accessoires (35%) dont 61% au niveau du palais. Aucun cas de tumeur maligne de la glande sublinguale n'a été recensé dans notre étude. Le type histologique prédominant dans notre série était le carcinome adénoïde kystique et retrouvé chez 43 patients (27,9%), suivi de l'adénocarcinome sans autre indication chez 37 patients (24%) puis du carcinome mucoépidermoïde chez 16 patients (10,4%) et de l'adénocarcinome polymorphe de bas grade également chez 16 patients (10. 4%). Conclusion Les tumeurs malignes des glandes salivaires représentent un ensemble hétérogène de maladies de caractérisation complexe et de fréquence variable. PMID:25120861

Syndrome métabolique chez les patients hypertendus dans le service cardiologie du CHU Yalgado Ouedraogo de Ouagadougou, Burkina Faso

PubMed Central

Millogo, Georges Rosario Christian; Samandoulougou, André; Yaméogo, Nobila Valentin; Yaméogo, Aristide Relwendé; Kologo, Koudougou Jonas; Toguyeni, Jean Yves; Zabsonré, Patrice

2014-01-01

Introduction Le syndrome métabolique constitue de nos jours un véritable problème de santé publique. Le syndrome métabolique est le moteur d'une double épidémie mondiale de diabète type II et de maladies cardiovasculaires. L'objectif de notre étude est de décrire les aspects épidémiologiques, cliniques, para cliniques et évolutifs chez les hypertendus dans le service de Cardiologie du CHU Yalgado Ouédraogo. Méthodes Il s'agissait d'une étude rétrospective sur une période de deux ans dans le service de cardiologie chez les patients hypertendus ayant un syndrome métabolique. Résultats La fréquence du syndrome métabolique était de 17,5% des patients hypertendus. Le sex ratio était de 1,2. L’âge moyen des patients étaient de 56,1 ±10,7 ans. Les patients connus hypertendus étaient de 92,1% avec une durée moyenne d’évolution de l'HTA qui était de 8,7 ± 5,9 ans. Le suivi était irrégulier dans 60% cas et une rupture du traitement dans 37,1% des cas. La dyslipidémie était notée dans 84,2% des cas et le diabète dans 60,5% des cas. La PAS moyenne était de 184,3 ± 47,3 mmHg et la PAD moyenne était de 110,7 ± 27,7 mmHg. L'HTA était sévère dans 63,2% des cas. La glycémie moyenne était de 8,3 ± 4,3 mmol/L, le LDL cholestérol moyen était de 3,5 ± 1,0 mmol/L et le taux des triglycérides moyen était de 1,6 ± 1,1 mmol/L. L'HVG électrique était notée chez 76,3% des patients et échographique dans 58,8% des cas. Les atteintes viscérales étaient neurologique dans 44,5%, rénale dans 55,3% et cardiaque dans 31,2% des cas. Le nombre moyen d'antihypertenseurs était de 3,0 ± 1,0 et 76,3% ont reçu au moins une trithérapie antihypertensive. Le taux de mortalité était de 5,3%. Conclusion Le syndrome métabolique est une pathologie qui pose la problématique de la définition qui n'est pas consensuelle d'une part et d'autre part du contrôle de ses éléments constitutifs surtout l'HTA. PMID:25883718

Prise en charge des corps étrangers enclaves de l’œsophage: à propos de 36 cas

PubMed Central

Togo, Seydou; Ouattara, Moussa Abdoulaye; Li, Xing; Yang, Shang Wen; Koumaré, Sékou

2017-01-01

L'ingestion de corps étranger de l'œsophage est un motif fréquent de consultation aux urgences pédiatriques. Cependant le phénomène peut se retrouver à tous les âges. Les auteurs décrivent les caractéristiques cliniques, paracliniques et thérapeutiques des corps étrangers enclavés dans l'œsophage pris en charge à l'hôpital du Mali. Il s'agit d'une étude prospective, menée entre janvier 2011 et décembre 2014 incluant tous les cas d'ingestion de corps étrangers enclavés dans l'œsophage. Au total 36 patients ont été pris en charge par des moyens endoscopiques ou chirurgicaux. L'âge moyen était de 6 ans (extrêmes: 14 mois- 62 ans). Le sexe masculin était dominant avec un sexe ratio de 1,75. Les corps étrangers étaient bloqués dans le rétrécissement crico-pharyngien dans 69,45% des cas suivi du rétrécissement aortique dans 22,22% des cas. Le délai d'extraction du corps étranger en moyenne était de 7 heures 30. La fibroscopie rigide a permis l'extraction du corps étranger dans 88,89% des cas. Une chirurgie par thoracotomie a permis d'extraire le corps étranger dans 5,55%. Les corps étrangers de l'œsophage peuvent se retrouver à tout âge mais restent plus fréquent chez l'enfant. L'extraction endoscopique est la man'uvre la plus réalisée mais la chirurgie pour extraction d'un corps étranger bloqué dans l'œsophage bien que rare reste le dernier recours à cause souvent de leur nature et de la survenue des complications. Le meilleur moyen pour lutter contre ces accidents reste la prévention. PMID:28904731

Les instabilités antérieures de l’épaule:à propos de 73 cas

PubMed Central

Jamal, Louaste; Bousbaa, Hicham; Cherrad, Taoufik; Wahidi, Mohammed; Amhajji, Larbi; Rachid, Khalid

2016-01-01

Entre 2005 et 2014, 73patients (77 épaules) ont bénéficié d’une intervention de Latarjet pour instabilité antérieure de l’épaule. Nous avons, rétrospectivement, évalué les résultats cliniques et radiologiques de cette technique opératoire. L’intervention a été réalisée pour le traitement d’une luxation récidivante dans 69 cas, subluxation récidivante douloureuse dans 5 cas et 3 épaules douloureuses Tous les patients ont eu une évaluation radiographique avant l’intervention et lors du contrôle le plus récent. Selon le score de Rowe, 73 (94.8 %) des 77 épaules ont obtenu un résultat bon ou excellent. Au plus grand recul, 74 épaules étaient indemnes d’arthrose glénohumérale. PMID:27800066

La tuberculose cutanée: observation de six cas confirmés au CHU Souro SANOU (CHUSS) de Bobo-Dioulasso (Burkina Faso)

PubMed Central

Andonaba, Jean Baptiste; Barro-Traoré, Fatou; Yaméogo, Téné; Diallo, Boukary; Korsaga-Somé, Nina; Traoré, Adama

2013-01-01

La localisation cutanée de la maladie tuberculeuse demeure une forme rare et représente seulement 2,1% des localisations. L'objet de cette étude est de rapporter le profil épidémiologique, anatomoclinique et évolutif des cas de tuberculose ganglio-cutanée diagnostiqués dans un CHU au Burkina Faso. La fréquence de la tuberculose cutanée est très faible au CHUSS. Six cas ont été diagnostiqués entre 2004 et 2010, soit une fréquence de un cas par an. La durée d’évolution des cas allait de deux jusqu’à dix ans avant leur diagnostic. Les lésions observées étaient: trois scrofulodermes, trois gommes, une tuberculose testiculaire associée à un mal de Pott, un cas de polyadénopathies et des cicatrices atropho-rétractiles dans la plupart des cas. Sur le plan anatomopathologique, des granulomes tuberculoïdes ont été mis en évidence dans tous les cas avec une forte réaction tuberculinique à l'IDR. Sous antituberculeux pendant six mois, l’évolution a été bonne dans tous les cas mais au prix de séquelles cutanées cicatricielles inesthétiques. Son ampleur reste peut-être encore méconnue. Le renforcement du plateau technique du CHU et une bonne collaboration interdisciplinaire contribuerait à un meilleur diagnostic et prise en charge de cette affection. PMID:24648863

Le lupus systémique juvénile familial: à propos de deux familles

PubMed Central

Krich, Sanaa; Inani, Kawtar; Meziane, Mariame; Souilmi, Fatima Zohta; Atmani, Samir; Hida, Mustapha; Harmouch, Taoufik; Amarti, Afaf; Mernissi, Fatima Zohra

2015-01-01

Le lupus érythémateux systémique (LES) juvénile est une connectivite rare, d’évolution plus sévère que chez l'adulte. Les cas familiaux sont exceptionnels. Il s'agissait de deux familles (5 patients atteints), chez qui on a objectivé un LES juvénile chez deux sæurs âgées de 14 ans et 6 ans respectivement chez la première famille, deux frères, âgés de 20 ans et 6 ans respectivement plus une sæur âgée de 10 ans chez la deuxième famille. Dans tout les cas le diagnostic de lupus systémique a été posé selon les nouveaux critères du groupe du SLICC (Systemic Lupus International Collaborating Clinics). Tous les patients ont été mis sous photoprotection, dermocorticoïdes et antipaludéens de synthèse sauf dans deux cas où la corticothérapie a été administrée. L’évolution a été favorable après le traitement dans la majorité des cas. Nous rapportons ces cas afin de discuter les particularités épidémiologiques, physiopathologiques, cliniques, paracliniques et thérapeutiques. PMID:26301023

Cancers biliaires: aspects épidémiologiques cliniques et thérapeutiques à propos de 20 cas

PubMed Central

Ka, Ibrahima; Faye, Magatte; Diop, Papa Saloum; Faye, Amadou Bocar Niang Aliou Coly; Ndoye, Jean Marc; Fall, Babacar

2018-01-01

Les cancers des voies biliaires se répartissent en deux localisations principales: les cancers de la vésicule biliaire qui sont des adénocarcinomes et les cholangiocarcinomes de localisations intra et extra-hépatiques. Il s'agit étude rétrospective portant sur 20 cas de cancers biliaires entre Janvier 2006 et Octobre 2014 à la clinique chirurgicale de l'Hôpital Général de Grand- Yoff. Il s'agissait de 40% de cancer de la vésicule biliaire, 60% de cancer de la voie biliaire principale. Le sex-ratio était de 1. L'âge moyen de nos patients était de 58,1 ans. Le délai diagnostique moyen était de 3,77 mois. La symptomatologie était dominée par le syndrome ictérique et les douleurs de l'hypochondre droit. Tous les patients avaient présenté un syndrome de cholestase biologique. L'échographie abdominale a été réalisée dans 65% des cas, la TDM abdominale dans 85% des cas et L'IRM dans 35% des cas. Les formes avancées étaient prédominantes dans notre série (n=19).La majorité de nos patients a bénéficié d'une chirurgie palliative. Le geste le plus pratiqué était la dérivation biliaire chez 50% des patients. On notait une prédominance des cholangiocarcinomes. La morbidité opératoire globale était de 43,75%. La mortalité globale toutes localisations confondues était de 31,25%. La moyenne de survie est de 4 mois et demi. Les cancers des voies biliaires sont d'expression multiforme, se différenciant essentiellement en un cholangiocarcinome intra, extrahépatique et adénocarcinome de la vésicule biliaire dont l'évolution est globalement différente mais le pronostic spontanément mauvais. PMID:29662598

Résultats fonctionnels des lésions des tendons fléchisseurs de la main: à propos de 90 cas

PubMed Central

Boussakri, Hassan; Azarkane, Mohamad; Elidrissi, Mohamad; Shimi, Mohamad; Elibrahimi, Abdelhalim; Elmrini, Abdelmajid

2013-01-01

Les auteurs rapportent une série de 90 patients, présentant une section tendineuse des fléchisseurs de la main, et suivis avec un recul moyen de 8 mois (min: 2 mois; max: 13 mois). La lésion était localisée dans 12% des cas en zone I, 46% des cas en zone II, 2% en zone III et 25% des cas en zone IV et V. Pour le pouce (13 patients), 10 cas en zone T2 et 3 cas en zone T3. La technique opératoire utilisée était les sutures tendineuses en cadre de Kessler modifié, associée à un surjet épitendineux. Nous avons obtenus 54% de très bons résultats, 34% de résultats moyens et 12% de mauvais résultats. Pour le pouce les résultats semble moins bons avec un taux de résultats médiocre de 48%. Certes les chiffres de cette série sont moins bons que ceux des autres séries publiées dans la littérature. Les facteurs influençant les résultats sont d'abord l'utilisation d'immobilisation postopératoire systématique ainsi que le mécanisme d'agression, et la localisation à la zone II et au pouce. Les complications mécaniques sont représentées par 7% de rupture, toutes au niveau de pouce, et 31% des adhérences tendineuses (soit 30 cas), dont 19 en zone II, l'infections (22%) et 4% des cas d'algodystrophies. PMID:23847698

Reflux gastro œsophagiens du prématuré: à propos d'un cas

PubMed Central

Ndour, Daouda

2016-01-01

Le reflux gastro-œsophagien (RGO) est un problème fréquent en néonatologie. Le RGO est souvent incriminé dans diverses manifestations cliniques survenant chez le prématuré. Diverses réponses reflexes physiologiques fournissent un lien biologique possible entre le reflux gastro-œsophagien; l'apnée et les bradycardies du prématuré sans que lien de causalité ne soit clairement établi. En outre les explorations et le traitement proposés chez le prématuré présentant un reflux sont très discutés. Nous rapportons le cas d'un nouveau-né prématuré admis en soins intensifs néonatals et présentant des épisodes d'apnées et de bradycardies. L'examen clinique et les résultats des explorations étaient normaux. Le diagnostic de reflux gastro œsophagien compliqué d'apnée et de bradycardie a été retenu. Le diagnostic de RGO est difficile à confirmer malgré l'arsenal des examens complémentaires. Le traitement médicamenteux n'a pas montré de réel intérêt pour l'amélioration des symptômes et devrait être réservé aux formes sévères. Nous nous proposons à partir de ce cas clinique de faire une revue de la littérature pour une mise au point sur les différents aspects du problème. PMID:28293359

Le pronostic statural après une pseudo-puberté précoce par déficit en 11ß hydroxylase chez une fille de 7 ans: à propos d'un cas avec revue de la literature

PubMed Central

Latrech, Hanane; Gaouzi, Ahmed

2015-01-01

L'hyperplasie congénitale des surrénales par déficit en 11ß hydroxylase se voit dans 5 à 10% des cas et est diagnostiquée, habituellement, devant des signes de virilisation d'un nouveau né ou d'un fœtus 46 XX et plus tard devant une HTA avec une hypokaliémie. Le pronostic de taille chez ces patients est très souvent compromis. Nous rapportons le cas d'un déficit en 11ß hydroxylase chez une enfant âgée de 7 ans révélé par une pseudo- puberté précoce traitée par hydrocortisone. La survenue d'une puberté précoce centrale complique encore plus la situation par la mise en jeu du pronostic de taille finale et nécessitant une prise en charge thérapeutique particulière. PMID:26113905

Le syndrome d'embolie graisseuse post traumatique

PubMed Central

Berdai, Adnane Mohamed; Shimi, Abdelkarim; Khatouf, Mohammed

2014-01-01

Le syndrome d'embolie graisseuse est une complication grave des fractures des os longs, il est la conséquence de la dissémination des particules graisseuses dans la microcirculation. L'objectif de ce travail est de déterminer le profil épidémiologique, la présentation clinique et paraclinique de ce syndrome et sa prise en charge thérapeutique. Notre étude porte sur 11 cas de syndrome d'embolie graisseuse colligés au service de réanimation A1 au centre hospitalier universitaire Hassan II de Fès, de Janvier 2009 à Juin 2012. Le diagnostic positif est basé sur les critères de Gurd. Les cas collectés se caractérisent par la prédominance du sexe masculin, d'un âge inférieur à 40 ans, présentant une fracture fémorale. Ce syndrome survient souvent dans les 72 heures après le traumatisme. La présentation clinique est dominée par l'hypoxémie et les troubles de conscience. Sur le plan biologique: l'anémie et la thrombopénie sont les manifestations les plus fréquentes. La prise en charge est symptomatique, 63% des patients ont nécessité l'intubation et la ventilation. L’évolution n'est pas toujours bénigne. Nos résultats confirme le polymorphisme de la présentation clinique et paraclinique du syndrome d'embolie graisseuse. Le diagnostic de ce syndrome se base sur des critères cliniques, mais reste essentiellement un diagnostic d’élimination. La prise en charge est symptomatique. La prévention de ce syndrome est essentielle et se base sur une fixation précoce des fractures des os longs. PMID:25452829

Une urgence médico-chirurgicale rare: l’abcès épidural rachidien (à propos de 03 cas)

PubMed Central

Saqui, Abderrazzak El; Aggouri, Mohamed; Benzagmout, Mohamed; Chakour, Khalid; Chaoui, Mohamed El Faiz

2017-01-01

Les infections de l’espace épidural sont de mieux en mieux connues grâce au développement de la neurochirurgie, notamment l’IRM. Les abcès épiduraux rachidiens représentent une pathologie rare mais éminemment grave sur le plan fonctionnel, avec un risque vital potentiel. Nous rapportons trois cas d’abcès épidural rachidien tous diagnostiqués chez des patients de sexe masculin, le premier âgé de 52 ans le deuxième de 57 ans et le troisième de 63ans. Deux patients ont été admis aux urgences neurochirurgicales pour un tableau de compression médullaire lente évoluant dans un contexte infectieux, et le dernier se plaignait d’une sciatique S1 droite rebelle au traitement avec des fuites urinaires. Aucune porte d’entrée n’a été identifiée dans le bilan initial. Tous les patients ont été opérés par voie d’abord postérieure avec décompression médullaire/radiculaire et évacuation de l’abcès épidural. L’étude bactériologique a trouvé un germe pyogène justifiant une antibiothérapie adaptée dans les trois cas. L’évolution a été favorable dans deux cas. Par contre un patient est décédé trois jours en post-opératoire par un sepsis sévère. PMID:28533868

Le kyste hydatique du cordon spermatique: une localisation exceptionnelle

PubMed Central

Hamdane, Mohamed Moncef; Bougrine, Fethi; Msakni, Issam; Dhaoui-Ghozzi, Amen; Bouziani, Ammar

2011-01-01

L’ hydatidose est une anthropo-zoonose due au développement chez l'homme de la forme larvaire du taenia Echinococcus granulosis. La plupart des kystes hydatiques se localisent dans le foie et les poumons. Le kyste hydatique du cordon spermatique est extrêmement rare avec seulement 4 cas rapportés dans la littérature. Les auteurs rapportent dans cet article un nouveau cas d'hydatidose du cordon spermatique. Il s'agissait d'un homme de 40 ans qui consultait pour des douleurs scrotales évoluant depuis huit mois. L'examen clinique a mis en évidence une tuméfaction mobile, inguino-scrotale, droite. L’échographie testiculaire a objectivé une hernie inguinale droite associée à deux kystes épididymaires bilatéraux. Le patient a été opéré pour cure de son hernie avec découverte en per-opératoire d'un kyste du cordon spermatique qui a été réséqué. L'examen anatomopathologique a conclu à une hydatidose du cordon spermatique. PMID:22384304

Les masques trompeurs de la bipolarité: étude de 100 cas

PubMed Central

Nabih, Fadoua Oueriagli; Benali, Abdesslam; Adali, Imane; Manoudi, Fatiha; Asri, Fatima

2015-01-01

Le trouble bipolaire (TB) est une pathologie dont la prévalence est estimée à 1-2%. Le diagnostic précoce du trouble constitue un enjeu thérapeutique majeur. L'objectif de ce travail est de déterminer les différents diagnostiques attribués aux patients bipolaires avant de recevoir le diagnostic adéquat et de préciser le délai moyen du retard diagnostique. C'est une étude descriptive transversale portant sur 100 patients atteints de TB, inclus selon les critères du DSM V, qui ont été vus en consultation ou bien hospitalisés dans le service de psychiatrie de l'hôpital Militaire Avicenne de Marrakech, durant une période de deux ans. L’âge moyen des patients était de 29,5 ans avec une prédominance masculine (80%). 40% de nos patients ont reçu au début un autre diagnostic que celui du TB et le premier diagnostic retenu était celui de l’épisode dépressif majeur dans 36% des cas, suivi de l'accès psychotique aigu dans 28% des cas, la schizophrénie dans 16,8% et le trouble de personnalité dans 10,2%. Le délai moyen du retard diagnostic était de 64 mois. 50% des patients ayant reçu un autre diagnostic avaient consulté au moins un psychiatre et 60% des patients avaient été hospitalisés au moins une fois avant le diagnostic du TB. Les errances diagnostiques du TB sont bien établies, conduisant forcément à un retard de prise en charge adéquate. Ces données devraient alerter les psychiatres pour favoriser un meilleur dépistage de la manie et de l'hypomanie qui restent les éléments clé du diagnostic du TB. PMID:26587161

Spectra of Cas A's Highest Velocity Ejecta

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Fesen, Robert A.; Milisavljevic, Dan

2010-08-01

The young age and close distance of the Galactic supernova remnant Cassiopeia A (Cas A) make it perhaps our best case study and clearest look at the explosion dynamics of a core-collapse supernova (CCSN). Interestingly, Cas A exhibits two nearly opposing streams of high velocity ejecta or `jets' in its NE and SW regions racing outward at speeds more than twice that of the main shell. The nature of these jets, however, and their possible association with an aspherical supernova explosion mechanism is controversial. A handful of existing low-resolution spectra of outer knots in the NE jet display chemical abundances hinting at an origin from the S-Si-Ca- Ar rich layer deep inside the progenitor. If these abundances could be firmly established in both the NE and SW jets, it would be very strong evidence in support of a highly asymmetrical explosion engine for Cas A's progenitor and, in turn, for CCSNe in general. We request KPNO 4m telescope + MARS time to obtain high quality multi-object spectroscopy of Cas A's highest velocity ejecta to measure their nitrogen, sulfur, oxygen, calcium, and argon abundances. These spectra will be analyzed with the metal-rich shock models of J. Raymond and then compared to current sets of CCSN models paying particular attention to knot composition vs. ejection velocity and ejecta mixing.

Nutrition chez le brûlé

PubMed Central

Perro, G.

2016-01-01

Summary La nutrition est un challenge chez le brûlé, paradigme de l’agressé. Les points importants sont les apports entéraux précoces par sonde gastrique voire post pyloriques, la position proclive > 30°, la surveillance du transit et sa régulation par gastro ou entéro-kinétiques, la surveillance du poids, la quantification des apports avec supplémentation parentérale en cas de retard protéino énergétique. Chez l’enfant, l’adhésion à l’alimentation est difficile, de même que chez le senior, où une évaluation nutritionnelle initiale dépiste souvent une dénutrition préexistante. Les compléments alimentaires seront largement prescrits chez les patients de gravité intermédiaire. Les obèses bénéficieront d’un régime hypocalorique et hyperprotidique. Chez l’insuffisant rénal non dialysé il convient de limiter les apports en potassium. En cas brûlure périnéale, on peut proposer soit une constipation de courte durée, soit la mise en place d’un entéro-collecteur, les indications de colostomie étant devenues rares. Les apports entéraux sont difficiles à gérer en cas de décubitus ventral pour SDRA. Chez le brûlé grave de réanimation, l’accent doit plus être mis sur la qualité des nutriments que sur leur quantité. Les anciennes formules d’estimation calorique conduisaient à une surnutrition difficile à administrer et en général mal tolérée; la quantification mesurée par calorimétrie indirecte ou estimée par la formule de Toronto est bien plus adaptée. Plus récemment, l’instauration d’une immunonutrition (supplémentation en vitamines et oligo-éléments, glutamine, arginine, acide Ω 3 et contrôle raisonné de la glycémie) a été proposée pour réduire le stress oxydatif et l’inflammation provoqués par l’accident. PMID:27857647

La fibrose rétropéritonéale: à propos de 12 cas

PubMed Central

Majdoub, Aziz El; Khallouk, Abdelhak; Farih, Moulay Hassan

2017-01-01

La fibrose rétropéritonéale (FRP) est une maladie rare. Elle se caractérise par la transformation progressive du tissu adipeux rétopéritonéal en une masse fibreuse qui enserre l'aorte, la veine cave inférieure et les voies urinaires responsable d'une altération progressive de la fonction rénale. Le mode habituel de présentation de cette maladie comporte l'association de douleurs lombaires, d'une insuffisance rénale, et d'un syndrome inflammatoire biologique. Nous rapportons 12 cas de fibrose rétropéritonéale dont nous précisons les particularités cliniques, radiologiques et thérapeutiques. Il s'agit d'une étude rétrospective portant sur douze cas de fibrose rétropéritonéale colligés au service d'urologie au CHU Hassan II de Fès durant une période de 9 ans (2005-2013). Il s'agissait de dix hommes et deux femmes. La symptomatologie clinique était très variable, dominée par la douleur lombaire qui était présente chez tous les malades et une hydrocèle chez un patient. Les explorations biologiques avaient montré une insuffisance rénale chez tous les malades et un syndrome inflammatoire chez dix patients. Le diagnostic de la maladie était suspecté dans tous les cas sur les données de l'échographie qui a montré une obstruction de la voie excrétrice supérieure sans obstacle visible chez tous les malades, et confirmé par la TDM abdominale sans injection du produit de contraste qui objectivait une lésion tissulaire rétropéritonéale engainant les vaisseaux et les voies urinaires. Dans notre série, la fibrose rétropéritonéale était idiopathique dans neuf cas. Elle était péri anévrysmale chez deux malades, et post radiothérapie chez un malade. Tous nos patients avaient bénéficié d'un drainage urinaire par sonde urétérale double J. Sept malades avaient reçu une corticothérapie. Une amélioration clinique et biologique, avec disparition de la douleur et amélioration de l'état général, a été observée chez 6

Récidive de mélanome malin unguéal achromique: à propos d'un cas

PubMed Central

Benyass, Youssef; Chafry, Bouchaib; Koufagued, Kaldadak; Bouabid, Salim; Benchebba, Driss; Chagar, Belkacem

2015-01-01

Le mélanome malin unguéal représente 1,8 à 8,1% des mélanomes malins cutanés. Sa prise en charge s'adresse aujourd'hui aux praticiens de différentes spécialités. L'acte chirurgical initial est une étape incontournable du traitement curatif. La biopsie de la lésion doit être complète, afin de déterminer de façon exacte la profondeur de l'envahissement en cas de malignité. Nous rapportons un cas de mélanome malin achromique à localisation unguéal chez une femme. La chirurgie initiale consistait en une amputation transphalangienne proximale. L’évolution après deux ans était marquée par une récidive avec extension vers le carpe. Ayant subie une reprise chirurgicale avec une exérèse large. Le traitement des récidives est palliatif et vise à apporter un confort de vie au patient. Le principe du traitement fait appel à l'exérèse chirurgicale des lésions. Des alternatives thérapeutiques sont à l’étude. PMID:26977229

La tuberculose abdominale pseudo-tumorale

PubMed Central

El Barni, Rachid; Lahkim, Mohamed; Achour, Abdessamad

2012-01-01

Introduction L’objectif de ce travail est de rapporter cinq cas de tuberculose abdominale pseudo-tumorale afin d’en souligner les aspects diagnostiques et thérapeutiques. Cinq observations sont colligées dans le service de chirurgie générale de l’hôpital militaire Avicenne de Marrakech au cours de l’année 2007. Les aspects cliniques sont disparates. Ainsi, les auteurs ont noté un syndrome péritonéal dans un cas, une masse épigastrique dans un cas, une lésion suspect du sigmoïde dans un cas, une masse de la fosse iliaque droite dans un cas et une altération de l’état général avec fièvre dans le dernier cas. Un seul patient avaient bénéficié d’une biopsie scano-guidée et les quatre patients restants avaient été opérés. Une masse du méso côlon était notée dans le premier cas. Dans le second cas, l’aspect de la masse épigastrique et son siège avaient orienté vers une tumeur du grand omentum. Une localisation tuberculeuse péritonéale et sigmoïdienne avait été trouvée dans le troisième cas. Le diagnostic d’une tumeur du côlon droit était hautement suspect chez le patient séropositif qui avait présenté une péritonite post-opératoire et décédé à J + 3 dans un tableau de choc septique. Le siège et l’aspect nécrotique des lésions trouvées à la tomodensitométrie chez la seule patiente de l’étude avaient fait discuter en premier un lymphome. Même en l’absence d’antécédents de tuberculose pulmonaire, le diagnostic tuberculose abdominale pseudo-tumorale doit être évoqué surtout dans un pays d’endémie comme le notre et le recours à une laparotomie est justifié chaque fois que persiste un doute diagnostique ou en cas de complication. PMID:23330023

Kyste épidermoïde du testicule : Étude de cas

PubMed Central

Diarra, Alkadri; Elammari, Jalal Eddine; Kassogue, Amadou; El Fassi, Mohammed Jamal; Farih, My Hassan

2013-01-01

Résumé Le kyste épidermoïde (KE) du testicule est une tumeur bénigne rare. Le diagnostic peut être évoqué par l’échographie et l’IRM. En cas de lésion unique de petite taille, il est possible d’effectuer une chirurgie conservatrice. Ce traitement nécessite une confirmation anatomopathologique. Le présent article fait état de l’observation d’un patient de 34 ans ayant été admis en consultation d’urologie pour désir d’enfant. Le diagnostic de KE associé à une varicocèle gauche a été retenu. L’énucléation du kyste avec cure de varicocèle a été réalisée sans complications postopératoires. Une revue de la littérature nous a permis de mettre en évidence les différents aspects du KE du testicule et les méthodes thérapeutiques envisageables. PMID:24282476

Schwannome bénin du nerf grand sciatique, à propos de 2 cas

PubMed Central

Chahbouni, Mohammed; Eloukili, Issam; Berrady, Mohamed Ali; Lamrani, Moulay Omar; Kharmaz, Mohamed; Ismail, Farid; Mahfoud, Mustapha; El Bardouni, Ahmed; Berrada, Mohamed Saleh; El Yaacoubi, Mouradh

2014-01-01

Les tumeurs primitives des nerfs périphériques représentent 1 à 2% des tumeurs des tissus mous. Les schwannomes sont en règle des tumeurs isolées de taille modérée et de croissance lente. Il convient de distinguer le schwannomes bénin et le neurofibrome des tumeurs malignes survenant généralement au cours d'une maladie de Recklinghausen. L'IRM permet d'orienter le diagnostic en mettant en évidence une tumeur de même signal que le tissu musculaire. Le traitement idéal de ces tumeurs consiste en une énucléation chirurgicale avec dissection soigneuse des faisceaux nerveux avoisinants. Nous rapportons deux cas d'un schwannome bénin développé aux dépens du nerf grand sciatique. PMID:25489357

How type II CRISPR-Cas establish immunity through Cas1-Cas2-mediated spacer integration.

PubMed

Xiao, Yibei; Ng, Sherwin; Nam, Ki Hyun; Ke, Ailong

2017-10-05

CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) and the nearby Cas (CRISPR-associated) operon establish an RNA-based adaptive immunity system in prokaryotes. Molecular memory is created when a short foreign DNA-derived prespacer is integrated into the CRISPR array as a new spacer. Whereas the RNA-guided CRISPR interference mechanism varies widely among CRISPR-Cas systems, the spacer integration mechanism is essentially identical. The conserved Cas1 and Cas2 proteins form an integrase complex consisting of two distal Cas1 dimers bridged by a Cas2 dimer. The prespacer is bound by Cas1-Cas2 as a dual-forked DNA, and the terminal 3'-OH of each 3' overhang serves as an attacking nucleophile during integration. The prespacer is preferentially integrated into the leader-proximal region of the CRISPR array, guided by the leader sequence and a pair of inverted repeats inside the CRISPR repeat. Spacer integration in the well-studied Escherichia coli type I-E CRISPR system also relies on the bacterial integration host factor. In type II-A CRISPR, however, Cas1-Cas2 alone integrates spacers efficiently in vitro; other Cas proteins (such as Cas9 and Csn2) have accessory roles in the biogenesis phase of prespacers. Here we present four structural snapshots from the type II-A system of Enterococcus faecalis Cas1 and Cas2 during spacer integration. Enterococcus faecalis Cas1-Cas2 selectively binds to a splayed 30-base-pair prespacer bearing 4-nucleotide 3' overhangs. Three molecular events take place upon encountering a target: first, the Cas1-Cas2-prespacer complex searches for half-sites stochastically, then it preferentially interacts with the leader-side CRISPR repeat, and finally, it catalyses a nucleophilic attack that connects one strand of the leader-proximal repeat to the prespacer 3' overhang. Recognition of the spacer half-site requires DNA bending and leads to full integration. We derive a mechanistic framework to explain the stepwise spacer

Persistance de la veine cave supérieure gauche: à propos d'un cas

PubMed Central

Abidi, Kamel; Jellouli, Manel; Hammi, Yousra; Gargah, Tahar

2015-01-01

La persistance de la veine cave supérieure gauche (PVCSG) est une malformation congénitale rare et bénigne. Elle est souvent asymptomatique et sa découverte est dans la majorité des cas fortuite. Nous rapportons le cas d'un enfant chez lequel on découvre cette anomalie suite à une perte de connaissance. S.M, âgé de 9 ans, sans antécédents pathologiques notables, admis pour perte de connaissance de durée brève, sans mouvements anormaux toniques ou cloniques. L'examen physique à son admission est normal. L’électrocardiogramme est sans anomalies. La radiographie du thorax a montré un arc moyen gauche en double contour. Le Holter rythmique a montré des signes d'hyperréactivité vagale. L’échocardiographie trans-thoracique (ETT) a mis en évidence une dilatation nette du sinus coronaire et a éliminé la présence d'une cardiopathie. Une angio- IRM cardiaque a confirmé le diagnostic de PVCSG. Par ailleurs l'aorte thoracique a été normale dans ces différents segments. PMID:26664537

Diagnostic et prévalence du syndrome métabolique chez les diabétiques suivis dans un contexte de ressources limitées: cas du Burkina-Faso

PubMed Central

Marceline, Yaméogo Téné; Issiaka, Sombié; Gilberte, Kyélem Carole; Nadège, Rouamba; Macaire, Ouédraogo Sampawindé; Arsène, Yaméogo Aimé; Djingri, Lankoandé; Apollinaire, Sawadogo; Joseph, Drabo Youssouf

2014-01-01

Introduction Les conséquences du syndrome métabolique impliquent son diagnostic effectif pour une prise en charge globale des comorbidités dépistées. Objectif: Déterminer la capacité à diagnostiquer le syndrome métabolique en routine, sa prévalence chez les diabétiques, leurs connaissances et pratiques vis-à-vis du risque cardio-métabolique. Méthodes Il s'est agi d'une étude transversale auprès de 388 diabétiques au CHU de Bobo-Dioulasso. Les critères de la fédération internationale du diabète (2009) ont été utilisés. Résultats l’âge moyen était de 53,5±13,5 ans, le sex ratio de 0,7. L'obésité abdominale était présente dans 61,9% des cas; L'HTA l’était dans 56,4% des cas. La prescription du bilan lipidique a été documentée dans 55,4% des cas pour le HDL et 56,2% pour les triglycérides pour un taux de réalisation de 49,3% et 62,9%. Le taux de dépistage des critères lipidiques était de 26,8%. Un taux de HDL bas a été noté dans 46 cas (43,4%) et une hypertriglycéridémie dans 24 cas (17,6%). In fine, la prévalence du syndrome métabolique était de 48,9% (n = 190). Seuls 27,4% savaient que d'autres facteurs de risque cardiovasculaire pouvaient être associés au diabète et seulement 6,7% pratiquaient une activité physique régulière. Conclusion Malgré la faible contribution du laboratoire, le syndrome métabolique est fréquent parmi nos diabétiques. Les patients sont peu sensibilisés sur le risque vasculaire et la pratique d'une activité physique régulière reste faible. Un programme d’éducation adaptée contribuerait à un meilleur dépistage et à une prise en charge optimale des cas. PMID:25932077

How Type II CRISPR-Cas establish immunity through Cas1-Cas2 mediated spacer integration

PubMed Central

Xiao, Yibei; Ng, Sherwin; Nam, Ki Hyun; Ke, Ailong

2017-01-01

CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and the nearby cas (CRISPR-associated) operon establish an RNA-based adaptive immunity system in prokaryotes1–5. Molecular memory is created when a short foreign DNA-derived prespacer is integrated into the CRISPR array as a new spacer6–9. Whereas the RNA-guided CRISPR interference mechanism varies widely among CRISPR-Cas systems, the spacer integration mechanism is essentially identical7–9. The conserved Cas1 and Cas2 proteins form an integrase complex consisting two distal Cas1 dimers bridged by a Cas2 dimer in the middle6,10. The prespacer is bound by Cas1-Cas2 as a dual forked DNA, and the terminal 3′-OH of each 3′-overhang serves as an attacking nucleophile during integration11–14. Importantly, the prespacer is preferentially integrated into the leader-proximal region of the CRISPR array1,7,10,15, guided by the leader sequence and a pair of inverted repeats (IRs) inside the CRISPR repeat7,15–20. Spacer integration in the most well-studied Escherichia coli Type I-E CRISPR system further relies on the bacterial Integration Host Factor (IHF)21,22. In Type II-A CRISPR, however, Cas1-Cas2 alone integrates spacer efficiently in vitro18; other Cas proteins (Cas9 and Csn2) play accessory roles in prespacer biogenesis17,23. Focusing on the Enterococcus faecalis Type II-A system24, here we report four structure snapshots of Cas1-Cas2 during spacer integration. EfaCas1-Cas2 selectively binds to a splayed 30-bp prespacer bearing 4-nt 3′-overhangs. Three molecular events take place upon encountering a target: Cas1-Cas2/prespacer first searches for half-sites stochastically, then preferentially interacts with the leader-side CRISPR repeat and catalyzes a nucleophilic attack that connects one strand of the leader-proximal repeat to the prespacer 3′-overhang. Recognition of the spacer half-site requires DNA bending and leads to full integration. We derive a mechanistic framework explaining

Une étude rétrospective sur l'incidence de l'insuffisance rénale chronique dans le service de Médecine Interne et Néphrologie du Centre Hospitalier Universitaire d'Antananarivo

PubMed Central

Ramilitiana, Benja; Ranivoharisoa, Eliane Mikkelsen; Dodo, Mihary; Razafimandimby, Evanirina; Randriamarotia, Willy Franck

2016-01-01

L'insuffisance rénale chronique est un problème de santé publique au niveau mondial. Dans les pays développés, cette affection survient essentiellement chez les sujets âgés, mais en Afrique, elle s'installe plutôt chez les sujets jeunes actifs. C'est une affection de lourde prise en charge dans un pays à faible revenu à cause de ses coûts. Notre but est de décrire les aspects épidémiologiques des nouveaux cas d'insuffisance rénale chronique à Madagascar. Il s'agit d'une étude rétrospective descriptive de 3 ans partant du 1er janvier 2007 au 31 décembre 2009 dans le service de Médecine Interne et Néphrologie du Centre Hospitalier Universitaire d'Antananarivo portant sur 239 patients diagnostiqués comme une insuffisance rénale chronique. L'incidence était de 8,51% parmi les patients hospitalisés dans le service. L’âge moyen des patients était de 45,4 ans avec des extrêmes de 16 et 82 ans et un sex-ratio de 1,46. Le principal antécédent était l'hypertension artérielle (59,8%). L'insuffisance rénale chronique était terminale dans 75,31% des cas (n=180). Les causes de l'insuffisance rénale chronique étaient dominées par la glomérulonéphrite chronique (40,1%), la néphroangiosclérose (35,5%). L'hémodialyse était réalisée chez 3 patients (1,26%), aucun patient n’était pas programmé pour une greffe rénale. Le taux de mortalité dans le service était de 28,87%. L'insuffisance rénale chronique est une maladie de pronostic redoutable et handicapante qui affecte les sujets jeunes à Madagascar. Son traitement reste inaccessible dans la majorité des patients. L'accent doit donc être mis principalement sur la prévention notamment une bonne prise en charge précoce des infections, de l'hypertension artérielle et du diabète pour réduire ses impacts négatifs sur la santé communautaire et publique. Le projet de la transplantation rénale - donneur vivant, traitement efficace et moins coûteux par rapport à l

Aspects épidémiologiques des traumatismes du rachis: à propos de 139 cas

PubMed Central

Bemora, Joseph Synèse; Rakotondraibe, Willy Francis; Ramarokoto, Mijoro; Ratovondrainy, Willy; Andriamamonjy, Clément

2017-01-01

Les traumatismes du rachis représentent une des lésions les plus fréquemment observées, chez les victimes d’accidents de circulation, d’accident de sportifs, domestique et du travail. Il s’agissait d’une étude rétrospective de 3 ans portant sur 139 cas de traumatismes du rachis hospitalisés et pris en charge dans le service de neurochirurgie du CHUJRA Madagascar. A travers cette étude, 25,17% des traumatisés étaient entre 21 et 30 ans avec une nette prédominance masculine de 69,78% (sexe ratio 2,3). L’étiologie était dominéepar la chute dans 33,09% des cas avec des facteurs de risque dont prise d’alcool (8,63%). Le traumatisme entrait dans le cadre d’un polytraumatisme dont un traumatisme crânien dans 34,63%. Les patients étaient admis dans le service 1 à 5h après le traumatisme dans 31,65% en utilisant comme moyen de transport une voiture personnelle dans 36,69%. Pendant l’hospitalisation 20 patients ont signé une décharge et 6,34% des patients sont décédés. Les traumatismes du rachis posent un problème de santé publique avec une prise en charge lourde surtout pour les patients déficitaires à vie. Devant tout traumatisme du rachis, il faut rechercher systématiquement une lésion crânienne. PMID:28450995

Encéphalopathie pancréatique: à propos de deux cas

PubMed Central

Doghmi, Nawfal; Benakrout, Aziz; Meskine, Amine; Bensghir, Mustaphja; Baite, Abdelouah; Haimeur, Charki

2016-01-01

L'encéphalopathie pancréatique, est une complication rare de la pancréatite aiguë, notre étude porte sur 02 cas d'encéphalopathie pancréatique, hospitalisés et traités au sein du service de Réanimation chirurgicale de l'Hôpital Militaire d'Instruction Mohamed V de Rabat. L'âge des patients était compris entre 43 ans et 54 ans, nos 02 cas sont repartis en une femme et un homme. Le mécanisme physiopathologique de l'EP n'est pas encore bien élucidé, de nombreuses hypothèses ont été rapportées dans la littérature, certains auteurs suggèrent que la lipase et la Phospholipase A2 jouent un rôle dans le processus pathologique de l'EP. D'autres facteurs tels que les infections, les troubles hydroélectrolytiques, l'hypoxémie et la perturbation de la glycémie, peuvent être déclencheurs. Le diagnostic de l'encéphalopathie pancréatique est facile à établir, la symptomatologie clinique se résume le plus souvent à une confusion, avec stupeur, et agitation psychomotrice, Il s'y ajoute parfois des atteintes neurologiques comme des convulsions, une céphalée, des hémiparésies passagères, une dysarthrie, enfin des difficultés d'expression verbale et une amnésie. Les examens paracliniques, notamment L'IRM cérébrale et l'électroencéphalogramme, permettent de confirmer le diagnostic. Le traitement est d'abord symptomatique, il a comme objectif de lutter contre les facteurs qui favorisent l'apparition des signes neurologiques par les mesures de réanimation que réclame la gravité de la situation. L'évolution de l'EP est le plus souvent favorable, avec une disparition progressive des symptômes, cependant la persistance de quelques séquelles, est décrite dans la littérature. Le pronostic est fonction de la gravité de la pancréatite aigüe et des complications associées. Dans notre étude les données sont globalement comparables à celles publiées actuellement par la majorité des auteurs. PMID:28292109

Parotidite aigue néonatale suppurative: à propos de trois cas cliniques avec revue de la littérature

PubMed Central

Isfaoun, Zineb; Radouani, Mohammed Amine; Azzaoui, Sihame; Knouni, Houria; Aguenaou, Hassan; Barkat, Amina

2016-01-01

Cet article fait mention de trois cas de parotidite bactérienne néonatale observés pendant une période de sept mois. Ce diagnostic est souvent clinique: on retrouve classiquement hyperthermie, tuméfaction, érythème, chaleur ainsi que sensibilité locale et écoulement purulent au niveau du canal de Sténon lors du massage de la parotide. Le diagnostic clinique est confirmé par échographie et culture de la sécrétion parotidienne purulente. Elles sont le plus souvent d’origine nosocomiale, favorisées par la prématurité et la déshydratation. Traitées précocement, leur évolution est favorable. Les risques liés à l’âge doivent faire débuter une antibiothérapie empirique puis fonction de l'examen direct du pus extrait du canal de Sténon. On isole le plus communément le Staphylocoque aureus; le Streptocoque Viridans et les germes anaérobies. Les parotidites aigues sont très rares en période néonatale: moins de 50 cas ont été rapportés dans la littérature. Nous rapportons trois observations assez particulières. Le diagnostic avait été suspecté sur les signes inflammatoires locaux. PMID:28154641

Fibre optique à la maison en Pays de Gex et de Bellegarde

DOE Office of Scientific and Technical Information (OSTI.GOV)

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2010-05-19

Le Syndicat Intercommunal d’Electricité de l’Ain(SIEA) déploie un réseau FTTH (Fiber To The Home) de fibres optiques dans le département de l’Ain vers l’ensemble des habitations. Le déploiement sur la zone pilote du Pays de Gex et du Bassin Bellegardien arrive dans la phase terminale vers les habitations. Le SIEA présentera ses activités, l’état du développement du réseau, les implications d’une connexion fibre optique et les procédures d’abonnement. La présentation sera donnée en Français. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Public conference "Optical fiber To The Home in Pays de Gex et de Bellegarde" Michel Chanel et Jean Paul Goy (SIEA) Wednesday, 19th May at 11.30more » hrs., Council Chamber, CERN The ‘’ Syndicat Intercommunal d’Electricité de l’Ain’’(SIEA) is deploying an optical fiber network FTTH (Fiber To The Home) in the Ain department towards the ensemble of houses. The installation on the pilot areas of Pays de Gex and Bassin Bellegardien is arriving in the phase of connecting houses. The SIEA will show its activities, the state of the network development, the implications of an optical fiber connection and the contract procedures. The presentation will be given in French« less

Apport de la biopsie radioguidée dans le diagnostic histopathologique des tumeurs de l'enfant: expérience de l'Hôpital d'Enfant de Rabat

PubMed Central

El Ochi, Mohamed Réda; Bellarbi, Salma; Rouas, Lamiae; Lamalmi, Najat; Malihy, Abderrahmane; Alhamany, Zaitouna; Cherradi, Nadia

2015-01-01

La biopsie radioguidée constitue une alternative à la biopsie chirurgicale invasive et à la cytologie pour le diagnostic des tumeurs pédiatriques. L'intérêt de notre étude est d’évaluer la valeur diagnostique des biopsies radioguidées examinées au laboratoire d'anatomopathologie de l'hôpital d'Enfants de Rabat (HER). L’étude a porté sur 78 biopsies radioguidées recueillies dans notre laboratoire entre janvier 2008 et décembre 2011. l’âge moyen des patients était de 5 ans et 10 mois avec une prédominance masculine (65,4%). La tumeur était abdominale dans 80% des cas, thoracique dans 15% cas, thoracique et abdominale dans 2,5% et sacrée dans 1,2%. Les biopsies étaient écho-guidées dans 90% des cas et scannoguidées dans 10% des cas. Le diagnostic histopathologique était posé dans 89% des cas. L'immuno-histochimie a été indiquée dans 35% des cas. Les diagnostics les plus fréquents étaient: tumeurs neuroblastiques (42 cas), lymphomes non hodgkiniens (10 cas), rhabdomyosarcomes (6 cas), autres (sarcome d'Ewing, néphroblastomes, tumeur myofibroblastique inflammatoire, maladies de Hodgkin, leucémie aiguë, hépatoblastome et ostéosarcome). Dans notre série, la biopsie radioguidée a permis un diagnostic histopathologique certain dans 89% des cas. Elle nécessite une étroite collaboration entre clinicien, radiologue et anatomopathologiste pour discuter son indication, afin de diminuer le nombre de biopsies peu ou non représentatives. PMID:26587165

Transforming plant biology and breeding with CRISPR/Cas9, Cas12 and Cas13.

PubMed

Schindele, Patrick; Wolter, Felix; Puchta, Holger

2018-04-30

Currently, biology is revolutionized by ever growing applications of the CRISPR/Cas system. As discussed in this Review, new avenues have opened up for plant research and breeding by the use of the sequence-specific DNases Cas9 and Cas12 (formerly named Cpf1) and, more recently, the RNase Cas13 (formerly named C2c2). Although double strand break-induced gene editing based on error-prone nonhomologous end joining has been applied to obtain new traits, such as powdery mildew resistance in wheat or improved pathogen resistance and increased yield in tomato, improved technologies based on CRISPR/Cas for programmed change in plant genomes via homologous recombination have recently been developed. Cas9- and Cas12- mediated DNA binding is used to develop tools for many useful applications, such as transcriptional regulation or fluorescence-based imaging of specific chromosomal loci in plant genomes. Cas13 has recently been applied to degrade mRNAs and combat viral RNA replication. By the possibility to address multiple sequences with different guide RNAs and by the simultaneous use of different Cas proteins in a single cell, we should soon be able to achieve complex changes of plant metabolism in a controlled way. © 2018 Federation of European Biochemical Societies.

Le schwannome malin du nerf grand sciatique chez l'enfant

PubMed Central

Lechqar, Maryem; Elbiache, Imad; Atarraf, Karima; Bouabdellah, Youssef; Afifi, My Abderahman

2012-01-01

Le schwannome malin est une tumeur très rare chez l'enfant (1 à 2% des tumeurs des tissus mous), elle se développe au dépend des cellules de schwanne. Dans ce travail, les auteurs rapportent un cas de schwannome malin développé au dépend du nerf grand sciatique. La radiographie de la cuisse de face et de profil était normale. L'imagerie par résonance magnétique a identifié une lésion le long du trajet du nerf grand sciatique. La tumeur a été réséquée en totalité emportant le nerf grand sciatique. L'examen anatomo-pathologique a confirmé le diagnostic. PMID:23133710

Griffe cubitale d'origine lépreuse traitée par transfert tendineux de Lasso Zancolli: à propos d'un cas

PubMed Central

El Alaoui, Adil; Sbiyaa, Mouhcine; Bah, Aliou; Rabhi, Ilyas; mezzani, Amine; Marzouki, Amine; Boutayeb, Fawzi

2015-01-01

La lèpre est une maladie infectieuse due à une mycobactérie (M. Leprae, Bacille de Hansen, ou BH) dont le tropisme nerveux est destructeur pour les cellules de Schwann. La localisation préférentielle des neuropathies tronculaire secondaire à la lèpre restent dominé par les zones ou les troncs nerveux traversent les défilés ostéo-ligamentaires inextensibles comme le défilé rétro-épitrochléen ou passe le nerf ulnaire. De nombreux travaux ont été consacrés à la souffrance nerveuse secondaire à la lèpre et surtout l'atteinte du nerf ulnaire qui se manifeste par une griffe des doigts. Le traitement dans ce cas est palliatif et fait appel à plusieurs techniques décrites dans la littérature. Nous rapportons dans ce travail un cas de griffe cubitale chez un patient lépreux traité par transfert tendineux de Lasso Zancolli. PMID:26985277

Hypertension artérielle pulmonaire au cours de la sclérodermie: à propos de 12 cas

PubMed Central

Diao, Maboury; Ndiaye, Mouhamadou Bamba; Kane, Adama; Bodian, Malick; Tchintchui, Nadége Christelle; Mbaye, Alassane; Mounir Dia, Mouhamadoul; Sarr, Moustapha; Kane, Assane; Abdou Ba, Serigne

2012-01-01

Introduction La survenue de l’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP) est un tournant dans l’évolution de la sclérodermie. L’objectif de cette étude est de décrire les aspects épidémiologiques et évolutifs de l’HTAP au cours de la sclérodermie systémique. Méthodes Nous avons réalisé une étude descriptive concernant des patients suivis pour sclérodermie systémique, au service de Dermatologie de l’hôpital Aristide Le Dantec entre Janvier 2000 et Août 2009. Ces patients étaient inclus dans l’étude après exploration cardio-vasculaire (ECG, échocardiographie-Doppler). Nous avons étudié les paramètres épidémiologiques, cliniques, paracliniques et évolutifs des patients. Résultats Nous avons enregistré 12 cas d’hypertension artérielle pulmonaire parmi les 83 patients atteints de sclérodermie systémique soit une prévalence de 14,45%. L’âge moyen des patients était de 43,58 ans±12,5 ans et le sex-ratio (H/F) de 0,33. Sur le plan clinique, la dyspnée était quasi constante (75%) et la douleur thoracique présente dans 25% des cas. Le syndrome de Raynaud était observé chez 8 patients soit 66,67% de nos patients. L’électrocardiogramme montrait des signes de surcharge droite chez 4 malades (33,33%) et la radiographie thoracique en faveur d’une fibrose pulmonaire chez 4 patients. L’échocardiographie-Doppler notait une insuffisance tricuspide importante dans 58, 33% des cas (7 patients), une pression artérielle pulmonaire systolique (PAPs) en moyenne de 66,25±29,3 mmHg, une dilatation des cavités cardiaques droites dans 5 cas et un mouvement paradoxal du septum interventriculaire chez 3 malades (33,33%). Il était également noté 3 cas (25%) d’épanchement péricardique. Nous avons déploré 4 décès (33,33%). Conclusion L’hypertension artérielle pulmonaire est une complication fréquente et grave de la sclérodermie. Son dépistage, grâce à l’échocardiographie-Doppler systématique, constitue une �

Textilome abdominal: à propos d'un cas

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Serghini, Issam; El Fikri, Abdelghani; Salim Lalaoui, Jaafar; Zoubir, Mohamed; Boui, Mohammed; Boughanem, Mohamed

2011-01-01

Le textilome est une complication postopératoire très rare mais bien connue. Il peut s'agir d'un corps étranger composé de compresse(s) ou champ(s) chirurgicaux laissés au niveau d'un foyer opératoire. La découverte du textilome abdominale est généralement tardive. L'anamnèse est donc essentielle pour diagnostic vu que la clinique n'est pas concluante. La clinique associe des troubles chroniques du transit à des syndromes sub-occlusifs, le cliché d'abdomen sans préparation est peu contributif. L’échographie est fiable. La tomodensitométrie permet un diagnostic topographique précis. Certaines équipes proposent des explorations par IRM. Nous rapportons un cas de textilome intra abdominale, chez une patiente opérée 6 mois auparavant d'un fibrome utérin. PMID:22355422

Considérations nosographiques sur le délire d'infestation parasitaire à travers trois observations cliniques

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Berhili, Nabil; Bout, Amine; Hlal, Hayat; Aarab, Chadya; Aalouane, Rachid; Rammouz, Ismail

2016-01-01

Le syndrome d'Ekbom, ou délire d'infestation parasitaire, est une pathologie rare, caractérisée par la conviction inébranlable d'avoir une peau infestée d'insectes ou de parasites. Il s'agit d'un délire monothématique à mécanisme hallucinatoire qui touche typiquement les femmes d’âge avancé. Nous rapportons les cas de trois patients qui présentent un délire d'infestation parasitaire dans des contextes cliniques différents. Le premier patient souffre d'un délire d'infestation isolé correspondant à la forme décrite par Karl Ekbom. Le deuxième cas présente un délire d'infestation secondaire, s'inscrivant dans le cadre d'une leuco-encéphalopathie de type CADASIL. Enfin, le troisième patient se présente dans un tableau évocateur d'un épisode dépressif avec une caractéristique psychotique qui intègre le délire d'infestation. Ces trois vignettes cliniques illustrent parfaitement le caractère trans-nosographique de ce syndrome ainsi que les difficultés de prise en charge de ces patients, tant au niveau de l'alliance thérapeutique que sur le plan des choix en matière de traitement pharmacologiques. PMID:27642468

Adenomyose utérine, étude clinique et thérapeutique: à propos de 87 cas

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Kdous, Moez; Ferchiou, Monia; Zhioua, Fethi

2015-01-01

Le but de notre étude est l'analyse des différents aspects épidémiologiques, cliniques, paracliniques et thérapeutiques de l'adénomyose. Il s'agit d'une étude rétrospective sur 87 patientes ayant bénéficié d'une hystérectomie pour des raisons diverses (hors prolapsus) entre le 1er janvier 2000 et 31 décembre 2006 et dont l’étude histologique de la pièce opératoire a révélé la présence d'adénomyose. 586 hystérectomies (hors prolapsus) ont été réalisées pendant la même période d’étude, soit une fréquence de l'adénomyose sur pièce opératoire de 14.85%. L'age moyen de nos patientes est de 43.97 ans (extrêmes: 26-64 ans). 29.88% d'entres-elles sont ménopausées et 41.37% avaient des antécédents de traumatisme utérin. La symptomatologie a été dominée par les ménometrorragies (82.77%) et les douleurs pelviennes (71.22%). Le diagnostic préopératoire a été suspecté sur les données de l'hystéroscopie dans 63.22% des cas, de l'hystérographie dans 58.46% des cas et de l’échographie transvaginale dans 40.5% des cas. Une chirurgie radicale a été indiquée de première intention dans 57 cas, après échec du traitement médical dans 16 cas et après échec d'une réduction endométriale dans 14 cas. L'analyse histologique des pièces d'hystérectomie trouve des myomes associés dans 32.18% des cas, une hyperplasie de l'endomètre dans 13.79%, des polypes dans 5.74% et une atrophie de l'endomètre dans 3.44%. L'adénomyose, maladie énigmatique, échappe toujours à une stratégie thérapeutique bien codifiée, et demeure étroitement liée à l'hystérectomie. Son dépistage chez des femmes de plus en plus jeunes et à des stades moins avancés pourrait éviter l’évolution systématique vers les traitements radicaux. PMID:26834926

Fibre optique à la maison en Pays de Gex et de Bellegarde

ScienceCinema

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2017-12-09

Le Syndicat Intercommunal d’Electricité de l’Ain(SIEA) déploie un réseau FTTH (Fiber To The Home) de fibres optiques dans le département de l’Ain vers l’ensemble des habitations. Le déploiement sur la zone pilote du Pays de Gex et du Bassin Bellegardien arrive dans la phase terminale vers les habitations. Le SIEA présentera ses activités, l’état du développement du réseau, les implications d’une connexion fibre optique et les procédures d’abonnement. La présentation sera donnée en Français. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Public conference "Optical fiber To The Home in Pays de Gex et de Bellegarde" Michel Chanel et Jean Paul Goy (SIEA) Wednesday, 19th May at 11.30 hrs., Council Chamber, CERN The ‘’ Syndicat Intercommunal d’Electricité de l’Ain’’(SIEA) is deploying an optical fiber network FTTH (Fiber To The Home) in the Ain department towards the ensemble of houses. The installation on the pilot areas of Pays de Gex and Bassin Bellegardien is arriving in the phase of connecting houses. The SIEA will show its activities, the state of the network development, the implications of an optical fiber connection and the contract procedures. The presentation will be given in French

Alacrymie congénitale révélant un syndrome d'Allgrove: à propos de trois cas

PubMed Central

Derrar, Rajae; Boutimzine, Nourredinne; Laghmari, Amina; Alouane, Amal; Daoudi, Rajae

2015-01-01

Le syndrome d'Allgrove ou triple A syndrome est une affection autosomique récessive constatée chez la population pédiatrique, associant dans sa forme complète: Achalasie œsophagienne, Alacrymie, maladie d'Addison (insuffisance surrénale), une dégénérescence neurologique et occasionnellement une instabilité du système autonome. Nous rapportons les cas de 3 enfants issus de mariages consanguins, chez qui l'examen ophtalmologique a révélé une sécheresse sévère avec dans deux cas une kératite envahissant l'axe visuel, ainsi qu'une paresse du reflexe photomoteur. Le bilan radiologique: transit œsogastroduodénal (TOGD) et fibroscopie œsogastroduodénale (FOGD) a révélé un mégaoesophage associé dans un cas à une œsophagite. Un traitement à base de larmes artificielles est instauré aussitôt, ainsi qu'un traitement chirurgical par voie laparoscopique. La connaissance de cette pathologie permettra une prise de conscience de la gravité de cette maladie en plus de suggérer sa prise en charge. PMID:26185551

Radionécrose cérébrale chez des patients irradiés pour cancers du nasopharynx: à propos de 3 cas

PubMed Central

El Mazghi, Abderrahman; Lalya, Issam; Loukili, Kaoutar; El Kacemi, Hanan; Kebdani, Taieb; Hassouni, Khalid

2014-01-01

La radionécrose cérébrale est une complication tardive, iatrogène, relativement rare de la radiothérapie qui survient après plus de six mois suivant le début du traitement. Elle pourrait s'expliquer par la conjonction de lésions vasculaires, gliales et d'ordre immunologiques. Elle peut mettre en jeu le pronostic fonctionnel et vital du malade. La prévention de cette affection redoutable est fondamentale vu l'absence de traitement potentiellement efficace. Nous rapportons 03 nouveaux cas, chez des patients traités par chimiothérapie d'induction puis radio- chimiothérapie concomitante pour des cancers localement avancés du nasopharynx. Le diagnostic a été orienté par l'IRM spectroscopique et l’évolution était favorable sous corticothérapie dans les 03 cas. PMID:25722784

Facteurs associés à la tuberculose chez l'enfant au Centre Hospitalier Universitaire Mère-Enfant de Tsaralalàna, Antananarivo: une étude cas-témoins

PubMed Central

Randriatsarafara, Fidiniaina Mamy; Vololonarivelo, Barbara Elyan Edwige; Rabemananjara, Nambinina Nirina Gaby; Randrianasolo, Jean Baptiste Olivier; Rakotomanga, Jean de Dieu Marie; Randrianarimanana, Vahiniarison Dieudonné

2014-01-01

Introduction A Madagascar, la tuberculose reste un problème de santé publique majeur, l'incidence s’élevant à 16% depuis 2009. Le présent travail a pour objet d'identifier les facteurs de risque de tuberculose chez l'enfant. Méthodes Nous avons mené une étude rétrospective de type cas-témoins sur les facteurs de risque de la tuberculose chez les enfants de 0 à 15 ans au Centre Hospitalier Universitaire Mère-Enfant de Tsaralalàna, de Janvier 2009 à Décembre 2011. Les enfants diagnostiqués de tuberculose dont le diagnostic a été retenu par des éléments de certitude ou par le score pédiatrique de la tuberculose représentent les cas. Les enfants hospitalisés durant la même période, non tuberculeux et de même âge, sont classés témoins. L'Odds Ratio quantifie les associations. Résultats Au total, 91 cas et 173 témoins ont été inclus. Parmi les cas, 73,62% présentent une malnutrition. De fortes associations sont démontrées avec: la malnutrition sévère (OR=6 (IC95% 2,43-15,61 (p<10-5))); le contage tuberculeux (OR=4,71 (IC95% 1,76-12,7 (p=0,003))); la non vaccination par le BCG (OR=4,21 (IC95% 1,99-8,99 (p < 2.10-5))); le niveau intellectuel maternel bas (OR=4,17 (IC95% 0,67-28,14 (p=0,06))); la taille de la fratrie à partir de 5 (OR=4,5). Des associations faibles sont retrouvées pour les autres facteurs étudiés. Les cas présentent une létalité de 18,7% contre 6,3% chez les témoins (p<10-5); 64,7 % des décès sont dus aux formes méningées. Conclusion La tuberculose reste un fléau chez les enfants, avec une lourde responsabilité de la pauvreté rassemblant presque tous les facteurs sus-cités. PMID:25838852

Cas9 specifies functional viral targets during CRISPR-Cas adaptation.

PubMed

Heler, Robert; Samai, Poulami; Modell, Joshua W; Weiner, Catherine; Goldberg, Gregory W; Bikard, David; Marraffini, Luciano A

2015-03-12

Clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR) loci and their associated (Cas) proteins provide adaptive immunity against viral infection in prokaryotes. Upon infection, short phage sequences known as spacers integrate between CRISPR repeats and are transcribed into small RNA molecules that guide the Cas9 nuclease to the viral targets (protospacers). Streptococcus pyogenes Cas9 cleavage of the viral genome requires the presence of a 5'-NGG-3' protospacer adjacent motif (PAM) sequence immediately downstream of the viral target. It is not known whether and how viral sequences flanked by the correct PAM are chosen as new spacers. Here we show that Cas9 selects functional spacers by recognizing their PAM during spacer acquisition. The replacement of cas9 with alleles that lack the PAM recognition motif or recognize an NGGNG PAM eliminated or changed PAM specificity during spacer acquisition, respectively. Cas9 associates with other proteins of the acquisition machinery (Cas1, Cas2 and Csn2), presumably to provide PAM-specificity to this process. These results establish a new function for Cas9 in the genesis of prokaryotic immunological memory.

Prévention de la transmission mère-enfant du VIH/sida au Bénin: le consentement des femmes au dépistage est-il libre et éclairé ?

PubMed Central

Kêdoté, N.M.; Brousselle, A.; Champagne, F.; Laudy, D.

2016-01-01

Résumé Introduction Dans les politiques internationales et nationales sur le VIH/sida, le consentement libre et éclairé est reconnu comme une composante essentielle des programmes de dépistage. Le consentement libre et éclairé implique pour les femmes enceintes d’obtenir des informations sur le programme de prévention de la transmission du VIH de la mère à l’enfant (PTME), de les comprendre et de faire un choix autonome après avoir évalué les risques et avantages. Cependant, aucune évaluation du programme de PTME ne s’est intéressée au consentement. L’objectif de cet article est d’explorer le caractère libre et éclairé du consentement des femmes enceintes quant au dépistage et à leurs motivations à faire le test. Méthode Nous avons utilisé des données récoltées dans le cadre d’une analyse d’implantation du programme de PTME au Bénin. Cette analyse s’appuie sur un devis d’étude de cas multiples incluant six maternités choisies parmi les 56 sites fonctionnels. Spécifiquement pour l’analyse du consentement, nous avons associé les données provenant d’une enquête à celles d’une recherche qualitative. Résultats Hormis trois cas de dépistage à l’insu, le caractère volontaire du consentement au test est respecté sur les sites de PTME. Vingt-neuf cas de refus ont été identifiés. Les raisons les plus souvent évoquées par les femmes enceintes sont la peur du résultat positif et de ses conséquences sur la vie familiale dans 55,2 % des cas et l’attente de l’accord ou du désaccord du mari dans 27,6 % des cas. Si globalement le consentement a été volontaire sur tous les sites, son caractère éclairé est moins probant. PMID:27840660

Phylogeny of Cas9 determines functional exchangeability of dual-RNA and Cas9 among orthologous type II CRISPR-Cas systems

PubMed Central

Fonfara, Ines; Le Rhun, Anaïs; Chylinski, Krzysztof; Makarova, Kira S.; Lécrivain, Anne-Laure; Bzdrenga, Janek; Koonin, Eugene V.; Charpentier, Emmanuelle

2014-01-01

The CRISPR-Cas-derived RNA-guided Cas9 endonuclease is the key element of an emerging promising technology for genome engineering in a broad range of cells and organisms. The DNA-targeting mechanism of the type II CRISPR-Cas system involves maturation of tracrRNA:crRNA duplex (dual-RNA), which directs Cas9 to cleave invading DNA in a sequence-specific manner, dependent on the presence of a Protospacer Adjacent Motif (PAM) on the target. We show that evolution of dual-RNA and Cas9 in bacteria produced remarkable sequence diversity. We selected eight representatives of phylogenetically defined type II CRISPR-Cas groups to analyze possible coevolution of Cas9 and dual-RNA. We demonstrate that these two components are interchangeable only between closely related type II systems when the PAM sequence is adjusted to the investigated Cas9 protein. Comparison of the taxonomy of bacterial species that harbor type II CRISPR-Cas systems with the Cas9 phylogeny corroborates horizontal transfer of the CRISPR-Cas loci. The reported collection of dual-RNA:Cas9 with associated PAMs expands the possibilities for multiplex genome editing and could provide means to improve the specificity of the RNA-programmable Cas9 tool. PMID:24270795

Localisation buccale d’un lymphome de Burkitt: à propos d’un cas

PubMed Central

Kissi, Lamia; El Bouihi, Rajaa; Lamchahab, Mouna; Alaoui, Ahmed; Benyahya, Ihsane

2017-01-01

Le lymphome de Burkitt (LB) est une forme de lymphome malin non-Hodgkinien qui provient de l'évolution maligne et de la prolifération de cellules lymphoïdes de type B. Le diagnostic positif repose sur la biopsie d'une masse tumorale ou la ponction de la moelle osseuse révélant la présence de cellules tumorales. Le cas rapporté est celui d'un jeune homme d'une vingtaine d'années qui a été adressé pour des tuméfactions gingivales évoluant depuis 1 mois suite à des extractions dentaires. L'examen anatomopathologique après biopsie complété par l'immunohistochimie conclut à un lymphome de Burkitt. La prise en charge a consisté en une chimiothérapie. Bien que rare, le lymphome de Burkitt est une tumeur agressive qui représente un véritable problème de santé publique d'où la place importante qu'occupe le médecin dentiste dans le diagnostic précoce afin de permettre une prise en charge rapide et appropriée seule garante de la guérison. PMID:28451040

Les leishmanioses cutanées à Leishmania major et à Leishmania tropica au Maroc: aspects épidémio-cliniques comparatifs de 268 cas

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Chiheb, Soumia; Slaoui, Widad; Mouttaqui, Tarik; Riyad, Meriem; Benchikhi, Hakima

2014-01-01

Introduction Depuis 1995, le Maroc a connu une réactivation des foyers de leishmanioses cutanées (LC) à L. major et une nouvelle répartition géographique des foyers à L. tropica. Le but de cette étude est de comparer les aspects épidémio-cliniques associés aux LC potentiellement dûes à L. major et à L. tropica. Méthodes Une étude rétrospective a colligé 268 cas de LC au service de dermatologie du CHU Ibn Rochd de Casablanca entre Janvier 1995 et Septembre 2010. Les données étaient analysées par Epi info version 3.5.1. Le test X2 était appliqué (Différence significative = p< 0,05). Résultats Deux cent soixante-huit cas de LC ont été colligés, dont 160 femmes et 108 hommes. Ils ont été répartis en 123 patients originaires des foyers à L.major et 145 patients originaires des foyers à L. tropica. L'aspect ulcéronodulaire, ulcérovégétant ou végétant était retrouvé dans 58 cas (47,2%) des cas de LC à L. major versus 24 cas (16,7%) dans la L.C à L. tropica. L'aspect papulonodulaire était retrouvé dans 84 cas (58%) de LC à L. tropica contre 41 cas (33,3%) de LC à L. major. Conclusion Dans la LC à L. major, l'atteinte des membres et les aspects cliniques végétant ou ulcéro-végétant restent toujours prédominants. Dans la L.C à L. tropica, l'atteinte papulonodulaire unique du visage reste prédominante mais des formes ulcéronodulaires, végétantes ou ulcérovégétantes existent également dans les foyers récents à L. tropica, prêtant à confusion cliniquement avec des LC à L. major. PMID:25810796

Pseudo-HELLP syndrome par carence en folates et/ou en vitamine B12: à propos d'un cas

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Benali, Mechaal; Bouassida, Mahdi; Dhouib, Firas; Bouzeidi, Kaled

2014-01-01

Plusieurs pathologies médicales peuvent interférer avec la grossesse et mimer le tableau biologique de HELLP syndrome. L’évolution naturelle de ce syndrome est d'une particulière gravité pour la mère et le fœtus, il convient d’éliminer rapidement les autres diagnostics afin d’éviter une extraction fœtale prématurée injustifiée. Nous rapportons le cas d'une parturiente qui s'est présentée avec un tableau évocateur d'un HELLP syndrome, rapporté finalement à une carence en folates et en vitamine B12. PMID:25404961

Syndrome de larva migrans cutanée sur pied malformé (à propos d'un cas)

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Benbella, Imane; Khalki, Hanane; Lahmadi, Khalid; Kouara, Sara; Abbadi, Abderrahim; Er-rami, Mohammed

2016-01-01

Le syndrome de larva migrans cutanée est une dermite sous cutanée causée par des larves d'ankylostomes d'animaux en impasse parasitaire chez l'homme. L'infestation transcutanée est favorisée par le contact avec le sol contaminé par les larves du parasite. Nous rapportons le cas d'un nourrisson de 15 mois, originaire de Guinée-Bissau, atteint d'un syndrome de larva migrans cutanée sur un pied malformé. Cette malformation sous forme d'une syndactylie associée à une tuméfaction du pied, était à l'origine d'un retard d'acquisition de la station debout. De même, on a rapporté une notion de pieds nus, vue la difficulté de chausser le pied malformé du patient. Tous ces facteurs auraient contribués à favoriser l'infestation du malade par les larves du nématode. PMID:27217876

The CAS Classroom

ERIC Educational Resources Information Center

Garner, Sue

2004-01-01

The Victorian Curriculum and Assessment Authority (VCAA) Computer Algebra System (CAS)Pilot study (2001-2005) is monitoring the use of CAS in senior secondary mathematics. This article explores the author's experiences in the CAS classroom and delineates changes in teaching style, as a result of the introduction of CAS into the senior mathematics…

Hématome spontané du méso de l'angle colique droit et du colon transverse compliquant un traitement par anti vitamine K: à propos d'un cas et revue de la littérature

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Traoré, Ibrahim Alain; Zaré, Cyprien; Barro, Sié Drissa; Guibla, Ismaël

2016-01-01

L'hématome spontané du méso de l'angle colique droit et du transverse est une complication rare du traitement anticoagulant par antivitamine K. Nous rapportons un cas d'hématome spontané du méso de l'angle colique droit et du transverse associé à un hémopéritoine de grande abondance chez un patient traité par antivitamine K pour embolie pulmonaire consécutive à une fracture des plateaux tibiaux droits. Le diagnostic doit être fait en urgence. L’échographie abdominale et la tomodensitométrie confirment le diagnostic. Le traitement non opératoire est la règle. Le traitement chirurgical est indiqué en cas de complications telles que la rupture de l'hématome. PMID:27217878

Troubles psychotiques précipités par le mariage : étude de trois observations

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Jaweher, Masmoudi; Kammoun, Mohamed Faouzi; Inès, Feki; Imen, Baati; Rim, Sallami; Abdelaziz, Jaoua

2013-01-01

Le mariage est un évènement très investi dans notre culture arabo-musulmane. Il présente une situation à grande charge émotionnelle et ayant un vécu stressant. C'est ainsi qu'il peut être à l'origine de la décompensation de certains troubles psychiatriques. Ce moment particulier de déclenchement de la pathologie peut altérer significativement l'adaptation familiale et sociale du patient en question, le rendant dépendant en partie ou en totalité à une institution. Dans ce travail, nous proposons d’étudier certains facteurs psychiques, sociaux et culturels pouvant aboutir à la précipitation des manifestations psychotiques par le mariage. Il s'agit de l’étude de trois observations cliniques, deux hommes et une femme, hospitalisés dans le service de psychiatrie A du CHU Hédi Chaker de Sfax et qui ont développés des manifestations psychotiques de façon concomitante à leur mariage. La durée moyenne de survenue des crises a été de vingt ans, le diagnostic retenu a été celui de trouble bipolaire dans deux cas et d'une schizophrénie indifférenciée chez le troisième patient. L’évolution s'est faite vers une chronicisation de deux malades et une dépendance institutionnelle dans le troisième cas. La précipitation des troubles psychotiques par le mariage, reste un phénomène en relation intime avec les composantes culturelles, elles-mêmes sont déterminantes dans la prise en charge ultérieure de ces patients. PMID:23785551

Apport de l'orientation clinique dans le diagnostic des hypertensions arterielles endocriniennes

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El Aziz, Siham; Chadli, Asma; Louda, Fatima; El Ghomari, Hassan; Farouqi, Ahmed

2014-01-01

L'hypertension artérielle d'origine endocrinienne représente une cause curable d'hypertension artérielle (HTA), ce qui en justifie le dépistage. Une orientation clinique est souhaitable afin de prescrire les bilans adéquats, notamment dans les pays en voie de développement. L'objectif de notre étude est décrire les aspects cliniques des patients ayant une HTA endocrinienne diagnostiquée au CHU de Casablanca. Méthodes: Il s'agit d'une étude descriptive rétrospective de 2004 à 2011, incluant tout patient ayant une HTA endocrinienne (en dehors des dysthyroïdies) admis en Endocrinologie. Les données concernant les facteurs cliniques, paracliniques et thérapeutiques ont été colligées. Au cours de la période étudiée, 53 cas d'HTA endocrinienne ont été admis, avec une age moyen au diagnostic de 39,3 ans et un sex-ratio F/H de 3,9. Trente patients (56.6%) ont un age ont un âge inférieur à 40 ans. On ne retrouve pas d'hérédité tensionelle chez 88.7% des patients. Les étiologies sont le Syndrome de cushing (41.5%), le phéochromocytome (32%), les adénomes somatotropes (15%) et les hyperaldostéronismes primaire (7.5%). L'HTA est essentiellement de grade un ou deux (69.8%), avec un retentissement cardio-vasculaire chez 11 patients (20.7%). Les patients ayant un SC avaient tous des signes cutanés spécifiques. Il s'agissait de sujets jeunes avec plusieurs facteurs de risque cardiovasculaire. Nous avons retrouvé un amaigrissement chez 37.5% des patients ayant un phéochromocytome avec un indice de masse corporel moyen de 20 kg/m2. L'HTA était permanente dans 5 cas de phéochromocytomes. Il n'existait pas d'hypokaliémie chez 50% des patients ayant un hyperaldostéronisme. Les signes cliniques des patients ayant une acromégalie étaient francs, avec un age moyen plus élevé de 50 ans. Nous avons noté une régression de l'HTA chez 59% de ces patients après guérison de l'endocrinopathie en cause. Plusieurs signes cliniques peuvent nous

Tératome immature de l’ovaire: à propos d’un cas

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Bouzoubaa, Wail; Jayi, Sofia; Alaoui, Fatima Zohra Fdili; Chaara, Hikmat; Melhouf, Moulay Abdelilah

2017-01-01

Les tératomes ovariens sont des tumeurs issues des cellules germinales pluripotentes, on décrit 3 types de tératomes: tératome mature, immature et monodermique. Le tératome immature constitue moins de 1% des cancers ovariens, et touche préférentiellement les sujets jeunes. Nous rapportons le cas d'une patiente de 25 ans, admise pour prise en charge d'une masse abdomino-pelvienne pour laquelle elle a bénéficiée d'une échographie et d'un scanner pelvien suivie d'un traitement conservateur a base d'une annexectomie gauche, avec multiples biopsies, dont le résultat anatomo-pathologique était en faveur d'un tératome ovarien immature. Par la suite le traitement a été complété par une hystérectomie avec curage lombo-aortique et omentectomie. Nous insistons à travers cette observation et sous la lumière d'une revue de la littérature sur les terrains particuliers prédisposant à ce type de tumeur rare et grave et sur les différents critères radiologiques orientant vers ce type histologique rare des tumeurs ovariennes, afin d'améliorer le pronostic et la prise en charge de cette pathologie qui reste multidisciplinaires. PMID:29187932

Processes for Assessing Outcomes of Multi-national Missions (Processus d’evaluation des resultats de missions multinationales)

DTIC Science & Technology

2013-11-01

la raison d’être du recueil des données relatives aux variables centrales afin de soutenir ces efforts dans...communs utilisés par les pays membres et un ensemble central d’indicateurs complétant les Mesures de Performance (MOP) et Mesures d’Efficacité (MOE...dénomination « STO », « RTO » ou « AGARD » selon le cas, suivi du numéro de série. Des informations analogues, telles que le titre est la date de

Les calculs urinaires de l'enfant au Burkina Faso: à propos de 67 cas

PubMed Central

Ouédraogo, Isso; Napon, Aïcha Madina; Bandré, Emile; Ouédraogo, Francis Somkieta; Tapsoba, Wendlamita Toussaint; Wandaogo, Albert

2015-01-01

L'objectif de cette étude est de déterminer la fréquence, de décrire les circonstances de découverte, les signes cliniques et paracliniques, la composition chimique des calculs prélevés et les difficultés rencontrées dans le traitement des lithiases urinaires. Notre étude a été rétrospective sur une période de six ans (janvier 2005 à décembre 2010) et a eu pour cadre le CHUP-CDG et a concerné 67 patients âgés de moins de 15 ans opérés pour lithiases urinaires. Les calculs de la dernière année au nombre de douze ont fait l'objet d'une analyse spectrophotométrique. La lithiase urinaire figure parmi les dix premières pathologies du service de chirurgie et représente 1,32% des hospitalisations. L’âge moyen de nos patients est de deux ans et varie de 6 mois à 14 ans. La symptomatologie de la lithiase urinaire est polymorphe. Le diagnostic des lithiases urinaires a été essentiellement radiologique (ASP) dans 87, 50 des cas. Les localisations les plus fréquentes sont: vésicales (49,25%) et pyéliques (46,26%). L'ECBU a révélé une infection urinaire chez 9 patients. Les germes le plus fréquemment rencontrés sont: Klebsiella pneumoniae pneumoniae (22,22%) et staphyloccocus aureus (22,22%). Les difficultés du traitement sont dues à la modicité de nos moyens diagnostiques et à la nature chimique des calculs et le traitement a été dans tous les cas chirurgical. La composition chimique est dominée par les sels calciques notamment les oxalates, les phosphates et les carbonates. PMID:26175840

CasA mediates Cas3-catalyzed target degradation during CRISPR RNA-guided interference.

PubMed

Hochstrasser, Megan L; Taylor, David W; Bhat, Prashant; Guegler, Chantal K; Sternberg, Samuel H; Nogales, Eva; Doudna, Jennifer A

2014-05-06

In bacteria, the clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated (Cas) DNA-targeting complex Cascade (CRISPR-associated complex for antiviral defense) uses CRISPR RNA (crRNA) guides to bind complementary DNA targets at sites adjacent to a trinucleotide signature sequence called the protospacer adjacent motif (PAM). The Cascade complex then recruits Cas3, a nuclease-helicase that catalyzes unwinding and cleavage of foreign double-stranded DNA (dsDNA) bearing a sequence matching that of the crRNA. Cascade comprises the CasA-E proteins and one crRNA, forming a structure that binds and unwinds dsDNA to form an R loop in which the target strand of the DNA base pairs with the 32-nt RNA guide sequence. Single-particle electron microscopy reconstructions of dsDNA-bound Cascade with and without Cas3 reveal that Cascade positions the PAM-proximal end of the DNA duplex at the CasA subunit and near the site of Cas3 association. The finding that the DNA target and Cas3 colocalize with CasA implicates this subunit in a key target-validation step during DNA interference. We show biochemically that base pairing of the PAM region is unnecessary for target binding but critical for Cas3-mediated degradation. In addition, the L1 loop of CasA, previously implicated in PAM recognition, is essential for Cas3 activation following target binding by Cascade. Together, these data show that the CasA subunit of Cascade functions as an essential partner of Cas3 by recognizing DNA target sites and positioning Cas3 adjacent to the PAM to ensure cleavage.

Complications inattendues de la chirurgie: deux cas de brûlure par plaque de bistouri électrique

PubMed Central

Diop, B.; Sy, A.; Ba, P.A.; MBaye, B.; Wane, Y.; Sarre, S.M.

2016-01-01

Summary Les risques d’accidents électriques sont une réalité dans les blocs opératoires avec le nombre croissant d’équipements électriques, électroniques et de liquides inflammables utilisés. Le bistouri électrique demeure le dispositif le plus utilisé pour son effet électrochirurgical de coagulation ou section tissulaire. Lorsque qu’elle est défectueuse ou mal placée sur une surface réduite de la peau, la plaque du bistouri peut être à l’origine de brûlure cutanée classiquement profonde, de cicatrisation lente. Elle ajoute à l’affection initiale une surmorbidité iatrogène, inattendue, aux conséquences dévastatrices pour le patient, le chirurgien et parfois la structure hospitalière. Nous rapportons deux cas de brûlure cutanée par plaque de bistouri survenue en peropératoire lors de l’utilisation du bistouri électrique en mode monopolaire et discutons les aspects étiologiques, cliniques et préventifs. PMID:28289364

Les infections à Pseudomonas aeruginosa au service des maladies infectieuses du CHU YO, Burkina Faso: à propos deux cas

PubMed Central

Mamoudou, Savadogo; Lassina, Dao; Fla, Koueta

2015-01-01

Nous rapportons deux cas d'infection à Pseudomonas aeruginosa: un cas de méningite et un cas d'infection urinaire. Les auteurs rappellent qu’à côté des étiologies classiques des méningites et des infections urinaires, des germes résistants comme Pseudomonas aeruginosa peuvent être responsables d'infections à localisation méningées et urinaires et dont il faut connaître pour une bonne prise en charge. Le traitement de ces infections requiert un antibiogramme au regard de la grande capacité de résistance de Pseudomonas aeruginosa en milieu hospitalier. La limitation des gestes invasifs et l'application rigoureuse des mesures de prévention des infections en milieu hospitalier contribueront à lutter efficacement contre ces infections en milieu de soins. PMID:26491521

Concordance et apports de l'hystérosalpingographie et de la cœlioscopie dans l'exploration tubaire et pelvienne en cas d'infertilité

PubMed Central

Kehila, Mehdi; Ben Hmid, Rim; Ben Khedher, Sonia; Mahjoub, Sami; Channoufi, Mohamed Bedis

2014-01-01

Introduction La coelioscopie et l'hystérosalpingographie sont les deux procédures usuellement admises pour l'exploration tubaire et pelvienne en cas d'infertilité. Les objectifs de ce travail etaient de comparer les données de l'Hystérosalpingographie à celles de la coelioscopie chez des patientes explorées pour infertilité et voir l'apport de l'une par rapport à l'autre. Méthodes Etude prospective menée au service C du centre de maternité et de néonatologie de Tunis, s’étendant sur 15 mois, colligeant 120 patientes suivies pour infertilité ayant bénéficié d'une HSG suivie d'une coelioscopie. Résultats L’âge moyen de nos patientes était de 35,3 ans. L'infertilité était primaire dans 56,7% des cas et secondaire dans 43,7% des cas. Sa durée moyenne était de 48,9 mois. Le test statistique de concordance Kappa entre les 2 examens était de 0.42 pour les obstructions tubaires en général, de 0.48 pour les obstructions tubaires proximales et de 0.53 pour les obstructions tubaires distales indiquant une concordance modérée dans tous les cas. La coelioscopie a permis d'objectiver en plus une endométriose pelvienne dans 7% des cas, des adhérences pelviennes dans 33% des cas et des trompes perméables mais d'aspect pathologique dans 20% des cas. Conclusion Il existe un intérêt d′associer, chaque fois que c′est possible, l'HSG et la coelioscopie dans l'exploration du pelvis féminin dans le cadre de l'infertilité. Aucun de ces deux examens n'est parfait. Leurs résultats sont complémentaires. PMID:25374631

Kyste épidermoide de la selle turcique: à propos d’un cas

PubMed Central

El Mghari, Ghizlane; Rafiq, Bouchra; El Ansari, Nawal

2017-01-01

Le kyste épidermoïde (KE) ou cholestéatome est une tumeur bénigne d'origine souvent congénitale, survenant dans les espaces sous-arachnoïdiens, son traitement est principalement chirurgical. Nous rapportons le cas d'un patient, âgé de 38 ans, qui a présenté d'une façon progressive, un syndrome d'hypertension intracrânienne, associé à des signes d'insuffisance antéhypophysaire des axe corticotrope, thyréotrope et gonadotrope installés depuis 1an et chez qui l'IRM cérébrale a été en faveur d'un craniopharyngiome, avec révélation de kyste épidermoide sur pièce anatomo-pathologique. PMID:29158862

Epithéliomas basocellulaires de la face: prise en charge chirurgicale, à propos de 45 cas et revue de la literature

PubMed Central

Ennouhi, Mohamed Amine; Moussaoui, Abdenacer

2014-01-01

L’épithélioma basocellulaire est de loin la tumeur épithéliale maligne la plus répandue. L'atteinte faciale représente plus de 65% des cas et constitue un facteur de risque de récidive. L'objectif de notre travail est de rappeler les principes et modalités du traitement chirurgical. Sur une période de douze mois, nous avons pris en charge quarante-cinq patients atteints de carcinomes basocellulaires de la face. Le traitement chirurgical comprend deux volets: -carcinologique: emportant la tumeur et une marge de tissu sain; -et une chirurgie réparatrice faisant appel à la suture cutanée directe; greffes ou lambeaux loco -régionaux. L'examen histologique systématique des pièces opératoires permet la confirmation du diagnostic, le typage histologique et l'appréciation de la qualité de l'exérèse chirurgicale. Les résultats esthétiques sont jugés satisfaisants. Quant aux résultats carcinologiques, nous déplorons quatre récidives. Le traitement chirurgical des épithéliomas basocellulaires est le seul garant de la guérison. Au niveau de la face, il faut trouver le meilleur compromis entre impératifs carcinologiques et esthétiques. L'amélioration des résultats passe par: la prévention, le dépistage précoce des lésions, la collaboration étroite des anatomo-pathologistes et la création de comités de concertation pluri -disciplinaire pour la prise en charge des cas difficiles. PMID:25709738

Fragmentation of the CRISPR-Cas Type I-B signature protein Cas8b.

PubMed

Richter, Hagen; Rompf, Judith; Wiegel, Julia; Rau, Kristina; Randau, Lennart

2017-11-01

CRISPR arrays are transcribed into long precursor RNA species, which are further processed into mature CRISPR RNAs (crRNAs). Cas proteins utilize these crRNAs, which contain spacer sequences that can be derived from mobile genetic elements, to mediate immunity during a reoccurring virus infection. Type I CRISPR-Cas systems are defined by the presence of different Cascade interference complexes containing large and small subunits that play major roles during target DNA selection. Here, we produce the protein and crRNA components of the Type I-B CRISPR-Cas complex of Clostridium thermocellum and Methanococcus maripaludis. The C. thermocellum Cascade complexes were reconstituted and analyzed via size-exclusion chromatography. Activity of the heterologous M. maripaludis CRISPR-Cas system was followed using phage lambda plaques assays. The reconstituted Type-I-B Cascade complex contains Cas7, Cas5, Cas6b and the large subunit Cas8b. Cas6b can be omitted from the reconstitution protocol. The large subunit Cas8b was found to be represented by two tightly associated protein fragments and a small C-terminal Cas8b segment was identified in recombinant complexes and C. thermocellum cell lysate. Production of Cas8b generates a small C-terminal fragment, which is suggested to fulfill the role of the missing small subunit. A heterologous, synthetic M. maripaludis Type I-B system is active in E. coli against phage lambda, highlighting a potential for genome editing using endogenous Type-I-B CRISPR-Cas machineries. This article is part of a Special Issue entitled "Biochemistry of Synthetic Biology - Recent Developments" Guest Editor: Dr. Ilka Heinemann and Dr. Patrick O'Donoghue. Copyright © 2017 Elsevier B.V. All rights reserved.

Spacer capture and integration by a type I-F Cas1-Cas2-3 CRISPR adaptation complex.

PubMed

Fagerlund, Robert D; Wilkinson, Max E; Klykov, Oleg; Barendregt, Arjan; Pearce, F Grant; Kieper, Sebastian N; Maxwell, Howard W R; Capolupo, Angela; Heck, Albert J R; Krause, Kurt L; Bostina, Mihnea; Scheltema, Richard A; Staals, Raymond H J; Fineran, Peter C

2017-06-27

CRISPR-Cas adaptive immune systems capture DNA fragments from invading bacteriophages and plasmids and integrate them as spacers into bacterial CRISPR arrays. In type I-E and II-A CRISPR-Cas systems, this adaptation process is driven by Cas1-Cas2 complexes. Type I-F systems, however, contain a unique fusion of Cas2, with the type I effector helicase and nuclease for invader destruction, Cas3. By using biochemical, structural, and biophysical methods, we present a structural model of the 400-kDa Cas1 4 -Cas2-3 2 complex from Pectobacterium atrosepticum with bound protospacer substrate DNA. Two Cas1 dimers assemble on a Cas2 domain dimeric core, which is flanked by two Cas3 domains forming a groove where the protospacer binds to Cas1-Cas2. We developed a sensitive in vitro assay and demonstrated that Cas1-Cas2-3 catalyzed spacer integration into CRISPR arrays. The integrase domain of Cas1 was necessary, whereas integration was independent of the helicase or nuclease activities of Cas3. Integration required at least partially duplex protospacers with free 3'-OH groups, and leader-proximal integration was stimulated by integration host factor. In a coupled capture and integration assay, Cas1-Cas2-3 processed and integrated protospacers independent of Cas3 activity. These results provide insight into the structure of protospacer-bound type I Cas1-Cas2-3 adaptation complexes and their integration mechanism.

Association maladie cœliaque et tuberculose multifocale: à propos d’un cas avec revue de la littérature

PubMed Central

Sarghini, Khadija; Oubaha, Sofia; Samlani, Zouhour; Krati, Khadija

2017-01-01

La maladie cœliaque est une entéropathie auto-immune liée à l'intolérance au Gluten qui survient sur un terrain génétiquement prédisposé. Le diagnostic repose sur la combinaison d'arguments cliniques, biologiques et histologiques. Elle est associée à de nombreuses complications, notamment le lymphome. Le risque de tuberculose chez les patients cœliaques est augmenté. Plusieurs hypothèses expliquant cette association ont été discutées. Nous rapportons un cas de maladie cœliaque associée à la tuberculose multifocale chez une patiente âgée de 17 ans. PMID:28979616

Autre cause de mort subite du nourrisson: à propos d'un cas clinique de syndrome du QT long congenital

PubMed Central

Seka, Zena; Mols, Pierre; Gobin, Eric; Ngatchou, William

2014-01-01

Le syndrome du QT long congénital est une maladie rythmique liée à une mutation génétique et caractérisée par un espace QT allongé sur l’électrocardiogramme, des arythmies malignes type torsade de pointe et fibrillation ventriculaire entraînant une mort subite. Les gènes impliqués dans ces mutations codent pour des sous unités des canaux ioniques responsables de l'activité électrique cardiaque. Le diagnostic est basé sur l’électrocardiogramme, une enquête familiale et l’étude génétique. Le traitement repose sur les bêtabloquants, la sympathectomie et le stimulateur cardiaque. Nous rapportons le cas d'un nourrisson de 2 ans retrouvé en état de mort apparente. Nous discutons de sa prise en charge initiale, de l'enquête familiale et de son suivi ultérieur. PMID:25667708

Les conjonctivites néonatales dans le canton de Glidji au Sud du Togo: une étude transversale à propos de 159 nouveau-nés

PubMed Central

Kokou, Vonor; Nidain, Maneh; Kassoula, Nononsaa Batomguela; Kwassi, Fiaty- Amenouvor; Meba, Banla; Patrice, Balo Komi

2016-01-01

Introduction Le but de l’étude était décrire les aspects épidémiologiques des conjonctivites néonatales dans le canton de Glidji au Sud du Togo. Methodes Nous avons mené une étude transversale dans les 4 Unités Sanitaires Périphériques du canton de Glidji du 19 Mars au 13 Mai 2009 soit 8 semaines. Tous les nouveau-nés ont été inclus et la conjonctivite néonatale était définie par la présence chez un nouveau-né d'au moins deux des signes suivants: hyperhémie conjonctivale, œdème palpébral, chémosis, sécrétions purulentes, larmoiement. Les paramètres étudiés étaient l’âge, le sexe, les facteurs de risque, les antécédents, la présence ou non de conjonctivite, les germes en causes et l’évolution sous traitement. Resultats Sur la période, 159 nouveau-nés ont été examinés. L’âge moyen était de 10,9 jours avec des extrêmes de 0 à 28 jours. Il y avait 80 garçons pour 79 filles soit un sex-ratio de 1,01. Sur les 159 nouveau-nés, 7 cas de conjonctivite ont été diagnostiqués soit une prévalence de 4,4%. Les facteurs de risque identifiés étaient l'accouchement par voie basse et la présence d'IST chez la mère pendant la grossesse. Sur les 7 cas de conjonctivite, l'examen cytobactériologique a permis d'isoler le staphylococcus aureus dans 2 cas. L’évolution des cas de conjonctivite sous traitement était favorable avec régression des signes dès le 3è jour. Conclusion Les conjonctivites néonatales avaient une prévalence de 4,4% dans le canton de Glidji au sud du Togo et le staphylocoque doré était le germe en cause. Leur prévention passe par un bon suivi lors de la consultation prénatale et l'instillation de collyre antibiotique à la naissance PMID:27642383

Signes cliniques rencontrés chez l'enfant malnutri dans un milieu minier: cas de la ville de Lubumbashi et ses environs

PubMed Central

Musimwa, Aimée Mudekereza; Kanteng, Gray Wakamb; Kitoko, Hermann Tamubango; Luboya, Oscar Numbi

2016-01-01

Introduction La malnutrition reste à ce jour un problème majeur de santé publique, notamment dans les pays en voie de développement. Cette étude a eu pour objectif de déterminer les signes cliniques observés chez l'enfant mal nourri, admis dans une unité de prise en charge. Méthodes Il s'agit d'une étude descriptive transversale, effectuée de juillet 2013 à décembre 2014. 311 cas ont été colligés (182 malnutris et 129 biens nourris), par échantillonnage exhaustif, avec un dépistage actif des enfants malnutris et biens nourris. Le diagnostic est fait cliniquement associé à l'anthropométrie. Résultats Les signes les plus enregistrés chez les enfants malnutris étaient dominés par la toux ou pneumopathie dans 42,50%, la gastroentérite dans 38,55%, les lésions dermatologiques ont présenté 22,91% de cas, la fièvre dans 22,35% de cas, 19,0% des enfants ont présenté les œdèmes, 8,38% d'enfants ont présenté la pâleur, enfin hépatomégalie et splénomégalie sont les signes les moins fréquents avec respectivement 1,68% et 2,89%. Tandis que les enfants en bonne état nutritionnel ont présenté plus la splénomégalie et la fièvre qui seraient liés au paludisme. Conclusion Les enfants malnutris vivant dans un milieu minier présentent une symptomatologie qui ne pas différents de autres enfants mal nourris à l'exception de l'hépatomégalie et splénomégalie qui sont très rare chez nos mal nourris. PMID:27642407

L'endométriose de la paroi abdominale: à propos d'un cas rare

PubMed Central

Jayi, Sofia; Laadioui, Meriem; Bouguern, Hakima; Chaara, Hikmat; Melhouf, Aabdelilah

2013-01-01

L'endométriose de la paroi est une entité clinique rare, dont la physiopathologie demeure imprécise. Elle survient le plus souvent après une intervention chirurgicale gynécologique ou obstétricale. Nous rapportons le cas d'une patiente présentant une douleur cyclique, au niveau de la cicatrice de césarienne. Avec à l'examen clinique une masse de 3 cm localisée au niveau de la fosse iliaque droite. L'échographie-doppler a objectivé une image d'allure tissulaire, polylobée, à vascularisation centrale, mesurant 32/16 mm, évoquent une masse endométriosique ou une tumeur des parties molles. D'où la décision d'excision de la lésion, au cours de laquelle on a découvert une masse dure de 3/2 cm, en sous aponévrotique accolée au muscle grand droit de l'abdomen. L'étude anatomopathologique a confirmé le diagnostic d'endométriose pariétale. Les suites postopératoires étaient simples avec un recul de 2 ans et demie sans récidive de la masse ni de la douleur. A travers notre cas, nous insisterons sur les caractéristiques de cette pathologie notamment pronostic, ce qui permettra au praticien de comprendre l'intérêt du diagnostic et prise en charge précoce de cette entité - pour laquelle on ne pense jamais assez devant une masse pariétale - et de sa prévention au cours de chaque chirurgie gynécologique ou obstétricale. PMID:24171068

Atteinte cardiaque au cours de la dystrophie myotonique de Steinert: expérience marocaine, à propos de 18 cas

PubMed Central

Saghi, Ghita; Bouhouch, Rachida; Salaheddine, Loubna; Birouk, Nezha; Nadifi, Salama; Fellat, Ibtissam; Cherti, Mohamed

2015-01-01

La maladie de Steinert ou dystrophie myotonique de type 1 (DM1) est une maladie génétique à transmission autosomique dominante caractérisée par une myotonie et une atteinte de plusieurs organes dont le cœur. L'atteinte cardiaque est la plus grave des atteintes systémiques puisqu'elle conditionne le pronostic vital. Ce travail a pour but de déterminer les anomalies cardiaques rencontrées au cours de la DM1 et de mettre en exergue l'intérêt d'un examen cardiaque rigoureux et régulier, indépendamment de la sévérité de l'atteinte neuromusculaire, ainsi que l'apport des examens cardiaques complémentaires et notamment l'exploration électrophysiologique. 18 patients atteints de DM1 ont bénéficiés d'une exploration cardiaque systématique. Il s'agit de 9 hommes et de 9 femmes, d’âge moyen de 41,8 +/- 16,2 ans. 66 p.100 des patients sont symptomatiques sur le plan cardiovasculaire. Les anomalies électrocardiographiques sont dominées par un trouble de la conduction intra-ventriculaire dans 16 p.100 des cas et un BAV de 1er degré dans 16 p.100 des cas. L'Holter ECG objective une hyperexcitabilité à l’étage atrial et/ou ventriculaire dans 50p.100 des cas. L'ETT est normale chez 95 p.100 des patients. L'exploration électrophysiologique, réalisée chez 4 patients symptomatiques, a objectivé un bloc tronculaire dans un cas ayant conduit à l'implantation d'un PM double chambre. Un seul patient est décédé suite à une détresse respiratoire. Enfin, on n'a pas noté de corrélation entre l'atteinte cardiaque et neuromusculaire. Une exploration cardiaque est indispensable chez tout patient atteint de DM1, en dépit de l'absence de symptômes, et un bilan annuel minimal s'impose pour guetter un éventuel trouble rythmique et/ou conductif, fatal en l'absence de traitement adéquat. PMID:26097635

Stratégie transfusionnelle des hémorragies graves du post-partum: étude rétrospective à propos de 47 cas

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Khouadja, Hosni; Rouissi, Wissem; Mahjoub, Mohamed; Sakhri, Jaballah; Beletaifa, Dhafer; Jazia, Khaled Ben

2016-01-01

Introduction L’hémorragie du post-partum est la principale cause de morbi-mortalité maternelle dans le monde. La prise en charge est multidisciplinaire. La stratégie transfusionnelle est capitale jouant un rôle majeur dans le pronostic maternel. L’objectif de ce travail a été de déterminer le rapport PFC/CGR lors de la prise en charge des hémorragies graves du post-partum. Méthodes Une étude Etude rétrospective sur une période de 4 ans (2009-2012) a été réalisée dans un centre de maternité de référence de niveau III du centre-Est tunisien. Elle a inclut les parturientes admises pour une hémorragie sévère du post-partum définit par la nécessité d’une transfusion de plus de 04 CGR durant les 3 premières heures ou de plus de 10 CGR durant les 24 premières heures de prise en charge. Résultats Notre étude a inclut 47 parturientes. Le diagnostic de l’HPP a été fait devant un saignement vaginal dans 28 cas et suite à une césarienne dans 19 cas. En préopératoire le taux d’Hb a été de 6.3 g/dl. Le rapport transfusionnel (PFC/CGR) a été de 1/0.7. Conclusion Au cours de notre prise en charge, le rapport transfusionnel a été plus élevé que les recommandations récentes de la littérature stipulant une administration précoce et massive de PFC avec un ratio PFC/CGR compris entre 1/2 et 1/1. L’administration du fibrinogène (Fbg) et de l’acide tranexamique doit être précoce. L’emploi du facteur VII activé recombinant (rFVIIa) doit rester une solution ultime de prise en charge. PMID:28292131

CONCLUSIONS ET RECOMMANDATIONS À L’ISSUE DE LA CONSULTATION DE L’OMS SUR LA LUTTE CONTRE LA CARENCE MARTIALE CHEZ LE NOURRISSON ET LE JEUNE ENFANT DANS LES PAYS D’ENDÉMIE PALUSTRE

PubMed Central

Allen, L.; Black, R.E.; Brandes, N.; Brittenham, G.; Chazot, G.; Chunming, C.; Crawley, J.; de Benoist, B.; Dalmiya, N.; Darnton-Hill, I.; Dewey, K.; El-Arifeen, S.; Fontaine, O.; Geissler, C.; Haberle, H.; Harvey, P.; Hasler, J.; Hershko, C.; Hurrell, R.; Juma, M.A.; Lönnerdal, B.; Lozoff, B.; Lynch, S.; Salgado, H. Martines; McLean, E.; Metz, J.; Oppenheimer, S.; Premji, Z.; Prentice, A.; Ramsan, M.; Ratledge, C.; Stoltzfus, R.; Tielsch, J.; Winachagoon, P.

2011-01-01

Cet article présentent les résultats d'une Consultation d'Experts dont l'objectif était d'évaluer l'efficacité et l'innocuité des suppléments de fer administrés aux nourrissons et aux jeunes enfants dans les zones d’endémie palustre, ainsi que les conséquences d’une telle mesure pour la santé publique. Les participants à cette Consultation, qui s’est déroulée à Lyon (France) les 12–14 juin 2006, se sont entendus sur plusieurs questions importantes concernant l’administration d’une supplémentation martiale aux nourrissons et aux jeunes enfants dans les zones d’endémie palustre. Les conclusions du présent rapport s’appliquent plus particulièrement aux pays où le paludisme est endémique. PMID:18630054

Ostéo-arthrite tuberculeuse tarsienne: à propos d’un cas

PubMed Central

Yacoubi, Hicham; Erraji, Moncef; Abdelillah, Rachid; Abbassi, Najib; Abdeljawad, Najib; Daoudi, Abdelkrim

2012-01-01

Nous rapportons le cas d’une patiente de 45 ans sans antécédents médicaux particuliers, qui a présenté une atteinte inflammatoire du pied gauche, sans notion de traumatisme ni de fièvre, avec apparition secondaire d’une fistule cutanée purulente à la face externe du cou de pied. Les radiographies standards et la Tomodensitométrie de la cheville mettaient en évidence une ostéite calcanéenne avec atteinte articulaire subtalienne. Une biopsie chirurgicale associée à une excision des tissus inflammatoires et nécrotiques et l’ablation du trajet fistuleux, ont été réalisées. L’analyse histologique montrait une image de granulome épithélio-giganto-cellulaire avec une nécrose caséeuse et les prélèvements bactériologiques (retrouvaient Mycobacterium tuberculosis. Une chimiothérapie antituberculeuse a été administrée pendant 12 mois. À 24 mois, la patiente ne présentait pas de récidive mais une arthropathie dégénérative secondaire subtalienne. Il nous semble intéressant de rappeler que tout tableau clinique traînant ou toute lésion osseuse suspecte et de présentation atypique doit faire évoquer le diagnostic de tuberculose afin d’éviter des retards de diagnostic. Ceci permet une prise en charge thérapeutique précoce de la pathologie. PMID:22655098

Cas9 versus Cas12a/Cpf1: Structure-function comparisons and implications for genome editing.

PubMed

Swarts, Daan C; Jinek, Martin

2018-05-22

Cas9 and Cas12a are multidomain CRISPR-associated nucleases that can be programmed with a guide RNA to bind and cleave complementary DNA targets. The guide RNA sequence can be varied, making these effector enzymes versatile tools for genome editing and gene regulation applications. While Cas9 is currently the best-characterized and most widely used nuclease for such purposes, Cas12a (previously named Cpf1) has recently emerged as an alternative for Cas9. Cas9 and Cas12a have distinct evolutionary origins and exhibit different structural architectures, resulting in distinct molecular mechanisms. Here we compare the structural and mechanistic features that distinguish Cas9 and Cas12a, and describe how these features modulate their activity. We discuss implications for genome editing, and how they may influence the choice of Cas9 or Cas12a for specific applications. Finally, we review recent studies in which Cas12a has been utilized as a genome editing tool. This article is categorized under: RNA Interactions with Proteins and Other Molecules > Protein-RNA Interactions: Functional Implications Regulatory RNAs/RNAi/Riboswitches > Biogenesis of Effector Small RNAs RNA Interactions with Proteins and Other Molecules > RNA-Protein Complexes. © 2018 Wiley Periodicals, Inc.

[Clustered regularly interspaced short palindromic repeat associated protein genes cas1 and cas2 in Shigella].

PubMed

Xue, Zerun; Wang, Yingfang; Duan, Guangcai; Wang, Pengfei; Wang, Linlin; Guo, Xiangjiao; Xi, Yuanlin

2014-05-01

To detect the distribution of clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR) associated protein genes cas1 and cas2 in Shigella and to understand the characteristics of CRISPR with relationship between CRISPR and related characteristics on drug resistance. CRISPR associated protein genes cas1 and cas2 in Shigella were detected by PCR, with its products sequenced and compared. The CRISPR-associated protein genes cas1 and cas2 were found in all the 196 Shigella isolates which were isolated at different times and locations in China. Consistencies showed through related sequencing appeared as follows: cas2, cas1 (a) and cas1 (b) were 96.44%, 97.61% and 96.97%, respectively. There were two mutations including 3177129 site(C→G)and 3177126 site (G→C) of cas1 (b) gene in 2003135 strain which were not found in the corresponding sites of Z23 and 2008113. showed that in terms of both susceptibility and antibiotic-resistance, strain 2003135 was stronger than Z23 and 2008113. CRISPR system widely existed in Shigella, with the level of drug resistance in cas1 (b) gene mutant strains higher than in wild strains. Cas1 (b) gene mutation might be one of the reasons causing the different levels of resistance.

Facteurs de risque de l'inobservance thérapeutique chez les patients schizophrènes: étude cas- témoins'

PubMed Central

Aarab, Chadya; Elghazouani, Fatima; Aalouane, Rachid; Rammouz, Ismail

2015-01-01

Les progrès réalisés dans le traitement de la schizophrénie n'ont jusqu'ici pas modifié de manière radicale l'importance de l'adhésion des patients à leur médication. L'objectif de ce travail est d'identifier les facteurs de risque de l'abandon du traitement sur un échantillon marocain de malades schizophrènes. C'est une étude transversale menée au centre psychiatrique universitaire de Fès sur une période de 4 mois. Les malades inclus présentaient une schizophrénie ou un trouble schizo-affectif, sélectionnés en deux groupes observant et non observant. L’évaluation de l'observance a été faite par un hétéro-questionnaire comprenant une liste de causes d'abandon du traitement avec des réponses par oui ou non et à l'aide de l’échelle MARS (Medication Adherence Rating Scale). Le traitement statistique des résultats a été réalisé par le logiciel Epi Info version 3.5.1. On a recruté 164 participants, 112 étaient des malades non observants à leur traitement (cas) et 52 patients bien observants (témoins). L’âge moyen est 31 ans, avec une prédominance masculine. Les facteurs de risque d'inobservance thérapeutique sont: l’âge jeune, le sexe masculin, le célibat, les troubles addictifs. Les principales raisons d'abandon du traitement sont le changement fréquent du médecin, le manque d'informations sur la maladie, un mauvais insight et les effets secondaires des antipsychotiques. Le groupe de schizophrènes non adhérents à leur traitement pharmacologique avait un score élevé à l’échelle MARS dans 80% cas. Ces résultats doivent être pris en considération par le personnel soignant pour optimiser l'observance thérapeutique chez les patients souffrant de schizophrénie. PMID:26161196

Une fistule recto-vaginale rentrant dans le cadre d'un syndrome de Currarino

PubMed Central

Idrissi, Mounia Lakhdar; Babakhoya, Abdeladim; Bouabdellah, Youssef; Hida, Mostapha

2011-01-01

Le syndrome de Currarino (SC) est défini par une triade rassemblant une malformation ano-rectale, une agénésie sacrée et une tumeur pré-sacrée. Nous rapportons le cas d'une fille de 4 ans et demi ayant été admise en consultation de gastro-entérologie pédiatrique pour constipation avec issue de selle à travers un orifice vulvaire. La radiographie du rachis avait montré une agénésie sacrée. Le fistulo-scanner a mis en évidence une fistule recto-vaginale et l'IRM pelvienne a confirmé l'agénésie sacrée et a retrouvé une méningocèle antérieure. La découverte d'une malformation ano-rectale doit faire chercher une autre anomalie de la triade de Currarino. Cette affection, rare, nécessite une prise en charge médico-chirurgicale assez complexe. PMID:22384297

Paragangliome malin orbitaire, à propos d’un cas

PubMed Central

Andaloussi, Idriss Benatiya; Maaroufi, Mustapha; Benzagmout, Mohammed; Harmouch, Taoufiq; Abdellaoui, Meryem; Bhallil, Salima; Tizniti, Siham; Elfaiz, Mohammed Chaoui; Amarti, Afaf; Tahri, Hicham

2012-01-01

Les paragangliomes sont des tumeurs neuroendocrines développées aux dépens du système nerveux parasympathique. Ils peuvent se localiser n’ importe où dans l’organisme depuis la tète et cou jusqu’au pelvis. La localisation orbitaire de cette tumeur est très rare. Nous présentons le cas d’un patient âgé de 37 ans qui présente depuis 4 mois une exophtalmie unilatérale droite, d’installation progressive, sans douleur ni baisse de l’acuité visuelle associés. L’examen général montre une tuméfaction sous le cuire chevelu, sans adénopathies locorégionales ni hépato ou splénomégalie. La tomodensitométrie retrouve un processus tumoral occupant le cadran supéro-externe de l’orbite droite, mesurant 38 mm de grand axe, envahissant la paroi supérieure et externe de l’orbite avec une importante ostéolyse. Un body scan révèle alors une métastase pulmonaire. L’examen histopathologique complétés par l’immunohistochimie, réalisé après biopsie, révèle un marquage cytoplasmique par l’anticorps anti-chromogranin, l’anticorps anti-synaptophysine et un marquage des vaisseaux par l’anticorps anti-CD31 soulignant l’architecture en zellbalen des nids tumoraux. Cet aspect est en faveur d’un paragangliome malin. Une exérèse chirurgicale incomplète suivie d’une radiothérapie adjuvante, sont alors réalisés. L’origine exacte de cette tumeur au sein de l’orbite reste très controversée. L’exophtalmie reste le principal signe révélateur. La tomodensitométrie, l’imagerie par résonnance magnétique et la scintigraphie au Metaiodobenzylguanidine radioinonisée à l’iode (MIBG-I131) permettent d’orienter le diagnostic et faire un bilan d’extension de la tumeur. Le diagnostic de certitude repose sur l’histopathologie et l’immunohistochimie. L’excision totale de la lésion est le traitement de choix pour les lésions bien délimitées. Dans les formes plus étendues le traitement repose sur l�

Prise en charge diagnostique et thérapeutique de la tuberculose ganglionnaire en Tunisie

PubMed Central

Ben Brahim, Hajer; Kooli, Ikbel; Aouam, Abir; Toumi, Adnene; Loussaief, Chawki; Koubaa, Jamel; Chakroun, Mohamed

2014-01-01

La tuberculose ganglionnaire est la localisation extra-pulmonaire la plus fréquente de la tuberculose. Nous nous proposons dans ce travail d’étudier les modalités diagnostiques, thérapeutiques et évolutives de cette localisation. Il s'agit d'une étude rétrospective portant sur 100 cas de tuberculose ganglionnaire. L’âge moyen était de 35 ± 15 ans (15-85 ans). Aucun malade n’était VIH positif. L'aire cervicale était la plus touchée (93 cas). L'intradermo-réaction à la tuberculine était positive dans 76/91 cas (83,5%). L'examen bactériologique des prélèvements au niveau des ganglions atteints avait mis en évidence des bacilles acido-alcoolo-résistants à l'examen direct dans 2/31 cas (6,4%) et la culture avait isolé Mycobacteruim tuberculosis dans 1/31 cas (3,2%). La cytoponction ganglionnaire (FNAC) était évocatrice de tuberculose dans 35/42 cas (83,3%). La biopsie ganglionnaire était réalisée dans 69 cas et avait permis de retenir le diagnostic de tuberculose dans tous les cas. La FNAC, comparativement à la biopsie, avait permis de raccourcir significativement le délai de la prise en charge (15,1 vs 22,8 jours; p=0,001) et la durée d'hospitalisation (17,3 vs 24,6; p=0,004). La durée moyenne du traitement antituberculeux était de 9,8 ± 4,6 mois (7 à 44 mois). Le traitement chirurgical initial avait raccourci significativement la durée du traitement médical. Il n'avait pas d'impact sur le taux de guérison. Nous avons noté 10 cas de réponse paradoxale aux antituberculeux, quatre cas de résistance clinique et une rechute dans deux cas. La tuberculose ganglionnaire pose un problème diagnostique et thérapeutique. La microbiologie est d'un faible apport. La FNAC est un moyen diagnostique très utiles dans les pays endémiques et à faibles ressources. Un traitement médical seul permet d’éviter les inconvénients de la chirurgie. PMID:25829976

Carcinome neuroendocrine thymique: à propos d’un cas et revue de la littérature

PubMed Central

Ramahandrisoa, Andriatsihoarana Voahary Nasandratriniavo; Hasiniatsy, Nomeharisoa Rodrigue Emile; Refeno, Valéry; Vololonantenaina, Clairette Raharisolo; Rakotoarisoa, Andriamihaja Jean Claude; Rakotovao, Hanitrala Jean Louis; Rafaramino, Florine

2017-01-01

Les tumeurs neuroendocrines thymiques (TNET) sont rares, de pronostic mal connu. L'objectif est de rapporter un cas de TNET et discuter la difficulté diagnostique et thérapeutique en milieu à faibles ressources. Un homme de 60 ans présentait une douleur thoracique, une toux grasse et un amaigrissement récent. Le scanner thoracique révélait une masse tissulaire médiastinale antérieure. L'histologie définitive obtenue quatre mois après la biopsie par médiastinotomie antérieure montrait une TNET bien différenciée, avec marquage intense à la chromogranine et à la synaptophysine. La recherche d'autres tumeurs neuroendocrines et le bilan d'extension étaient négatifs. La tumeur était inextirpable d'emblée et la radiothérapie indisponible. Le patient a reçu deux lignes de chimiothérapie première. Avec un recul de 16 mois, le patient était asymptomatique, mais en progression tumorale. Le diagnostic de TNET peut être retardé quand l'examen immunohistochimique n'est pas réalisé en routine. La chimiothérapie apporte une amélioration des symptômes en situation palliative. PMID:28451004

Tumeur d'Abrikossoff juxta axillaire: une localisation rare d'une tumeur très rare, à propos d'un cas

PubMed Central

Amourak, Sarah; Bouzoubaa, Wael; Jayi, Sofia; Alaoui, Fatimazahra Fdili; Chaara, Hikmat; Melhouf, Moulay Abdelilah

2015-01-01

Décrite pour la première fois en 1926 par Abrikossoff, les tumeurs à cellules granuleuses (TCG) sont bénignes et uniques dans la grande majorité des cas. Les principales localisations sont la cavité orale, puis les tissus sous-cutanés de la tête et du cou et les seins. La pathogenèse a été longtemps débattue, après avoir proposé initialement une origine musculaire striée les études récentes sont en faveur d'une origine neurogène schwannienne confirmées par une étude immunohistochimique. Le traitement de la tumeur à cellules granuleuses est un traitement chirurgical, il permet un diagnostic de certitude par l'examen anatomo-pathologique de la pièce d'exérèse qui doit rechercher les limites d'exérèse et la présence de critères de malignité. Leur évolution est souvent favorable si la résection chirurgicale est complète. Nous rapportons ici le cas d'une tumeur d'Abrikossoff à localisation juxta axillaire et nous profitons de faire une revue de la littérature afin de mettre le point sur cette entité rare. PMID:26328001

Mise à jour sur le nouveau vaccin 9-valent pour la prévention du virus du papillome humain

PubMed Central

Yang, David Yi; Bracken, Keyna

2016-01-01

Résumé Objectif Informer les médecins de famille quant à l’efficacité, à l’innocuité, aux effets sur la santé publique et à la rentabilité du vaccin 9-valent contre le virus du papillome humain (VPH). Qualité des données Des articles pertinents publiés dans PubMed jusqu’en mai 2015 ont été examinés et analysés. La plupart des données citées sont de niveau I (essais randomisés et contrôlés et méta-analyses) ou de niveau II (études transversales, cas-témoins et épidémiologiques). Des rapports et recommandations du gouvernement sont aussi cités en référence. Message principal Le vaccin 9-valent contre le VPH, qui offre une protection contre les types 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52 et 58 du VPH, est sûr et efficace et réduira encore plus l’incidence des infections à VPH, de même que les cas de cancer lié au VPH. Il peut également protéger indirectement les personnes non immunisées par l’entremise du phénomène d’immunité collective. Un programme d’immunisation efficace peut prévenir la plupart des cancers du col de l’utérus. Les analyses montrent que la rentabilité du vaccin 9-valent chez les femmes est comparable à celle du vaccin quadrivalent original contre le VPH (qui protège contre les types 6, 11, 16 et 18 du VPH) en usage à l’heure actuelle. Toutefois, il faut investiguer plus en profondeur l’utilité d’immuniser les garçons avec le vaccin 9-valent contre le VPH. Conclusion en plus d’être sûr, le vaccin 9-valent protège mieux contre le VPH que le vaccin quadrivalent. Une analyse coûtefficacité en favorise l’emploi, du moins chez les adolescentes. Ainsi, les médecins devraient recommander le vaccin 9-valent à leurs patients plutôt que le vaccin quadrivalent contre le VPH.

Comparaison des Champs de Pression Instationnaires Calcules et Mesures sur le Modele ZKP (Comparison of Unstable Pressure Fields Calculated and Measured on the ZKP Model),

DTIC Science & Technology

1980-08-01

bord de fuite. Le nombre de Mach Man’est donc d~fini qu’entre deux limites et seule I’expdrience peut nous permettre de ...Si ion consid~re lea valeurs de Ia portance at du moment quart avant pour ce cas on obtient le tableau suivant: CC rsn Module Phase Module Phase P.P.T...Comparaison des Champs de Pression Instationnaires Calcules et Mesures sur le Mod ele ZK P COMPARISON OF UNSTABLE PRESSURE FIELDS .- %P, CALCULATED

Démarche pour la mise à niveau d’un secteur de soins pharmaceutiques : le cas de l’hémato-oncologie pédiatrique

PubMed Central

Bussières, Jean-François; Robelet, Antoine; Therrien, Roxane; Touzin, Karine

2010-01-01

Contexte : Bien que le concept de pharmacie clinique ait été développé dans les années soixante, il existe une grande variété de programmes et une grande disparité entre les programmes en clinique externe et en hospitalisation, bénéficiant de la présence d’un pharmacien dans un secteur de soins. Objectif: Éprouver une méthode de mise à niveau des secteurs de soins pharmaceutiques en établissement de santé. Méthode : Il s’agit d’une étude descriptive se déroulant au Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine, un établissement mère-enfant de 500 lits. Le secteur de soins pharmaceutiques ciblé pour illustrer la méthode de mise à niveau est l’hématologie-oncologie pédiatrique. La méthode comporte trois étapes, soit une revue de la documentation scientifique, un profil du secteur et une mise à jour du niveau de pratique selon un profil des activités pharmaceutiques dans le secteur avant et après la mise à niveau. Résultats : Au total, 108 articles ont été recensés et 22 ont été retenus à partir d’une recherche dans PubMed. Après une recherche manuelle complémentaire, 36 articles ont finalement été évalués. Parmi les articles retenus, on compte trois lignes directrices, 11 études de développement, une revue de la littérature scientifique, six études pré- et post-interventions et 15 études quasi expérimentales. Bien que les patients de ce secteur ne comptent que pour 5 % des admissions de l’hôpital, la complexité des cas est élevée tant sur le plan de la codification de l’épisode de soins que du potentiel d’intervention pharmaceutique par admission. Conclusion : Il existe peu de données illustrant une démarche de mise à niveau de la pratique dans un secteur de soins pharmaceutiques. Cette étude a éprouvé une méthode de mise à niveau dans un service d’hématologie-oncologie pédiatrique et comporte une revue de la documentation scientifique, un profil du secteur et une description des t

Folie à Trois à Lubumbashi: à propos d’un cas

PubMed Central

Bugeme, Marcellin; Mukuku, Olivier; Mobambo, Pitchou; Koba, Bora; Muyumba, Emmanuel

2013-01-01

Le trouble psychotique partagé est une entité psychiatrique rare caractérisée par la transmission des idées délirantes d’un patient dit “inducteur”, à un autre dit “induit”, tous vivant en association proche, dans un milieu clos et isolé, partageant des idées délirantes sur le même thème. Nous vous rapportons un cas clinique de “folie à trois” mettant en jeu un délire de persécution à mécanisme hallucinatoire et interprétatif par trois soeurs de même famille biologique, orphelines de père, vivant ensemble, ayant un niveau socio-économique bas après la mort de leur père. Elles ont des relations étroitement liéeset font leurs activités ensemble. L’aînée étant parvenue à partager ses idées délirantes avec ses soeurs et toutes troisse sont retrouvées dans un état d’excitation psychomotrice. PMID:23560130

Anomalie d’émergence radiculaire par racine conjointe S1: à propos d'un cas

PubMed Central

Kessely, Yannick Canton; Sakho, Maguette Gaye; Fondo, Alidji; Daisy, Akerey Diop; Thiam, Aley; Sakho, Youssoupha

2015-01-01

De découverte per-opératoire pour hernie discale, les anomalies d’émergence radiculaires constituent une entité rare. La présentation clinique est généralement identique à celle d'une radiculopathie. Nous rapportons le cas d'un patient âgé de 35 ans présentant une sciatique droite S1 hyperalgique rebelle aux multiples médications. L'IRM du rachis lombo-sacré avait mis en évidence une discopathie protrusive de petit volume en L5 S1 droite et un aspect de grosse racine ou de kyste de Tarlov au niveau de l’émergence droite de S1. Une fenestration inter lamaire L5-S1 droite avec une ablation du ligament jaune a montré une émergence radiculaire double au niveau de l'espace retro-discal. Un geste de foraminostomie a été réalisé sans discectomie. L’évolution a très favorable avec une rétrocession dès le lendemain. L'analyse pré-opératoire fine et rigoureuse de l'imagerie est indispensable. Une bonne libération améliore l’état clinique du patient. Y penser en cas de sciatique hyperalgique sans Lasègue. PMID:26113909

L'endométriose périnéale profonde sur cicatrice d’épisiotomie: à propos d'un cas rare

PubMed Central

Laadioui, Meriem; Alaoui, Fdili; Jayi, Sofia; Bouguern, Hakima; Chaara, Hikmat; Melhouf, Moulay Aabdelilah

2013-01-01

Parmi les localisations rares de l'endométriose sur cicatrice, celle du périnée demeure exceptionnelle, l'origine en est souvent iatrogène (épisiotomie). Nous rapportons le cas d'une patiente présentant une douleur cyclique, au niveau de la cicatrice d’épisiotomie. Avec à l'examen clinique une masse de 3,5 cm de grand diamètre au niveau de la cicatrice d’épisiotomie. L’écho périnéale a objectivé une image hypoéchgène hétérogène non vascularisée en regard de la cicatrice d’épisiotomie faisant 3,23/1cm. L'excision de la lésion a été réalisée et l’étude anatomopathologique a confirmé le diagnostic d'endométriose. Les suites postopératoires étaient simples avec un recul de 3 mois sans récidive de la douleur ni de la masse. A travers notre cas et une revue de la littérature, nous insistons sur les la nécessité du diagnostic clinique et d'une prise en charge précoce en vue d'améliorer le pronostic de cette entité rare. PMID:24778749

La carence en vitamine D chez l'adulte au Gabon: cas isolé ou problème méconnu?

PubMed Central

Ntyonga-Pono, Marie-Pierrette

2014-01-01

La carence en vitamine D chez l'adulte est un sujet d'actualité à cause de ses multiples effets et de son extension de par le monde. Cependant elle est peu explorée au Gabon et en Afrique centrale en général. Le but de cet article qui rapporte trois cas documentés de carence en vitamine D chez l'adulte au Gabon, est d'attirer l'attention sur l'existence de ce problème même en zone équatoriale ensoleillée. Vu les implications de cette carence dans diverses pathologies osseuses, cardio-vasculaires, métaboliques, infectieuses, auto-immunes, néoplasiques..., des recherches plus approfondies sont nécessaires pour cerner le problème et prendre des mesures appropriées. PMID:25815104

Molecular Mechanisms of RNA-Targeting by Cas13-containing Type VI CRISPR-Cas Systems.

PubMed

O'Connell, Mitchell

2018-06-22

Prokaryotic adaptive immune systems use CRISPRs (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and CRISPR associated (Cas) proteins for RNA-guided cleavage of foreign genetic elements. The focus of this review, Type VI CRISPR-Cas systems, include a single protein known as Cas13 (formerly C2c2), that when assembled with a crRNA forms a crRNA-guided RNA-targeting effector complex. Type VI CRISPR-Cas systems can be divided into four subtypes (A-D) based on Cas13 phylogeny. All Cas13 proteins studied to date possess two enzymatically distinct ribonuclease activities that are required for optimal interference. One RNase is responsible for pre-crRNA processing to form mature Type VI interference complexes, while the other RNase activity provided by the two HEPN (Higher Eukaryotes and Prokaryotes Nucleotide-binding) domains, is required for degradation of target RNA during viral interference. In this review, I will compare and contrast what is known about the molecular architecture and behavior of Type VI (A-D) CRISPR-Cas13 interference complexes, how this allows them to carry out their RNA-targeting function, how Type VI accessory proteins are able to modulate Cas13 activity, and how together all of these features have led to the rapid development of a range of RNA-targeting applications. Throughout I will also discuss some of the outstanding questions regarding Cas13's molecular behavior, and its role in bacterial adaptive immunity and RNA-targeting applications. Copyright © 2018. Published by Elsevier Ltd.

Les traumatismes de l’étage antérieur de la base du crane: à propos d'une série de 136 cas

PubMed Central

Bouchaouch, Abdelali; Hassani, Fahd Derkaoui; Abboud, Hilal; Mukengeshay, Jeff Ntalaja; El Fatemi, Nizare; Gana, Rachid; El Maaqili, Moulay Rchid; El Abbadi, Najia; Bellakhdar, Fouad

2015-01-01

Les traumatismes de l’étage antérieur de la base du crâne représentent 15 à 20% des traumatismes crâniens en général. Ils menacent les structures neuro-encéphaliques sus jacentes et sont très souvent responsables de brèches ostéo-méningées exposant au risque infectieux. Notre travail a concerné 136 dossiers exploitables de traumatisme de l’étage antérieur de la base du crâne colligés sur une période de 10 ans entre janvier 2003 et décembre 2012. Le diagnostic a été suspecté devant les signes cliniques évocateurs (ecchymose péri-orbitaire, rhinorrhée…) et a été confirmé dans la plupart des cas par la TDM. Le traitement idéal est la fermeture chirurgicale de la brèche en association aux moyens médicaux (vaccination, anti-épileptiques, mesures de réanimation…) Le moment idéal de la réparation est au-delà de la 72ème heure après la diminution de l'oedème cérébral en cas d'absence d'une lésion intracrânienne nécessitant une intervention en urgence. Notre équipe ne pratiquant pas la voie endoscopique, l'abord frontal est souvent indiqué. Le pronostic dépend des lésions cérébrales associées et surtout de la présence d'une brèche dont le diagnostic et la réparation doivent être les plus rapides et les plus précis possibles. Ainsi toute rhinorrhée post-traumatique nécessite une exploration systématique, le timing idéal: c'est la disparition de l'oedème cérébral pour faciliter l'exploration, ceci est en général possible à partir de la 72ème heure sauf dans les cas associés à une autre lésion intra crânienne nécessitant une exploration en urgence. PMID:26327992

Mariage non consommé et vaginisme: à propos de trois cas Clinique

PubMed Central

2017-01-01

Le vaginisme est un problème de couple. Il est source de mariages non consommés, d’infertilité et d’altération de la qualité de la relation sexuelle du couple. Par trois cas cliniques illustratifs rapportés de notre pratique clinique quotidienne et suivis sur deux années en consultation du service de psychiatrie de l’Hôpital Militaire Moulay Ismail de Meknès, nous essayons de clarifier les motifs de rencontre pour vaginisme, ses aspects cliniques et relationnels et ses particularités culturelles. PMID:28819482

Tumeur de Frantz: deux nouveaux cas

PubMed Central

Bellarbi, Salma; Sina, Mohamed; Jahid, Ahmed; Zouaidia, Fouad; Bernoussi, Zakia; Mahassini, Najat

2013-01-01

A travers cet article, nous détaillons les caractéristiques clinico-pathologiques et discutons l'histogenèse de la tumeur de Frantz. Deux patients opérés pour tumeur de Frantz. Ils ont eu un traitement chirurgical seul. L'étude morphologique était couplée à un examen immuno-histochimique (IHC) utilisant les anticorps anti CD10, anti- vimentine, anti-énolase neuronale spécifique (NSE), anti-synaptophysine, anti-chromogranine A et anti-cytokératine. Un immuno-marquage à l'anti-oestrogène et l'anti-progestérone a été réalisé dans un cas. Il s'agissait d'une femme âgée de 45ans et d'un garçon de 12 ans. Les aspects échographiques et scannographiques étaient non spécifiques. Une exérèse chirurgicale complète a été réalisée dans les deux cas. L'analyse histologique évoquait une tumeur de Frantz. Le diagnostic a été retenu après étude immuno-histohimique. L'évolution était favorable sans récidive avec respectivement un recul de 18 et 16 mois. La tumeur de Frantz est une entité rare. Son diagnostic repose sur l'examen anatomopathologique complété par l'étude immuno-histochimique. Son pronostic est excellent après résection chirurgicale. PMID:23503717

Cancer développé sur dilatation kystique de la voie biliaire: à propos d’un cas

PubMed Central

Soufi, Mehdi; Lahlou, Mohammed Khalid; Chad, Bouziane

2014-01-01

Les auteurs rapportent un cas de dilatation kystique du cholédoque intra- pancréatique découvert chez une femme de 46 ans et compliqué d'un carcinome tubulo-papillaire n'envahissant pas le pancréas. Le traitement a consisté en une duodénopancréatectomie céphalique avec un curage ganglionnaire et anastomose hépatico-jéjunale; la survie était de 30 mois; les auteurs abordent les aspects radiologiques, anatomopathologiques, thérapeutiques et pronostiques de ces cancers développé sur dilatation kystique de la voie biliaire et discutent la place d'une radiothérapie complémentaire de la chirurgie susceptible d'améliorer la survie. PMID:25922635

Crystal Structure of Streptococcus pyogenes Cas1 and Its Interaction with Csn2 in the Type II CRISPR-Cas System.

PubMed

Ka, Donghyun; Lee, Hasup; Jung, Yi-Deun; Kim, Kyunggon; Seok, Chaok; Suh, Nayoung; Bae, Euiyoung

2016-01-05

CRISPRs and Cas proteins constitute an RNA-guided microbial immune system against invading nucleic acids. Cas1 is a universal Cas protein found in all three types of CRISPR-Cas systems, and its role is implicated in new spacer acquisition during CRISPR-mediated adaptive immunity. Here, we report the crystal structure of Streptococcus pyogenes Cas1 (SpCas1) in a type II CRISPR-Cas system and characterize its interaction with S. pyogenes Csn2 (SpCsn2). The SpCas1 structure reveals a unique conformational state distinct from type I Cas1 structures, resulting in a more extensive dimerization interface, a more globular overall structure, and a disruption of potential metal-binding sites for catalysis. We demonstrate that SpCas1 directly interacts with SpCsn2, and identify the binding interface and key residues for Cas complex formation. These results provide structural information for a type II Cas1 protein, and lay a foundation for studying multiprotein Cas complexes functioning in type II CRISPR-Cas systems. Copyright © 2016 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Exploiting CRISPR/Cas systems for biotechnology

PubMed Central

Sampson, Timothy R.; Weiss, David S.

2015-01-01

The Cas9 endonuclease is the central component of the Type II CRISPR/Cas system, a prokaryotic adaptive restriction system against invading nucleic acids, such as those originating from bacteriophages and plasmids. Recently, this RNA-directed DNA endonuclease has been harnessed to target DNA sequences of interest. Here, we review the development of Cas9 as an important tool to not only edit the genomes of a number of different prokaryotic and eukaryotic species, but also as an efficient system for site-specific transcriptional repression or activation. Additionally, a specific Cas9 protein has been observed to target an RNA substrate, suggesting that Cas9 may have the ability to be programmed to target RNA as well. Cas proteins from other CRISPR/Cas subtypes may also be exploited in this regard. Thus, CRISPR/Cas systems represent an effective and versatile biotechnological tool, which will have significant impact on future advancements in genome engineering. PMID:24323919

Exploiting CRISPR/Cas systems for biotechnology.

PubMed

Sampson, Timothy R; Weiss, David S

2014-01-01

The Cas9 endonuclease is the central component of the Type II CRISPR/Cas system, a prokaryotic adaptive restriction system against invading nucleic acids, such as those originating from bacteriophages and plasmids. Recently, this RNA-directed DNA endonuclease has been harnessed to target DNA sequences of interest. Here, we review the development of Cas9 as an important tool to not only edit the genomes of a number of different prokaryotic and eukaryotic species, but also as an efficient system for site-specific transcriptional repression or activation. Additionally, a specific Cas9 protein has been observed to target an RNA substrate, suggesting that Cas9 may have the ability to be programmed to target RNA as well. Cas proteins from other CRISPR/Cas subtypes may also be exploited in this regard. Thus, CRISPR/Cas systems represent an effective and versatile biotechnological tool, which will have significant impact on future advancements in genome engineering. © 2014 WILEY Periodicals, Inc.

Les violences conjugales à Dakar

PubMed Central

Soumah, Mohamed Maniboliot; Issa, Abdoul Wahab; Ndiaye, Mor; Ndoye, El Hadj Oumar; Sow, Mamadou Lamine

2015-01-01

L'objectif était d’évaluer les aspects épidémiologiques des violences conjugales, identifier les facteurs de risques et les différents types de violences conjugales, évaluer les conséquences des violences conjugales sur la santé des victimes, afin d'améliorer la prise en charge des victimes et la prévention du phénomène. Il s'est agit d'une étude transversale effectuée de décembre 2012 à janvier 2013 à Dakar. Les données ont été recueillies, après consentement, sur fiche d'enquête anonyme soumise à toute personne volontaire vivant en couple et résidant à Dakar. L'analyse statistique a été effectuée avec le logiciel SPSS 13.0. Le nombre de personnes victimes de violences conjugales était de 60 soit 37,30% dont 31 femmes (51,70%) et 29 hommes (48,30%). Le sex-ratio était de 0,93. Parmi les victimes, 53 étaient scolarisées soit 88,30%. Le régime matrimonial était de type monogame dans 39 cas (65%) et polygame dans 21 cas (35%). La vie en couple durait depuis moins de 11 ans dans 60% des cas et durait de 11 ans à 20 ans au plus dans 26,6% des cas. L’étude des types de violences montrait la fréquence des agressions physiques. Les armes utilisées étaient surtout les armes naturelles. Les principaux facteurs de risque de violence conjugale sont les facteurs sociodémographiques, culturels et économiques comme le jeune âge, l'inégalité du genre, les jeunes couples, la précarité, le niveau d'instruction élevé. La prise en charge des victimes et la prévention du phénomène restent insuffisantes dans nos pays. PMID:26918077

La perforation stercorale du côlon: à propos d'un cas et revue de la littérature

PubMed Central

Mahmoudi, Ammar; Maâtouk, Mezri; Noomen, Faouzi; Nasr, Mohamed; Zouari, Khadija; Hamdi, Abdelaziz

2015-01-01

Affection rare, la perforation stercorale du côlon touche des malades âgés souvent fragiles ayant une longue histoire de constipation chronique et sévère. Elle constitue une urgence chirurgicale dont le pronostic, souvent sombre, dépend du terrain et de la rapidité de la prise en charge. Nous rapportons le cas d'une perforation stercorale du côlon survenu chez une patiente âgée de 74 ans. La symptomatologie clinique était celle d'une péritonite aiguë évoluant depuis quatre jours. Le diagnostic n’était posé qu'en peropératoire. Le geste avait consisté en une intervention de Hartmann. Les suites étaient malheureusement marquées par un état de choc septique résistant aboutissant au décès de la patiente à J 2 postopératoire. Le diagnostic de perforation stercorale du côlon, souvent difficile et retardé, doit être connu par tous les médecins qui prennent en charge une population de patients de plus en plus âgés. PMID:26958112

A newly discovered Bordetella species carries a transcriptionally active CRISPR-Cas with a small Cas9 endonuclease

USDA-ARS?s Scientific Manuscript database

The Cas9 endonuclease of the Type II-a clustered regularly interspersed short palindromic repeats (CRISPR), of Streptococcus pyogenes (SpCas9) has been adapted as a widely used tool for genome editing and genome engineering. Herein, we describe a gene encoding a novel Cas9 ortholog (BpsuCas9) and th...

Choroïdopathie du lupus érythémateux systémique, à propos d'un cas

PubMed Central

Idriss, Benatiya Andaloussi; Fouad, Chraibi; Salima, Bhallil; Meryem, Abdellaoui; Hicham, Tahri

2013-01-01

Le lupus érythémateux systémique (LES) est une maladie auto-immune multi systémique d’étiologie inconnue. Nous rapportons une manifestation très rare du LES représentée par une choroidopathie bilatérale sans hypertension artérielle associée. Il s'agit d'une patiente âgée de 45 ans, suivie pour un LES depuis 5 ans, qui présente une baisse de l'acuité visuelle bilatérale et progressive depuis 3 mois. L'examen du fond d’œil, complété l'angiographie à la fluorescéine et la tomographie en cohérence optique, retrouve un décollement séreux rétinien (DSR) multifocal et bilatéral. L’évolution après corticothérapie systémique est marquée par une amélioration de l'acuité visuelle et une régression du DSR. L'atteinte oculaire au cours du LED est dominée par la kérato-conjonctivite sèche (1/4 à 1/3 des cas). La choroïdopathie est plus rare: seulement une trentaine de cas sont rapportés dans littérature. Elle se manifeste par un décollement séreux rétinien et est habituellement observée chez les patients présentant une néphropathie ou une hypertension artérielle, ce qui n'est pas le cas de notre observation. L'apparition d'une atteinte oculaire au cours du LES peut annoncer une poussée d'atteinte systémique et doit susciter une enquête appropriée. PMID:23717732

[Detection of CRSPR-Cas system in Streptococcus thermophiles].

PubMed

Li, Wan; Liang, Hongzhang; Zhang, Danqing; Wang, Nana; Tang, Yaru; Li, Bailiang; Huo, Guicheng

2016-04-14

We aimed to detect the CRSPR-Cas system of six Streptococcus thermophilus. Bioinformatics method was used to predict CRSPR-Cas system of nine S. thermophilus that published in National Center for Biotechnology Information. Four primers were designed according to the flanking sequences of standard strains and the CRISPR-Cas system of six S. thermophilus have been detected by PCR method. S. thermophilus S4 had a Cas9 gene, others all had Cas9 gene, Cas10 gene and Cas9* gene. In addition, 79 and KLDS3.0207 still had Cas3 gene. Signature genes amplification of CRSPR-Cas system could predict the type of CRSPR-Cas system in unsequenced strains, these findings will help establish the foundation for the study of CRSPR-Cas system in lactic acid bacteria.

5 CFR 410.402 - Paying premium pay.

Code of Federal Regulations, 2010 CFR

2010-01-01

... 5 Administrative Personnel 1 2010-01-01 2010-01-01 false Paying premium pay. 410.402 Section 410... for Training Expenses § 410.402 Paying premium pay. (a) Prohibitions. Except as provided by paragraph (b) of this section, an agency may not use its funds, appropriated or otherwise available, to pay...

Schwannome benin primitif retrovesical: une tumeur très rare à propos d'un cas

PubMed Central

Beddouche, Ali; Fahsi, Othemane; Kallat, Adil; El Bote, Hicham; Ziani, Idriss; El Sayegh, Hachem; Iken, Ali; Benslimane, Lounis; Nouini, Yassine

2016-01-01

Le schwannome est une tumeur le plus souvent bénigne, d'origine nerveuse se développant à partir des cellules de la gaine de Schwann. C'est une tumeur très rare tant par sa fréquence que par sa localisation rétrovésicale. L'examen anatomopathologique et immunohistochimique confirme le type histologique ainsi que le caractère bénin ou malin du schwannome. En raison des récidives, et du risque de transformation maligne, l'exérèse doit être complète. Nous rapportons le cas d'un patient âgé de 39 ans, admis pour une douleur pelvienne chronique à type de pesanteur, des signes irritatifs du bas appareil urinaire, et des troubles de transit. L'imagerie (échographie, TDM, IRM) a révélé la présence d'une masse pelvienne rétrovésicale, à paroi fine, latéralisée à gauche, mesurant 68x70x70 mm, exerçant un effet de masse sur la vessie et le sigmoïde. L'intervention chirurgicale menée par une laparotomie médiane a permis l'exérèse d'une masse retrovésicale bien encapsulée. L'examen anatomopathologique et immunohistochimique ont conclu à un schwannome bénin. La récidive et la transformation maligne bien que rare après chirurgie impose une surveillance post opératoire clinique et tomodensitométrique annuelle. PMID:27217902

A newly discovered Bordetella species carries a transcriptionally active CRISPR-Cas with a small Cas9 endonuclease.

PubMed

Ivanov, Yury V; Shariat, Nikki; Register, Karen B; Linz, Bodo; Rivera, Israel; Hu, Kai; Dudley, Edward G; Harvill, Eric T

2015-10-26

Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) and CRISPR-associated genes (cas) are widely distributed among bacteria. These systems provide adaptive immunity against mobile genetic elements specified by the spacer sequences stored within the CRISPR. The CRISPR-Cas system has been identified using Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) against other sequenced and annotated genomes and confirmed via CRISPRfinder program. Using Polymerase Chain Reactions (PCR) and Sanger DNA sequencing, we discovered CRISPRs in additional bacterial isolates of the same species of Bordetella. Transcriptional activity and processing of the CRISPR have been assessed via RT-PCR. Here we describe a novel Type II-C CRISPR and its associated genes-cas1, cas2, and cas9-in several isolates of a newly discovered Bordetella species. The CRISPR-cas locus, which is absent in all other Bordetella species, has a significantly lower GC-content than the genome-wide average, suggesting acquisition of this locus via horizontal gene transfer from a currently unknown source. The CRISPR array is transcribed and processed into mature CRISPR RNAs (crRNA), some of which have homology to prophages found in closely related species B. hinzii. Expression of the CRISPR-Cas system and processing of crRNAs with perfect homology to prophages present in closely related species, but absent in that containing this CRISPR-Cas system, suggest it provides protection against phage predation. The 3,117-bp cas9 endonuclease gene from this novel CRISPR-Cas system is 990 bp smaller than that of Streptococcus pyogenes, the 4,017-bp allele currently used for genome editing, and which may make it a useful tool in various CRISPR-Cas technologies.

Histiocytose langerhansienne pulmonaire révélée par un pneumothorax: à propos d’un cas

PubMed Central

Sajiai, Hafsa; Rachidi, Mariam; Serhane, Hind; Aitbatahar, Salma; Amro, Lamyae

2016-01-01

L’histiocytose langerhansienne est une affection rare d’étiologie inconnue caractérisée par une infiltration d’un ou plusieurs organes, par des cellules de type Langerhans. Elle a une présentation clinique polymorphe. Nous rapportons le cas de Mr R.Y, âgé de 22 ans, tabagique à 8 PA, admis pour pneumothorax total spontané droit. Un drainage thoracique a été réalisé avec bonne évolution. La TDM thoracique de contrôle a objectivé de multiples formations kystiques diffuses prédominant aux lobes supérieurs. Un bilan a été réalisé à la recherche d’une histiocytose systémique mais s’est révélé négatif. L’évolution était marquée par la récidive du pneumothorax, le recours à une pleurodèse et la réalisation d’une biopsie pulmonaire qui a confirmé le diagnostic. Le diagnostic de l’HistiocytoseLangerhansienne doit être évoqué devant un pneumothorax sur poumon kystique. Le diagnostic est aisé devant un tableau clinique et radiologique évocateur. Néanmoins, les possibilités thérapeutiques restent limitées et la récidive du pneumothorax est fréquente. PMID:28154724

Localisation humérale d'une tumeur à cellules géantes récidivantes (à propos d'un cas)

PubMed Central

Nader, Youssef; Serghini, Issam; Koulali, Idrissi Khalid; Salahi, Hicham; Galwia, Farid

2015-01-01

Les auteurs rapportent un cas de localisation rare d'une tumeur à cellules géantes au niveau de la palette humérale du coude droit chez un militaire de 36 ans de sexe masculin, la radio standard montrait une image kystique ne soufflant pas la corticale. L'examen anatomo-pathologique a permis d’ établir le diagnostic et le traitement a fait appel: au début a une Exérèse chirurgicale totale et une greffe osseuse par un greffon iliaque de la totalité de la palette huméral qui s'est compliquée à 6 mois de recule d une récidive locale. PMID:25995809

All-in-One CRISPR-Cas9/FokI-dCas9 Vector-Mediated Multiplex Genome Engineering in Cultured Cells.

PubMed

Sakuma, Tetsushi; Sakamoto, Takuya; Yamamoto, Takashi

2017-01-01

CRISPR-Cas9 enables highly convenient multiplex genome engineering in cultured cells, because it utilizes generic Cas9 nuclease and an easily customizable single-guide RNA (sgRNA) for site-specific DNA double-strand break induction. We previously established a multiplex CRISPR-Cas9 assembly system for constructing an all-in-one vector simultaneously expressing multiple sgRNAs and Cas9 nuclease or other Cas9 variants including FokI-dCas9, which supersedes the wild-type Cas9 with regard to high specificity. In this chapter, we describe a streamlined protocol to design and construct multiplex CRISPR-Cas9 or FokI-dCas9 vectors, to introduce them into cultured cells by lipofection or electroporation, to enrich the genomically edited cells with a transient puromycin selection, to validate the mutation efficiency by Surveyor nuclease assay, and to perform off-target analyses. We show that our protocol enables highly efficient multiplex genome engineering even in hard-to-transfect HepG2 cells.

La Greffe de Peau dans le Traitement des Sequelles de la Main Brulee. A Propos de 152 Cas - Experience du Service de Chirurgie Plastique du Centre Hospitalier Universitaire Ibn-Sina, Rabat, Maroc

PubMed Central

El Mazouz, S.; Fejjal, N.; Hafidi, J.; Cherkab, L.; Mejjati, H.; Belfqih, R.; Gharib, N.; Abbassi, A.

2010-01-01

Summary La main est fréquemment exposée aux brûlures, entraînant des séquelles esthétiques et fonctionnelles. Le traitement de ces séquelles est surtout chirurgical et consiste en la greffe de peau, dont le type dépend de la localisation de la brûlure et du type des séquelles. Dans ce travail rétrospectif, nous rapportons une série de 152 cas de brûlures des mains colligés au service de chirurgie plastique du Centre Hospitalier Universitaire Ibn-Sina de Rabat sur une période de dix ans, allant de 1998 à 2007. Les indications thérapeutiques dépendent du type de séquelles et de la localisation de la brûlure. En tout, 97 patients ont bénéficié d'une greffe cutanée, dont 76% par greffe de peau totale, 21% par greffe de peau demi-épaisse et 3% par peau fine. Les séquelles des brûlures des mains posent un problème thérapeutique majeur, malgré la diversité des procédés chirurgicaux, d'où l'intérêt de la prévention. PMID:21991196

Crystal Structure of the Minimal Cas9 from Campylobacter jejuni Reveals the Molecular Diversity in the CRISPR-Cas9 Systems.

PubMed

Yamada, Mari; Watanabe, Yuto; Gootenberg, Jonathan S; Hirano, Hisato; Ran, F Ann; Nakane, Takanori; Ishitani, Ryuichiro; Zhang, Feng; Nishimasu, Hiroshi; Nureki, Osamu

2017-03-16

The RNA-guided endonuclease Cas9 generates a double-strand break at DNA target sites complementary to the guide RNA and has been harnessed for the development of a variety of new technologies, such as genome editing. Here, we report the crystal structures of Campylobacter jejuni Cas9 (CjCas9), one of the smallest Cas9 orthologs, in complex with an sgRNA and its target DNA. The structures provided insights into a minimal Cas9 scaffold and revealed the remarkable mechanistic diversity of the CRISPR-Cas9 systems. The CjCas9 guide RNA contains a triple-helix structure, which is distinct from known RNA triple helices, thereby expanding the natural repertoire of RNA triple helices. Furthermore, unlike the other Cas9 orthologs, CjCas9 contacts the nucleotide sequences in both the target and non-target DNA strands and recognizes the 5'-NNNVRYM-3' as the protospacer-adjacent motif. Collectively, these findings improve our mechanistic understanding of the CRISPR-Cas9 systems and may facilitate Cas9 engineering. Copyright © 2017 Elsevier Inc. All rights reserved.

A Broad-Spectrum Inhibitor of CRISPR-Cas9.

PubMed

Harrington, Lucas B; Doxzen, Kevin W; Ma, Enbo; Liu, Jun-Jie; Knott, Gavin J; Edraki, Alireza; Garcia, Bianca; Amrani, Nadia; Chen, Janice S; Cofsky, Joshua C; Kranzusch, Philip J; Sontheimer, Erik J; Davidson, Alan R; Maxwell, Karen L; Doudna, Jennifer A

2017-09-07

CRISPR-Cas9 proteins function within bacterial immune systems to target and destroy invasive DNA and have been harnessed as a robust technology for genome editing. Small bacteriophage-encoded anti-CRISPR proteins (Acrs) can inactivate Cas9, providing an efficient off switch for Cas9-based applications. Here, we show that two Acrs, AcrIIC1 and AcrIIC3, inhibit Cas9 by distinct strategies. AcrIIC1 is a broad-spectrum Cas9 inhibitor that prevents DNA cutting by multiple divergent Cas9 orthologs through direct binding to the conserved HNH catalytic domain of Cas9. A crystal structure of an AcrIIC1-Cas9 HNH domain complex shows how AcrIIC1 traps Cas9 in a DNA-bound but catalytically inactive state. By contrast, AcrIIC3 blocks activity of a single Cas9 ortholog and induces Cas9 dimerization while preventing binding to the target DNA. These two orthogonal mechanisms allow for separate control of Cas9 target binding and cleavage and suggest applications to allow DNA binding while preventing DNA cutting by Cas9. Copyright © 2017 Elsevier Inc. All rights reserved.

Annotation and Classification of CRISPR-Cas Systems

PubMed Central

Makarova, Kira S.; Koonin, Eugene V.

2018-01-01

The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-Cas (CRISPR-associated proteins) is a prokaryotic adaptive immune system that is represented in most archaea and many bacteria. Among the currently known prokaryotic defense systems, the CRISPR-Cas genomic loci show unprecedented complexity and diversity. Classification of CRISPR-Cas variants that would capture their evolutionary relationships to the maximum possible extent is essential for comparative genomic and functional characterization of this theoretically and practically important system of adaptive immunity. To this end, a multipronged approach has been developed that combines phylogenetic analysis of the conserved Cas proteins with comparison of gene repertoires and arrangements in CRISPR-Cas loci. This approach led to the current classification of CRISPR-Cas systems into three distinct types and ten subtypes for each of which signature genes have been identified. Comparative genomic analysis of the CRISPR-Cas systems in new archaeal and bacterial genomes performed over the 3 years elapsed since the development of this classification makes it clear that new types and subtypes of CRISPR-Cas need to be introduced. Moreover, this classification system captures only part of the complexity of CRISPR-Cas organization and evolution, due to the intrinsic modularity and evolutionary mobility of these immunity systems, resulting in numerous recombinant variants. Moreover, most of the cas genes evolve rapidly, complicating the family assignment for many Cas proteins and the use of family profiles for the recognition of CRISPR-Cas subtype signatures. Further progress in the comparative analysis of CRISPR-Cas systems requires integration of the most sensitive sequence comparison tools, protein structure comparison, and refined approaches for comparison of gene neighborhoods. PMID:25981466

Annotation and Classification of CRISPR-Cas Systems.

PubMed

Makarova, Kira S; Koonin, Eugene V

2015-01-01

The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-Cas (CRISPR-associated proteins) is a prokaryotic adaptive immune system that is represented in most archaea and many bacteria. Among the currently known prokaryotic defense systems, the CRISPR-Cas genomic loci show unprecedented complexity and diversity. Classification of CRISPR-Cas variants that would capture their evolutionary relationships to the maximum possible extent is essential for comparative genomic and functional characterization of this theoretically and practically important system of adaptive immunity. To this end, a multipronged approach has been developed that combines phylogenetic analysis of the conserved Cas proteins with comparison of gene repertoires and arrangements in CRISPR-Cas loci. This approach led to the current classification of CRISPR-Cas systems into three distinct types and ten subtypes for each of which signature genes have been identified. Comparative genomic analysis of the CRISPR-Cas systems in new archaeal and bacterial genomes performed over the 3 years elapsed since the development of this classification makes it clear that new types and subtypes of CRISPR-Cas need to be introduced. Moreover, this classification system captures only part of the complexity of CRISPR-Cas organization and evolution, due to the intrinsic modularity and evolutionary mobility of these immunity systems, resulting in numerous recombinant variants. Moreover, most of the cas genes evolve rapidly, complicating the family assignment for many Cas proteins and the use of family profiles for the recognition of CRISPR-Cas subtype signatures. Further progress in the comparative analysis of CRISPR-Cas systems requires integration of the most sensitive sequence comparison tools, protein structure comparison, and refined approaches for comparison of gene neighborhoods.

Naturally occurring off-switches for CRISPR-Cas9

PubMed Central

Pawluk, April; Amrani, Nadia; Zhang, Yan; Garcia, Bianca; Hidalgo-Reyes, Yurima; Lee, Jooyoung; Edraki, Alireza; Shah, Megha; Sontheimer, Erik J.; Maxwell, Karen L.; Davidson, Alan R.

2017-01-01

Summary CRISPR-Cas9 technology would be enhanced by the ability to inhibit Cas9 function spatially, temporally, or conditionally. Previously, we discovered small proteins encoded by bacteriophages that inhibit the CRISPR-Cas systems of their host bacteria. These “anti-CRISPRs” were specific to type I CRISPR-Cas systems that do not employ the Cas9 protein. We posited that nature would also yield Cas9 inhibitors in response to the evolutionary arms race between bacteriophages and their hosts. Here, we report the discovery of three distinct families of anti-CRISPRs that specifically inhibit the CRISPR-Cas9 system of Neisseria meningitidis. We show that these proteins bind directly to N. meningitidis Cas9 (NmeCas9), and can be used as potent inhibitors of genome editing by this system in human cells. These anti-CRISPR proteins now enable “off-switches” for CRISPR-Cas9 activity, and provide a genetically-encodable means to inhibit CRISPR-Cas9 genome editing in eukaryotes. PMID:27984730

Épidémiologie des brûlures de la main chez les enfants vus dans le Centre National des Brûlés et de Chirurgie Plastique de Casablanca, Maroc

PubMed Central

Rafik, A.; Lahlou, M.; Diouri, M.; Bahechar, N.; Chlihi, A.

2015-01-01

Summary Les brûlures de la main chez l’enfant constituent une source de séquelles invalidantes. A cet régard, la conservation et la restauration complète de la fonction de la main demeurent le but primordial de la prise en charge. Afin de répertorier les caractéristiques épidémiologiques, cliniques et évolutives des mains brûlées, nous avons réalisé une étude rétrospective étalée sur 4 ans, de janvier 2011 à janvier 2015. Cette étude a permis de colliger les cas de 313 enfants atteints de brûlure de la main vus dans le Centre National des Brulés et de Chirurgie Plastique du CHU Ibn Rochd de Casablanca. La majorité des brûlures touche les enfants de 3 à 6 ans (70% des cas), avec une légère prédominance masculine. La principale cause des brûlures survenant à cet âge est l’ébouillantement. Les brûlures par flamme représentent 33% des cas, celles par électricité 4,5%. Les brûlures chimiques et par contact sont anecdotiques (1 cas chacune). L’accident survient le plus souvent à domicile. Soixante douze pour cent des brûlures ont guéri spontanément. Afin de diminuer l’incidence de ces accidents, une approche préventive faite de sensibilisation et d’éducation devrait faire partie du cursus scolaire. PMID:27777543

CRISPR-Cas: Adapting to change.

PubMed

Jackson, Simon A; McKenzie, Rebecca E; Fagerlund, Robert D; Kieper, Sebastian N; Fineran, Peter C; Brouns, Stan J J

2017-04-07

Bacteria and archaea are engaged in a constant arms race to defend against the ever-present threats of viruses and invasion by mobile genetic elements. The most flexible weapons in the prokaryotic defense arsenal are the CRISPR-Cas adaptive immune systems. These systems are capable of selective identification and neutralization of foreign DNA and/or RNA. CRISPR-Cas systems rely on stored genetic memories to facilitate target recognition. Thus, to keep pace with a changing pool of hostile invaders, the CRISPR memory banks must be regularly updated with new information through a process termed CRISPR adaptation. In this Review, we outline the recent advances in our understanding of the molecular mechanisms governing CRISPR adaptation. Specifically, the conserved protein machinery Cas1-Cas2 is the cornerstone of adaptive immunity in a range of diverse CRISPR-Cas systems. Copyright © 2017, American Association for the Advancement of Science.

Une étude rétrospective sur le cancer de l'ovaire avec un recul médian de 42 mois

PubMed Central

Raherinantenaina, Fanomezantsoa; Rakotomena, Solonirina Davidà; Hasiniatsy, Nomeharisoa Rodrigue Emile; Rakototiana, Felantsoa Auberlin; Rafaramino, Florine; Ratsimba, Hery Nirina Rakoto

2015-01-01

Le cancer de l'ovaire est relativement fréquent mais grave et de mauvais pronostic. Le but de cette étude était de mettre en évidence les aspects épidémiologique, diagnostique, thérapeutique et évolutif de cette pathologie maligne prise en charge dans un pays en développement. Il s'agit d'une étude rétrospective et descriptive de 10 ans (2000- 2009) effectuée dans un CHU de chirurgie générale et d'Oncologie sur 62 patientes ayant développé un cancer de l'ovaire et opérées à visée curative. L’âge moyen des patientes était de 43 ans dont 53,23% avaient plus de 45 ans. Le dosage sanguin du CA-125 était positif chez 10 patientes sur 12. Les tumeurs étaient découvertes à l’échographie dans 87,10% des cas et à la laparotomie dans 12,90%. L'hystérectomie totale avec annexectomie bilatérale était l'intervention la plus pratiquée (64,52%). Les suites opératoires précoces étaient simples. Dix patientes étaient opérées de second regard (16,13%) pour des récidives locorégionales. Les tumeurs épithéliales étaient le type histologique le plus fréquent (93,55%) dont 79% au stade avancé (Ic-IV) et 21% au stade précoce (Ia-Ib). La chimiothérapie adjuvante était administrée chez 22,60% des patientes. Avec un recul médian de 42 mois, 29 patientes étaient perdues de vue. L’évolution était favorable dans 27,42% et dans 25,81% les décès se sont survenus en postopératoire tardif. Le cancer de l'ovaire n’était pas fréquent mais grave compte tenu des stades avancés et du taux élevé des décès postopératoires tardifs qui étaient largement observés chez les patientes privées d'une chimiothérapie adéquate. PMID:26113942

Modèle tridimensionnel pour coupler les équations magnétiques et électriques dans le cas de la magnétostatique

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Piriou, F.; Razek, A.

1991-03-01

In this paper a 3D model for coupling of magnetic and electric equations is presented. The magnetic equations are solved with the help of finite element method using the magnetic vector potential formulation. To take into account the effects of magnetic saturation we use the Newton-Raphson algorithm. We develop the analysis permitting the coupling of magnetic and electric equations to obtain a difrerential system equations which can be solved with numerical integration. As example we model an iron core coil and the validity of our model is verified by a comparison of the obtained results with an analytical solution and a 2D code calculation. Dans cet article est présenté un modèle 3D qui permet de coupler les équations magnétiques et électriques. Les équations magnétiques sont résolues à l'aide de la méthode des éléments finis en utilisant une formulation en potentiel vecteur magnétique. Dans le modèle proposé les effets de la saturation du circuit magnétique sont pris en compte en utilisant l'algorithme de Newton-Raphson. On montre comment relier les équations magnétiques avec celles du circuit électrique pour aboutir à un système d'équations différentielles que l'on résout avec une intégration numérique. A titre d'exemple on modélise une bobine à noyau ferromagnétique et pour montrer la validité du modèle on compare les résultats obtenus avec une solution analytique et un code de calcul 2D.

New CRISPR-Cas systems from uncultivated microbes

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Burstein, David; Harrington, Lucas B.; Strutt, Steven C.; Probst, Alexander J.; Anantharaman, Karthik; Thomas, Brian C.; Doudna, Jennifer A.; Banfield, Jillian F.

2017-02-01

CRISPR-Cas systems provide microbes with adaptive immunity by employing short DNA sequences, termed spacers, that guide Cas proteins to cleave foreign DNA. Class 2 CRISPR-Cas systems are streamlined versions, in which a single RNA-bound Cas protein recognizes and cleaves target sequences. The programmable nature of these minimal systems has enabled researchers to repurpose them into a versatile technology that is broadly revolutionizing biological and clinical research. However, current CRISPR-Cas technologies are based solely on systems from isolated bacteria, leaving the vast majority of enzymes from organisms that have not been cultured untapped. Metagenomics, the sequencing of DNA extracted directly from natural microbial communities, provides access to the genetic material of a huge array of uncultivated organisms. Here, using genome-resolved metagenomics, we identify a number of CRISPR-Cas systems, including the first reported Cas9 in the archaeal domain of life, to our knowledge. This divergent Cas9 protein was found in little-studied nanoarchaea as part of an active CRISPR-Cas system. In bacteria, we discovered two previously unknown systems, CRISPR-CasX and CRISPR-CasY, which are among the most compact systems yet discovered. Notably, all required functional components were identified by metagenomics, enabling validation of robust in vivo RNA-guided DNA interference activity in Escherichia coli. Interrogation of environmental microbial communities combined with in vivo experiments allows us to access an unprecedented diversity of genomes, the content of which will expand the repertoire of microbe-based biotechnologies.

Épidémiologie des accidents domestiques graves de l'enfant admis en réanimation pédiatrique polyvalente à l'hôpital d'enfants de Rabat-Maroc

PubMed Central

Rafai, Mostafa; Mekaoui, Nour; Chouaib, Naoufal; Bakkali, Hicham; Belyamani, Lahcen; El Koraichi, Alae; El Kettani, Salma Ech-Cherif

2015-01-01

Introduction Les accidents domestiques de l'enfant représentent un vrai problème de santé publique dans les pays industrialisés. Au Maroc, la priorité en santé publique est toujours donnée aux pathologies infectieuses, et bien qu'elle soit très peu décrite, la pathologie accidentelle de l'enfant devient de plus en plus fréquente dans notre pays avec une mortalité importante. L'objectif est de mettre le point sur la prévalence, la gravité, les aspects étiologiques, les facteurs de risque et les circonstances de survenue de ces accidents, ainsi que les moyens de prévention active et passive. Méthodes Enquête rétrospective descriptive sur une période de douze mois portant sur tous les enfants pris en charge pour accident domestique grave au service de réanimation pédiatrique polyvalente de l'hôpital universitaire d'enfants de Rabat. Résultats Parmi 698 admissions, 108 cas d'accidents domestiques graves ont étaient colligés (soit 15,5%), L’âge moyen des enfants était de 04ans tout accident confondu, avec un sex-ratio de 1,08 en faveur des garçons. L’évolution générale était marquée par le décès de 16 enfants (soit 14,8%) parmi 164 décès toute pathologie confondue au cours de la même période d’étude (soit 9,75% des décès) avec une durée moyenne d'hospitalisation de 04jours. les brûlures constituaient le premier accident dans notre série par 37cas, et elles étaient la première cause de mortalité par huit cas; par ailleurs, la population la plus à risque de brûlure était les nourrissons (67,6%). L'inhalation intrabronchique d’épingle à foulard (accident particulier dans notre contexte islamique) à été retrouvée chez six cas. Conclusion Les accidents domestiques de l'enfant constituent rarement une préoccupation de premier plan dans la population alors qu'ils sont parfois très graves et source d'une mortalité importante. Le meilleur traitement reste la prévention active et passive. PMID:26015848

Naturally Occurring Off-Switches for CRISPR-Cas9.

PubMed

Pawluk, April; Amrani, Nadia; Zhang, Yan; Garcia, Bianca; Hidalgo-Reyes, Yurima; Lee, Jooyoung; Edraki, Alireza; Shah, Megha; Sontheimer, Erik J; Maxwell, Karen L; Davidson, Alan R

2016-12-15

CRISPR-Cas9 technology would be enhanced by the ability to inhibit Cas9 function spatially, temporally, or conditionally. Previously, we discovered small proteins encoded by bacteriophages that inhibit the CRISPR-Cas systems of their host bacteria. These "anti-CRISPRs" were specific to type I CRISPR-Cas systems that do not employ the Cas9 protein. We posited that nature would also yield Cas9 inhibitors in response to the evolutionary arms race between bacteriophages and their hosts. Here, we report the discovery of three distinct families of anti-CRISPRs that specifically inhibit the CRISPR-Cas9 system of Neisseria meningitidis. We show that these proteins bind directly to N. meningitidis Cas9 (NmeCas9) and can be used as potent inhibitors of genome editing by this system in human cells. These anti-CRISPR proteins now enable "off-switches" for CRISPR-Cas9 activity and provide a genetically encodable means to inhibit CRISPR-Cas9 genome editing in eukaryotes. VIDEO ABSTRACT. Copyright © 2016 Elsevier Inc. All rights reserved.

Toxicité sérotoninergique résultant d’une interaction médicamenteuse entre le bleu de méthylène et les inhibiteurs de la recapture de la sérotonine

PubMed Central

Charbonneau, Annie

2013-01-01

RÉSUMÉ Contexte : Le bleu de méthylène est employé en pratique pour diverses raisons médicales. Des données récentes ont évoqué une interaction potentielle avec les inhibiteurs de la recapture de la sérotonine, pouvant conduire à une toxicité sérotoninergique. Objectif : Décrire le risque de toxicité sérotoninergique associé à l’interaction entre le bleu de méthylène et les inhibiteurs de la recapture de la sérotonine. Sources de l’information : Les publications pertinentes ont été ciblées systématiquement au moyen des moteurs de recherche MEDLINE (1946 au 21 mars 2013) et Embase (1974 à 2013, semaine 11) en utilisant les mots clés suivants : methylene blue, methylthioninium, monoamine oxidase inhibitors, serotonin reuptake inhibitors et serotonin syndrome. Aucune restriction touchant l’indication du bleu de méthylène ou la langue n’a été appliquée. Les références des publications ont également été analysées. Sélection des études et extraction des données : Dix-huit études de cas et deux séries de cas systématiques ont été sélectionnées. Aucune étude clinique aléatoire n’a encore été publiée. Synthèse des résultats : La première étude de cas à avoir soupçonné une interaction entre le bleu de méthylène et les inhibiteurs de la recapture de la sérotonine est parue en 2003. Dix-sept autres études de cas décrivant le même type d’interaction ont par la suite été rapportées. Les deux séries de cas ont regroupé les données de quelques 325 parathyroïdectomies où le bleu de méthylène avait été employé comme agent colorant. Les 17 patients qui ont présenté une toxicité du système nerveux central prenaient tous en période préopératoire des inhibiteurs de recapture de la sérotonine. Conclusion : Lorsqu’il est administré en concomitance avec des inhibiteurs de recapture de la sérotonine, le bleu de méthylène peut conduire à une toxicité sérotoninergique à une dose aussi

Detection de la fin de la compaction des anodes par le son

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Sanogo, Bazoumana

ete le lieu de tests finaux a l'usine en fabriquant des anodes avec differents criteres (variation du temps de compaction, taux de brai, arret manuel du compacteur, variation de la pression des ballons du haut du compacteur). Ces anodes ont ete ensuite analysees au laboratoire a l'UQAC. En parallele a ces travaux precites, l'amelioration de l'application d'analyse du son a ete faite avec le choix des parametres d'analyse et leur standardisation. Les resultats des premiers tests au laboratoire et ceux de la campagne de juin 2014 ont montre que la formation des anodes se fait suivant trois etapes : rearrangement des particules et du brai, compaction et consolidation et enfin la finition. Ces travaux ont montre en outre que le temps de compaction joue un role tres important dans la definition des proprietes finales des anodes. Ainsi, en plus du type de brai, du taux de brai et du type de coke, il faut tenir compte du temps de sur-compaction et de sous-compaction. En effet, ceci a ete demontre a travers les deux validations qui ont ete realisees. Les resultats de la caracterisation des echantillons (venant des anodes de la campagne de decembre 2015) ont montre qu'une anode compactee a un temps optimal acquiert une bonne resistance a la compression et sa resistivite electrique baisse. En outre, on note que le temps de compaction dans notre cas a baisse legerement avec l'augmentation de la pression des ballons de haut du vibrocompacteur. Ce qui a eu pour effet d'augmenter la densite crue de l'anode. Toutefois, il faut s'abstenir de generaliser ce constat car le nombre d'anodes testees est faible dans notre cas. Par ailleurs, cette etude montre que le temps necessaire pour le formage d'une anode croit avec l'augmentation du taux de brai et baisse legerement avec l'augmentation de la pression des ballons. (Abstract shortened by ProQuest.).

Anesthésie pour prothése totale de la hanche: à propos de 50 cas

PubMed Central

Serghini, Issam; Qamouss, Youssef; Zoubir, Mohamed; Lalaoui, Jaafar Salim; Koulali, Idrissi Khalid; Boughalem, Mohamed

2015-01-01

La chirurgie de la prothèse totale de la hanche (PTH) est une chirurgie fonctionnelle qui consiste en un remplacement d'une articulation endommagée afin d'améliorer la qualité de vie du patient. L'anesthésie pour PTH exige une préparation rigoureuse à l'intervention, la consultation d'anesthésie sera donc la clef de cette réussite. Nous avons réalisé une étude rétrospective concernant 60 arthroplasties totales de la hanche implantées chez 50 patients adultes, colligée au sevice de Traumatologie et de chirurgie orthopédique à l'Hôpital Militaire Avicenne de Marrakech sur une période étalée de Janvier 2010 au Décembre 2012. Nous avons évalué la prise en charge anesthésique: pré, per et postopératoire des patients opérés pour une PTH. La moyenne d’âge était de 56,5 ans, le sex-ratio était de 1,63 en faveur des hommes. L'indication prédominante était la coxarthrose primitive. L'anesthésie générale était la technique anesthésique la plus utilisée (66% des cas), l'intubation difficile était rencontrée chez 6% de nos patients. La durée moyenne de l'acte chirurgical était de 114 +/- 25,33 mn. 12% de nos patients ont présenté une hypotension artérielle peropératoire. L'incidence de la transfusion homologue perop était de 14%. Nous avons noté 08 cas de complications postop: 03 cas d'infection de la PTH 15 jours après l'intervention, 03 cas de descellement aseptique, 01 cas de luxation de PTH et 01 cas de descellement septique avec un recul moyen de 54 mois. PMID:27047619

RNA targeting with CRISPR-Cas13.

PubMed

Abudayyeh, Omar O; Gootenberg, Jonathan S; Essletzbichler, Patrick; Han, Shuo; Joung, Julia; Belanto, Joseph J; Verdine, Vanessa; Cox, David B T; Kellner, Max J; Regev, Aviv; Lander, Eric S; Voytas, Daniel F; Ting, Alice Y; Zhang, Feng

2017-10-12

RNA has important and diverse roles in biology, but molecular tools to manipulate and measure it are limited. For example, RNA interference can efficiently knockdown RNAs, but it is prone to off-target effects, and visualizing RNAs typically relies on the introduction of exogenous tags. Here we demonstrate that the class 2 type VI RNA-guided RNA-targeting CRISPR-Cas effector Cas13a (previously known as C2c2) can be engineered for mammalian cell RNA knockdown and binding. After initial screening of 15 orthologues, we identified Cas13a from Leptotrichia wadei (LwaCas13a) as the most effective in an interference assay in Escherichia coli. LwaCas13a can be heterologously expressed in mammalian and plant cells for targeted knockdown of either reporter or endogenous transcripts with comparable levels of knockdown as RNA interference and improved specificity. Catalytically inactive LwaCas13a maintains targeted RNA binding activity, which we leveraged for programmable tracking of transcripts in live cells. Our results establish CRISPR-Cas13a as a flexible platform for studying RNA in mammalian cells and therapeutic development.

New CRISPR–Cas systems from uncultivated microbes

DOE PAGES

Burstein, David; Harrington, Lucas B.; Strutt, Steven C.; ...

2016-12-22

We present that CRISPR-Cas systems provide microbes with adaptive immunity by employing short DNA sequences, termed spacers, that guide Cas proteins to cleave foreign DNA. Class 2 CRISPR-Cas systems are streamlined versions, in which a single RNA-bound Cas protein recognizes and cleaves target sequences. The programmable nature of these minimal systems has enabled researchers to repurpose them into a versatile technology that is broadly revolutionizing biological and clinical research. However, current CRISPR-Cas technologies are based solely on systems from isolated bacteria, leaving the vast majority of enzymes from organisms that have not been cultured untapped. Metagenomics, the sequencing of DNAmore » extracted directly from natural microbial communities, provides access to the genetic material of a huge array of uncultivated organisms. Here, using genome-resolved metagenomics, we identify a number of CRISPR-Cas systems, including the first reported Cas9 in the archaeal domain of life, to our knowledge. This divergent Cas9 protein was found in little-studied nanoarchaea as part of an active CRISPR-Cas system. In bacteria, we discovered two previously unknown systems, CRISPR-CasX and CRISPR-CasY, which are among the most compact systems yet discovered. Notably, all required functional components were identified by metagenomics, enabling validation of robust in vivo RNA-guided DNA interference activity in Escherichia coli. Lastly, interrogation of environmental microbial communities combined with in vivo experiments allows us to access an unprecedented diversity of genomes, the content of which will expand the repertoire of microbe-based biotechnologies.« less

New CRISPR–Cas systems from uncultivated microbes

DOE Office of Scientific and Technical Information (OSTI.GOV)

Burstein, David; Harrington, Lucas B.; Strutt, Steven C.

We present that CRISPR-Cas systems provide microbes with adaptive immunity by employing short DNA sequences, termed spacers, that guide Cas proteins to cleave foreign DNA. Class 2 CRISPR-Cas systems are streamlined versions, in which a single RNA-bound Cas protein recognizes and cleaves target sequences. The programmable nature of these minimal systems has enabled researchers to repurpose them into a versatile technology that is broadly revolutionizing biological and clinical research. However, current CRISPR-Cas technologies are based solely on systems from isolated bacteria, leaving the vast majority of enzymes from organisms that have not been cultured untapped. Metagenomics, the sequencing of DNAmore » extracted directly from natural microbial communities, provides access to the genetic material of a huge array of uncultivated organisms. Here, using genome-resolved metagenomics, we identify a number of CRISPR-Cas systems, including the first reported Cas9 in the archaeal domain of life, to our knowledge. This divergent Cas9 protein was found in little-studied nanoarchaea as part of an active CRISPR-Cas system. In bacteria, we discovered two previously unknown systems, CRISPR-CasX and CRISPR-CasY, which are among the most compact systems yet discovered. Notably, all required functional components were identified by metagenomics, enabling validation of robust in vivo RNA-guided DNA interference activity in Escherichia coli. Lastly, interrogation of environmental microbial communities combined with in vivo experiments allows us to access an unprecedented diversity of genomes, the content of which will expand the repertoire of microbe-based biotechnologies.« less

Comparison of Various Nuclear Localization Signal-Fused Cas9 Proteins and Cas9 mRNA for Genome Editing in Zebrafish.

PubMed

Hu, Peinan; Zhao, Xueying; Zhang, Qinghua; Li, Weiming; Zu, Yao

2018-03-02

The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/Cas9 system has been proven to be an efficient and precise genome editing technology in various organisms. However, the gene editing efficiencies of Cas9 proteins with a nuclear localization signal (NLS) fused to different termini and Cas9 mRNA have not been systematically compared. Here, we compared the ability of Cas9 proteins with NLS fused to the N-, C-, or both the N- and C-termini and N-NLS-Cas9-NLS-C mRNA to target two sites in the tyr gene and two sites in the gol gene related to pigmentation in zebrafish. Phenotypic analysis revealed that all types of Cas9 led to hypopigmentation in similar proportions of injected embryos. Genome analysis by T7 Endonuclease I (T7E1) assays demonstrated that all types of Cas9 similarly induced mutagenesis in four target sites. Sequencing results further confirmed that a high frequency of indels occurred in the target sites ( tyr1 > 66%, tyr2 > 73%, gol1 > 50%, and gol2 > 35%), as well as various types (more than six) of indel mutations observed in all four types of Cas9-injected embryos. Furthermore, all types of Cas9 showed efficient targeted mutagenesis on multiplex genome editing, resulting in multiple phenotypes simultaneously. Collectively, we conclude that various NLS-fused Cas9 proteins and Cas9 mRNAs have similar genome editing efficiencies on targeting single or multiple genes, suggesting that the efficiency of CRISPR/Cas9 genome editing is highly dependent on guide RNAs (gRNAs) and gene loci. These findings may help to simplify the selection of Cas9 for gene editing using the CRISPR/Cas9 system. Copyright © 2018 Hu et al.

Comparison of Various Nuclear Localization Signal-Fused Cas9 Proteins and Cas9 mRNA for Genome Editing in Zebrafish

PubMed Central

Hu, Peinan; Zhao, Xueying; Zhang, Qinghua; Li, Weiming; Zu, Yao

2018-01-01

The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/Cas9 system has been proven to be an efficient and precise genome editing technology in various organisms. However, the gene editing efficiencies of Cas9 proteins with a nuclear localization signal (NLS) fused to different termini and Cas9 mRNA have not been systematically compared. Here, we compared the ability of Cas9 proteins with NLS fused to the N-, C-, or both the N- and C-termini and N-NLS-Cas9-NLS-C mRNA to target two sites in the tyr gene and two sites in the gol gene related to pigmentation in zebrafish. Phenotypic analysis revealed that all types of Cas9 led to hypopigmentation in similar proportions of injected embryos. Genome analysis by T7 Endonuclease I (T7E1) assays demonstrated that all types of Cas9 similarly induced mutagenesis in four target sites. Sequencing results further confirmed that a high frequency of indels occurred in the target sites (tyr1 > 66%, tyr2 > 73%, gol1 > 50%, and gol2 > 35%), as well as various types (more than six) of indel mutations observed in all four types of Cas9-injected embryos. Furthermore, all types of Cas9 showed efficient targeted mutagenesis on multiplex genome editing, resulting in multiple phenotypes simultaneously. Collectively, we conclude that various NLS-fused Cas9 proteins and Cas9 mRNAs have similar genome editing efficiencies on targeting single or multiple genes, suggesting that the efficiency of CRISPR/Cas9 genome editing is highly dependent on guide RNAs (gRNAs) and gene loci. These findings may help to simplify the selection of Cas9 for gene editing using the CRISPR/Cas9 system. PMID:29295818

Structure and Engineering of Francisella novicida Cas9

PubMed Central

Hirano, Hisato; Gootenberg, Jonathan S.; Horii, Takuro; Abudayyeh, Omar O.; Kimura, Mika; Hsu, Patrick D.; Nakane, Takanori; Ishitani, Ryuichiro; Hatada, Izuho; Zhang, Feng; Nishimasu, Hiroshi; Nureki, Osamu

2016-01-01

Summary The RNA-guided endonuclease Cas9 cleaves double-stranded DNA targets complementary to the guide RNA, and has been applied to programmable genome editing. Cas9-mediated cleavage requires a protospacer adjacent motif (PAM) juxtaposed with the DNA target sequence, thus constricting the range of targetable sites. Here, we report the 1.7 Å resolution crystal structures of Cas9 from Francisella novicida (FnCas9), one of the largest Cas9 orthologs, in complex with a guide RNA and its PAM-containing DNA targets. A structural comparison of FnCas9 with other Cas9 orthologs revealed striking conserved and divergent features among distantly related CRISPR-Cas9 systems. We found that FnCas9 recognizes the 5′-NGG-3′ PAM, and used the structural information to create a variant that can recognize the more relaxed 5′-YG-3′ PAM. Furthermore, we demonstrated that pre-assembled FnCas9 ribonucleoprotein complexes can be microinjected into mouse zygotes to edit endogenous sites with the 5′-YG-3′ PAMs, thus expanding the target space of the CRISPR-Cas9 toolbox. PMID:26875867

Structure and Engineering of Francisella novicida Cas9.

PubMed

Hirano, Hisato; Gootenberg, Jonathan S; Horii, Takuro; Abudayyeh, Omar O; Kimura, Mika; Hsu, Patrick D; Nakane, Takanori; Ishitani, Ryuichiro; Hatada, Izuho; Zhang, Feng; Nishimasu, Hiroshi; Nureki, Osamu

2016-02-25

The RNA-guided endonuclease Cas9 cleaves double-stranded DNA targets complementary to the guide RNA and has been applied to programmable genome editing. Cas9-mediated cleavage requires a protospacer adjacent motif (PAM) juxtaposed with the DNA target sequence, thus constricting the range of targetable sites. Here, we report the 1.7 Å resolution crystal structures of Cas9 from Francisella novicida (FnCas9), one of the largest Cas9 orthologs, in complex with a guide RNA and its PAM-containing DNA targets. A structural comparison of FnCas9 with other Cas9 orthologs revealed striking conserved and divergent features among distantly related CRISPR-Cas9 systems. We found that FnCas9 recognizes the 5'-NGG-3' PAM, and used the structural information to create a variant that can recognize the more relaxed 5'-YG-3' PAM. Furthermore, we demonstrated that the FnCas9-ribonucleoprotein complex can be microinjected into mouse zygotes to edit endogenous sites with the 5'-YG-3' PAM, thus expanding the target space of the CRISPR-Cas9 toolbox. Copyright © 2016 Elsevier Inc. All rights reserved.

Not all predicted CRISPR-Cas systems are equal: isolated cas genes and classes of CRISPR like elements.

PubMed

Zhang, Quan; Ye, Yuzhen

2017-02-06

The CRISPR-Cas systems in prokaryotes are RNA-guided immune systems that target and deactivate foreign nucleic acids. A typical CRISPR-Cas system consists of a CRISPR array of repeat and spacer units, and a locus of cas genes. The CRISPR and the cas locus are often located next to each other in the genomes. However, there is no quantitative estimate of the co-location. In addition, ad-hoc studies have shown that some non-CRISPR genomic elements contain repeat-spacer-like structures and are mistaken as CRISPRs. Using available genome sequences, we observed that a significant number of genomes have isolated cas loci and/or CRISPRs. We found that 11%, 22% and 28% of the type I, II and III cas loci are isolated (without CRISPRs in the same genomes at all or with CRISPRs distant in the genomes), respectively. We identified a large number of genomic elements that superficially reassemble CRISPRs but don't contain diverse spacers and have no companion cas genes. We called these elements false-CRISPRs and further classified them into groups, including tandem repeats and Staphylococcus aureus repeat (STAR)-like elements. This is the first systematic study to collect and characterize false-CRISPR elements. We demonstrated that false-CRISPRs could be used to reduce the false annotation of CRISPRs, therefore showing them to be useful for improving the annotation of CRISPR-Cas systems.

Le carcinome parathyroïdien: à propos d’un cas et revue de la literature

PubMed Central

kolsi, Naourez; Jellali, Sondos; Koubaa, Jamel

2017-01-01

Le carcinome parathyroïdien est une tumeur maligne, très rare, de la glande parathyroïde. Cliniquement, ce cancer se présente souvent par un tableau d'hyperparathyroïdie primaire sévère. Le diagnostic est histologique mais n'est pas toujours aisé. Le traitement est basé sur la chirurgie. Femme âgée de 59 ans, aux antécédents d'hypertension artérielle, et de lithiases rénales récidivantes, consultait pour des douleurs osseuses diffuses avec asthénie. L'examen du cou a trouvé une tuméfaction basi-cervicale dure et à bord inférieur non palpable. A la biologie: hypercalcémie à 4,1 mmol/l, une hyperparathyroïdie avec valeur de parathormone (PTH) très élevée à 1088 pg/ml soit 13 fois la normale. La scintigraphie au Technétium-99m-sestamibi a montré une plage de fixation anormale de MIBI en projection de la parathyroïde inférieure gauche. Une parathyroïdectomie inférieure gauche, avec évidement médiastino-récurrentiel homolatéral ont été réalisés. Les suites opératoires étaient marquées par la normalisation de la calcémie et de la PTH. L'anatomopathologie était en faveur d'un carcinome parathyroïdien. Le diagnostic de carcinome parathyroïdien est généralement établi sur la conjonction de signes radiologiques biologiques et histologiques. La gravité de cette pathologie est due à l'hypercalcémie sévère et au risque de récidive et de métastases à distance justifiant la surveillance prolongée. PMID:28819506

Inhibition of CRISPR-Cas9 with Bacteriophage Proteins.

PubMed

Rauch, Benjamin J; Silvis, Melanie R; Hultquist, Judd F; Waters, Christopher S; McGregor, Michael J; Krogan, Nevan J; Bondy-Denomy, Joseph

2017-01-12

Bacterial CRISPR-Cas systems utilize sequence-specific RNA-guided nucleases to defend against bacteriophage infection. As a countermeasure, numerous phages are known that produce proteins to block the function of class 1 CRISPR-Cas systems. However, currently no proteins are known to inhibit the widely used class 2 CRISPR-Cas9 system. To find these inhibitors, we searched cas9-containing bacterial genomes for the co-existence of a CRISPR spacer and its target, a potential indicator for CRISPR inhibition. This analysis led to the discovery of four unique type II-A CRISPR-Cas9 inhibitor proteins encoded by Listeria monocytogenes prophages. More than half of L. monocytogenes strains with cas9 contain at least one prophage-encoded inhibitor, suggesting widespread CRISPR-Cas9 inactivation. Two of these inhibitors also blocked the widely used Streptococcus pyogenes Cas9 when assayed in Escherichia coli and human cells. These natural Cas9-specific "anti-CRISPRs" present tools that can be used to regulate the genome engineering activities of CRISPR-Cas9. Copyright © 2017 Elsevier Inc. All rights reserved.

Le rôle de l’omalizumab dans le traitement de l’asthme allergique grave

PubMed Central

Chapman, Kenneth R; Cartier, André; Hébert, Jacques; McIvor, R Andrew; Schellenberg, R Robert

2006-01-01

les patients traités par l’omalizumab que chez les sujets témoins. Des analyses rétrospectives ont permis d’identifier les caractéristiques des patients les plus susceptibles de répondre au traitement par l’omalizumab. RECOMMANDATIONS : L’omalizumab pourrait être envisagé comme traitement d’appoint dans les cas atopiques d’asthme grave non maîtrisé avec des traitements classiques par des doses optimales de CSI et un traitement d’appoint approprié (p. ex. : agonistes bêta-2 à action prolongée). En général, les patients sont classés en fonction de leur recours – traitement court et fréquent ou continu et oral – aux corticostéroïdes. Il ne faut amorcer le traitement qu’après avoir consulté un spécialiste pour confirmer le diagnostic et s’assurer que le traitement classique est optimal.

Tuberculose pariétale compliquée d’embolie pulmonaire

PubMed Central

Bopaka, Regis Gothard; Bemba, Presley Lee Esthel; Janah, Hind; Okombi, Franck Hardain Okemba; Jabri, Hasna; Khattabi, Wiam El; Afif, Hicham

2017-01-01

La tuberculose est une maladie infectieuse qui reste fréquente dans les pays en développement. La localisation peut être pulmonaire ou extra-pulmonaire. Cette forme extra-pulmonaire pose un grand problème diagnostique. Nous rapportons le cas d'un patient présentant une embolie pulmonaire révélant une tuberculose pariétale. A travers cette observation, nous soulignons la nécessité de rechercher l'étiologie devant une embolie pulmonaire. PMID:28819528

Breaking-Cas-interactive design of guide RNAs for CRISPR-Cas experiments for ENSEMBL genomes.

PubMed

Oliveros, Juan C; Franch, Mònica; Tabas-Madrid, Daniel; San-León, David; Montoliu, Lluis; Cubas, Pilar; Pazos, Florencio

2016-07-08

The CRISPR/Cas technology is enabling targeted genome editing in multiple organisms with unprecedented accuracy and specificity by using RNA-guided nucleases. A critical point when planning a CRISPR/Cas experiment is the design of the guide RNA (gRNA), which directs the nuclease and associated machinery to the desired genomic location. This gRNA has to fulfil the requirements of the nuclease and lack homology with other genome sites that could lead to off-target effects. Here we introduce the Breaking-Cas system for the design of gRNAs for CRISPR/Cas experiments, including those based in the Cas9 nuclease as well as others recently introduced. The server has unique features not available in other tools, including the possibility of using all eukaryotic genomes available in ENSEMBL (currently around 700), placing variable PAM sequences at 5' or 3' and setting the guide RNA length and the scores per nucleotides. It can be freely accessed at: http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/breakingcas, and the code is available upon request. © The Author(s) 2016. Published by Oxford University Press on behalf of Nucleic Acids Research.

CAS-Induced Difficulties in Learning Mathematics?

ERIC Educational Resources Information Center

Jankvist, Uffe Thomas; Misfeldt, Morten

2015-01-01

In recent years computer algebra systems (CAS) have become an integrated part of the upper secondary school mathematics program. Despite the many positive possibilities of CAS, there also seems to be a flip side of the coin in relation to actual difficulties in learning mathematics, not least because a strong dependence on CAS for mathematical…

[CAS General Standards 2012

ERIC Educational Resources Information Center

Council for the Advancement of Standards in Higher Education, 2011

2011-01-01

The mission of the Council for the Advancement of Standards in Higher Education (CAS) is to promote the improvement of programs and services to enhance the quality of student learning and development. CAS is a consortium of professional associations who work collaboratively to develop and promulgate standards and guidelines and to encourage…

Arthroplastie totale du coude sur séquelles d'ostéoarthrite négligée-à propos d'un cas

PubMed Central

El Ibrahimi, Abdelhalim; Elidrissi, Mohammed; Shimi, Mohammed; Elmrini, Abdelmajid

2011-01-01

L'arthroplastie totale au cours des séquelles d'infection ostéo-articulaire a été destinée surtout pour la hanche et le genou. Cependant, peu de travaux ont étaient consacrée pour l'articulation du coude. Nous rapportons le cas d'une patiente, âgée de 26 ans, ayant présentée dans l'enfance une ostéoarthrite du coude traitée traditionnellement, mais qui a développé progressivement une instabilité sévère du coude. Après l'implantation d'une prothèse semi-contrainte de Coonrad-Morrey non cimentée, le résultat est très satisfaisant jusqu’à deux ans de recul, avec un gain de la mobilité en flexion de 110 degrés et en extension de 5 degrés, l'index de performance pour le coude selon la Mayo Clinic de 80/100. Nous n'avons pas de complication à déplorer. PMID:22355439

Consequences experimentales des effets des fluctuations du vide sur la fluorescence parametrique et la generation du second harmonique en milieu confine

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Robichaud, Luc

Les fluctuations du vide, qui consistent en l'apparition momentanee de particules, ce qui est permit par le principe d'incertitude de Heisenberg, joue un role primordial dans les processus photoniques, en particulier les processus non-lineaires. Par la manipulation de ces fluctuations du vide a l'aide de confinement optique, on retrouve deux phenomenes particuliers : l'intensification de la fluorescence parametrique (Walker, 2008) et l'inhibition de la generation du second harmonique (Collette, 2013). Dans ce travail, on presente les resultats dans le cas classique ; c'est-a-dire sans fluctuations du vide et confinement. Par la suite, on presente les effets des fluctuations du vide et du confinement, ce qui mene aux deux effets mentionnes. Dans le cas de la fluorescence parametrique, le bruit quantique sur le champ interne et externe est calcule, le role du desaccord de phase dans le modele est expose et une generalisation tridimensionnelle est etudiee afin de generaliser la conception du modele d'un cas unidimensionnel a un cas tridimensionnel planaire. Dans le cas de la generation du second harmonique, les difficultes d'un modele purement tridimensionnel sont exposees et ensuite le cas limite planaire est etudie.

Use Cases for Dynamic Secure Wireless Networking in Coalition Environments (Cas d utilisation de r seau sans fil dynamique et s curis dans des environnements de coalition)

DTIC Science & Technology

2015-05-01

la dénomination « STO », « RTO » ou « AGARD » selon le cas, suivi du numéro de série. Des informations analogues, telles que le titre est la ...supplémentaire de nécessiter moins de déploiement et de ressources de gestion que les réseaux fixes. Néanmoins, les propriétés qui, précisément, rendent...ces réseaux séduisants de prime abord – support ouvert, topologie souple, règles d’adhésion dynamiques, algorithmes simples de formation du

Using CRISPR-Cas systems as antimicrobials.

PubMed

Bikard, David; Barrangou, Rodolphe

2017-06-01

Although CRISPR-Cas systems naturally evolved to provide adaptive immunity in bacteria and archaea, Cas nucleases can be co-opted to target chromosomal sequences rather than invasive genetic elements. Although genome editing is the primary outcome of self-targeting using CRISPR-based technologies in eukaryotes, self-targeting by CRISPR is typically lethal in bacteria. Here, we discuss how DNA damage introduced by Cas nucleases in bacteria can efficiently and specifically lead to plasmid curing or drive cell death. Specifically, we discuss how various CRISPR-Cas systems can be engineered and delivered using phages or phagemids as vectors. These principles establish CRISPR-Cas systems as potent and programmable antimicrobials, and open new avenues for the development of CRISPR-based tools for selective removal of bacterial pathogens and precise microbiome composition alteration. Copyright © 2017 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Evolution and classification of the CRISPR-Cas systems

PubMed Central

S. Makarova, Kira; H. Haft, Daniel; Barrangou, Rodolphe; J. J. Brouns, Stan; Charpentier, Emmanuelle; Horvath, Philippe; Moineau, Sylvain; J. M. Mojica, Francisco; I. Wolf, Yuri; Yakunin, Alexander F.; van der Oost, John; V. Koonin, Eugene

2012-01-01

The CRISPR–Cas (clustered regularly interspaced short palindromic repeats–CRISPR-associated proteins) modules are adaptive immunity systems that are present in many archaea and bacteria. These defence systems are encoded by operons that have an extraordinarily diverse architecture and a high rate of evolution for both the cas genes and the unique spacer content. Here, we provide an updated analysis of the evolutionary relationships between CRISPR–Cas systems and Cas proteins. Three major types of CRISPR–Cas system are delineated, with a further division into several subtypes and a few chimeric variants. Given the complexity of the genomic architectures and the extremely dynamic evolution of the CRISPR–Cas systems, a unified classification of these systems should be based on multiple criteria. Accordingly, we propose a `polythetic' classification that integrates the phylogenies of the most common cas genes, the sequence and organization of the CRISPR repeats and the architecture of the CRISPR–cas loci. PMID:21552286

CRISPR/Cas9-mediated gene editing in human zygotes using Cas9 protein.

PubMed

Tang, Lichun; Zeng, Yanting; Du, Hongzi; Gong, Mengmeng; Peng, Jin; Zhang, Buxi; Lei, Ming; Zhao, Fang; Wang, Weihua; Li, Xiaowei; Liu, Jianqiao

2017-06-01

Previous works using human tripronuclear zygotes suggested that the clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)/Cas9 system could be a tool in correcting disease-causing mutations. However, whether this system was applicable in normal human (dual pronuclear, 2PN) zygotes was unclear. Here we demonstrate that CRISPR/Cas9 is also effective as a gene-editing tool in human 2PN zygotes. By injection of Cas9 protein complexed with the appropriate sgRNAs and homology donors into one-cell human embryos, we demonstrated efficient homologous recombination-mediated correction of point mutations in HBB and G6PD. However, our results also reveal limitations of this correction procedure and highlight the need for further research.

CRISPR-Cas9 Structures and Mechanisms.

PubMed

Jiang, Fuguo; Doudna, Jennifer A

2017-05-22

Many bacterial clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-CRISPR-associated (Cas) systems employ the dual RNA-guided DNA endonuclease Cas9 to defend against invading phages and conjugative plasmids by introducing site-specific double-stranded breaks in target DNA. Target recognition strictly requires the presence of a short protospacer adjacent motif (PAM) flanking the target site, and subsequent R-loop formation and strand scission are driven by complementary base pairing between the guide RNA and target DNA, Cas9-DNA interactions, and associated conformational changes. The use of CRISPR-Cas9 as an RNA-programmable DNA targeting and editing platform is simplified by a synthetic single-guide RNA (sgRNA) mimicking the natural dual trans-activating CRISPR RNA (tracrRNA)-CRISPR RNA (crRNA) structure. This review aims to provide an in-depth mechanistic and structural understanding of Cas9-mediated RNA-guided DNA targeting and cleavage. Molecular insights from biochemical and structural studies provide a framework for rational engineering aimed at altering catalytic function, guide RNA specificity, and PAM requirements and reducing off-target activity for the development of Cas9-based therapies against genetic diseases.

CRISPR-Cas: biology, mechanisms and relevance

PubMed Central

Hille, Frank

2016-01-01

Prokaryotes have evolved several defence mechanisms to protect themselves from viral predators. Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) and their associated proteins (Cas) display a prokaryotic adaptive immune system that memorizes previous infections by integrating short sequences of invading genomes—termed spacers—into the CRISPR locus. The spacers interspaced with repeats are expressed as small guide CRISPR RNAs (crRNAs) that are employed by Cas proteins to target invaders sequence-specifically upon a reoccurring infection. The ability of the minimal CRISPR-Cas9 system to target DNA sequences using programmable RNAs has opened new avenues in genome editing in a broad range of cells and organisms with high potential in therapeutical applications. While numerous scientific studies have shed light on the biochemical processes behind CRISPR-Cas systems, several aspects of the immunity steps, however, still lack sufficient understanding. This review summarizes major discoveries in the CRISPR-Cas field, discusses the role of CRISPR-Cas in prokaryotic immunity and other physiological properties, and describes applications of the system as a DNA editing technology and antimicrobial agent. This article is part of the themed issue ‘The new bacteriology’. PMID:27672148

CRISPR-Cas: biology, mechanisms and relevance.

PubMed

Hille, Frank; Charpentier, Emmanuelle

2016-11-05

Prokaryotes have evolved several defence mechanisms to protect themselves from viral predators. Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) and their associated proteins (Cas) display a prokaryotic adaptive immune system that memorizes previous infections by integrating short sequences of invading genomes-termed spacers-into the CRISPR locus. The spacers interspaced with repeats are expressed as small guide CRISPR RNAs (crRNAs) that are employed by Cas proteins to target invaders sequence-specifically upon a reoccurring infection. The ability of the minimal CRISPR-Cas9 system to target DNA sequences using programmable RNAs has opened new avenues in genome editing in a broad range of cells and organisms with high potential in therapeutical applications. While numerous scientific studies have shed light on the biochemical processes behind CRISPR-Cas systems, several aspects of the immunity steps, however, still lack sufficient understanding. This review summarizes major discoveries in the CRISPR-Cas field, discusses the role of CRISPR-Cas in prokaryotic immunity and other physiological properties, and describes applications of the system as a DNA editing technology and antimicrobial agent.This article is part of the themed issue 'The new bacteriology'. © 2016 The Authors.

Syndrome de poland: à propos d’un cas et revue de la litterature

PubMed Central

Benzalim, Meriam; Berghalout, Laila; Elfakir, Sophia; Jalal, Hicham

2017-01-01

Le syndrome de Poland est une malformation congénitale rare associant à des degrés divers des anomalies thoraciques et du membre supérieur homolatéral. Nous rapportons le cas d'une fillette de 7 ans, explorée pour dépression de l'hémithorax gauche avec masse sous claviculaire homolatérale. La tomodensitométrie a montré que la déformation de la paroi thoracique était liée à l'absence des chefs à insertion sterno-costale du muscle pectoralis major gauche avec agénésie du pectoralis minor et hypoplasie des arcs antérieurs des six premières côtes correspondantes. Ces anomalies étaient rapportées à un syndrome de Poland. Un bilan général fait d'échographie abdominale, radiographies des deux mains, a été réalisé chez la patiente n'ayant révélé aucune malformation associée. Le syndrome de Poland résulte d'un défaut d'approvisionnement sanguin des éléments musculosquelettiques de la paroi thoracique pendant la vie fœtale. Il existe de nombreuses variantes du syndrome de Poland qui peuvent être mieux détectées par la TDM qui doit être réalisée chaque fois qu'il est disponible, sans omettre le rôle de la radiologie général dans la détection des malformations associées. La caractéristique de ce syndrome est l'agénésie des faisceaux sternocostaux du muscle pectoralis major. Son étiologie reste inconnue et discutée. Une anomalie vasculaire en serait la cause, sans que le primum movens de cette anomalie vasculaire soit connu. PMID:28450991

Rational Design of Mini-Cas9 for Transcriptional Activation.

PubMed

Ma, Dacheng; Peng, Shuguang; Huang, Weiren; Cai, Zhiming; Xie, Zhen

2018-04-20

Nuclease dead Cas9 (dCas9) has been widely used for modulating gene expression by fusing with different activation or repression domains. However, delivery of the CRISPR/Cas system fused with various effector domains in a single adeno-associated virus (AAV) remains challenging due to the payload limit. Here, we engineered a set of downsized variants of Cas9 including Staphylococcus aureus Cas9 (SaCas9) that retained DNA binding activity by deleting conserved functional domains. We demonstrated that fusing FokI nuclease domain to the N-terminal of the minimal SaCas9 (mini-SaCas9) or to the middle of the split mini-SaCas9 can trigger efficient DNA cleavage. In addition, we constructed a set of compact transactivation domains based on the tripartite VPR activation domain and self-assembled arrays of split SpyTag:SpyCatch peptides, which are suitable for fusing to the mini-SaCas9. Lastly, we produced a single AAV containing the mini-SaCas9 fused with a downsized transactivation domain along with an optimized gRNA expression cassette, which showed efficient transactivation activity. Our results highlighted a practical approach to generate down-sized CRISPR/Cas9 and gene activation systems for in vivo applications.

48 CFR 30.201-1 - CAS applicability.

Code of Federal Regulations, 2011 CFR

2011-10-01

... 48 Federal Acquisition Regulations System 1 2011-10-01 2011-10-01 false CAS applicability. 30.201-1 Section 30.201-1 Federal Acquisition Regulations System FEDERAL ACQUISITION REGULATION GENERAL CONTRACTING REQUIREMENTS COST ACCOUNTING STANDARDS ADMINISTRATION CAS Program Requirements 30.201-1 CAS...

Facteurs de risque de faible poids de naissance en milieu semi-rural de Kamina, République Démocratique du Congo

PubMed Central

Kangulu, Ignace Bwana; Umba, Elie Kilolo Ngoy; Nzaji, Michel Kabamba; Kayamba, Prosper Kalenga Mwenze

2014-01-01

Introduction Le faible poids de naissance constitue un problème majeur de santé publique, aussi bien dans les pays développés que dans les pays en développement, de par son ampleur et sa forte association avec la morbidité et la mortalité infantiles. Méthodes Il s’agit d’une étude cas-témoins rétrospective menée sur les différents facteurs de risque de faible poids de naissance(FPN) en milieu semi-rural de Kamina chez les accouchées et leurs nouveau-nés respectifs enregistrés de la période allant de janvier 2009 à décembre 2010. Résultats Cette étude a répertorié 69 cas des nouveau-nés de FPN sur 483 accouchements enregistrés (14,3%). Les facteurs associés au FPN déterminés dans ce travail sont l’âge maternel inférieur à 18 ans (OR=7,62, IC=3.46-16.8) et supérieur à 35 ans (OR=2,04;IC=0.91-4.46), la primiparité(OR=2,48;IC=1.18-5.21) et le non suivi des consultations prénatales (OR=5,50;IC=2.00-15.03), la prématurité avec grossesse âgée de moins de 37 semaines d’aménorrhée, la grossesse multiple (OR=30,94) et le sexe féminin du nouveau-né. Conclusion Cette étude a démontré que l’âge maternel inférieur à 18 ans et supérieur à 35 ans, le non suivi des consultations prénatales, la primiparité et la prématurité, la grossesse multiple et le sexe féminin du nouveau-né sont les facteurs associés au faible poids de naissance. PMID:25237417

Contrôle du marché informel à l’heure de la mondialisation des échanges. Le cas des antirétroviraux au Chili

PubMed Central

Brousselle, Astrid; Morales, Cristián

2013-01-01

Résumé Les nouveaux médicaments pour le VIH/sida ont créé des besoins d’accessibilité aux traitements que les gouvernements n’ont pas toujours réussi à couvrir. Il en résulte l’émergence d’un marché informel des ARV. Par l’analyse de la situation au Chili, nous traitons des différents créneaux d’approvisionnement, des conséquences de l’existence d’un tel marché, ainsi que des moyens envisageables pour réduire les effets indésirables. Les aspects tant microéconomiques que macroéconomiques concernant le marché et l’accessibilité aux médicaments sont abordés. PMID:23997580

5 CFR 534.305 - Pay periods and computation of pay.

Code of Federal Regulations, 2010 CFR

2010-01-01

... 5 Administrative Personnel 1 2010-01-01 2010-01-01 false Pay periods and computation of pay. 534... PAY UNDER OTHER SYSTEMS Basic Pay for Employees of Temporary Organizations § 534.305 Pay periods and computation of pay. (a) The requirements of 5 U.S.C. 5504, must be applied to employees of temporary...

Envenimation scorpionique compliqué d'un accident vasculaire cérébral ischemique

PubMed Central

Bibiche, Youssef; Berdai, Adnan; Labib, Smael; Harandou, Mustapha

2015-01-01

Les piqûres de scorpion sont dans un certain nombre de pays, un accident fréquemment rencontré, et un risque grave. Au Maroc, les données épidémiologiques établies par le centre anti-poison (CAPM) montrent que les piqûres scorpioniques se placent en tête de toutes les intoxications relevées par le centre (60%). Les envenimations scorpioniques posent un grand problème de santé publique. L'apparition de signes neurologiques lors d'une envenimation scorpionique témoigne d'une envenimation grave et correspond au stade III de l’échelle de sévérité. Nous rapportons le cas d'une envenimation scorpionique compliqué d'un Accident vasculaire cérébral ischémique (AVCI) chez un enfant. PMID:26175806

Coinfection pulmonaire par pneumocystis jirovecii et pseudomonas aeruginosa au cours du SIDA: à propos de deux cas

PubMed Central

Mamoudou, Savadogo; Bellaud, Guillaume; Ana, Canestri; Gilles, Pialoux

2015-01-01

Rapporter deux cas cliniques de coinfections pulmonaires par Pneumocystis jirovecii et par Pseudomonas aeruginosa chez des patients vivant avec le VIH. Les deux patients étaient âgés respectivement de 32 ans et 46 ans. Un patient a été pris en charge à l'hôpital Yalgado Ouédraogo de Ouagadougou au Burkina Faso et l'autre a été pris en charge à l'hôpital Ténon de Paris, en France. Les deux souffraient de pneumopathie confirmée à la radiographie et à la tomodensitométrie. L'un des patients était sévèrement immuno déprimé, contrairement à l'autre. L'examen bactériologique dans les crachats avait permis d'isoler Pseudomonas aeruginosa et Pneumocystis jirovecii chez les deux patients. Sous traitement, l’évolution a été favorable. Les coinfections morbides sont relativement fréquentes chez les patients vivant avec le VIH. Devant une symptomatologie respiratoire du sujet vivant avec le VIH, il faut savoir rechercher en plus du Bacille de Koch, Pneumocystis jirovecii et Pseudomonas aeruginosa par un lavage broncho alvéolaire. PMID:26516396

Fusion of SpCas9 to E. coli Rec A protein enhances CRISPR-Cas9 mediated gene knockout in mammalian cells.

PubMed

Lin, Lin; Petersen, Trine Skov; Jensen, Kristopher Torp; Bolund, Lars; Kühn, Ralf; Luo, Yonglun

2017-04-10

Mammalian cells repair double-strand DNA breaks (DSB) by a range of different pathways following DSB induction by the engineered clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated protein Cas9. While CRISPR-Cas9 thus enables predesigned modifications of the genome, applications of CRISPR-Cas9-mediated genome-editing are frequently hampered by the unpredictable and varying pathways for DSB repair in mammalian cells. Here we present a strategy of fusing Cas9 to recombinant proteins for fine-tuning of the DSB repair preferences in mammalian cells. By fusing Streptococcus Pyogenes Cas9 (SpCas9) to the recombinant protein A (Rec A, NP_417179.1) from Escherichia coli, we create a recombinant Cas9 protein (rSpCas9) which enhances the generation of indel mutations at DSB sites in mammalian cells, increases the frequency of DSB repair by homology-directed single-strand annealing (SSA), and represses homology-directed gene conversion by approximately 33%. Our study thus proves for the first time that fusing SpCas9 to recombinant proteins can influence the balance between DSB repair pathways in mammalian cells. This approach may form the basis for further investigations of the applications of recombinant Cas9 proteins to fine-tuning DSB repair pathways in eukaryotic cells. Copyright © 2017 Elsevier B.V. All rights reserved.

Approximation auto-coherente a deux particules, pseudogap et supraconductivite dans le modele de Hubbard attractif

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Allen, Steve

2000-10-01

Dans cette these nous presentons une nouvelle methode non perturbative pour le calcul des proprietes d'un systeme de fermions. Notre methode generalise l'approximation auto-coherente a deux particules proposee par Vilk et Tremblay pour le modele de Hubbard repulsif. Notre methode peut s'appliquer a l'etude du comportement pre-critique lorsque la symetrie du parametre d'ordre est suffisamment elevee. Nous appliquons la methode au probleme du pseudogap dans le modele de Hubbard attractif. Nos resultats montrent un excellent accord avec les donnees Monte Carlo pour de petits systemes. Nous observons que le regime ou apparait le pseudogap dans le poids spectral a une particule est un regime classique renormalise caracterise par une frequence caracteristique des fluctuations supraconductrices inferieure a la temperature. Une autre caracteristique est la faible densite de superfluide de cette phase demontrant que nous ne sommes pas en presence de paires preformees. Les resultats obtenus semblent montrer que la haute symetrie du parametre d'ordre et la bidimensionalite du systeme etudie elargissent le domaine de temperature pour lequel le regime pseudogap est observe. Nous argumentons que ce resultat est transposable aux supraconducteurs a haute temperature critique ou le pseudogap apparait a des' temperatures beaucoup plus grandes que la temperature critique. La forte symetrie dans ces systemes pourraient etre reliee a la theorie SO(5) de Zhang. En annexe, nous demontrons un resultat tout recent qui permettrait d'assurer l'auto-coherence entre les proprietes a une et a deux particules par l'ajout d'une dynamique au vertex irreductible. Cet ajout laisse entrevoir la possibilite d'etendre la methode au cas d'une forte interaction.

RNA Editing with CRISPR-Cas13

PubMed Central

Cox, David B.T.; Gootenberg, Jonathan S.; Abudayyeh, Omar O.; Franklin, Brian; Kellner, Max J.; Joung, Julia; Zhang, Feng

2017-01-01

Nucleic acid editing holds promise for treating genetic disease, particularly at the RNA level, where disease-relevant sequences can be rescued to yield functional protein products. Type VI CRISPR-Cas systems contain the programmable single-effector RNA-guided RNases Cas13. Here, we profile Type VI systems to engineer a Cas13 ortholog capable of robust knockdown and demonstrate RNA editing by using catalytically-inactive Cas13 (dCas13) to direct adenosine to inosine deaminase activity by ADAR2 to transcripts in mammalian cells. This system, referred to as RNA Editing for Programmable A to I Replacement (REPAIR), has no strict sequence constraints, can be used to edit full-length transcripts containing pathogenic mutations. We further engineer this system to create a high specificity variant, REPAIRv2, that is 919 times more specific than REPAIRv1 as well as minimize the system to ease viral delivery. REPAIR presents a promising RNA editing platform with broad applicability for research, therapeutics, and biotechnology. PMID:29070703

Retour vers le futur: l'expérience des patients et le lien avec la qualité, la sécurité et le rendement financier.

PubMed

Cochrane, Bonnie S; Hagins, Mitch; King, John A; Picciano, Gino; McCafferty, Maureen M; Nelson, Brian

2015-11-01

Au Canada, l'amélioration de l'expérience des patients est devenue une priorité des politiques de santé. Le perfectionnement et la normalisation des outils et systèmes pour surveiller les mesures de l'expérience des patients augmentent, tandis que la tendance vers une plus grande reddition de compte sur des améliorations durables et abordables se confirme. Pour de nombreux professionnels de la santé, ce phénomène fait foi d'un intérêt renouvelé pour les besoins et priorités fondamentaux des patients, après des décennies où les changements structurels et technologiques ont dominé les programmes de santé. Pour les leaders en santé canadiens, l'amélioration de l'expérience des patients comporte actuellement de grands défis et de belles possibilités. À cet égard, l'expérience des organisations partenaires du groupe Studer au Canada est à la fois pertinente et instructive. Ces organisations ont adopté un modèle, du nom de Evidence-Based Leadership (EBL, ou leadership fondé sur des données probantes), qui favorise et soutient l'harmonisation de l'ensemble des activités et des comportements, conformément à des objectifs organisationnels précis, y compris des améliorations mesurables de l'expérience des patients. Le présent article expose des études de cas d'organisations qui ont adopté l'EBL. Ces organisations ont réalisé des progrès rapides en matière d'indicateurs de l'expérience des patients, ainsi que dans des secteurs essentiels comme les résultats cliniques, la sécurité et le rendement financier. Les données émergentes sur les facteurs et processus qui sous-tendent ces améliorations sont également abordées. © 2015 Collège canadien des leaders en santé

The Reverse Transcriptases Associated with CRISPR-Cas Systems.

PubMed

Toro, Nicolás; Martínez-Abarca, Francisco; González-Delgado, Alejandro

2017-08-02

CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) and associated proteins (Cas) act as adaptive immune systems in bacteria and archaea. Some CRISPR-Cas systems have been found to be associated with putative reverse transcriptases (RT), and an RT-Cas1 fusion associated with a type III-B system has been shown to acquire RNA spacers in vivo. Nevertheless, the origin and evolutionary relationships of these RTs and associated CRISPR-Cas systems remain largely unknown. We performed a comprehensive phylogenetic analysis of these RTs and associated Cas1 proteins, and classified their CRISPR-Cas modules. These systems were found predominantly in bacteria, and their presence in archaea may be due to a horizontal gene transfer event. These RTs cluster into 12 major clades essentially restricted to particular phyla, suggesting host-dependent functioning. The RTs and associated Cas1 proteins may have largely coevolved. They are, therefore, subject to the same selection pressures, which may have led to coadaptation within particular protein complexes. Furthermore, our results indicate that the association of an RT with a CRISPR-Cas system has occurred on multiple occasions during evolution.

Pyélonéphrite xanthogranulomateuse bilatérale focale : à propos d’un cas

PubMed Central

El Yacoubi, Souhail; Ziouziou, Imad; Zizi, Mohamed; Jahid, Ahmed; Karmouni, Tariq; El Khader, Khalid; Koutani, Abdellatif; Andaloussi, Ahmed Iben Attya

2014-01-01

Résumé Nous présentons l’observation clinique d’un cas rare de pyélonéphrite xanthogranulomateuse (PXG) bilatérale chez un jeune patient âgé de 17 ans. La découverte progressive de l’infection a débuté par l’apparition de lombalgies bilatérales évoluant depuis un mois, sans autre signe associé. L’urotomodensitométrie penchait en faveur de deux masses rénales bilatérales, soit une masse polaire inférieure droite et une masse polaire supérieure gauche, toutes deux de densité tissulaire. Une biopsie échoguidée a suggéré la présence d’une réaction inflammatoire non spécifique. Une néphrectomie partielle polaire inférieure droite a été effectuée devant la forte présomption de tumeurs rénales malignes. Finalement, l’histologie a orienté le diagnostic vers une PXG. Il s’agit, à notre connaissance, du sixième cas de PXG focale bilatérale rapporté dans la littérature. Notre patient a reçu un traitement antibiotique à base de fluoroquinolone pendant un mois. L’évolution clinique s’est avérée bonne, et les lésions visibles à la tomodensitométrie se sont entièrement résorbées au bout d’un mois. Le patient vit toujours après un an et présente une fonction rénale normale. PMID:25295145

The CRISPR/Cas revolution reaches the RNA world: Cas13, a new Swiss Army knife for plant biologists.

PubMed

Wolter, Felix; Puchta, Holger

2018-06-01

Application of the bacterial CRISPR/Cas systems to eukaryotes is revolutionizing biology. Cas9 and Cas12 (previously called Cpf1) are widely used as DNA nucleases for inducing site-specific DNA breaks for different kinds of genome engineering applications, and in their mutated forms as DNA-binding proteins to modify gene expression. Moreover, histone modifications, as well as cytosine methylation or base editing, were achieved with these systems in plants. Recently, with the discovery of the nuclease Cas13a (previously called C2c2), molecular biologists have obtained a system that enables sequence-specific cleavage of single-stranded RNA molecules. The latest experiments with this and also the alternative Cas13b system demonstrate that these proteins can be used in a similar manner in eukaryotes for RNA manipulation as Cas9 and Cas12 for DNA manipulations. The first application of Cas13a for post-transcriptional regulation of gene expression in plants has been reported. Recent results show that the system is also applicable for combating viral infection in plants. As single-stranded RNA viruses are by far the most abundant class of viruses in plants, the application of this system is of special promise for crops. More interesting applications are imminent for plant biologists, with nuclease dead versions of Cas13 enabling the ability to visualize RNA molecules in vivo, as well as to edit different kinds of RNA molecules at specific bases by deamination or to modify them by conjugation. Moreover, by combining DNA- and RNA-directed systems, the most complex of changes in plant metabolism might be achievable. © 2018 The Authors The Plant Journal © 2018 John Wiley & Sons Ltd.

Spectroscopic studies of three Cepheids with high positive pulsation period increments: SZ Cas, BY Cas, and RU Sct

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Usenko, I. A.; Klochkova, V. G.

2015-07-01

Three high-resolution spectra have been taken at different times with the 6-m SAO RAS telescope (LYNX and PFES spectrographs) for three Cepheids exhibiting high positive period increments: the small-amplitude (DCEPS) SZ Cas and BY Cas and the classical (DCEP) RU Sct. SZ Cas and RU Sct are members of the Galactic open clusters χ and h Per and Trump 35, respectively. Analysis of the spectra has shown that the interstellar Na I D1 and D2 lines in all objects are considerably stronger than the atmospheric ones and are redshifted in SZ Cas and BY Cas and blushifted in RU Sct. The core of the H α absorption line in BY Cas has an asymmetric knifelike shape, while RU Sct exhibits an intense emission in the blue wing of this line. Such phenomena are observed in long-period Cepheids and bright hypergiants with an extended envelope. In this case, the strong Mg Ib 5183.62 Å and Ba II 5853.67, 6141.713, and 6496.90 Å lines with low χlow in SZ Cas and RU Sct also show characteristic knifelike profiles with an asymmetry in the red region, while the Ba II 4934.095 Å line shows similar profiles in the blue one. The absorption lines of neutral atoms and singly ionized metals with different lowerlevel excitation potentials exhibit different degrees of asymmetry: from a pronounced one with secondary components in BY Cas (similar to those in the small-amplitude Cepheid BG Cru pulsating in the first overtone and having an envelope) to its insignificance or virtual absence in SZ Cas and RU Sct. Analysis of the secular changes in mean T eff determined from photometric color indices and spectra over the last 55 years for these stars has revealed periodic fluctuations of 200 K for SZ Cas and BY Cas and 500 K for RU Sct. For SZ Cas and RU Sct, T eff determined in some years from some color indices show much lower values, which together with the temperature fluctuations can be associated with mass loss and dust formation. Based on these facts, we hypothesize the existence of

La syphilis congénitale révélée par une fracture spontanée

PubMed Central

Idrissi, Mounia Lakhdar; Ismaili, Leila; Bouharrou, Abdelhak; Hida, Moustapha

2011-01-01

Alors qu'elle est actuellement oubliée dans les pays développés, la syphilis congénitale se voit encore chez nous faute du dépistage anténatal. Ses formes cliniques sont polymorphes et orientent à tord vers d'autres pathologies surtout en période néonatale. Le diagnostic n'est donc pas toujours facile. La révélation d'une syphilis congénitale par une fracture spontanée est exceptionnellement décrite. Nous rapportons dans ce travail le cas d'un nourrisson de 2 mois ramené en consultation pour limitation douloureuse des mouvements du bras droit. Le diagnostic est évoqué sur les données radiologiques et confirmé par la sérologie syphilitique. Le traitement a reposé essentiellement sur l'administration de la pénicilline G avec une bonne évolution clinique. PMID:22384288

Poumon du puisatier

PubMed Central

Elidrissi, Amal Moustarhfir; Zaghba, Nahid; Benjelloun, Hanane; Yassine, Najiba

2016-01-01

Le puisatier a pour profession le creusement et l'entretien des puits pour fournir de l'eau. Il est au contact de divers minerais, particulièrement la silice, particule qui présente un risque certain de développement des maladies pulmonaires connues sous le nom de silicose. Le but de notre travail est de préciser le profil épidémiologique, clinique, radiologique et évolutif des patients puisatiers silicotiques. C'est une étude rétrospective concernant 54 cas de puisatiers ayant une silicose, colligés au service des maladies respiratoires du CHU Ibn Rochd de Casablanca, de Mars 1997 à Janvier 2016. Tous les malades étaient des puisatiers, de sexe masculin, avec une moyenne d'âge de 50 ans. Le tabagisme était retrouvé dans 36 cas et un antécédent de tuberculose était noté dans huit cas. La radiographie thoracique retrouvait des grandes opacités dans 39 cas, des petites opacités dans 15 cas, et un épaississement des septats dans 11 cas. Ce tableau de silicose s'était compliqué d'une surinfection bactérienne dans 37% des cas, d' un pneumothorax dans 4% des cas et d'une tuberculose dans 20% des cas. La prise en charge thérapeutique était celle des complications. La déclaration de la maladie professionnelle et de l'indemnisation était faite. L'évolution était bonne dans 12 cas, stationnaire dans 17 cas et mauvaise dans 16 cas. La silicose est une pneumoconiose fréquente chez les puisatiers. Elle retentit sur la fonction respiratoire. Nous soulignons l'association fréquente de tuberculose et nous insistons sur la prévention qui reste le meilleur traitement. PMID:28292119

Cas4 Facilitates PAM-Compatible Spacer Selection during CRISPR Adaptation.

PubMed

Kieper, Sebastian N; Almendros, Cristóbal; Behler, Juliane; McKenzie, Rebecca E; Nobrega, Franklin L; Haagsma, Anna C; Vink, Jochem N A; Hess, Wolfgang R; Brouns, Stan J J

2018-03-27

CRISPR-Cas systems adapt their immunological memory against their invaders by integrating short DNA fragments into clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR) loci. While Cas1 and Cas2 make up the core machinery of the CRISPR integration process, various class I and II CRISPR-Cas systems encode Cas4 proteins for which the role is unknown. Here, we introduced the CRISPR adaptation genes cas1, cas2, and cas4 from the type I-D CRISPR-Cas system of Synechocystis sp. 6803 into Escherichia coli and observed that cas4 is strictly required for the selection of targets with protospacer adjacent motifs (PAMs) conferring I-D CRISPR interference in the native host Synechocystis. We propose a model in which Cas4 assists the CRISPR adaptation complex Cas1-2 by providing DNA substrates tailored for the correct PAM. Introducing functional spacers that target DNA sequences with the correct PAM is key to successful CRISPR interference, providing a better chance of surviving infection by mobile genetic elements. Copyright © 2018 The Authors. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.

Disabling Cas9 by an anti-CRISPR DNA mimic.

PubMed

Shin, Jiyung; Jiang, Fuguo; Liu, Jun-Jie; Bray, Nicolas L; Rauch, Benjamin J; Baik, Seung Hyun; Nogales, Eva; Bondy-Denomy, Joseph; Corn, Jacob E; Doudna, Jennifer A

2017-07-01

CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats)-Cas9 gene editing technology is derived from a microbial adaptive immune system, where bacteriophages are often the intended target. Natural inhibitors of CRISPR-Cas9 enable phages to evade immunity and show promise in controlling Cas9-mediated gene editing in human cells. However, the mechanism of CRISPR-Cas9 inhibition is not known, and the potential applications for Cas9 inhibitor proteins in mammalian cells have not been fully established. We show that the anti-CRISPR protein AcrIIA4 binds only to assembled Cas9-single-guide RNA (sgRNA) complexes and not to Cas9 protein alone. A 3.9 Å resolution cryo-electron microscopy structure of the Cas9-sgRNA-AcrIIA4 complex revealed that the surface of AcrIIA4 is highly acidic and binds with a 1:1 stoichiometry to a region of Cas9 that normally engages the DNA protospacer adjacent motif. Consistent with this binding mode, order-of-addition experiments showed that AcrIIA4 interferes with DNA recognition but has no effect on preformed Cas9-sgRNA-DNA complexes. Timed delivery of AcrIIA4 into human cells as either protein or expression plasmid allows on-target Cas9-mediated gene editing while reducing off-target edits. These results provide a mechanistic understanding of AcrIIA4 function and demonstrate that inhibitors can modulate the extent and outcomes of Cas9-mediated gene editing.

Transformation of OODT CAS to Perform Larger Tasks

NASA Technical Reports Server (NTRS)

Mattmann, Chris; Freeborn, Dana; Crichton, Daniel; Hughes, John; Ramirez, Paul; Hardman, Sean; Woollard, David; Kelly, Sean

2008-01-01

A computer program denoted OODT CAS has been transformed to enable performance of larger tasks that involve greatly increased data volumes and increasingly intensive processing of data on heterogeneous, geographically dispersed computers. Prior to the transformation, OODT CAS (also alternatively denoted, simply, 'CAS') [wherein 'OODT' signifies 'Object-Oriented Data Technology' and 'CAS' signifies 'Catalog and Archive Service'] was a proven software component used to manage scientific data from spaceflight missions. In the transformation, CAS was split into two separate components representing its canonical capabilities: file management and workflow management. In addition, CAS was augmented by addition of a resource-management component. This third component enables CAS to manage heterogeneous computing by use of diverse resources, including high-performance clusters of computers, commodity computing hardware, and grid computing infrastructures. CAS is now more easily maintainable, evolvable, and reusable. These components can be used separately or, taking advantage of synergies, can be used together. Other elements of the transformation included addition of a separate Web presentation layer that supports distribution of data products via Really Simple Syndication (RSS) feeds, and provision for full Resource Description Framework (RDF) exports of metadata.

Chronic arsenic intoxication diagnostic score (CAsIDS).

PubMed

Dani, Sergio Ulhoa; Walter, Gerhard Franz

2018-01-01

Arsenic and its compounds are well-established, potent, environmentally widespread and persistent toxicants with metabolic, genotoxic, mutagenic, teratogenic, epigenetic and carcinogenic effects. Arsenic occurs naturally in the Earth's crust, but anthropogenic arsenic emissions have surmounted the emissions from important natural sources such as volcanism. Inorganic arsenicals exhibit acute and chronic toxicities in virtually all cell types and tissues, and hence arsenic intoxication affects multiple systems. Whereas acute arsenic intoxication is rare and relatively easy to diagnose, chronic arsenic intoxication (CAsI) is common but goes often misdiagnosed. Based on a review of the literature as well as our own clinical experience, we propose a chronic arsenic intoxication diagnostic score (CAsIDS). A distinctive feature of CAsIDS is the use of bone arsenic load as an essential criterion for the individual risk assessment of chronic arsenic intoxication, combined with a systemic clinical assessment. We present clinical examples where CAsIDS is applied for the diagnosis of CAsI, review the main topics of the toxicity of arsenic in different cell and organ systems and discuss the therapy and prevention of disease caused or aggravated by chronic arsenic intoxication. CAsIDS can help physicians establish the diagnosis of CAsI and associated conditions. Copyright © 2017 John Wiley & Sons, Ltd.

Sulfonamide inhibition studies of two β-carbonic anhydrases from the ascomycete fungus Sordaria macrospora, CAS1 and CAS2.

PubMed

Vullo, Daniela; Lehneck, Ronny; Pöggeler, Stefanie; Supuran, Claudiu T

2018-12-01

The two β-carbonic anhydrases (CAs, EC 4.2.1.1) recently cloned and purified from the ascomycete fungus Sordaria macrospora, CAS1 and CAS2, were investigated for their inhibition with a panel of 39 aromatic, heterocyclic, and aliphatic sulfonamides and one sulfamate, many of which are clinically used agents. CAS1 was efficiently inhibited by tosylamide, 3-fluorosulfanilamide, and 3-chlorosulfanilamide (K I s in the range of 43.2-79.6 nM), whereas acetazolamide, methazolamide, topiramate, ethoxzolamide, dorzolamide, and brinzolamide were medium potency inhibitors (K I s in the range of 360-445 nM). CAS2 was less sensitive to sulfonamide inhibitors. The best CAS2 inhibitors were 5-amino-1,3,4-thiadiazole-2-sulfonamide (the deacetylated acetazolamide precursor) and 4-hydroxymethyl-benzenesulfonamide, with K I s in the range of 48.1-92.5 nM. Acetazolamide, dorzolamide, ethoxzolamide, topiramate, sulpiride, indisulam, celecoxib, and sulthiame were medium potency CAS2 inhibitors (K I s of 143-857 nM). Many other sulfonamides showed affinities in the high micromolar range or were ineffective as CAS1/2 inhibitors. Small changes in the structure of the inhibitor led to important differences of the activity. As these enzymes may show applications for the removal of anthropically generated polluting gases, finding modulators of their activity may be crucial for designing environmental-friendly CO 2 capture processes.

5 CFR 550.604 - Biweekly pay periods and computation of pay.

Code of Federal Regulations, 2010 CFR

2010-01-01

... 5 Administrative Personnel 1 2010-01-01 2010-01-01 false Biweekly pay periods and computation of pay. 550.604 Section 550.604 Administrative Personnel OFFICE OF PERSONNEL MANAGEMENT CIVIL SERVICE REGULATIONS PAY ADMINISTRATION (GENERAL) Computation of Pay for Biweekly Pay Periods § 550.604 Biweekly pay...

RNA editing with CRISPR-Cas13.

PubMed

Cox, David B T; Gootenberg, Jonathan S; Abudayyeh, Omar O; Franklin, Brian; Kellner, Max J; Joung, Julia; Zhang, Feng

2017-11-24

Nucleic acid editing holds promise for treating genetic disease, particularly at the RNA level, where disease-relevant sequences can be rescued to yield functional protein products. Type VI CRISPR-Cas systems contain the programmable single-effector RNA-guided ribonuclease Cas13. We profiled type VI systems in order to engineer a Cas13 ortholog capable of robust knockdown and demonstrated RNA editing by using catalytically inactive Cas13 (dCas13) to direct adenosine-to-inosine deaminase activity by ADAR2 (adenosine deaminase acting on RNA type 2) to transcripts in mammalian cells. This system, referred to as RNA Editing for Programmable A to I Replacement (REPAIR), which has no strict sequence constraints, can be used to edit full-length transcripts containing pathogenic mutations. We further engineered this system to create a high-specificity variant and minimized the system to facilitate viral delivery. REPAIR presents a promising RNA-editing platform with broad applicability for research, therapeutics, and biotechnology. Copyright © 2017, American Association for the Advancement of Science.

La plastie en rail dans le traitement des brides rétractiles du creux poplite

PubMed Central

Achbouk, A.; Khales, A.; Bourra, K.; Tourabi, K.; Ababou, K.; Ihrai, H.

2011-01-01

Summary Les Auteurs décrivent le cas d’un patient âgé de 45 ans atteint de brûlures thermiques par flammes suite à la déflagration d’une bonbonne de gaz. Les lésions initiales intéressaient les quatre membres (en particulier, le genou) et le tronc. La prise en charge initiale a consisté en une excision-greffe précoce des membres. L’évolution a été marquée par la survenue de cicatrices hypertrophiques au niveau des zones non greffées et à la bordure de la greffe ainsi que la survenue de brides rétractiles. Devant l’handicap fonctionnel engendré par la bride à cause de la limitation importante de l’extension, le patient a été admis pour cure chirurgicale. Grâce à la technique en rail décrite, le patient a pu récupérer une fonction normale du genou. Les suites ont été simples avec une durée d’hospitalisation d’un mois. Le résultat esthétique est relativement satisfaisant. La technique en rail est un moyen parmi l’arsenal thérapeutique qui permet de traiter la bride du creux poplité. Sa simplicité, sa facilité technique et son résultat satisfaisant ainsi que ses suites simples permettent de la rendre une technique très prisée dans le traitement de ce type de bride. PMID:21991240

Effects of Using a Computer Algebra System (CAS) on Junior College Students' Attitudes towards CAS and Achievement in Mathematics

ERIC Educational Resources Information Center

Leng, Ng Wee; Choo, Kwee Tiow; Soon, Lau Hock; Yi-Huak, Koh; Sun, Yap Yew

2005-01-01

This study examines the effects of using Texas Instruments' Voyage 200 calculator (V200), a graphing calculator with a built-in computer algebra system (CAS), on attitudes towards CAS and achievement in mathematics of junior college students (17 year olds). Students' attitudes towards CAS were examined using a 40-item Likert-type instrument…

A Selection of Experimental Test Cases for the Validation of CFD Codes (Recueil de cas d’essai experimentaux pour la validation des codes de l’aerodynamique numerique). Volume 1

DTIC Science & Technology

1994-08-01

volume H1. Le rapport ext accompagnt5 doun jeo die disqoettex contenant les donn~es appropri~es Li bous let cas d’essai. (’es disqoettes sont disponibles ...GERMANY PURPL’Sb OF THE TESi The tests are part of a larger effort to establish a database of experimental measurements for missile configurations

[CRISPR/CAS9, the King of Genome Editing Tools].

PubMed

Bannikov, A V; Lavrov, A V

2017-01-01

The discovery of CRISPR/Cas9 brought a hope for having an efficient, reliable, and readily available tool for genome editing. CRISPR/Cas9 is certainly easy to use, while its efficiency and reliability remain the focus of studies. The review describes the general principles of the organization and function of Cas nucleases and a number of important issues to be considered while planning genome editing experiments with CRISPR/Cas9. The issues include evaluation of the efficiency and specificity for Cas9, sgRNA selection, Cas9 variants designed artificially, and use of homologous recombination and nonhomologous end joining in DNA editing.

Standardissimo. Les limitations théoriques du Modèle Standard. Quelles réponses y apporter?

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Renard, F. M.

Nous présentons I 'état du Modèle Standard des interactions fortes, faibles et électromagnétiques. Après une description rapide de ses 3 secteurs, secteur de jauge (radiation), secteur fermionique (matière) et secteur scalaire (génération des masses), nous insistons sur le grand nombre de paramètres libres et sur les choix arbitraires qu'il a fallu faire dans l'élaboration du modèle. Nous faisons ressortir les problèmes techniques non résolus et nous dressons la liste des questions fondamentales restées sans réponses. Nous passons ensuite en revue les idées et méthodes proposées pour répondre à ces questions. Elles utilisent essentiellement 3 voies différentes. La première consiste à requérir plus de symétrie (extension du modèle, symétrie Gauche-Droite, Grandes Unifications, Supersymétrie,...). La seconde contient les diverses alternatives au Modèle Standard impliquant des modifications dans certains secteurs (par exemple le secteur scalaire avec le modèle de la Technicouleur) ou de façon plus violente l'hypothèse d'une sous-structure des leptons, des quarks et des bosons W et Z eux-mêmes. Une dernière voie cherche à justifier les particularités du Modèle Standard et relier ses paramètres libres en se basant sur des principes de cohérence interne du modèle. Les conséquences observables de ces diverses approches sont dans chaque cas mentionnées.

CRISPR/Cas9 for cancer research and therapy.

PubMed

Zhan, Tianzuo; Rindtorff, Niklas; Betge, Johannes; Ebert, Matthias P; Boutros, Michael

2018-04-16

CRISPR/Cas9 has become a powerful method for making changes to the genome of many organisms. First discovered in bacteria as part of an adaptive immune system, CRISPR/Cas9 and modified versions have found a widespread use to engineer genomes and to activate or to repress the expression of genes. As such, CRISPR/Cas9 promises to accelerate cancer research by providing an efficient technology to dissect mechanisms of tumorigenesis, identify targets for drug development, and possibly arm cells for cell-based therapies. Here, we review current applications of the CRISPR/Cas9 technology for cancer research and therapy. We describe novel Cas9 variants and how they are used in functional genomics to discover novel cancer-specific vulnerabilities. Furthermore, we highlight the impact of CRISPR/Cas9 in generating organoid and mouse models of cancer. Finally, we provide an overview of the first clinical trials that apply CRISPR/Cas9 as a therapeutic approach against cancer. Copyright © 2018 The Authors. Published by Elsevier Ltd.. All rights reserved.

Profil épidémiologique des hémoglobinopathies: étude transversale descriptive autour du cas index

PubMed Central

Dahmani, Fatima; Benkirane, Souad; Kouzih, Jaafar; Woumki, Aziz; Mamad, Hassan; Masrar, Azlarab

2017-01-01

Les hémoglobinopathies sont des affections constitutionnelles conséquentes à des anomalies des hémoglobines. Elles sont souvent graves dans leurs formes majeures, leur prise en charge est lourde avec un grand impact psycho-social sur les patients et leur famille. Classées parmi les maladies rares, elles sont encore insuffisamment connues des professionnels de santé. Cette méconnaissance est à l'origine d'une errance diagnostique, d'un retard dans leur prise en charge et par conséquent une morbidité et une mortalité élevée chez ces patients. L'Organisation Mondiale de la Santé (OMS) a publié en 2008 des données concernant l'épidémiologie des hémoglobinopathies: plus de 330000 cas naissent chaque année avec une hémoglobinopathie (83% des cas de drépanocytose, 17% des cas de thalassémie). Les troubles de l'hémoglobine sont responsables d'environ 3,4% des décès chez les moins de 5 ans. A l'échelle mondiale, 7% environ des femmes enceintes seraient porteuses d'une forme de la thalassémie et 1% des couples sont à risque. Toutefois, elles sont relativement fréquentes dans certaines régions du globe où les mariages consanguins sont communs. Afin de décrire les caractéristiques épidémiologiques des familles à risque d'hémoglobinopathies (étude autour du cas) dont les cas index sont suivis au service de pédiatrie à l'Hôpital Provincial El Idrisi de Kenitra au Maroc, une étude transversale descriptive a été réalisée durant deux enquêtes la première en mai 2015 et la deuxième en juin de la même année lors des journées de vaccination des cas index contre le pneumocoque. Après avoir recueilli les données épidémiologiques de nos patients, nous avons réalisé une étude biologique comportant: l'hémogramme avec étude morphologique des globules rouges en coloration MGG et numération automatique des réticulocytes; les électrophorèses de l'hémoglobine à pH alcalin (8.8) et secondairement à pH acide (5.4) sur gel d

Examination of CRISPR/Cas9 design tools and the effect of target site accessibility on Cas9 activity.

PubMed

Lee, Ciaran M; Davis, Timothy H; Bao, Gang

2018-04-01

What is the topic of this review? In this review, we analyse the performance of recently described tools for CRISPR/Cas9 guide RNA design, in particular, design tools that predict CRISPR/Cas9 activity. What advances does it highlight? Recently, many tools designed to predict CRISPR/Cas9 activity have been reported. However, the majority of these tools lack experimental validation. Our analyses indicate that these tools have poor predictive power. Our preliminary results suggest that target site accessibility should be considered in order to develop better guide RNA design tools with improved predictive power. The recent adaptation of the clustered regulatory interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated protein 9 (Cas9) system for targeted genome engineering has led to its widespread application in many fields worldwide. In order to gain a better understanding of the design rules of CRISPR/Cas9 systems, several groups have carried out large library-based screens leading to some insight into sequence preferences among highly active target sites. To facilitate CRISPR/Cas9 design, these studies have spawned a plethora of guide RNA (gRNA) design tools with algorithms based solely on direct or indirect sequence features. Here, we demonstrate that the predictive power of these tools is poor, suggesting that sequence features alone cannot accurately inform the cutting efficiency of a particular CRISPR/Cas9 gRNA design. Furthermore, we demonstrate that DNA target site accessibility influences the activity of CRISPR/Cas9. With further optimization, we hypothesize that it will be possible to increase the predictive power of gRNA design tools by including both sequence and target site accessibility metrics. © 2017 The Authors. Experimental Physiology © 2017 The Physiological Society.

Formes hémorragiques graves de la fièvre de la vallée du Rift: à propos de 5 cas

PubMed Central

Salem, Mohamed Lemine Ould; Baba, Sidi El Wafi Ould; Fall-Malick, Fatimetou Zahra; Boushab, Boushab Mohamed; Ghaber, Sidi Mohamed; Mokhtar, Abdelwedoud

2016-01-01

La fièvre de la vallée du Rift (FVR) est une arbovirose due à un virus à ARN appartenant à la famille de Bunyaviridae (genre phlebovirus). C'est une zoonose touchant principalement les animaux mais pouvant aussi contaminer l'homme, soit directement par la manipulation des viandes ou avortons d'animaux malades ou indirectement par la piqure de moustiques infectées (Aèdes sp, anophèles sp, Culex sp). Dans la majorité des cas, l'infection humaine à FVR est asymptomatique, mais elle peut également se manifester par un syndrome fébrile modérée d’évolution favorable. Néanmoins, certains patients peuvent développer un syndrome hémorragique et/ou des lésions neurologiques d’évolution mortelle. Nous décrivons l’évolution de cinq cas de patients atteints de la FVR, admis dans le service de médecine interne du Centre Hospitalier National de Nouakchott (Mauritanie), le mois d'Octobre 2015 et présentant tous, un syndrome hémorragique dans un contexte fébrile. L’évolution n’était favorable que pour 2 des cinq patients. Les 3 autres sont décédés, deux dans un tableau de choc hémorragique et dans un état de choc septique. PMID:27642413

Pay-for-virtue: an option to improve pay-for-performance?

PubMed

Buetow, Stephen; Entwistle, Vikki

2011-10-01

Pay-for-performance schemes reward standardized professional behaviours associated with effective care. However, they neglect the significance of virtue and devalue and erode professional motivation based on virtue. Pay for training to cultivate virtue, and/or pay-for-virtue, may mitigate these dangers. Although virtue is typically considered its own reward, and the assessment of virtue is problematic, pay-for-virtue could involve (1) stringent checks on the appropriateness of the standardized care currently rewarded by pay-for-performance for individual patients or (2) pay for indicators of virtue. These indicators could be based on virtues identified from a framework of universal virtues and through logical inferences from features of practice. It is possible that pay-for-virtue could ultimately strengthen health professionals' intrinsic motivation for good practice, but this and the broader effects of pay-for-virtue would need careful investigation. © 2011 Blackwell Publishing Ltd.

Hématome sous capsulaire de foie compliquant une pré-éclampsie: à propos de 6 cas

PubMed Central

Mamouni, Nisrine; Derkaoui, Ali; Bougern, Hakima; Bouchikhi, Chehrazad; Chaara, Hikmat; Banani, Abdelaziz; Abdelilah, Melhouf Moulay

2011-01-01

L'hématome sous capsulaire du foie (HSCF) est une complication rare mais gravissime de la grossesse. Devant une symptomatologie clinique souvent non spécifique et un tableau biologique retardé, son diagnostic est basé essentiellement sur les moyens de l'imagerie (échographie, TDM, IRM). Son traitement est fonction de l'intégrité ou non de la capsule de Glisson. Nous rapportons les observations de 6 patientes, à travers une étude rétrospective s’étalant sur la période du Janvier 2005 à Octobre 2008, incluant tous les cas de preeclampsie colligés au service de gynécologie obstétrique du CHU Hassan II. Durant la période d’étude, L'incidence de l'hématome sous capsulaire de foie chez les patientes préeclamptiques admises durant la période d’étude est de 1,49 %. Aucune des patientes n'a benificié d'un suivi prénatal au sein de notre formation. La moyenne d’âge des patientes est de 37,6 ans avec des extrêmes allant de 33 à 45 ans. La gestité moyenne était de 4,8 avec une parité moyenne de 4,5.l'hematome sous capsulaire est survenu en post partum chez tous nos cas avec un délai moyen de 4 jours et des extrêmes allant de J0 et J10 du post partum .Toutes les patientes ont présenté un HELLP syndrome concomitant à la survenue de cette complication gravissime.Le diagnostic positif s'est basé sur les données échographiques dans 5 cas (hemoperitoine –HSCF).l’équipe a opté pour une abstention thérapeutique avec surveillance armée chez 2 cas et l'exploration chirurgicale a été indiquée chez quatre patientes en instabilité hemodynamique.Nous avons déploré deux cas de décès maternel. PMID:22145072

Advances in therapeutic CRISPR/Cas9 genome editing.

PubMed

Savić, Nataša; Schwank, Gerald

2016-02-01

Targeted nucleases are widely used as tools for genome editing. Two years ago the clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)-associated Cas9 nuclease was used for the first time, and since then has largely revolutionized the field. The tremendous success of the CRISPR/Cas9 genome editing tool is powered by the ease design principle of the guide RNA that targets Cas9 to the desired DNA locus, and by the high specificity and efficiency of CRISPR/Cas9-generated DNA breaks. Several studies recently used CRISPR/Cas9 to successfully modulate disease-causing alleles in vivo in animal models and ex vivo in somatic and induced pluripotent stem cells, raising hope for therapeutic genome editing in the clinics. In this review, we will summarize and discuss such preclinical CRISPR/Cas9 gene therapy reports. Copyright © 2016 Elsevier Inc. All rights reserved.

Recent Advances in Genome Editing Using CRISPR/Cas9.

PubMed

Ding, Yuduan; Li, Hong; Chen, Ling-Ling; Xie, Kabin

2016-01-01

The CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat)-Cas9 (CRISPR-associated nuclease 9) system is a versatile tool for genome engineering that uses a guide RNA (gRNA) to target Cas9 to a specific sequence. This simple RNA-guided genome-editing technology has become a revolutionary tool in biology and has many innovative applications in different fields. In this review, we briefly introduce the Cas9-mediated genome-editing method, summarize the recent advances in CRISPR/Cas9 technology, and discuss their implications for plant research. To date, targeted gene knockout using the Cas9/gRNA system has been established in many plant species, and the targeting efficiency and capacity of Cas9 has been improved by optimizing its expression and that of its gRNA. The CRISPR/Cas9 system can also be used for sequence-specific mutagenesis/integration and transcriptional control of target genes. We also discuss off-target effects and the constraint that the protospacer-adjacent motif (PAM) puts on CRISPR/Cas9 genome engineering. To address these problems, a number of bioinformatic tools are available to help design specific gRNAs, and new Cas9 variants and orthologs with high fidelity and alternative PAM specificities have been engineered. Owing to these recent efforts, the CRISPR/Cas9 system is becoming a revolutionary and flexible tool for genome engineering. Adoption of the CRISPR/Cas9 technology in plant research would enable the investigation of plant biology at an unprecedented depth and create innovative applications in precise crop breeding.

Recent Advances in Genome Editing Using CRISPR/Cas9

PubMed Central

Ding, Yuduan; Li, Hong; Chen, Ling-Ling; Xie, Kabin

2016-01-01

The CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat)-Cas9 (CRISPR-associated nuclease 9) system is a versatile tool for genome engineering that uses a guide RNA (gRNA) to target Cas9 to a specific sequence. This simple RNA-guided genome-editing technology has become a revolutionary tool in biology and has many innovative applications in different fields. In this review, we briefly introduce the Cas9-mediated genome-editing method, summarize the recent advances in CRISPR/Cas9 technology, and discuss their implications for plant research. To date, targeted gene knockout using the Cas9/gRNA system has been established in many plant species, and the targeting efficiency and capacity of Cas9 has been improved by optimizing its expression and that of its gRNA. The CRISPR/Cas9 system can also be used for sequence-specific mutagenesis/integration and transcriptional control of target genes. We also discuss off-target effects and the constraint that the protospacer-adjacent motif (PAM) puts on CRISPR/Cas9 genome engineering. To address these problems, a number of bioinformatic tools are available to help design specific gRNAs, and new Cas9 variants and orthologs with high fidelity and alternative PAM specificities have been engineered. Owing to these recent efforts, the CRISPR/Cas9 system is becoming a revolutionary and flexible tool for genome engineering. Adoption of the CRISPR/Cas9 technology in plant research would enable the investigation of plant biology at an unprecedented depth and create innovative applications in precise crop breeding. PMID:27252719

Crise convulsive chez les abuseurs de Tramadol et caféine: à propos de 8 cas et revue de la littérature

PubMed Central

Maiga, Djibo Douma; Seyni, Houdou; Sidikou, Amadou; Azouma, Alfazazi

2012-01-01

Nous rapportons Huit cas de crises convulsives diagnostiquées comme maladie épileptique après ingestion de Tramadol et d'autres substances psychotropes dont la Caféine dans une région ou maladie épileptique et addiction au café sont fréquentes. L'objectif de ce travail était d'informer les praticiens sur le risque de convulsion lié à la consommation du Tramadol seul ou en association avec d'autres psychotropes en s'appuyant sur les données de la littérature. Il s'agissait d'une étude rétrospective et exhaustive de patients vus en consultation ambulatoire pour crise convulsive et consommation de Tramadol et de caféine de janvier à mai 2012. Les données collectées étaient les caractéristiques sociodémographiques et de la consommation de Tramadol. Le diagnostic de crise convulsive a été posé sur les renseignements obtenus à l'anamnèse. Tous les patients ont été soumis à un examen neurologique et aux critères de dépendance du Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders (DSMIV)-R par rapport à leur consommation de Tramadol. Nous n'avons pas trouvé dans la littérature médicale de cas de consommation concomitante de Tramadol et de Caféine. Les données expérimentales suggèrent une action synergique du Tramadol et de la Caféine sur la douleur et le seuil épileptogène. Nos observations plaident également en faveur d'une synergie d'action de ces deux molécules dans la survenue des crises convulsives. La fréquence des crises convulsives suite à une intoxication par le Tramadol et la caféine est susceptible d'augmenter en Afrique en raison du mésusage croissant de ces substances. Une étude comparative usagers de Tramadol associé à la Caféine et usagers du Tramadol seul devrait permettre d’évaluer le risque. PMID:23308329

Assisting Students' Cognitive Strategies with the Use of CAS

ERIC Educational Resources Information Center

Sarvari, Csaba; Lavicza, Zsolt; Klincsik, Mihaly

2010-01-01

This paper examines various cognitive strategies applied while CAS (Computer Algebra System) are used in undergraduate-level engineering mathematics teaching and learning. We posed some questions in relation to such CAS use: What kind of tools can CAS offer to enhance different cognitive strategies of students? How can the use of CAS widen the…

Production of Purified CasRNPs for Efficacious Genome Editing.

PubMed

Lingeman, Emily; Jeans, Chris; Corn, Jacob E

2017-10-02

CRISPR-Cas systems have been harnessed as modular genome editing reagents for functional genomics and show promise to cure genetic diseases. Directed by a guide RNA, a Cas effector introduces a double stranded break in DNA and host cell DNA repair leads to the introduction of errors (e.g., to knockout a gene) or a programmed change. Introduction of a Cas effector and guide RNA as a purified Cas ribonucleoprotein complex (CasRNP) has recently emerged as a powerful approach to alter cell types and organisms. Not only does CasRNP editing exhibit increased efficacy and specificity, it avoids optimization and iteration of species-specific factors such as codon usage, promoters, and terminators. CasRNP editing has been rapidly adopted for research use in many contexts and is quickly becoming a popular method to edit primary cells for therapeutic application. This article describes how to make a Cas9 RNP and outlines its use for gene editing in human cells. © 2017 by John Wiley & Sons, Inc. Copyright © 2017 John Wiley & Sons, Inc.

A Cas9 transgenic Plasmodium yoelii parasite for efficient gene editing.

PubMed

Qian, Pengge; Wang, Xu; Yang, Zhenke; Li, Zhenkui; Gao, Han; Su, Xin-Zhuan; Cui, Huiting; Yuan, Jing

2018-06-01

The RNA-guided endonuclease Cas9 has applied as an efficient gene-editing method in malaria parasite Plasmodium. However, the size (4.2 kb) of the commonly used Cas9 from Streptococcus pyogenes (SpCas9) limits its utility for genome editing in the parasites only introduced with cas9 plasmid. To establish the endogenous and constitutive expression of Cas9 protein in the rodent malaria parasite P. yoelii, we replaced the coding region of an endogenous gene sera1 with the intact SpCas9 coding sequence using the CRISPR/Cas9-mediated genome editing method, generating the cas9-knockin parasite (PyCas9ki) of the rodent malaria parasite P. yoelii. The resulted PyCas9ki parasite displays normal progression during the whole life cycle and possesses the Cas9 protein expression in asexual blood stage. By introducing the plasmid (pYCs) containing only sgRNA and homologous template elements, we successfully achieved both deletion and tagging modifications for different endogenous genes in the genome of PyCas9ki parasite. This cas9-knockin PyCas9ki parasite provides a new platform facilitating gene functions study in the rodent malaria parasite P. yoelii. Copyright © 2018 Elsevier B.V. All rights reserved.

CRISPR/Cas9 in Genome Editing and Beyond.

PubMed

Wang, Haifeng; La Russa, Marie; Qi, Lei S

2016-06-02

The Cas9 protein (CRISPR-associated protein 9), derived from type II CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) bacterial immune systems, is emerging as a powerful tool for engineering the genome in diverse organisms. As an RNA-guided DNA endonuclease, Cas9 can be easily programmed to target new sites by altering its guide RNA sequence, and its development as a tool has made sequence-specific gene editing several magnitudes easier. The nuclease-deactivated form of Cas9 further provides a versatile RNA-guided DNA-targeting platform for regulating and imaging the genome, as well as for rewriting the epigenetic status, all in a sequence-specific manner. With all of these advances, we have just begun to explore the possible applications of Cas9 in biomedical research and therapeutics. In this review, we describe the current models of Cas9 function and the structural and biochemical studies that support it. We focus on the applications of Cas9 for genome editing, regulation, and imaging, discuss other possible applications and some technical considerations, and highlight the many advantages that CRISPR/Cas9 technology offers.

Structural and functional insights into the interaction between the Cas family scaffolding protein p130Cas and the focal adhesion-associated protein paxillin

DOE Office of Scientific and Technical Information (OSTI.GOV)

Zhang, Chi; Miller, Darcie J.; Guibao, Cristina D.

The Cas family scaffolding protein p130Cas is a Src substrate localized in focal adhesions (FAs) and functions in integrin signaling to promote cell motility, invasion, proliferation, and survival. p130Cas targeting to FAs is essential for its tyrosine phosphorylation and downstream signaling. Although the N-terminal SH3 domain is important for p130Cas localization, it has also been reported that the C-terminal region is involved in p130Cas FA targeting. The C-terminal region of p130Cas or Cas family homology domain (CCHD) has been reported to adopt a structure similar to that of the focal adhesion kinase C-terminal focal adhesion-targeting domain. The mechanism by whichmore » the CCHD promotes FA targeting of p130Cas, however, remains unclear. In this study, using a calorimetry approach, we identified the first LD motif (LD1) of the FA-associated protein paxillin as the binding partner of the p130Cas CCHD (in a 1:1 stoichiometry with a Kd ~4.2 μM) and elucidated the structure of the p130Cas CCHD in complex with the paxillin LD1 motif by X-ray crystallography. Of note, a comparison of the CCHD/LD1 complex with a previously solved structure of CCHD in complex with the SH2-containing protein NSP3 revealed that LD1 had almost identical positioning of key hydrophobic and acidic residues relative to NSP3. Because paxillin is one of the key scaffold molecules in FAs, we propose that the interaction between the p130Cas CCHD and the LD1 motif of paxillin plays an important role in p130Cas FA targeting.« less

RNA-dependent RNA targeting by CRISPR-Cas9

PubMed Central

Strutt, Steven C; Torrez, Rachel M; Kaya, Emine; Negrete, Oscar A

2018-01-01

Double-stranded DNA (dsDNA) binding and cleavage by Cas9 is a hallmark of type II CRISPR-Cas bacterial adaptive immunity. All known Cas9 enzymes are thought to recognize DNA exclusively as a natural substrate, providing protection against DNA phage and plasmids. Here, we show that Cas9 enzymes from both subtypes II-A and II-C can recognize and cleave single-stranded RNA (ssRNA) by an RNA-guided mechanism that is independent of a protospacer-adjacent motif (PAM) sequence in the target RNA. RNA-guided RNA cleavage is programmable and site-specific, and we find that this activity can be exploited to reduce infection by single-stranded RNA phage in vivo. We also demonstrate that Cas9 can direct PAM-independent repression of gene expression in bacteria. These results indicate that a subset of Cas9 enzymes have the ability to act on both DNA and RNA target sequences, and suggest the potential for use in programmable RNA targeting applications. PMID:29303478

The Revolution Continues: Newly Discovered Systems Expand the CRISPR-Cas Toolkit.

PubMed

Murugan, Karthik; Babu, Kesavan; Sundaresan, Ramya; Rajan, Rakhi; Sashital, Dipali G

2017-10-05

CRISPR-Cas systems defend prokaryotes against bacteriophages and mobile genetic elements and serve as the basis for revolutionary tools for genetic engineering. Class 2 CRISPR-Cas systems use single Cas endonucleases paired with guide RNAs to cleave complementary nucleic acid targets, enabling programmable sequence-specific targeting with minimal machinery. Recent discoveries of previously unidentified CRISPR-Cas systems have uncovered a deep reservoir of potential biotechnological tools beyond the well-characterized Type II Cas9 systems. Here we review the current mechanistic understanding of newly discovered single-protein Cas endonucleases. Comparison of these Cas effectors reveals substantial mechanistic diversity, underscoring the phylogenetic divergence of related CRISPR-Cas systems. This diversity has enabled further expansion of CRISPR-Cas biotechnological toolkits, with wide-ranging applications from genome editing to diagnostic tools based on various Cas endonuclease activities. These advances highlight the exciting prospects for future tools based on the continually expanding set of CRISPR-Cas systems. Copyright © 2017 Elsevier Inc. All rights reserved.

Cas4-Dependent Prespacer Processing Ensures High-Fidelity Programming of CRISPR Arrays.

PubMed

Lee, Hayun; Zhou, Yi; Taylor, David W; Sashital, Dipali G

2018-04-05

CRISPR-Cas immune systems integrate short segments of foreign DNA as spacers into the host CRISPR locus to provide molecular memory of infection. Cas4 proteins are widespread in CRISPR-Cas systems and are thought to participate in spacer acquisition, although their exact function remains unknown. Here we show that Bacillus halodurans type I-C Cas4 is required for efficient prespacer processing prior to Cas1-Cas2-mediated integration. Cas4 interacts tightly with the Cas1 integrase, forming a heterohexameric complex containing two Cas1 dimers and two Cas4 subunits. In the presence of Cas1 and Cas2, Cas4 processes double-stranded substrates with long 3' overhangs through site-specific endonucleolytic cleavage. Cas4 recognizes PAM sequences within the prespacer and prevents integration of unprocessed prespacers, ensuring that only functional spacers will be integrated into the CRISPR array. Our results reveal the critical role of Cas4 in maintaining fidelity during CRISPR adaptation, providing a structural and mechanistic model for prespacer processing and integration. Copyright © 2018 Elsevier Inc. All rights reserved.

Les accidents aux AVK: étude rétrospective à propos de 30 cas

PubMed Central

Serghini, Issam; Aissaoui, Younés; Quamouss, Youssef; Sedikki, Rachid; Taj, Nourredine; Salim Alaoui, Jaafar; Zoubir, Mohamed; Boughanem, Mohamed

2012-01-01

Les accidents hémorragiques sous AVK (antivitamines K) sont la première cause d’hospitalisation iatrogène. Le but de cette étude est de ressortir les caractéristiques des patients présentant des accidents hémorragiques graves sous AVK et de mettre le point sur la prise en charge. Nous avons réalisé une étude rétrospective portant sur 30 malades, réalisée au service de réanimation de l’hôpital militaire Avicenne de Marrakech. L’âge moyen de nos patients est de 59, 6 avec un sexe ratio de 1,5 (18 femmes et 12 femmes). On note dans notre série le terrain multi-taré des patients sous AVK avec plusieurs antécédents en cause. La fibrillation auriculaire était la principale indication recensée. Plus que la moitié ne bénéficiaient pas d’une bonne surveillance biologique à base d’INR (international normalized ratio). Le saignement d’origine gastro-intestinal était le plus fréquent. La conduite était différente en fonction des cas mais axée sur l’arrêt des AVK, l’administration de vit K, la transfusion de culots globulaires et plasma frais congelé. Plus du quart des patients admis sont décédés. L’index de Landefeld s’est avéré utile, il permet de classer les patients selon le risque prédictif de saignement (élevé moyen ou faible), ce qui concordait avec les résultats de notre étude. Son importance est d’ autant plus qu’il est facile à mesurer et à appliquer par le médecin en ambulatoire et permet de définir les patients nécessitant une surveillance accrue. La polymédication et les antécédents de saignement digestif sont apparus comme facteur de risque de saignement sous AVK. La prévention de la survenue de ces accidents est le pilier de la prise en charge, d’où l’importance de l’information et de l’éducation des différents intervenants dans cette complication iatrogène potentiellement mortelle. PMID:22514758

Nucleosome breathing and remodeling constrain CRISPR-Cas9 function

PubMed Central

Isaac, R Stefan; Jiang, Fuguo; Doudna, Jennifer A; Lim, Wendell A; Narlikar, Geeta J; Almeida, Ricardo

2016-01-01

The CRISPR-Cas9 bacterial surveillance system has become a versatile tool for genome editing and gene regulation in eukaryotic cells, yet how CRISPR-Cas9 contends with the barriers presented by eukaryotic chromatin is poorly understood. Here we investigate how the smallest unit of chromatin, a nucleosome, constrains the activity of the CRISPR-Cas9 system. We find that nucleosomes assembled on native DNA sequences are permissive to Cas9 action. However, the accessibility of nucleosomal DNA to Cas9 is variable over several orders of magnitude depending on dynamic properties of the DNA sequence and the distance of the PAM site from the nucleosome dyad. We further find that chromatin remodeling enzymes stimulate Cas9 activity on nucleosomal templates. Our findings imply that the spontaneous breathing of nucleosomal DNA together with the action of chromatin remodelers allow Cas9 to effectively act on chromatin in vivo. DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.13450.001 PMID:27130520

CRISPR/Cas9 Based Genome Editing of Penicillium chrysogenum.

PubMed

Pohl, C; Kiel, J A K W; Driessen, A J M; Bovenberg, R A L; Nygård, Y

2016-07-15

CRISPR/Cas9 based systems have emerged as versatile platforms for precision genome editing in a wide range of organisms. Here we have developed powerful CRISPR/Cas9 tools for marker-based and marker-free genome modifications in Penicillium chrysogenum, a model filamentous fungus and industrially relevant cell factory. The developed CRISPR/Cas9 toolbox is highly flexible and allows editing of new targets with minimal cloning efforts. The Cas9 protein and the sgRNA can be either delivered during transformation, as preassembled CRISPR-Cas9 ribonucleoproteins (RNPs) or expressed from an AMA1 based plasmid within the cell. The direct delivery of the Cas9 protein with in vitro synthesized sgRNA to the cells allows for a transient method for genome engineering that may rapidly be applicable for other filamentous fungi. The expression of Cas9 from an AMA1 based vector was shown to be highly efficient for marker-free gene deletions.

Evaluation du niveau de connaissance des patients sur la gestion du traitement par les antis vitamines K dans le service de cardiologie de Ouagadougou

PubMed Central

Samadoulougou, André; Temoua Naibe, Dangwé; Mandi, Germain; Yameogo, Relwendé Aristide; Kabore, Elisé; Millogo, Georges; Yameogo, Nobila Valentin; Kologo, Jonas Koudougou; Thiam/Tall, Anna; Toguyeni, Boubacar Jean Yves; Zabsonre, Patrice

2014-01-01

Introduction Les antivitamines K (AVK), traitement anticoagulant oral le plus largement prescrit, posent un réel problème de santé publique du fait de leur risque iatrogène. L'objectif de cette étude était de préciser le niveau de connaissance des patients sur la gestion de leur traitement par les AVK. Méthodes Il s'est agi d'une enquête transversale descriptive réalisée au CHU-Yalgado Ouédraogo, sur une période de 03 mois : du 1er mars au 31 mai 2012. Un questionnaire a été administré aux patients bénéficiant d'un traitement AVK depuis au moins un mois. Résultats Soixante-dix patients ont été inclus dans l'étude dont 30 hommes. L'âge moyen était de 49 ans ± 16 ans. Les cardiopathies et la maladie thromboembolique veineuse justifiant l'institution du traitement AVK étaient retrouvées respectivement dans 58,6% et 41,4% des cas. Le nom de l'AVK et la raison exacte du traitement étaient connus respectivement dans 91,4% et 67,1% des cas. Plus de la moitié des patients (68,6%) savaient que les AVK rendaient le sang plus fluide. Quarante-six patients (65,7%) citaient l'INR comme examen biologique de surveillance du traitement et seulement 28 patients (40%) connaissaient les valeurs cibles. La majorité des patients ne connaissait pas les risques encourus en cas de surdosage (72,8%) et de sous-dosage (71,4%). Une automédication par anti-inflammatoire non stéroïdien était signalée par 18 patients (25,7%). Les choux (74,3%) et la laitue (62,9%), aliments à consommer avec modération, étaient les plus cités. Conclusion Les connaissances des patients sur la gestion des AVK étaient fragmentaires et insuffisantes pour assurer la sécurité et l'efficacité du traitement. La création d'un programme d'éducation thérapeutique sur les AVK s'avère alors nécessaire. PMID:25870741

Single-stranded DNA cleavage by divergent CRISPR-Cas9 enzymes

PubMed Central

Ma, Enbo; Harrington, Lucas B.; O’Connell, Mitchell R.; Zhou, Kaihong; Doudna, Jennifer A.

2015-01-01

Summary Double-stranded DNA (dsDNA) cleavage by Cas9 is a hallmark of type II CRISPR-Cas immune systems. Cas9–guide RNA complexes recognize 20-base-pair sequences in DNA and generate a site-specific double-strand break, a robust activity harnessed for genome editing. DNA recognition by all studied Cas9 enzymes requires a protospacer adjacent motif (PAM) next to the target site. We show that Cas9 enzymes from evolutionarily divergent bacteria can recognize and cleave single-stranded DNA (ssDNA) by an RNA-guided, PAM-independent recognition mechanism. Comparative analysis shows that in contrast to the type II-A S. pyogenes Cas9 that is widely used for genome engineering, the smaller type II-C Cas9 proteins have limited dsDNA binding and unwinding activity and promiscuous guide-RNA specificity. These results indicate that inefficiency of type II-C Cas9 enzymes for genome editing results from a limited ability to cleave dsDNA, and suggest that ssDNA cleavage was an ancestral function of the Cas9 enzyme family. PMID:26545076

Torsion d'annexe en cours de grossesse: à propos d'un cas à l'Hôpital Central de Yaoundé, Cameroun

PubMed Central

Fouedjio, Jeanne Hortence; Fouogue, Jovanny Tsuala; Fouelifack, Florent Ymele; Nangue, Charlette; Sando, Zacharie; Enow Mbu, Robinson

2014-01-01

Les kystes ovariens sont dans la majorité des cas asymptomatiques et peuvent être de découverte fortuite lors d'une échographie. Ils ne deviennent symptomatiques que lorsque survient une complication. Nous présentons un cas de torsion d'annexe gauche diagnostiqué à 8 semaines et 4 jours de grossesse. Nous avons réalisé une annexectomie Suivie de l'administration de progestérone retard à la dose 500 mg par jour. L'évolution a été marquée par la survenue d'un avortement au cinquième jour post opératoire. L'analyse anatomopathologique de la masse chirurgicale a conclu à une apoplexie ovarienne. L'ablation chirurgicale du corps jaune au premier trimestre de la grossesse pose le problème du maintien de celle - ci et devrait être présente à l'esprit des praticiens avant toute chirurgie pelvienne pendant cette période. PMID:24932350

Applications of 3D orbital computer-assisted surgery (CAS).

PubMed

Scolozzi, P

2017-09-01

The purpose of the present report is to describe the indications for use of 3D orbital computer-assisted surgery (CAS). We analyzed the clinical and radiological data of all patients with orbital deformities treated using intra-operative navigation and CAD/CAM techniques at the Hôpitaux Universitaires de Genève, Switzerland, between 2009 and 2016. We recorded age and gender, orbital deformity, technical and surgical procedure and postoperative complications. One hundred and three patients were included. Mean age was 39.5years (range, 5 to 84years) and 85 (87.5%) were men. Of the 103 patients, 96 had intra-operative navigation (34 for primary and 3 for secondary orbito-zygomatic fractures, 15 for Le Fort fractures, 16 for orbital floor fractures, 10 for combined orbital floor and medial wall fractures, 7 for orbital medial wall fractures, 3 for NOE (naso-orbito-ethmoidal) fractures, 2 for isolated comminuted zygomatic arch fractures, 1 for enophthalmos, 3 for TMJ ankylosis and 2 for fibrous dysplasia bone recontouring), 8 patients had CAD/CAM PEEK-PSI for correction of residual orbital bone contour following craniomaxillofacial trauma, and 1 patient had CAD/CAM surgical splints and cutting guides for correction of orbital hypertelorism. Two patient (1.9%) required revision surgery for readjustment of an orbital mesh. The 1-year follow-up examination showed stable cosmetic and dimensional results in all patients. This study demonstrated that the application of 3D orbital CAS with regards to intra-operative navigation and CAD/CAM techniques allowed for a successful outcome in the patients presented in this series. Copyright © 2017 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.

Application of CRISPR/Cas9 in plant biology.

PubMed

Liu, Xuan; Wu, Surui; Xu, Jiao; Sui, Chun; Wei, Jianhe

2017-05-01

The CRISPR/Cas (clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated proteins) system was first identified in bacteria and archaea and can degrade exogenous substrates. It was developed as a gene editing technology in 2013. Over the subsequent years, it has received extensive attention owing to its easy manipulation, high efficiency, and wide application in gene mutation and transcriptional regulation in mammals and plants. The process of CRISPR/Cas is optimized constantly and its application has also expanded dramatically. Therefore, CRISPR/Cas is considered a revolutionary technology in plant biology. Here, we introduce the mechanism of the type II CRISPR/Cas called CRISPR/Cas9, update its recent advances in various applications in plants, and discuss its future prospects to provide an argument for its use in the study of medicinal plants.

Les traces matérielles de la Carte du Ciel. Le cas des observatoires d'Alger et de Bordeaux.

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Le Guet Tully, F.; Davoigneau, J.; Lamy, J.; de La Noë, J.; Rousseau, J.-M.; Sadsaoud, H.

2008-06-01

Le chapitre évoque les traces matérielles de la Carte du ciel subsistant dans les observatoires d'Alger et de Bordeaux. Les auteurs examinent d'abord l'opération d'inventaire du patrimoine astronomique entreprise à partir du milieu des années 1990. Ils examinent ensuite les éléments concrets constituant aujourd'hui le patrimoine de la Carte du Ciel : lunettes, abris, accessoires, laboratoires, réseaux, plaques de verre, registres, machines à mesurer les clichés, et cartes.

CRISPR-Cas Genome Surgery in Ophthalmology

PubMed Central

DiCarlo, James E.; Sengillo, Jesse D.; Justus, Sally; Cabral, Thiago; Tsang, Stephen H.; Mahajan, Vinit B.

2017-01-01

Genetic disease affecting vision can significantly impact patient quality of life. Gene therapy seeks to slow the progression of these diseases by treating the underlying etiology at the level of the genome. Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) and CRISPR-associated systems (Cas) represent powerful tools for studying diseases through the creation of model organisms generated by targeted modification and by the correction of disease mutations for therapeutic purposes. CRISPR-Cas systems have been applied successfully to the visual sciences and study of ophthalmic disease – from the modification of zebrafish and mammalian models of eye development and disease, to the correction of pathogenic mutations in patient-derived stem cells. Recent advances in CRISPR-Cas delivery and optimization boast improved functionality that continues to enhance genome-engineering applications in the eye. This review provides a synopsis of the recent implementations of CRISPR-Cas tools in the field of ophthalmology. PMID:28573077

Le syndrome du canal d’Alcock ou névralgie pudendale : un diagnostic à ne pas méconnaître

PubMed Central

Ziouziou, Imad; Bennani, Hassan; Zizi, Mohamed; Karmouni, Tarik; Khader, Khalid El; Koutani, Abdellatif; Andaloussi, Ahmed Iben Attya

2013-01-01

Résumé Le syndrome du canal d’Alcock – ou névralgie pudendale – est lié à la compression chronique du nerf pudendal dans la fossette ischiorectale ou au niveau du ligament sacroépineux. Le diagnostic du syndrome d’Alcock est surtout clinique. Les examens complémentaires sont dominés par les explorations électrophysiologiques et le test de bloc anesthésique. Le diagnostic repose sur des critères bien précis, soit les critères de Nantes. La prise en charge doit être globale, comprenant un traitement médicamenteux, des infiltrations, des techniques de neuromodulation, et dans les cas graves ou résistants, un traitement chirurgical qui consiste à libérer le nerf pudendal. Les névralgies pudendales peuvent être rencontrées après traitement d’une incontinence urinaire d’effort par bande-lettes sous-urétrales (TVT). Ce syndrome motive des consultations en urologie, car la douleur intéresse le territoire du périnée et des organes génitaux. Des signes urinaires peuvent aussi accompagner cette douleur. Il est donc judicieux de connaître cette pathologie. PMID:23914265

RNA-dependent RNA targeting by CRISPR-Cas9

DOE Office of Scientific and Technical Information (OSTI.GOV)

Strutt, Steven C.; Torrez, Rachel M.; Kaya, Emine

Double-stranded DNA (dsDNA) binding and cleavage by Cas9 is a hallmark of type II CRISPR-Cas bacterial adaptive immunity. All known Cas9 enzymes are thought to recognize DNA exclusively as a natural substrate, providing protection against DNA phage and plasmids. Here, we show that Cas9 enzymes from both subtypes II-A and II-C can recognize and cleave single-stranded RNA (ssRNA) by an RNA-guided mechanism that is independent of a protospacer-adjacent motif (PAM) sequence in the target RNA. RNA-guided RNA cleavage is programmable and site-specific, and we find that this activity can be exploited to reduce infection by single-stranded RNA phage in vivo.more » We also demonstrate that Cas9 can direct PAM-independent repression of gene expression in bacteria. In conclusion, these results indicate that a subset of Cas9 enzymes have the ability to act on both DNA and RNA target sequences, and suggest the potential for use in programmable RNA targeting applications.« less

RNA-dependent RNA targeting by CRISPR-Cas9

DOE PAGES

Strutt, Steven C.; Torrez, Rachel M.; Kaya, Emine; ...

2018-01-05

Double-stranded DNA (dsDNA) binding and cleavage by Cas9 is a hallmark of type II CRISPR-Cas bacterial adaptive immunity. All known Cas9 enzymes are thought to recognize DNA exclusively as a natural substrate, providing protection against DNA phage and plasmids. Here, we show that Cas9 enzymes from both subtypes II-A and II-C can recognize and cleave single-stranded RNA (ssRNA) by an RNA-guided mechanism that is independent of a protospacer-adjacent motif (PAM) sequence in the target RNA. RNA-guided RNA cleavage is programmable and site-specific, and we find that this activity can be exploited to reduce infection by single-stranded RNA phage in vivo.more » We also demonstrate that Cas9 can direct PAM-independent repression of gene expression in bacteria. In conclusion, these results indicate that a subset of Cas9 enzymes have the ability to act on both DNA and RNA target sequences, and suggest the potential for use in programmable RNA targeting applications.« less

Editing plants for virus resistance using CRISPR-Cas.

PubMed

Green, J C; Hu, J S

This minireview summarizes recent advancements using the clustered regularly interspaced palindromic repeats-associated nuclease systems (CRISPR-Cas) derived from prokaryotes to breed plants resistant to DNA and RNA viruses. The CRISPR-Cas system represents a powerful tool able to edit and insert novel traits into plants precisely at chosen loci offering enormous advantages to classical breeding. Approaches to engineering plant virus resistance in both transgenic and non-transgenic plants are discussed. Iterations of the CRISPR-Cas system, FnCas9 and C2c2 capable of editing RNA in eukaryotic cells offer a particular advantage for providing resistance to RNA viruses which represent the great majority of known plant viruses. Scientists have obtained conflicting results using gene silencing technology to produce transgenic plants resistant to geminiviruses. CRISPR-Cas systems engineered in plants to target geminiviruses have consistently reduced virus accumulation providing increased resistance to virus infection. CRISPR-Cas may provide novel and reliable approaches to control geminiviruses and other ssDNA viruses such as Banana bunchy top virus (BBTV).

Versatile High-Throughput Fluorescence Assay for Monitoring Cas9 Activity.

PubMed

Seamon, Kyle J; Light, Yooli K; Saada, Edwin A; Schoeniger, Joseph S; Harmon, Brooke

2018-06-05

The RNA-guided DNA nuclease Cas9 is now widely used for the targeted modification of genomes of human cells and various organisms. Despite the extensive use of Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats (CRISPR) systems for genome engineering and the rapid discovery and engineering of new CRISPR-associated nucleases, there are no high-throughput assays for measuring enzymatic activity. The current laboratory and future therapeutic uses of CRISPR technology have a significant risk of accidental exposure or clinical off-target effects, underscoring the need for therapeutically effective inhibitors of Cas9. Here, we develop a fluorescence assay for monitoring Cas9 nuclease activity and demonstrate its utility with S. pyogenes (Spy), S. aureus (Sau), and C. jejuni (Cje) Cas9. The assay was validated by quantitatively profiling the species specificity of published anti-CRISPR (Acr) proteins, confirming the reported inhibition of Spy Cas9 by AcrIIA4 and Cje Cas9 by AcrIIC1 and no inhibition of Sau Cas9 by either anti-CRISPR. To identify drug-like inhibitors, we performed a screen of 189 606 small molecules for inhibition of Spy Cas9. Of 437 hits (0.2% hit rate), six were confirmed as Cas9 inhibitors in a direct gel electrophoresis secondary assay. The high-throughput nature of this assay makes it broadly applicable for the discovery of additional Cas9 inhibitors or the characterization of Cas9 enzyme variants.

Versatile High-Throughput Fluorescence Assay for Monitoring Cas9 Activity

DOE Office of Scientific and Technical Information (OSTI.GOV)

Seamon, Kyle Jeffrey; Light, Yooli Kim; Saada, Edwin A.

Here, the RNA-guided DNA nuclease Cas9 is now widely used for the targeted modification of genomes of human cells and various organisms. Despite the extensive use of Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats (CRISPR) systems for genome engineering and the rapid discovery and engineering of new CRISPR-associated nucleases, there are no high-throughput assays for measuring enzymatic activity. The current laboratory and future therapeutic uses of CRISPR technology have a significant risk of accidental exposure or clinical off-target effects, underscoring the need for therapeutically effective inhibitors of Cas9. Here, we develop a fluorescence assay for monitoring Cas9 nuclease activity and demonstrate itsmore » utility with S. pyogenes (Spy), S. aureus (Sau), and C. jejuni (Cje) Cas9. The assay was validated by quantitatively profiling the species specificity of published anti-CRISPR (Acr) proteins, confirming the reported inhibition of Spy Cas9 by AcrIIA4 and Cje Cas9 by AcrIIC1 and no inhibition of Sau Cas9 by either anti-CRISPR. To identify drug-like inhibitors, we performed a screen of 189 606 small molecules for inhibition of Spy Cas9. Of 437 hits (0.2% hit rate), six were confirmed as Cas9 inhibitors in a direct gel electrophoresis secondary assay. The high-throughput nature of this assay makes it broadly applicable for the discovery of additional Cas9 inhibitors or the characterization of Cas9 enzyme variants.« less

Versatile High-Throughput Fluorescence Assay for Monitoring Cas9 Activity

DOE PAGES

Seamon, Kyle Jeffrey; Light, Yooli Kim; Saada, Edwin A.; ...

2018-05-14

Here, the RNA-guided DNA nuclease Cas9 is now widely used for the targeted modification of genomes of human cells and various organisms. Despite the extensive use of Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats (CRISPR) systems for genome engineering and the rapid discovery and engineering of new CRISPR-associated nucleases, there are no high-throughput assays for measuring enzymatic activity. The current laboratory and future therapeutic uses of CRISPR technology have a significant risk of accidental exposure or clinical off-target effects, underscoring the need for therapeutically effective inhibitors of Cas9. Here, we develop a fluorescence assay for monitoring Cas9 nuclease activity and demonstrate itsmore » utility with S. pyogenes (Spy), S. aureus (Sau), and C. jejuni (Cje) Cas9. The assay was validated by quantitatively profiling the species specificity of published anti-CRISPR (Acr) proteins, confirming the reported inhibition of Spy Cas9 by AcrIIA4 and Cje Cas9 by AcrIIC1 and no inhibition of Sau Cas9 by either anti-CRISPR. To identify drug-like inhibitors, we performed a screen of 189 606 small molecules for inhibition of Spy Cas9. Of 437 hits (0.2% hit rate), six were confirmed as Cas9 inhibitors in a direct gel electrophoresis secondary assay. The high-throughput nature of this assay makes it broadly applicable for the discovery of additional Cas9 inhibitors or the characterization of Cas9 enzyme variants.« less

Les psychoses de l’épileptique: approche clinique à propos d'un cas

PubMed Central

Charfi, Nada; Trigui, Dorsaf; Ben Thabet, Jihène; Zouari, Nasreddine; Zouari, Lobna; Maalej, Mohamed

2014-01-01

Pour discuter les liens entre épilepsie et psychose, les auteurs rapportent l'observation d'une fille âgée de 22 ans, traitée pour épilepsie fronto-temporale, adressée en psychiatrie pour des hallucinations sensorielles et cénesthésiques et un délire mystique et d'influence, apparus secondairement et non améliorés par le traitement antiépileptique. Les symptômes psychotiques, chez l’épileptique, peuvent entrer dans le cadre de psychoses intercritiques, post-critiques ou alternatives. Pour le cas rapporté, les symptômes psychotiques étaient intercritiques et chroniques. Il s'agissait vraisemblablement d'une psychose schizophréniforme. Dans ce type de psychose, une indifférence affective et une restriction des activités sont rarement rencontrés, alors que les fluctuations rapides de l'humeur sont fréquentes. Les thématiques délirantes sont assez souvent mystiques, alimentées par des hallucinations auditives et par des hallucinations visuelles inhabituelles. Les troubles négatifs sont rares. Les psychoses épileptiques n'ont pas été identifiées comme des entités nosographiques dans les systèmes de classification psychiatrique (DSM-IV et CIM-10), ce qui pose un problème de reconnaissance de ces troubles. Une collaboration entre psychiatre et neurologue devient ainsi nécessaire pour mieux comprendre cette comorbidité complexe, éviter les erreurs diagnostiques et optimiser la prise en charge. PMID:25309665

Programmable RNA recognition and cleavage by CRISPR/Cas9.

PubMed

O'Connell, Mitchell R; Oakes, Benjamin L; Sternberg, Samuel H; East-Seletsky, Alexandra; Kaplan, Matias; Doudna, Jennifer A

2014-12-11

The CRISPR-associated protein Cas9 is an RNA-guided DNA endonuclease that uses RNA-DNA complementarity to identify target sites for sequence-specific double-stranded DNA (dsDNA) cleavage. In its native context, Cas9 acts on DNA substrates exclusively because both binding and catalysis require recognition of a short DNA sequence, known as the protospacer adjacent motif (PAM), next to and on the strand opposite the twenty-nucleotide target site in dsDNA. Cas9 has proven to be a versatile tool for genome engineering and gene regulation in a large range of prokaryotic and eukaryotic cell types, and in whole organisms, but it has been thought to be incapable of targeting RNA. Here we show that Cas9 binds with high affinity to single-stranded RNA (ssRNA) targets matching the Cas9-associated guide RNA sequence when the PAM is presented in trans as a separate DNA oligonucleotide. Furthermore, PAM-presenting oligonucleotides (PAMmers) stimulate site-specific endonucleolytic cleavage of ssRNA targets, similar to PAM-mediated stimulation of Cas9-catalysed DNA cleavage. Using specially designed PAMmers, Cas9 can be specifically directed to bind or cut RNA targets while avoiding corresponding DNA sequences, and we demonstrate that this strategy enables the isolation of a specific endogenous messenger RNA from cells. These results reveal a fundamental connection between PAM binding and substrate selection by Cas9, and highlight the utility of Cas9 for programmable transcript recognition without the need for tags.

Programmable RNA recognition and cleavage by CRISPR/Cas9

PubMed Central

O’Connell, Mitchell R.; Oakes, Benjamin L.; Sternberg, Samuel H.; East-Seletsky, Alexandra; Kaplan, Matias; Doudna, Jennifer A.

2014-01-01

The CRISPR-associated protein Cas9 is an RNA-guided DNA endonuclease that uses RNA:DNA complementarity to identify target sites for sequence-specific doublestranded DNA (dsDNA) cleavage1-5. In its native context, Cas9 acts on DNA substrates exclusively because both binding and catalysis require recognition of a short DNA sequence, the protospacer adjacent motif (PAM), next to and on the strand opposite the 20-nucleotide target site in dsDNA4-7. Cas9 has proven to be a versatile tool for genome engineering and gene regulation in many cell types and organisms8, but it has been thought to be incapable of targeting RNA5. Here we show that Cas9 binds with high affinity to single-stranded RNA (ssRNA) targets matching the Cas9-associated guide RNA sequence when the PAM is presented in trans as a separate DNA oligonucleotide. Furthermore, PAM-presenting oligonucleotides (PAMmers) stimulate site-specific endonucleolytic cleavage of ssRNA targets, similar to PAM-mediated stimulation of Cas9-catalyzed DNA cleavage7. Using specially designed PAMmers, Cas9 can be specifically directed to bind or cut RNA targets while avoiding corresponding DNA sequences, and we demonstrate that this strategy enables the isolation of a specific endogenous mRNA from cells. These results reveal a fundamental connection between PAM binding and substrate selection by Cas9, and highlight the utility of Cas9 for programmable and tagless transcript recognition. PMID:25274302

DNA targeting specificity of RNA-guided Cas9 nucleases.

PubMed

Hsu, Patrick D; Scott, David A; Weinstein, Joshua A; Ran, F Ann; Konermann, Silvana; Agarwala, Vineeta; Li, Yinqing; Fine, Eli J; Wu, Xuebing; Shalem, Ophir; Cradick, Thomas J; Marraffini, Luciano A; Bao, Gang; Zhang, Feng

2013-09-01

The Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9) nuclease can be efficiently targeted to genomic loci by means of single-guide RNAs (sgRNAs) to enable genome editing. Here, we characterize SpCas9 targeting specificity in human cells to inform the selection of target sites and avoid off-target effects. Our study evaluates >700 guide RNA variants and SpCas9-induced indel mutation levels at >100 predicted genomic off-target loci in 293T and 293FT cells. We find that SpCas9 tolerates mismatches between guide RNA and target DNA at different positions in a sequence-dependent manner, sensitive to the number, position and distribution of mismatches. We also show that SpCas9-mediated cleavage is unaffected by DNA methylation and that the dosage of SpCas9 and sgRNA can be titrated to minimize off-target modification. To facilitate mammalian genome engineering applications, we provide a web-based software tool to guide the selection and validation of target sequences as well as off-target analyses.

Genome Editing with CRISPR-Cas9: Can It Get Any Better?

PubMed Central

Haeussler, Maximilian; Concordet, Jean-Paul

2017-01-01

The CRISPR-Cas revolution is taking place in virtually all fields of life sciences. Harnessing DNA cleavage with the CRISPR-Cas9 system of Streptococcus pyogenes has proven to be extraordinarily simple and efficient, relying only on the design of a synthetic single guide RNA (sgRNA) and its co-expression with Cas9. Here, we review the progress in the design of sgRNA from the original dual RNA guide for S. pyogenes and Staphylococcus aureus Cas9 (SpCas9 and SaCas9). New assays for genome-wide identification of off-targets have provided important insights into the issue of cleavage specificity in vivo. At the same time, the on-target activity of thousands of guides has been determined. These data have led to numerous online tools that facilitate the selection of guide RNAs in target sequences. It appears that for most basic research applications, cleavage activity can be maximized and off-targets minimized by carefully choosing guide RNAs based on computational predictions. Moreover, recent studies of Cas proteins have further improved the flexibility and precision of the CRISPR-Cas toolkit for genome editing. Inspired by the crystal structure of the complex of sgRNA-SpCas9 bound to target DNA, several variants of SpCas9 have recently been engineered, either with novel protospacer adjacent motifs (PAMs) or with drastically reduced off-targets. Novel Cas9 and Cas9-like proteins called Cpf1 have also been characterized from other bacteria and will benefit from the insights obtained from SpCas9. Genome editing with CRISPR-Cas9 may also progress with better understanding and control of cellular DNA repair pathways activated after Cas9-induced DNA cleavage. PMID:27210042

Genome Editing with CRISPR-Cas9: Can It Get Any Better?

PubMed

Haeussler, Maximilian; Concordet, Jean-Paul

2016-05-20

The CRISPR-Cas revolution is taking place in virtually all fields of life sciences. Harnessing DNA cleavage with the CRISPR-Cas9 system of Streptococcus pyogenes has proven to be extraordinarily simple and efficient, relying only on the design of a synthetic single guide RNA (sgRNA) and its co-expression with Cas9. Here, we review the progress in the design of sgRNA from the original dual RNA guide for S. pyogenes and Staphylococcus aureus Cas9 (SpCas9 and SaCas9). New assays for genome-wide identification of off-targets have provided important insights into the issue of cleavage specificity in vivo. At the same time, the on-target activity of thousands of guides has been determined. These data have led to numerous online tools that facilitate the selection of guide RNAs in target sequences. It appears that for most basic research applications, cleavage activity can be maximized and off-targets minimized by carefully choosing guide RNAs based on computational predictions. Moreover, recent studies of Cas proteins have further improved the flexibility and precision of the CRISPR-Cas toolkit for genome editing. Inspired by the crystal structure of the complex of sgRNA-SpCas9 bound to target DNA, several variants of SpCas9 have recently been engineered, either with novel protospacer adjacent motifs (PAMs) or with drastically reduced off-targets. Novel Cas9 and Cas9-like proteins called Cpf1 have also been characterized from other bacteria and will benefit from the insights obtained from SpCas9. Genome editing with CRISPR-Cas9 may also progress with better understanding and control of cellular DNA repair pathways activated after Cas9-induced DNA cleavage. Copyright © 2016 Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, and Genetics Society of China. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.

Multidrug-resistant enterococci lack CRISPR-cas.

PubMed

Palmer, Kelli L; Gilmore, Michael S

2010-10-12

Clustered, regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) provide bacteria and archaea with sequence-specific, acquired defense against plasmids and phage. Because mobile elements constitute up to 25% of the genome of multidrug-resistant (MDR) enterococci, it was of interest to examine the codistribution of CRISPR and acquired antibiotic resistance in enterococcal lineages. A database was built from 16 Enterococcus faecalis draft genome sequences to identify commonalities and polymorphisms in the location and content of CRISPR loci. With this data set, we were able to detect identities between CRISPR spacers and sequences from mobile elements, including pheromone-responsive plasmids and phage, suggesting that CRISPR regulates the flux of these elements through the E. faecalis species. Based on conserved locations of CRISPR and CRISPR-cas loci and the discovery of a new CRISPR locus with associated functional genes, CRISPR3-cas, we screened additional E. faecalis strains for CRISPR content, including isolates predating the use of antibiotics. We found a highly significant inverse correlation between the presence of a CRISPR-cas locus and acquired antibiotic resistance in E. faecalis, and examination of an additional eight E. faecium genomes yielded similar results for that species. A mechanism for CRISPR-cas loss in E. faecalis was identified. The inverse relationship between CRISPR-cas and antibiotic resistance suggests that antibiotic use inadvertently selects for enterococcal strains with compromised genome defense.

Méningiome en plaque sphéno-orbitaire: à propos d'un cas avec revue de la littérature

PubMed Central

Abdellaoui, Meriem; Andaloussi, Idriss Benatiya; Tahri, Hicham

2015-01-01

Le méningiome intra osseux est une variété des méningiomes ectopiques dans lequel les cellules méningothéliales envahissent la paroi osseuse et entraînent une hyperostose. Le méningiome en plaque, variante macroscopique des méningiomes intra osseux, est une tumeur rare et survient fréquemment au niveau de la région sphéno-orbitaire ce qui le confond avec les tumeurs osseuses primitives. Nous rapportons le cas d'une patiente de 50 ans qui présente une exophtalmie avec cécité unilatérale gauche d'installation progressive depuis un an. L'examen trouve une exophtalmie axile, indolore et non réductible ainsi qu'une limitation de la motilité oculaire dans tous les sens du regard. La palpation montre une masse temporale gauche dure et adhérente à l'os. L'examen du fond d’œil trouve un œdème papillaire gauche. Le scanner montre une lésion ostéocondensante temporo-sphéno-orbitaire gauche avec envahissement locorégional. Le diagnostic préopératoire fut une tumeur osseuse essentiellement maligne primitive ou secondaire. L’étude histologique a révélée un méningiome meningothélial de type en plaque. La patiente a bénéficié d'une exérèse avec reconstruction chirurgicale. Aucune récidive n'a été notée après 1 an de recul. PMID:26327996

Histoire d’un itinéraire épidémiologique entre le Burkina Faso et la Côte d’Ivoire : le cas des foyers de maladie du sommeil de Koudougou

PubMed Central

Kiendrébéogo, D.; Kambiré, R.; Jamonneau, V.; Lingué, K.; Solano, P.; Courtin, F.

2012-01-01

Dans la première moitié du XXème siècle, alors que la Haute-Volta (actuel Burkina Faso) subissait une terrible épidémie de maladie du sommeil, l’administration coloniale française a orchestré des déplacements massifs de populations de la Haute-Volta vers la Côte d’Ivoire, pour exploiter le territoire. Cela a conduit à la mise en place de villages de colonisation Mossi en zone forestière ivoirienne, comme ceux de Koudougou, issus de l’une des régions les plus peuplées de Haute-Volta, mais aussi l’une des plus touchées par la maladie du sommeil. Depuis 2000, au Burkina Faso, c’est dans le district sanitaire de Koudougou que sont dépistés passivement le plus grand nombre de trypanosomés en provenance de Côte d’Ivoire. Qui sont-ils ? Où habitent-ils au Burkina Faso ? D’où viennent-ils de Côte d’Ivoire ? Après avoir retracé l’histoire épidémiologique des villages de Koudougou au Burkina Faso et en Côte d’Ivoire, nous avons recherché les trypanosomés dépistés passivement depuis 2000 dans le district sanitaire de Koudougou au Burkina Faso. Au total, dix trypanosomés ont été enquêtés. Le processus de propagation de la maladie du sommeil dans l’espace ivoiro-burkinabé a été mis en évidence et des zones à risque de la maladie identifiées dans ce même espace. PMID:23193525

The role of Cas8 in type I CRISPR interference.

PubMed

Cass, Simon D B; Haas, Karina A; Stoll, Britta; Alkhnbashi, Omer S; Sharma, Kundan; Urlaub, Henning; Backofen, Rolf; Marchfelder, Anita; Bolt, Edward L

2015-05-05

CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat) systems provide bacteria and archaea with adaptive immunity to repel invasive genetic elements. Type I systems use 'cascade' [CRISPR-associated (Cas) complex for antiviral defence] ribonucleoprotein complexes to target invader DNA, by base pairing CRISPR RNA (crRNA) to protospacers. Cascade identifies PAMs (protospacer adjacent motifs) on invader DNA, triggering R-loop formation and subsequent DNA degradation by Cas3. Cas8 is a candidate PAM recognition factor in some cascades. We analysed Cas8 homologues from type IB CRISPR systems in archaea Haloferax volcanii (Hvo) and Methanothermobacter thermautotrophicus (Mth). Cas8 was essential for CRISPR interference in Hvo and purified Mth Cas8 protein responded to PAM sequence when binding to nucleic acids. Cas8 interacted physically with Cas5-Cas7-crRNA complex, stimulating binding to PAM containing substrates. Mutation of conserved Cas8 amino acid residues abolished interference in vivo and altered catalytic activity of Cas8 protein in vitro. This is experimental evidence that Cas8 is important for targeting Cascade to invader DNA. © 2015 Authors.

Exploiting CRISPR-Cas to manipulate Enterococcus faecalis populations.

PubMed

Hullahalli, Karthik; Rodrigues, Marinelle; Palmer, Kelli L

2017-06-23

CRISPR-Cas provides a barrier to horizontal gene transfer in prokaryotes. It was previously observed that functional CRISPR-Cas systems are absent from multidrug-resistant (MDR) Enterococcus faecalis , which only possess an orphan CRISPR locus, termed CRISPR2, lacking cas genes. Here, we investigate how the interplay between CRISPR-Cas genome defense and antibiotic selection for mobile genetic elements shapes in vitro E. faecalis populations. We demonstrate that CRISPR2 can be reactivated for genome defense in MDR strains. Interestingly, we observe that E. faecalis transiently maintains CRISPR targets despite active CRISPR-Cas systems. Subsequently, if selection for the CRISPR target is present, toxic CRISPR spacers are lost over time, while in the absence of selection, CRISPR targets are lost over time. We find that forced maintenance of CRISPR targets induces a fitness cost that can be exploited to alter heterogeneous E. faecalis populations.

Kyste épidermoïde du quatrième ventricule: à propos d’un cas

PubMed Central

El Saqui, Abderrazzak; Aggouri, Mohamed; Benzagmout, Mohamed; Chakour, Khalid; Chaoui, Mohamed El Faiz

2017-01-01

Les kystes épidermoïdes sont des tumeurs bénignes rares développées à partir d'inclusions ectodermiques. Ils siègent habituellement au niveau de l'angle ponto-cérébelleux, la région para-sellaire et la fosse temporale. Leur siège au niveau du quatrième ventricule est exceptionnel. Nous rapportons le cas d'une patiente de 47 ans admise pour un syndrome d'hypertension intracrânienne associé à des troubles de la marche. Le diagnostic de kyste épidermoïde du V4 fut évoqué sur les données de l'IRM en séquences de diffusion puis confirmé en per opératoire et en histologie. L'exérèse chirurgicale a été subtotale en raison d'une adhérence de la capsule à la partie supérieure du plancher du V4. Après un recul de 36 mois, la patiente ne manifeste aucun signe de ré-évolution tumorale. PMID:28690753

48 CFR 9903.201-2 - Types of CAS coverage.

Code of Federal Regulations, 2010 CFR

2010-10-01

.... 9903.201-2 Section 9903.201-2 Federal Acquisition Regulations System COST ACCOUNTING STANDARDS BOARD... ACCOUNTING STANDARDS CONTRACT COVERAGE CAS Program Requirements 9903.201-2 Types of CAS coverage. (a) Full... net CAS-covered awards during its preceding cost accounting period. (b) Modified coverage. (1...

NSP-CAS Protein Complexes: Emerging Signaling Modules in Cancer.

PubMed

Wallez, Yann; Mace, Peter D; Pasquale, Elena B; Riedl, Stefan J

2012-05-01

The CAS (CRK-associated substrate) family of adaptor proteins comprises 4 members, which share a conserved modular domain structure that enables multiple protein-protein interactions, leading to the assembly of intracellular signaling platforms. Besides their physiological role in signal transduction downstream of a variety of cell surface receptors, CAS proteins are also critical for oncogenic transformation and cancer cell malignancy through associations with a variety of regulatory proteins and downstream effectors. Among the regulatory partners, the 3 recently identified adaptor proteins constituting the NSP (novel SH2-containing protein) family avidly bind to the conserved carboxy-terminal focal adhesion-targeting (FAT) domain of CAS proteins. NSP proteins use an anomalous nucleotide exchange factor domain that lacks catalytic activity to form NSP-CAS signaling modules. Additionally, the NSP SH2 domain can link NSP-CAS signaling assemblies to tyrosine-phosphorylated cell surface receptors. NSP proteins can potentiate CAS function by affecting key CAS attributes such as expression levels, phosphorylation state, and subcellular localization, leading to effects on cell adhesion, migration, and invasion as well as cell growth. The consequences of these activities are well exemplified by the role that members of both families play in promoting breast cancer cell invasiveness and resistance to antiestrogens. In this review, we discuss the intriguing interplay between the NSP and CAS families, with a particular focus on cancer signaling networks.

Optimization of genome editing through CRISPR-Cas9 engineering.

PubMed

Zhang, Jian-Hua; Adikaram, Poorni; Pandey, Mritunjay; Genis, Allison; Simonds, William F

2016-04-01

CRISPR (Clustered Regularly-Interspaced Short Palindromic Repeats)-Cas9 (CRISPR associated protein 9) has rapidly become the most promising genome editing tool with great potential to revolutionize medicine. Through guidance of a 20 nucleotide RNA (gRNA), CRISPR-Cas9 finds and cuts target protospacer DNA precisely 3 base pairs upstream of a PAM (Protospacer Adjacent Motif). The broken DNA ends are repaired by either NHEJ (Non-Homologous End Joining) resulting in small indels, or by HDR (Homology Directed Repair) for precise gene or nucleotide replacement. Theoretically, CRISPR-Cas9 could be used to modify any genomic sequences, thereby providing a simple, easy, and cost effective means of genome wide gene editing. However, the off-target activity of CRISPR-Cas9 that cuts DNA sites with imperfect matches with gRNA have been of significant concern because clinical applications require 100% accuracy. Additionally, CRISPR-Cas9 has unpredictable efficiency among different DNA target sites and the PAM requirements greatly restrict its genome editing frequency. A large number of efforts have been made to address these impeding issues, but much more is needed to fully realize the medical potential of CRISPR-Cas9. In this article, we summarize the existing problems and current advances of the CRISPR-Cas9 technology and provide perspectives for the ultimate perfection of Cas9-mediated genome editing.

Optimization of genome editing through CRISPR-Cas9 engineering

PubMed Central

Zhang, Jian-Hua; Adikaram, Poorni; Pandey, Mritunjay; Genis, Allison; Simonds, William F.

2016-01-01

ABSTRACT CRISPR (Clustered Regularly-Interspaced Short Palindromic Repeats)-Cas9 (CRISPR associated protein 9) has rapidly become the most promising genome editing tool with great potential to revolutionize medicine. Through guidance of a 20 nucleotide RNA (gRNA), CRISPR-Cas9 finds and cuts target protospacer DNA precisely 3 base pairs upstream of a PAM (Protospacer Adjacent Motif). The broken DNA ends are repaired by either NHEJ (Non-Homologous End Joining) resulting in small indels, or by HDR (Homology Directed Repair) for precise gene or nucleotide replacement. Theoretically, CRISPR-Cas9 could be used to modify any genomic sequences, thereby providing a simple, easy, and cost effective means of genome wide gene editing. However, the off-target activity of CRISPR-Cas9 that cuts DNA sites with imperfect matches with gRNA have been of significant concern because clinical applications require 100% accuracy. Additionally, CRISPR-Cas9 has unpredictable efficiency among different DNA target sites and the PAM requirements greatly restrict its genome editing frequency. A large number of efforts have been made to address these impeding issues, but much more is needed to fully realize the medical potential of CRISPR-Cas9. In this article, we summarize the existing problems and current advances of the CRISPR-Cas9 technology and provide perspectives for the ultimate perfection of Cas9-mediated genome editing. PMID:27340770

Control of gene expression by CRISPR-Cas systems

PubMed Central

2013-01-01

Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) loci and their associated cas (CRISPR-associated) genes provide adaptive immunity against viruses (phages) and other mobile genetic elements in bacteria and archaea. While most of the early work has largely been dominated by examples of CRISPR-Cas systems directing the cleavage of phage or plasmid DNA, recent studies have revealed a more complex landscape where CRISPR-Cas loci might be involved in gene regulation. In this review, we summarize the role of these loci in the regulation of gene expression as well as the recent development of synthetic gene regulation using engineered CRISPR-Cas systems. PMID:24273648

Editing Citrus Genome via SaCas9/sgRNA System

PubMed Central

Jia, Hongge; Xu, Jin; Orbović, Vladimir; Zhang, Yunzeng; Wang, Nian

2017-01-01

SaCas9/sgRNA, derived from Staphylococcus aureus, is an alternative system for genome editing to Streptococcus pyogenes SpCas9/sgRNA. The smaller SaCas9 recognizes a different protospacer adjacent motif (PAM) sequence from SpCas9. SaCas9/sgRNA has been employed to edit the genomes of Arabidopsis, tobacco and rice. In this study, we aimed to test its potential in genome editing of citrus. Transient expression of SaCas9/sgRNA in Duncan grapefruit via Xcc-facilitated agroinfiltration showed it can successfully modify CsPDS and Cs2g12470. Subsequently, binary vector GFP-p1380N-SaCas9/35S-sgRNA1:AtU6-sgRNA2 was developed to edit two target sites of Cs7g03360 in transgenic Carrizo citrange. Twelve GFP-positive Carrizo transformants were successfully established, designated as #Cz1 to #Cz12. Based on targeted next generation sequencing results, the mutation rates for the two targets ranged from 15.55 to 39.13% for sgRNA1 and 49.01 to 79.67% for sgRNA2. Therefore, SaCas9/sgRNA can be used as an alternative tool to SpCas9/sgRNA for citrus genome editing. PMID:29312390

Forme pseudotumorale de la tuberculose pulmonaire et les difficultés diagnostic: à propos d’un cas

PubMed Central

Ouarssani, Aziz; Atoini, Fouad; Reda, Rafik; Lhou, Fatima Ait; Rguibi, Mustapha Idrissi

2013-01-01

La tuberculose pulmonaire est un problème majeur de santé publique. Dans sa forme commune, le diagnostic est habituellement aisé, mais elle peut se présenter sous une forme trompeuse et entrainer un retard diagnostic et thérapeutique. Nous rapportons le cas d’un patient âgé de 25ans, étudiant, sans antécédents pathologiques particuliers, hospitalisé dans notre formation pour un syndrome bronchique trainant avec altération de l’état général. L’examen clinique pleuropulmonaire est normal, l’examen des aires ganglionnaires trouve une adénopathie sus claviculaire droite, la radiographie thoracique de face objective une opacité hilaire droite hétérogène à contours irréguliers, la TDM thoracique retrouve un processus lésionnel tissulaire du lobe supérieur droit qui s’étend vers le médiastin et englobe partiellement la veine cave supérieure avec une adénopathie latérotracheale droite nécrosée. La fibroscopie bronchique objective un élargissement des éperons intersegmentaires du lobe supérieur droit, les biopsies réalisées avec étude histologique sont non concluantes. Les recherches de BK dans les expectorations et dans le liquide d’aspiration bronchique sont negatives. L’IDR à la tuberculine est à 15mm. C’est la ponction transparietale scannoguidée avec étude anatomopathologique qui confirme le diagnostic de tuberculose caseofolliculaire. La sérologie VIH est négative. Le diagnostic de tuberculose pulmonaire pseudotumorale chez un immunocompétent a été retenu et le patient a été mis sous traitement antibacillaire (régime standard national Marocain) par rifampicine, isoniazide, pyrazinamide et éthambutol pendant 6 mois avec évolution clinique et radiologique favorable. La tuberculose pulmonaire ne cesse de tromper le clinicien par son polymorphisme clinique et radiologique, elle doit être évoquée devant toute atteinte pulmonaire d’allure tumorale pour permettre une prise en charge précoce de la

Ostéogenèse imparfaite: à propos de quatre cas à Ouagadougou (Burkina Faso)

PubMed Central

Kaboré, Aïssata; Cissé, Aissata; Yonaba, Caroline; Savadogo, Hamidou; Ouédraogo, Sylvie Armelle; Dao, Lassina; Kaboret, Sonia; Nagalo, Kisito; Koueta, Fla; Bandré, Emile; Yé, Diarra; Kam, Ludovic

2015-01-01

L'ostéogenèse imparfaite (OI) regroupe un ensemble d'affections constitutionnelles de gravité variable dû à une anomalie de la production du collagène et de la matrice de l'os entraînant une fragilité osseuse. La présente étude rapporte quatre cas d'ostéogenèse imparfaite suivis aux Centres Hospitaliers Universitaires Charles de Gaulle et Yalgado Ouédraogo. Le but de ce travail était d'analyser les aspects cliniques, thérapeutiques et évolutifs de la maladie. Cette étude souligne la nécessité d'améliorer la prise en charge de cette maladie rare mais non exceptionnelle et handicapante. PMID:26834922

Cas9 Variants Expand the Target Repertoire in Caenorhabditis elegans

PubMed Central

Bell, Ryan T.; Fu, Becky X. H.; Fire, Andrew Z.

2016-01-01

The proliferation of CRISPR/Cas9-based methods in Caenorhabditis elegans has enabled efficient genome editing and precise genomic tethering of Cas9 fusion proteins. Experimental designs using CRISPR/Cas9 are currently limited by the need for a protospacer adjacent motif (PAM) in the target with the sequence NGG. Here we report the characterization of two modified Cas9 proteins in C. elegans that recognize NGA and NGCG PAMs. We found that each variant could stimulate homologous recombination with a donor template at multiple loci and that PAM specificity was comparable to that of wild-type Cas9. To directly compare effectiveness, we used CRISPR/Cas9 genome editing to generate a set of assay strains with a common single-guide RNA (sgRNA) target sequence, but that differ in the juxtaposed PAM (NGG, NGA, or NGCG). In this controlled setting, we determined that the NGA PAM Cas9 variant can be as effective as wild-type Cas9. We similarly edited a genomic target to study the influence of the base following the NGA PAM. Using four strains with four NGAN PAMs differing only at the fourth position and adjacent to the same sgRNA target, we observed that efficient homologous replacement was attainable with any base in the fourth position, with an NGAG PAM being the most effective. In addition to demonstrating the utility of two Cas9 mutants in C. elegans and providing reagents that permit CRISPR/Cas9 experiments with fewer restrictions on potential targets, we established a means to benchmark the efficiency of different Cas9::PAM combinations that avoids variations owing to differences in the sgRNA sequence. PMID:26680661

Functional Insights Revealed by the Kinetic Mechanism of CRISPR/Cas9.

PubMed

Raper, Austin T; Stephenson, Anthony A; Suo, Zucai

2018-02-28

The discovery of prokaryotic adaptive immunity prompted widespread use of the RNA-guided clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)-associated (Cas) endonuclease Cas9 for genetic engineering. However, its kinetic mechanism remains undefined, and details of DNA cleavage are poorly characterized. Here, we establish a kinetic mechanism of Streptococcus pyogenes Cas9 from guide-RNA binding through DNA cleavage and product release. Association of DNA to the binary complex of Cas9 and guide-RNA is rate-limiting during the first catalytic turnover, while DNA cleavage from a pre-formed ternary complex of Cas9, guide-RNA, and DNA is rapid. Moreover, an extremely slow release of DNA products essentially restricts Cas9 to be a single-turnover enzyme. By simultaneously measuring the contributions of the HNH and RuvC nuclease activities of Cas9 to DNA cleavage, we also uncovered the kinetic basis by which HNH conformationally regulates the RuvC cleavage activity. Together, our results provide crucial kinetic and functional details regarding Cas9 which will inform gene-editing experiments, guide future research to understand off-target DNA cleavage by Cas9, and aid in the continued development of Cas9 as a biotechnological tool.

CRISPR/Cas9: Transcending the Reality of Genome Editing.

PubMed

Chira, Sergiu; Gulei, Diana; Hajitou, Amin; Zimta, Alina-Andreea; Cordelier, Pierre; Berindan-Neagoe, Ioana

2017-06-16

With the expansion of the microbiology field of research, a new genome editing tool arises from the biology of bacteria that holds the promise of achieving precise modifications in the genome with a simplicity and versatility that surpasses previous genome editing methods. This new technique, commonly named CRISPR/Cas9, led to a rapid expansion of the biomedical field; more specifically, cancer characterization and modeling have benefitted greatly from the genome editing capabilities of CRISPR/Cas9. In this paper, we briefly summarize recent improvements in CRISPR/Cas9 design meant to overcome the limitations that have arisen from the nuclease activity of Cas9 and the influence of this technology in cancer research. In addition, we present challenges that might impede the clinical applicability of CRISPR/Cas9 for cancer therapy and highlight future directions for designing CRISPR/Cas9 delivery systems that might prove useful for cancer therapeutics. Copyright © 2017 The Author(s). Published by Elsevier Inc. All rights reserved.

CRISPR/Cas9-mediated correction of human genetic disease.

PubMed

Men, Ke; Duan, Xingmei; He, Zhiyao; Yang, Yang; Yao, Shaohua; Wei, Yuquan

2017-05-01

The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated (Cas) protein 9 system (CRISPR/Cas9) provides a powerful tool for targeted genetic editing. Directed by programmable sequence-specific RNAs, this system introduces cleavage and double-stranded breaks at target sites precisely. Compared to previously developed targeted nucleases, the CRISPR/Cas9 system demonstrates several promising advantages, including simplicity, high specificity, and efficiency. Several broad genome-editing studies with the CRISPR/Cas9 system in different species in vivo and ex vivo have indicated its strong potential, raising hopes for therapeutic genome editing in clinical settings. Taking advantage of non-homologous end-joining (NHEJ) and homology directed repair (HDR)-mediated DNA repair, several studies have recently reported the use of CRISPR/Cas9 to successfully correct disease-causing alleles ranging from single base mutations to large insertions. In this review, we summarize and discuss recent preclinical studies involving the CRISPR/Cas9-mediated correction of human genetic diseases.

Anesthésie d’un greffé cardiaque en chirurgie non cardiaque: à propos d’un cas clinique et revue de la littérature

PubMed Central

Nassirou, Oumarou Mahamane Mamane; Jaafari, Abdelhamid; Chlouchi, Abdellatif; Bensghir, Mustapha; Haimeur, Charki

2016-01-01

Le nombre et la durée de survie des patients transplantés cardiaque sont en augmentation. Une partie de ces patients se présentent régulièrement pour une chirurgie générale en dehors de la transplantation cardiaque. L’anesthésie chez ces patients peut être difficile en raison des particularités physiologiques du cœur dénervé et de la gestion du traitement immunosuppresseur avec le risque de rejet et d’infection. Nous discutons la prise en charge anesthésique à travers un cas d’un patient âgé de 60 ans transplanté cardiaque devant subir une chirurgie de cure d’éventration abdominale et une revue de la littérature. PMID:28154639

CRISPR-Cas9-Edited Site Sequencing (CRES-Seq): An Efficient and High-Throughput Method for the Selection of CRISPR-Cas9-Edited Clones.

PubMed

Veeranagouda, Yaligara; Debono-Lagneaux, Delphine; Fournet, Hamida; Thill, Gilbert; Didier, Michel

2018-01-16

The emergence of clustered regularly interspaced short palindromic repeats-Cas9 (CRISPR-Cas9) gene editing systems has enabled the creation of specific mutants at low cost, in a short time and with high efficiency, in eukaryotic cells. Since a CRISPR-Cas9 system typically creates an array of mutations in targeted sites, a successful gene editing project requires careful selection of edited clones. This process can be very challenging, especially when working with multiallelic genes and/or polyploid cells (such as cancer and plants cells). Here we described a next-generation sequencing method called CRISPR-Cas9 Edited Site Sequencing (CRES-Seq) for the efficient and high-throughput screening of CRISPR-Cas9-edited clones. CRES-Seq facilitates the precise genotyping up to 96 CRISPR-Cas9-edited sites (CRES) in a single MiniSeq (Illumina) run with an approximate sequencing cost of $6/clone. CRES-Seq is particularly useful when multiple genes are simultaneously targeted by CRISPR-Cas9, and also for screening of clones generated from multiallelic genes/polyploid cells. © 2018 by John Wiley & Sons, Inc. Copyright © 2018 John Wiley & Sons, Inc.

Arthrose due au genu varum: traitement par osteotomie tibiale de valgisation

PubMed Central

Moussa, Abdou Kadri; Lukulunga, Loubet Unyendje; Mahfoud, Mustapha; El Bardouni, Ahmed; Ismail, Farid; Kharmaz, Mohamed; Berrada, Mohammed Saleh; El Yaacoubi, Moradh

2014-01-01

Le traitement du genu varum est le plus souvent conservateur (ostéotomie tibiale de valgisation) permettant de corriger le trouble architectural afin de rétablir l'axe physiologique du membre inférieur. Le but de l’étude était d’évaluer les résultats du traitement et comparer à ceux de la littérature. Il s'est agi d'une étude rétrospective portant sur des patients présentant un genu varum qui s'est déroulée dans le Service de Chirurgie Orthopédique et Traumatologie de CHU Ibn SINA de RABAT, sur une période de 9 ans (2000 au 31 Décembre 2008). Nous avons inclus dans notre étude: les patients qui avaient un genu-varum clinique avec examen radiographique standard ainsi qu'un pangonogramme; traités par différents procédés d'ostéotomie tibiale de valgisation; avec un suivis d’ au moins deux ans. Nos critères d’évaluation ont été appréciés selon le score HSS. Nous avons colligé 115 cas de genu-varum par ostéotomie de valgisation. L’âge de nos patients variait entre 40 et 69 ans, avec une moyenne de 53 ans. Le pic de fréquence se situait entre 52et 63 ans. Le sexe féminin prédominait avec 87 cas (75,6%) avec un sex ratio 3,1. Un Indice de masse corporelle supérieur à 30 a été noté dans 44 cas (38%). Quant aux antécédents chirurgicaux,18 patients de la série (soit 14%) ont été opérés pour le genu varum d'un autre genou. Le délai de consultation a varié entre 4 mois à 6 ans, avec une moyenne de 2 ans. La douleur était le principal motif de consultation et était de siège médial dans 70% des cas et bicompartimental dans 30% cas. Il s'agissait d'une douleur mécanique dans 76% des cas, mixte 21% des cas et inflammatoire 4% des cas. La déformation du genou appréciée par l’écart intercondylien a été en moyenne de 8,7 cm avec des extrêmes de 3 cm et 33cm. Le bilan de l'imagerie médicale reposait essentiellement sur les radiographies standards du genou de face et de profil, ainsi que la goniométrie. Ces

Interference activity of a minimal Type I CRISPR–Cas system from Shewanella putrefaciens

PubMed Central

Dwarakanath, Srivatsa; Brenzinger, Susanne; Gleditzsch, Daniel; Plagens, André; Klingl, Andreas; Thormann, Kai; Randau, Lennart

2015-01-01

Type I CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)–Cas (CRISPR-associated) systems exist in bacterial and archaeal organisms and provide immunity against foreign DNA. The Cas protein content of the DNA interference complexes (termed Cascade) varies between different CRISPR-Cas subtypes. A minimal variant of the Type I-F system was identified in proteobacterial species including Shewanella putrefaciens CN-32. This variant lacks a large subunit (Csy1), Csy2 and Csy3 and contains two unclassified cas genes. The genome of S. putrefaciens CN-32 contains only five Cas proteins (Cas1, Cas3, Cas6f, Cas1821 and Cas1822) and a single CRISPR array with 81 spacers. RNA-Seq analyses revealed the transcription of this array and the maturation of crRNAs (CRISPR RNAs). Interference assays based on plasmid conjugation demonstrated that this CRISPR-Cas system is active in vivo and that activity is dependent on the recognition of the dinucleotide GG PAM (Protospacer Adjacent Motif) sequence and crRNA abundance. The deletion of cas1821 and cas1822 reduced the cellular crRNA pool. Recombinant Cas1821 was shown to form helical filaments bound to RNA molecules, which suggests its role as the Cascade backbone protein. A Cascade complex was isolated which contained multiple Cas1821 copies, Cas1822, Cas6f and mature crRNAs. PMID:26350210

CRISPR-Cas Technologies and Applications in Food Bacteria.

PubMed

Stout, Emily; Klaenhammer, Todd; Barrangou, Rodolphe

2017-02-28

Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPRs) and CRISPR-associated (Cas) proteins form adaptive immune systems that occur in many bacteria and most archaea. In addition to protecting bacteria from phages and other invasive mobile genetic elements, CRISPR-Cas molecular machines can be repurposed as tool kits for applications relevant to the food industry. A primary concern of the food industry has long been the proper management of food-related bacteria, with a focus on both enhancing the outcomes of beneficial microorganisms such as starter cultures and probiotics and limiting the presence of detrimental organisms such as pathogens and spoilage microorganisms. This review introduces CRISPR-Cas as a novel set of technologies to manage food bacteria and offers insights into CRISPR-Cas biology. It primarily focuses on the applications of CRISPR-Cas systems and tools in starter cultures and probiotics, encompassing strain-typing, phage resistance, plasmid vaccination, genome editing, and antimicrobial activity.

Diversity and evolution of class 2 CRISPR–Cas systems

PubMed Central

Shmakov, Sergey; Smargon, Aaron; Scott, David; Cox, David; Pyzocha, Neena; Yan, Winston; Abudayyeh, Omar O.; Gootenberg, Jonathan S.; Makarova, Kira S.; Wolf, Yuri I.; Severinov, Konstantin; Zhang, Feng; Koonin, Eugene V.

2018-01-01

Class 2 CRISPR–Cas systems are characterized by effector modules that consist of a single multidomain protein, such as Cas9 or Cpf1. We designed a computational pipeline for the discovery of novel class 2 variants and used it to identify six new CRISPR–Cas subtypes. The diverse properties of these new systems provide potential for the development of versatile tools for genome editing and regulation. In this Analysis article, we present a comprehensive census of class 2 types and class 2 subtypes in complete and draft bacterial and archaeal genomes, outline evolutionary scenarios for the independent origin of different class 2 CRISPR–Cas systems from mobile genetic elements, and propose an amended classification and nomenclature of CRISPR–Cas. PMID:28111461

CRISPR/Cas9 for genome editing: progress, implications and challenges.

PubMed

Zhang, Feng; Wen, Yan; Guo, Xiong

2014-09-15

Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated (Cas) protein 9 system provides a robust and multiplexable genome editing tool, enabling researchers to precisely manipulate specific genomic elements, and facilitating the elucidation of target gene function in biology and diseases. CRISPR/Cas9 comprises of a nonspecific Cas9 nuclease and a set of programmable sequence-specific CRISPR RNA (crRNA), which can guide Cas9 to cleave DNA and generate double-strand breaks at target sites. Subsequent cellular DNA repair process leads to desired insertions, deletions or substitutions at target sites. The specificity of CRISPR/Cas9-mediated DNA cleavage requires target sequences matching crRNA and a protospacer adjacent motif locating at downstream of target sequences. Here, we review the molecular mechanism, applications and challenges of CRISPR/Cas9-mediated genome editing and clinical therapeutic potential of CRISPR/Cas9 in future. © The Author 2014. Published by Oxford University Press. All rights reserved. For Permissions, please email: journals.permissions@oup.com.

Cas5d Protein Processes Pre-crRNA and Assembles into a Cascade-like Interference Complex in Subtype I-C/Dvulg CRISPR-Cas System

DOE Office of Scientific and Technical Information (OSTI.GOV)

Nam, Ki Hyun; Haitjema, Charles; Liu, Xueqi

Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPRs), together with an operon of CRISPR-associated (Cas) proteins, form an RNA-based prokaryotic immune system against exogenous genetic elements. Cas5 family proteins are found in several type I CRISPR-Cas systems. Here, we report the molecular function of subtype I-C/Dvulg Cas5d from Bacillus halodurans. We show that Cas5d cleaves pre-crRNA into unit length by recognizing both the hairpin structure and the 3 single stranded sequence in the CRISPR repeat region. Cas5d structure reveals a ferredoxin domain-based architecture and a catalytic triad formed by Y46, K116, and H117 residues. We further show that after pre-crRNA processing,more » Cas5d assembles with crRNA, Csd1, and Csd2 proteins to form a multi-sub-unit interference complex similar to Escherichia coli Cascade (CRISPR-associated complex for antiviral defense) in architecture. Our results suggest that formation of a crRNA-presenting Cascade-like complex is likely a common theme among type I CRISPR subtypes.« less

Cas9 in Genetically Modified Food Is Unlikely to Cause Food Allergy.

PubMed

Nakajima, Osamu; Nishimaki-Mogami, Tomoko; Kondo, Kazunari

2016-01-01

Genome editing has undergone rapid development during the last three years. It is anticipated that genetically modified organisms (GMOs) for food purposes will be widely produced using the clustered regularly interspaced short palindromic repeat/Cas9 (CRISPR)/Cas9 system in the near future. However, the Cas9 gene may then enter the genomes of GMOs for food if the breeding process is not strictly managed, which could lead to the Cas9 protein or associated peptides being produced within these organisms. A variety of peptides could theoretically be produced from the Cas9 gene by using open reading frames different from that of Cas9 in the GMOs. In this study, Cas9 and the peptides potentially encoded by Cas9 genes were studied regarding their immunogenicity, in terms of the digestibility of Cas9 and the homology of the peptides to food allergens. First, the digestibility and thermal stability of Cas9 were studied. Digestibility was tested with natural or heat-denatured Cas9 in simulated gastric fluid in vitro. The two types of Cas9 were digested rapidly. Cas9 was also gradually degraded during heat treatment. Second, the peptides potentially encoded by Cas9 genes were examined for their homology to food allergens. Specifically, an 8-mer exact match search and a sliding 80-mer window search were performed using allergen databases. One of the peptides was found to have homology with a food allergen.

Recruitment of CRISPR-Cas systems by Tn7-like transposons.

PubMed

Peters, Joseph E; Makarova, Kira S; Shmakov, Sergey; Koonin, Eugene V

2017-08-29

A survey of bacterial and archaeal genomes shows that many Tn7-like transposons contain minimal type I-F CRISPR-Cas systems that consist of fused cas8f and cas5f , cas7f , and cas6f genes and a short CRISPR array. Several small groups of Tn7-like transposons encompass similarly truncated type I-B CRISPR-Cas. This minimal gene complement of the transposon-associated CRISPR-Cas systems implies that they are competent for pre-CRISPR RNA (precrRNA) processing yielding mature crRNAs and target binding but not target cleavage that is required for interference. Phylogenetic analysis demonstrates that evolution of the CRISPR-Cas-containing transposons included a single, ancestral capture of a type I-F locus and two independent instances of type I-B loci capture. We show that the transposon-associated CRISPR arrays contain spacers homologous to plasmid and temperate phage sequences and, in some cases, chromosomal sequences adjacent to the transposon. We hypothesize that the transposon-encoded CRISPR-Cas systems generate displacement (R-loops) in the cognate DNA sites, targeting the transposon to these sites and thus facilitating their spread via plasmids and phages. These findings suggest the existence of RNA-guided transposition and fit the guns-for-hire concept whereby mobile genetic elements capture host defense systems and repurpose them for different stages in the life cycle of the element.

Multiple mechanisms for CRISPR-Cas inhibition by anti-CRISPR proteins.

PubMed

Bondy-Denomy, Joseph; Garcia, Bianca; Strum, Scott; Du, Mingjian; Rollins, MaryClare F; Hidalgo-Reyes, Yurima; Wiedenheft, Blake; Maxwell, Karen L; Davidson, Alan R

2015-10-01

The battle for survival between bacteria and the viruses that infect them (phages) has led to the evolution of many bacterial defence systems and phage-encoded antagonists of these systems. Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) and the CRISPR-associated (cas) genes comprise an adaptive immune system that is one of the most widespread means by which bacteria defend themselves against phages. We identified the first examples of proteins produced by phages that inhibit a CRISPR-Cas system. Here we performed biochemical and in vivo investigations of three of these anti-CRISPR proteins, and show that each inhibits CRISPR-Cas activity through a distinct mechanism. Two block the DNA-binding activity of the CRISPR-Cas complex, yet do this by interacting with different protein subunits, and using steric or non-steric modes of inhibition. The third anti-CRISPR protein operates by binding to the Cas3 helicase-nuclease and preventing its recruitment to the DNA-bound CRISPR-Cas complex. In vivo, this anti-CRISPR can convert the CRISPR-Cas system into a transcriptional repressor, providing the first example-to our knowledge-of modulation of CRISPR-Cas activity by a protein interactor. The diverse sequences and mechanisms of action of these anti-CRISPR proteins imply an independent evolution, and foreshadow the existence of other means by which proteins may alter CRISPR-Cas function.

Le syndrome d’alcoolisme foetal

PubMed Central

2002-01-01

L’alcool est un tératogène physique et comportemental. Le syndrome d’alcoolisme foetal (SAF) est un trouble courant mais encore sous-diagnostiqué découlant de la consommation d’alcool par la mère pendant la grossesse. Bien qu’il puisse être prévenu, le SAF est également invalidant. Même si le SAF est présent dans tous les groupes socioéconomiques du Canada, sa prévalence est élevée dans certaines communautés inuites et des Premières nations du Canada. Le présent énoncé porte sur la prévention, le diagnostic, le dépistage précoce et la prise en charge du SAF par les professionnels de la santé. La prévention du SAF doit s’effectuer à deux échelons. La prévention primaire consiste à éliminer le SAF par une formation en classe ou dans la collectivité et à inciter les femmes à éviter de consommer de l’alcool avant la conception et pendant la grossesse. La prévention secondaire consiste à repérer les femmes qui boivent pendant leur grossesse et à réduire leur consommation. Le présent énoncé décrit plusieurs stratégies de dépistage, dont la stratégie T-ACE (tolérance-agacement, réduction, éveil). Les dispensateurs de soins devraient recommander l’abstinence dès la première visite prénatale. Un envoi rapide en consultation en vue de traiter l’alcoolisme est recommandé pour les femmes enceintes incapables d’arrêter de boire. Le présent énoncé décrit le diagnostic de SAF, de SAF partiel ou atypique, d’anomalies congénitales et de troubles neurodéveloppementaux reliés à l’alcool. En cas d’exposition à l’alcool in utero, un diagnostic de SAF devrait être envisagé en présence d’un retard de croissance courant ou antérieur, de certaines anomalies faciales touchant la lèvre supérieure et les yeux et d’anomalies neurodéveloppementales. Ces caractéristiques sont mieux quantifiées au moyen d’une méthode diagnostique à quatre chiffres. Des stratégies de dépistage précoce des

48 CFR 9903.201-2 - Types of CAS coverage.

Code of Federal Regulations, 2012 CFR

2012-10-01

... later award of a CAS-covered contract. Full coverage applies to contractor business units that— (1) Receive a single CAS-covered contract award of $50 million or more; or (2) Received $50 million or more in net CAS-covered awards during its preceding cost accounting period. (b) Modified coverage. (1...

48 CFR 9903.201-2 - Types of CAS coverage.

Code of Federal Regulations, 2014 CFR

2014-10-01

... later award of a CAS-covered contract. Full coverage applies to contractor business units that— (1) Receive a single CAS-covered contract award of $50 million or more; or (2) Received $50 million or more in net CAS-covered awards during its preceding cost accounting period. (b) Modified coverage. (1...

Infection respiratoire aigüe et statut nutritionnel chez les enfants de 0-5 ans: cas des cliniques universitaires de Lubumbashi, République Démocratique du Congo

PubMed Central

Ngombe, Léon Kabamba; Mbombo-Ditunga; Kameya, Nduwa; Malingo, Aimé Abasiko; Kayomb, Nathalie Kaj; ea Ngolomba, Jean Ngolomba; Nday, David Kakez; Numbi, Luboya

2014-01-01

Les auteurs rapportent les données d'une étude rétrospective de 153 dossiers d'enfants hospitalisés dans le service de pédiatrie des Cliniques Universitaires de Lubumbashi/RD Congo pour IRA. En ce qui nous concerne, les IRA chez les enfants de moins de 5 ans représentent 26,11% de l'effectif, dont 17,75% âgés de moins d'un an. Le sexe masculin est légèrement prédominant (85 contre 68) et près de 70% des enfants ont un statut nutritionnel précaire. La répartition mensuelle connaît des pics en mars et octobre. Les diagnostiques notifiés sont: rhinite(16,3%),Amygdalite(5,9%),Otite Moyenne Aigue(0,7%),Laryngite (3,3%), Rhinopharyngite (39,2%), Pharyngite (6,5%), Bronchite (7,2%), Bronchopneumonie (5,9%), Pneumonie(2,6%) et Bronchiolite (12,4%).Tous les cas ont bien évolués sous traitement. Le but de ce travail est de déterminer la fréquence des IRA et le statut nutritionnel des enfants ayant été admis dans le service des pédiatries aux C.U.L. PMID:25995789

Interference activity of a minimal Type I CRISPR-Cas system from Shewanella putrefaciens.

PubMed

Dwarakanath, Srivatsa; Brenzinger, Susanne; Gleditzsch, Daniel; Plagens, André; Klingl, Andreas; Thormann, Kai; Randau, Lennart

2015-10-15

Type I CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)-Cas (CRISPR-associated) systems exist in bacterial and archaeal organisms and provide immunity against foreign DNA. The Cas protein content of the DNA interference complexes (termed Cascade) varies between different CRISPR-Cas subtypes. A minimal variant of the Type I-F system was identified in proteobacterial species including Shewanella putrefaciens CN-32. This variant lacks a large subunit (Csy1), Csy2 and Csy3 and contains two unclassified cas genes. The genome of S. putrefaciens CN-32 contains only five Cas proteins (Cas1, Cas3, Cas6f, Cas1821 and Cas1822) and a single CRISPR array with 81 spacers. RNA-Seq analyses revealed the transcription of this array and the maturation of crRNAs (CRISPR RNAs). Interference assays based on plasmid conjugation demonstrated that this CRISPR-Cas system is active in vivo and that activity is dependent on the recognition of the dinucleotide GG PAM (Protospacer Adjacent Motif) sequence and crRNA abundance. The deletion of cas1821 and cas1822 reduced the cellular crRNA pool. Recombinant Cas1821 was shown to form helical filaments bound to RNA molecules, which suggests its role as the Cascade backbone protein. A Cascade complex was isolated which contained multiple Cas1821 copies, Cas1822, Cas6f and mature crRNAs. © The Author(s) 2015. Published by Oxford University Press on behalf of Nucleic Acids Research.

5 CFR 410.402 - Paying premium pay.

Code of Federal Regulations, 2011 CFR

2011-01-01

... firefighter is entitled to a greater amount of pay based on actual work hours during the week in which... Sunday work shall continue to receive that premium pay. This exception does not apply to an employee assigned to full-time training at institutions of higher learning. (2) Training at night. An employee given...

5 CFR 410.402 - Paying premium pay.

Code of Federal Regulations, 2013 CFR

2013-01-01

... firefighter is entitled to a greater amount of pay based on actual work hours during the week in which... Sunday work shall continue to receive that premium pay. This exception does not apply to an employee assigned to full-time training at institutions of higher learning. (2) Training at night. An employee given...

5 CFR 410.402 - Paying premium pay.

Code of Federal Regulations, 2014 CFR

2014-01-01

... firefighter is entitled to a greater amount of pay based on actual work hours during the week in which... Sunday work shall continue to receive that premium pay. This exception does not apply to an employee assigned to full-time training at institutions of higher learning. (2) Training at night. An employee given...

5 CFR 410.402 - Paying premium pay.

Code of Federal Regulations, 2012 CFR

2012-01-01

... firefighter is entitled to a greater amount of pay based on actual work hours during the week in which... Sunday work shall continue to receive that premium pay. This exception does not apply to an employee assigned to full-time training at institutions of higher learning. (2) Training at night. An employee given...

Cas9-nickase-mediated genome editing corrects hereditary tyrosinemia in rats.

PubMed

Shao, Yanjiao; Wang, Liren; Guo, Nana; Wang, Shengfei; Yang, Lei; Li, Yajing; Wang, Mingsong; Yin, Shuming; Han, Honghui; Zeng, Li; Zhang, Ludi; Hui, Lijian; Ding, Qiurong; Zhang, Jiqin; Geng, Hongquan; Liu, Mingyao; Li, Dali

2018-05-04

Hereditary tyrosinemia type I (HTI) is a metabolic genetic disorder caused by mutation of fumarylacetoacetate hydrolase (FAH). Because of the accumulation of toxic metabolites, HTI causes severe liver cirrhosis, liver failure, and even hepatocellular carcinoma. HTI is an ideal model for gene therapy, and several strategies have been shown to ameliorate HTI symptoms in animal models. Although CRISPR/Cas9-mediated genome editing is able to correct the Fah mutation in mouse models, WT Cas9 induces numerous undesired mutations that have raised safety concerns for clinical applications. To develop a new method for gene correction with high fidelity, we generated a Fah mutant rat model to investigate whether Cas9 nickase (Cas9n)-mediated genome editing can efficiently correct the Fah First, we confirmed that Cas9n rarely induces indels in both on-target and off-target sites in cell lines. Using WT Cas9 as a positive control, we delivered Cas9n and the repair donor template/single guide (sg)RNA through adenoviral vectors into HTI rats. Analyses of the initial genome editing efficiency indicated that only WT Cas9 but not Cas9n causes indels at the on-target site in the liver tissue. After receiving either Cas9n or WT Cas9-mediated gene correction therapy, HTI rats gained weight steadily and survived. Fah-expressing hepatocytes occupied over 95% of the liver tissue 9 months after the treatment. Moreover, CRISPR/Cas9-mediated gene therapy prevented the progression of liver cirrhosis, a phenotype that could not be recapitulated in the HTI mouse model. These results strongly suggest that Cas9n-mediated genome editing is a valuable and safe gene therapy strategy for this genetic disease. © 2018 by The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Inc.

Circulating leptin and inflammatory response in esophageal cancer, esophageal cancer-related cachexia-anorexia syndrome (CAS) and non-malignant CAS of the alimentary tract.

PubMed

Diakowska, Dorota; Krzystek-Korpacka, Malgorzata; Markocka-Maczka, Krystyna; Diakowski, Witold; Matusiewicz, Malgorzata; Grabowski, Krzysztof

2010-08-01

We investigated the association between esophageal cancer and cachexia-anorexia syndrome (CAS) of the alimentary tract and leptin, an adipocytokine crucial for body weight regulation, a modulator of inflammatory/immune response, implication of which in cancer and CAS development remains debatable. Circulating leptin was measured in 135 esophageal cancer patients (51 non-cachectic and 84 cachectic) and 83 controls (63 non-cachectic and 20 cachectic) and referred to cancer stage, CAS, and inflammatory and nutritional indices. Leptin was down-regulated in cancer patients and cachectic controls as compared to non-cachectic controls, with more pronounced hypoleptinemia in advanced cancers. Leptin correlated directly with BMI, TNF-alpha, albumin, and hemoglobin and indirectly with IL-6, IL-8, and hsCRP. The correlations, except for hsCRP, were more pronounced in females. BMI alone (females) and BMI and hsCRP (males) were independent predictors of leptin explaining over 60% of its variability. Following adjustment for BMI and gender, cancer-related CAS but not cancer itself negatively affected leptin. Leptin and BMI were independently associated with cancer-related and non-malignant CAS with diagnostic accuracy of 93% in identifying subjects with CAS. Pro-inflammatory, angiogenic and mitogenic properties of leptin do not seem to be important for esophageal cancer development but hypoleptinemia, independently from co-occurring reduction of adiposity, appears to be strongly associated with esophageal cancer-related CAS and non-malignant CAS of the alimentary tract. Copyright 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

The CRISPR-Cas system in Enterobacteriaceae.

PubMed

Medina-Aparicio, Liliana; Dávila, Sonia; Rebollar-Flores, Javier E; Calva, Edmundo; Hernández-Lucas, Ismael

2018-02-01

In nature, microorganisms are constantly exposed to multiple viral infections and thus have developed many strategies to survive phage attack and invasion by foreign DNA. One of such strategies is the clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated proteins (Cas) bacterial immunological system. This defense mechanism is widespread in prokaryotes including several families such as Enterobacteriaceae. Much knowledge about the CRISPR-Cas system has been generated, including its biological functions, transcriptional regulation, distribution, utility as a molecular marker and as a tool for specific genome editing. This review focuses on these aspects and describes the state of the art of the CRISPR-Cas system in the Enterobacteriaceae bacterial family. © FEMS 2018. All rights reserved. For permissions, please e-mail: journals.permissions@oup.com.

Ostéogenèse imparfaite type III de découverte tardive: à propos d'un cas

PubMed Central

Rachidi, Wafae; Nassar, Kawtar; Janani, Saadia; Mkinsi, Ouafa

2015-01-01

Patient âgé de 52 ans, était admis dans notre établissement pour des polyarthralgies chroniques, plutôt mécaniques, touchant spécialement les articulations du membre inférieur. L'interrogatoire retrouvait l'antécédent de fractures répétées depuis l'enfance, pour des traumatismes minimes, suite à des chutes par glissement. Les signes cliniques et radiologiques, notamment, les fractures récurrentes, sclérotiques bleues, hyperlaxité ligamentaire, dentinogenèse imparfaite, syndrome dysmorphique, ostéoporose densitométrique importante, plaidaient tous en faveur d'une ostéogénèse imparfaite type III. Le patient a initié le traitement, par prise régulière du calcium (1g/jour), supplémentation en vitamine D, et il est programmé pour perfusion de Bisphosphonate (Pamidronate 60mg). Ce cas illustre une forme rare de découverte tardive d'ostéogénèse imparfaite type III. PMID:25995811

Rational design of a split-Cas9 enzyme complex.

PubMed

Wright, Addison V; Sternberg, Samuel H; Taylor, David W; Staahl, Brett T; Bardales, Jorge A; Kornfeld, Jack E; Doudna, Jennifer A

2015-03-10

Cas9, an RNA-guided DNA endonuclease found in clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) bacterial immune systems, is a versatile tool for genome editing, transcriptional regulation, and cellular imaging applications. Structures of Streptococcus pyogenes Cas9 alone or bound to single-guide RNA (sgRNA) and target DNA revealed a bilobed protein architecture that undergoes major conformational changes upon guide RNA and DNA binding. To investigate the molecular determinants and relevance of the interlobe rearrangement for target recognition and cleavage, we designed a split-Cas9 enzyme in which the nuclease lobe and α-helical lobe are expressed as separate polypeptides. Although the lobes do not interact on their own, the sgRNA recruits them into a ternary complex that recapitulates the activity of full-length Cas9 and catalyzes site-specific DNA cleavage. The use of a modified sgRNA abrogates split-Cas9 activity by preventing dimerization, allowing for the development of an inducible dimerization system. We propose that split-Cas9 can act as a highly regulatable platform for genome-engineering applications.

Applications of CRISPR/Cas System to Bacterial Metabolic Engineering.

PubMed

Cho, Suhyung; Shin, Jongoh; Cho, Byung-Kwan

2018-04-05

The clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated (CRISPR/Cas) adaptive immune system has been extensively used for gene editing, including gene deletion, insertion, and replacement in bacterial and eukaryotic cells owing to its simple, rapid, and efficient activities in unprecedented resolution. Furthermore, the CRISPR interference (CRISPRi) system including deactivated Cas9 (dCas9) with inactivated endonuclease activity has been further investigated for regulation of the target gene transiently or constitutively, avoiding cell death by disruption of genome. This review discusses the applications of CRISPR/Cas for genome editing in various bacterial systems and their applications. In particular, CRISPR technology has been used for the production of metabolites of high industrial significance, including biochemical, biofuel, and pharmaceutical products/precursors in bacteria. Here, we focus on methods to increase the productivity and yield/titer scan by controlling metabolic flux through individual or combinatorial use of CRISPR/Cas and CRISPRi systems with introduction of synthetic pathway in industrially common bacteria including Escherichia coli . Further, we discuss additional useful applications of the CRISPR/Cas system, including its use in functional genomics.

Rational design of a split-Cas9 enzyme complex

DOE PAGES

Wright, Addison V.; Sternberg, Samuel H.; Taylor, David W.; ...

2015-02-23

Cas9, an RNA-guided DNA endonuclease found in clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) bacterial immune systems, is a versatile tool for genome editing, transcriptional regulation, and cellular imaging applications. Structures of Streptococcus pyogenes Cas9 alone or bound to single-guide RNA (sgRNA) and target DNA revealed a bilobed protein architecture that undergoes major conformational changes upon guide RNA and DNA binding. To investigate the molecular determinants and relevance of the interlobe rearrangement for target recognition and cleavage, we designed a split-Cas9 enzyme in which the nuclease lobe and α-helical lobe are expressed as separate polypeptides. The lobes do not interactmore » on their own, the sgRNA recruits them into a ternary complex that recapitulates the activity of full-length Cas9 and catalyzes site-specific DNA cleavage. The use of a modified sgRNA abrogates split-Cas9 activity by preventing dimerization, allowing for the development of an inducible dimerization system. We propose that split-Cas9 can act as a highly regulatable platform for genome-engineering applications.« less

Rational design of a split-Cas9 enzyme complex

DOE Office of Scientific and Technical Information (OSTI.GOV)

Wright, Addison V.; Sternberg, Samuel H.; Taylor, David W.

Cas9, an RNA-guided DNA endonuclease found in clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) bacterial immune systems, is a versatile tool for genome editing, transcriptional regulation, and cellular imaging applications. Structures of Streptococcus pyogenes Cas9 alone or bound to single-guide RNA (sgRNA) and target DNA revealed a bilobed protein architecture that undergoes major conformational changes upon guide RNA and DNA binding. To investigate the molecular determinants and relevance of the interlobe rearrangement for target recognition and cleavage, we designed a split-Cas9 enzyme in which the nuclease lobe and α-helical lobe are expressed as separate polypeptides. The lobes do not interactmore » on their own, the sgRNA recruits them into a ternary complex that recapitulates the activity of full-length Cas9 and catalyzes site-specific DNA cleavage. The use of a modified sgRNA abrogates split-Cas9 activity by preventing dimerization, allowing for the development of an inducible dimerization system. We propose that split-Cas9 can act as a highly regulatable platform for genome-engineering applications.« less

CRISPR/Cas9 Inhibits Multiple Steps of HIV-1 Infection.

PubMed

Yin, Lijuan; Hu, Siqi; Mei, Shan; Sun, Hong; Xu, Fengwen; Li, Jian; Zhu, Weijun; Liu, Xiaoman; Zhao, Fei; Zhang, Di; Cen, Shan; Liang, Chen; Guo, Fei

2018-05-09

CRISPR/Cas9 is an adaptive immune system where bacteria and archaea have evolved to resist the invading viruses and plasmid DNA by creating site-specific double-strand breaks in DNA. This study tested this gene editing system in inhibiting human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection by targeting the viral long terminal repeat and the gene coding sequences. Strong inhibition of HIV-1 infection by Cas9/gRNA was observed, which resulted not only from insertions and deletions (indels) that were introduced into viral DNA due to Cas9 cleavage, but also from the marked decrease in the levels of the late viral DNA products and the integrated viral DNA. This latter defect might have reflected the degradation of viral DNA that has not been immediately repaired after Cas9 cleavage. It was further observed that Cas9, when solely located in the cytoplasm, inhibits HIV-1 as strongly as the nuclear Cas9, except that the cytoplasmic Cas9 does not act on the integrated HIV-1 DNA and thus cannot be used to excise the latent provirus. Together, the results suggest that Cas9/gRNA is able to target and edit HIV-1 DNA both in the cytoplasm and in the nucleus. The inhibitory effect of Cas9 on HIV-1 is attributed to both the indels in viral DNA and the reduction in the levels of viral DNA.

Analysis of microsatellite instability in CRISPR/Cas9 editing mice.

PubMed

Huo, Xueyun; Du, Yating; Lu, Jing; Guo, Meng; Li, Zhenkun; Zhang, Shuangyue; Li, Xiaohong; Chen, Zhenwen; Du, Xiaoyan

2017-03-01

Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR- associated (Cas) protein 9 system is a novel and powerful tool which is widely used for genome editing. CRISPR/Cas9 is RNA-guided and can lead to desired genomic modifications. However, whether the CRISPR/Cas9-mediated genome editing causes genomic alterations and genomic instability, such as microsatellite instability (MSI), is still unknown. Here we detected MSI in 21 CRISPR/Cas9 mouse strains using a panel of 42 microsatellite loci which were selected from our previous studies. Surprisingly, MSI occurrence was common in CRISPR/Cas9 modified genome, and most of the strains (19/21, 90.5%) examined showed MSI. Of 42 loci examined, 8 loci (8/42, 19.05%) exhibited MSI in the Cas9 editing mice. The Ttll9 (4/42, 9.5%) were the most unstable strains, and D10Mit3 and D10Mit198 (9/21, 42.9%) were considered to be the most "hot" loci in the Cas9 strains we tested. Through analyzing the mutation of microsatellite loci, we provide new insights into the genomic alterations of CRISPR/Cas9 models and it will help us for a better understanding of this powerful technology. Copyright © 2017 Elsevier B.V. All rights reserved.

DNA interrogation by the CRISPR RNA-guided endonuclease Cas9.

PubMed

Sternberg, Samuel H; Redding, Sy; Jinek, Martin; Greene, Eric C; Doudna, Jennifer A

2014-03-06

The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated enzyme Cas9 is an RNA-guided endonuclease that uses RNA-DNA base-pairing to target foreign DNA in bacteria. Cas9-guide RNA complexes are also effective genome engineering agents in animals and plants. Here we use single-molecule and bulk biochemical experiments to determine how Cas9-RNA interrogates DNA to find specific cleavage sites. We show that both binding and cleavage of DNA by Cas9-RNA require recognition of a short trinucleotide protospacer adjacent motif (PAM). Non-target DNA binding affinity scales with PAM density, and sequences fully complementary to the guide RNA but lacking a nearby PAM are ignored by Cas9-RNA. Competition assays provide evidence that DNA strand separation and RNA-DNA heteroduplex formation initiate at the PAM and proceed directionally towards the distal end of the target sequence. Furthermore, PAM interactions trigger Cas9 catalytic activity. These results reveal how Cas9 uses PAM recognition to quickly identify potential target sites while scanning large DNA molecules, and to regulate scission of double-stranded DNA.

DNA interrogation by the CRISPR RNA-guided endonuclease Cas9

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Sternberg, Samuel H.; Redding, Sy; Jinek, Martin; Greene, Eric C.; Doudna, Jennifer A.

2014-03-01

The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated enzyme Cas9 is an RNA-guided endonuclease that uses RNA-DNA base-pairing to target foreign DNA in bacteria. Cas9-guide RNA complexes are also effective genome engineering agents in animals and plants. Here we use single-molecule and bulk biochemical experiments to determine how Cas9-RNA interrogates DNA to find specific cleavage sites. We show that both binding and cleavage of DNA by Cas9-RNA require recognition of a short trinucleotide protospacer adjacent motif (PAM). Non-target DNA binding affinity scales with PAM density, and sequences fully complementary to the guide RNA but lacking a nearby PAM are ignored by Cas9-RNA. Competition assays provide evidence that DNA strand separation and RNA-DNA heteroduplex formation initiate at the PAM and proceed directionally towards the distal end of the target sequence. Furthermore, PAM interactions trigger Cas9 catalytic activity. These results reveal how Cas9 uses PAM recognition to quickly identify potential target sites while scanning large DNA molecules, and to regulate scission of double-stranded DNA.

L’ostéotomie de Chiari dans la prise en charge de la dysplasie de la hanche chez l’adulte: à propos de 9 cas

PubMed Central

Shimi, Mohammed; Mahdane, Hicham; Mechchat, Atif; El Ibrahimi, Abedelhalim; El Mrini, Abedelmajid

2013-01-01

La dysplasie acétabulaire de l’adulte jeune entraîne, dans plus de 50% des cas, une coxarthrose secondaire avant l’âge de 50 ans, l’ostéotomie de CHIARI a été décrite initialement dans le traitement de la dysplasie acétabulaire de l’enfant et de l’adolescent, elle a vu ses indications s’étendre à la dysplasie acétabulaire de l’adulte. Nous avons réalisé 9 ostéotomies de CHIARI de 2009 à 2012. Les 9 hanches ont été évaluées cliniquement et radiologiquement en préopératoire et en postopératoire, avec un recul moyen de 18.4 mois. L’ostéotomie a été réalisée sur des hanches douloureuses dysplasiques, sans arthrose (45%) ou avec une arthrose peu évoluée (stade 2: 11%) ou évoluée (stade 3 et 4: 44%). Les résultats fonctionnels ont été très satisfaisants au dernier recul. En effet, le score PMA au dernier recul était de 17.4 en moyenne, avec en particulier, une action antalgique remarquable. Radiologiquement, l’ostéotomie a normalisé pratiquement dans tous les cas la coxométrie, grâce à une médialisation importante habituellement supérieure à 20 mm (87.5%). L’ostéotomie de CHIARI est une intervention sûre. Si l’indication est correctement posée, elle soulage remarquablement les patients et stoppe l’arthrose. Elle garde donc une place privilégiée dans le traitement de la coxarthrose même évoluée sur dysplasie acétabulaire pure ou mixte. PMID:23565312

Potential pitfalls of CRISPR/Cas9-mediated genome editing.

PubMed

Peng, Rongxue; Lin, Guigao; Li, Jinming

2016-04-01

Recently, a novel technique named the clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)/CRISPR-associated protein (Cas)9 system has been rapidly developed. This genome editing tool has improved our ability tremendously with respect to exploring the pathogenesis of diseases and correcting disease mutations, as well as phenotypes. With a short guide RNA, Cas9 can be precisely directed to target sites, and functions as an endonuclease to efficiently produce breaks in DNA double strands. Over the past 30 years, CRISPR has evolved from the 'curious sequences of unknown biological function' into a promising genome editing tool. As a result of the incessant development in the CRISPR/Cas9 system, Cas9 co-expressed with custom guide RNAs has been successfully used in a variety of cells and organisms. This genome editing technology can also be applied to synthetic biology, functional genomic screening, transcriptional modulation and gene therapy. However, although CRISPR/Cas9 has a broad range of action in science, there are several aspects that affect its efficiency and specificity, including Cas9 activity, target site selection and short guide RNA design, delivery methods, off-target effects and the incidence of homology-directed repair. In the present review, we highlight the factors that affect the utilization of CRISPR/Cas9, as well as possible strategies for handling any problems. Addressing these issues will allow us to take better advantage of this technique. In addition, we also review the history and rapid development of the CRISPR/Cas system from the time of its initial discovery in 2012. © 2015 FEBS.

CAS as Environments for Implementing Mathematical Microworlds.

ERIC Educational Resources Information Center

Alpers, Burkhard

2002-01-01

Investigates whether computer algebra systems (CAS) are suitable environments for implementing mathematical microworlds. Recalls what constitutes a microworld and explores how CAS can be used for implementation, stating potentials as well as limitations. Provides as an example the microworld "Formula 1", implemented in Maple Software. (Author/KHR)

Etude du strabisme chez des enfants de 0 à 15 ans suivis a Lubumbashi, République Démocratique du Congo: analyse des aspects épidémiologiques et cliniques

PubMed Central

Bienvenu, Yogolelo Asani; Angel, Musau Nkola; Sebastien, Mbuyi Musanzayi; Philippe, Cilundika Mulenga; Léon, Kabamba Ngombe; Eugene, Twite Kabange; Chami, Cham Lubamba; Prosper, Kalenga Muenze Kayamba; Claude, Speeg-Schatz; Gaby, Chenge Borasisi

2015-01-01

Introduction Le strabisme est défini comme un syndrome à double composante: motrice et sensorielle. Le but de ce travail est de décrire les aspects épidémiologiques et cliniques du strabisme chez l'enfant congolais de 0 à 15 ans dans la ville de Lubumbashi. Méthodes Il s'agit d'une étude descriptive longitudinale sur les aspects épidémiologiques et cliniques du strabisme chez l'enfant congolais de 0 à 15 ans dans la ville de Lubumbashi entre Décembre 2012 à Décembre 2013. Nous avons recueilli l’âge des patients, leur sexe, leur provenance, le type de strabisme, la réfraction, le fond d'oeil, les antécédents (hérédité) ainsi que le type de la déviation strabique observé sur 70 patients. Résultats Nous avons observé 70 cas de strabisme manifeste dont 31 cas (44,28%) étaient dans la tranche d’âge comprise entre 0 et 5 ans. L’âge moyen de nos patients était de 6,7 ans avec une prédominance du sexe féminin, soit 51,42%. Le strabisme était convergent dans 65,71%, divergent dans 30%, et vertical dans 4,28%. Les ésotropies représentaient 65 cas (92,85%), quatre cas (5,71%) avaient un antécédent familial de strabisme au premier degré de parenté, 21 cas (30%) au second degré de parenté, 45 cas (64,28%) n'avaient pas cet antécédent. L'oeil gauche était le plus dominé dans 30% des cas. Les facteurs favorisant le strabisme étaient inconnus dans 54 cas (77,14%). Le strabisme était secondaire à l'hypermétropie chez 32 patients (42,71%). Conclusion La fréquence du strabisme dans la ville de Lubumbashi chez les enfants âgés de 0 à 15 ans est de 0,50%. Comme dans la plupart des études sur le strabisme de l'enfant, c'est l’ésotropie qui est la déviation la plus commune. PMID:26834919

Pay for Performance.

ERIC Educational Resources Information Center

LaFee, Scott

1999-01-01

Top school administrators and school boards across the country are increasingly employing a private-sector incentive: bonus pay for improved (school) performance. Connecticut, Texas, and North Carolina have merit-pay clauses in superintendents' contracts. This article discusses pay-for-performance criteria, increased job expectations, and ethical…

Single step production of Cas9 mRNA for zygote injection.

PubMed

Redel, Bethany K; Beaton, Benjamin P; Spate, Lee D; Benne, Joshua A; Murphy, Stephanie L; O'Gorman, Chad W; Spate, Anna M; Prather, Randall S; Wells, Kevin D

2018-03-01

Production of Cas9 mRNA in vitro typically requires the addition of a 5´ cap and 3´ polyadenylation. A plasmid was constructed that harbored the T7 promoter followed by the EMCV IRES and a Cas9 coding region. We hypothesized that the use of the metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1 (Malat1) triplex structure downstream of an IRES/Cas9 expression cassette would make polyadenylation of in vitro produced mRNA unnecessary. A sequence from the mMalat1 gene was cloned downstream of the IRES/Cas9 cassette described above. An mRNA concentration curve was constructed with either commercially available Cas9 mRNA or the IRES/ Cas9/triplex, by injection into porcine zygotes. Blastocysts were genotyped to determine if differences existed in the percent of embryos modified. The concentration curve identified differences due to concentration and RNA type injected. Single step production of Cas9 mRNA provides an alternative source of Cas9 for use in zygote injections.

Mutations in Cas9 Enhance the Rate of Acquisition of Viral Spacer Sequences during the CRISPR-Cas Immune Response.

PubMed

Heler, Robert; Wright, Addison V; Vucelja, Marija; Bikard, David; Doudna, Jennifer A; Marraffini, Luciano A

2017-01-05

CRISPR loci and their associated (Cas) proteins encode a prokaryotic immune system that protects against viruses and plasmids. Upon infection, a low fraction of cells acquire short DNA sequences from the invader. These sequences (spacers) are integrated in between the repeats of the CRISPR locus and immunize the host against the matching invader. Spacers specify the targets of the CRISPR immune response through transcription into short RNA guides that direct Cas nucleases to the invading DNA molecules. Here we performed random mutagenesis of the RNA-guided Cas9 nuclease to look for variants that provide enhanced immunity against viral infection. We identified a mutation, I473F, that increases the rate of spacer acquisition by more than two orders of magnitude. Our results highlight the role of Cas9 during CRISPR immunization and provide a useful tool to study this rare process and develop it as a biotechnological application. Copyright © 2017 Elsevier Inc. All rights reserved.

Survey of clustered regularly interspaced short palindromic repeats and their associated Cas proteins (CRISPR/Cas) systems in multiple sequenced strains of Klebsiella pneumoniae.

PubMed

Ostria-Hernández, Martha Lorena; Sánchez-Vallejo, Carlos Javier; Ibarra, J Antonio; Castro-Escarpulli, Graciela

2015-08-04

In recent years the emergence of multidrug resistant Klebsiella pneumoniae strains has been an increasingly common event. This opportunistic species is one of the five main bacterial pathogens that cause hospital infections worldwide and multidrug resistance has been associated with the presence of high molecular weight plasmids. Plasmids are generally acquired through horizontal transfer and therefore is possible that systems that prevent the entry of foreign genetic material are inactive or absent. One of these systems is CRISPR/Cas. However, little is known regarding the clustered regularly interspaced short palindromic repeats and their associated Cas proteins (CRISPR/Cas) system in K. pneumoniae. The adaptive immune system CRISPR/Cas has been shown to limit the entry of foreign genetic elements into bacterial organisms and in some bacteria it has been shown to be involved in regulation of virulence genes. Thus in this work we used bioinformatics tools to determine the presence or absence of CRISPR/Cas systems in available K. pneumoniae genomes. The complete CRISPR/Cas system was identified in two out of the eight complete K. pneumoniae genomes sequences and in four out of the 44 available draft genomes sequences. The cas genes in these strains comprises eight cas genes similar to those found in Escherichia coli, suggesting they belong to the type I-E group, although their arrangement is slightly different. As for the CRISPR sequences, the average lengths of the direct repeats and spacers were 29 and 33 bp, respectively. BLAST searches demonstrated that 38 of the 116 spacer sequences (33%) are significantly similar to either plasmid, phage or genome sequences, while the remaining 78 sequences (67%) showed no significant similarity to other sequences. The region where the CRISPR/Cas systems were located is the same in all the Klebsiella genomes containing it, it has a syntenic architecture, and is located among genes encoding for proteins likely involved in

Participation des médecins généralistes de la province de Benimellal (Maroc) dans le dépistage du cancer du col

PubMed Central

Nani, Samira; Benallal, Mohamed; Hassoune, Samira; Kissi, Dounia; Maaroufi, Abderrahmane

2013-01-01

Introduction Au Maroc, chaque année il y aurait environ 2000 nouveaux cas de cancer du col et les 2/3 des cas sont pris en charge à un stade très avancé. Nous avons mené une étude transversale, exhaustive incluant les 71 médecins généralistes exerçant dans les établissements de soins de santé de base du secteur public et privé de la province de Benimellal. Le but était d’évaluer leurs connaissances et leur participation au dépistage du cancer du col. Méthodes Nous avons mené une étude transversale, exhaustive incluant les 71 médecins généralistes exerçant dans les établissements de soins de santé de base du secteur public et privé de la province de Benimellal. Le but était d’évaluer leurs connaissances et leur participation au dépistage du cancer du col. Résultats Le niveau de connaissance était relativement modeste, 22 médecins généraliste avaient répondu à la question sur l'incidence du cancer du col au Maroc, Parmi eux (81,8%) avaient donné une réponse incorrecte. L'Herpes Papilloma virus comme facteur de risque du cancer du col a été identifié par seulement 21% des médecins généralistes. La participation au dépistage était également défaillante, 92,8% n'avaient jamais pratiqué le FCV chez leurs patientes à cause principalement du manque de formation (95,5%). Conclusion Les résultats montrent la nécessité d'améliorer les connaissances théoriques et pratique des médecins généralistes concernant le dépistage du cancer du col. PMID:23785557

A non-inheritable maternal Cas9-based multiple-gene editing system in mice.

PubMed

Sakurai, Takayuki; Kamiyoshi, Akiko; Kawate, Hisaka; Mori, Chie; Watanabe, Satoshi; Tanaka, Megumu; Uetake, Ryuichi; Sato, Masahiro; Shindo, Takayuki

2016-01-28

The CRISPR/Cas9 system is capable of editing multiple genes through one-step zygote injection. The preexisting method is largely based on the co-injection of Cas9 DNA (or mRNA) and guide RNAs (gRNAs); however, it is unclear how many genes can be simultaneously edited by this method, and a reliable means to generate transgenic (Tg) animals with multiple gene editing has yet to be developed. Here, we employed non-inheritable maternal Cas9 (maCas9) protein derived from Tg mice with systemic Cas9 overexpression (Cas9 mice). The maCas9 protein in zygotes derived from mating or in vitro fertilization of Tg/+ oocytes and +/+ sperm could successfully edit the target genome. The efficiency of such maCas9-based genome editing was comparable to that of zygote microinjection-based genome editing widely used at present. Furthermore, we demonstrated a novel approach to create "Cas9 transgene-free" gene-modified mice using non-Tg (+/+) zygotes carrying maCas9. The maCas9 protein in mouse zygotes edited nine target loci simultaneously after injection with nine different gRNAs alone. Cas9 mouse-derived zygotes have the potential to facilitate the creation of genetically modified animals carrying the Cas9 transgene, enabling repeatable genome engineering and the production of Cas9 transgene-free mice.

Chemical and Biophysical Modulation of Cas9 for Tunable Genome Engineering.

PubMed

Nuñez, James K; Harrington, Lucas B; Doudna, Jennifer A

2016-03-18

The application of the CRISPR-Cas9 system for genome engineering has revolutionized the ability to interrogate genomes of mammalian cells. Programming the Cas9 endonuclease to induce DNA breaks at specified sites is achieved by simply modifying the sequence of its cognate guide RNA. Although Cas9-mediated genome editing has been shown to be highly specific, cleavage events at off-target sites have also been reported. Minimizing, and eventually abolishing, unwanted off-target cleavage remains a major goal of the CRISPR-Cas9 technology before its implementation for therapeutic use. Recent efforts have turned to chemical biology and biophysical approaches to engineer inducible genome editing systems for controlling Cas9 activity at the transcriptional and protein levels. Here, we review recent advancements to modulate Cas9-mediated genome editing by engineering split-Cas9 constructs, inteins, small molecules, protein-based dimerizing domains, and light-inducible systems.

Excision of Nucleopolyhedrovirus Form Transgenic Silkworm Using the CRISPR/Cas9 System.

PubMed

Dong, Zhanqi; Dong, Feifan; Yu, Xinbo; Huang, Liang; Jiang, Yaming; Hu, Zhigang; Chen, Peng; Lu, Cheng; Pan, Minhui

2018-01-01

The CRISPR/Cas9-mediated genome engineering has been shown to efficiently suppress infection by disrupting genes of the pathogen. We recently constructed transgenic lines expressing CRISPR/Cas9 and the double sgRNA target Bombyx mori nucleopolyhedrovirus (BmNPV) immediate early-1 ( ie-1 ) gene in the silkworm, respectively, and obtained four transgenic hybrid lines by G1 generation hybridization: Cas9(-)/sgRNA(-), Cas9(+)/sgRNA(-), Cas9(-)/sgRNA(+), and Cas9(+)/sgRNA(+). We demonstrated that the Cas9(+)/sgRNA(+) transgenic lines effectively edited the target site of the BmNPV genome, and large fragment deletion was observed after BmNPV infection. Further antiviral analysis of the Cas9(+)/sgRNA(+) transgenic lines shows that the median lethal dose (LD50) is 1,000-fold higher than the normal lines after inoculation with occlusion bodies. The analysis of economic characters and off-target efficiency of Cas9(+)/sgRNA(+) transgenic hybrid line showed no significant difference compared with the normal lines. Our findings indicate that CRISPR/Cas9-mediated genome engineering more effectively targets the BmNPV genomes and could be utilized as an insect antiviral treatment.

Excision of Nucleopolyhedrovirus Form Transgenic Silkworm Using the CRISPR/Cas9 System

PubMed Central

Dong, Zhanqi; Dong, Feifan; Yu, Xinbo; Huang, Liang; Jiang, Yaming; Hu, Zhigang; Chen, Peng; Lu, Cheng; Pan, Minhui

2018-01-01

The CRISPR/Cas9-mediated genome engineering has been shown to efficiently suppress infection by disrupting genes of the pathogen. We recently constructed transgenic lines expressing CRISPR/Cas9 and the double sgRNA target Bombyx mori nucleopolyhedrovirus (BmNPV) immediate early-1 (ie-1) gene in the silkworm, respectively, and obtained four transgenic hybrid lines by G1 generation hybridization: Cas9(-)/sgRNA(-), Cas9(+)/sgRNA(-), Cas9(-)/sgRNA(+), and Cas9(+)/sgRNA(+). We demonstrated that the Cas9(+)/sgRNA(+) transgenic lines effectively edited the target site of the BmNPV genome, and large fragment deletion was observed after BmNPV infection. Further antiviral analysis of the Cas9(+)/sgRNA(+) transgenic lines shows that the median lethal dose (LD50) is 1,000-fold higher than the normal lines after inoculation with occlusion bodies. The analysis of economic characters and off-target efficiency of Cas9(+)/sgRNA(+) transgenic hybrid line showed no significant difference compared with the normal lines. Our findings indicate that CRISPR/Cas9-mediated genome engineering more effectively targets the BmNPV genomes and could be utilized as an insect antiviral treatment. PMID:29503634

5 CFR 550.1409 - Inapplicability of premium pay and aggregate pay caps.

Code of Federal Regulations, 2011 CFR

2011-01-01

... SERVICE REGULATIONS PAY ADMINISTRATION (GENERAL) Compensatory Time Off for Travel § 550.1409 Inapplicability of premium pay and aggregate pay caps. Accrued compensatory time off under this subpart is not...

5 CFR 550.1409 - Inapplicability of premium pay and aggregate pay caps.

Code of Federal Regulations, 2010 CFR

2010-01-01

... SERVICE REGULATIONS PAY ADMINISTRATION (GENERAL) Compensatory Time Off for Travel § 550.1409 Inapplicability of premium pay and aggregate pay caps. Accrued compensatory time off under this subpart is not...

5 CFR 550.1409 - Inapplicability of premium pay and aggregate pay caps.

Code of Federal Regulations, 2014 CFR

2014-01-01

... SERVICE REGULATIONS PAY ADMINISTRATION (GENERAL) Compensatory Time Off for Travel § 550.1409 Inapplicability of premium pay and aggregate pay caps. Accrued compensatory time off under this subpart is not...

5 CFR 550.1409 - Inapplicability of premium pay and aggregate pay caps.

Code of Federal Regulations, 2013 CFR

2013-01-01

... SERVICE REGULATIONS PAY ADMINISTRATION (GENERAL) Compensatory Time Off for Travel § 550.1409 Inapplicability of premium pay and aggregate pay caps. Accrued compensatory time off under this subpart is not...

5 CFR 550.1409 - Inapplicability of premium pay and aggregate pay caps.

Code of Federal Regulations, 2012 CFR

2012-01-01

... SERVICE REGULATIONS PAY ADMINISTRATION (GENERAL) Compensatory Time Off for Travel § 550.1409 Inapplicability of premium pay and aggregate pay caps. Accrued compensatory time off under this subpart is not...

Cas9 gRNA engineering for genome editing, activation and repression

DOE PAGES

Kiani, Samira; Chavez, Alejandro; Tuttle, Marcelle; ...

2015-09-07

Here we demonstrate that by altering the length of Cas9-associated guide RNA(gRNA) we were able to control Cas9 nuclease activity and simultaneously perform genome editing and transcriptional regulation with a single Cas9 protein. We exploited these principles to engineer mammalian synthetic circuits with combined transcriptional regulation and kill functions governed by a single multifunctional Cas9 protein.

CRISPR-Cas9 technology and its application in haematological disorders

PubMed Central

Zhang, Han; McCarty, Nami

2018-01-01

Summary The recent advent of the Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)-CRISPR associated protein 9 (Cas9) system for precise genome editing has revolutionized methodologies in haematology and oncology studies. CRISPR-Cas9 technology can be used to remove and correct genes or mutations, and to introduce site-specific therapeutic genes in human cells. Inherited haematological disorders represent ideal targets for CRISPR-Cas9-mediated gene therapy. Correcting disease-causing mutations could alleviate disease-related symptoms in the near future. The CRISPR-Cas9 system is also a useful tool for delineating molecular mechanisms involving haematological malignancies. Prior to the use of CRISPR-Cas9-mediated gene correction in humans, appropriate delivery systems with higher efficiency and specificity must be identified, and ethical guidelines for applying the technology with controllable safety must be established. Here, the latest applications of CRISPR-Cas9 technology in haematological disorders, current challenges and future directions are reviewed and discussed. PMID:27619566

CRISPR-Cas9 technology and its application in haematological disorders.

PubMed

Zhang, Han; McCarty, Nami

2016-10-01

The recent advent of the Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)-CRISPR associated protein 9 (Cas9) system for precise genome editing has revolutionized methodologies in haematology and oncology studies. CRISPR-Cas9 technology can be used to remove and correct genes or mutations, and to introduce site-specific therapeutic genes in human cells. Inherited haematological disorders represent ideal targets for CRISPR-Cas9-mediated gene therapy. Correcting disease-causing mutations could alleviate disease-related symptoms in the near future. The CRISPR-Cas9 system is also a useful tool for delineating molecular mechanisms involving haematological malignancies. Prior to the use of CRISPR-Cas9-mediated gene correction in humans, appropriate delivery systems with higher efficiency and specificity must be identified, and ethical guidelines for applying the technology with controllable safety must be established. Here, the latest applications of CRISPR-Cas9 technology in haematological disorders, current challenges and future directions are reviewed and discussed. © 2016 John Wiley & Sons Ltd.

Profiling of engineering hotspots identifies an allosteric CRISPR-Cas9 switch.

PubMed

Oakes, Benjamin L; Nadler, Dana C; Flamholz, Avi; Fellmann, Christof; Staahl, Brett T; Doudna, Jennifer A; Savage, David F

2016-06-01

The clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats (CRISPR)-associated protein Cas9 from Streptococcus pyogenes is an RNA-guided DNA endonuclease with widespread utility for genome modification. However, the structural constraints limiting the engineering of Cas9 have not been determined. Here we experimentally profile Cas9 using randomized insertional mutagenesis and delineate hotspots in the structure capable of tolerating insertions of a PDZ domain without disruption of the enzyme's binding and cleavage functions. Orthogonal domains or combinations of domains can be inserted into the identified sites with minimal functional consequence. To illustrate the utility of the identified sites, we construct an allosterically regulated Cas9 by insertion of the estrogen receptor-α ligand-binding domain. This protein showed robust, ligand-dependent activation in prokaryotic and eukaryotic cells, establishing a versatile one-component system for inducible and reversible Cas9 activation. Thus, domain insertion profiling facilitates the rapid generation of new Cas9 functionalities and provides useful data for future engineering of Cas9.

Mr.CAS-A minimalistic (pure) Ruby CAS for fast prototyping and code generation

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Ragni, Matteo

There are Computer Algebra System (CAS) systems on the market with complete solutions for manipulation of analytical models. But exporting a model that implements specific algorithms on specific platforms, for target languages or for particular numerical library, is often a rigid procedure that requires manual post-processing. This work presents a Ruby library that exposes core CAS capabilities, i.e. simplification, substitution, evaluation, etc. The library aims at programmers that need to rapidly prototype and generate numerical code for different target languages, while keeping separated mathematical expression from the code generation rules, where best practices for numerical conditioning are implemented. The library is written in pure Ruby language and is compatible with most Ruby interpreters.

Cas9-mediated targeting of viral RNA in eukaryotic cells.

PubMed

Price, Aryn A; Sampson, Timothy R; Ratner, Hannah K; Grakoui, Arash; Weiss, David S

2015-05-12

Clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats-CRISPR associated (CRISPR-Cas) systems are prokaryotic RNA-directed endonuclease machineries that act as an adaptive immune system against foreign genetic elements. Using small CRISPR RNAs that provide specificity, Cas proteins recognize and degrade nucleic acids. Our previous work demonstrated that the Cas9 endonuclease from Francisella novicida (FnCas9) is capable of targeting endogenous bacterial RNA. Here, we show that FnCas9 can be directed by an engineered RNA-targeting guide RNA to target and inhibit a human +ssRNA virus, hepatitis C virus, within eukaryotic cells. This work reveals a versatile and portable RNA-targeting system that can effectively function in eukaryotic cells and be programmed as an antiviral defense.

Cas9-mediated targeting of viral RNA in eukaryotic cells

PubMed Central

Price, Aryn A.; Sampson, Timothy R.; Ratner, Hannah K.; Grakoui, Arash; Weiss, David S.

2015-01-01

Clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats–CRISPR associated (CRISPR-Cas) systems are prokaryotic RNA-directed endonuclease machineries that act as an adaptive immune system against foreign genetic elements. Using small CRISPR RNAs that provide specificity, Cas proteins recognize and degrade nucleic acids. Our previous work demonstrated that the Cas9 endonuclease from Francisella novicida (FnCas9) is capable of targeting endogenous bacterial RNA. Here, we show that FnCas9 can be directed by an engineered RNA-targeting guide RNA to target and inhibit a human +ssRNA virus, hepatitis C virus, within eukaryotic cells. This work reveals a versatile and portable RNA-targeting system that can effectively function in eukaryotic cells and be programmed as an antiviral defense. PMID:25918406

Déclenchement du travail à terme par le misoprostol: expérience d'une maternité tunisienne

PubMed Central

Ouerdiane, Nadia; Tlili, Nihel; Othmani, Kaouther; Daaloul, Walid; Masmoudi, Abdelwaheb; Hamouda, Sonia Ben; Bouguerra, Badreddine

2016-01-01

Evaluer l'efficacité et l'innocuité de l'utilisation du misoprostol par voie vaginale pour le déclenchement du travail à terme. Etude prospective réalisée au service de gynécologie obstétrique B de l'hôpital Charles Nicolle de Tunis sur une durée de 4 mois. La population sélectionnée concernait les patientes à terme devant bénéficier d'une maturation cervicale. Le misoprostol à la dose de 50 µg par voie vaginale toutes les 12 h était utilisé. Les paramètres étudiés étaient les anomalies contractiles, les anomalies du RCF, le mode d'accouchement, le délai d'accouchement et l’état néonatal. 44 patientes ont bénéficié d'une maturation cervicale par misoprostol. Le terme moyen était de 40 SA. Le taux de nullipare était de 23/44 (52%). Le taux d'accouchement par voie basse était de 31/44 (70.4%). 84% des patientes ont reçu une seule dose de misoprostol. Les anomalies du RCF ont été notées dans 14/44 (32%). Le taux de liquides méconiaux était de 12/44 (27%). Un score d'Apgar à 5 mn inférieur à 7 était noté chez 7/44 (16%). Un cas de rupture utérine était survenue chez une primipare et ce après une seule prise de misoprostol. Nos résultats sont décevants en raison de la survenue d'une rupture utérine et d'une morbidité néonatale importante. D'autres études prospectives multicentriques restent utiles pour mieux s'assurer de l'efficacité mais surtout de l'innocuité du misoprostol à dose faible pour le déclenchement du travail à terme. PMID:27583092

An updated evolutionary classification of CRISPR–Cas systems

PubMed Central

Makarova, Kira S.; Wolf, Yuri I.; Alkhnbashi, Omer S.; Costa, Fabrizio; Shah, Shiraz A.; Saunders, Sita J.; Barrangou, Rodolphe; Brouns, Stan J. J.; Charpentier, Emmanuelle; Haft, Daniel H.; Horvath, Philippe; Moineau, Sylvain; Mojica, Francisco J. M.; Terns, Rebecca M.; Terns, Michael P.; White, Malcolm F.; Yakunin, Alexander F.; Garrett, Roger A.; van der Oost, John; Backofen, Rolf; Koonin, Eugene V.

2017-01-01

The evolution of CRISPR–cas loci, which encode adaptive immune systems in archaea and bacteria, involves rapid changes, in particular numerous rearrangements of the locus architecture and horizontal transfer of complete loci or individual modules. These dynamics complicate straightforward phylogenetic classification, but here we present an approach combining the analysis of signature protein families and features of the architecture of cas loci that unambiguously partitions most CRISPR–cas loci into distinct classes, types and subtypes. The new classification retains the overall structure of the previous version but is expanded to now encompass two classes, five types and 16 subtypes. The relative stability of the classification suggests that the most prevalent variants of CRISPR–Cas systems are already known. However, the existence of rare, currently unclassifiable variants implies that additional types and subtypes remain to be characterized. PMID:26411297

Tuberculose cutanée à Bamako, Mali

PubMed Central

Dicko, Adama; Faye, Ousmane; Fofana, Youssouf; Soumoutera, Moussa; Berthé, Siritio; Touré, Saidou; Traoré, Bekaye; Guindo, Binta; Tall, Koureissi; Keita, Alimata; Kéita, Lassine; Coulibaly, Karim; Keita, Somita

2017-01-01

Introduction La tuberculose est la mycobactériose la plus fréquente en Afrique subsaharienne. La localisation cutanée est rare et sous diagnostiquée à cause de son polymorphisme clinique et la faiblesse du plateau technique. Le but de cette étude était de décrire les aspects épidémiologiques, cliniques, histopathologiques de la tuberculose cutanée à Bamako (Mali). Méthodes De janvier 1991 à décembre 2008 nous avons réalisé une étude transversale descriptive. L’étude s’est déroulée dans le service de Dermatologie du Centre National d’Appui à la lutte contre la Maladie et le service de Pneumo-phtisiologie au l’hôpital du Point G. Ont été inclus dans l’étude les cas de tuberculose confirmés par l’histologie et ou la biologie. Résultats Sur 4269 dossiers, 61 cas de tuberculose cutanée étaient recensées (1,43%). Les hommes représentaient 59% des cas (36 malades) et les femmes 41 % soit (25 cas); soit un sex-ratio de 1,44. L’âge des malades variait de 3 mois à 61 ans pour une moyenne de 27,56 ± 36 ans. La durée d’évolution était en moyenne de 10,9 ± 10 mois. Les formes cliniques recensées étaient le scrofuloderme (41 cas), la forme ulcéreuse (13 cas), la forme verruqueuse (4 cas), et le lupus tuberculeux (3 cas). La tuberculose était associée au VIH dans 7 cas, à la lèpre dans 3 cas. Conclusion La tuberculose cutanée est sous diagnostiquée au Mali. Des efforts sont nécessaires pour améliorer l’accessibilité et le plateau technique des services spécialisés, pour mener une étude approfondie interdisciplinaire sur cette pathologie. PMID:28819523

Cornerstones of CRISPR-Cas in drug development and therapy

PubMed Central

Fellmann, Christof; Gowen, Benjamin G.; Lin, Pei-Chun; Doudna, Jennifer A.; Corn, Jacob E.

2017-01-01

The recent development of CRISPR-Cas systems as easily accessible and programmable tools for genome editing and regulation is spurring a revolution in biology. Paired with the rapid expansion of personalized and reference genomic sequence information, technologies based on CRISPR-Cas are enabling nearly unlimited genetic manipulation even in previously difficult contexts, including human cells. Although much attention has focused on the potential of CRISPR-Cas to cure Mendelian diseases, the technology also holds promise to transform the development of therapies to treat complex heritable and somatic disorders. Here we discuss how CRISPR-Cas can impact the next generation of drugs through accelerating the identification and validation of high-value targets, uncovering high confidence biomarkers and developing differentiated breakthrough therapies. We focus on the promises, pitfalls and hurdles of this revolutionary gene editing technology, and also discuss key aspects of different CRISPR-Cas screening platforms and offer our perspectives on the best practices in genome engineering. PMID:28008168

Temperature effect on CRISPR-Cas9 mediated genome editing.

PubMed

Xiang, Guanghai; Zhang, Xingying; An, Chenrui; Cheng, Chen; Wang, Haoyi

2017-04-20

Zinc-finger nuclease (ZFN), transcription activator-like effector nuclease (TALEN), and clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9 (CRISPR-Cas9) are the most commonly used genome editing tools. Previous studies demonstrated that hypothermia treatment increased the mutation rates induced by ZFNs and TALENs in mammalian cells. Here, we characterize the effect of different culture temperatures on CRISPR-Cas9 mediated genome editing and find that the genome editing efficiency of CRISPR-Cas9 is significantly hampered by hypothermia treatment, unlike ZFN and TALEN. In addition, hyperthermia culture condition enhances genome editing by CRISPR-Cas9 in some cell lines, due to the higher enzyme activity and sgRNA expression level at higher temperature. Our study has implications on CRISPR-Cas9 applications in a broad spectrum of species, many of which do not live at 37°C. Copyright © 2017 Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, and Genetics Society of China. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.

Torsion d'annexe au second trimestre de la grossesse, à propos de deux cas

PubMed Central

Ayachi, Amira; Blel, Zeineb; Khelifa, Nahed; Mkaouer, Lassaad; Bouchahda, Rim; Mourali, Mechaal

2016-01-01

Les douleurs pelviennes aigues pendant la grossesse peuvent poser un problème de diagnostic différentiel.Nous rapportons deux cas de torsion d'annexes au deuxième trimestre de la grossesse afin d'attirer l'attention sur ce diagnostic, dont seule une prise en charge précoce permet d'éviter des lésions irréversibles dues à l'ischémie, pouvant mettre en jeu le pronostic ultérieur de fertilité. La première patiente, G1P0, enceinte à 20 SA, s'est présenté initialement pour un syndrome appendiculaire. Une incision de Mac Burney, au cours de l'exploration, a montré un ovaire droit nécrosé et une ovariectomie a été faite. Les suites post opératoires étaient simples. La seconde patiente, G2P2, s'est présenté aux urgences avec des douleurs aigues de la fosse iliaque gauche à 26 SA. La laparotomie a mis en évidence une torsion d'une hydatide de Morgani, dont l'aspect nécrosé dû à une torsion, a orienté vers une ablation de l'hydatide. Pour les deux patientes, aucune complication postopératoire n'a été relevée. La torsion d'annexe est une urgence à ne pas méconnaître devant toute douleur pelvienne aigue chez la femme enceinte. Le traitement conservateur est actuellement le gold standard et une prise en charge appropriée est nécessaire pour éviter d'éventuelles complications maternelles et fœtales. PMID:28292076

Cas9, Cpf1 and C2c1/2/3-What's next?

PubMed

Nakade, Shota; Yamamoto, Takashi; Sakuma, Tetsushi

2017-05-04

Since the rapid emergence of clustered regulatory interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-CRISPR-associated protein 9 (Cas9) system, developed as a genome engineering tool in 2012-2013, most researchers in the life science field have had a fixated interest in this fascinating technology. CRISPR-Cas9 is an RNA-guided DNA endonuclease system, which consists of Cas9 nuclease defining a few targeting base via protospacer adjacent motif complexed with easily customizable single guide RNA targeting around 20-bp genomic sequence. Although Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9), one of the Cas9 proteins that applications in genome engineering were first demonstrated, still has wide usage because of its high nuclease activity and broad targeting range, there are several limitations such as large molecular weight and potential off-target effect. In this commentary, we describe various improvements and alternatives of CRISPR-Cas systems, including engineered Cas9 variants, Cas9 homologs, and novel Cas proteins other than Cas9. These variations enable flexible genome engineering with high efficiency and specificity, orthogonal genetic control at multiple gene loci, gene knockdown, or fluorescence imaging of transcripts mediated by RNA targeting, and beyond.

Les Cicatrices Retractiles Post-Brulures Du Membre Inferieur Chez L’Enfant

PubMed Central

Sankale, A.A.; Manyacka Ma Nyemb, P.; Coulibaly, N.F.; Ndiaye, A.; Ndoye, M.

2010-01-01

Summary Il s'agit d'une étude faisant ressortir les aspects épidémiologiques, cliniques et thérapeutiques des séquelles de brûlures du membre inférieur chez l'enfant, à propos de 42 cas colligés au service de chirurgie infantile de l'Hôpital Aristide Le Dantec (Sénégal). L'âge moyen retrouvé est de 5 ans et 3 mois, et le sex-ratio garçons/filles de 1,8/1. La brûlure thermique est causée par une flamme dans 33% des cas, par un liquide chaud dans 21% des cas, et par des braises dans 21% des cas. Les cicatrices rétractiles intéressent le genou et le creux poplité dans 47% des cas et le pied dans 45% des cas. Elles sont bilatérales dans 21% des cas, et concernent une autre localisation associée dans 21% des cas. Quant aux brides, 21% ont bénéficié d'une chirurgie, avec un délai moyen de 3 ans et 2 mois après la brûlure. Cette procédure chirurgicale consiste en une plastie en Z dans 91% des cas, à laquelle est associée une greffe de peau dans 54% des cas. Une rééducation fonctionnelle est pratiquée chez 54% des opérés. Parallèlement aux données de la littérature, nos résultats montrent que l'optimisation de la prise en charge passe par une meilleure prévention des accidents domestiques et une bonne codification thérapeutique. PMID:21991202

Efficient CRISPR/Cas9-based gene knockout in watermelon.

PubMed

Tian, Shouwei; Jiang, Linjian; Gao, Qiang; Zhang, Jie; Zong, Mei; Zhang, Haiying; Ren, Yi; Guo, Shaogui; Gong, Guoyi; Liu, Fan; Xu, Yong

2017-03-01

CRISPR/Cas9 system can precisely edit genomic sequence and effectively create knockout mutations in T0 generation watermelon plants. Genome editing offers great advantage to reveal gene function and generate agronomically important mutations to crops. Recently, RNA-guided genome editing system using the type II clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated protein 9 (Cas9) has been applied to several plant species, achieving successful targeted mutagenesis. Here, we report the genome of watermelon, an important fruit crop, can also be precisely edited by CRISPR/Cas9 system. ClPDS, phytoene desaturase in watermelon, was selected as the target gene because its mutant bears evident albino phenotype. CRISPR/Cas9 system performed genome editing, such as insertions or deletions at the expected position, in transfected watermelon protoplast cells. More importantly, all transgenic watermelon plants harbored ClPDS mutations and showed clear or mosaic albino phenotype, indicating that CRISPR/Cas9 system has technically 100% of genome editing efficiency in transgenic watermelon lines. Furthermore, there were very likely no off-target mutations, indicated by examining regions that were highly homologous to sgRNA sequences. Our results show that CRISPR/Cas9 system is a powerful tool to effectively create knockout mutations in watermelon.

[CAS in rhino-surgical procedures in the growing age].

PubMed

Schipper, J; Maier, W; Gellrich, N-C; Arapakis, I; Hochmuth, A; Laszig, R

2005-01-01

Rhinosurgery in children and adolescents meets special requirements: Limited cooperation and reduced limits for the organ dose for ionizing radiological examinations aggravate diagnostics. On the other side, bone sutures and bone growth areas have to be respected intraoperatively, and regions of bones not yet calcified have to be distinguished from possible tumor infiltration. Computer assisted surgery (CAS) can help to identify these areas safely. 5 patients, from the first to the 20 (th) year of life, suffering from tumors, malformation syndromes or therapy resistant nasal polyposis were treated with CAS in rhinosurgery. In addition to radiological diagnostics, we performed 3D computed tomography of the skull for CAS. CAS enabled us to intraoperatively respect possible areas of bone growth, to identify regions with thin, not bonily developed cranial vault and to safely distinguish bone sutures from ethmoidal cells. CAS helped the surgeon to navigate in the not yet developed paranasal sinus system. CAS is a useful complementary method in rhinosurgery of the developing skull of the child. In spite of the additional 3D computed tomography, the calculated organ dose of the ocular lense amounted to 5 millisievert, so a recommended maximal organ dose for the ocular lense of 15 millisievert was not exceeded.

Rupture utérine sur utérus bicorne à 12 semaines d'aménorrhée: à propos d'un cas

PubMed Central

Itchimouh, Sanaa; Khabtou, Karima; Mahdaoui, Sakher; Boufettal, Houssine; Samouh, Naima

2016-01-01

La fréquence des malformations utérines ayant un impact sur la reproduction est difficile à apprécier. Leur mise en évidence nécessite un bilan spécifique (hystérosalpingographie, hystéroscopie, cœlioscopie). La fertilité spontanée peut être altérée en fonction du type d'anomalie utérine. Toutes ces anomalies peuvent avoir des répercussions sur l’évolution de la conception à type de fausses couches précoces et tardives, de grossesse extra utérine, de menace d'accouchement prématuré, d'accouchement prématuré, de pathologies vasculaires gravidiques et de retard de croissance intra-utérin. L'utérus bicorne est la plus connue des malformations et représente environ la moitié des anomalies de l'utérus. La survenue d'une telle grossesse constitue une situation à risque pouvant entraîner une mort maternelle, mais le diagnostic précoce et un bon suivi peut mener des grossesses à terme sur des utérus malformé. Le dépistage échographique devrait permettre la détection systématique de ce genre de cas afin de prendre préventivement les mesures qui s'imposent. Nous rapportons un cas de rupture utérine sur utérus bicorne unicervical sur grossesse à 12 semaines d'aménorrhée. PMID:27642490

Cancer du sein au Maroc: profil phénotypique des tumeurs

PubMed Central

Khalil, Ahmadaye Ibrahim; Bendahhou, Karima; Mestaghanmi, Houriya; Saile, Rachid; Benider, Abdellatif

2016-01-01

Le cancer du sein est le plus fréquent chez la femme et figure parmi les principales causes de mortalité liées au cancer. La curabilité de ce type tumoral est en augmentation, grâce aux programmes de dépistage et aux progrès thérapeutiques, qui ont certes augmenté la survie des patients. Mais des défis restent à relever en rapport avec l’instabilité phénotypique des cellules cancéreuses. L’objectif de ce travail est d’étudier le profil phénotypique du cancer du sein chez les patients pris en charge au Centre Mohammed VI pour le traitement des Cancers, durant les années 2013-2014. Il s’agit d’une étude transversale sur deux années, incluant les cas du cancer du sein pris en charge au Centre. Le recueil des données était fait à partir des dossiers des patients et analysés par le logiciel Epi Info. 1277 patients ont été pris en charge au sein de notre centre. 99,5% des cas de sexe féminin, l’âge moyen était 50,20 ± 11,34 ans. Le type histologique le plus fréquent était le carcinome canalaire infiltrant (80,7% des cas). Le stade diagnostic était précoce (56,9%). Le phénotype moléculaire le plus fréquent était le luminal A (41,4% des cas). Le luminal B, le HER2 et les triples négatifs étaient dans respectivement 10,4%, 6,3%, 11,2% des cas. L’étude du phénotype tumoral des patients atteints du cancer du sein permet l’orientation du clinicien dans le choix du traitement, et des décideurs dans la planification de programmes de lutte contre cette pathologie. PMID:28292037

Évolution des conditions d’initiation du traitement antirétroviral des patients infectés par le VIH en Afrique de l’Ouest

PubMed Central

Bashi, J.; Balestre, E.; Messou, E.; Maiga, M.; Coffie, P.A.; Zannou, D.M.; Ba-Gomis, O.; Traore, H.A.; Eholie, S.; Minga, A.; Sow, P.S.; Bissagnene, E.; Dabis, F.; Ekouevi, D.K.

2013-01-01

Résumé Objectif Étudier entre 1996 et 2006, l’évolution des schémas thérapeutiques et du profil clinique et immunologique des patients infectés par le VIH au début du traitement antirétroviral (TARV) en Afrique de l’Ouest. Cadre et méthode Les données issues de 12 centres cliniques adultes (IeDEA West Africa réseau collaboratif de prise en charge de l’infection à VIH) de cinq pays (Bénin, Cote d’Ivoire, Sénégal, Gambie, Mali) ont été mises en commun et analysées. Les patients âgés de 16 ans et plus dont le sexe, la date de naissance et la date d’initiation du TARV étaient connus ont été inclus dans cette étude. Résultats Quatorze mille quatre-cent-quatre-vingt-seize patients avaient débuté un TARV entre 1996–2006 avec 55 % des patients l’ayant débuté entre 2005–2006. La proportion de femmes était de 46 % en 1996–2000 et de 63 % en 2005–2006. L’âge médian à la mise sous traitement était constant: 35 ans chez les femmes et 40 ans chez les hommes. La proportion de patients qui ont débuté le TARV avec un taux de CD4 inférieur à 200 cellules/µl était de 54 % en 1996–2000 et de 64 % en 2005–2006. Les combinaisons thérapeutiques les plus prescrites étaient: AZT/3TC (ou d4T/DDI)/IDV (27 %) en 1996–2000; d4T (ou AZT)/3TC/EFV (59 %) en 2003–2004; et d4T/3TC/NVP (49 %) en 2005–2006. Les traitements de première ligne recommandés par l’OMS étaient débutés dans 83 % de cas en 2005–2006. Conclusion De nouvelles approches pour débuter un TARV plus précocement doivent être développées pour améliorer la survie des patients sous TARV. PMID:20045273

Relationship between drug resistance and the clustered, regularly interspaced, short, palindromic repeat-associated protein genes cas1 and cas2 in Shigella from giant panda dung

PubMed Central

Ren, Lu; Deng, Lin-Hua; Zhang, Ri-Peng; Wang, Cheng-Dong; Li, De-Sheng; Xi, Li-Xin; Chen, Zhen-rong; Yang, Rui; Huang, Jie; Zeng, Yang-ru; Wu, Hong-Lin; Cao, San-Jie; Wu, Rui; Huang, Yong; Yan, Qi-Gui

2017-01-01

Abstract Background: To detect drug resistance in Shigella obtained from the dung of the giant panda, explore the factors leading to drug resistance in Shigella, understand the characteristics of clustered, regularly interspaced, short, palindromic repeats (CRISPR), and assess the relationship between CRISPR and drug resistance. Methods: We collected fresh feces from 27 healthy giant pandas in the Giant Panda Conservation base (Wolong, China). We identified the strains of Shigella in the samples by using nucleotide sequence analysis. Further, the Kirby-Bauer paper method was used to determine drug sensitivity of the Shigella strains. CRISPR-associated protein genes cas1 and cas2 in Shigella were detected by polymerase chain reaction (PCR), and the PCR products were sequenced and compared. Results: We isolated and identified 17 strains of Shigella from 27 samples, including 14 strains of Shigella flexneri, 2 strains of Shigella sonnei, and 1 strain of Shigella dysenteriae. Further, drug resistance to cefazolin, imipenem, and amoxicillin–clavulanic acid was identified as a serious problem, as multidrug-resistant strains were detected. Further, cas1 and cas2 showed different degrees of point mutations. Conclusion: The CRISPR system widely exists in Shigella and shares homology with that in Escherichia coli. The cas1 and cas 2 mutations contribute to the different levels of resistance. Point mutations at sites 3176455, 3176590, and 3176465 in cas1 (a); sites 3176989, 3176992, and 3176995 in cas1 (b); sites 3176156 and 3176236 in cas2 may affect the resistance of bacteria, cause emergence of multidrug resistance, and increase the types of drug resistance. PMID:28207509

Relationship between drug resistance and the clustered, regularly interspaced, short, palindromic repeat-associated protein genes cas1 and cas2 in Shigella from giant panda dung.

PubMed

Ren, Lu; Deng, Lin-Hua; Zhang, Ri-Peng; Wang, Cheng-Dong; Li, De-Sheng; Xi, Li-Xin; Chen, Zhen-Rong; Yang, Rui; Huang, Jie; Zeng, Yang-Ru; Wu, Hong-Lin; Cao, San-Jie; Wu, Rui; Huang, Yong; Yan, Qi-Gui

2017-02-01

To detect drug resistance in Shigella obtained from the dung of the giant panda, explore the factors leading to drug resistance in Shigella, understand the characteristics of clustered, regularly interspaced, short, palindromic repeats (CRISPR), and assess the relationship between CRISPR and drug resistance. We collected fresh feces from 27 healthy giant pandas in the Giant Panda Conservation base (Wolong, China). We identified the strains of Shigella in the samples by using nucleotide sequence analysis. Further, the Kirby-Bauer paper method was used to determine drug sensitivity of the Shigella strains. CRISPR-associated protein genes cas1 and cas2 in Shigella were detected by polymerase chain reaction (PCR), and the PCR products were sequenced and compared. We isolated and identified 17 strains of Shigella from 27 samples, including 14 strains of Shigella flexneri, 2 strains of Shigella sonnei, and 1 strain of Shigella dysenteriae. Further, drug resistance to cefazolin, imipenem, and amoxicillin-clavulanic acid was identified as a serious problem, as multidrug-resistant strains were detected. Further, cas1 and cas2 showed different degrees of point mutations. The CRISPR system widely exists in Shigella and shares homology with that in Escherichia coli. The cas1 and cas 2 mutations contribute to the different levels of resistance. Point mutations at sites 3176455, 3176590, and 3176465 in cas1 (a); sites 3176989, 3176992, and 3176995 in cas1 (b); sites 3176156 and 3176236 in cas2 may affect the resistance of bacteria, cause emergence of multidrug resistance, and increase the types of drug resistance.

Behind the Pay Gap

ERIC Educational Resources Information Center

Dey, Judy Goldberg; Hill, Catherine

2007-01-01

Women have made remarkable gains in education during the past three decades, yet these achievements have resulted in only modest improvements in pay equity. The gender pay gap has become a fixture of the U.S. workplace and is so ubiquitous that many simply view it as normal. "Behind the Pay Gap" examines the gender pay gap for college graduates.…

5 CFR 9901.212 - Pay schedules and pay bands.

Code of Federal Regulations, 2010 CFR

2010-01-01

... Section 9901.212 Administrative Personnel DEPARTMENT OF DEFENSE HUMAN RESOURCES MANAGEMENT AND LABOR RELATIONS SYSTEMS (DEPARTMENT OF DEFENSE-OFFICE OF PERSONNEL MANAGEMENT) DEPARTMENT OF DEFENSE NATIONAL... Secretary may establish one or more pay schedules within each career group. (b) Each pay schedule may...

Comparative analysis of CRISPR-Cas systems in Klebsiella genomes.

PubMed

Shen, Juntao; Lv, Li; Wang, Xudong; Xiu, Zhilong; Chen, Guoqiang

2017-04-01

Prokaryotic CRISPR-Cas system provides adaptive immunity against invasive genetic elements. Bacteria of the genus Klebsiella are important nosocomial opportunistic pathogens. However, information of CRISPR-Cas system in Klebsiella remains largely unknown. Here, we analyzed the CRISPR-Cas systems of 68 complete genomes of Klebsiella representing four species. All the elements for CRISPR-Cas system (cas genes, repeats, leader sequences, and PAMs) were characterized. Besides the typical Type I-E and I-F CRISPR-Cas systems, a new Subtype I system located in the ABC transport system-glyoxalase region was found. The conservation of the new subtype CRISPR system between different species showed new evidence for CRISPR horizontal transfer. CRISPR polymorphism was strongly correlated both with species and multilocus sequence types. Some results indicated the function of adaptive immunity: most spacers (112 of 124) matched to prophages and plasmids and no matching housekeeping genes; new spacer acquisition was observed within the same sequence type (ST) and same clonal complex; the identical spacers were observed only in the ancient position (far from the leader) between different STs and clonal complexes. Interestingly, a high ratio of self-targeting spacers (7.5%, 31 of 416) was found in CRISPR-bearing Klebsiella pneumoniae (61%, 11 of 18). In some strains, there even were multiple full matching self-targeting spacers. Some self-targeting spacers were conserved even between different STs. These results indicated that some unknown mechanisms existed to compromise the function of self-targets of CRISPR-Cas systems in K. pneumoniae. © 2017 WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim.

CRISPR/Cas9-mediated noncoding RNA editing in human cancers.

PubMed

Yang, Jie; Meng, Xiaodan; Pan, Jinchang; Jiang, Nan; Zhou, Chengwei; Wu, Zhenhua; Gong, Zhaohui

2018-01-02

Cancer is characterized by multiple genetic and epigenetic alterations, including a higher prevalence of mutations of oncogenes and/or tumor suppressors. Mounting evidences have shown that noncoding RNAs (ncRNAs) are involved in the epigenetic regulation of cancer genes and their associated pathways. The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated nuclease 9 (CRISPR/Cas9) system, a revolutionary genome-editing technology, has shed light on ncRNA-based cancer therapy. Here, we briefly introduce the classifications and mechanisms of CRISPR/Cas9 system. Importantly, we mainly focused on the applications of CRISPR/Cas9 system as a molecular tool for ncRNA (microRNA, long noncoding RNA and circular RNA, etc.) editing in human cancers, and the novel techniques that are based on CRISPR/Cas9 system. Additionally, the off-target effects and the corresponding solutions as well as the challenges toward CRISPR/Cas9 were also evaluated and discussed. Long- and short-ncRNAs have been employed as targets in precision oncology, and CRISPR/Cas9-mediated ncRNA editing may provide an excellent way to cure cancer.

CAS or Pen-and-Paper: Factors That Influence Students' Choices

ERIC Educational Resources Information Center

Cameron, Scott; Ball, Lynda

2015-01-01

This paper reports on a study of choices about the use of a computer algebra system (CAS) or pen-and-paper (p&p) by a class of seven Year 11 Mathematical Methods (CAS) students as they completed a calculus worksheet. Factors that influenced students' choices are highlighted by comparing and contrasting the use of CAS and p&p between…

L'Apport de la Greffe de Peau Totale dans le Traitement des Sequelles des Brulures de la Main: a Propos de 14 Cas

PubMed Central

Ettalbi, S.; Ibnouzahir, M.; Rachid, M.; Bahaichar, N.; Boukind, H.

2007-01-01

Summary La main est fréquemment exposée aux brûlures, ce qui entraîne des séquelles cutanées. A partir d'une série de 14 patients suivis dans notre service sur une année, nous avons essayé d'établir la simplicité, l'efficacité et le rôle de la greffe de peau totale dans le traitement de ces séquelles (les organes nobles ne sont pas mis à nu). La greffe de peau totale associée à une rééducation efficace permet aux patients de reprendre la mobilité des mains dans les brefs délais. PMID:21991094

Using CRISPR-Cas9 to Study ERK Signaling in Drosophila.

PubMed

Forés, Marta; Papagianni, Aikaterini; Rodríguez-Muñoz, Laura; Jiménez, Gerardo

2017-01-01

Genome engineering using the clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-CRISPR associated nuclease 9 (Cas9) technology is revolutionizing biomedical research. CRISPR-Cas9 enables precise editing of genes in a wide variety of cells and organisms, thereby accelerating molecular studies via targeted mutagenesis, epitope tagging, and other custom genetic modifications. Here, we illustrate the CRISPR-Cas9 methodology by focusing on Capicua (Cic), a nuclear transcriptional repressor directly phosphorylated and inactivated by ERK/MAPK. Specifically, we use CRISPR-Cas9 for targeting an ERK docking site of Drosophila Cic, thus generating ERK-insensitive mutants of this important signaling sensor.

Promoting Cas9 degradation reduces mosaic mutations in non-human primate embryos

PubMed Central

Tu, Zhuchi; Yang, Weili; Yan, Sen; Yin, An; Gao, Jinquan; Liu, Xudong; Zheng, Yinghui; Zheng, Jiezhao; Li, Zhujun; Yang, Su; Li, Shihua; Guo, Xiangyu; Li, Xiao-Jiang

2017-01-01

CRISPR-Cas9 is a powerful new tool for genome editing, but this technique creates mosaic mutations that affect the efficiency and precision of its ability to edit the genome. Reducing mosaic mutations is particularly important for gene therapy and precision genome editing. Although the mechanisms underlying the CRSIPR/Cas9-mediated mosaic mutations remain elusive, the prolonged expression and activity of Cas9 in embryos could contribute to mosaicism in DNA mutations. Here we report that tagging Cas9 with ubiquitin-proteasomal degradation signals can facilitate the degradation of Cas9 in non-human primate embryos. Using embryo-splitting approach, we found that shortening the half-life of Cas9 in fertilized zygotes reduces mosaic mutations and increases its ability to modify genomes in non-human primate embryos. Also, injection of modified Cas9 in one-cell embryos leads to live monkeys with the targeted gene modifications. Our findings suggest that modifying Cas9 activity can be an effective strategy to enhance precision genome editing. PMID:28155910

CRISPR-Cas-Mediated Phage Resistance Enhances Horizontal Gene Transfer by Transduction.

PubMed

Watson, Bridget N J; Staals, Raymond H J; Fineran, Peter C

2018-02-13

A powerful contributor to prokaryotic evolution is horizontal gene transfer (HGT) through transformation, conjugation, and transduction, which can be advantageous, neutral, or detrimental to fitness. Bacteria and archaea control HGT and phage infection through CRISPR-Cas (clustered regularly interspaced short palindromic repeats-CRISPR-associated proteins) adaptive immunity. Although the benefits of resisting phage infection are evident, this can come at a cost of inhibiting the acquisition of other beneficial genes through HGT. Despite the ability of CRISPR-Cas to limit HGT through conjugation and transformation, its role in transduction is largely overlooked. Transduction is the phage-mediated transfer of bacterial DNA between cells and arguably has the greatest impact on HGT. We demonstrate that in Pectobacterium atrosepticum , CRISPR-Cas can inhibit the transduction of plasmids and chromosomal loci. In addition, we detected phage-mediated transfer of a large plant pathogenicity genomic island and show that CRISPR-Cas can inhibit its transduction. Despite these inhibitory effects of CRISPR-Cas on transduction, its more common role in phage resistance promotes rather than diminishes HGT via transduction by protecting bacteria from phage infection. This protective effect can also increase transduction of phage-sensitive members of mixed populations. CRISPR-Cas systems themselves display evidence of HGT, but little is known about their lateral dissemination between bacteria and whether transduction can contribute. We show that, through transduction, bacteria can acquire an entire chromosomal CRISPR-Cas system, including cas genes and phage-targeting spacers. We propose that the positive effect of CRISPR-Cas phage immunity on enhancing transduction surpasses the rarer cases where gene flow by transduction is restricted. IMPORTANCE The generation of genetic diversity through acquisition of DNA is a powerful contributor to microbial evolution and occurs through

Sérologie palustre: quel apport dans un pays d’endémie palustre comme la Côte d’Ivoire?

PubMed Central

Goran-Kouacou, Amah Patricia Victorine; Dou, Gonat Serge; Zika, Kalou Dibert; Adou, Adjoumanvoulé Honoré; Yéboah, Oppong Richard; Aka, Rita Ahou; Hien, Sansan; Siransy, Kouabla Liliane; N’Guessan, Koffi; Djibangar, Tariam Agnès; Dassé, Séry Romuald; Adoubryn, Koffi Daho

2017-01-01

Introduction La sérologie palustre semble avoir peu d’intérêt dans les pays d’endémie comme la Côte d’Ivoire. Cependant cet examen a été régulièrement réalisé au laboratoire de Parasitologie de l’Unité de Formation et de Recherche Sciences Médicales d’Abidjan. Le but de notre étude était d’apprécier l’apport de la sérologie palustre dans notre contexte de pays endémique. Méthodes Nous avons réalisé une étude rétrospective portant sur la sérologie palustre qui a utilisé le kit Falciparum spot-IF de Biomérieux à la recherche d’anticorps antiplasmodiaux d’isotype IgG. Elle a concerné les sérologies réalisées de janvier 2007 à février 2011 et dont les résultats étaient disponibles dans le registre. Résultats Au total, 136 patients ont été sélectionnés. L’âge moyen était de 36,3 ans avec des extrêmes de 1 an et 81 ans et un sex-ratio de 0,97. Les indications de sérologie palustre étaient variées, dominées par la splénomégalie (49,3%), les cytopénies (14,7%), la fièvre d’origine indéterminée (13,2%). La quasi-totalité des patients (98,5%) avaient des anticorps antiplasmodiaux avec un titre moyen élevé à 1057,35UI/ml. Il n’existait pas de lien entre l’âge et le titre d’Ac qui était plus élevé pour les cytopénies, les fièvres prolongées et la splénomégalie. Conclusion La sérologie palustre a peu d’intérêt dans notre pratique courante en zone d’endémie car quelque soit le motif de la prescription, les titres étaient élevés. PMID:28690735

Evaluation de l'intergiciel de communication DDS pour son utilisation dans le domaine avionique

NASA Astrophysics Data System (ADS)

Levesque-Landry, Kevin

Les aeronefs modernes doivent combler de plus en plus de fonctionnalites afin de satisfaire les besoins de la clientele. De ce fait, les besoins en communications des systemes avioniques sont grandissants. De plus, la portabilite et la reutilisabilite des applications sont des defis d'actualite dans le domaine avionique. De ce fait, ce projet de recherche vise a faire une evaluation de la technologie d'intergiciel de service de distribution de donnees (DDS) pour son utilisation dans le domaine avionique. Cette technologie permettrait de reduire la complexite des communications et faciliter la portabilite et reutilisabilite des applications grâce a son interface standardisee. Dans ce projet de recherche, la norme DDS est tout d'abord etudiee pour cibler les fonctionnalites qui sont utiles au domaine avionique. Les differentes polices de qualite de services sont ainsi etudiees et denotent la flexibilite de la technologie DDS. Un intergiciel DDS est egalement evalue dans un environnement de laboratoire afin de mesurer l'impact de l'utilisation de cette technologie sur les performances de latence ainsi que sur l'utilisation de la bande passante. Les resultats montrent une faible augmentation de la latence moyenne lorsque l'intergiciel DDS est utilise. L'intergiciel DDS est egalement utilise dans une etude de cas avec un AFCS (automatic flight control system) afin de quantifier les effets de son utilisation sur une application avionique. Les resultats montrent que l'utilisation de l'intergiciel DDS n'empeche pas l'AFCS d'atteindre la stabilite, mais qu'elle ralentit l'atteinte de cette derniere. Finalement, une etude de cas est effectuee afin de valider que la technologie DDS peut etre utilisee pour construire des systemes redondants. Les resultats montrent que l'intergiciel DDS permet de faire de la redondance de reserve sans avoir un impact visible sur les performances du systeme redondant.

[Application of CRISPR/Cas9 mediated genome editing in farm animals].

PubMed

Xing, Yu-yun; Yang, Qiang; Ren, Jun

2016-03-01

CRISPR (Clustered regularly interspaced short palindromic repeats)/Cas (CRISPR associated proteins) is an acquired immune system found in bacteria and archaea that fight against invasion of viruses or plasmids. CRISPR/Cas systems are currently classified into three main types: I, II and III, of which type II has relatively simple components. The CRISPR/Cas9 technology modified from type II CRISPR/Cas system has been developed as an efficient genome editing tool. Since the initial application of the CRISPR/Cas9 technology in mammals in 2013, the reports of this system for genomic editing has skyrocketed. Farm animals are not only economically important animals, but also ideal animal models for human diseases and biomedical studies. In this review, we summarize the applications of CRISPR/Cas9 in farm animals, briefly describe the off-target effects and the main solutions, and finally highlight the future perspectives of this technology.

Merit pay: viable?

PubMed

Farmer, C R

1978-01-01

Can an organization really have a meaningful relationship between its merit pay program and motivation of its employees? C. Richard Farmer of Armstrong Cork says yes--if. If the approach to granting merit pay increases is coupled with a salary structure attuned to economic and competitive conditions, and if it is communicated effectively and openly to the employees, then it automatically translates labor market activity, performance, and the cost of living into a meaningful increase. Position descriptions, evaluations, and performance appraisals are some of the tools essential to a viable merit pay program. But besides these definite do's, the author outlines some of the don'ts of merit pay programs, such as centralized administration of the program--policies, programs, and procedures may be centralized, but their administration must be carried out by those close to the individual employees and work units. Above all, the merit pay program must be based on performance, not longevity.

4 CFR 5.1 - Pay.

Code of Federal Regulations, 2010 CFR

2010-01-01

... 4 Accounts 1 2010-01-01 2010-01-01 false Pay. 5.1 Section 5.1 Accounts GOVERNMENT ACCOUNTABILITY OFFICE PERSONNEL SYSTEM COMPENSATION § 5.1 Pay. (a) Pay principles. Pay of the employees of GAO shall be fixed by the Comptroller General consistent with the principles that— (1) There be equal pay for work of...

CRISPR-Cas systems: prokaryotes upgrade to adaptive immunity

PubMed Central

Barrangou, Rodolphe; Marraffini, Luciano A.

2014-01-01

Summary Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR), and associated proteins (Cas) comprise the CRISPR-Cas system, which confers adaptive immunity against exogenic elements in many bacteria and most archaea. CRISPR-mediated immunization occurs through the uptake of DNA from invasive genetic elements such as plasmids and viruses, followed by its integration into CRISPR loci. These loci are subsequently transcribed and processed into small interfering RNAs that guide nucleases for specific cleavage of complementary sequences. Conceptually, CRISPR-Cas shares functional features with the mammalian adaptive immune system, while also exhibiting characteristics of Lamarckian evolution. Because immune markers spliced from exogenous agents are integrated iteratively in CRISPR loci, they constitute a genetic record of vaccination events and reflect environmental conditions and changes over time. Cas endonucleases, which can be reprogrammed by small guide RNAs have shown unprecedented potential and flexibility for genome editing, and can be repurposed for numerous DNA targeting applications including transcriptional control. PMID:24766887

CRISPR-Cas systems: Prokaryotes upgrade to adaptive immunity.

PubMed

Barrangou, Rodolphe; Marraffini, Luciano A

2014-04-24

Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR), and associated proteins (Cas) comprise the CRISPR-Cas system, which confers adaptive immunity against exogenic elements in many bacteria and most archaea. CRISPR-mediated immunization occurs through the uptake of DNA from invasive genetic elements such as plasmids and viruses, followed by its integration into CRISPR loci. These loci are subsequently transcribed and processed into small interfering RNAs that guide nucleases for specific cleavage of complementary sequences. Conceptually, CRISPR-Cas shares functional features with the mammalian adaptive immune system, while also exhibiting characteristics of Lamarckian evolution. Because immune markers spliced from exogenous agents are integrated iteratively in CRISPR loci, they constitute a genetic record of vaccination events and reflect environmental conditions and changes over time. Cas endonucleases, which can be reprogrammed by small guide RNAs have shown unprecedented potential and flexibility for genome editing and can be repurposed for numerous DNA targeting applications including transcriptional control. Copyright © 2014 Elsevier Inc. All rights reserved.

The effect of nursing professional pay structures and pay levels on hospitals' heart attack outcomes.

PubMed

Brown, Mark P

2006-01-01

The effect of nursing professionals (i.e., nurse aid/orderly, licensed practical nurse, registered nurse) pay structures and pay levels on hospitals risk-adjusted heart attack outcomes was determined. Operationalizing hospitals' heart attack outcomes as their thirty-day risk-adjusted mortality rates, a positive curvilinear relation is hypothesized between pay dispersion and hospitals' heart attack outcomes, whereas a direct relation is hypothesized between pay level and hospitals' heart attack outcomes. Pay level is also hypothesized as a moderator of the relation between pay dispersion and hospitals' heart attack outcomes. Using a sample of 138 California hospitals, support is not found for either the curvilinear relation between hospitals' nursing professionals pay dispersion and hospitals' heart attack outcomes, or the direct relation between nursing professionals' pay level and hospitals' heart attack outcomes. Support is found for the moderation hypothesis in which nursing professionals' pay level moderates the relation between hospitals' nursing professionals pay dispersion and hospitals' heart attack outcomes. Implications for practice are discussed in light of the study's results.

Advancing chimeric antigen receptor T cell therapy with CRISPR/Cas9.

PubMed

Ren, Jiangtao; Zhao, Yangbing

2017-09-01

The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated 9 (CRISPR/Cas9) system, an RNA-guided DNA targeting technology, is triggering a revolution in the field of biology. CRISPR/Cas9 has demonstrated great potential for genetic manipulation. In this review, we discuss the current development of CRISPR/Cas9 technologies for therapeutic applications, especially chimeric antigen receptor (CAR) T cell-based adoptive immunotherapy. Different methods used to facilitate efficient CRISPR delivery and gene editing in T cells are compared. The potential of genetic manipulation using CRISPR/Cas9 system to generate universal CAR T cells and potent T cells that are resistant to exhaustion and inhibition is explored. We also address the safety concerns associated with the use of CRISPR/Cas9 gene editing and provide potential solutions and future directions of CRISPR application in the field of CAR T cell immunotherapy. As an integration-free gene insertion method, CRISPR/Cas9 holds great promise as an efficient gene knock-in platform. Given the tremendous progress that has been made in the past few years, we believe that the CRISPR/Cas9 technology holds immense promise for advancing immunotherapy.

CRISPR/Cas9 Platforms for Genome Editing in Plants: Developments and Applications.

PubMed

Ma, Xingliang; Zhu, Qinlong; Chen, Yuanling; Liu, Yao-Guang

2016-07-06

The clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)-associated protein9 (Cas9) genome editing system (CRISPR/Cas9) is adapted from the prokaryotic type II adaptive immunity system. The CRISPR/Cas9 tool surpasses other programmable nucleases, such as ZFNs and TALENs, for its simplicity and high efficiency. Various plant-specific CRISPR/Cas9 vector systems have been established for adaption of this technology to many plant species. In this review, we present an overview of current advances on applications of this technology in plants, emphasizing general considerations for establishment of CRISPR/Cas9 vector platforms, strategies for multiplex editing, methods for analyzing the induced mutations, factors affecting editing efficiency and specificity, and features of the induced mutations and applications of the CRISPR/Cas9 system in plants. In addition, we provide a perspective on the challenges of CRISPR/Cas9 technology and its significance for basic plant research and crop genetic improvement. Copyright © 2016 The Author. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.

Intrinsic sequence specificity of the Cas1 integrase directs new spacer acquisition

PubMed Central

Rollie, Clare; Schneider, Stefanie; Brinkmann, Anna Sophie; Bolt, Edward L; White, Malcolm F

2015-01-01

The adaptive prokaryotic immune system CRISPR-Cas provides RNA-mediated protection from invading genetic elements. The fundamental basis of the system is the ability to capture small pieces of foreign DNA for incorporation into the genome at the CRISPR locus, a process known as Adaptation, which is dependent on the Cas1 and Cas2 proteins. We demonstrate that Cas1 catalyses an efficient trans-esterification reaction on branched DNA substrates, which represents the reverse- or disintegration reaction. Cas1 from both Escherichia coli and Sulfolobus solfataricus display sequence specific activity, with a clear preference for the nucleotides flanking the integration site at the leader-repeat 1 boundary of the CRISPR locus. Cas2 is not required for this activity and does not influence the specificity. This suggests that the inherent sequence specificity of Cas1 is a major determinant of the adaptation process. DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.08716.001 PMID:26284603

Paying for Better Teaching: Merit Pay and Its Alternatives. OAP Monograph Series.

ERIC Educational Resources Information Center

Bacharach, Samuel B.; And Others

President Reagan's promotion of merit pay as the main vehicle of educational change has prompted a sharp debate. This monograph presents arguments for and against merit pay and assesses its relative worth as a means of improving American education. First, merit pay is defined as a compensation system linking individual teachers' salaries to…

Exploiting CRISPR/Cas: Interference Mechanisms and Applications

PubMed Central

Richter, Hagen; Randau, Lennart; Plagens, André

2013-01-01

The discovery of biological concepts can often provide a framework for the development of novel molecular tools, which can help us to further understand and manipulate life. One recent example is the elucidation of the prokaryotic adaptive immune system, clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated (Cas) that protects bacteria and archaea against viruses or conjugative plasmids. The immunity is based on small RNA molecules that are incorporated into versatile multi-domain proteins or protein complexes and specifically target viral nucleic acids via base complementarity. CRISPR/Cas interference machines are utilized to develop novel genome editing tools for different organisms. Here, we will review the latest progress in the elucidation and application of prokaryotic CRISPR/Cas systems and discuss possible future approaches to exploit the potential of these interference machineries. PMID:23857052

Exploiting CRISPR/Cas: interference mechanisms and applications.

PubMed

Richter, Hagen; Randau, Lennart; Plagens, André

2013-07-12

The discovery of biological concepts can often provide a framework for the development of novel molecular tools, which can help us to further understand and manipulate life. One recent example is the elucidation of the prokaryotic adaptive immune system, clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated (Cas) that protects bacteria and archaea against viruses or conjugative plasmids. The immunity is based on small RNA molecules that are incorporated into versatile multi-domain proteins or protein complexes and specifically target viral nucleic acids via base complementarity. CRISPR/Cas interference machines are utilized to develop novel genome editing tools for different organisms. Here, we will review the latest progress in the elucidation and application of prokaryotic CRISPR/Cas systems and discuss possible future approaches to exploit the potential of these interference machineries.

Marine Corps Pay Incentives

DTIC Science & Technology

Marines from 2000 to 2017. The thesis includes a literature review on economic theory related to pay incentives in the Department of Defense, a...The purpose of this thesis to provide the Marine Corps with a comprehensive report on pay incentive programs and special pay that were available to...summarization of pay incentive categories, a data analysis on take-up rates and average annual amounts at the end of each fiscal year, and a program review

Cas9, Cpf1 and C2c1/2/3―What's next?

PubMed Central

Yamamoto, Takashi; Sakuma, Tetsushi

2017-01-01

ABSTRACT Since the rapid emergence of clustered regulatory interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-CRISPR-associated protein 9 (Cas9) system, developed as a genome engineering tool in 2012–2013, most researchers in the life science field have had a fixated interest in this fascinating technology. CRISPR-Cas9 is an RNA-guided DNA endonuclease system, which consists of Cas9 nuclease defining a few targeting base via protospacer adjacent motif complexed with easily customizable single guide RNA targeting around 20-bp genomic sequence. Although Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9), one of the Cas9 proteins that applications in genome engineering were first demonstrated, still has wide usage because of its high nuclease activity and broad targeting range, there are several limitations such as large molecular weight and potential off-target effect. In this commentary, we describe various improvements and alternatives of CRISPR-Cas systems, including engineered Cas9 variants, Cas9 homologs, and novel Cas proteins other than Cas9. These variations enable flexible genome engineering with high efficiency and specificity, orthogonal genetic control at multiple gene loci, gene knockdown, or fluorescence imaging of transcripts mediated by RNA targeting, and beyond. PMID:28140746

Cell-type-specific genome editing with a microRNA-responsive CRISPR–Cas9 switch

PubMed Central

Hirosawa, Moe; Fujita, Yoshihiko; Parr, Callum J. C.; Hayashi, Karin; Kashida, Shunnichi; Hotta, Akitsu; Woltjen, Knut

2017-01-01

Abstract The CRISPR–Cas9 system is a powerful genome-editing tool useful in a variety of biotechnology and biomedical applications. Here we developed a synthetic RNA-based, microRNA (miRNA)-responsive CRISPR–Cas9 system (miR-Cas9 switch) in which the genome editing activity of Cas9 can be modulated through endogenous miRNA signatures in mammalian cells. We created miR-Cas9 switches by using a miRNA-complementary sequence in the 5΄-UTR of mRNA encoding Streptococcus pyogenes Cas9. The miR-21-Cas9 or miR-302-Cas9 switches selectively and efficiently responded to miR-21-5p in HeLa cells or miR-302a-5p in human induced pluripotent stem cells, and post-transcriptionally attenuated the Cas9 activity only in the target cells. Moreover, the miR-Cas9 switches could differentially control the genome editing by sensing endogenous miRNA activities within a heterogeneous cell population. Our miR-Cas9 switch system provides a promising framework for cell-type selective genome editing and cell engineering based on intracellular miRNA information. PMID:28525578

Genetic and epigenetic control of gene expression by CRISPR–Cas systems

PubMed Central

Lo, Albert; Qi, Lei

2017-01-01

The discovery and adaption of bacterial clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)–CRISPR-associated (Cas) systems has revolutionized the way researchers edit genomes. Engineering of catalytically inactivated Cas variants (nuclease-deficient or nuclease-deactivated [dCas]) combined with transcriptional repressors, activators, or epigenetic modifiers enable sequence-specific regulation of gene expression and chromatin state. These CRISPR–Cas-based technologies have contributed to the rapid development of disease models and functional genomics screening approaches, which can facilitate genetic target identification and drug discovery. In this short review, we will cover recent advances of CRISPR–dCas9 systems and their use for transcriptional repression and activation, epigenome editing, and engineered synthetic circuits for complex control of the mammalian genome. PMID:28649363

CRISPR-Cas: evolution of an RNA-based adaptive immunity system in prokaryotes.

PubMed

Koonin, Eugene V; Makarova, Kira S

2013-05-01

The CRISPR-Cas (clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR-associated genes) is an adaptive immunity system in bacteria and archaea that functions via a distinct self-non-self recognition mechanism that is partially analogous to the mechanism of eukaryotic RNA interference (RNAi). The CRISPR-Cas system incorporates fragments of virus or plasmid DNA into the CRISPR repeat cassettes and employs the processed transcripts of these spacers as guide RNAs to cleave the cognate foreign DNA or RNA. The Cas proteins, however, are not homologous to the proteins involved in RNAi and comprise numerous, highly diverged families. The majority of the Cas proteins contain diverse variants of the RNA recognition motif (RRM), a widespread RNA-binding domain. Despite the fast evolution that is typical of the cas genes, the presence of diverse versions of the RRM in most Cas proteins provides for a simple scenario for the evolution of the three distinct types of CRISPR-cas systems. In addition to several proteins that are directly implicated in the immune response, the cas genes encode a variety of proteins that are homologous to prokaryotic toxins that typically possess nuclease activity. The predicted toxins associated with CRISPR-Cas systems include the essential Cas2 protein, proteins of COG1517 that, in addition to a ligand-binding domain and a helix-turn-helix domain, typically contain different nuclease domains and several other predicted nucleases. The tight association of the CRISPR-Cas immunity systems with predicted toxins that, upon activation, would induce dormancy or cell death suggests that adaptive immunity and dormancy/suicide response are functionally coupled. Such coupling could manifest in the persistence state being induced and potentially providing conditions for more effective action of the immune system or in cell death being triggered when immunity fails.