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Sample records for qedp numa amostra

  1. NUMA: A Northern Paiute History.

    ERIC Educational Resources Information Center

    Inter-Tribal Council of Nevada, Reno.

    One in a series of four histories of native Nevadans, this volume presents the story of the Northern Paiute people, or Numa, who lived, hunted, and travelled in the Great Basin area which occupies one-third of present day Nevada and parts of Oregon, Idaho, and California. Based on interviews with tribal elders and research conducted at numerous…

  2. Identification and characterization of novel NuMA isoforms

    SciTech Connect

    Wu, Jin; Xu, Zhe; He, Dacheng; Lu, Guanting

    2014-11-21

    Highlights: • Seven NuMA isoforms generated by alternative splicing were categorized into 3 groups: long, middle and short. • Both exons 15 and 16 in long NuMA were “hotspot” for alternative splicing. • Lower expression of short NuMA was observed in cancer cells compared with nonneoplastic controls. • Distinct localization pattern of short isoforms indicated different function from that of long and middle NuMA. - Abstract: The large nuclear mitotic apparatus (NuMA) has been investigated for over 30 years with functions related to the formation and maintenance of mitotic spindle poles during mitosis. However, the existence and functions of NuMA isoforms generated by alternative splicing remains unclear. In the present work, we show that at least seven NuMA isoforms (categorized into long, middle and short groups) generated by alternative splicing from a common NuMA mRNA precursor were discovered in HeLa cells and these isoforms differ mainly at the carboxyl terminus and the coiled-coil domains. Two “hotspot” exons with molecular mass of 3366-nt and 42-nt tend to be spliced during alternative splicing in long and middle groups. Furthermore, full-length coding sequences of long and middle NuMA obtained by using fusion PCR were constructed into GFP-tagged vector to illustrate their cellular localization. Long NuMA mainly localized in the nucleus with absence from nucleoli during interphase and translocated to the spindle poles in mitosis. Middle NuMA displayed the similar cell cycle-dependent distribution pattern as long NuMA. However, expression of NuMA short isoforms revealed a distinct subcellular localization. Short NuMA were present in the cytosol during the whole cycle, without colocalization with mitotic apparatus. These results have allowed us tentatively to explore a new research direction for NuMA’s various functions.

  3. The Effect of NUMA Tunings on CPU Performance

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Hollowell, Christopher; Caramarcu, Costin; Strecker-Kellogg, William; Wong, Antonio; Zaytsev, Alexandr

    2015-12-01

    Non-Uniform Memory Access (NUMA) is a memory architecture for symmetric multiprocessing (SMP) systems where each processor is directly connected to separate memory. Indirect access to other CPU's (remote) RAM is still possible, but such requests are slower as they must also pass through that memory's controlling CPU. In concert with a NUMA-aware operating system, the NUMA hardware architecture can help eliminate the memory performance reductions generally seen in SMP systems when multiple processors simultaneously attempt to access memory. The x86 CPU architecture has supported NUMA for a number of years. Modern operating systems such as Linux support NUMA-aware scheduling, where the OS attempts to schedule a process to the CPU directly attached to the majority of its RAM. In Linux, it is possible to further manually tune the NUMA subsystem using the numactl utility. With the release of Red Hat Enterprise Linux (RHEL) 6.3, the numad daemon became available in this distribution. This daemon monitors a system's NUMA topology and utilization, and automatically makes adjustments to optimize locality. As the number of cores in x86 servers continues to grow, efficient NUMA mappings of processes to CPUs/memory will become increasingly important. This paper gives a brief overview of NUMA, and discusses the effects of manual tunings and numad on the performance of the HEPSPEC06 benchmark, and ATLAS software.

  4. Critical Path-Based Thread Placement for NUMA Systems

    SciTech Connect

    Su, C Y; Li, D; Nikolopoulos, D S; Grove, M; Cameron, K; de Supinski, B R

    2011-11-01

    Multicore multiprocessors use a Non Uniform Memory Architecture (NUMA) to improve their scalability. However, NUMA introduces performance penalties due to remote memory accesses. Without efficiently managing data layout and thread mapping to cores, scientific applications, even if they are optimized for NUMA, may suffer performance loss. In this paper, we present algorithms and a runtime system that optimize the execution of OpenMP applications on NUMA architectures. By collecting information from hardware counters, the runtime system directs thread placement and reduces performance penalties by minimizing the critical path of OpenMP parallel regions. The runtime system uses a scalable algorithm that derives placement decisions with negligible overhead. We evaluate our algorithms and runtime system with four NPB applications implemented in OpenMP. On average the algorithms achieve between 8.13% and 25.68% performance improvement compared to the default Linux thread placement scheme. The algorithms miss the optimal thread placement in only 8.9% of the cases.

  5. Quantifying NUMA and Contention Effects in Multi-GPU Systems

    SciTech Connect

    Spafford, Kyle L; Meredith, Jeremy S; Vetter, Jeffrey S

    2011-01-01

    As system architects strive for increased density and power efficiency, the traditional compute node is being augmented with an increasing number of graphics processing units (GPUs). The integration of multiple GPUs per node introduces complex performance phenomena including non-uniform memory access (NUMA) and contention for shared system resources. Utilizing the Keeneland system, this paper quantifies these effects and presents some guidance on programming strategies to maximize performance in multi-GPU environments.

  6. Program partitioning for NUMA multiprocessor computer systems. [Nonuniform memory access

    SciTech Connect

    Wolski, R.M.; Feo, J.T. )

    1993-11-01

    Program partitioning and scheduling are essential steps in programming non-shared-memory computer systems. Partitioning is the separation of program operations into sequential tasks, and scheduling is the assignment of tasks to processors. To be effective, automatic methods require an accurate representation of the model of computation and the target architecture. Current partitioning methods assume today's most prevalent models -- macro dataflow and a homogeneous/two-level multicomputer system. Based on communication channels, neither model represents well the emerging class of NUMA multiprocessor computer systems consisting of hierarchical read/write memories. Consequently, the partitions generated by extant methods do not execute well on these systems. In this paper, the authors extend the conventional graph representation of the macro-dataflow model to enable mapping heuristics to consider the complex communication options supported by NUMA architectures. They describe two such heuristics. Simulated execution times of program graphs show that the model and heuristics generate higher quality program mappings than current methods for NUMA architectures.

  7. Rae1 interaction with NuMA is required for bipolar spindle formation

    PubMed Central

    Wong, Richard W.; Blobel, Günter; Coutavas, Elias

    2006-01-01

    In eukaryotic cells, the faithful segregation of daughter chromosomes during cell division depends on formation of a microtubule (MT)-based bipolar spindle apparatus. The Nuclear Mitotic Apparatus protein (NuMA) is recruited from interphase nuclei to spindle MTs during mitosis. The carboxy terminal domain of NuMA binds MTs, allowing a NuMA dimer to function as a “divalent” crosslinker that bundles MTs. The messenger RNA export factor, Rae1, also binds to MTs. Lowering Rae1 or increasing NuMA levels in cells results in spindle abnormalities. We have identified a mitotic-specific interaction between Rae1 and NuMA and have explored the relationship between Rae1 and NuMA in spindle formation. We have mapped a specific binding site for Rae1 on NuMA that would convert a NuMA dimer to a “tetravalent” crosslinker of MTs. In mitosis, reducing Rae1 or increasing NuMA concentration would be expected to alter the valency of NuMA toward MTs; the “density” of NuMA-MT crosslinks in these conditions would be diminished, even though a threshold number of crosslinks sufficient to stabilize aberrant multipolar spindles may form. Consistent with this interpretation, we found that coupling NuMA overexpression to Rae1 overexpression or coupling Rae1 depletion to NuMA depletion prevented the formation of aberrant spindles. Likewise, we found that overexpression of the specific Rae1-binding domain of NuMA in HeLa cells led to aberrant spindle formation. These data point to the Rae1–NuMA interaction as a critical element for normal spindle formation in mitosis. PMID:17172455

  8. Towards Exascale Computing with NUMA: an Element-based Galerkin Nonhydrostatic Global and Mesoscale Atmospheric Modeling

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Giraldo, F.; Mueller, A.; Kopera, M. A.; Abdi, D. S.; Wilcox, L.

    2015-12-01

    In this talk, we shall describe the NUMA atmospheric model, focusing in particular on its unified continuous/discontinuous (CG and DG) Galerkin numerical methods that are used to represent the spatial derivatives. We shall describe how these two methods are formulated in a unified approach and the advantages that this brings. We will also report on the progress in extending NUMA to using adaptive mesh refinement. Lastly, we will report on the scalability and performance of NUMA on the leadership computing facilities (LCF) of the Department of Energy where we have scaled NUMA to over 3 million MPI threads achieving a 90% efficiency.

  9. Cell cycle-dependent SUMO-1 conjugation to nuclear mitotic apparatus protein (NuMA)

    SciTech Connect

    Seo, Jae Sung; Kim, Ha Na; Kim, Sun-Jick; Bang, Jiyoung; Kim, Eun-A; Sung, Ki Sa; Yoon, Hyun-Joo; Yoo, Hae Yong; Choi, Cheol Yong

    2014-01-03

    Highlights: •NuMA is modified by SUMO-1 in a cell cycle-dependent manner. •NuMA lysine 1766 is the primary target site for SUMOylation. •SUMOylation-deficient NuMA induces multiple spindle poles during mitosis. •SUMOylated NuMA induces microtubule bundling. -- Abstract: Covalent conjugation of proteins with small ubiquitin-like modifier 1 (SUMO-1) plays a critical role in a variety of cellular functions including cell cycle control, replication, and transcriptional regulation. Nuclear mitotic apparatus protein (NuMA) localizes to spindle poles during mitosis, and is an essential component in the formation and maintenance of mitotic spindle poles. Here we show that NuMA is a target for covalent conjugation to SUMO-1. We find that the lysine 1766 residue is the primary NuMA acceptor site for SUMO-1 conjugation. Interestingly, SUMO modification of endogenous NuMA occurs at the entry into mitosis and this modification is reversed after exiting from mitosis. Knockdown of Ubc9 or forced expression of SENP1 results in impairment of the localization of NuMA to mitotic spindle poles during mitosis. The SUMOylation-deficient NuMA mutant is defective in microtubule bundling, and multiple spindles are induced during mitosis. The mitosis-dependent dynamic SUMO-1 modification of NuMA might contribute to NuMA-mediated formation and maintenance of mitotic spindle poles during mitosis.

  10. NuMA localization, stability, and function in spindle orientation involve 4.1 and Cdk1 interactions

    PubMed Central

    Seldin, Lindsey; Poulson, Nicholas D.; Foote, Henry P.; Lechler, Terry

    2013-01-01

    The epidermis is a multilayered epithelium that requires asymmetric divisions for stratification. A conserved cortical protein complex, including LGN, nuclear mitotic apparatus (NuMA), and dynein/dynactin, plays a key role in establishing proper spindle orientation during asymmetric divisions. The requirements for the cortical recruitment of these proteins, however, remain unclear. In this work, we show that NuMA is required to recruit dynactin to the cell cortex of keratinocytes. NuMA's cortical recruitment requires LGN; however, LGN interactions are not sufficient for this localization. Using fluorescence recovery after photobleaching, we find that the 4.1-binding domain of NuMA is important for stabilizing its interaction with the cell cortex. This is functionally important, as loss of 4.1/NuMA interaction results in spindle orientation defects, using two distinct assays. Furthermore, we observe an increase in cortical NuMA localization as cells enter anaphase. Inhibition of Cdk1 or mutation of a single residue in NuMA mimics this effect. NuMA's anaphase localization is independent of LGN and 4.1 interactions, revealing two distinct mechanisms responsible for NuMA cortical recruitment at different stages of mitosis. This work highlights the complexity of NuMA localization and reveals the importance of NuMA cortical stability for productive force generation during spindle orientation. PMID:24109598

  11. Memphis: Finding and Fixing NUMA-related Performance Problems on Multi-core Platforms

    SciTech Connect

    McCurdy, Collin B; Vetter, Jeffrey S

    2010-01-01

    Until recently, most high-end scientific applications have been immune to performance problems caused by Non-Uniform Memory Access (NUMA). However, current trends in micro-processor design are pushing NUMA to smaller and smaller scales. This paper examines the current state of NUMA and makes several contributions. First, we summarize the performance problems that NUMA can present for multithreaded applications and describe methods of addressing them. Second, we demonstrate that NUMA can indeed be a significant problem for scientific applications, showing that it can mean the difference between an application scaling perfectly and failing to scale at all. Third, we describe, in increasing order of usefulness, three methods of using hardware performance counters to aid in finding NUMA-related problems. Finally, we introduce Memphis, a data-centric toolset that uses Instruction Based Sampling to help pinpoint problematic memory accesses, and demonstrate how we used it to improve the performance of several production-level codes - HYCOM, XGC1 and CAM - by 13%, 23% and 24% respectively.

  12. Parallel calculations on shared memory, NUMA-based computers using MATLAB

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Krotkiewski, Marcin; Dabrowski, Marcin

    2014-05-01

    Achieving satisfactory computational performance in numerical simulations on modern computer architectures can be a complex task. Multi-core design makes it necessary to parallelize the code. Efficient parallelization on NUMA (Non-Uniform Memory Access) shared memory architectures necessitates explicit placement of the data in the memory close to the CPU that uses it. In addition, using more than 8 CPUs (~100 cores) requires a cluster solution of interconnected nodes, which involves (expensive) communication between the processors. It takes significant effort to overcome these challenges even when programming in low-level languages, which give the programmer full control over data placement and work distribution. Instead, many modelers use high-level tools such as MATLAB, which severely limit the optimization/tuning options available. Nonetheless, the advantage of programming simplicity and a large available code base can tip the scale in favor of MATLAB. We investigate whether MATLAB can be used for efficient, parallel computations on modern shared memory architectures. A common approach to performance optimization of MATLAB programs is to identify a bottleneck and migrate the corresponding code block to a MEX file implemented in, e.g. C. Instead, we aim at achieving a scalable parallel performance of MATLABs core functionality. Some of the MATLABs internal functions (e.g., bsxfun, sort, BLAS3, operations on vectors) are multi-threaded. Achieving high parallel efficiency of those may potentially improve the performance of significant portion of MATLABs code base. Since we do not have MATLABs source code, our performance tuning relies on the tools provided by the operating system alone. Most importantly, we use custom memory allocation routines, thread to CPU binding, and memory page migration. The performance tests are carried out on multi-socket shared memory systems (2- and 4-way Intel-based computers), as well as a Distributed Shared Memory machine with 96 CPU

  13. LAMTOR1-PRKCD and NUMA1-SFMBT1 fusion genes identified by RNA sequencing in aneurysmal benign fibrous histiocytoma with t(3;11)(p21;q13).

    PubMed

    Panagopoulos, Ioannis; Gorunova, Ludmila; Bjerkehagen, Bodil; Lobmaier, Ingvild; Heim, Sverre

    2015-11-01

    RNA sequencing of an aneurysmal benign fibrous histiocytoma with the karyotype 46,XY,t(3;11)(p21;q13),del(6)(p23)[17]/46,XY[2] showed that the t(3;11) generated two fusion genes: LAMTOR1-PRKCD and NUMA1-SFMBT1. RT-PCR together with Sanger sequencing verified the presence of fusion transcripts from both fusion genes. In the LAMTOR1-PRKCD fusion, the part of the PRKCD gene coding for the catalytic domain of the serine/threonine kinase is under control of the LAMTOR1 promoter. In the NUMA1-SFMBT1 fusion, the part of the SFMBT1 gene coding for two of four malignant brain tumor domains and the sterile alpha motif domain is controlled by the NUMA1 promoter. The data support a neoplastic genesis of aneurysmal benign fibrous histiocytoma and indicate a pathogenetic role for LAMTOR1-PRKCD and NUMA1-SFMBT1.

  14. Interconnected contribution of tissue morphogenesis and the nuclear protein NuMA to the DNA damage response

    PubMed Central

    Vidi, Pierre-Alexandre; Chandramouly, Gurushankar; Gray, Matthew; Wang, Lei; Liu, Er; Kim, Joseph J.; Roukos, Vassilis; Bissell, Mina J.; Moghe, Prabhas V.; Lelièvre, Sophie A.

    2012-01-01

    Epithelial tissue morphogenesis is accompanied by the formation of a polarity axis – a feature of tissue architecture that is initiated by the binding of integrins to the basement membrane. Polarity plays a crucial role in tissue homeostasis, preserving differentiation, cell survival and resistance to chemotherapeutic drugs among others. An important aspect in the maintenance of tissue homeostasis is genome integrity. As normal tissues frequently experience DNA double-strand breaks (DSBs), we asked how tissue architecture might participate in the DNA damage response. Using 3D culture models that mimic mammary glandular morphogenesis and tumor formation, we show that DSB repair activity is higher in basally polarized tissues, regardless of the malignant status of cells, and is controlled by hemidesmosomal integrin signaling. In the absence of glandular morphogenesis, in 2D flat monolayer cultures, basal polarity does not affect DNA repair activity but enhances H2AX phosphorylation, an early chromatin response to DNA damage. The nuclear mitotic apparatus protein 1 (NuMA), which controls breast glandular morphogenesis by acting on the organization of chromatin, displays a polarity-dependent pattern and redistributes in the cell nucleus of basally polarized cells upon the induction of DSBs. This is shown using high-content analysis of nuclear morphometric descriptors. Furthermore, silencing NuMA impairs H2AX phosphorylation – thus, tissue polarity and NuMA cooperate to maintain genome integrity. PMID:22331358

  15. NMR characterisation of the minimal interacting regions of centrosomal proteins 4.1R and NuMA1: effect of phosphorylation

    PubMed Central

    2010-01-01

    Background Some functions of 4.1R in non-erythroid cells are directly related with its distinct sub-cellular localisation during cell cycle phases. During mitosis, 4.1R is implicated in cell cycle progression and spindle pole formation, and co-localizes with NuMA1. However, during interphase 4.1R is located in the nucleus and only partially co-localizes with NuMA1. Results We have characterized by NMR the structural features of the C-terminal domain of 4.1R and those of the minimal region (the last 64 residues) involved in the interaction with NuMA1. This subdomain behaves as an intrinsically unfolded protein containing a central region with helical tendency. The specific residues implicated in the interaction with NuMA1 have been mapped by NMR titrations and involve the N-terminal and central helical regions. The segment of NuMA1 that interacts with 4.1R is phosphorylated during mitosis. Interestingly, NMR data indicates that the phosphorylation of NuMA1 interacting peptide provokes a change in the interaction mechanism. In this case, the recognition occurs through the central helical region as well as through the C-terminal region of the subdomain meanwhile the N-terminal region do not interact. Conclusions These changes in the interaction derived from the phosphorylation state of NuMA1 suggest that phosphorylation can act as subtle mechanism of temporal and spatial regulation of the complex 4.1R-NuMA1 and therefore of the processes where both proteins play a role. PMID:20109190

  16. O Universo das Sociedades Numa Perspectiva Relativa: Exercícios de Etnoastronomia

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Fares, Érika Akel; Pessoa Martins, Karla; Maciel Araujo, Lidiane; Sauma Filho, Michel

    2004-12-01

    This work developed at the Planetarium of Pará employing workshops designed for visitor schools (public, private, specials groups), promotes the popularization of the Ethnoastronomy with the aim of diffusing values based on a cultural diversity tolerance and the need of harmonic interplay between people and environment. Using stories and debates, the relationship between humans and the Cosmos is traced from antiquity until today, with the help of slides as a didactic resource. Thus, many conceptions about the origin of the Universe are shown; as well as some constellations created along the History, ending with the present scientific manner of know and explain the World. We then demonstrate the links between space, time and culture with the Cosmos vision. The need to think the World within a plural context to create respect for other different persons is emphasized. Este trabalho, desenvolvido no Planetário do Pará através de oficinas com escolas visitantes (públicas, privadas e grupos especiais), promove a popularização da Etnoastronomia, com o objetivo de difundir valores pautados na tolerância à diversidade cultural e na necessidade da convivência harmônica entre o ser humano e o meio ambiente. Através da contação de histórias e promoção de debate, é tratada a relação dos humanos com o céu desde a antiguidade até os dias atuais, tendo como apoio didático o uso de slides. Assim, são mostradas diversas concepções de origem do Universo; algumas constelações criadas no decorrer da História; e a atual forma científica de conhecer e explicar o mundo. Demonstrando-se, então, a interligação entre espaço, tempo e cultura com a visão do Cosmo. Enfatiza-se a necessidade de se pensar o mundo numa perspectiva relativa ou plural, de forma a propiciar o respeito ao ser diferente.

  17. NuMA promotes homologous recombination repair by regulating the accumulation of the ISWI ATPase SNF2h at DNA breaks

    PubMed Central

    Vidi, Pierre-Alexandre; Liu, Jing; Salles, Daniela; Jayaraman, Swaathi; Dorfman, George; Gray, Matthew; Abad, Patricia; Moghe, Prabhas V.; Irudayaraj, Joseph M.; Wiesmüller, Lisa; Lelièvre, Sophie A.

    2014-01-01

    Chromatin remodeling factors play an active role in the DNA damage response by shaping chromatin to facilitate the repair process. The spatiotemporal regulation of these factors is key to their function, yet poorly understood. We report that the structural nuclear protein NuMA accumulates at sites of DNA damage in a poly[ADP-ribose]ylation-dependent manner and functionally interacts with the ISWI ATPase SNF2h/SMARCA5, a chromatin remodeler that facilitates DNA repair. NuMA coimmunoprecipitates with SNF2h, regulates its diffusion in the nucleoplasm and controls its accumulation at DNA breaks. Consistent with NuMA enabling SNF2h function, cells with silenced NuMA exhibit reduced chromatin decompaction after DNA cleavage, lesser focal recruitment of homologous recombination repair factors, impaired DNA double-strand break repair in chromosomal (but not in episomal) contexts and increased sensitivity to DNA cross-linking agents. These findings reveal a structural basis for the orchestration of chromatin remodeling whereby a scaffold protein promotes genome maintenance by directing a remodeler to DNA breaks. PMID:24753406

  18. National Urbanization Monitoring Assessment (NUMA)

    USGS Publications Warehouse

    Hester, Dave

    2006-01-01

    A core geographic science element of the U.S. Geological Survey's Geographic Analysis and Monitoring (GAM) Program is to monitor land-surface change for the Nation through time. The Nation's land surface is dynamically evolving and transitioning in response to natural and human processes. The need to understand the transformations and locations where changes are taking place, their underlying causes, and the rate at which the transitions are occurring is fundamental to the health and viability of the Nation's natural and developed environments.

  19. Advances in the U.S. Navy Non-hydrostatic Unified Model of the Atmosphere (NUMA): LES as a Stabilization Methodology for High-Order Spectral Elements in the Simulation of Deep Convection

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Marras, Simone; Giraldo, Frank

    2015-04-01

    The prediction of extreme weather sufficiently ahead of its occurrence impacts society as a whole and coastal communities specifically (e.g. Hurricane Sandy that impacted the eastern seaboard of the U.S. in the fall of 2012). With the final goal of solving hurricanes at very high resolution and numerical accuracy, we have been developing the Non-hydrostatic Unified Model of the Atmosphere (NUMA) to solve the Euler and Navier-Stokes equations by arbitrary high-order element-based Galerkin methods on massively parallel computers. NUMA is a unified model with respect to the following criteria: (a) it is based on unified numerics in that element-based Galerkin methods allow the user to choose between continuous (spectral elements, CG) or discontinuous Galerkin (DG) methods and from a large spectrum of time integrators, (b) it is unified across scales in that it can solve flow in limited-area mode (flow in a box) or in global mode (flow on the sphere). NUMA is the dynamical core that powers the U.S. Naval Research Laboratory's next-generation global weather prediction system NEPTUNE (Navy's Environmental Prediction sysTem Utilizing the NUMA corE). Because the solution of the Euler equations by high order methods is prone to instabilities that must be damped in some way, we approach the problem of stabilization via an adaptive Large Eddy Simulation (LES) scheme meant to treat such instabilities by modeling the sub-grid scale features of the flow. The novelty of our effort lies in the extension to high order spectral elements for low Mach number stratified flows of a method that was originally designed for low order, adaptive finite elements in the high Mach number regime [1]. The Euler equations are regularized by means of a dynamically adaptive stress tensor that is proportional to the residual of the unperturbed equations. Its effect is close to none where the solution is sufficiently smooth, whereas it increases elsewhere, with a direct contribution to the

  20. Variação temporal do gradiente radial de o/h a partir de uma amostra de nebulosas planetárias

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Maciel, W. J.; Costa, R. D. D.; Uchida, M. M. M.

    2003-08-01

    Gradientes radiais de abundância são observados no disco de nossa Galáxia e também em outras galáxias espirais. No caso da Galáxia, o principal problema relativo aos gradientes é sua variação temporal, que constitui um dos principais vínculos aos modelos de evolução química da Galáxia. As nebulosas planetárias são particularmente interessantes no estudo dos gradientes e suas variações, tanto espaciais como temporais. São objetos brilhantes, podendo ser observadas a grandes distâncias, e têm abundâncias relativamente precisas de diversos elementos químicos. Além disso, sendo originadas de estrelas com massas entre 0.8 e 8 massas solares na sequência principal, incluem objetos com idades e populações diferentes, o que as torna especialmente interessantes ao estudo da variação temporal dos gradientes. Neste trabalho, apresentamos resultados recentes sobre a variação temporal do gradiente de O/H a partir de uma amostra contendo cerca de 200 nebulosas, para as quais obtivemos distâncias por métodos estatísticos. As abundâncias foram parcialmente obtidas a partir de observações em Itajubá e La Silla, sendo as restantes obtidas da literatura. Os resultados mostram, pela primeira vez, evidências de um achatamento do gradiente de O/H, de -0.11 dex/kpc para -0.06 dex/kpc nos últimos 9 giga-anos ou de -0.08 dex/kpc para -0.06 dex/kpc nos últimos 5 giga-anos. Esses valores apresentam um bom acordo com alguns modelos recentes para a evolução química da Galáxia. (FAPESP/CNPq)

  1. Utilization of nuclear structural proteins for targeted therapy and detection of proliferative and differentiation disorders

    DOEpatents

    Lelievre, Sophie; Bissell, Mina

    2001-01-01

    The localization of nuclear apparatus proteins (NUMA) is used to identify tumor cells and different stages in the tumor progression and differentiation processes. There is a characteristic organization of NuMA in tumor cells and in phenotypically normal cells. NuMA distribution patterns are significantly less diffuse in proliferating non-malignant cells compared to malignant cells. The technique encompasses cell immunostaining using a NuMA specific antibody, and microscopic analysis of NuMA distribution within each nucleus.

  2. The Moon Phases in a Paper Box. (Spanish Title: Las Fases de la Luna en Una Caja de Cartón.) As Fases da Lua Numa Caixa de Papelão

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    de Fátima O. Saraiva, Maria; Amador, Cláudio B.; Kemper, Érico; Goulart, Paulo; Muller, Angela

    2007-12-01

    We present a very simple concrete model to demonstrate the concept of phases of an illuminated body. The main objective of our model is to help the understanding of the Moon phases as viewed from the perspective of an observer on Earth. The material allows the visualization of two important effects: (1st) even though all the time half Moon is illuminated by the Sun, we see different fractions of the illuminated Moon surface, depending on our angle of sight; (2nd) the orientation of the convex part of the Moon in the crescent and waning phases on the sky also depends on our perspective from Earth. The use of a closed box allows one to see the contrast among the different phases with no need of a dark room. We also present a text on the Moon phases, emphasizing the dependence of the aspect of the bright part on the angle of sight. En este trabajo proponemos la construcción de material didáctico de bajo costo para demostración del concepto de fases de un cuerpo iluminado. El principal objetivo de nuestro material es facilitar la comprensión de las fases de la Luna desde la perspectiva de un observador en la Tierra. El material ayuda la visualización de dos efectos importantes: (1º) a pesar de tener siempre la mitad de la Luna (representada por una bolita de espuma plástica o de ping-pong), iluminada por el Sol ( representado por una fuente de luz natural o artificial), vemos diferentes fracciones de su superficie iluminada, dependiendo del ángulo por el cual la vemos; (2º) la orientación del borde convexo de la Luna en las fases Creciente y Menguante también depende de la perspectiva por la cual la miramos desde la Tierra. El uso de una caja cerrada permite observar el contraste entre las diferentes fases sin necesidad de estar en un recinto oscuro. Presentamos también un texto explicativo sobre las fases de la Luna, enfatizando la dependencia de la apariencia de la parte iluminada con el ángulo de visión. Neste trabalho propomos a construção de material didático de baixo custo para demonstração do conceito de fases de um corpo iluminado. O principal objetivo de nosso material é facilitar a compreensão das fases da Lua da perspectiva de um observador na Terra. O material ajuda na visualização de dois efeitos importantes: (1º) mesmo tendo sempre a metade da "Lua" (representada por uma bolinha de isopor ou de ping-pong) iluminada pelo "Sol" (representado por uma fonte de luz natural ou artificial), nós vemos diferentes frações de sua superfície iluminada, dependendo do ângulo pelo qual a olhamos; (2º) a orientação da borda convexa da Lua nas fases Crescente e Minguante também depende da perspectiva pela qual a olhamos da Terra. O uso de uma caixa fechada permite observar o contraste entre as diferentes fases sem necessidade de estar em uma sala escurecida. Apresentamos também um texto explicativo sobre fases da Lua, enfatizando a dependência da aparência da parte iluminada com o ângulo de visada.

  3. Abundâncias espectroscópicas de simbióticas amarelas

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Calbo, S. R.; Costa, R. D. D.

    2003-08-01

    Este trabalho consiste no estudo de uma amostra de estrelas simbióticas amarelas cujas componentes frias apresentam tipos espectrais G ou K. Uma amostra de 20 estrelas foi usada, o que corresponde ao conjunto completo de estrelas simbióticas amarelas visíveis no hemisfério sul presentes no catálogo de Belczynski et al (2000 A&A Suppl. 146, 407). Os espectros estelares foram obtidos por observações usando os telescópios de 1,6 m do LNA e 1,52 m do ESO e os dados fornecidos pelo satélite IUE (International Ultraviolet Explorer) e posteriormente reduzidos no IAG. Os fluxos das linhas medidas de cada espectro foram calibrados em fluxo (com as correções de avermelhamento baseados no trabalho de Pacheco e Costa 1992, A&A 257, 619), e os parâmetros físicos (temperatura e densidade eletrônica) das nebulosas que envolvem os sistemas simbióticos determinados, usando-se fluxos medidos de OIII e NII da parte visível do espectro. Para a determinação das razões de abundâncias de C/N e O/N aplicou-se o método de Nussbaumer et al. (1988, A&A 198, 179). As razões de abundâncias foram derivadas das linhas de emissão (NIV, CIV, OIII, NIII e CIII) dos espectros IUE. Numa última fase plotou-se o diagrama C/N-O/N onde comparou-se a abundância química das simbióticas amarelas obtidas neste trabalho com as de gigantes normais. Os resultados mostram abundâncias compatíveis com aquelas derivadas para nebulosas planetárias do bojo, indicando que o material nebular é originado das gigantes vermelhas de cada sistema, e não da fonte quente. (FAPESP, CNPq)

  4. [Diagnosis recommendations for late-onset Pompe disease].

    PubMed

    Brito-Avô, Luis; Alves, José Delgado; Costa, João Matos; Valverde, Ana; Santos, Lélita; Araújo, Francisco; Aguiar, Patrício; Marinho, António; Oliveira, Anabela; Gomes, Daniel

    2014-01-01

    Introdução: A Doença de Pompe é uma miopatia autossómica recessiva progressiva e incapacitante, devida ao défice da enzima lisossómica a-glicosidade-ácida. A sua forma tardia tem uma apresentação heterogénea que mimetiza outras doenças neuromusculares, o que dificulta o diagnóstico. Objectivo: Desenvolver recomendações baseadas em consenso para o diagnóstico da forma tardia da doença de Pompe. Material e Métodos: Revisão bibliográfica e análise de um questionário de opinião aplicado a um grupo de especialistas com experiência no diagnóstico de várias miopatias e doenças de sobrecarga lisossomal. Discussão em reunião de consenso. Recomendações: Doentes com miopatia proximal progressiva, fadiga, cãibras e mialgias devem ser submetidos a uma avaliação complementar com determinação de níveis de creatinina fosfoquinase, electromiograma, espirometria dinâmica e, em casos inconclusivos, biópsia muscular. Nos casos suspeitos ou naqueles em que a biópsia muscular não permita outro diagnóstico deve ser determinada a atividade da enzima lisossómica a-glicosidade-ácida através de teste de gota seca (DBS – dried blood spot). A redução da atividade da enzima lisossómica a-glicosidade-ácida requer a confirmação numa segunda amostra e a sequenciação do gene da enzima lisossómica a-glicosidade-ácida.

  5. Espectroscopia multi-objeto e imageamento de Abell 586 com GMOS - o estado dinâmico de um aglomerado de galáxias com arcos gravitacionais

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Cypriano, E. S.; Sodrã©, L., Jr.; Kneib, J.-P.; Campusano, L.

    2003-08-01

    Nesse trabalho é apresentado um estudo do conteúdo de massa do aglomerado de galáxias A586 (z = 0.171) bem como sua distribuição espacial. Isso foi feito a partir de dados de espectroscopia multi-objeto e imageamento obtidos com o instrumento GMOS acoplado ao telescópio Gemini-Norte. A massa desse aglomerado foi estudada a partir da posição dos seus arcos gravitacionais (lentes fortes), da medida estatística da distorção na forma das galáxias de fundo (lentes fracas) e através da dispersão de velocidades de uma amostra de cerca de 30 galáxias pertencentes ao aglomerado (teorema do virial). Os dois primeiros métodos não dependem do estado dinâmico do aglomerado, enquanto que o terceiro sim. Desse modo, comparando seus resultados pode-se estimar o grau de relaxamento desse sistema. Dados de raios X presentes na literatura também serão incluídos nessa análise. Nossos resultados preliminares a partir das técnicas de lentes fracas, mostram que, supondo que a distribuição de massa desse aglomerado seja a de uma esfera isotérmica, espera-se que ele apresente uma dispersão de velocidades de 1330+/-78 km s-1, em contradicao com medidas similares feitas por Dahle et al. 2002 que encontram valores tão altos quanto 1680 km s-1. Já o estudo dinâmico resultou numa dispersão de velocidades de ~950 km s-1.

  6. Differentiation inducing factor-1 (DIF-1) induces gene and protein expression of the Dictyostelium nuclear calmodulin-binding protein nucleomorphin.

    PubMed

    O'Day, Danton H; Poloz, Yekaterina; Myre, Michael A

    2009-02-01

    The nucleomorphin gene numA1 from Dictyostelium codes for a multi-domain, calmodulin binding protein that regulates nuclear number. To gain insight into the regulation of numA, we assessed the effects of the stalk cell differentiation inducing factor-1 (DIF-1), an extracellular signalling molecule, on the expression of numA1 RNA and protein. For comparison, the extracellular signalling molecules cAMP (mediates chemotaxis, prestalk and prespore differentiation) and ammonia (NH(3)/NH(4)(+); antagonizes DIF) were also studied. Starvation, which is a signal for multicellular development, results in a greater than 80% decrease in numA1 mRNA expression within 4 h. Treatment with ammonium chloride led to a greater than 90% inhibition of numA1 RNA expression within 2 h. In contrast, the addition of DIF-1 completely blocked the decrease in numA1 gene expression caused by starvation. Treatment of vegetative cells with cAMP led to decreases in numA1 RNA expression that were equivalent to those seen with starvation. Western blotting after various morphogen treatments showed that the maintenance of vegetative levels of numA1 RNA by DIF-1 in starved cells was reflected in significantly increased numA1 protein levels. Treatment with cAMP and/or ammonia led to decreased protein expression and each of these morphogens suppressed the stimulatory effects of DIF-1. Protein expression levels of CBP4a, a calcium-dependent binding partner of numA1, were regulated in the same manner as numA1 suggesting this potential co-regulation may be related to their functional relationship. NumA1 is the first calmodulin binding protein shown to be regulated by developmental morphogens in Dictyostelium being upregulated by DIF-1 and down-regulated by cAMP and ammonia. PMID:19000924

  7. HELAC-Onia 2.0: An upgraded matrix-element and event generator for heavy quarkonium physics

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Shao, Hua-Sheng

    2016-01-01

    We present an upgraded version (denoted as version 2.0) of the program HELAC-ONIA for the automated computation of heavy-quarkonium helicity amplitudes within non-relativistic QCD framework. The new code has been designed to include many new and useful features for practical phenomenological simulations. It is designed for job submissions under cluster environment for parallel computations via PYTHON scripts. We have interfaced HELAC-ONIA to the parton shower Monte Carlo programs PYTHIA 8 and QEDPS to take into account the parton-shower effects. Moreover, the decay module guarantees that the program can perform the spin-entangled (cascade-)decay of heavy quarkonium after its generation. We have also implemented a reweighting method to automatically estimate the uncertainties from renormalization and/or factorization scales as well as parton-distribution functions to weighted or unweighted events. A further update is the possibility to generate one-dimensional or two-dimensional plots encoded in the analysis files on the fly. Some dedicated examples are given at the end of the writeup.

  8. The Role of Haemoglobin A1c in Screening Obese Children and Adolescents for Glucose Intolerance and Type 2 Diabetes.

    PubMed

    Galhardo, Júlia; Shield, Julian

    2015-01-01

    hemoglobina glicada com fins diagnósticos até um maior número de estudos estar disponível. O homeostasis model assessment for insulin resistance e a razão triglicerídeos:colesterol HDL demonstraram uma maior exatidão diagnóstica, podendo ser calculados com base numa amostra única em jejum.

  9. Bundle Approach to Reduce Bloodstream Infections in Neutropenic Hematologic Patients with a Long-Term Central Venous Catheter.

    PubMed

    Martinez, Jose Manuel; Leite, Luís; França, Daniela; Capela, Rita; Viterbo, Luísa; Varajão, Natalina; Martins, Ângelo; Oliveira, Isabel; Domingues, Nélson; Moreira, Ilídia; Santo, Ana; Trigo, Filipe; Mariz, Jose

    2015-01-01

    Introdução: O objetivo deste estudo foi reduzir através de um pacote de medidas as infeções sistémicas e as taxas de infeções com origem no cateter venoso central nos doentes hematológicos em neutropenia com cateter venoso central de longa duração. Material e Métodos: Estudo prospetivo não randomizado realizado na unidade onco-hematológica do Instituto Português de Oncologia do Porto no período compreendido entre 1 de agosto de 2010 até 31 de janeiro de 2012. Durante este período foi introduzido um pacote de medidas (grupo estudo) e comparados os resultados nos 6 meses anteriores à sua implementação (grupo de controlo). As medidas consistiram na utilização de conectores de pressão neutra em detrimento dos conectores de pressão positiva, na sua troca mais frequente e numa solução anti-séptica mais eficaz. Foram incluídos neste estudo 116 doentes hematológicos com cateter venoso central de longa duração inserido por um período superior a 72 h. Foram contabilizados 8 867 dias de cateter (6 756 dias de cateter venoso central no grupo estudo e 2 111 dias de cateter venoso central no grupo de controlo). Resultados: Obteve-se uma redução significativa nas taxas de infeções sistémicas e infeções com origem no cateter venoso central. As taxas de infeções sistémicas: [32,69 (grupo de controlo) vs. 9,43 (grupo estudo)], com uma redução de incidência de 71% [risco relativo 0,2886, CI 95% (0,1793 - 0,4647), p < 0,001] e taxas de infeções com origem no cateter venoso central: [17,53 (grupo de controlo) vs. 4,73 (grupo estudo)], com redução de incidência de 71% [risco relativo 0,2936, CI 95% (0,1793 - 0,5615), p < 0,014]. Não foi encontrada diferença significativa (p > 0,05) na contagem de neutrófilos à data da colheita das amostras de hemoculturas entre ambos os grupos: 69% (< 500 neutrófilos/mm3) [71% (grupo estudo) vs. 68% (grupo de controlo)]. Conclusões: A introdução deste pacote de medidas baseado nas variáveis do

  10. Inclusion of Astronomy Themes in an Inovative Approach of Informal Physics Teaching for High School Students. (Spanish Title: Inclusión de Temas Astronómicos en Uma Abordaje Innovadora de la Enseñanza Informal de Física Para Estudiantes de Secumdaria.) Inclusão de Temas Astronômicos Numa Abordagem Inovadora do Ensino Informal de Física Para Estudantes do Ensino Médio

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Tiara Mota, Aline; de Morais Bonomini, Iracema Ariel; Meloni Martins Rosado, Ricardo

    2009-12-01

    The current work reports on an experience on Astronomy education at the Federal University of Itajubá through an extra-curricular course offered for High School students. This initiative was motivated by the low attention paid to the Astronomy subjects at this stage of the Brazilian Formal Education, in spite that the National Curricular Parameters (PCN and PCN+, in Brazil) point out the importance of their inclusion Este artículo relata una experiencia en la enseñanza de la astronomía efectuada en la Universidad Federal de Itajubá en la forma de un curso de extensión orientado para los estudiantes del colegio secundario. Esta iniciativa surgió de constatar la poca atención dada a la Astronomía en esta etapa de la Educación formal brasileña, a pesar que los Parámetros Curriculares Nacionales (PCN y PCN+, en Brasil) destacan la importancia de su inclusión. Este artigo relata uma experiência em ensino de Astronomia realizada na Universidade Federal de Itajubá na forma de um curso de extensão voltado para alunos do Ensino Médio. Esta iniciativa surgiu da pouca atenção que se dá à Astronomia nesta etapa da Educação embora os Parâmetros Curriculares Nacionais (PCN e PCN+) apontem a importância de sua inclusão.

  11. Abundância química de simbióticas na direção do bojo galáctico

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Luna, G. J. M.; Costa, R. D. D.

    2003-08-01

    O estudo da distribuição de metalicidades de gigantes K no Bojo indica um largo intervalo com valores entre 0.1 a 10 vezes o valor solar. As razões elementais Ca/Fe, Si/Fe, Mg/Fe são típicas de estrelas do halo, apontando para um processo rápido de enriquecimento, via estrelas masssivas (SN's tipo II). No entanto, este cenário não combina com os resultados derivados de nebulosas planetárias do bojo tais como os de Ratag et al. (1992, A&A,255,270), Cuisinier et al.(2000, A&A,353, 543), Escudero e Costa (2001, A&A,380, 300),que obtêm abundâncias análogas às do disco. Neste cenário, o estudo de estrelas simbióticas possibilita uma abordagem particularmente apropriada para o problema das abundâncias químicas de estrelas de massa intermediária em estágios avançados da evoluçao estelar. Apresentamos aqui os resultados da determinacão das abundâncias do grupo do CNO numa extensa amostra de simbióticas do bojo. Aliás, com a disponibilidade de espectros no visível determinamos também abundâncias de Ar, Ne, S e He, fundamentais para analisar os processos de enriquecimento químico ocorridos ao longo da evolução estelar, bem como a evolução química do meio interestelar. Com os espectros UV do satelite IUE obtivemos abundâncias de C, necessárias no estudo da evolução dos sistemas. As relaçoes C/N-O/N mostram que o material nebular é produto do vento da componente gigante e não dos eventos de nova que às vezes acontecem nestes sistemas, como foi mostrado por Nussbaumer et al (1988,A&A,198,179). As abundâncias de Ar, S, Ne e O são compativeis com resultados de fontes no disco e bojo, seguindo o gradiente proposto por muitos autores na literatura a partir de diferentes objetos como cefeidas, nebulosas planetárias e anãs G. (CAPES,FAPESP,CNPq)

  12. [Relational and reproductive trajectories leading to adolescent pregnancy in Portugal: a national and regional characterization].

    PubMed

    Pires, Raquel; Pereira, Joana; Pedrosa, Anabela Araújo; Bombas, Teresa; Vilar, Duarte; Vicente, Lisa; Canavarro, Maria Cristina

    2014-01-01

    Introdução: Este estudo pretendeu caracterizar as trajetórias relacionais e reprodutivas conducentes à gravidez na adolescência em Portugal, explorando a existência de especificidades regionais.Material e Métodos: O estudo decorreu entre 2008 e 2013 em 42 serviços de saúde públicos. A amostra, nacionalmente representativa, incluiu 459 grávidas com idades entre os 12 e os 19 anos. Os dados foram obtidos por autorrelato, através de uma ficha de caracterização construída para o efeito.Resultados: Independentemente de terem tido um (59,91%) ou múltiplos parceiros sexuais (40,09%), as adolescentes engravidaram de forma mais frequente numa relação de namoro, utilizando contraceção à data da conceção e tendo identificado a falha contracetiva que esteve na origem da gravidez (39,22%). A nível regional, outras trajetórias surgiram com elevada prevalência, refletindo opções como a decisão de engravidar (Alentejo/Açores), a não utilização de contraceção (Centro/Madeira) ou a sua utilização ineficaz sem que a falha contracetiva fosse identificada (Madeira). As relações de namoro revelaram-se maioritariamente duradouras (> 19 meses), com homens mais velhos (> 4 anos) e fora do sistema de ensino (75,16%); estes resultados foram particularmente expressivos quando a gravidez foi planeada.Discussão: O conhecimento gerado por este estudo reflete a necessidade de investir em abordagens preventivas que atendam às necessidades específicas das jovens de cada região e integrem a população masculina de maior risco.Conclusão: Os nossos resultados podem contribuir para o delineamento de políticas de saúde mais eficazes e para uma atuação multidisciplinar mais informada ao nível da educação sexual e do planeamento familiar nas diferentes regiões do país.

  13. Measuring emotional awareness from a cognitive-developmental perspective: Portuguese adaptation studies of the levels of emotional awareness scale.

    PubMed

    Torrado, Marco; Ouakinin, Sílvia; Lane, Richard

    2013-01-01

    Introdução: A Escala de Níveis de Consciência Emocional (LEAS) foi desenvolvida para avaliar o constructo consciência emocional, numa perspectiva cognitivo-desenvolvimentista e influenciada pelas Teorias de Piaget e Werner. É composta por 20 situações ou cenários que evocam emoções e tem sido usada em múltiplas investigações nos domínios da regulação emocional, alexitimia e perturbações psiquiátricas. Trata-se de uma medida bem documentada, validada e precisa. Em virtude da sua extensão, alguns investigadores têm vindo a utilizar uma das formas paralelas que compõe a versão completa, a LEAS-A, sendo contudo notória a vacuidade de estudos que descrevam as qualidades psicométricas desta versão. Face à inexistência de uma medida de caracterização da organização da experiência emocional para a população portuguesa, desenvolveu-se a versão portuguesa da LEAS, caracterizaram-se diversos indicadores de precisão e validade, assim como para a versão reduzida LEAS-A. Materiais e Métodos: Foram desenvolvidos três estudos com estas versões, dois deles com recurso a estudantes universitários e um outro com uma amostra da população em geral. Resultados: A versão portuguesa demonstrou níveis elevados de precisão, mais robustos do que os encontrados em estudos de adaptação da escala noutros países. A LEAS-A apresentou bons níveis de precisão e indicadores de validade discriminante e concorrente. As pontuações obtidas na LEAS-A mostraram-se independentes da presença de afecto negativo e associaram-se significativamente a um estilo cognitivo externalizado, próprio do funcionamento alexitímico. Conclusões: As versões portuguesas da LEAS e da LEAS-A apresentam qualidades psicométricas muito adequadas, o que permite o seu uso científico. São discutidas as implicações da sua utilização nos contextos clínico e de investigação.

  14. [Weight control attempts among Portuguese adults: prevalence, motives and behavioral strategies].

    PubMed

    Santos, Inês; Andrade, Ana M; Teixeira, Pedro J

    2015-01-01

    Introdução: Em Portugal não existem dados atuais sobre tentativas de controlo do peso nem sobre estratégias e motivos na base dessas tentativas na população. Este estudo teve como objectivos determinar a prevalência das tentativas de perda/manutenção do peso e identificar as estratégias comportamentais e os motivos associados, numa amostra representativa da população adulta portuguesa. Material e Métodos: Estudo transversal constituído por 1098 indivíduos adultos. A informação sociodemográfica, os dados antropométricos e as estratégias e motivos associados à perda/manutenção do peso foram recolhidos por entrevista telefónica. Resultados: Cerca de 44% dos adultos portugueses (53% de mulheres e 35% dos homens) estão ativamente a tentar controlar o peso. Salienta-se que 22% das mulheres com peso normal tentam perder peso e que 53% dos homens e 34% das mulheres com peso excessivo não o fazem. Entre os homens, 49% com nível educacional superior estão a tentar controlar o peso versus 32% com nível educacional básico. A estratégia mais frequentemente adoptada para gerir o peso é o consumo regular de hortícolas e os motivos mais referenciados são melhorar a saúde/prevenir doenças e melhorar o bem-estar. Discussão e Conclusão: Mais de metade das mulheres e cerca de um terço dos homens em Portugal estão ativamente a tentar gerir o seu peso, utilizando estratégias comportamentais consistentes com as recomendações de saúde pública. Os motivos de saúde e bem-estar predominam sobre os restantes. Este estudo contribui para o conhecimento da gestão do peso em Portugal, alertando para o desenvolvimento de estratégias de prevenção da obesidade adequadas ao perfil da população.

  15. [Alcohol consumption in the schooled youth: an old question revisited].

    PubMed

    Marques, Marilia; Viveiro, Carolina; Passadouro, Rui

    2013-01-01

    Introdução: É principalmente na adolescência que os jovens procuram novas experiências. O consumo de álcool surge neste contexto como uma atitude banalizada e, por vezes, até incitada socialmente, já que o acesso a bebidas alcoólicas é facilitado. Associa-se a comportamentos de risco, com consequências sérias do ponto de vista de saúde pública. O nosso objectivo é caracterizar os padrões de consumo de álcool numa amostra de adolescentes residentes no distrito de Leiria. Material e Métodos: Estudo transversal, descritivo, através de um questionário anónimo aplicado em alunos do distrito de Leiria. Resultados: A amostra final foi de 405 indivíduos, 56% do sexo feminino, com idade média de 16,5 ± 1 anos (15 - 18 anos). A maioria (48%) frequentava o 10º ano, 15,4% reprovaram pelo menos uma vez. Noventa por cento dos inquiridos afirmaram ter experimentado bebidas alcoólicas pelo menos uma vez. O primeiro contacto com o álcool ocorreu preferencialmente com amigos (63%), na maioria dos casos por curiosidade (47%). Os resultados apontaram para maiores índices de consumo de cerveja e maior insucesso escolar no género masculino, comparativamente ao género feminino, que apresentava um maior consumo de bebidas brancas. Em ambos os sexos verificou-se uma tendência para o binge drinking. A maioria dos inquiridos (60%) consumia 2 a 3 copos por ocasião mas cerca de 30% dos rapazes afirmaram consumir mais de quatro copos por ocasião (7% até ficarem embriagados), tendência que não se verificou nas raparigas. A maioria dos consumos efectuou-se nos bares e discotecas (60%). Constatou-se que 41% dos inquiridos saíam à noite, e 70% ingeriam bebidas alcoólicas; 66% começaram a sair à noite entre os 13 e os 15 anos de idade e 9% já tinham experimentado drogas pelo menos uma vez. Os jovens estão mal informados quanto ao consumo do álcool: 20% achavam que as bebidas alcoólicas podem matar a sede, 34% acreditavam que abrem o apetite, 15

  16. [Prevalence of use of preimplantation genetic diagnosis in Unidade Clínica de Paramiloidose from Centro Hospitalar do Porto].

    PubMed

    Valdrez, Kátia; Alves, Elisabete; Coelho, Teresa; Silva, Susana

    2014-01-01

    IntroduçÉo: A Polineuropatia Amiloidótica Familiar, cujo maior foco mundial é em Portugal, é reconhecida pelo Conselho Nacional de ProcriaçÉo Medicamente Assistida como uma doença grave elegível para Diagnóstico Genético Pré-ImplantaçÉo. Pretendemos determinar a prevalência do uso de Diagnóstico Genético Pré-ImplantaçÉo nos portadores de Polineuropatia Amiloidótica Familiar seguidos na Unidade Clínica de Paramiloidose, Centro Hospitalar do Porto, e identificar os fatores associados.Material e Métodos: Entre janeiro e maio de 2013, recrutamos sistematicamente uma amostra representativa de portadores entre os 18 e 55 anos. A análise baseia-se em 111 portadores com diagnóstico familiar prévio da doença, que referiram estar envolvidos numa tentativa de gravidez alguma vez depois de 2001. Através de questionário autoadministrado, recolhemos dados sociodemográficos e informações sobre o uso de Diagnóstico Genético Pré-ImplantaçÉo. Para comparaçÉo de proporções, utilizamos o teste de qui-quadrado. Odds ratios brutos e ajustados e os respetivos intervalos de confiança de 95% (IC 95%) foram estimados através de regressÉo logística multivariada.Resultados: A prevalência de uso de Diagnóstico Genético Pré-ImplantaçÉo foi de 20,7% (IC 95%: 13,6-29,5). Após ajuste, o rendimento familiar superior a 1000 '¬/mês (OR = 11,87; IC 95% 2,87-49,15) associou-se diretamente ao uso Diagnóstico Genético Pré-ImplantaçÉo, enquanto portadores com diagnóstico individual (OR = 0,15; IC 95% 0,04-0,57) e filhos nascidos após 2001 (OR = 0,07; IC 95% 0,02-0,32) revelaram uma prevalência de uso significativamente menor do que aqueles com diagnóstico individual e filhos nascidos antes de 2001.DiscussÉo: A baixa prevalência de uso de Diagnóstico Genético Pré-ImplantaçÉo, bem como a utilizaçÉo menos frequente da técnica por aqueles com um rendimento familiar mais baixo evidenciam a import'ncia de melhorar a acessibilidade ao Diagn

  17. [Skin disease in liver and kidney transplant recipients referred to the department of dermatology and venereology].

    PubMed

    Fernandes, Sónia; Carrelha, Ana Sofia; Marques Pinto, Gabriela; Nolasco, Fernando; Barroso, Eduardo; Cardoso, Jorge

    2013-01-01

    Introdução: Foram descritas várias doenças cutâneas em doentes transplantados, em relação com a terapêutica imunossupressora instituída. Pretendemos caracterizar o espectro clínico das patologias dermatológicas e comparar os diagnósticos entre os doentes transplantados hepáticos e os doentes transplantados renais.Material e Métodos: Estudo descritivo e retrospectivo através da consulta de processos clínicos de todos os doentes submetidos a transplante hepático ou renal entre 2000 - 2010 referenciados à Consulta de Dermatologia e Venereologia.Resultados: Observámos 319 doentes transplantados (23,5%) e apurámos 410 diagnósticos (230 na sub-população com transplante hepático e 180 na sub-população com transplante renal), divididos em quatro grupos: 1) infecções cutâneas; 2) cancro cutâneo ou lesões precursoras; 3) manifestações cutâneas relacionadas com efeitos secundários de fármacos; 4) outras patologias dermatológicas não iatrogénicas. As infecções cutâneas foram as mais observadas (42,2%), em média 32,7 meses após o transplante. Este grupo incluiu 20,5% de infecções fúngicas, 12,7% virais e 8,5% bacterianas. Identificámos patologia tumoral e lesões precursoras em 11,7% dos casos, em média 44,8 meses após o transplante e assumindo maior importância na sub-população com transplante renal (20,6%vs 4,8% nos transplantados hepáticos; P < 0,001). Os transplantados renais apresentaram predomínio de carcinomas espinocelulares (CEC) sobre os casos de carcinomas basocelulares (CBC), numa razão CEC:CBC de 1,3:1 mas nos transplantados hepáticos verificou- se uma razão CBC: carcinomas de 3,5:1. Ocorreram efeitos secundários de fármacos em 10,5% dos casos e outras patologiasdermatológicas não iatrogénicas em 35,6%.Discussão: Apesar da patologia tumoral ser a mais referida na literatura, as infecções cutâneas foram as mais observadas na nossa amostra. As diferenças significativas entre as duas sub

  18. Prognostic Factors after Liver Resection for Colorectal Liver Metastasis.

    PubMed

    Matias, Margarida; Casa-Nova, Mafalda; Faria, Mariana; Pires, Ricardo; Tato-Costa, Joana; Ribeiro, Leonor; Costa, Luís

    2015-01-01

    Introdução: A ressecção de metástases hepáticas é o único tratamento potencialmente curativo em doentes com metástases hepáticas de cancro colo-rectal, resultando numa sobrevida global de 36-58%. Até à data foram publicados múltiplos trabalhos sobre factores de prognóstico após hepatectomia em doentes com metástases hepáticas de cancro colo-rectal. No entanto, poucos apresentaram modelos de prognóstico que permitam estratificar os doentes em grupos de risco, relacionando-os com sobrevida após metastasectomia hepática.Objectivos: Identificar, avaliar e comparar os diferentes scores de prognóstico após recessão de metástases hepáticas de cancro colo-rectal.Material e Métodos: Pesquisa na PubMed, Cochrane e Embase, de artigos publicados entre 1990 e 2013, usando os termos ‘recessão hepática’, ‘cancro colo-rectal’, ‘metástases hepáticas’, ‘hepatectomia’, ‘prognóstico’ e ‘modelo’. Apenas os artigos que apresentaram modelos de prognóstico com base em variáveis clínico-patológicas foram incluídos.Resultados: De 1996 a Junho de 2013, 19 modelos de prognóstico foram identificados, incluindo um nomograma. Foram identificados 30 diferentes factores prognósticos, embora nenhum factor fosse comum a todos os modelos prognósticos. Os factores mais frequentemente incluídos foram: número de metástases hepáticas, envolvimento ganglionar regional do tumor primário, nível sérico de CEA pré-operatório e tamanho máximo das metástases. A amostra mediana foi de 305 doentes (81-1 568 doentes) e o seguimento mediano foi de 33 meses (16-54 meses). Todos os estudos foram retrospectivos e utilizaram o modelo proporcional de Cox para análise multivariada.Conclusão: Vários factores têm sido constantemente reportados como tendo valor prognostico após ressecção de metástases hepáticas de cancro colorectal, no entanto, não existe consenso sobre o modelo ideal de prognóstico.

  19. [SwapINN: analytic study about prescription swaps at pharmacies].

    PubMed

    Moutinho, Ana; Alexandra, Denise; Rodrigues, Renata

    2014-01-01

    Introdução: A prescrição obrigatória por DCI foi imposta em 2012, para redução de custos do SNS e motivou discussão entre as partes envolvidas. Estudámos, numa população real, a dinâmica prescrição-dispensa de medicamentos.Objetivos: Determinar a percentagem de prescrições substituídas; avaliar os fatores associados à substituição; identificar as respetivas justificações; quantificar os diferenciais dos custos para utente e Serviço Nacional de Saúde.Material e Métodos: Estudo analítico. Amostra de conveniência constituída pelos medicamentos prescritos de uma unidade de saúde, de 19 a 23 de Dezembro de 2011. Três dias depois, os utentes foram entrevistados telefonicamente. Software: Excel® e SPSS®. Testes: Qui-quadrado e Mann-Whitney; n.s. = 0,05.Resultados: Total de 255 prescrições. A maioria foi efetuada a mulheres (62%), idade média 52 anos, 4 anos de escolaridade (33%) e para situações agudas (53%). Foram substituídas 31% das prescrições, sem relação com idade, sexo ou escolaridade, nem com o médico prescritor ou farmácia. Os medicamentos prescritos para situações crónicas foram menos substituídos (p < 0,001), assim como as prescrições de marca (p < 0,001). Os anti-infeciosos e anti-alérgicos foram os grupos com mais substituições (p = 0,009). Os utentes não se aperceberam da substituição em 72% dos casos. Nos casos de substituição, o utente pagou, em média, mais 79% que o prescrito e o Serviço Nacional de Saúde 5%.Discussão/Conclusão: Verificou-se substituição de 31% das prescrições, com mais custos para utente e Serviço Nacional de Saúde. Consideramos possível viés de seleção, informação e registo. Sendo agora obrigatória a prescrição por DCI, sugerimos a análise regular, a nível nacional, com base nas aplicações informáticas em uso, da prescrição e respetiva dispensa.

  20. [Burnout in Portuguese Healthcare Professionals: An Analysis at the National Level].

    PubMed

    Marôco, João; Marôco, Ana Lúcia; Leite, Ema; Bastos, Cristina; Vazão, Maria José; Campos, Juliana

    2016-01-01

    Introdução: O burnout é uma síndrome psicológica, caracterizada por elevada exaustão emocional, elevada despersonalização e baixa realização profissional, que conduz à erosão dos valores pessoais, profissionais e de saúde. Este estudo reporta a prevalência do burnout em profissionais de saúde Portugueses. Material e Métodos: Os níveis de burnout foram estimados pelo Maslach Burnout Inventory - Human Services Survey numa escala ordinal de zero (nunca) a seis (sempre) pontos. A amostra foi constituída por 1 262 enfermeiros e 466 médicos com médias de idade de 36,8 anos (DP = 12,2) e 38,7 (DP = 11,0), respetivamente. Os participantes foram provenientes de todos os distritos nacionais (35% Lisboa; 18% Porto; 6% Aveiro, 6% Setúbal, 5% Coimbra; 5% regiões autónomas), com atuação em meio hospitalar (54%), centros de saúde (Unidade de Saúde Familiar - 30%; Unidades de Cuidados de Saúde Primários - 8%) e outras instituições públicas/privadas (8%). Resultados: A análise dos níveis de burnout revelou que ambas as categorias profissionais apresentaram níveis moderados a elevados de burnout (M = 3,0; DP = 1,7) não sendo significativas as diferenças entre as duas profissões. Vila Real (M = 3,8; SD = 1,7) e a Madeira (M = 2,5; DP = 1,5) são as regiões onde os níveis de burnout são mais e menos elevados, respetivamente. Os níveisde burnout não diferiram significativamente entre Hospitais, Unidades de Cuidados de Saúde Personalizados e Unidades de Saúde Familiares. Os profissionais com maior tempo na função são menos acometidos por burnout (r = -0,15) não ocorrendo associação significativa com a duração da jornada de trabalho (r = 0,04). A má qualidade das condições de trabalho foi o melhor preditor do burnout (r = -0,35). Discussão: A ocorrência da síndrome de burnout em profissionais de saúde portugueses é frequente, estando associada à percepção de más condições de trabalho e à menor duração do tempo de servi

  1. Tank binding kinase 1 is a centrosome-associated kinase necessary for microtubule dynamics and mitosis.

    PubMed

    Pillai, Smitha; Nguyen, Jonathan; Johnson, Joseph; Haura, Eric; Coppola, Domenico; Chellappan, Srikumar

    2015-12-10

    TANK Binding Kinase 1 (TBK1) is a non-canonical IκB kinase that contributes to KRAS-driven lung cancer. Here we report that TBK1 plays essential roles in mammalian cell division. Specifically, levels of active phospho-TBK1 increase during mitosis and localize to centrosomes, mitotic spindles and midbody, and selective inhibition or silencing of TBK1 triggers defects in spindle assembly and prevents mitotic progression. TBK1 binds to the centrosomal protein CEP170 and to the mitotic apparatus protein NuMA, and both CEP170 and NuMA are TBK1 substrates. Further, TBK1 is necessary for CEP170 centrosomal localization and binding to the microtubule depolymerase Kif2b, and for NuMA binding to dynein. Finally, selective disruption of the TBK1-CEP170 complex augments microtubule stability and triggers defects in mitosis, suggesting that TBK1 functions as a mitotic kinase necessary for microtubule dynamics and mitosis.

  2. Function of donor cell centrosome in intraspecies and interspecies nuclear transfer embryos

    SciTech Connect

    Zhong Zhisheng; Zhang Gang; Meng Xiaoqian; Zhang Yanling; Chen Dayuan; Schatten, Heide; Sun Qingyuan . E-mail: sunqy1@yahoo.com

    2005-05-15

    Centrosomes, the main microtubule-organizing centers (MTOCs) in most animal cells, are important for many cellular activities such as assembly of the mitotic spindle, establishment of cell polarity, and cell movement. In nuclear transfer (NT), MTOCs that are located at the poles of the meiotic spindle are removed from the recipient oocyte, while the centrosome of the donor cell is introduced. We used mouse MII oocytes as recipients, mouse fibroblasts, rat fibroblasts, or pig granulosa cells as donor cells to construct intraspecies and interspecies nuclear transfer embryos in order to observe centrosome dynamics and functions. Three antibodies against centrin, {gamma}-tubulin, and NuMA, respectively, were used to stain the centrosome. Centrin was not detected either at the poles of transient spindles or at the poles of first mitotic spindles. {gamma}-tubulin translocated into the two poles of the transient spindles, while no accumulated {gamma}-tubulin aggregates were detected in the area adjacent to the two pseudo-pronuclei. At first mitotic metaphase, {gamma}-tubulin was translocated to the spindle poles. The distribution of {gamma}-tubulin was similar in mouse intraspecies and rat-mouse interspecies embryos. The NuMA antibody that we used can recognize porcine but not murine NuMA protein, so it was used to trace the NuMA protein of donor cell in reconstructed embryos. In the pig-mouse interspecies reconstructed embryos, NuMA concentrated between the disarrayed chromosomes soon after activation and translocated to the transient spindle poles. NuMA then immigrated into pseudo-pronuclei. After pseudo-pronuclear envelope breakdown, NuMA was located between the chromosomes and then translocated to the spindle poles of first mitotic metaphase. {gamma}-tubulin antibody microinjection resulted in spindle disorganization and retardation of the first cell division. NuMA antibody microinjection also resulted in spindle disorganization. Our findings indicate that (1) the

  3. Walker River Paiutes: A Tribal History.

    ERIC Educational Resources Information Center

    Johnson, Edward C.

    The Northern Paiute people of Nevada's Walker Lake area were known as the Agai Diccutta (Trout Eaters); they called themselves the Numa, or the People. For as long as anyone could recall, they had lived in the area, catching the huge trout from the lake and harvesting the pinon nuts and other foods from the surrounding desert. In the 1820's the…

  4. NuMA-microtubule interactions are critical for spindle orientation and the morphogenesis of diverse epidermal structures.

    PubMed

    Seldin, Lindsey; Muroyama, Andrew; Lechler, Terry

    2016-01-01

    Mitotic spindle orientation is used to generate cell fate diversity and drive proper tissue morphogenesis. A complex of NuMA and dynein/dynactin is required for robust spindle orientation in a number of cell types. Previous research proposed that cortical dynein/dynactin was sufficient to generate forces on astral microtubules (MTs) to orient the spindle, with NuMA acting as a passive tether. In this study, we demonstrate that dynein/dynactin is insufficient for spindle orientation establishment in keratinocytes and that NuMA's MT-binding domain, which targets MT tips, is also required. Loss of NuMA-MT interactions in skin caused defects in spindle orientation and epidermal differentiation, leading to neonatal lethality. In addition, we show that NuMA-MT interactions are also required in adult mice for hair follicle morphogenesis and spindle orientation within the transit-amplifying cells of the matrix. Loss of spindle orientation in matrix cells results in defective differentiation of matrix-derived lineages. Our results reveal an additional and direct function of NuMA during mitotic spindle positioning, as well as a reiterative use of spindle orientation in the skin to build diverse structures. PMID:26765568

  5. Opposing motor activities are required for the organization of the mammalian mitotic spindle pole

    PubMed Central

    1996-01-01

    We use both in vitro and in vivo approaches to examine the roles of Eg5 (kinesin-related protein), cytoplasmic dynein, and dynactin in the organization of the microtubules and the localization of NuMA (Nu-clear protein that associates with the Mitotic Apparatus) at the polar ends of the mammalian mitotic spindle. Perturbation of the function of Eg5 through either immunodepletion from a cell free system for assembly of mitotic asters or antibody microinjection into cultured cells leads to organized astral microtubule arrays with expanded polar regions in which the minus ends of the microtubules emanate from a ring-like structure that contains NuMA. Conversely, perturbation of the function of cytoplasmic dynein or dynactin through either specific immunodepletition from the cell free system or expression of a dominant negative subunit of dynactin in cultured cells results in the complete lack of organization of microtubules and the failure to efficiently concentrate the NuMA protein despite its association with the microtubules. Simultaneous immunodepletion of these proteins from the cell free system for mitotic aster assembly indicates that the plus end- directed activity of Eg5 antagonizes the minus end-directed activity of cytoplasmic dynein and a minus end-directed activity associated with NuMA during the organization of the microtubules into a morphologic pole. Taken together, these results demonstrate that the unique organization of the minus ends of microtubules and the localization of NuMA at the polar ends of the mammalian mitotic spindle can be accomplished in a centrosome-independent manner by the opposing activities of plus end- and minus end-directed motors. PMID:8896597

  6. Interaction of the transforming acidic coiled-coil 1 (TACC1) protein with ch-TOG and GAS41/NuBI1 suggests multiple TACC1-containing protein complexes in human cells.

    PubMed Central

    Lauffart, Brenda; Howell, Scott J; Tasch, Jason E; Cowell, John K; Still, Ivan H

    2002-01-01

    Dysregulation of the human transforming acidic coiled-coil (TACC) proteins is thought to be important in the evolution of breast cancer and multiple myeloma. However, the exact role of these proteins in the oncogenic process is currently unknown. Using the full-length TACC1 protein as bait to screen a human mammary epithelial cDNA library, we have identified two genes that are also amplified and overexpressed in tumours derived from different cellular origins. TACC1 interacts with the C-terminus of both the microtubule-associated colonic and hepatic tumour overexpressed (ch-TOG) protein, and the oncogenic transcription factor glioma amplified sequence 41/NuMA binding protein 1 (GAS41/NuBI1; where NuMA stands for nuclear mitotic apparatus protein 1). This suggests that the TACC proteins can form multiple complexes, dysregulation of which may be an important step during tumorigenesis. PMID:11903063

  7. An N-terminal nuclear localization sequence but not the calmodulin-binding domain mediates nuclear localization of nucleomorphin, a protein that regulates nuclear number in Dictyostelium.

    PubMed

    Myre, Michael A; O'Day, Danton H

    2005-06-24

    Nucleomorphin is a novel nuclear calmodulin (CaM)-binding protein (CaMBP) containing an extensive DEED (glu/asp repeat) domain that regulates nuclear number. GFP-constructs of the 38 kDa NumA1 isoform localize as intranuclear patches adjacent to the inner nuclear membrane. The translocation of CaMBPs into nuclei has previously been shown by others to be mediated by both classic nuclear localization sequences (NLSs) and CaM-binding domains (CaMBDs). Here we show that NumA1 possesses a CaMBD (171EDVSRFIKGKLLQKQQKIYKDLERF195) containing both calcium-dependent-binding motifs and an IQ-like motif for calcium-independent binding. GFP-constructs containing only NumA1 residues 1-129, lacking the DEED and CaMBDs, still localized as patches at the internal periphery of nuclei thus ruling out a direct role for the CaMBD in nuclear import. These constructs contained the amino acid residues 48KKSYQDPEIIAHSRPRK64 that include both a putative bipartite and classical NLS. GFP-bipartite NLS constructs localized uniformly within nuclei but not as patches. As with previous work, removal of the DEED domain resulted in highly multinucleate cells. However as shown here, multinuclearity only occurred when the NLS was present allowing the protein to enter nuclei. Site-directed mutation analysis in which the NLS was changed to 48EF49 abolished the stability of the GFP fusion at the protein but not RNA level preventing subcellular analyses. Cells transfected with the 48EF49 construct exhibited slowed growth when compared to parental AX3 cells and other GFP-NumA1 deletion mutants. In addition to identifying an NLS that is sufficient for nuclear translocation of nucleomorphin and ruling out CaM-binding in this event, this work shows that the nuclear localization of NumA1 is crucial to its ability to regulate nuclear number in Dictyostelium. PMID:15896312

  8. A splicing alteration of 4.1R pre-mRNA generates 2 protein isoforms with distinct assembly to spindle poles in mitotic cells.

    PubMed

    Delhommeau, François; Vasseur-Godbillon, Corinne; Leclerc, Philippe; Schischmanoff, Pierre-Olivier; Croisille, Laure; Rince, Patricia; Morinière, Madeleine; Benz, Edward J; Tchernia, Gil; Tamagnini, Gabriel; Ribeiro, Leticia; Delaunay, Jean; Baklouti, Faouzi

    2002-10-01

    The C-terminal region of erythroid cytoskeletal protein 4.1R, encoded by exons 20 and 21, contains a binding site for nuclear mitotic apparatus protein (NuMA), a protein needed for the formation and stabilization of the mitotic spindle. We have previously described a splicing mutation of 4.1R that yields 2 isoforms: One, CO.1, lacks most of exon 20-encoded peptide and carries a missense C-terminal sequence. The other, CO.2, lacks exon 20-encoded C-terminal sequence, but retains the normal exon 21-encoded C-terminal sequence. Knowing that both shortened proteins are expressed in red cells and assemble to the membrane skeleton, we asked whether they would ensure 4.1R mitotic function in dividing cells. We show here that CO.2, but not CO.1, assembles to spindle poles, and colocalizes with NuMA in erythroid and lymphoid mutated cells, but none of these isoforms interact with NuMA in vitro. In microtubule-destabilizing conditions, again only CO.2 localizes to the centrosomes. These data suggest that the stability of 4.1R association with centrosomes requires an intact C-terminal end, either for a proper conformation of the protein, for a direct binding to an unknown centrosome-cytoskeletal network, or for both. We also found that 4.1G, a ubiquitous homolog of 4.1R, is present in mutated as well as control cells and that its C-terminal region binds efficiently to NuMA, suggesting that in fact mitotic spindles host a mixture of the two 4.1 family members. These findings led to the postulate that the coexpression at the spindle poles of 2 related proteins, 4.1R and 4.1G, might reflect a functional redundancy in mitotic cells. PMID:12239178

  9. Automated local bright feature image analysis of nuclear proteindistribution identifies changes in tissue phenotype

    SciTech Connect

    Knowles, David; Sudar, Damir; Bator, Carol; Bissell, Mina

    2006-02-01

    The organization of nuclear proteins is linked to cell and tissue phenotypes. When cells arrest proliferation, undergo apoptosis, or differentiate, the distribution of nuclear proteins changes. Conversely, forced alteration of the distribution of nuclear proteins modifies cell phenotype. Immunostaining and fluorescence microscopy have been critical for such findings. However, there is an increasing need for quantitative analysis of nuclear protein distribution to decipher epigenetic relationships between nuclear structure and cell phenotype, and to unravel the mechanisms linking nuclear structure and function. We have developed imaging methods to quantify the distribution of fluorescently-stained nuclear protein NuMA in different mammary phenotypes obtained using three-dimensional cell culture. Automated image segmentation of DAPI-stained nuclei was generated to isolate thousands of nuclei from three-dimensional confocal images. Prominent features of fluorescently-stained NuMA were detected using a novel local bright feature analysis technique, and their normalized spatial density calculated as a function of the distance from the nuclear perimeter to its center. The results revealed marked changes in the distribution of the density of NuMA bright features as non-neoplastic cells underwent phenotypically normal acinar morphogenesis. In contrast, we did not detect any reorganization of NuMA during the formation of tumor nodules by malignant cells. Importantly, the analysis also discriminated proliferating non-neoplastic cells from proliferating malignant cells, suggesting that these imaging methods are capable of identifying alterations linked not only to the proliferation status but also to the malignant character of cells. We believe that this quantitative analysis will have additional applications for classifying normal and pathological tissues.

  10. The BRCA1-binding protein BRAP2 can act as a cytoplasmic retention factor for nuclear and nuclear envelope-localizing testicular proteins.

    PubMed

    Davies, Rebecca G; Wagstaff, Kylie M; McLaughlin, Eileen A; Loveland, Kate L; Jans, David A

    2013-12-01

    Regulation of nuclear protein import is central to many cellular processes such as development, with a key mechanism being factors that retain cargoes in the cytoplasm that normally localize in the nucleus. The breast cancer antigen BRCA1-binding protein BRAP2 has been reported as a novel negative regulator of nuclear import of various nuclear localization signal (NLS)-containing viral and cellular proteins, but although implicated in differentiation pathways and highly expressed in tissues including testis, the gamut of targets for BRAP2 action in a developmental context is unknown. As a first step towards defining the BRAP2 interactome, we performed a yeast-2-hybrid screen to identify binding partners of BRAP2 in human testis. Here we report characterization for the first time of three of these: the high mobility group (HMG)-box-domain-containing chromatin component HMG20A, nuclear mitotic apparatus protein NuMA1 and synaptic nuclear envelope protein SYNE2. Co-immunoprecipitation experiments indicate association of BRAP2 with HMG20A, NuMA1, and SYNE2 in testis, underlining the physiological relevance of the interactions, with immunohistochemistry showing that where BRAP2 is co-expressed with HMG20A and NuMA1, both are present in the cytoplasm, in contrast to their nuclear localization in other testicular cell types. Importantly, quantitative confocal microscopic analysis of cultured cells indicates that ectopic expression of BRAP2 inhibits nuclear localization of HMG20A and NuMA1, and prevents nuclear envelope accumulation of SYNE2, the first report of BRAP2 altering localization of a non-nuclear protein. These results imply for the first time that BRAP2 may have an important role in modulating subcellular localization during testicular development. PMID:23707952

  11. The early days of caesarian section.

    PubMed

    Ellis, Harold

    2010-05-01

    The story of the early days of caesarian section is shrouded in mystery, myths and old folk tales. The very name itself is the subject of debate. One thing is certain--it is nothing at all to do with Julius Caesar; his mother was still alive when he invaded Britain in 55BC. The most probable explanation of the term is the law promulgated by King Numa Pompillius of Rome in the year 715BC. PMID:20521579

  12. Acceptance test report 2721-Z upgrades

    SciTech Connect

    Keck, R.D.

    1998-02-03

    This test procedure provides instructions for acceptance testing of modifications to the 2721-Z diesel-generator system made by Project C-189. The modifications include (1) replacing the generator NUMA-LOGIC controller with connection to the PFP distributed control system (DCS), (2) replacing ATSI with a breaker switching scheme for 2736-ZB backup power and (3) providing a method for generator load and system testing.

  13. Dictyostelium calcium-binding protein 4a interacts with nucleomorphin, a BRCT-domain protein that regulates nuclear number.

    PubMed

    Myre, Michael A; O'Day, Danton H

    2004-09-17

    Nucleomorphin from Dictyostelium discoideum is a nuclear calmodulin-binding protein that is a member of the BRCT-domain containing cell cycle checkpoint proteins. Two differentially expressed isoforms, NumA and NumB, share an extensive acidic domain (DEED) that when deleted produces highly multinucleated cells. We performed a yeast two-hybrid screen of a Dictyostelium cDNA library using NumA as bait. Here we show that nucleomorphin interacts with calcium-binding protein 4a (CBP4a) in a Ca(2+)-dependent manner. Further deletion analysis suggests this interaction requires residues found within the DEED domain. NumA and CBP4a mRNAs are expressed at the same stages of development. CBP4a belongs to a large family of Dictyostelium CBPs, for which no cellular or developmental functions had previously been determined. Since the interaction of CBP4a with nucleomorphin requires the DEED domain, this suggests that CBP4a may respond to Ca(2+)-signalling through modulating factors that might function in concert to regulate nuclear number. PMID:15325281

  14. NuMA-microtubule interactions are critical for spindle orientation and the morphogenesis of diverse epidermal structures

    PubMed Central

    Seldin, Lindsey; Muroyama, Andrew; Lechler, Terry

    2016-01-01

    Mitotic spindle orientation is used to generate cell fate diversity and drive proper tissue morphogenesis. A complex of NuMA and dynein/dynactin is required for robust spindle orientation in a number of cell types. Previous research proposed that cortical dynein/dynactin was sufficient to generate forces on astral microtubules (MTs) to orient the spindle, with NuMA acting as a passive tether. In this study, we demonstrate that dynein/dynactin is insufficient for spindle orientation establishment in keratinocytes and that NuMA’s MT-binding domain, which targets MT tips, is also required. Loss of NuMA-MT interactions in skin caused defects in spindle orientation and epidermal differentiation, leading to neonatal lethality. In addition, we show that NuMA-MT interactions are also required in adult mice for hair follicle morphogenesis and spindle orientation within the transit-amplifying cells of the matrix. Loss of spindle orientation in matrix cells results in defective differentiation of matrix-derived lineages. Our results reveal an additional and direct function of NuMA during mitotic spindle positioning, as well as a reiterative use of spindle orientation in the skin to build diverse structures. DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.12504.001 PMID:26765568

  15. LDRD final report : managing shared memory data distribution in hybrid HPC applications.

    SciTech Connect

    Merritt, Alexander M.; Pedretti, Kevin Thomas Tauke

    2010-09-01

    MPI is the dominant programming model for distributed memory parallel computers, and is often used as the intra-node programming model on multi-core compute nodes. However, application developers are increasingly turning to hybrid models that use threading within a node and MPI between nodes. In contrast to MPI, most current threaded models do not require application developers to deal explicitly with data locality. With increasing core counts and deeper NUMA hierarchies seen in the upcoming LANL/SNL 'Cielo' capability supercomputer, data distribution poses an upper boundary on intra-node scalability within threaded applications. Data locality therefore has to be identified at runtime using static memory allocation policies such as first-touch or next-touch, or specified by the application user at launch time. We evaluate several existing techniques for managing data distribution using micro-benchmarks on an AMD 'Magny-Cours' system with 24 cores among 4 NUMA domains and argue for the adoption of a dynamic runtime system implemented at the kernel level, employing a novel page table replication scheme to gather per-NUMA domain memory access traces.

  16. Locality-Aware Parallel Process Mapping for Multi-Core HPC Systems

    SciTech Connect

    Hursey, Joshua J; Squyres, Jeffrey M.; Dontje, Terry

    2011-01-01

    High Performance Computing (HPC) systems are composed of servers containing an ever-increasing number of cores. With such high processor core counts, non-uniform memory access (NUMA) architectures are almost universally used to reduce inter-processor and memory communication bottlenecks by distributing processors and memory throughout a server-internal networking topology. Application studies have shown that the tuning of processes placement in a server s NUMA networking topology to the application can have a dramatic impact on performance. The performance implications are magnified when running a parallel job across multiple server nodes, especially with large scale HPC applications. This paper presents the Locality-Aware Mapping Algorithm (LAMA) for distributing the individual processes of a parallel application across processing resources in an HPC system, paying particular attention to the internal server NUMA topologies. The algorithm is able to support both homogeneous and heterogeneous hardware systems, and dynamically adapts to the available hardware and user-specified process layout at run-time. As implemented in Open MPI, the LAMA provides 362,880 mapping permutations and is able to naturally scale out to additional hardware resources as they become available in future architectures.

  17. The novel tankyrase inhibitor (AZ1366) enhances irinotecan activity in tumors that exhibit elevated tankyrase and irinotecan resistance

    PubMed Central

    Quackenbush, Kevin S.; Bagby, Stacey; Tai, Wai Meng; Messersmith, Wells A.; Schreiber, Anna; Greene, Justin; Kim, Jihye; Wang, Guoliang; Purkey, Alicia; Pitts, Todd M.; Nguyen, Anna; Gao, Dexiang; Blatchford, Patrick; Capasso, Anna; Schuller, Alwin G.; Eckhardt, S. Gail; Arcaroli, John J.

    2016-01-01

    Background Dysregulation of the canonical Wnt signaling pathway has been implicated in colorectal cancer (CRC) development as well as incipient stages of malignant transformation. In this study, we investigated the antitumor effects of AZ1366 (a novel tankyrase inhibitor) as a single agent and in combination with irinotecan in our patient derived CRC explant xenograft models. Results Six out of 18 CRC explants displayed a significant growth reduction to AZ1366. There was one CRC explant (CRC040) that reached the threshold of sensitivity (TGII ≤ 20%) in this study. In addition, the combination of AZ1366 + irinotecan demonstrated efficacy in 4 out of 18 CRC explants. Treatment effects on the WNT pathway revealed that tankyrase inhibition was ineffective at reducing WNT dependent signaling. However, the anti-tumor effects observed in this study were likely a result of alternative tankyrase effects whereby tankyrase inhibition reduced NuMA levels. Materials and Methods Eighteen CRC explants were treated with AZ1366 single agent or in combination for 28 days and treatment responses were assessed. Pharmacokinetic (AZ1366 drug concentrations) and pharmacodynamic effects (Axin2 levels) were investigated over 48 hours. Immunohistochemistry of nuclear β-catenin levels as well as western blot was employed to examine the treatment effects on the WNT pathway as well as NuMA. Conclusions Combination AZ1366 and irinotecan achieved greater anti-tumor effects compared to monotherapy. Activity was limited to CRC explants that displayed irinotecan resistance and increased protein levels of tankyrase and NuMA. PMID:27070088

  18. Two protein 4.1 domains essential for mitotic spindle and aster microtubule dynamics and organization in vitro.

    PubMed

    Krauss, Sharon Wald; Lee, Gloria; Chasis, Joel Anne; Mohandas, Narla; Heald, Rebecca

    2004-06-25

    Multifunctional structural proteins belonging to the 4.1 family are components of nuclei, spindles, and centrosomes in vertebrate cells. Here we report that 4.1 is critical for spindle assembly and the formation of centrosome-nucleated and motor-dependent self-organized microtubule asters in metaphase-arrested Xenopus egg extracts. Immunodepletion of 4.1 disrupted microtubule arrays and mislocalized the spindle pole protein NuMA. Remarkably, assembly was completely rescued by supplementation with a recombinant 4.1R isoform. We identified two 4.1 domains critical for its function in microtubule polymerization and organization utilizing dominant negative peptides. The 4.1 spectrin-actin binding domain or NuMA binding C-terminal domain peptides caused morphologically disorganized structures. Control peptides with low homology or variant spectrin-actin binding domain peptides that were incapable of binding actin had no deleterious effects. Unexpectedly, the addition of C-terminal domain peptides with reduced NuMA binding caused severe microtubule destabilization in extracts, dramatically inhibiting aster and spindle assembly and also depolymerizing preformed structures. However, the mutant C-terminal peptides did not directly inhibit or destabilize microtubule polymerization from pure tubulin in a microtubule pelleting assay. Our data showing that 4.1 is a crucial factor for assembly and maintenance of mitotic spindles and self-organized and centrosome-nucleated microtubule asters indicates that 4.1 is involved in regulating both microtubule dynamics and organization. These investigations underscore an important functional context for protein 4.1 in microtubule morphogenesis and highlight a previously unappreciated role for 4.1 in cell division.

  19. The OpenMP Implementation of NAS Parallel Benchmarks and its Performance

    NASA Technical Reports Server (NTRS)

    Jin, Hao-Qiang; Frumkin, Michael; Yan, Jerry

    1999-01-01

    As the new ccNUMA architecture became popular in recent years, parallel programming with compiler directives on these machines has evolved to accommodate new needs. In this study, we examine the effectiveness of OpenMP directives for parallelizing the NAS Parallel Benchmarks. Implementation details will be discussed and performance will be compared with the MPI implementation. We have demonstrated that OpenMP can achieve very good results for parallelization on a shared memory system, but effective use of memory and cache is very important.

  20. [The use of water as indication of the presence of life: technical ways of employment in the archaelogical documentation].

    PubMed

    Cancellieri, M

    1995-01-01

    Ancient urbanization often is strictly connected with rivers and sources. In the ancient world, the usage of water is also linked with the idea of sacrum and with specific religious cults (i.e. the King's Numa mith or the legend of the nymph Egeria). A complex technique of rain water preservation has been elaborated in Rome by building structures of water supplying: the exemples of Segni's colony and Ventotene's imperial island are here examined. Due to the general absence of water supply directly in the houses, public fountains were largely present in the public ways. PMID:11623481

  1. Dictyostelium nucleomorphin is a member of the BRCT-domain family of cell cycle checkpoint proteins.

    PubMed

    Myre, Michael A; O'Day, Danton H

    2004-11-18

    A search of the Dictyostelium genome project database (http://dictybase.org/db/cgi-bin/blast.pl) with nucleomorphin, a protein that regulates the nuclear number, predicted it to be encoded by a larger gene containing a putative breast cancer carboxy-terminus domain (BRCT). Using RT-PCR, Northern and Western blotting we have identified a differentially expressed, 2318 bp cDNA encoding a protein isoform of Dictyostelium NumA with an apparent molecular weight of 70 kDa that we have called NumB. It contains a single amino-terminal BRCT-domain spanning residues 125-201. Starvation of shaking cultures reduces NumA expression by approximately 88+/-5.6%, whereas NumB expression increases approximately 35+/-3.5% from vegetative levels. NumC, a third isoform that is also expressed during development but not growth, remains to be characterized. These findings suggest NumB may be a member of the BRCT-domain containing cell cycle checkpoint proteins. PMID:15535983

  2. The Fz-Dsh planar cell polarity pathway induces oriented cell division via Mud/NuMA in Drosophila and zebrafish

    PubMed Central

    Ségalen, Marion; Johnston, Christopher A.; Martin, Charlotte A.; Dumortier, Julien G.; Prehoda, Kenneth E.; David, Nicolas B.; Doe, Chris Q.; Bellaïche, Yohanns

    2010-01-01

    SUMMARY The Frizzled receptor and Dishevelled effector regulate mitotic spindle orientation in both vertebrates and invertebrates, but how Dishevelled orients the mitotic spindle is unknown. Using the Drosophila S2 cell "induced polarity" system, we find that Dishevelled cortical polarity is sufficient to orient the spindle, and that Dishevelled's DEP domain mediates this function. This domain binds a C-terminal domain of Mud (the Drosophila NuMA ortholog), and Mud is required for Dishevelled-mediated spindle orientation. In Drosophila, Frizzled-Dishevelled planar cell polarity (PCP) orients the sensory organ precursor (pI) spindle along the anterior-posterior axis. We show that Dishevelled and Mud colocalize at the posterior cortex of pI, Mud localization at the posterior cortex requires Dsh, and Mud loss-of-function randomizes spindle orientation. During zebrafish gastrulation, the Wnt11-Frizzled-Dishevelled PCP pathway orients spindles along the animal-vegetal axis, and reducing NuMA levels disrupts spindle orientation. Overall, we describe a Frizzled-Dishevelled-NuMA pathway that orients division from Drosophila to vertebrates. PMID:21074723

  3. Polyglutamylated Tubulin Binding Protein C1orf96/CSAP Is Involved in Microtubule Stabilization in Mitotic Spindles

    PubMed Central

    Ohta, Shinya; Hamada, Mayako; Sato, Nobuko; Toramoto, Iyo

    2015-01-01

    The centrosome-associated C1orf96/Centriole, Cilia and Spindle-Associated Protein (CSAP) targets polyglutamylated tubulin in mitotic microtubules (MTs). Loss of CSAP causes critical defects in brain development; however, it is unclear how CSAP association with MTs affects mitosis progression. In this study, we explored the molecular mechanisms of the interaction of CSAP with mitotic spindles. Loss of CSAP caused MT instability in mitotic spindles and resulted in mislocalization of Nuclear protein that associates with the Mitotic Apparatus (NuMA), with defective MT dynamics. Thus, CSAP overload in the spindles caused extensive MT stabilization and recruitment of NuMA. Moreover, MT stabilization by CSAP led to high levels of polyglutamylation on MTs. MT depolymerization by cold or nocodazole treatment was inhibited by CSAP binding. Live-cell imaging analysis suggested that CSAP-dependent MT-stabilization led to centrosome-free MT aster formation immediately upon nuclear envelope breakdown without γ-tubulin. We therefore propose that CSAP associates with MTs around centrosomes to stabilize MTs during mitosis, ensuring proper bipolar spindle formation and maintenance. PMID:26562023

  4. Self-organization of stabilized microtubules by both spindle and midzone mechanisms in Xenopus egg cytosol

    PubMed Central

    Mitchison, Timothy J.; Nguyen, Phuong; Coughlin, Margaret; Groen, Aaron C.

    2013-01-01

    Previous study of self-organization of Taxol-stabilized microtubules into asters in Xenopus meiotic extracts revealed motor-dependent organizational mechanisms in the spindle. We revisit this approach using clarified cytosol with glycogen added back to supply energy and reducing equivalents. We added probes for NUMA and Aurora B to reveal microtubule polarity. Taxol and dimethyl sulfoxide promote rapid polymerization of microtubules that slowly self-organize into assemblies with a characteristic morphology consisting of paired lines or open circles of parallel bundles. Minus ends align in NUMA-containing foci on the outside, and plus ends in Aurora B–containing foci on the inside. Assemblies have a well-defined width that depends on initial assembly conditions, but microtubules within them have a broad length distribution. Electron microscopy shows that plus-end foci are coated with electron-dense material and resemble similar foci in monopolar midzones in cells. Functional tests show that two key spindle assembly factors, dynein and kinesin-5, act during assembly as they do in spindles, whereas two key midzone assembly factors, Aurora B and Kif4, act as they do in midzones. These data reveal the richness of self-organizing mechanisms that operate on microtubules after they polymerize in meiotic cytoplasm and provide a biochemically tractable system for investigating plus-end organization in midzones. PMID:23515222

  5. The deubiquitinating enzyme complex BRISC is required for proper mitotic spindle assembly in mammalian cells

    PubMed Central

    Yan, Kaowen; Li, Li; Wang, Xiaojian; Hong, Ruisha; Zhang, Ying; Yang, Hua; Lin, Ming; Zhang, Sha; He, Qihua; Zheng, Duo; Tang, Jun; Yin, Yuxin

    2015-01-01

    Deubiquitinating enzymes (DUBs) negatively regulate protein ubiquitination and play an important role in diverse physiological processes, including mitotic division. The BRCC36 isopeptidase complex (BRISC) is a DUB that is specific for lysine 63–linked ubiquitin hydrolysis; however, its biological function remains largely undefined. Here, we identify a critical role for BRISC in the control of mitotic spindle assembly in cultured mammalian cells. BRISC is a microtubule (MT)-associated protein complex that predominantly localizes to the minus ends of K-fibers and spindle poles and directly binds to MTs; importantly, BRISC promotes the assembly of functional bipolar spindle by deubiquitinating the essential spindle assembly factor nuclear mitotic apparatus (NuMA). The deubiquitination of NuMA regulates its interaction with dynein and importin-β, which are required for its function in spindle assembly. Collectively, these results uncover BRISC as an important regulator of the mitotic spindle assembly and cell division, and have important implications for the development of anticancer drugs targeting BRISC. PMID:26195665

  6. The Mother Centriole Appendage Protein Cenexin Modulates Lumen Formation through Spindle Orientation.

    PubMed

    Hung, Hui-Fang; Hehnly, Heidi; Doxsey, Stephen

    2016-03-21

    Establishing apical-basal polarity is instrumental in the functional shaping of a solitary lumen within an acinus. By exploiting micropatterned slides, wound healing assays, and three-dimensional culture systems, we identified a mother centriole subdistal appendage protein, cenexin, as a critical player in symmetric lumen expansion through the control of microtubule organization. In this regard, cenexin was required for both centrosome positioning in interphase cells and proper spindle orientation during mitosis. In contrast, the essential mother centriole distal appendage protein CEP164 did not play a role in either process, demonstrating the specificity of subdistal appendages for these events. Importantly, upon closer examination we found that cenexin depletion decreased astral microtubule length, disrupted astral microtubule minus-end organization, and increased levels of the polarity protein NuMA at the cell cortex. Interestingly, spindle misorientation and NuMA mislocalization were reversed by treatment with a low dose of the microtubule-stabilizing agent paclitaxel. Taken together, these results suggest that cenexin modulates microtubule organization and stability to mediate spindle orientation. PMID:26948879

  7. Concomitant binding of Afadin to LGN and F-actin directs planar spindle orientation.

    PubMed

    Carminati, Manuel; Gallini, Sara; Pirovano, Laura; Alfieri, Andrea; Bisi, Sara; Mapelli, Marina

    2016-02-01

    Polarized epithelia form by oriented cell divisions in which the mitotic spindle aligns parallel to the epithelial plane. To orient the mitotic spindle, cortical cues trigger the recruitment of NuMA-dynein-based motors, which pull on astral microtubules via the protein LGN. We demonstrate that the junctional protein Afadin is required for spindle orientation and correct epithelial morphogenesis of Caco-2 cysts. Molecularly, Afadin binds directly and concomitantly to F-actin and to LGN. We determined the crystallographic structure of human Afadin in complex with LGN and show that it resembles the LGN-NuMA complex. In mitosis, Afadin is necessary for cortical accumulation of LGN and NuMA above the spindle poles, in an F-actin-dependent manner. Collectively, our results depict Afadin as a molecular hub governing the enrichment of LGN and NuMA at the cortex. To our knowledge, Afadin is the first-described mechanical anchor between dynein and cortical F-actin. PMID:26751642

  8. The Fz-Dsh planar cell polarity pathway induces oriented cell division via Mud/NuMA in Drosophila and zebrafish.

    PubMed

    Ségalen, Marion; Johnston, Christopher A; Martin, Charlotte A; Dumortier, Julien G; Prehoda, Kenneth E; David, Nicolas B; Doe, Chris Q; Bellaïche, Yohanns

    2010-11-16

    The Frizzled receptor and Dishevelled effector regulate mitotic spindle orientation in both vertebrates and invertebrates, but how Dishevelled orients the mitotic spindle is unknown. Using the Drosophila S2 cell "induced polarity" system, we find that Dishevelled cortical polarity is sufficient to orient the spindle and that Dishevelled's DEP domain mediates this function. This domain binds a C-terminal domain of Mud (the Drosophila NuMA ortholog), and Mud is required for Dishevelled-mediated spindle orientation. In Drosophila, Frizzled-Dishevelled planar cell polarity (PCP) orients the sensory organ precursor (pI) spindle along the anterior-posterior axis. We show that Dishevelled and Mud colocalize at the posterior cortex of pI, Mud localization at the posterior cortex requires Dsh, and Mud loss-of-function randomizes spindle orientation. During zebrafish gastrulation, the Wnt11-Frizzled-Dishevelled PCP pathway orients spindles along the animal-vegetal axis, and reducing NuMA levels disrupts spindle orientation. Overall, we describe a Frizzled-Dishevelled-NuMA pathway that orients division from Drosophila to vertebrates.

  9. Education for Disaster Prevention in Elementary School in Japan

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Shida, Masakuni

    2013-04-01

    Education for disaster prevention has become more and more important since the Great East Japan Earthquake and tsunami in 2011. More than 18 thousand people were killed or have not been found yet in the tragedy, however, in Kesn'numa, which is a city located in the seriously damaged area, there were few student victims of tsunami. This is because every school in Kesen'numa has excellent education systems for disaster prevention. They have several safety exercises and conducts emergency drills each year in unique ways which have been developed upon the tragic experiences of serious earthquakes and tsunami in the past. For disaster prevention education, we should learn two important points from the case in Kesen'numa; to learn from the ancient wisdom, and to ensure for students to have enough opportunities of safety exercises and emergency drills at school. In addition to these two points, another issue from the viewpoint of science education can be added, which is to learn about the mechanisms of earthquake. We have developed disaster prevention and reduction programs in educational context, taking these three points into consideration. First part of the program is to study local history, focusing on ancient wisdom. In Kesen'numa City, there were thirty-three monumental stones with cautionary lessons of the possible danger of tsunami before the great earthquake. The lessons were based on the disasters actually happened in the past and brought down to the current generation. Kesen'numa-Otani elementary school has conducted education for disaster prevention referring to this information with full of ancient wisdom. Second part of the program is to make sure that every student has enough and rich opportunities to simulate the worst situation of any disasters. For example, in the case of earthquake and tsunami, teachers take students to the safest place through the designated evacuation rout according to each school's original manual. Students can experience this

  10. Exploring Shared Memory Protocols in FLASH

    SciTech Connect

    Horowitz, Mark; Kunz, Robert; Hall, Mary; Lucas, Robert; Chame, Jacqueline

    2007-04-01

    ABSTRACT The goal of this project was to improve the performance of large scientific and engineering applications through collaborative hardware and software mechanisms to manage the memory hierarchy of non-uniform memory access time (NUMA) shared-memory machines, as well as their component individual processors. In spite of the programming advantages of shared-memory platforms, obtaining good performance for large scientific and engineering applications on such machines can be challenging. Because communication between processors is managed implicitly by the hardware, rather than expressed by the programmer, application performance may suffer from unintended communication – communication that the programmer did not consider when developing his/her application. In this project, we developed and evaluated a collection of hardware, compiler, languages and performance monitoring tools to obtain high performance on scientific and engineering applications on NUMA platforms by managing communication through alternative coherence mechanisms. Alternative coherence mechanisms have often been discussed as a means for reducing unintended communication, although architecture implementations of such mechanisms are quite rare. This report describes an actual implementation of a set of coherence protocols that support coherent, non-coherent and write-update accesses for a CC-NUMA shared-memory architecture, the Stanford FLASH machine. Such an approach has the advantages of using alternative coherence only where it is beneficial, and also provides an evolutionary migration path for improving application performance. We present data on two computations, RandomAccess from the HPC Challenge benchmarks and a forward solver derived from LS-DYNA, showing the performance advantages of the alternative coherence mechanisms. For RandomAccess, the non-coherent and write-update versions can outperform the coherent version by factors of 5 and 2.5, respectively. In LS-DYNA, we obtain

  11. Energy-aware Thread and Data Management in Heterogeneous Multi-core, Multi-memory Systems

    SciTech Connect

    Su, Chun-Yi

    2014-12-16

    (NUMA) systems. I use critical path analysis to quantify memory contention in the NUMA memory system and determine thread mappings. In addition, I implement a runtime system that combines concurrent throttling and a novel thread mapping algorithm to manage thread resources and improve energy efficient execution in multi-core, NUMA systems.

  12. IMPACC: A Tightly Integrated MPI+OpenACC Framework Exploiting Shared Memory Parallelism

    SciTech Connect

    Lee, Seyong; Vetter, Jeffrey S

    2016-01-01

    We propose IMPACC, an MPI+OpenACC framework for heterogeneous accelerator clusters. IMPACC tightly integrates MPI and OpenACC, while exploiting the shared memory parallelism in the target system. IMPACC dynamically adapts the input MPI+OpenACC applications on the target heterogeneous accelerator clusters to fully exploit target system-specific features. IMPACC provides the programmers with the unified virtual address space, automatic NUMA-friendly task-device mapping, efficient integrated communication routines, seamless streamlining of asynchronous executions, and transparent memory sharing. We have implemented IMPACC and evaluated its performance using three heterogeneous accelerator systems, including Titan supercomputer. Results show that IMPACC can achieve easier programming, higher performance, and better scalability than the current MPI+OpenACC model.

  13. Healthcare IT system in the midst of and after Great East Japan Earthquake Disaster : Grand design for reconstruction of Tohoku-region healthcare IT system

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Tanaka, Hiroshi

    In this article, we described what was really going in the disaster medical care at the Great East Japan Earthquake, mainly in Ishinomaki and Kesen-numa areas. As for exchange tools of the disaster information, in contrast to the breakdown of fixed-line and mobile phone, MCA radio system, satellite mobiles and internet, especially SNS, were greatly helpful. Learned from the disaster experiences, we are making the grand design for “disaster-robust” regional healthcare IT systems, which are composed of (1) cloud center storing whole-prefecture medical records, (2) SS-MIX based regional healthcare information systems of “the second medical care zones”, (3) ASP/SaaS typed electronic medical record system for all clinics located at Pacific coastal areas, and (4) wireless communication environment supporting comprehensive care of elderly for daily living activities.

  14. Performance of the Cray T3D and Emerging Architectures on Canopy QCD Applications

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Fischler, Mark; Uchima, Mike

    1996-03-01

    The Cray T3D, an MIMD system with NUMA shared memory capabilities and in principle very low communications latency, can support the Canopy framework for grid-oriented applications. CANOPY has been ported to the T3D, with the intent of making it available to a spectrum of users. The performance of the T3D running Canopy has been benchmarked on five QCD applications extensively run on ACPMAPS at Fermilab, requiring a variety of data access patterns. The net performance and scaling behavior reveals an efficiency relative to peak Gflops almost identical to that achieved on ACPMAPS. Detailed studies of the major factors impacting performance are presented. Generalizations applying this analysis to the newly emerging crop of commercial systems reveal where their limitations will lie. On these applications, efficiencies of above 25% are not to be expected; eliminating overheads due to Canopy will improve matters, but by less than a factor of two.

  15. Clomp

    2007-05-25

    CLOMP is the C version of the Livermore OpenMP benchmark deeloped to measure OpenMP overheads and other performance impacts due to threading (like NUMA memory layouts, memory contention, cache effects, etc.) in order to influence future system design. Current best-in-class implementations of OpenMP have overheads at least ten times larger than is required by many of our applications for effective use of OpenMP. This benchmark shows the significant negative performance impact of these relatively largemore » overheads and of other thread effects. The CLOMP benchmark highly configurable to allow a variety of problem sizes and threading effects to be studied and it carefully checks its results to catch many common threading errors. This benchmark is expected to be included as part of the Sequoia Benchmark suite for the Sequoia procurement.« less

  16. CLOMP: Accurately Characterizing OpenMP Application Overheads

    SciTech Connect

    Bronevetsky, G; Gyllenhaal, J; de Supinski, B

    2008-02-11

    Despite its ease of use, OpenMP has failed to gain widespread use on large scale systems, largely due to its failure to deliver sufficient performance. Our experience indicates that the cost of initiating OpenMP regions is simply too high for the desired OpenMP usage scenario of many applications. In this paper, we introduce CLOMP, a new benchmark to characterize this aspect of OpenMP implementations accurately. CLOMP complements the existing EPCC benchmark suite to provide simple, easy to understand measurements of OpenMP overheads in the context of application usage scenarios. Our results for several OpenMP implementations demonstrate that CLOMP identifies the amount of work required to compensate for the overheads observed with EPCC. Further, we show that CLOMP also captures limitations for OpenMP parallelization on NUMA systems.

  17. Performance of the Cray T3D and emerging architectures on canopy QCD applications

    SciTech Connect

    Fischler, M.; Uchima, M.

    1995-11-01

    The Cray T3D, an MIMD system with NUMA shared memory capabilities and in principle very low communications latency, can support the Canopy framework for grid-oriented applications. CANOPY has been ported to the T3D, with the intent of making it available to a spectrum of users. The performance of the T3D running Canopy has been benchmarked on five QCD applications extensively run on ACPMAPS at Fermilab, requiring a variety of data access patterns. The net performance and scaling behavior reveals an efficiency relative to peak Gflops almost identical to that achieved on ACPMAPS. Detailed studies of the major factors impacting performance are presented. Generalizations applying this analysis to the newly emerging crop of commercial systems reveal where their limitations will lie. On these applications, efficiencies of above 25% are not to be expected; eliminating overheads due to Canopy will improve matters, but by less than a factor of two.

  18. Human papillomavirus type 16 E7 oncoprotein engages but does not abrogate the mitotic spindle assembly checkpoint

    SciTech Connect

    Yu, Yueyang; Munger, Karl

    2012-10-10

    The mitotic spindle assembly checkpoint (SAC) ensures faithful chromosome segregation during mitosis by censoring kinetochore-microtubule interactions. It is frequently rendered dysfunctional during carcinogenesis causing chromosome missegregation and genomic instability. There are conflicting reports whether the HPV16 E7 oncoprotein drives chromosomal instability by abolishing the SAC. Here we report that degradation of mitotic cyclins is impaired in cells with HPV16 E7 expression. RNAi-mediated depletion of Mad2 or BubR1 indicated the involvement of the SAC, suggesting that HPV16 E7 expression causes sustained SAC engagement. Mutational analyses revealed that HPV16 E7 sequences that are necessary for retinoblastoma tumor suppressor protein binding as well as sequences previously implicated in binding the nuclear and mitotic apparatus (NuMA) protein and in delocalizing dynein from the mitotic spindle contribute to SAC engagement. Importantly, however, HPV16 E7 does not markedly compromise the SAC response to microtubule poisons.

  19. Parathyroid hormone regulates the expression of rat osteoblast and osteosarcoma nuclear matrix proteins.

    PubMed

    Bidwell, J; Feister, H; Swartz, D; Onyia, J; Holden, J; Hock, J

    1996-12-01

    Parathyroid hormone (PTH) alters osteoblast morphology. How these changes in cell shape modify nuclear structure and ultimately gene expression is not known. Chronic exposure to rat PTH (1-34) [10 nM] attenuated the expression of 200, 190, and 160 kD proteins in the nuclear matrix-intermediate filament subfraction of the rat osteosarcoma cells, ROS 17/2.8 [Bidwell et al. (1994b): Endocrinology 134:1738-1744]. Here, we determined that these same PTH-responsive proteins were expressed in rat metaphyseal osteoblasts. We identified the 200 kD protein as a non-muscle myosin. Although the molecular weights, subcellular distribution, and half-lives of the 190 and 160 kD proteins were similar to topoisomerase II-alpha and -beta, nuclear matrix enzymes that mediate DNA topology, the 190 and 160 kD proteins did not interact with topoisomerase antibodies. Nevertheless, the expression of topoisomerase II-alpha, and NuMA, a component of the nuclear core filaments, was also regulated by PTH in the osteosarcoma cells. The 190 kD protein was selectively expressed in bone cells as it was not observed in OK opossum kidney cells, H4 hepatoma cells, or NIH3T3 cells. PTH attenuated mRNA expression of the PTH receptor in our cell preparations. These results demonstrate that PTH selectively alters the expression of osteoblast membrane, cytoskeletal, and nucleoskeletal proteins. Topoisomerase II-alpha, NuMA, and the 190 and 160 kD proteins may direct the nuclear PTH signalling pathways to the target genes and play a structural role in osteoblast gene expression. PMID:8913889

  20. Dominant-Negative Effects of Adult-Onset Huntingtin Mutations Alter the Division of Human Embryonic Stem Cells-Derived Neural Cells

    PubMed Central

    Lopes, Carla; Aubert, Sophie; Bourgois-Rocha, Fany; Barnat, Monia; Rego, Ana Cristina; Déglon, Nicole

    2016-01-01

    Mutations of the huntingtin protein (HTT) gene underlie both adult-onset and juvenile forms of Huntington’s disease (HD). HTT modulates mitotic spindle orientation and cell fate in mouse cortical progenitors from the ventricular zone. Using human embryonic stem cells (hESC) characterized as carrying mutations associated with adult-onset disease during pre-implantation genetic diagnosis, we investigated the influence of human HTT and of an adult-onset HD mutation on mitotic spindle orientation in human neural stem cells (NSCs) derived from hESCs. The RNAi-mediated silencing of both HTT alleles in neural stem cells derived from hESCs disrupted spindle orientation and led to the mislocalization of dynein, the p150Glued subunit of dynactin and the large nuclear mitotic apparatus (NuMA) protein. We also investigated the effect of the adult-onset HD mutation on the role of HTT during spindle orientation in NSCs derived from HD-hESCs. By combining SNP-targeting allele-specific silencing and gain-of-function approaches, we showed that a 46-glutamine expansion in human HTT was sufficient for a dominant-negative effect on spindle orientation and changes in the distribution within the spindle pole and the cell cortex of dynein, p150Glued and NuMA in neural cells. Thus, neural derivatives of disease-specific human pluripotent stem cells constitute a relevant biological resource for exploring the impact of adult-onset HD mutations of the HTT gene on the division of neural progenitors, with potential applications in HD drug discovery targeting HTT-dynein-p150Glued complex interactions. PMID:26863614

  1. Dominant-Negative Effects of Adult-Onset Huntingtin Mutations Alter the Division of Human Embryonic Stem Cells-Derived Neural Cells.

    PubMed

    Lopes, Carla; Aubert, Sophie; Bourgois-Rocha, Fany; Barnat, Monia; Rego, Ana Cristina; Déglon, Nicole; Perrier, Anselme L; Humbert, Sandrine

    2016-01-01

    Mutations of the huntingtin protein (HTT) gene underlie both adult-onset and juvenile forms of Huntington's disease (HD). HTT modulates mitotic spindle orientation and cell fate in mouse cortical progenitors from the ventricular zone. Using human embryonic stem cells (hESC) characterized as carrying mutations associated with adult-onset disease during pre-implantation genetic diagnosis, we investigated the influence of human HTT and of an adult-onset HD mutation on mitotic spindle orientation in human neural stem cells (NSCs) derived from hESCs. The RNAi-mediated silencing of both HTT alleles in neural stem cells derived from hESCs disrupted spindle orientation and led to the mislocalization of dynein, the p150Glued subunit of dynactin and the large nuclear mitotic apparatus (NuMA) protein. We also investigated the effect of the adult-onset HD mutation on the role of HTT during spindle orientation in NSCs derived from HD-hESCs. By combining SNP-targeting allele-specific silencing and gain-of-function approaches, we showed that a 46-glutamine expansion in human HTT was sufficient for a dominant-negative effect on spindle orientation and changes in the distribution within the spindle pole and the cell cortex of dynein, p150Glued and NuMA in neural cells. Thus, neural derivatives of disease-specific human pluripotent stem cells constitute a relevant biological resource for exploring the impact of adult-onset HD mutations of the HTT gene on the division of neural progenitors, with potential applications in HD drug discovery targeting HTT-dynein-p150Glued complex interactions.

  2. Translation, Cultural Adaptation and Validation of the Power of Food Scale for Use by Adult Populations in Portugal.

    PubMed

    Ribeiro, Gabriela; Santos, Osvaldo; Camacho, Marta; Torres, Sandra; Mucha-Vieira, Filipa; Sampaio, Daniel; Oliveira-Maia, Albino J

    2015-01-01

    Introdução: A Power of Food Scale é uma escala que avalia um constructo designado por fome hedónica, frequentemente definido como o apetite por alimentos de elevada palatibilidade, mais do que a sua ingestão propriamente dita. Este estudo teve como objetivo a caracterização das propriedades psicométricas de uma versão portuguesa da Power of Food Scale, nomeadamente da sua fiabilidade e validade de constructo. Material e Métodos: Os dados foram obtidos de 1266 participantes adultos, provenientes de três amostras distintas: duas amostras não clínicas e uma amostra clínica de indivíduos com obesidade severa, candidatos a cirurgia da obesidade. Resultados: Verificamos que a estrutura factorial da versão portuguesa da Power of Food Scale é semelhante à do questionário original e que apresenta fiabilidade teste-reteste e validade de constructo adequadas. Adicionalmente, apresentamos neste estudo o primeiro contributo para a definição de normas populacionais para os scores da Power of Food Scale. Discussão: A versão portuguesa da Power of Food Scale apresentou boas propriedades psicométricas: é um instrumento válido e fiável para a avaliação do constructo fome hedónica, suportando a sua utilização tanto em amostras clínicas como não clínicas, bem como em estudos longitudinais. Conclusão: Estes resultados demostram que a versão portuguesa da Power of Food Scale é um instrumento útil, tanto em contexto clínico, como de investigação, nomeadamente para o estudo do constructo fome hedónica em populações de língua portuguesa, incluindo populações clínicas de indivíduos com obesidade.

  3. [The Sao Paulo labor force: a critical analysis of data sources].

    PubMed

    Costa, L B

    1990-01-01

    The author traces the recent evolution of the labor force in the state of Sao Paulo, Brazil. After a comparison of the two main sources of labor statistics, the decennial census and the annual survey entitled Pesquisa Nacional por Amostra de Domicilios, her findings are presented separately by sex for the period 1971-1988. An increase in the number of women who are heads of households is shown across most age groups and all types of union. Data are also included by sex on educational status, unemployment, residence characteristics, and hours of work.

  4. Optimal cut-off value for homeostasis model assessment (HOMA) index of insulin-resistance in a population of patients admitted electively in a Portuguese cardiology ward.

    PubMed

    Timóteo, Ana Teresa; Miranda, Fernando; Carmo, Miguel Mota; Ferreira, Rui Cruz

    2014-01-01

    Introdução: A resistência à insulina é a chave fisiopatológica de explicação da Síndrome Metabólica. Apesar de claramente útil, o índice Homeostasis Model Assessment (uma medição da resistência à insulina) não tem sido aplicado sistematicamente na prática clínica. Uma das principais razões relaciona-se com a discrepância de valores limiares reportados em diferentes populações. Procurámos avaliar uma população portuguesa o valor limiar ideal e avaliar a sua relação com a Síndrome Metabólica. Material e Métodos: Selecionámos uma coorte de indivíduos admitidos eletivamente numa enfermaria de cardiologia com um IMC < 25 Kg/m2 e sem anomalias do metabolismo da glicose (glicémia em jejum < 100 mg/dL e sem diabetes). Utilizámos o percentil 90 da distribuição do índice Homeostasis Model Assessment para seleção do limiar adequado para resistência à insulina. Selecionouse também uma coorte de validação composta por 300 indivíduos, sem aplicação dos critérios de exclusão referidos anteriormente. Resultados: De uma população de 7 000 indivíduos e após aplicação dos critérios de exclusão, ficámos com 1 784 indivíduos para análise. O percentil 90 do índice foi 2,33. Na coorte de validação, aplicando esse limiar, 49,3% dos indivíduos apresentam resistência à insulina. Contudo, apenas 69,9% dos doentes com síndrome metabólica apresentam resistência à insulina com esse limiar. Por análise das curvas ROC, o limiar ideal para síndrome metabólica é 2,41. O índice Homeostasis Model Assessment correlacionou-se com o IMC (r = 0,371, p < 0,001) e é um preditor independente de presença de síndrome metabólica (OR 19,4, IC 95% 6,6 – 57,2, p < 0,001). Discussão: O nosso estudo mostrou que numa população portuguesa de doentes admitidos eletivamente numa enfermaria de cardiologia, o limiar pelo índice Homeostasis Model Assessment para resistência à insulina é 2,33 e para síndrome metabólica é 2

  5. Rad53 homologue forkhead-associated kinase A (FhkA) and Ca2+-binding protein 4a (CBP4a) are nucleolar proteins that differentially redistribute during mitosis in Dictyostelium

    PubMed Central

    2013-01-01

    Background During mitosis most nucleolar proteins redistribute to other locales providing an opportunity to study the relationship between nucleolar protein localization and function. Dictyostelium is a model organism for the study of several fundamental biological processes and human diseases but only two nucleolar proteins have been studied during mitosis: NumA1 and Snf12. Both of them are linked to the cell cycle. To acquire a better understanding of nucleolar protein localization and dynamics in Dictyostelium we studied the nucleolar localization of two additional proteins during mitosis: Snf12-linked forkhead-associated kinase A (FhkA), which is involved in the cell cycle, and Ca2+-binding protein 4a (CBP4a), which is a binding partner of NumA1. Methods Polyclonal antibodies were produced in-house. Cells were fixed and probed with either anti-FhkA or anti-CBP4a in order to determine cellular localization during interphase and throughout the stages of mitosis. Colocalization with DAPI nuclear stain allowed us to determine the location of the nucleus and nucleolus while colocalization with anti-α-tubulin allowed us to determine the cell cycle stage. Results Here we verify two novel nucleolar proteins, Rad53 homologue FhkA which localized around the edge of the nucleolus and CBP4a which was detected throughout the entire nucleolus. Treatment with the Ca2+ chelator BAPTA (5 mM) showed that the nucleolar localization of CBP4a is Ca2+-dependent. In response to actinomycin D (0.05 mg/mL) CBP4a disappeared from the nucleolus while FhkA protruded from the nucleus, eventually pinching off as cytoplasmic circles. FhkA and CBP4a redistributed differently during mitosis. FhkA redistributed throughout the entire cell and at the nuclear envelope region from prometaphase through telophase. In contrast, during prometaphase CBP4a relocated to many large, discrete “CBP4a islands” throughout the nucleoplasm. Two larger “CBP4a islands” were also detected specifically

  6. Volcanic Activities of Hakkoda Volcano after the 2011 Tohoku Earthquake

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Yamamoto, M.; Miura, S.

    2014-12-01

    The 2011 Tohoku Earthquake of 11 March 2011 generated large deformation in and around the Japanese islands, and the large crustal deformation raises fear of further disasters including triggered volcanic activities. In this presentation, as an example of such potential triggered volcanic activities, we report the recent seismic activities of Hakkoda volcano, and discuss the relation to the movement of volcanic fluids. Hakkoda volcano is a group of stratovolcanoes at the northern end of Honshu Island, Japan. There are fumaroles and hot springs around the volcano, and phreatic eruptions from Jigoku-numa on the southwestern flank of Odake volcano, which is the highest peak of the volcanic group, were documented in its history. Since just after the occurrence of the Tohokui Earthquake, the seismicity around the volcano became higher, and the migration of hypocenters of volcano-tectonic (VT) earthquakes was observed.In addition to these VT earthquakes, long-period (LP) events started occurring beneath Odake at a depth of about 2-3 km since February, 2013, and subtle crustal deformation caused by deep inflation source was also detected by the GEONET GNSS network around the same time. The spectra of LP events are common between events irrespective of the magnitude of events, and they have several spectral peaks at 6-7 sec, 2-3 sec, 1 sec, and so on. These LP events sometimes occur like a swarm with an interval of several minutes. The characteristics of observed LP events at Hakkoda volcano are similar to those of LP events at other active volcanoes and hydrothermal area in the world, where abundant fluids exist. Our further analysis using far-field Rayleigh radiation pattern observed by NIED Hi-net stations reveals that the source of LP events is most likely to be a nearly vertical tensile crack whose strike is NE-SW direction. The strike is almost perpendicular to the direction of maximum extensional strain estimated from the geodetic analysis, and is almost parallel to

  7. CLOMP: Accurately Characterizing OpenMP Application Overheads

    SciTech Connect

    Bronevetsky, G; Gyllenhaal, J; de Supinski, B R

    2008-11-10

    Despite its ease of use, OpenMP has failed to gain widespread use on large scale systems, largely due to its failure to deliver sufficient performance. Our experience indicates that the cost of initiating OpenMP regions is simply too high for the desired OpenMP usage scenario of many applications. In this paper, we introduce CLOMP, a new benchmark to characterize this aspect of OpenMP implementations accurately. CLOMP complements the existing EPCC benchmark suite to provide simple, easy to understand measurements of OpenMP overheads in the context of application usage scenarios. Our results for several OpenMP implementations demonstrate that CLOMP identifies the amount of work required to compensate for the overheads observed with EPCC.We also show that CLOMP also captures limitations for OpenMP parallelization on SMT and NUMA systems. Finally, CLOMPI, our MPI extension of CLOMP, demonstrates which aspects of OpenMP interact poorly with MPI when MPI helper threads cannot run on the NIC.

  8. GDP-Mannose-4,6-Dehydratase Is a Cytosolic Partner of Tankyrase 1 That Inhibits Its Poly(ADP-Ribose) Polymerase Activity

    PubMed Central

    Bisht, Kamlesh K.; Dudognon, Charles; Chang, William G.; Sokol, Ethan S.; Ramirez, Alejandro

    2012-01-01

    Tankyrase 1 is a poly(ADP-ribose) polymerase (PARP) that participates in a broad range of cellular activities due to interaction with multiple binding partners. Tankyrase 1 recognizes a linear six-amino-acid degenerate motif and, hence, has hundreds of potential target proteins. Binding of partner proteins to tankyrase 1 usually results in their poly(ADP-ribosyl)ation (PARsylation) and can lead to ubiquitylation and proteasomal degradation. However, it is not known how tankyrase 1 PARP activity is regulated. Here we identify GDP-mannose 4,6-dehydratase (GMD) as a binding partner of tankyrase 1. GMD is a cytosolic protein required for the first step of fucose synthesis. We show that GMD is complexed to tankyrase 1 in the cytosol throughout interphase, but its association with tankyrase 1 is reduced upon entry into mitosis, when tankyrase 1 binds to its other partners TRF1 (at telomeres) and NuMA (at spindle poles). In contrast to other binding partners, GMD is not PARsylated by tankyrase 1. Indeed, we show that GMD inhibits tankyrase 1 PARP activity in vitro, dependent on the GMD tankyrase 1 binding motif. In vivo, depletion of GMD led to degradation of tankyrase 1, dependent on the catalytic PARP activity of tankyrase 1. We speculate that association of tankyrase 1 with GMD in the cytosol sequesters tankyrase 1 in an inactive stable form that can be tapped by other target proteins as needed. PMID:22645305

  9. Sodium Channels in Pain and Cancer: New Therapeutic Opportunities.

    PubMed

    Luiz, Ana Paula; Wood, John N

    2016-01-01

    Voltage-gated sodium channels (VGSCs) underpin electrical activity in the nervous system through action potential propagation. First predicted by the modeling studies of Hodgkin and Huxley, they were subsequently identified at the molecular level by groups led by Catterall and Numa. VGSC dysfunction has long been linked to neuronal and cardiac disorders with some nonselective sodium channel blockers in current use in the clinic. The lack of selectivity means that side effect issues are a major impediment to the use of broad spectrum sodium channel blockers. Nine different sodium channels are known to exist, and selective blockers are now being developed. The potential utility of these drugs to target diseases ranging from migraine, multiple sclerosis, muscle, and immune system disorders, to cancer and pain is being explored. Four channels are potential targets for pain disorders. This conclusion comes from mouse knockout studies and human mutations that prove the involvement of Nav1.3, Nav1.7, Nav1.8, and Nav1.9 in the development and maintenance of acute and chronic pain. In this chapter, we present a short overview of the possible role of Nav1.3, Nav1.7, Nav1.8, and Nav1.9 in human pain and the emerging and unexpected role of sodium channels in cancer pathogenesis. PMID:26920012

  10. Optimization of Forward Wave Modeling on Contemporary HPC Architectures

    SciTech Connect

    Krueger, Jens; Micikevicius, Paulius; Williams, Samuel

    2012-07-20

    Reverse Time Migration (RTM) is one of the main approaches in the seismic processing industry for imaging the subsurface structure of the Earth. While RTM provides qualitative advantages over its predecessors, it has a high computational cost warranting implementation on HPC architectures. We focus on three progressively more complex kernels extracted from RTM: for isotropic (ISO), vertical transverse isotropic (VTI) and tilted transverse isotropic (TTI) media. In this work, we examine performance optimization of forward wave modeling, which describes the computational kernels used in RTM, on emerging multi- and manycore processors and introduce a novel common subexpression elimination optimization for TTI kernels. We compare attained performance and energy efficiency in both the single-node and distributed memory environments in order to satisfy industry’s demands for fidelity, performance, and energy efficiency. Moreover, we discuss the interplay between architecture (chip and system) and optimizations (both on-node computation) highlighting the importance of NUMA-aware approaches to MPI communication. Ultimately, our results show we can improve CPU energy efficiency by more than 10× on Magny Cours nodes while acceleration via multiple GPUs can surpass the energy-efficient Intel Sandy Bridge by as much as 3.6×.

  11. Nuclear substructure reorganization during late-stage erythropoiesis is selective and does not involve caspase cleavage of major nuclear substructural proteins.

    PubMed

    Krauss, Sharon Wald; Lo, Annie J; Short, Sarah A; Koury, Mark J; Mohandas, Narla; Chasis, Joel Anne

    2005-09-15

    Enucleation, a rare feature of mammalian differentiation, occurs in 3 cell types: erythroblasts, lens epithelium, and keratinocytes. Previous investigations suggest that caspase activation functions in lens epithelial and keratinocyte enucleation, as well as in early erythropoiesis encompassing erythroid burst-forming unit (BFU-E) differentiation to proerythroblast. To determine whether caspase activation contributes to later erythropoiesis and whether nuclear substructures other than chromatin reorganize, we analyzed distributions of nuclear subcompartment proteins and assayed for caspase-induced cleavage of subcompartmental target proteins in mouse erythroblasts. We found that patterns of lamin B in the filamentous network interacting with both the nuclear envelope and DNA, nuclear matrix protein NuMA (Nuclear mitotic apparatus), and splicing factors Sm and SC35 persisted during nuclear condensation, consistent with effective transcription of genes expressed late in differentiation. Thus, nuclear reorganization prior to enucleation is selective, allowing maintenance of critical transcriptional processes independent of extensive chromosomal reorganization. Consistent with these data, we found no evidence for caspase-induced cleavage of major nuclear subcompartment proteins during late erythropoiesis, in contrast to what has been observed in early erythropoiesis and in lens epithelial and keratinocyte differentiation. These findings imply that nuclear condensation and extrusion during terminal erythroid differentiation involve novel mechanisms that do not entail major activation of apoptotic machinery.

  12. Two distinct domains of protein 4.1 critical for assembly of functional nuclei in vitro.

    PubMed

    Krauss, Sharon Wald; Heald, Rebecca; Lee, Gloria; Nunomura, Wataru; Gimm, J Aura; Mohandas, Narla; Chasis, Joel Anne

    2002-11-15

    Protein 4.1R, a multifunctional structural protein, acts as an adaptor in mature red cell membrane skeletons linking spectrin-actin complexes to plasma membrane-associated proteins. In nucleated cells protein 4.1 is not associated exclusively with plasma membrane but is also detected at several important subcellular locations crucial for cell division. To identify 4.1 domains having critical functions in nuclear assembly, 4.1 domain peptides were added to Xenopus egg extract nuclear reconstitution reactions. Morphologically disorganized, replication deficient nuclei assembled when spectrin-actin-binding domain or NuMA-binding C-terminal domain peptides were present. However, control variant spectrin-actin-binding domain peptides incapable of binding actin or mutant C-terminal domain peptides with reduced NuMA binding had no deleterious effects on nuclear reconstitution. To test whether 4.1 is required for proper nuclear assembly, 4.1 isoforms were depleted with spectrin-actin binding or C-terminal domain-specific antibodies. Nuclei assembled in the depleted extracts were deranged. However, nuclear assembly could be rescued by the addition of recombinant 4.1R. Our data establish that protein 4.1 is essential for nuclear assembly and identify two distinct 4.1 domains, initially characterized in cytoskeletal interactions, that have crucial and versatile functions in nuclear assembly.

  13. Downregulation of Protein 4.1R, a Mature Centriole Protein, Disrupts Centrosomes, Alters Cell Cycle Progression, and Perturbs Mitotic Spindles and Anaphase▿

    PubMed Central

    Krauss, Sharon Wald; Spence, Jeffrey R.; Bahmanyar, Shirin; Barth, Angela I. M.; Go, Minjoung M.; Czerwinski, Debra; Meyer, Adam J.

    2008-01-01

    Centrosomes nucleate and organize interphase microtubules and are instrumental in mitotic bipolar spindle assembly, ensuring orderly cell cycle progression with accurate chromosome segregation. We report that the multifunctional structural protein 4.1R localizes at centrosomes to distal/subdistal regions of mature centrioles in a cell cycle-dependent pattern. Significantly, 4.1R-specific depletion mediated by RNA interference perturbs subdistal appendage proteins ninein and outer dense fiber 2/cenexin at mature centrosomes and concomitantly reduces interphase microtubule anchoring and organization. 4.1R depletion causes G1 accumulation in p53-proficient cells, similar to depletion of many other proteins that compromise centrosome integrity. In p53-deficient cells, 4.1R depletion delays S phase, but aberrant ninein distribution is not dependent on the S-phase delay. In 4.1R-depleted mitotic cells, efficient centrosome separation is reduced, resulting in monopolar spindle formation. Multipolar spindles and bipolar spindles with misaligned chromatin are also induced by 4.1R depletion. Notably, all types of defective spindles have mislocalized NuMA (nuclear mitotic apparatus protein), a 4.1R binding partner essential for spindle pole focusing. These disruptions contribute to lagging chromosomes and aberrant microtubule bridges during anaphase/telophase. Our data provide functional evidence that 4.1R makes crucial contributions to the structural integrity of centrosomes and mitotic spindles which normally enable mitosis and anaphase to proceed with the coordinated precision required to avoid pathological events. PMID:18212055

  14. Binding of matrix attachment regions to lamin polymers involves single-stranded regions and the minor groove.

    PubMed Central

    Ludérus, M E; den Blaauwen, J L; de Smit, O J; Compton, D A; van Driel, R

    1994-01-01

    Chromatin in eukaryotic nuclei is thought to be partitioned into functional loop domains that are generated by the binding of defined DNA sequences, named MARs (matrix attachment regions), to the nuclear matrix. We have previously identified B-type lamins as MAR-binding matrix components (M. E. E. Ludérus, A. de Graaf, E. Mattia, J. L. den Blaauwen, M. A. Grande, L. de Jong, and R. van Driel, Cell 70:949-959, 1992). Here we show that A-type lamins and the structurally related proteins desmin and NuMA also specifically bind MARs in vitro. We studied the interaction between MARs and lamin polymers in molecular detail and found that the interaction is saturable, of high affinity, and evolutionarily conserved. Competition studies revealed the existence of two different types of interaction related to different structural features of MARs: one involving the minor groove of double-stranded MAR DNA and one involving single-stranded regions. We obtained similar results for the interaction of MARs with intact nuclear matrices from rat liver. A model in which the interaction of nuclear matrix proteins with single-stranded MAR regions serves to stabilize the transcriptionally active state of chromatin is discussed. Images PMID:8065361

  15. Performance of an MPI-only semiconductor device simulator on a quad socket/quad core InfiniBand platform.

    SciTech Connect

    Shadid, John Nicolas; Lin, Paul Tinphone

    2009-01-01

    This preliminary study considers the scaling and performance of a finite element (FE) semiconductor device simulator on a capacity cluster with 272 compute nodes based on a homogeneous multicore node architecture utilizing 16 cores. The inter-node communication backbone for this Tri-Lab Linux Capacity Cluster (TLCC) machine is comprised of an InfiniBand interconnect. The nonuniform memory access (NUMA) nodes consist of 2.2 GHz quad socket/quad core AMD Opteron processors. The performance results for this study are obtained with a FE semiconductor device simulation code (Charon) that is based on a fully-coupled Newton-Krylov solver with domain decomposition and multilevel preconditioners. Scaling and multicore performance results are presented for large-scale problems of 100+ million unknowns on up to 4096 cores. A parallel scaling comparison is also presented with the Cray XT3/4 Red Storm capability platform. The results indicate that an MPI-only programming model for utilizing the multicore nodes is reasonably efficient on all 16 cores per compute node. However, the results also indicated that the multilevel preconditioner, which is critical for large-scale capability type simulations, scales better on the Red Storm machine than the TLCC machine.

  16. Eccrine porocarcinoma: cytologic diagnosis by fine needle aspiration biopsy (FNAB).

    PubMed

    Kalogeraki, Alexandra; Tamiolakis, Dimitrios; Tsagatakis, Thomas; Geronatsiou, Katerina; Haniotis, Vrettos; Kafoussi, Maria

    2013-01-01

    Introdução: O porocarcinoma écrino (PE) é um tumor maligno pouco comum dos anexos cutâneos. Trata-se de um adenocarcinoma da glândula sudorípara écrina com propensão para recorrer localmente e para originar metástases ao longo dos gânglios linfáticos regionais. Este artigo apresenta um diagnóstico por citologia aspirativa com agulha fina (CAAF) de um PE, associado ao exame histológico e de imunocito/histoquímica.Caso Clínico: São descritos os achados da citologia de um porocarcinoma écrino numa doente de 76 anos de idade, bem como as características histológicas do tumor cutâneo. A citologia aspirativa revelou que o tumor se caracterizava pela presença de células atípicas malignas com citoplasma basófilo, núcleos hipercromáticos e nucléolos proeminentes. O diagnóstico citológico foi confirmado pela histologia.Conclusões: É crucial obter um diagnóstico pré-operatório preciso de modo a desencadear um plano cirúrgico curativo. A CAAF possibilita uma abordagem pouco invasiva, segura e efectiva, de modo a esclarecer um diagnóstico diferencial exigente.

  17. CENP-32 is required to maintain centrosomal dominance in bipolar spindle assembly

    PubMed Central

    Ohta, Shinya; Wood, Laura; Toramoto, Iyo; Yagyu, Ken-Ichi; Fukagawa, Tatsuo; Earnshaw, William C.

    2015-01-01

    Centrosomes nucleate spindle formation, direct spindle pole positioning, and are important for proper chromosome segregation during mitosis in most animal cells. We previously reported that centromere protein 32 (CENP-32) is required for centrosome association with spindle poles during metaphase. In this study, we show that CENP-32 depletion seems to release centrosomes from bipolar spindles whose assembly they had previously initiated. Remarkably, the resulting anastral spindles function normally, aligning the chromosomes to a metaphase plate and entering anaphase without detectable interference from the free centrosomes, which appear to behave as free asters in these cells. The free asters, which contain reduced but significant levels of CDK5RAP2, show weak interactions with spindle microtubules but do not seem to make productive attachments to kinetochores. Thus CENP-32 appears to be required for centrosomes to integrate into a fully functional spindle that not only nucleates astral microtubules, but also is able to nucleate and bind to kinetochore and central spindle microtubules. Additional data suggest that NuMA tethers microtubules at the anastral spindle poles and that augmin is required for centrosome detachment after CENP-32 depletion, possibly due to an imbalance of forces within the spindle. PMID:25657325

  18. Modern multicore and manycore architectures: Modelling, optimisation and benchmarking a multiblock CFD code

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Hadade, Ioan; di Mare, Luca

    2016-08-01

    Modern multicore and manycore processors exhibit multiple levels of parallelism through a wide range of architectural features such as SIMD for data parallel execution or threads for core parallelism. The exploitation of multi-level parallelism is therefore crucial for achieving superior performance on current and future processors. This paper presents the performance tuning of a multiblock CFD solver on Intel SandyBridge and Haswell multicore CPUs and the Intel Xeon Phi Knights Corner coprocessor. Code optimisations have been applied on two computational kernels exhibiting different computational patterns: the update of flow variables and the evaluation of the Roe numerical fluxes. We discuss at great length the code transformations required for achieving efficient SIMD computations for both kernels across the selected devices including SIMD shuffles and transpositions for flux stencil computations and global memory transformations. Core parallelism is expressed through threading based on a number of domain decomposition techniques together with optimisations pertaining to alleviating NUMA effects found in multi-socket compute nodes. Results are correlated with the Roofline performance model in order to assert their efficiency for each distinct architecture. We report significant speedups for single thread execution across both kernels: 2-5X on the multicore CPUs and 14-23X on the Xeon Phi coprocessor. Computations at full node and chip concurrency deliver a factor of three speedup on the multicore processors and up to 24X on the Xeon Phi manycore coprocessor.

  19. Proceedings of the second SISAL users` conference

    SciTech Connect

    Feo, J T; Frerking, C; Miller, P J

    1992-12-01

    This report contains papers on the following topics: A sisal code for computing the fourier transform on S{sub N}; five ways to fill your knapsack; simulating material dislocation motion in sisal; candis as an interface for sisal; parallelisation and performance of the burg algorithm on a shared-memory multiprocessor; use of genetic algorithm in sisal to solve the file design problem; implementing FFT`s in sisal; programming and evaluating the performance of signal processing applications in the sisal programming environment; sisal and Von Neumann-based languages: translation and intercommunication; an IF2 code generator for ADAM architecture; program partitioning for NUMA multiprocessor computer systems; mapping functional parallelism on distributed memory machines; implicit array copying: prevention is better than cure ; mathematical syntax for sisal; an approach for optimizing recursive functions; implementing arrays in sisal 2.0; Fol: an object oriented extension to the sisal language; twine: a portable, extensible sisal execution kernel; and investigating the memory performance of the optimizing sisal compiler.

  20. Aurora A Phosphorylates MCAK to Control Ran-dependent Spindle Bipolarity

    PubMed Central

    Zhang, Xin; Ems-McClung, Stephanie C.

    2008-01-01

    During mitosis, mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) localizes to chromatin/kinetochores, a cytoplasmic pool, and spindle poles. Its localization and activity in the chromatin region are regulated by Aurora B kinase; however, how the cytoplasmic- and pole-localized MCAK are regulated is currently not clear. In this study, we used Xenopus egg extracts to form spindles in the absence of chromatin and centrosomes and found that MCAK localization and activity are tightly regulated by Aurora A. This regulation is important to focus microtubules at aster centers and to facilitate the transition from asters to bipolar spindles. In particular, we found that MCAK colocalized with NuMA and XMAP215 at the center of Ran asters where its activity is regulated by Aurora A-dependent phosphorylation of S196, which contributes to proper pole focusing. In addition, we found that MCAK localization at spindle poles was regulated through another Aurora A phosphorylation site (S719), which positively enhances bipolar spindle formation. This is the first study that clearly defines a role for MCAK at the spindle poles as well as identifies another key Aurora A substrate that contributes to spindle bipolarity. PMID:18434591

  1. Integrated Performance Monitoring of a Cosmology Application onLeading HEC Platforms

    SciTech Connect

    Borrill, Julian; Carter, Jonathan; Oliker, Leonid; Skinner,David; Biswas, Rupak

    2005-04-01

    The Cosmic Microwave Background (CMB) is an exquisitely sensitive probe of the fundamental parameters of cosmology. Extracting this information is computationally intensive, requiring massively parallel computing and sophisticated numerical algorithms. In this work we present MAD bench, a lightweight version of the MADCAP CMB power spectrum estimation code that retains the operational complexity and integrated system requirements. In addition, to quantify communication behavior across a variety of architectural platforms, we introduce the Integrated Performance Monitoring (IPM) package: a portable, lightweight,and scalable tool for effectively extracting MPI message-passing overheads. A performance characterization study is conducted on some of the world's most powerful supercomputers, including the superscalar Seaborg(IBMPower3+) and CC-NUMA Columbia (SGI Altix), as well as the vector-based Earth Simulator (NEC SX-6 enhanced) and Phoenix (Cray X1)systems. In-depth analysis shows that in order to bridge the gap between theoretical and sustained system performance, it is critical to gain a clear understanding of how the distinct parts of large-scale parallel applications interact with the individual subcomponents of HEC platforms.

  2. A correlação índice espectral vs. luminosidade em QSOs e suas implicações

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Garcia-Rissmann, A.

    2003-08-01

    Estudos de variabilidade de núcleos ativos já demonstraram ser comum o fato de seu contínuo óptico/UV tornar-se mais "duro" à medida que a luminosidade aumenta. Essa tendência ocorre tanto de forma individual quanto global, e pode ter implicações importantes (1) para estudos fotométricos de variabilidade conduzidos numa banda fixa no referencial do observador, comparando objetos a diferentes redshifts, e (2) no cálculo da correção K, com consequente impacto na determinação de massas de buracos negros e bojos de galáxias hospedeiras (através da relação de Magorrian). Confirmo aqui as correlações positivas entre o índice espectral e a luminosidade óptica, utilizando dados espectroscópicos de 11 QSOs monitorados no Brasil e no Chile, durante ~2 anos. O estudo é complementado com parâmetros extraídos de espectros e de dados fotométricos públicos de quasares. Destaco ainda as diferenças observadas em tais correlações para objetos do tipo radio-loud e radio-quiet. Este projeto é financiado pelo I. Milênio/CNPq.

  3. Proceedings: Sisal `93

    SciTech Connect

    Feo, J.T.

    1993-10-01

    This report contain papers on: Programmability and performance issues; The case of an iterative partial differential equation solver; Implementing the kernal of the Australian Region Weather Prediction Model in Sisal; Even and quarter-even prime length symmetric FFTs and their Sisal Implementations; Top-down thread generation for Sisal; Overlapping communications and computations on NUMA architechtures; Compiling technique based on dataflow analysis for funtional programming language Valid; Copy elimination for true multidimensional arrays in Sisal 2.0; Increasing parallelism for an optimization that reduces copying in IF2 graphs; Caching in on Sisal; Cache performance of Sisal Vs. FORTRAN; FFT algorithms on a shared-memory multiprocessor; A parallel implementation of nonnumeric search problems in Sisal; Computer vision algorithms in Sisal; Compilation of Sisal for a high-performance data driven vector processor; Sisal on distributed memory machines; A virtual shared addressing system for distributed memory Sisal; Developing a high-performance FFT algorithm in Sisal for a vector supercomputer; Implementation issues for IF2 on a static data-flow architechture; and Systematic control of parallelism in array-based data-flow computation. Selected papers have been indexed separately for inclusion in the Energy Science and Technology Database.

  4. An autoinhibited conformation of LGN reveals a distinct interaction mode between GoLoco motifs and TPR motifs.

    PubMed

    Pan, Zhu; Zhu, Jinwei; Shang, Yuan; Wei, Zhiyi; Jia, Min; Xia, Caihao; Wen, Wenyu; Wang, Wenning; Zhang, Mingjie

    2013-06-01

    LGN plays essential roles in asymmetric cell divisions via its N-terminal TPR-motif-mediated binding to mInsc and NuMA. This scaffolding activity requires the release of the autoinhibited conformation of LGN by binding of Gα(i) to its C-terminal GoLoco (GL) motifs. The interaction between the GL and TPR motifs of LGN represents a distinct GL/target binding mode with an unknown mechanism. Here, we show that two consecutive GL motifs of LGN form a minimal TPR-motif-binding unit. GL12 and GL34 bind to TPR0-3 and TPR4-7, respectively. The crystal structure of a truncated LGN reveals that GL34 forms a pair of parallel α helices and binds to the concave surface of TPR4-7, thereby preventing LGN from binding to other targets. Importantly, the GLs bind to TPR motifs with a mode distinct from that observed in the GL/Gα(i)·GDP complexes. Our results also indicate that multiple and orphan GL motif proteins likely respond to G proteins with distinct mechanisms.

  5. Crystallization and X-ray diffraction of LGN in complex with the actin-binding protein afadin.

    PubMed

    Carminati, Manuel; Cecatiello, Valentina; Mapelli, Marina

    2016-02-01

    Asymmetric stem-cell divisions are fundamental for morphogenesis and tissue homeostasis. They rely on the coordination between cortical polarity and the orientation of the mitotic spindle, which is orchestrated by microtubule pulling motors recruited at the cortex by NuMA-LGN-Gαi complexes. LGN has emerged as a central component of the spindle-orientation pathway that is conserved throughout species. Its domain structure consists of an N-terminal TPR domain associating with NuMA, followed by four GoLoco motifs binding to Gαi subunits. The LGN(TPR) region is also involved in interactions with other membrane-associated proteins ensuring the correct cortical localization of microtubule motors, among which is the junctional protein afadin. To investigate the architecture of LGN(TPR) in complex with afadin, a chimeric fusion protein with a native linker derived from the region of afadin upstream of the LGN-binding domain was generated. The fusion protein behaves as a globular monomer in solution and readily crystallizes in the presence of sulfate-containing reservoirs. The crystals diffracted to 3.0 Å resolution and belonged to the cubic space group P213, with unit-cell parameter a = 170.3 Å. The structure of the engineered protein revealed that the crystal packing is promoted by the coordination of sulfate ions by residues of the afadin linker region and LGN(TPR).

  6. Global Arrays

    2006-02-23

    The Global Arrays (GA) toolkit provides an efficient and portable “shared-memory” programming interface for distributed-memory computers. Each process in a MIMD parallel program can asynchronously access logical blocks of physically distributed dense multi-dimensional arrays, without need for explicit cooperation by other processes. Unlike other shared-memory environments, the GA model exposes to the programmer the non-uniform memory access (NUMA) characteristics of the high performance computers and acknowledges that access to a remote portion of the sharedmore » data is slower than to the local portion. The locality information for the shared data is available, and a direct access to the local portions of shared data is provided. Global Arrays have been designed to complement rather than substitute for the message-passing programming model. The programmer is free to use both the shared-memory and message-passing paradigms in the same program, and to take advantage of existing message-passing software libraries. Global Arrays are compatible with the Message Passing Interface (MPI).« less

  7. Pins is not required for spindle orientation in the Drosophila wing disc

    PubMed Central

    Lovegrove, Holly E.; Kujawiak, Izabela; Dawney, Nicole S.; Zhu, Jinwei; Cooper, Samantha; Zhang, Rongguang

    2016-01-01

    In animal cells, mitotic spindles are oriented by the dynein/dynactin motor complex, which exerts a pulling force on astral microtubules. Dynein/dynactin localization depends on Mud/NUMA, which is typically recruited to the cortex by Pins/LGN. In Drosophila neuroblasts, the Inscuteable/Baz/Par-6/aPKC complex recruits Pins apically to induce vertical spindle orientation, whereas in epithelial cells Dlg recruits Pins laterally to orient the spindle horizontally. Here we investigate division orientation in the Drosophila imaginal wing disc epithelium. Live imaging reveals that spindle angles vary widely during prometaphase and metaphase, and therefore do not reliably predict division orientation. This finding prompted us to re-examine mutants that have been reported to disrupt division orientation in this tissue. Loss of Mud misorients divisions, but Inscuteable expression and aPKC, dlg and pins mutants have no effect. Furthermore, Mud localizes to the apical-lateral cortex of the wing epithelium independently of both Pins and cell cycle stage. Thus, Pins is not required in the wing disc because there are parallel mechanisms for Mud localization and hence spindle orientation, making it a more robust system than in other epithelia. PMID:27287805

  8. Mushroom body defect is required in parallel to Netrin for midline axon guidance in Drosophila

    PubMed Central

    Cate, Marie-Sophie; Gajendra, Sangeetha; Alsbury, Samantha; Raabe, Thomas; Tear, Guy; Mitchell, Kevin J.

    2016-01-01

    The outgrowth of many neurons within the central nervous system is initially directed towards or away from the cells lying at the midline. Recent genetic evidence suggests that a simple model of differential sensitivity to the conserved Netrin attractants and Slit repellents is insufficient to explain the guidance of all axons at the midline. In the Drosophila embryonic ventral nerve cord, many axons still cross the midline in the absence of the Netrin genes (NetA and NetB) or their receptor frazzled. Here we show that mutation of mushroom body defect (mud) dramatically enhances the phenotype of Netrin or frazzled mutants, resulting in many more axons failing to cross the midline, although mutations in mud alone have little effect. This suggests that mud, which encodes a microtubule-binding coiled-coil protein homologous to NuMA and LIN-5, is an essential component of a Netrin-independent pathway that acts in parallel to promote midline crossing. We demonstrate that this novel role of Mud in axon guidance is independent of its previously described role in neural precursor development. These studies identify a parallel pathway controlling midline guidance in Drosophila and highlight a novel role for Mud potentially acting downstream of Frizzled to aid axon guidance. PMID:26893348

  9. Asymmetric friction of non-motor MAPs can lead to their directional motion in active microtubule networks

    PubMed Central

    Forth, Scott; Hsia, Kuo-Chiang; Shimamoto, Yuta; Kapoor, Tarun M.

    2014-01-01

    Summary Diverse cellular processes require microtubules to be organized into distinct structures, such as asters or bundles. Within these dynamic motifs, microtubule-associated proteins (MAPs) are frequently under load, but how force modulates these proteins’ function is poorly understood. Here, we combine optical-trapping with TIRF-based microscopy to measure the force-dependence of microtubule interaction for three non-motor MAPs (NuMA, PRC1, and EB1) required for cell division. We find that frictional forces increase non-linearly with MAP velocity across microtubules and depend on filament polarity, with NuMA’s friction being lower when moving towards minus-ends, EB1’s lower towards plus-ends, and PRC1 exhibiting no directional preference. Mathematical models predict, and experiments confirm, that MAPs with asymmetric friction can move directionally within active microtubule pairs they crosslink. Our findings reveal how non-motor MAPs can generate frictional resistance in dynamic cytoskeletal networks via micromechanical adaptations whose anisotropy may be optimized for MAP localization and function within cellular structures. PMID:24725408

  10. Robust control of mitotic spindle orientation in the developing epidermis

    PubMed Central

    Poulson, Nicholas D.

    2010-01-01

    Progenitor cells must balance self-amplification and production of differentiated progeny during development and homeostasis. In the epidermis, progenitors divide symmetrically to increase surface area and asymmetrically to promote stratification. In this study, we show that individual epidermal cells can undergo both types of division, and therefore, the balance is provided by the sum of individual cells’ choices. In addition, we define two control points for determining a cell’s mode of division. First is the expression of the mouse Inscuteable gene, which is sufficient to drive asymmetric cell division (ACD). However, there is robust control of division orientation as excessive ACDs are prevented by a change in the localization of NuMA, an effector of spindle orientation. Finally, we show that p63, a transcriptional regulator of stratification, does not control either of these processes. These data have uncovered two important regulatory points controlling ACD in the epidermis and allow a framework for analysis of how external cues control this important choice. PMID:21098114

  11. Diatoms from Lake Kushu: A pilot study to test the potential of a Late Quaternary palaeoenvironmental archive from Rebun Island (Hokkaido Region, Japan)

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Schmidt, Mareike; Tarasov, Pavel E.; Hoelzmann, Philipp; Meyer, Hanno; Leipe, Christian

    2016-05-01

    Rebun Island is a key research area for the Baikal-Hokkaido Archaeology Project to better understand the dynamics of the Neolithic hunter-gatherers in the NW Pacific region. Hence, the ca. 19.5 m sediment core RK12 spanning the last ca. 16.6 cal. kyr BP was obtained from Lake Kushu. Our aim is to test its potential as a high-resolution multi-proxy archive. Here, we used diatoms to investigate the modern ecosystem of Lake Kushu and its surrounding area on Rebun Island and of Hime-numa Pond on Rishiri Island and selected core samples for comparison. Modern diatom and stable isotope analyses show well-mixed freshwater bodies with eutrophic, alkaline conditions. The fossil diatom and geochemical sediment analyses display three phases that represent major changes in the lake development: (i) a marshy phase (ca. 16.6-10 cal. kyr BP); (ii) a brackish water lagoon phase (ca. 10-6.6 cal. kyr BP); and (iii) a freshwater lake phase (since ca. 6.6 cal. kyr BP). This shows the major role of the post-glacial climate amelioration, global sea-level rise and marine transgression in the development of this landscape. Further analyses will provide a palaeolimnological record at (sub-)decadal resolution that will facilitate the interpretation of the hunter-gatherer dynamics.

  12. Scalable Triadic Analysis of Large-Scale Graphs: Multi-Core vs. Multi-Processor vs. Multi-Threaded Shared Memory Architectures

    SciTech Connect

    Chin, George; Marquez, Andres; Choudhury, Sutanay; Feo, John T.

    2012-09-01

    Triadic analysis encompasses a useful set of graph mining methods that is centered on the concept of a triad, which is a subgraph of three nodes and the configuration of directed edges across the nodes. Such methods are often applied in the social sciences as well as many other diverse fields. Triadic methods commonly operate on a triad census that counts the number of triads of every possible edge configuration in a graph. Like other graph algorithms, triadic census algorithms do not scale well when graphs reach tens of millions to billions of nodes. To enable the triadic analysis of large-scale graphs, we developed and optimized a triad census algorithm to efficiently execute on shared memory architectures. We will retrace the development and evolution of a parallel triad census algorithm. Over the course of several versions, we continually adapted the code’s data structures and program logic to expose more opportunities to exploit parallelism on shared memory that would translate into improved computational performance. We will recall the critical steps and modifications that occurred during code development and optimization. Furthermore, we will compare the performances of triad census algorithm versions on three specific systems: Cray XMT, HP Superdome, and AMD multi-core NUMA machine. These three systems have shared memory architectures but with markedly different hardware capabilities to manage parallelism.

  13. A unique set of centrosome proteins requires Pericentrin for spindle-pole localization and spindle orientation

    PubMed Central

    Farkas, Debby; Zheng, Guoqiang; Redick, Sambra D.; Hung, Hui-Fang; Samtani, Rajeev; Jurczyk, Agata; Akbarian, Schahram; Wise, Carol; Jackson, Andrew; Bober, Michael; Guo, Yin

    2014-01-01

    SUMMARY Majewski Osteodysplastic Primordial Dwarfism type II (MOPDII) is caused by mutations in the centrosome gene pericentrin (PCNT) which lead to severe pre- and post-natal growth retardation[1]. As in MOPDII patients, disruption of pericentrin (Pcnt) in mice caused a number of abnormalities including microcephaly, aberrant hemodynamics analyzed by in utero echocardiography and cardiovascular anomalies; the latter being associated with mortality, as in the human condition[1]. To identify the mechanisms underlying these defects, we tested for changes in cell and molecular function. All Pcnt−/− mouse tissues and cells examined showed spindle misorientation. This mouse phenotype was associated with misdirected ventricular septal growth in the heart, decreased proliferative symmetric divisions in brain neural progenitors and increased misoriented divisions in fibroblasts; the same phenotype was seen in fibroblasts from three MOPDII individuals. Misoriented spindles were associated with disrupted astral microtubules and near complete loss of a unique set of centrosome proteins from spindle poles (ninein, Cep215, centriolin). All these proteins appear to be crucial for microtubule anchoring and all interacted with Pcnt, suggesting that Pcnt serves as a molecular scaffold for this functionally-linked set of spindle pole proteins. Importantly, Pcnt disruption had no detectable effect on localization of proteins involved in the cortical polarity pathway (NuMA, p150glued, aPKC). Not only do these data reveal a spindle-pole-localized complex for spindle orientation, but they identify key spindle symmetry proteins involved in the pathogenesis of MOPDII. PMID:25220058

  14. Pins is not required for spindle orientation in the Drosophila wing disc.

    PubMed

    Bergstralh, Dan T; Lovegrove, Holly E; Kujawiak, Izabela; Dawney, Nicole S; Zhu, Jinwei; Cooper, Samantha; Zhang, Rongguang; St Johnston, Daniel

    2016-07-15

    In animal cells, mitotic spindles are oriented by the dynein/dynactin motor complex, which exerts a pulling force on astral microtubules. Dynein/dynactin localization depends on Mud/NUMA, which is typically recruited to the cortex by Pins/LGN. In Drosophila neuroblasts, the Inscuteable/Baz/Par-6/aPKC complex recruits Pins apically to induce vertical spindle orientation, whereas in epithelial cells Dlg recruits Pins laterally to orient the spindle horizontally. Here we investigate division orientation in the Drosophila imaginal wing disc epithelium. Live imaging reveals that spindle angles vary widely during prometaphase and metaphase, and therefore do not reliably predict division orientation. This finding prompted us to re-examine mutants that have been reported to disrupt division orientation in this tissue. Loss of Mud misorients divisions, but Inscuteable expression and aPKC, dlg and pins mutants have no effect. Furthermore, Mud localizes to the apical-lateral cortex of the wing epithelium independently of both Pins and cell cycle stage. Thus, Pins is not required in the wing disc because there are parallel mechanisms for Mud localization and hence spindle orientation, making it a more robust system than in other epithelia.

  15. Mushroom body defect is required in parallel to Netrin for midline axon guidance in Drosophila.

    PubMed

    Cate, Marie-Sophie; Gajendra, Sangeetha; Alsbury, Samantha; Raabe, Thomas; Tear, Guy; Mitchell, Kevin J

    2016-03-15

    The outgrowth of many neurons within the central nervous system is initially directed towards or away from the cells lying at the midline. Recent genetic evidence suggests that a simple model of differential sensitivity to the conserved Netrin attractants and Slit repellents is insufficient to explain the guidance of all axons at the midline. In the Drosophila embryonic ventral nerve cord, many axons still cross the midline in the absence of the Netrin genes (NetA and NetB) or their receptor frazzled. Here we show that mutation of mushroom body defect (mud) dramatically enhances the phenotype of Netrin or frazzled mutants, resulting in many more axons failing to cross the midline, although mutations in mud alone have little effect. This suggests that mud, which encodes a microtubule-binding coiled-coil protein homologous to NuMA and LIN-5, is an essential component of a Netrin-independent pathway that acts in parallel to promote midline crossing. We demonstrate that this novel role of Mud in axon guidance is independent of its previously described role in neural precursor development. These studies identify a parallel pathway controlling midline guidance in Drosophila and highlight a novel role for Mud potentially acting downstream of Frizzled to aid axon guidance. PMID:26893348

  16. GPU Accelerated Spectral Element Methods: 3D Euler equations

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Abdi, D. S.; Wilcox, L.; Giraldo, F.; Warburton, T.

    2015-12-01

    A GPU accelerated nodal discontinuous Galerkin method for the solution of three dimensional Euler equations is presented. The Euler equations are nonlinear hyperbolic equations that are widely used in Numerical Weather Prediction (NWP). Therefore, acceleration of the method plays an important practical role in not only getting daily forecasts faster but also in obtaining more accurate (high resolution) results. The equation sets used in our atomospheric model NUMA (non-hydrostatic unified model of the atmosphere) take into consideration non-hydrostatic effects that become more important with high resolution. We use algorithms suitable for the single instruction multiple thread (SIMT) architecture of GPUs to accelerate solution by an order of magnitude (20x) relative to CPU implementation. For portability to heterogeneous computing environment, we use a new programming language OCCA, which can be cross-compiled to either OpenCL, CUDA or OpenMP at runtime. Finally, the accuracy and performance of our GPU implementations are veried using several benchmark problems representative of different scales of atmospheric dynamics.

  17. Downregulation of Protein 4.1R impairs centrosome function,bipolar spindle organization and anaphase

    SciTech Connect

    Spence, Jeffrey R.; Go, Minjoung M.; Bahmanyar, S.; Barth,A.I.M.; Krauss, Sharon Wald

    2006-03-17

    Centrosomes nucleate and organize interphase MTs and areinstrumental in the assembly of the mitotic bipolar spindle. Here wereport that two members of the multifunctional protein 4.1 family havedistinct distributions at centrosomes. Protein 4.1R localizes to maturecentrioles whereas 4.1G is a component of the pericentriolar matrixsurrounding centrioles. To selectively probe 4.1R function, we used RNAinterference-mediated depletion of 4.1R without decreasing 4.1Gexpression. 4.1R downregulation reduces MT anchoring and organization atinterphase and impairs centrosome separation during prometaphase.Metaphase chromosomes fail to properly condense/align and spindleorganization is aberrant. Notably 4.1R depletion causes mislocalizationof its binding partner NuMA (Nuclear Mitotic Apparatus Protein),essential for spindle pole focusing, and disrupts ninein. Duringanaphase/telophase, 4.1R-depleted cells have lagging chromosomes andaberrant MT bridges. Our data provide functional evidence that 4.1R makescrucial contributions to centrosome integrity and to mitotic spindlestructure enabling mitosis and anaphase to proceed with the coordinatedprecision required to avoid pathological events.

  18. Pins is not required for spindle orientation in the Drosophila wing disc.

    PubMed

    Bergstralh, Dan T; Lovegrove, Holly E; Kujawiak, Izabela; Dawney, Nicole S; Zhu, Jinwei; Cooper, Samantha; Zhang, Rongguang; St Johnston, Daniel

    2016-07-15

    In animal cells, mitotic spindles are oriented by the dynein/dynactin motor complex, which exerts a pulling force on astral microtubules. Dynein/dynactin localization depends on Mud/NUMA, which is typically recruited to the cortex by Pins/LGN. In Drosophila neuroblasts, the Inscuteable/Baz/Par-6/aPKC complex recruits Pins apically to induce vertical spindle orientation, whereas in epithelial cells Dlg recruits Pins laterally to orient the spindle horizontally. Here we investigate division orientation in the Drosophila imaginal wing disc epithelium. Live imaging reveals that spindle angles vary widely during prometaphase and metaphase, and therefore do not reliably predict division orientation. This finding prompted us to re-examine mutants that have been reported to disrupt division orientation in this tissue. Loss of Mud misorients divisions, but Inscuteable expression and aPKC, dlg and pins mutants have no effect. Furthermore, Mud localizes to the apical-lateral cortex of the wing epithelium independently of both Pins and cell cycle stage. Thus, Pins is not required in the wing disc because there are parallel mechanisms for Mud localization and hence spindle orientation, making it a more robust system than in other epithelia. PMID:27287805

  19. Regulation of mitotic spindle orientation: an integrated view.

    PubMed

    di Pietro, Florencia; Echard, Arnaud; Morin, Xavier

    2016-08-01

    Mitotic spindle orientation is essential for cell fate decisions, epithelial maintenance, and tissue morphogenesis. In most animal cell types, the dynein motor complex is anchored at the cell cortex and exerts pulling forces on astral microtubules to position the spindle. Early studies identified the evolutionarily conserved Gαi/LGN/NuMA complex as a key regulator that polarizes cortical force generators. In recent years, a combination of genetics, biochemistry, modeling, and live imaging has contributed to decipher the mechanisms of spindle orientation. Here, we highlight the dynamic nature of the assembly of this complex and discuss the molecular regulation of its localization. Remarkably, a number of LGN-independent mechanisms were described recently, whereas NuMA remains central in most pathways involved in recruiting force generators at the cell cortex. We also describe the emerging role of the actin cortex in spindle orientation and discuss how dynamic astral microtubule formation is involved. We further give an overview on instructive external signals that control spindle orientation in tissues. Finally, we discuss the influence of cell geometry and mechanical forces on spindle orientation. PMID:27432284

  20. Aurora A kinase regulates proper spindle positioning in C. elegans and in human cells.

    PubMed

    Kotak, Sachin; Afshar, Katayon; Busso, Coralie; Gönczy, Pierre

    2016-08-01

    Accurate spindle positioning is essential for error-free cell division. The one-cell Caenorhabditis elegans embryo has proven instrumental for dissecting mechanisms governing spindle positioning. Despite important progress, how the cortical forces that act on astral microtubules to properly position the spindle are modulated is incompletely understood. Here, we report that the PP6 phosphatase PPH-6 and its associated subunit SAPS-1, which positively regulate pulling forces acting on spindle poles, associate with the Aurora A kinase AIR-1 in C. elegans embryos. We show that acute inactivation of AIR-1 during mitosis results in excess pulling forces on astral microtubules. Furthermore, we uncover that AIR-1 acts downstream of PPH-6-SAPS-1 in modulating spindle positioning, and that PPH-6-SAPS-1 negatively regulates AIR-1 localization at the cell cortex. Moreover, we show that Aurora A and the PP6 phosphatase subunit PPP6C are also necessary for spindle positioning in human cells. There, Aurora A is needed for the cortical localization of NuMA and dynein during mitosis. Overall, our work demonstrates that Aurora A kinases and PP6 phosphatases have an ancient function in modulating spindle positioning, thus contributing to faithful cell division. PMID:27335426

  1. CENP-32 is required to maintain centrosomal dominance in bipolar spindle assembly.

    PubMed

    Ohta, Shinya; Wood, Laura; Toramoto, Iyo; Yagyu, Ken-Ichi; Fukagawa, Tatsuo; Earnshaw, William C

    2015-04-01

    Centrosomes nucleate spindle formation, direct spindle pole positioning, and are important for proper chromosome segregation during mitosis in most animal cells. We previously reported that centromere protein 32 (CENP-32) is required for centrosome association with spindle poles during metaphase. In this study, we show that CENP-32 depletion seems to release centrosomes from bipolar spindles whose assembly they had previously initiated. Remarkably, the resulting anastral spindles function normally, aligning the chromosomes to a metaphase plate and entering anaphase without detectable interference from the free centrosomes, which appear to behave as free asters in these cells. The free asters, which contain reduced but significant levels of CDK5RAP2, show weak interactions with spindle microtubules but do not seem to make productive attachments to kinetochores. Thus CENP-32 appears to be required for centrosomes to integrate into a fully functional spindle that not only nucleates astral microtubules, but also is able to nucleate and bind to kinetochore and central spindle microtubules. Additional data suggest that NuMA tethers microtubules at the anastral spindle poles and that augmin is required for centrosome detachment after CENP-32 depletion, possibly due to an imbalance of forces within the spindle. PMID:25657325

  2. A unique set of centrosome proteins requires pericentrin for spindle-pole localization and spindle orientation.

    PubMed

    Chen, Chun-Ting; Hehnly, Heidi; Yu, Qing; Farkas, Debby; Zheng, Guoqiang; Redick, Sambra D; Hung, Hui-Fang; Samtani, Rajeev; Jurczyk, Agata; Akbarian, Schahram; Wise, Carol; Jackson, Andrew; Bober, Michael; Guo, Yin; Lo, Cecilia; Doxsey, Stephen

    2014-10-01

    Majewski osteodysplastic primordial dwarfism type II (MOPDII) is caused by mutations in the centrosome gene pericentrin (PCNT) that lead to severe pre- and postnatal growth retardation. As in MOPDII patients, disruption of pericentrin (Pcnt) in mice caused a number of abnormalities including microcephaly, aberrant hemodynamics analyzed by in utero echocardiography, and cardiovascular anomalies; the latter being associated with mortality, as in the human condition. To identify the mechanisms underlying these defects, we tested for changes in cell and molecular function. All Pcnt(-/-) mouse tissues and cells examined showed spindle misorientation. This mouse phenotype was associated with misdirected ventricular septal growth in the heart, decreased proliferative symmetric divisions in brain neural progenitors, and increased misoriented divisions in fibroblasts; the same phenotype was seen in fibroblasts from three MOPDII individuals. Misoriented spindles were associated with disrupted astral microtubules and near complete loss of a unique set of centrosome proteins from spindle poles (ninein, Cep215, centriolin). All these proteins appear to be crucial for microtubule anchoring and all interacted with Pcnt, suggesting that Pcnt serves as a molecular scaffold for this functionally linked set of spindle pole proteins. Importantly, Pcnt disruption had no detectable effect on localization of proteins involved in the cortical polarity pathway (NuMA, p150(glued), aPKC). Not only do these data reveal a spindle-pole-localized complex for spindle orientation, but they identify key spindle symmetry proteins involved in the pathogenesis of MOPDII. PMID:25220058

  3. Anillin interacts with microtubules and is part of the astral pathway that defines cortical domains.

    PubMed

    van Oostende Triplet, Chloe; Jaramillo Garcia, Melina; Haji Bik, Husni; Beaudet, Daniel; Piekny, Alisa

    2014-09-01

    Cytokinesis occurs by the ingression of an actomyosin ring that separates the cell into two daughter cells. The mitotic spindle, comprising astral and central spindle microtubules, couples contractile ring ingression with DNA segregation. Cues from the central spindle activate RhoA, the upstream regulator of the contractile ring. However, additional cues from the astral microtubules also reinforce the localization of active RhoA. Using human cells, we show that astral and central spindle microtubules independently control the localization of contractile proteins during cytokinesis. Astral microtubules restrict the accumulation and localization of contractile proteins during mitosis, whereas the central spindle forms a discrete ring by directing RhoA activation in the equatorial plane. Anillin stabilizes the contractile ring during cytokinesis. We show that human anillin interacts with astral microtubules and that this interaction is competed by the cortical recruitment of anillin by active RhoA. Anillin restricts the localization of myosin to the equatorial cortex and that of NuMA (part of the microtubule-tethering complex that regulates spindle position) to the polar cortex. The sequestration of anillin by astral microtubules might alter the organization of cortical proteins to polarize cells for cytokinesis. PMID:24994938

  4. Integrating Cache Performance Modeling and Tuning Support in Parallelization Tools

    NASA Technical Reports Server (NTRS)

    Waheed, Abdul; Yan, Jerry; Saini, Subhash (Technical Monitor)

    1998-01-01

    With the resurgence of distributed shared memory (DSM) systems based on cache-coherent Non Uniform Memory Access (ccNUMA) architectures and increasing disparity between memory and processors speeds, data locality overheads are becoming the greatest bottlenecks in the way of realizing potential high performance of these systems. While parallelization tools and compilers facilitate the users in porting their sequential applications to a DSM system, a lot of time and effort is needed to tune the memory performance of these applications to achieve reasonable speedup. In this paper, we show that integrating cache performance modeling and tuning support within a parallelization environment can alleviate this problem. The Cache Performance Modeling and Prediction Tool (CPMP), employs trace-driven simulation techniques without the overhead of generating and managing detailed address traces. CPMP predicts the cache performance impact of source code level "what-if" modifications in a program to assist a user in the tuning process. CPMP is built on top of a customized version of the Computer Aided Parallelization Tools (CAPTools) environment. Finally, we demonstrate how CPMP can be applied to tune a real Computational Fluid Dynamics (CFD) application.

  5. Performance Modeling and Measurement of Parallelized Code for Distributed Shared Memory Multiprocessors

    NASA Technical Reports Server (NTRS)

    Waheed, Abdul; Yan, Jerry

    1998-01-01

    This paper presents a model to evaluate the performance and overhead of parallelizing sequential code using compiler directives for multiprocessing on distributed shared memory (DSM) systems. With increasing popularity of shared address space architectures, it is essential to understand their performance impact on programs that benefit from shared memory multiprocessing. We present a simple model to characterize the performance of programs that are parallelized using compiler directives for shared memory multiprocessing. We parallelized the sequential implementation of NAS benchmarks using native Fortran77 compiler directives for an Origin2000, which is a DSM system based on a cache-coherent Non Uniform Memory Access (ccNUMA) architecture. We report measurement based performance of these parallelized benchmarks from four perspectives: efficacy of parallelization process; scalability; parallelization overhead; and comparison with hand-parallelized and -optimized version of the same benchmarks. Our results indicate that sequential programs can conveniently be parallelized for DSM systems using compiler directives but realizing performance gains as predicted by the performance model depends primarily on minimizing architecture-specific data locality overhead.

  6. Identification and characterization of INMAP, a novel interphase nucleus and mitotic apparatus protein that is involved in spindle formation and cell cycle progression

    SciTech Connect

    Shen, Enzhi; Lei, Yan; Liu, Qian; Zheng, Yanbo; Song, Chunqing; Marc, Jan; Wang, Yongchao; Sun, Le; Liang, Qianjin

    2009-04-15

    A novel protein that associates with interphase nucleus and mitotic apparatus (INMAP) was identified by screening HeLa cDNA expression library with an autoimmune serum followed by tandem mass spectrometry. Its complete cDNA sequence of 1.818 kb encodes 343 amino acids with predicted molecular mass of 38.2 kDa and numerous phosphorylation sites. The sequence is identical with nucleotides 1-1800 bp of an unnamed gene (GenBank accession no. (7022388)) and highly homologous with the 3'-terminal sequence of POLR3B. A monoclonal antibody against INMAP reacted with similar proteins in S. cerevisiae, Mel and HeLa cells, suggesting that it is a conserved protein. Confocal microscopy using either GFP-INMAP fusion protein or labeling with the monoclonal antibody revealed that the protein localizes as distinct dots in the interphase nucleus, but during mitosis associates closely with the spindle. Double immunolabeling using specific antibodies showed that the INMAP co-localizes with {alpha}-tubulin, {gamma}-tubulin, and NuMA. INMAP also co-immunoprecipitated with these proteins in their native state. Stable overexpression of INMAP in HeLa cell lines leads to defects in the spindle, mitotic arrest, formation of polycentrosomal and multinuclear cells, inhibition of growth, and apoptosis. We propose that INMAP is a novel protein that plays essential role in spindle formation and cell-cycle progression.

  7. Toward Millions of File System IOPS on Low-Cost, Commodity Hardware.

    PubMed

    Zheng, Da; Burns, Randal; Szalay, Alexander S

    2013-01-01

    We describe a storage system that removes I/O bottlenecks to achieve more than one million IOPS based on a user-space file abstraction for arrays of commodity SSDs. The file abstraction refactors I/O scheduling and placement for extreme parallelism and non-uniform memory and I/O. The system includes a set-associative, parallel page cache in the user space. We redesign page caching to eliminate CPU overhead and lock-contention in non-uniform memory architecture machines. We evaluate our design on a 32 core NUMA machine with four, eight-core processors. Experiments show that our design delivers 1.23 million 512-byte read IOPS. The page cache realizes the scalable IOPS of Linux asynchronous I/O (AIO) and increases user-perceived I/O performance linearly with cache hit rates. The parallel, set-associative cache matches the cache hit rates of the global Linux page cache under real workloads. PMID:24402052

  8. Efficient construction of unified continuous and discontinuous Galerkin formulations for the 3D Euler equations

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Abdi, Daniel S.; Giraldo, Francis X.

    2016-09-01

    A unified approach for the numerical solution of the 3D hyperbolic Euler equations using high order methods, namely continuous Galerkin (CG) and discontinuous Galerkin (DG) methods, is presented. First, we examine how classical CG that uses a global storage scheme can be constructed within the DG framework using constraint imposition techniques commonly used in the finite element literature. Then, we implement and test a simplified version in the Non-hydrostatic Unified Model of the Atmosphere (NUMA) for the case of explicit time integration and a diagonal mass matrix. Constructing CG within the DG framework allows CG to benefit from the desirable properties of DG such as, easier hp-refinement, better stability etc. Moreover, this representation allows for regional mixing of CG and DG depending on the flow regime in an area. The different flavors of CG and DG in the unified implementation are then tested for accuracy and performance using a suite of benchmark problems representative of cloud-resolving scale, meso-scale and global-scale atmospheric dynamics. The value of our unified approach is that we are able to show how to carry both CG and DG methods within the same code and also offer a simple recipe for modifying an existing CG code to DG and vice versa.

  9. The role of meiotic cohesin REC8 in chromosome segregation in {gamma} irradiation-induced endopolyploid tumour cells

    SciTech Connect

    Erenpreisa, Jekaterina; Cragg, Mark S.; Salmina, Kristine; Hausmann, Michael; Scherthan, Harry

    2009-09-10

    Escape from mitotic catastrophe and generation of endopolyploid tumour cells (ETCs) represents a potential survival strategy of tumour cells in response to genotoxic treatments. ETCs that resume the mitotic cell cycle have reduced ploidy and are often resistant to these treatments. In search for a mechanism for genome reduction, we previously observed that ETCs express meiotic proteins among which REC8 (a meiotic cohesin component) is of particular interest, since it favours reductional cell division in meiosis. In the present investigation, we induced endopolyploidy in p53-dysfunctional human tumour cell lines (Namalwa, WI-L2-NS, HeLa) by gamma irradiation, and analysed the sub-cellular localisation of REC8 in the resulting ETCs. We observed by RT-PCR and Western blot that REC8 is constitutively expressed in these tumour cells, along with SGOL1 and SGOL2, and that REC8 becomes modified after irradiation. REC8 localised to paired sister centromeres in ETCs, the former co-segregating to opposite poles. Furthermore, REC8 localised to the centrosome of interphase ETCs and to the astral poles in anaphase cells where it colocalised with the microtubule-associated protein NuMA. Altogether, our observations indicate that radiation-induced ETCs express features of meiotic cell divisions and that these may facilitate chromosome segregation and genome reduction.

  10. MLP: A Parallel Programming Alternative to MPI for New Shared Memory Parallel Systems

    NASA Technical Reports Server (NTRS)

    Taft, James R.

    1999-01-01

    Recent developments at the NASA AMES Research Center's NAS Division have demonstrated that the new generation of NUMA based Symmetric Multi-Processing systems (SMPs), such as the Silicon Graphics Origin 2000, can successfully execute legacy vector oriented CFD production codes at sustained rates far exceeding processing rates possible on dedicated 16 CPU Cray C90 systems. This high level of performance is achieved via shared memory based Multi-Level Parallelism (MLP). This programming approach, developed at NAS and outlined below, is distinct from the message passing paradigm of MPI. It offers parallelism at both the fine and coarse grained level, with communication latencies that are approximately 50-100 times lower than typical MPI implementations on the same platform. Such latency reductions offer the promise of performance scaling to very large CPU counts. The method draws on, but is also distinct from, the newly defined OpenMP specification, which uses compiler directives to support a limited subset of multi-level parallel operations. The NAS MLP method is general, and applicable to a large class of NASA CFD codes.

  11. Nuclear substructure reorganization during late stageerythropoiesis is selective and does not involve caspase cleavage ofmajor nuclear substructural proteins

    SciTech Connect

    Krauss, Sharon Wald; Lo, Annie J.; Short, Sarah A.; Koury, MarkJ.; Mohandas, Narla; Chasis, Joel Anne

    2005-04-06

    Enucleation, a rare feature of mammalian differentiation, occurs in three cell types: erythroblasts, lens epithelium and keratinocytes. Previous investigations suggest that caspase activation functions in lens epithelial and keratinocyte enucleation, as well as in early erythropoiesis encompassing BFU-E differentiation to proerythroblast. To determine whether caspase activation contributes to later erythropoiesis and whether nuclear substructures other than chromatin reorganize, we analyzed distributions of nuclear subcompartment proteins and assayed for caspase-induced cleavage of subcompartmental target proteins in mouse erythroblasts. We found that patterns of lamin B in the filamentous network interacting with both the nuclear envelope and DNA, nuclear matrix protein NuMA, and splicing factors Sm and SC35 persisted during nuclear condensation, consistent with effective transcription of genes expressed late in differentiation. Thus nuclear reorganization prior to enucleation is selective, allowing maintenance of critical transcriptional processes independent of extensive chromosomal reorganization. Consistent with these data, we found no evidence for caspase-induced cleavage of major nuclear subcompartment proteins during late erythropoiesis, in contrast to what has been observed in early erythropoiesis and in lens epithelial and keratinocyte differentiation. These findings imply that nuclear condensation and extrusion during terminal erythroid differentiation involve novel mechanisms that do not entail major activation of apoptotic machinery.

  12. Rab5 GTPase controls chromosome alignment through Lamin disassembly and relocation of the NuMA-like protein Mud to the poles during mitosis

    PubMed Central

    Capalbo, Luisa; D'Avino, Pier Paolo; Archambault, Vincent; Glover, David M.

    2011-01-01

    The small GTPase Rab5 is a conserved regulator of membrane trafficking; it regulates the formation of early endosomes, their transport along microtubules, and the fusion to the target organelles. Although several members of the endocytic pathway were recently implicated in spindle organization, it is unclear whether Rab5 has any role during mitosis. Here, we describe that Rab5 is required for proper chromosome alignment during Drosophila mitoses. We also found that Rab5 associated in vivo with nuclear Lamin and mushroom body defect (Mud), the Drosophila counterpart of nuclear mitotic apparatus protein (NuMA). Consistent with this finding, Rab5 was required for the disassembly of the nuclear envelope at mitotic entry and the accumulation of Mud at the spindle poles. Furthermore, Mud depletion caused chromosome misalignment defects that resembled the defects of Rab5 RNAi cells, and double-knockdown experiments indicated that the two proteins function in a linear pathway. Our results indicate a role for Rab5 in mitosis and reinforce the emerging view of the contributions made by cell membrane dynamics to spindle function. PMID:21987826

  13. Toward Millions of File System IOPS on Low-Cost, Commodity Hardware.

    PubMed

    Zheng, Da; Burns, Randal; Szalay, Alexander S

    2013-01-01

    We describe a storage system that removes I/O bottlenecks to achieve more than one million IOPS based on a user-space file abstraction for arrays of commodity SSDs. The file abstraction refactors I/O scheduling and placement for extreme parallelism and non-uniform memory and I/O. The system includes a set-associative, parallel page cache in the user space. We redesign page caching to eliminate CPU overhead and lock-contention in non-uniform memory architecture machines. We evaluate our design on a 32 core NUMA machine with four, eight-core processors. Experiments show that our design delivers 1.23 million 512-byte read IOPS. The page cache realizes the scalable IOPS of Linux asynchronous I/O (AIO) and increases user-perceived I/O performance linearly with cache hit rates. The parallel, set-associative cache matches the cache hit rates of the global Linux page cache under real workloads.

  14. [Assessment of Hepatitis C Virus Diversity in Addition to the Frequency of Genotypes in Samples Analyzed Between 2009 and 2014 at the Reference Laboratory of National Health Institute Dr. Ricardo Jorge].

    PubMed

    Pádua, Elizabeth; Avó, Ana Patricia; Almeida, Catarina; Água Doce, Ivone; Cortes Martins, Helena

    2015-01-01

    Introdução: A identificação dos genótipos do vírus da hepatite C foi essencial para o prognóstico e tratamento dos doentes crónicos durante os últimos anos. Foram objetivos deste estudo conhecer a frequência de genótipos do vírus da hepatite C nos últimos seis anos, e revelar o contributo de um ensaio in-house para caracterização molecular do vírus. Material e Métodos: A genotipagem do vírus da hepatite C por LiPA foi realizada em 923 amostras, maioritariamente provenientes de indivíduos do sexo masculino. A subtipagem do vírus da hepatite C pelo ensaio in-house com alvo nas regiões Core/E1 e/ou NS5B foi efetuada em 112 amostras. Resultados: Observámos elevada prevalência do genótipo 1 (56,6%), sendo a frequência do subtipo 1a quatro vezes superior ao subtipo 1b. Todos os casos de genótipo 3 (27,5%) foram classificados em subtipo 3a. Nas infeções pelo genótipo 4 (12,9%), identificaram-se os subtipos 4a (65,5%), 4d (31%), 4b (1,7%) e 4c (1,7%). Foram identificadas a RF1_2k/1b, recombinantes intragenótipo 2 e potenciais infeções mistas na população analisada. Discussão: Os subtipos mais prevalentes, 1a e 3a, estão descritos como comuns em utilizadores de drogas injetáveis. Apesar da maioria das amostras analisadas corresponder a reclusos (78,4%), não podemos excluir eventuais comportamentos de risco associados ao consumo de drogas ilícitas. Conclusões: A prevalência elevada do subtipo 1a, a frequência e diversidade do genótipo 4 e a identificação de vírus geneticamente recombinados, sugerem alteração do padrão molecular vírus da hepatite C descrito no passado. O ensaio in-house implementado revelou ser útil para a correta classificação do vírus da hepatite C e melhoria do conhecimento sobre a diversidade do vírus em circulação no país.

  15. [Adaptation and psychometric proprieties study for the Portuguese version of the Adolescent Coping Scale - Escala de Coping para Adolescentes].

    PubMed

    Guerreiro, Diogo Frasquilho; Cruz, Diana; Figueira, Maria Luísa; Sampaio, Daniel

    2014-01-01

    Introdução: O coping é um processo psicológico que leva ao ajustamento individual perante situações de stress. A Adolescent Coping Scale é um instrumento de investigação e uma ferramenta clínica, amplamente utilizada. O presente estudo tem como objectivos desenvolver uma versão Portuguesa da Adolescent Coping Scale e analisar as estratégias e estilos de coping dos jovens da nossa amostra.Material e Métodos: Um questionário anónimo compreendendo a Adolescent Coping Scale obteve respostas de 1 713 alunos (56% do sexo feminino, com idades compreendidas entre os 12 e os 20 anos e uma média etária de 16). O estudo de validade da escala contemplou: análise em componentes principais e avaliação da consistência interna; análise confirmatória através de modelo de equações estruturais. Posteriormente, foram comparadas por género as estratégias e estilos de coping da amostra (testes t para amostras independentes).Resultados: A estrutura final da adaptação da Adolescent Coping Scale reteve 70 itens, que avaliam 16 estratégias de coping agrupadas em três estilos distintos. As escalas apresentaram bons valores de consistência interna (alfas de Cronbach compreendidos entre 0,63 e 0,86, com a exceção de uma dimensão que apresentou um valor de 0,55) e o modelo confirmatório demonstrou bom fit (goodness of fit index compreendidos entre 0,94 e 0,96). Foram eliminadas duas estratégias de coping por motivos estatísticos (ausência de saturação de itens suficientes nas dimensões correspondentes). Verificámos que o estilo de coping focado na resolução do problema é aquele maioritariamente utilizado pelos adolescentes da nossa amostra, em ambos os sexos. No sexo feminino observaram-se valores médios mais elevados nos estilos de coping não produtivo e de referência a outros.Discussão: A versão adaptada apresenta elevada semelhança com a escala original, com alterações minor espectáveis tendo em conta que o coping é influenciado por

  16. A emissão em 8mm e as bandas de Merrill-Sanford em estrelas carbonadas

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    de Mello, A. B.; Lorenz-Martins, S.

    2003-08-01

    Estrelas carbonadas possuem bandas moleculares em absorção no visível e, no infravermelho (IR) as principais características espectrais se devem a emissão de grãos. Recentemente foi detectada a presença de bandas de SiC2 (Merrill-Sanford, MS) em emissão sendo atribuída à presença de um disco rico em poeira. Neste trabalho analisamos uma amostra de 14 estrelas carbonadas, observadas no telescópio de 1.52 m do ESO em 4 regiões espectrais diferentes, a fim de detectar as bandas de MS em emissão. Nossa amostra é composta de estrelas que apresentam além da emissão em 11.3 mm, outra em 8 mm. Esta última emissão, não usual nestes objetos, tem sido atribuída ou a moléculas de C2H2, ou a um composto sólido ainda indefinido. A detecção de emissões de MS e aquelas no IR, simultaneamente, revelaria um cenário mais complexo que o habitualmente esperado para os ventos destes objetos. No entanto como primeiro resultado, verificamos que as bandas de Merrill-Sanford encontram-se em absorção, não revelando nenhuma conexão com a emissão a 8 mm. Assim, temos duas hipóteses: (a) a emissão a 8 mm se deve à molécula C2H2 ou (b) essa emissão é resultado da emissão térmica de grãos. Testamos a segunda hipótese modelando a amostra com grãos não-homogêneos de SiC e quartzo, o qual emite em aproximadamente 8mm. Este grão seria produzido em uma fase evolutiva anterior a das carbonadas (estrelas S) e por terem uma estrutura cristalina são destruídos apenas na presença de campos de radiação ultravioleta muito intensos. Os modelos para os envoltórios utilizam o método de Monte Carlo para descrever o problema do transporte da radiação. As conclusões deste trabalho são: (1) as bandas de Merrill-Sanford se encontram em absorção, sugerindo um cenário usual para os ventos das estrelas da amostra; (2) neste cenário, a emissão em 8 mm seria resultado de grãos de quartzo com mantos de SiC, indicando que o quartzo poderia sobreviver a fase

  17. Educational Inequality by Race in Brazil, 1982–2007: Structural Changes and Shifts in Racial Classification

    PubMed Central

    Marteleto, Leticia J.

    2013-01-01

    Despite overwhelming improvements in educational levels and opportunity during the past three decades, educational disadvantages associated with race still persist in Brazil. Using the nationally representative Pesquisa Nacional de Amostra por Domicílio (PNAD) data from 1982 and 1987 to 2007, this study investigates educational inequalities between white, pardo (mixed-race), and black Brazilians over the 25-year period. Although the educational advantage of whites persisted during this period, I find that the significance of race as it relates to education changed. By 2007, those identified as blacks and pardos became more similar in their schooling levels, whereas in the past, blacks had greater disadvantages. I test two possible explanations for this shift: structural changes and shifts in racial classification. I find evidence for both. I discuss the findings in light of the recent race-based affirmative action policies being implemented in Brazilian universities. PMID:22259031

  18. Educational inequality by race in Brazil, 1982-2007: structural changes and shifts in racial classification.

    PubMed

    Marteleto, Leticia J

    2012-02-01

    Despite overwhelming improvements in educational levels and opportunity during the past three decades, educational disadvantages associated with race still persist in Brazil. Using the nationally representative Pesquisa Nacional de Amostra por Domicílio (PNAD) data from 1982 and 1987 to 2007, this study investigates educational inequalities between white, pardo (mixed-race), and black Brazilians over the 25-year period. Although the educational advantage of whites persisted during this period, I find that the significance of race as it relates to education changed. By 2007, those identified as blacks and pardos became more similar in their schooling levels, whereas in the past, blacks had greater disadvantages. I test two possible explanations for this shift: structural changes and shifts in racial classification. I find evidence for both. I discuss the findings in light of the recent race-based affirmative action policies being implemented in Brazilian universities. PMID:22259031

  19. What Multilevel Parallel Programs do when you are not Watching: A Performance Analysis Case Study Comparing MPI/OpenMP, MLP, and Nested OpenMP

    NASA Technical Reports Server (NTRS)

    Jost, Gabriele; Labarta, Jesus; Gimenez, Judit

    2004-01-01

    With the current trend in parallel computer architectures towards clusters of shared memory symmetric multi-processors, parallel programming techniques have evolved that support parallelism beyond a single level. When comparing the performance of applications based on different programming paradigms, it is important to differentiate between the influence of the programming model itself and other factors, such as implementation specific behavior of the operating system (OS) or architectural issues. Rewriting-a large scientific application in order to employ a new programming paradigms is usually a time consuming and error prone task. Before embarking on such an endeavor it is important to determine that there is really a gain that would not be possible with the current implementation. A detailed performance analysis is crucial to clarify these issues. The multilevel programming paradigms considered in this study are hybrid MPI/OpenMP, MLP, and nested OpenMP. The hybrid MPI/OpenMP approach is based on using MPI [7] for the coarse grained parallelization and OpenMP [9] for fine grained loop level parallelism. The MPI programming paradigm assumes a private address space for each process. Data is transferred by explicitly exchanging messages via calls to the MPI library. This model was originally designed for distributed memory architectures but is also suitable for shared memory systems. The second paradigm under consideration is MLP which was developed by Taft. The approach is similar to MPi/OpenMP, using a mix of coarse grain process level parallelization and loop level OpenMP parallelization. As it is the case with MPI, a private address space is assumed for each process. The MLP approach was developed for ccNUMA architectures and explicitly takes advantage of the availability of shared memory. A shared memory arena which is accessible by all processes is required. Communication is done by reading from and writing to the shared memory.

  20. Structural protein 4.1R is integrally involved in nuclear envelope protein localization, centrosome–nucleus association and transcriptional signaling

    PubMed Central

    Meyer, Adam J.; Almendrala, Donna K.; Go, Minjoung M.; Krauss, Sharon Wald

    2011-01-01

    The multifunctional structural protein 4.1R is required for assembly and maintenance of functional nuclei but its nuclear roles are unidentified. 4.1R localizes within nuclei, at the nuclear envelope, and in cytoplasm. Here we show that 4.1R, the nuclear envelope protein emerin and the intermediate filament protein lamin A/C co-immunoprecipitate, and that 4.1R-specific depletion in human cells by RNA interference produces nuclear dysmorphology and selective mislocalization of proteins from several nuclear subcompartments. Such 4.1R-deficiency causes emerin to partially redistribute into the cytoplasm, whereas lamin A/C is disorganized at nuclear rims and displaced from nucleoplasmic foci. The nuclear envelope protein MAN1, nuclear pore proteins Tpr and Nup62, and nucleoplasmic proteins NuMA and LAP2α also have aberrant distributions, but lamin B and LAP2β have normal localizations. 4.1R-deficient mouse embryonic fibroblasts show a similar phenotype. We determined the functional effects of 4.1R-deficiency that reflect disruption of the association of 4.1R with emerin and A-type lamin: increased nucleus–centrosome distances, increased β-catenin signaling, and relocalization of β-catenin from the plasma membrane to the nucleus. Furthermore, emerin- and lamin-A/C-null cells have decreased nuclear 4.1R. Our data provide evidence that 4.1R has important functional interactions with emerin and A-type lamin that impact upon nuclear architecture, centrosome–nuclear envelope association and the regulation of β-catenin transcriptional co-activator activity that is dependent on β-catenin nuclear export. PMID:21486941

  1. Astronomy at School: Measurements of the Earth-Moon Distance. (Spanish Title: Astronomía en la Escuela: Medición de la Distancia Tierra-Luna.) Astronomia na Escola: Medida da Distância Terra-Lua

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Paolantonio, Santiago; Pintado, Olga I.

    2006-12-01

    The aim of this project is to approach High School students to Science. We propose to measure the Earth-Moon distance using the parallax. The observation and measurements techniques and all the calculations needed are described in this paper. The results obtained in a test experience realized during 2003 are presented. This test shows that this is a feasible project and also shows which things needed to be improved. Se plantea la propuesta de un proyecto educativo dirigido al Nivel Medio de enseñanza, consistente en la determinación de la distancia Tierra - Luna por paralaje. Se describen las técnicas de observación, mediciones y cálculos. Se proporcionan a continuación los resultados obtenidos en la experiencia piloto realizada en el 2003, la que permitió comprobar la factibilidad de llevar a cabo la propuesta, así como perfeccionar los diferentes aspectos involucrados en la misma. Propomos neste trabalho um projeto educativo dirigido ao Ensino Médio que consiste na determinação da distância Terra-Lua pelo efeito da paralaxe. As técnicas de observação, medidas e cálculos auxiliares são descritos, e os resultados obtidos numa experiência-teste realizada no ano de 2003 apresentados. Este último teste permitiu comprovar a viabilidade de execução da proposta e aperfeiçoar diversos aspectos da mesma.

  2. Structural basis for the recognition of the scaffold protein Frmpd4/Preso1 by the TPR domain of the adaptor protein LGN.

    PubMed

    Takayanagi, Hiroki; Yuzawa, Satoru; Sumimoto, Hideki

    2015-02-01

    The adaptor protein LGN interacts via the N-terminal domain comprising eight tetratricopeptide-repeat (TPR) motifs with its partner proteins mInsc, NuMA, Frmpd1 and Frmpd4 in a mutually exclusive manner. Here, the crystal structure of the LGN TPR domain in complex with human Frmpd4 is described at 1.5 Å resolution. In the complex, the LGN-binding region of Frmpd4 (amino-acid residues 990-1011) adopts an extended structure that runs antiparallel to LGN along the concave surface of the superhelix formed by the TPR motifs. Comparison with the previously determined structures of the LGN-Frmpd1, LGN-mInsc and LGN-NuMA complexes reveals that these partner proteins interact with LGN TPR1-6 via a common core binding region with consensus sequence (E/Q)XEX4-5(E/D/Q)X1-2(K/R)X0-1(V/I). In contrast to Frmpd1, Frmpd4 makes additional contacts with LGN via regions N- and C-terminal to the core sequence. The N-terminal extension is replaced by a specific α-helix in mInsc, which drastically increases the direct contacts with LGN TPR7/8, consistent with the higher affinity of mInsc for LGN. A crystal structure of Frmpd4-bound LGN in an oxidized form is also reported, although oxidation does not appear to strongly affect the interaction with Frmpd4.

  3. Effect of phosphorus fluctuation caused by river water dilution in eutrophic lake on competition between blue-green alga Microcystis aeruginosa and diatom Cyclotella sp.

    PubMed

    Amano, Yoshimasa; Sakai, Yusuke; Sekiya, Takumi; Takeya, Kimitaka; Taki, Kazuo; Machida, Motoi

    2010-01-01

    Tega-numa (Lake Tega) is one of the eutrophic lakes in Japan. For the improvement of water quality in Lake Tega, the North-chiba Water Conveyance Channel was constructed in 2000, which transfer water from Tone River into the lake. After 2000, the dominant species of diatoms, mainly Cyclotella sp., have been replacing blue-green algae, mainly Microcystis aeruginosa in Lake Tega. This transition of dominant species would be due to the dilution, but the detail mechanism has not been understood yet. This study examined the relationship between phosphorus fluctuation caused by river water dilution to Lake Tega and dominance of algal species, M. aeruginosa or Cyclotella sp. based on the single-species and the mixed-species culture experiments. The single-species culture experiment showed that the half-saturation constant and uptake rate of phosphorus were one order lower and seven times higher for M. aeruginosa than those for Cyclotella sp. These findings implied that M. aeruginosa would possess a potential for the growth and survival over Cyclotella sp. in the phosphorus limited condition. The superiority of M. aeruginosa was reflected in the outcome of the mixed-species culture experiment, i.e., dominance of M. aeruginosa, even phosphorus concentration was lowered to 0.01 mg-P/L. Therefore, it could be concluded that the decrease in phosphorus concentration due to the river water dilution to Lake Tega would be interpreted as a minor factor for the transition of dominant species from M. aeruginosa to Cyclotella sp. PMID:21235152

  4. F-actin asymmetry and the endoplasmic reticulum-associated TCC-1 protein contribute to stereotypic spindle movements in the Caenorhabditis elegans embryo.

    PubMed

    Berends, Christian W H; Muñoz, Javier; Portegijs, Vincent; Schmidt, Ruben; Grigoriev, Ilya; Boxem, Mike; Akhmanova, Anna; Heck, Albert J R; van den Heuvel, Sander

    2013-07-01

    The microtubule spindle apparatus dictates the plane of cell cleavage in animal cells. During development, dividing cells control the position of the spindle to determine the size, location, and fate of daughter cells. Spindle positioning depends on pulling forces that act between the cell periphery and astral microtubules. This involves dynein recruitment to the cell cortex by a heterotrimeric G-protein α subunit in complex with a TPR-GoLoco motif protein (GPR-1/2, Pins, LGN) and coiled-coil protein (LIN-5, Mud, NuMA). In this study, we searched for additional factors that contribute to spindle positioning in the one-cell Caenorhabditis elegans embryo. We show that cortical actin is not needed for Gα-GPR-LIN-5 localization and pulling force generation. Instead, actin accumulation in the anterior actually reduces pulling forces, possibly by increasing cortical rigidity. Examining membrane-associated proteins that copurified with GOA-1 Gα, we found that the transmembrane and coiled-coil domain protein 1 (TCC-1) contributes to proper spindle movements. TCC-1 localizes to the endoplasmic reticulum membrane and interacts with UNC-116 kinesin-1 heavy chain in yeast two-hybrid assays. RNA interference of tcc-1 and unc-116 causes similar defects in meiotic spindle positioning, supporting the concept of TCC-1 acting with kinesin-1 in vivo. These results emphasize the contribution of membrane-associated and cortical proteins other than Gα-GPR-LIN-5 in balancing the pulling forces that position the spindle during asymmetric cell division.

  5. p21-activated kinase 4 regulates mitotic spindle positioning and orientation.

    PubMed

    Bompard, Guillaume; Morin, Nathalie

    2012-01-01

    During mitosis, microtubules (MTs) are massively rearranged into three sets of highly dynamic MTs that are nucleated from the centrosomes to form the mitotic spindle. Tight regulation of spindle positioning in the dividing cell and chromosome alignment at the center of the metaphase spindle are required to ensure perfect chromosome segregation and to position the cytokinetic furrow that will specify the two daughter cells. Spindle positioning requires regulation of MT dynamics, involving depolymerase activities together with cortical and kinetochore-mediated pushing and pulling forces acting on astral MTs and kinetochore fibres. These forces rely on MT motor activities. Cortical pulling forces exerted on astral MTs depend upon dynein/dynactin complexes and are essential in both symmetric and asymmetric cell division. A well-established spindle positioning pathway regulating the cortical targeting of dynein/dynactin involves the conserved LGN (Leu-Gly-Asn repeat-enriched-protein) and NuMA (microtubule binding nuclear mitotic apparatus protein) complex. Spindle orientation is also regulated by integrin-mediated cell adhesion and actin retraction fibres that respond to mechanical stress and are influenced by the microenvironment of the dividing cell. Altering the capture of astral MTs or modulating pulling forces affects spindle position, which can impair cell division, differentiation and embryogenesis. In this general scheme, the activity of mitotic kinases such as Auroras and Plk1 (Polo-like kinase 1) is crucial. Recently, the p21-activated kinases (PAKs) emerged as novel important players in mitotic progression. In our recent article, we demonstrated that PAK4 regulates spindle positioning in symmetric cell division. In this commentary, and in light of recent published studies, we discuss how PAK4 could participate in the regulation of mechanisms involved in spindle positioning and orientation. PMID:22960742

  6. Radiocesium biokinetics in olive flounder inhabiting the Fukushima accident-affected Pacific coastal waters of eastern Japan.

    PubMed

    Tateda, Yutaka; Tsumune, Daisuke; Tsubono, Takaki; Aono, Tatsuo; Kanda, Jota; Ishimaru, Takashi

    2015-09-01

    Radiocesium ((134)Cs and (137)Cs) originating from the Fukushima Dai-ichi Nuclear Power Plant (1FNPP) has contaminated coastal waters and been subsequently transferred to the marine biota along the Pacific coastal region of eastern Japan. To clarify the mechanism of radiocesium biokinetics in olive flounder, a commercially valuable and piscivorous predator, the biokinetics of (137)Cs was simulated using a dynamic biological compartment model and then validated with the measured concentrations in available monitoring data. The (137)Cs concentrations in seawater of the Pacific coastal sites of eastern Japan, from Kesen-numa (170 km north from the 1FNPP) to Choshi (190 km south from the 1FNPP), were reconstructed by fitting the simulated levels to the observed concentrations. Simulated values were verified by measured radiocesium levels in sedentary organism such as macro-algae and mussels inhabiting each study site which had accumulated radiocesium in their ambient environment from the beginning of the accident. Using reconstructed (137)Cs concentrations in seawater, the (137)Cs levels in olive flounder and its main planktivorous prey fish, e.g. anchovy, sand lance, whitebait, etc., were simulated and compared with observed concentrations to clarify the biokinetics of radiocesium in these organisms. This assessment showed that the determining factor for the maximum radiocesium concentrations in fish in the plankton food chain is likely to be the initial radiocesium concentration which they were exposed to during the contamination stage. Furthermore, the simulated (137)Cs concentrations in gut contents of olive flounder were verified by measured (137)Cs concentrations in the stomach contents of this fish collected within 30 km from the 1FNPP. These results indicated that the decrease of (137)Cs levels in their prey organisms was the primary determining factor of radiocesium depuration, and the resultant ecological half-lives were 140-160 d in the olive flounder

  7. Exploration of the nicotinamide-binding site of the tankyrases, identifying 3-arylisoquinolin-1-ones as potent and selective inhibitors in vitro.

    PubMed

    Paine, Helen A; Nathubhai, Amit; Woon, Esther C Y; Sunderland, Peter T; Wood, Pauline J; Mahon, Mary F; Lloyd, Matthew D; Thompson, Andrew S; Haikarainen, Teemu; Narwal, Mohit; Lehtiö, Lari; Threadgill, Michael D

    2015-09-01

    Tankyrases-1 and -2 (TNKS-1 and TNKS-2) have three cellular roles which make them important targets in cancer. Using NAD(+) as a substrate, they poly(ADP-ribosyl)ate TRF1 (regulating lengths of telomeres), NuMA (facilitating mitosis) and axin (in wnt/β-catenin signalling). Using molecular modelling and the structure of the weak inhibitor 5-aminoiso quinolin-1-one, 3-aryl-5-substituted-isoquinolin-1-ones were designed as inhibitors to explore the structure-activity relationships (SARs) for binding and to define the shape of a hydrophobic cavity in the active site. 5-Amino-3-arylisoquinolinones were synthesised by Suzuki-Miyaura coupling of arylboronic acids to 3-bromo-1-methoxy-5-nitro-isoquinoline, reduction and O-demethylation. 3-Aryl-5-methylisoquinolin-1-ones, 3-aryl-5-fluoroisoquinolin-1-ones and 3-aryl-5-methoxyisoquinolin-1-ones were accessed by deprotonation of 3-substituted-N,N,2-trimethylbenzamides and quench with an appropriate benzonitrile. SAR around the isoquinolinone core showed that aryl was required at the 3-position, optimally with a para-substituent. Small meta-substituents were tolerated but groups in the ortho-positions reduced or abolished activity. This was not due to lack of coplanarity of the rings, as shown by the potency of 4,5-dimethyl-3-phenylisoquinolin-1-one. Methyl and methoxy were optimal at the 5-position. SAR was rationalised by modelling and by crystal structures of examples with TNKS-2. The 3-aryl unit was located in a large hydrophobic cavity and the para-substituents projected into a tunnel leading to the exterior. Potency against TNKS-1 paralleled potency against TNKS-2. Most inhibitors were highly selective for TNKSs over PARP-1 and PARP-2. A range of highly potent and selective inhibitors is now available for cellular studies. PMID:26189030

  8. p21-activated kinase 4 regulates mitotic spindle positioning and orientation.

    PubMed

    Bompard, Guillaume; Morin, Nathalie

    2012-01-01

    During mitosis, microtubules (MTs) are massively rearranged into three sets of highly dynamic MTs that are nucleated from the centrosomes to form the mitotic spindle. Tight regulation of spindle positioning in the dividing cell and chromosome alignment at the center of the metaphase spindle are required to ensure perfect chromosome segregation and to position the cytokinetic furrow that will specify the two daughter cells. Spindle positioning requires regulation of MT dynamics, involving depolymerase activities together with cortical and kinetochore-mediated pushing and pulling forces acting on astral MTs and kinetochore fibres. These forces rely on MT motor activities. Cortical pulling forces exerted on astral MTs depend upon dynein/dynactin complexes and are essential in both symmetric and asymmetric cell division. A well-established spindle positioning pathway regulating the cortical targeting of dynein/dynactin involves the conserved LGN (Leu-Gly-Asn repeat-enriched-protein) and NuMA (microtubule binding nuclear mitotic apparatus protein) complex. Spindle orientation is also regulated by integrin-mediated cell adhesion and actin retraction fibres that respond to mechanical stress and are influenced by the microenvironment of the dividing cell. Altering the capture of astral MTs or modulating pulling forces affects spindle position, which can impair cell division, differentiation and embryogenesis. In this general scheme, the activity of mitotic kinases such as Auroras and Plk1 (Polo-like kinase 1) is crucial. Recently, the p21-activated kinases (PAKs) emerged as novel important players in mitotic progression. In our recent article, we demonstrated that PAK4 regulates spindle positioning in symmetric cell division. In this commentary, and in light of recent published studies, we discuss how PAK4 could participate in the regulation of mechanisms involved in spindle positioning and orientation.

  9. População nuclear e extranuclear em rádio-galáxias

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Raimann, D. I.; Storchi-Bergmann, T.; Quintana, H.; Alloin, D.; Hunstead, R.; Wisotzki, L.

    2003-08-01

    A natureza do contínuo UV/ótico em rádio-galáxias é muito importante para o seu entendimento. Em baixos redshifts existem evidências de que muitas delas são dominadas no ótico por luz de estrelas velhas, características de galáxias early-type e em altos redshifts a característica dominante é um excesso de luz no UV, freqüentemente associado com estruturas que estão alinhadas aos eixos das estruturas rádio em grande escala. Inicialmente esse excesso foi interpretado como devido a episódios intensos de formação estelar nas galáxias hospedeiras. Entretanto, as descobertas dos alinhamentos entre as estruturas UV e rádio modificaram essa idéia. Foi proposto que a formação estelar é iniciada pela passagem do jato rádio através do meio interestelar das galáxias hospedeiras. A natureza do excesso UV começou a ser compreendida em um estudo detalhado do continuo ótico da 3C321, onde se concluiu que o contínuo desta galáxia tem origem multicomponente, com contribuições de populações velhas e intermediárias, de luz espalhada oriunda de um quasar obscurecido e do contínuo nebular. No presente trabalho estudamos a população nuclear e extranuclear de uma amostra de 24 rádio-galáxias, utilizando espectros óticos de fenda longa, com alta razão sinal/ruído. Através do método de síntese espectral de populações estelares, foram estimadas as contribuições de populações estelares de diferentes idades (e de um contínuo tipo lei de potência devido a um AGN, FC) para a luz integrada das galáxias, em 4020Å. As principais conclusões deste trabalho são: apenas quatro dos objetos estudados têm contribuições significativas (maiores do que 10%) das populações de 100 milhões de anos ou mais jovens (ou de FC) ao longo da região espacial estudada (6 kpc centrais); nenhuma das rádio-galáxias de tipo FRI estudadas tem contribuição significativa destas populações ao longo desta região; duas (de oito) de tipo FRII tem contribui

  10. [Contribution for the validation of the Portuguese version of EQ-5D].

    PubMed

    Ferreira, Pedro Lopes; Ferreira, Lara Noronha; Pereira, Luis Nobre

    2013-01-01

    Introdução: O EQ-5D permite a junção de duas componentes essenciais de qualquer medida de qualidade de vida relacionada com a saúde a ser usada em avaliações económicas de custo-utilidade: (i) um perfil descrevendo o estado de saúde em termos de domínios ou dimensões; e (ii) um valor numérico associado ao estado de saúde anteriormente descrito.Objectivo: A versão portuguesa do questionário EQ-5D foi finalizada em 1998, com base em normas de orientação definidas pelo Grupo EuroQol, incluindo os procedimentos de tradução e retroversão. Apesar da sua larga utilização em Portugal, até agora ainda não tinham sido publicados os estudos que conduziram inicialmente à versão portuguesa e à garantia de aceitabilidade, fiabilidade e validade. O propósito do presente artigo é, assim, documentar estes primeiros valores referentes à versão portuguesa do EQ-5D.Material e Métodos: Foram utilizadas três amostras diferentes: uma primeira com 1.500 indivíduos representativa da populaçãoportuguesa; uma segunda com 140 indivíduos apenas destinada ao teste da fiabilidade; e uma terceira amostra com 643 indivíduos doentes com cataratas, asma, doença pulmonar obstrutiva crónica ou artrite reumatoide.Resultados: A aceitabilidade foi avaliada pelo número de respostas em falta. Foi também encontrado um marcado efeito de teto com grande parte da amostra a não reportar quaisquer problemas nas dimensões do EQ-5D.Discussão: A validade de construção foi testada pela análise do grau com que valores baixos de EQ-5D estavam positivamente associados ao aumento da idade, ao ser do sexo feminino, e ao estar doente, assim como a valores de dimensões da escala SF-36v2. A validade convergente foi baseada nas correlações entre valores do EQ-5D e outras escalas específicas de condição de saúde. O EQ-5D apresentou correlações moderadas a altas com outras medidas de estado de saúde e de qualidade de vida relacionada com a saúde, específicas de cada

  11. Abundâncias químicas de estrelas T Tauri fracas

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Rojas, G. A.; Gregorio-Hetem, J.

    2003-08-01

    Apresentamos resultados do estudo de 44 estrelas pré-seqüência principal, para as quais buscamos realizar uma classificação espectroscópica e determinar parâmetros estelares e abundâncias químicas. A amostra foi escolhida da seguinte maneira : 21 objetos selecionados a partir de catálogos de objetos jovens, como o Pico dos Dias Survey e o Herbig Bell Catalogue, e 23 objetos selecionados a partir de contrapartidas ópticas de fontes de raios X detectadas pelo satélite ROSAT. Dentre 24 objetos previamente classificados como estrelas T Tauri Fracas, apenas 7 revelaram ser realmente pertencentes à essa classe, sendo os demais objetos T Tauri Clássicas ou estrelas evoluídas da pré-seqüência principal. Esse resultado demonstra que o critério mais utilizado para distinguir as T Tauri Clássicas das T Tauri Fracas, baseado na largura equivelente da emissão Ha, não é suficiente para determinar o estágio evolutivo desses objetos. Para o cálculo de parâmetros estelares e abundâncias, foram escolhidas as estrelas que apresentam características ideais para esse tipo de estudo, como ausência de velamento, baixa velocidade de rotação e espectros com razão sinal-ruído adequada. Os parâmetros estelares como temperatura efetiva e gravidade foram determinados através do equilíbrio de excitação e ionização das linhas de Ferro, e as abundâncias químicas foram calculadas utilizando o método de síntese espectral. Serão apresentados os parâmetros estelares e as abundâncias de Lítio para toda a amostra, e abundâncias de vários elementos quimicos para 7 estrelas estudadas em maior detalhe

  12. Ambiente e formação estelar em galáxias

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Mateus, A., Jr.; Sodré, L., Jr.

    2003-08-01

    Estudamos o ambiente de galáxias com formação estelar inicialmente a partir de uma amostra limitada em volume proveniente do 2dF Galaxy Redshift Survey. Discriminamos as galáxias com formação estelar com base em distintas classes espectrais, utilizando para esta classificação as larguras equivalentes das linhas [OII]l3727 e Hd. O ambiente é caracterizado pela densidade espacial local de galáxias. Mostramos que a fração de galáxias com formação estelar é bastante reduzida em ambientes densos, enquanto a de galáxias passivas aumenta nestas regiões. Por outro lado, quando analisamos a fração de galáxias que apresentam um surto recente de formação estelar, notamos que ela independe do ambiente, sendo que em regiões mais densas alguns destes objetos apresentam distorções em sua morfologia. Estes resultados são confrontados com a análise da dependência ambiental da taxa de formação estelar, estimada pela emissão em Ha, de uma amostra extraída do Sloan Digital Sky Survey. Um declínio gradual da formação estelar também é observado nesta análise, sugerindo que as interações por efeitos de maré sejam responsáveis pela redução da formação estelar em ambientes densos através da remoção do reservatório de gás das galáxias. No entanto, estas interações também podem induzir surtos de formação estelar nas galáxias, além de peculiaridades morfológicas observadas nos objetos que habitam regiões mais densas.

  13. [Hodgkin's Lymphoma and Autoimmunity: Is There a Relationship?].

    PubMed

    Jerónimo, Mónica; Silva, Sónia; Benedito, Manuela; Brito, Manuel João

    2015-01-01

    Introdução: A relação entre linfomas e doenças autoimunes é descrita na literatura como bidirecional, existindo poucos dados em idade pediátrica. Este trabalho tem como objetivo avaliar a prevalência de doenças autoimunes em crianças e adolescentes com linfoma de Hodgkin seguidos num Serviço de Oncologia Pediátrica. Material e Métodos: Ao rever a casuística do Serviço de linfomas de Hodgkin nos últimos 16 anos (dados colhidos prospetivamente), constatou-se uma incidência aparentemente elevada de doenças autoimunes nas raparigas pelo que se realizou um estudo retrospetivo, com atualização do seguimento fora de tratamento, relativamente à existência de doenças autoimunes. Avaliaram-se: idade, sexo, tipo de doença autoimune, relação temporal com o linfoma, estádio e grupo histológico do linfoma e terapêutica efetuada. Resultados: Incluíram-se 52 casos de linfoma de Hodgkin, dos quais sete (13,5%), todos do sexo feminino, tiveram uma doença autoimune diagnosticada previamente, em simult'neo ou posteriormente ao linfoma. As doenças autoimunes encontradas foram: artrite idiopática juvenil, doença inflamatória intestinal, doença de Behçet, hepatite autoimune, lúpus eritematoso sistémico, tiroidite de Hashimoto e púrpura trombocitopénica idiopática. Em quatro doentes o diagnóstico foi posterior ao linfoma, em dois, prévio, e num simult'neo. Todos os casos, exceto o diagnóstico simult'neo, estão fora de tratamento e sem recidiva da doença oncológica. Não se verificaram óbitos. Discussão: Verificou-se uma importante prevalência de doenças autoimunes nas raparigas com linfoma de Hodgkin. Apresentamos os dados e discutimos possíveis causas desta relação com base numa revisão bibliográfica. Conclusões: Esta associação deve ser evocada, sendo necessário mais estudos, sobretudo em idade pediátrica.

  14. Uma análise do fenômeno “alternância de línguas” na fala de bilíngues intermodais (Libras e Português)

    PubMed Central

    de Sousa, Aline Nunes; de Quadros, Ronice Müller

    2013-01-01

    Um interessante fenômeno lingüístico presente nas interações das pessoas bilíngues é a alternância de línguas. Neste trabalho, estamos investigando a alternância entre a língua portuguesa oral e a língua de sinais brasileira – Libras, numa mesma cadeia enunciativa, com o objetivo de identificar e analisar o uso dessa alternância na fala de uma criança e de um adulto (ambos ouvintes, filhos de pais surdos), interagindo em uma situação de bilinguismo intermodal, com interlocutores surdos e ouvintes. A alternância de línguas, nesse caso, ocorre quando se para de falar em português e se alterna para sinalizar. O presente trabalho se caracteriza como um estudo inicial, com análise qualitativa de dados. Fazem parte do nosso corpus nove sessões de interações em Libras e em português oral, gravadas em vídeo, que fazem parte do Projeto Desenvolvimento Bilíngue Bimodal da UFSC. Os dados revelam que as características da alternância de línguas pelo adulto e pela criança parecem ter semelhanças e diferenças. O sujeito adulto parece ter feito um uso da alternância mais preocupado com o curso da interação. A criança, por sua vez, não parece tê-la usado com propósitos pragmáticos específicos. Quanto à extensão das alternâncias, pode-se perceber que tanto a criança quanto o adulto utilizaram enunciados maiores do que uma única palavra isolada. O papel dos interlocutores parece ter sido decisivo nas interações aqui investigadas – especialmente nas do adulto, já que a criança ainda está em processo de tomada de consciência do papel do interlocutor na interação. PMID:24379831

  15. Hospital admissions for herpes zoster in Portugal between 2000 and 2010.

    PubMed

    Mesquita, Margarida; Froes, Filipe

    2013-01-01

    Introdução e Objectivos: O aumento da incidência de herpes zoster e da nevralgia pós-herpética estão associados ao envelhecimento da população. Estas patologias podem ser francamente debilitantes e ter um grande impacto na qualidade de vida dos doentes. Numa população envelhecida como a portuguesa, é esperado que o impacto do herpes zoster e da post-herpetic neuralgia aumentem. No entanto, não existe no país nenhum sistema específico de monitorização da doença e não foram encontrados dados epidemiológicos portugueses nas últimas décadas. A vacina contra o herpes zoster, já recomendada noutros países europeus, ainda não se encontra disponível em Portugal. Conhecer o impacto do herpes zoster é importante para fundamentar medidas de saúde pública relacionadas com a vacinação.Material e Métodos: Procedeu-se a uma análise retrospetiva da base de dados da Administração Central dos Sistemas de Saúde com a informação clínica codificada dos internamentos hospitalares de todos os indivíduos com o diagnóstico principal de herpes zoster (ICD-9-CM 053) e que tiveram alta entre 2000 e 2010.Resultados: Em Portugal, entre 2000 e 2010, ocorreram 1 706 internamentos hospitalares com o diagnóstico principal de herpes zoster. A maioria dos doentes era idosa. Do total de internados, 10,6% tinham formas potencialmente graves de imunocompromisso. A doença predominante de herpes zoster sem complicações, seguido de herpes zoster do sistema nervoso e oftálmico. A duração média dos internamentos foi de 9,3 dias, aumentando com a idade. A letalidade intra-hospitalar foi de 1%. Considerando o período de 2000-2009 e apenas a população adulta, a média anual da incidência dos internamentos hospitalares com o diagnóstico principal deherpes zoster foi de 1,9 por 100 000 habitantes, aumentando com a idade.Conclusão: Este estudo confirma que, em Portugal, as formas graves de herpes zoster estão relacionadas com a idade e associadas a

  16. Implementing hybrid MPI/OpenMP parallelism in Fluidity

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Gorman, Gerard; Lange, Michael; Avdis, Alexandros; Guo, Xiaohu; Mitchell, Lawrence; Weiland, Michele

    2014-05-01

    Parallelising finite element codes using domain decomposition methods and MPI has nearly become routine at the application code level. This has been helped in no small part by the development of an eco-system of open source libraries to provide key functionality, for example SCOTCH for graph partitioning or PETSc for sparse iterative solvers. As we move to an era where pure MPI no longer suffices, application developers cannot only focus on the application code, but must consider the full software stack. In the case of Fluidity (an open source control volume/finite element general purpose fluid dynamics code) the decision to improve parallel efficiency by moving to a hybrid MPI/OpenMP programming model it became necessary to get involved in extending 3rd party open source libraries, specifically PETSc, in addition to the application code itself. The effort involved in re-engineering a large application code highlights the fact that as computing platforms continue their advance towards low power many core processors, the software stack must also develop at a similar pace or application codes will suffer. In this presentation we will illustrate the steps required to re-engineer Fluidity to achieve good parallel efficiency when using MPI/OpenMP. We identify performance pitfalls when using Fortran features such as automatic arrays in a multi-threaded context, as well as poor data locality on NUMA platforms. A significant proportion of the computational cost is in the sparse iterative solvers. For this we collaborated with the development team at Argonne National Laboratory to add OpenMP support to PETSc. We will present performance results for both the application as a whole, as well as for key individual components such as matrix assembly and the solvers. We also show that while we did not explicitly target I/O for optimisation here, its performance is nonetheless greatly improved because of fewer processes accessing the file system. One of the main remaining

  17. Structure-based design, synthesis and evaluation in vitro of arylnaphthyridinones, arylpyridopyrimidinones and their tetrahydro derivatives as inhibitors of the tankyrases.

    PubMed

    Kumpan, Katerina; Nathubhai, Amit; Zhang, Chenlu; Wood, Pauline J; Lloyd, Matthew D; Thompson, Andrew S; Haikarainen, Teemu; Lehtiö, Lari; Threadgill, Michael D

    2015-07-01

    The tankyrases are members of the PARP superfamily; they poly(ADP-ribosyl)ate their target proteins using NAD(+) as a source of electrophilic ADP-ribosyl units. The three principal protein substrates of the tankyrases (TRF1, NuMA and axin) are involved in replication of cancer cells; thus inhibitors of the tankyrases may have anticancer activity. Using structure-based drug design and by analogy with known 3-arylisoquinolin-1-one and 2-arylquinazolin-4-one inhibitors, series of arylnaphthyridinones, arylpyridinopyrimidinones and their tetrahydro-derivatives were synthesised and evaluated in vitro. 7-Aryl-1,6-naphthyridin-5-ones, 3-aryl-2,6-naphthyridin-1-ones and 3-aryl-2,7-naphthyridin-1-ones were prepared by acid-catalysed cyclisation of the corresponding arylethynylpyridinenitriles or reaction of bromopyridinecarboxylic acids with β-diketones, followed by treatment with NH3. The 7-aryl-1,6-naphthyridin-5-ones were methylated at 1-N and reduced to 7-aryl-1-methyl-1,2,3,4-tetrahydro-1,6-naphthyridin-5-ones. Cu-catalysed reaction of benzamidines with bromopyridinecarboxylic acids furnished 2-arylpyrido[2,3-d]pyrimidin-4-ones. Condensation of benzamidines with methyl 1-benzyl-4-oxopiperidine-3-carboxylate and deprotection gave 2-aryl-5,6,7,8-tetrahydropyrido[4,3-d]pyrimidin-4-ones, aza analogues of the known inhibitor XAV939. Introduction of the ring-N in the arylnaphthyridinones and the arylpyridopyrimidinones caused >1000-fold loss in activity, compared with their carbocyclic isoquinolinone and quinazolinone analogues. However, the 7-aryl-1-methyl-1,2,3,4-tetrahydro-1,6-naphthyridin-5-ones showed excellent inhibition of the tankyrases, with some examples having IC50=2nM. One compound (7-(4-bromophenyl)-1-methyl-1,2,3,4-tetrahydro-1,6-naphthyridin-5-one) showed 70-fold selectivity for inhibition of tankyrase-2 versus tankyrase-1. The mode of binding was explored through crystal structures of inhibitors in complex with tankyrase-2.

  18. Argumentos Antrópicos

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Villas da Rocha, J.F.; Casarejos, F.

    2004-02-01

    A existência de observadores é um fato. Este fato, entretanto, permite que possam ser extraídas informações físicas, astrofísicas e cosmológicas. A realidade da existência de observadores foi elevada por Carter [1] ao nível de um princípio, chamado Princípio Antrópico. Em linhas gerais o Princípio Antrópico afirma que a existência de observadores só é possível dentro de certos parâmetros físicos muito restritos. O Princípio Antrópico é uma fonte de compreensão de fatos observáveis do Universo. Na ausência de explicações provenientes das leis da física, as previsões antrópicas tornam-se importantes fatores de esclarecimento. Além disso, o Princípio Antrópico pode ainda atuar como supressor da necessidade de novas teorias. Foi aliás no quadro de discussões em torno da necessidade de novas teorias que o Princípio Antrópico foi concebido, nomeadamente na discussão em torno dos números muito grandes. Para explicar estes grandes números, Dirac [2] formulou uma hipótese inovadora, a de que a constante gravitacional variaria com o tempo na forma 1 - µ G t . Se aceita, tal relação se constituiria numa revisão das leis da física já estabelecida. Daria origem a uma nova física. Entretanto, com a elaboração do Princípio Antrópico por Dicke [3] e Carter [1] a coincidência de tais grandes números foi compreendida dentro da física tradicional, sem a necessidade de recurso a novas leis.

  19. Evidence for nucleolar subcompartments in Dictyostelium

    SciTech Connect

    Catalano, Andrew; O’Day, Danton H.

    2015-01-24

    Highlights: • Two nucleolar subcompartments (NoSC1, NoSC2) were found in Dictyostelium. • Specific nucleolar proteins localize to different nucleolar subcompartments. • Specific proteins exit NoSC1 and NoSC2 differently upon Actinomycin D treatment. • KRKR appears to function as an NoSC2 nucleolar subcompartment localization signal. - Abstract: The nucleolus is a multifunctional nuclear compartment usually consisting of two to three subcompartments which represent stages of ribosomal biogenesis. It is linked to several human diseases including viral infections, cancer, and neurodegeneration. Dictyostelium is a model eukaryote for the study of fundamental biological processes as well as several human diseases however comparatively little is known about its nucleolus. Unlike most nucleoli it does not possess visible subcompartments at the ultrastructural level. Several recently identified nucleolar proteins in Dictyostelium leave the nucleolus after treatment with the rDNA transcription inhibitor actinomycin-D (AM-D). Different proteins exit in different ways, suggesting that previously unidentified nucleolar subcompartments may exist. The identification of nucleolar subcompartments would help to better understand the nucleolus in this model eukaryote. Here, we show that Dictyostelium nucleolar proteins nucleomorphin isoform NumA1 and Bud31 localize throughout the entire nucleolus while calcium-binding protein 4a localizes to only a portion, representing nucleolar subcompartment 1 (NoSC1). SWI/SNF complex member Snf12 localizes to a smaller area within NoSC1 representing a second nucleolar subcompartment, NoSC2. The nuclear/nucleolar localization signal KRKR from Snf12 localized GFP to NoSC2, and thus also appears to function as a nucleolar subcompartment localization signal. FhkA localizes to the nucleolar periphery displaying a similar pattern to that of Hsp32. Similarities between the redistribution patterns of Dictyostelium nucleolar proteins during

  20. Prevendo a atividade solar através de redes neurais nebulosas

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Martin, V. A. F.; Poppe, P. C. R.

    2003-08-01

    Atualmente, a integração de redes neurais com técnicas da Matemática Nebulosa (Fuzzy Sets), tem sido usada robustamente para fazer previsões em vários sistemas físicos. Este trabalho representa uma continuidade da contribuição apresentada anteriormente durante a XXVIIa Reunião Anual da SAB, onde exploramos a aplicação de redes neurais para previsões futuras de séries temporais. Para este, enfatizamos o uso da técnica ANFIS (Adaptative Neuro-Fuzzy Inference System), que consiste em uma rede do tipo back-propagation, onde os dados são processados em uma camada intermediária, tendo numa camada de saída, os dados numéricos. Para que a previsão seja feita com sucesso utilizando-se técnicas matemáticas adequadas, é fundamental a existência de uma série razoavelmente longa de modo que a dinâmica contida nesta possa ser melhor extraída pela rede neural. Nesse sentido, foram utilizados novamente os dados históricos das manchas do Sol (1818-2002) afim de verificar o comportamento futuro da atividade solar (Ciclos de Schawbe) a partir da técnica descrita acima. Previsões realizadas para o ciclo anterior (n.22, máximo de 158,5 em julho de 1989), bem como para o atual (n.23, máximo de 153 em setembro de 2000), apontam valores bastante coerentes com os publicados na literatura, levando em consideração, respectivamente, as barras de erros associadas: 166+/-18 e 160+/-14. Para o próximo ciclo de Schawbe (2006-2017), nossa previsão aponta o valor de 172+/-23 como máximo para o primeiro semestre de 2011 (Abril +/- 3 meses). A ANFIS acompanha de maneira satisfatória o movimento das séries estudadas durante o treinamento e durante a verificação (menor dispersão das funções de pertinência), com erro absoluto inferior a 20 por cento.

  1. Final Scientific/Technical Report for "Enabling Exascale Hardware and Software Design through Scalable System Virtualization"

    SciTech Connect

    Dinda, Peter August

    2015-03-17

    This report describes the activities, findings, and products of the Northwestern University component of the "Enabling Exascale Hardware and Software Design through Scalable System Virtualization" project. The purpose of this project has been to extend the state of the art of systems software for high-end computing (HEC) platforms, and to use systems software to better enable the evaluation of potential future HEC platforms, for example exascale platforms. Such platforms, and their systems software, have the goal of providing scientific computation at new scales, thus enabling new research in the physical sciences and engineering. Over time, the innovations in systems software for such platforms also become applicable to more widely used computing clusters, data centers, and clouds. This was a five-institution project, centered on the Palacios virtual machine monitor (VMM) systems software, a project begun at Northwestern, and originally developed in a previous collaboration between Northwestern University and the University of New Mexico. In this project, Northwestern (including via our subcontract to the University of Pittsburgh) contributed to the continued development of Palacios, along with other team members. We took the leadership role in (1) continued extension of support for emerging Intel and AMD hardware, (2) integration and performance enhancement of overlay networking, (3) connectivity with architectural simulation, (4) binary translation, and (5) support for modern Non-Uniform Memory Access (NUMA) hosts and guests. We also took a supporting role in support for specialized hardware for I/O virtualization, profiling, configurability, and integration with configuration tools. The efforts we led (1-5) were largely successful and executed as expected, with code and papers resulting from them. The project demonstrated the feasibility of a virtualization layer for HEC computing, similar to such layers for cloud or datacenter computing. For effort (3

  2. [SAIMI Study--Health and Health Care Access by Immigrants from the Indian Subcontinent in Lisbon: What Recommendations for Equitable and Culturally Adequate Health Care?].

    PubMed

    Matos, Inês Campos; Alarcão, Violeta; Lopes, Elisa; Oiko, Carla; Carreira, Mário

    2015-01-01

    Introdução: O crescimento da população imigrante em Portugal tem sido consistente nas últimas décadas. Apesar disto, a informação sobre a saúde das populações imigrantes é escassa. Esta investigação utiliza dados recolhidos junto da população oriunda do subcontinente indiano a residir no distrito de Lisboa para produzir recomendações para a prestação de serviços de saúde culturalmente adaptados.Material e Métodos: Estudo transversal junto da comunidade imigrante do subcontinente indiano (Bangladesh, Ãçndia e Paquistão) a residir em Lisboa, selecionada com base numa técnica de amostragem bola de neve e recorrendo a inquiridores com acesso privilegiado à população-alvo. O questionário inquiriu sobre a saúde, o acesso aos cuidados de saúde, estilos de vida e atitudes perante a morte. Foi feita uma análise descritiva dos dados e uma comparação entre as três nacionalidades padronizada para a idade.Resultados: Foram administrados questionários a 1011 indivíduos com uma taxa de adesão de 97%. A maioria dos participantes eram adultos do sexo masculino. Os imigrantes indianos relataram mais frequentemente barreiras na utilização dos serviços de saúde e tinham uma maior frequência de doenças crónicas. Os imigrantes paquistaneses tinham piores indicadores de estilos de vida.Discussão: A população imigrante do subcontinente indiano tende a relatar mais dificuldades linguísticas no acesso aos cuidados de saúde quando comparada com outras populações imigrantes. Com base em recomendações da Organização Mundial da saúde, foi possível adaptar este conhecimento para produzir recomendações adaptadas ao contexto português.Conclusão: Existem diversos aspetos na gestão dos serviços de saúde em Portugal que podem ser melhor adaptados à população imigrante do subcontinente indiano.

  3. A Neurologist's Hard Day's Work: Impact of Inpatient Neurology Consultation in a Tertiary Hospital.

    PubMed

    Rocha, Helena; Monteiro, Ana; Gomes, Tiago; Grilo, Miguel; Carvalho, Marta

    2016-01-01

    Introdução: A consulta de neurologia realizada a doentes hospitalizados sob a responsabilidade de outras especialidades é um trabalho exigente mas muitas vezes sub-valorizado e pouco documentado. Este estudo pretendeu avaliar o impacto das consultas internas de neurologia num hospital português e, consequentemente, a performance do nosso Serviço no que diz respeito a esta matéria. Material e Métodos: Foi conduzido um estudo retrospetivo durante o ano de 2013 através da revisão de dados clínicos e demográficos. Resultados: Ao longo de um ano, os neurologistas no nosso Serviço avaliaram 632 doentes internados. As principais razões para o pedido de consulta foram a alteração do estado mental/comportamental, défice neurológico focal e crises epiléticas. Os pedidos de avaliação provieram principalmente de serviços médicos mas também de Unidades de Cuidados Intensivos e Intermédios. Os neurologistas sugeriram investigação adicional em cerca de 50% dos doentes; alterações terapêuticas foram efetuadas numa proporção semelhante de doentes. No final da consulta foi possível estabelecer um novo diagnóstico em 63% dos casos, sendo os mais frequentes manifestação neurológica de doenças sistémicas, epilepsia e doença vascular cerebral. Tal intervenção teve impacto no cuidado de 68% dos doentes. Discussão e Conclusão: Diferentes estudos na literatura suportam os nossos achados, enfatizando que esta atividade tem benefícios diretos no tratamento dos doentes e que é custo-efetiva. Os nossos resultados sugerem que a atividade de consultadoria interna da Neurologia resulta em intervenções úteis para a gestão clínica dos doentes internados.

  4. Shifts in alpine lakes' ecosystems in Japan driven by increasing Asian dusts

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Tsugeki, N. K.; Tani, Y.; Ueda, S.; Agusa, T.; Toyoda, K.; Kuwae, M.; Oda, H.; Tanabe, S.; Urabe, J.

    2011-12-01

    Recently in East Asia the amount of fossil fuel combustion have increased with economic growth. It has caused a problem of trans-boundary air pollution in the whole of eastern Asia. Furthermore, Asian dust storms contribute episodically to the global aerosol load. However, the effects of increased Asian dusts on aquatic ecosystems are not well understood. If biologically important nutrients such as nitrogen (N) and phosphorus (P) are transported via air dust, the atmospheric deposition of the dust may have serious impacts on recipient aquatic ecosystems because the biological production is limited by these nutrient elements. A previous report using sedimentary records has evaluated that atmospheric P inputs to the alpine lakes in the United States increased fivefold following the increased western settlement to this country during the nineteenth century. Since P is the most deficient nutrient for production in many lakes increase in P loading through atmospheric deposition of anthropogenically-derived dust might greatly affect the lake ecosystems. We examined fossil pigments and zooplankton remains from Pb-dated sediments taken from a high mountain lake of Hourai-Numa, located in the Towada-Hachimantai National Park of Japan, to uncover historical changes in the phyto- and zooplankton community over the past 100 years. Simultaneously, we measured the biogeochemical variables of TOC, TN, TP, δ13C, δ15N, and 206Pb/207Pb, 208Pb/207Pb in the sediments to identify environmental factors causing such changes. As a result, despite little anthropogenic activities in the watersheds, alpine lakes in Japan Islands increased algal and herbivore plankton biomasses by 3-6 folds for recent years depending on terrestrial the surrounded vegetations and landscape conditions. Biological and biogeochemical proxies recorded in the lake sediments indicate that this eutrophication occurred after the 1990s when P deposition increased due to atmospheric loading transported from Asian

  5. [Surgical Treated Spondylodiscitis Epidemiological Study].

    PubMed

    Soares do Brito, Joaquim; Tirado, António; Fernandes, Pedro

    2016-05-01

    Introdução: O termo espondilodiscite descreve uma qualquer infeção da coluna vertebral, sendo o tratamento gold standard baseado na terapêutica médica e a indicação cirúrgica ponderada em casos particulares. Foi objetivo deste trabalho estudar o perfil epide-miológico de um grupo de doentes com espondilodiscite submetidos a tratamento cirúrgico numa mesma instituição nacional entre 1997 e 2013. Material e Métodos: Análise epidemiológica de 85 doentes com diagnóstico de espondilodiscite submetidos a tratamento cirúrgico. Foram analisados os processos clínicos, estudos de imagem e registos informáticos. Resultados: Foram tratados 51 doentes do género masculino e 34 do género feminino. A idade média foi de 48 anos (min: 6 - máx: 80). O segmento lombar foi o mais afetado e o Mycobacterium tuberculosis o agente etiológico mais frequente. A distribuição do número de casos ao longo dos anos manteve-se aproximadamente constante, com discreto aumento da incidência do Staphylococus aureus e diminuição do número de casos sem agente identificado. Trinta e nove doentes apresentavam abcesso paravertebral e 17 lesão neurológica concomitante, a maioria no segmento torácico e em relação com infeção tuberculosa. Dez doentes apresentavam imunodepressão importante. Discussão: Nesta série verificou-se um predomínio da infeção tuberculosa, no género masculino e em indivíduos jovens. Enquanto o número de casos/ano das discites tuberculosas se mantém constante, as infeções a Staphylococus aureus parecem ganhar preponderância. O abcesso paravertebral e a lesão neurológica constituíram uma complicação frequente da infeção tuberculosa. Conclusão: As infeções da coluna vertebral com necessidade cirúrgica persistem como patologia relevante. Mycobacterium tuberculosis e Staphylococcus aureus representam os principais agentes etiológicos, parecendo existir uma incidência crescente deste último agente.

  6. Assessment of Suicidal Behavior in a Psychiatric Emergency Room in Lisbon.

    PubMed

    Marques, João Gama; Guerreiro, Diogo Frasquilho; Sampaio, Daniel

    2015-01-01

    Introdução: Alguns estudos têm alertado para a sobrecarga de tentativas de suicídio nas urgências médicas. Neste estudocaracterizamos os doentes suicidas numa urgência médica portuguesa. Material e Métodos: Durante três anos, todos os doentes observados pelo primeiro autor, em urgências médicas, após tentativa suicida, foram incluídos no estudo. A intencionalidade da tentativa suicida foi determinada com a Pierce Suicide Intent Scale. O seguimento foi registado recorrendo ao processo clínico, e o nível de satisfação a chamada telefónica. Resultados: Dos 120 doentes incluídos 70,8% eram mulheres e a média de idades foi 42,35 anos. A intencionalidade suicida (Pierce Suicide Intent Scale) foi baixa em 30,1%, média em 59,3% e elevada em 10,6%. Os principais preditores de intencionalidade suicida foram: género masculino (p < 0,001), história familiar de suicídio (p < 0,01), divórcio ou viuvez (p < 0,013) e doença mental grave (p < 0,015). Em 41,6% dos doentes não se apurou seguimento. Quanto à satisfação, apenas 19,5% deram resposta válida: 2,7% 'ligeiramente satisfeito', 4,4% 'moderadamente satisfeito', e 12,5% 'muito satisfeito'. Discussão: A Pierce Suicide Intent Scale é um instrumento útil na avaliação do comportamento suicida na urgência médica. Ocomportamento suicida de elevada intencionalidade está relacionado com género masculino, problemas sociais e antecedentes psiquiátricos pessoais e familiares. Conclusão: Os registos administrativos da urgência médica são ainda pouco rigorosos. As variáveis relacionadas com intencionalidade suicida são as mesmas que são descritas noutros países. Dos doentes a que conseguimos chegar, um quinto mostrou-se satisfeito com o seguimento. Mais estudos são necessários para compreender o comportamento suicida em Portugal.

  7. Experience with mixed MPI/threaded programming models

    SciTech Connect

    May, J M; Supinski, B R

    1999-04-01

    A shared memory cluster is a parallel computer that consists of multiple nodes connected through an interconnection network. Each node is a symmetric multiprocessor (SMP) unit in which multiple CPUs share uniform access to a pool of main memory. The SGI Origin 2000, Compaq (formerly DEC) AlphaServer Cluster, and recent IBM RS6000/SP systems are all variants of this architecture. The SGI Origin 2000 has hardware that allows tasks running on any processor to access any main memory location in the system, so all the memory in the nodes forms a single shared address space. This is called a nonuniform memory access (NUMA) architecture because it gives programs a single shared address space, but the access time to different memory locations varies. In the IBM and Compaq systems, each node's memory forms a separate address space, and tasks communicate between nodes by passing messages or using other explicit mechanisms. Many large parallel codes use standard MPI calls to exchange data between tasks in a parallel job, and this is a natural programming model for distributed memory architectures. On a shared memory architecture, message passing is unnecessary if the code is written to use multithreading: threads run in parallel on different processors, and they exchange data simply by reading and writing shared memory locations. Shared memory clusters combine architectural elements of both distributed memory and shared memory systems, and they support both message passing and multithreaded programming models. Application developers are now trying to determine which programming model is best for these machines. This paper presents initial results of a study aimed at answering that question. We interviewed developers representing nine scientific code groups at Lawrence Livermore National Laboratory (LLNL). All of these groups are attempting to optimize their codes to run on shared memory clusters, specifically the IBM and DEC platforms at LLNL. This paper will focus on ease

  8. [Bone Fractures in a Neonatal Intensive Care Unit].

    PubMed

    Machado, Angela; Rocha, Gustavo; Silva, Ana Isabel; Alegrete, Nuno; Guimarães, Hercília

    2015-01-01

    Introdução: As fraturas ósseas são raras durante o período neonatal. Algumas das fraturas, sobretudo as de ossos longos, podem ocorrer durante o parto. Por outro lado, os recém-nascidos internados em Unidades de Cuidados Intensivos Neonatais têm um risco aumentado de fraturas ósseas por várias razões.Objetivo: Avaliar a incidência e caracterizar as fraturas ósseas nos recém-nascidos internados numa Unidade de Cuidados Intensivos Neonatais nível III.Material e Métodos: Análise retrospetiva dos recém-nascidos internados na Unidade de Cuidados Intensivos Neonatais com o diagnóstico na alta de uma ou mais fraturas ósseas, entre janeiro de 1996 a junho de 2013.Resultados: Oitenta recém-nascidos apresentaram uma ou mais fraturas ósseas. Em 76 (95%) recém-nascidos, as fraturas foram atribuídas a traumatismo do parto. A fratura mais comum foi da clavícula em 60 (79%) recém-nascidos, seguida da fratura craniana em 6 (8%) recém-nascidos. Em dois (2,5%) recém-nascidos, prematuros de extremo baixo peso, as fraturas foram interpretadas como decorrentes de osteopenia da prematuridade. Ambos apresentaram fraturas múltiplas, um dos quais de várias costelas.Conclusão: Uma mudança das práticas obstétricas, aliada à melhoria dos cuidados prestados ao recém-nascido prematuro contribuíram para a diminuição da incidência de fraturas ósseas no período neonatal. Contudo nos recém-nascidos prematuros o seu diagnóstico pode estar subestimado, dado o elevado risco de desenvolvimento de fratura que estes recém-nascidos apresentam.

  9. [Streptococcus pneumoniae Vaccination in Children and Adolescents at High Risk of Invasive Pneumococcal Disease].

    PubMed

    Tendais-Almeida, Marta; Ferreira-Magalhães, Manuel; Alves, Inês; Tavares, Margarida; Azevedo, Inês

    2015-01-01

    Introdução: Em Portugal, a vacinação anti-pneumocócica é gratuita e recomendada pela Direção-Geral da Saúde na população pediátrica de alto risco para doença invasiva pneumocócica. O objetivo deste estudo foi analisar o cumprimento vacinal numa população pediátrica seguida em consulta hospitalar. Material e Métodos: Estudo observacional transversal, em crianças com diagnóstico de alto risco de doença invasiva pneumocócica e consulta num hospital nível três, entre julho e dezembro de 2014. Os dados foram obtidos através do processo clínico, Boletim Individual de Saúde e Plataforma de Dados da Saúde®. Resultados: Dos 122 participantes, 95,9% realizaram, pelo menos, uma dose de vacina mas, destes, só 64,8% efetuaram o esquema completo. O cumprimento do esquema vacinal foi melhor nos de idade inferior a cinco anos (p < 0,01). A proporção de crianças com esquema completo foi de: 100% nas hemoglobinopatias, 100% nas infeções por vírus da imunodeficiência humana, 66,7% nos prematuros com idade gestacional ⤠28 semanas, 62,5% nos esplenectomizados e 54,7% na síndrome de Down. As crianças têm mais esquemas completos quando são seguidas em consulta de Infeciologia (100%) e de Pneumologia pediátricas (88,2%). O grupocom idade superior a cinco anos está mais vacinado com a vacina polissacarida 23-valente do que o dos 2-5 anos (74,5% vs 40,5%; p < 0,01).Discussão: A maioria da nossa população de alto risco para doença invasiva pneumocócica efetuou vacinação anti-pneumocócica, mas apenas dois terços completaram o esquema recomendado, sendo a maior falha na administração da vacina polissacarida 23-valente. Conclusões: Embora estes resultados sejam melhores do que em países europeus com recomendações semelhantes, é necessário explorar as causas das falhas observadas para otimizar a vacinação.

  10. Imagens do céu ontem e hoje - um multimídia interativo de astronomia e uma nova exposição no MAST

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Caretta, C. A.; Lima, F. P.; Requeijo, F.; Vieira, G. G.; Alves, F.; Valente, M. E. A.; de Almeida, R.; de Garcia, G. C.; Quixadá, A. C.

    2003-08-01

    "Imagens do Céu Ontem e Hoje" é o título de uma nova exposição que está sendo inaugurada no Museu de Astronomia e Ciências Afins (MCT), que inclui experimentos interativos, maquetes, réplicas e 8 terminais de computador com um multimídia interativo sobre Astronomia para consulta dos visitantes. O multimídia apresenta um conteúdo bastante extenso, que engloba quase todos os temas em Astronomia, consistindo numa fonte de divulgação e pesquisa para um público que vai das crianças até estudantes universitários. O conteúdo está distribuído em mais de 500 páginas de texto divididas em 4 módulos: "O Universo", "Espectroscopia", "Telescópios" e "Observando o Céu". Cada módulo é subdividido em 5 seções, em média, cada uma iniciada por uma animação que ilustra os temas a serem abordados na seção. Ao final da animação, uma lista de temas é apresentada sob o título "Saiba Mais". Para exemplificar, o módulo "O Universo" contém as seguintes seções: "O Universo visto pelo homem", "Conhecendo o Sistema Solar", "Indo além do Sistema Solar", "Nossa Galáxia, a Via-Láctea" e "Indo mais além, a imensidão do Universo". A seção "Conhecendo o Sistema Solar", por sua vez, tem os seguintes temas: "A origem do Sistema Solar", "O Sol", "Os planetas", "Satélites, asteróides, cometas e outros bichos..." e "O Sistema Solar em números". Cada texto é repleto de imagens, quadros, desenhos, esquemas, etc, além de passatempos ao final de cada seção, incluindo jogos interativos, quadrinhos e curiosidades, que auxiliam o aprendizado de forma divertida. Apresentamos neste trabalho as idéias gerais que permearam a produção da exposição, e uma viagem pelo multimídia para exemplificar sua estrutura e conteúdo. O multimídia será posteriormente disponibilizado para o público externo pela página eletrônica do MAst e/ou por intermédio de uma publicação comercial.

  11. How do Japanese escape from TSUNAMI? - Disaster Prevention Education through using Hazard Maps

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Sakaue, Hiroaki

    2013-04-01

    After the disaster of the earthquake and tsunami in Tohoku, Japan in 2011, it is necessary to teach more "Disaster Prevention" in school. The government guideline for education of high school geography students emphasizes improving students' awareness of disaster prevention through acquiring geographical skills, for example reading hazard and thematic maps. The working group of the Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (MEXT) says that the purpose of Disaster Prevention Education is to develop the following competencies: 1. To acquire knowledge about disasters in the local area and the science of disaster prevention. 2. To teach individuals to protect themselves from natural hazards. 3. To safely support other people in the local area. 4. To build a safe society during rebuilding from the disasters. "Disaster Prevention Education" is part of the "Education for Sustainable Development" (ESD) curriculum. That is, teaching disaster prevention can contribute to developing abilities for sustainable development and building a sustainable society. I have tried to develop a high school geography class about "tsunami". The aim of this class is to develop the students' competencies to acquire the knowledge about tsunami and protect themselves from it through reading a hazard map. I especially think that in geography class, students can protect themselves from disasters through learning the risks of disasters and how to escape when disasters occur. In the first part of class, I have taught the mechanism of tsunami formation and where tsunamis occur in Japan. In the second part of class, I have shown students pictures that I had taken in Tohoku, for instance Ishinomaki-City, Minamisanriku-Town, Kesen'numa-City, and taught how to read hazard maps that show where safe and dangerous places are when natural hazards occur. I think that students can understand the features of the local area and how to escape from disasters that may occur in local area by

  12. Racial Inequality in Education in Brazil: A Twins Fixed-Effects Approach.

    PubMed

    Marteleto, Letícia J; Dondero, Molly

    2016-08-01

    Racial disparities in education in Brazil (and elsewhere) are well documented. Because this research typically examines educational variation between individuals in different families, however, it cannot disentangle whether racial differences in education are due to racial discrimination or to structural differences in unobserved neighborhood and family characteristics. To address this common data limitation, we use an innovative within-family twin approach that takes advantage of the large sample of Brazilian adolescent twins classified as different races in the 1982 and 1987-2009 Pesquisa Nacional por Amostra de Domicílios. We first examine the contexts within which adolescent twins in the same family are labeled as different races to determine the characteristics of families crossing racial boundaries. Then, as a way to hold constant shared unobserved and observed neighborhood and family characteristics, we use twins fixed-effects models to assess whether racial disparities in education exist between twins and whether such disparities vary by gender. We find that even under this stringent test of racial inequality, the nonwhite educational disadvantage persists and is especially pronounced for nonwhite adolescent boys.

  13. Socioeconomic and regional differences in active transportation in Brazil

    PubMed Central

    de Sá, Thiago Hérick; Pereira, Rafael Henrique Moraes; Duran, Ana Clara; Monteiro, Carlos Augusto

    2016-01-01

    ABSTRACT OBJECTIVE To present national estimates regarding walking or cycling for commuting in Brazil and in 10 metropolitan regions. METHODS By using data from the Health section of 2008’s Pesquisa Nacional por Amostra de Domicílio (Brazil’s National Household Sample Survey), we estimated how often employed people walk or cycle to work, disaggregating our results by sex, age range, education level, household monthly income per capita, urban or rural address, metropolitan regions, and macro-regions in Brazil. Furthermore, we estimated the distribution of this same frequency according to quintiles of household monthly income per capita in each metropolitan region of the country. RESULTS A third of the employed men and women walk or cycle from home to work in Brazil. For both sexes, this share decreases as income and education levels rise, and it is higher among younger individuals, especially among those living in rural areas and in the Northeast region of the country. Depending on the metropolitan region, the practice of active transportation is two to five times more frequent among low-income individuals than among high-income individuals. CONCLUSIONS Walking or cycling to work in Brazil is most frequent among low-income individuals and the ones living in less economically developed areas. Active transportation evaluation in Brazil provides important information for public health and urban mobility policy-making PMID:27355465

  14. [Pulmonary carcinoid: analysis of a single institutional experience and prognostic factors].

    PubMed

    Correia, Silvia da Silva; Pinto, Carlos; Bernardo, João

    2014-01-01

    IntroduçÉo: Os tumores carcinóides pulmonares sÉo tumores raros com origem nas células neuro-endócrinas do pulmÉo. Classificam-se de acordo com os critérios da OMS em carcinóides típicos ou atípicos. Quando comparados com outros tipos de neoplasia pulmonar, os tumores carcinóides apresentam melhor prognóstico.Objetivos: CaracterizaçÉo dos doentes com diagnóstico histológico de tumor carcinóide observados numa instituiçÉo. Análise dos fatores que influenciaram o prognóstico.Material e Métodos: Análise retrospetiva incluindo todos os doentes com diagnóstico histológico de tumor carcinóide pulmonar durante um período de 11 anos numa instituiçÉo. Os tumores foram classificados em típicos e atípicos de acordo com a classificaçÉo da OrganizaçÉo Mundial de Saúde de 2004. O estadiamento foi feito com base na classificaçÉo TNM de 2009 para o carcinoma do pulmÉo de nÉo pequenas células: T (Tumor); N (Ganglionar); M (Metástase).Resultados: Foram incluídos 59 doentes: 53 carcinóides típicos e seis carcinóides atípicos. Destes, 90% foram submetidos a cirurgia. O follow-up médio foi de 57 meses. A mortalidade operatória foi de 2% (n = 1) tratando-se de cirurgia paliativa para um doente em estádio IV. Em 49 doentes nÉo se verificou envolvimento ganglionar (N0), um doente apresentava doença N1, oito doença N2 e um doente doença N3. A sobrevivência global aos cinco anos foi de 79,2%: 80,2% nos carcinóides típicos e 66,7% nos carcinóides atípicos (p < 0,05). Nos doentes T1, a sobrevivência foi de 88,1% e de 58,2% nos T2-T4 (p < 0,01). Nos doentes N0 a sobrevivência aos cinco anos de 89,7% e de 36% para os doentes N1-N3 (p < 0,001). Os doentes com doença M0 apresentaram uma sobrevivência aos cinco anos de 85,9% sendo de 0% nos doentes M1 (p < 0,01). Dos 11 doentes que necessitaram de quimioterapia adjuvante, 45,4% eram carcinóides atípicos.DiscussÉo: Na nossa série, a cirurgia no tumor carcinóide pulmonar demonstrou

  15. [Autism and Early Neurodevelopmental Milestones].

    PubMed

    Ferreira, Xavier; Oliveira, Guiomar

    2016-03-01

    Introdução: A perturbação do espectro do autismo, neste texto também designada por autismo, é uma patologia crónica do neurodesenvolvimento, que se manifesta precocemente na infância por alterações da interação social, comunicação e comportamento repetitivo. Não estando disponíveis biomarcadores específicos, o diagnóstico baseia-se exclusivamente na avaliação clínica. O objetivo deste estudo é verificar quais os marcadores precoces do desenvolvimento psicomotor ou neurodesenvolvimento, que se correlacionam significativamente com a gravidade da clínica central do autismo, quocientes de desenvolvimento e com a função adaptativa. Material e Métodos: Procedemos ao estudo retrospetivo de uma população de 1 572 indivíduos com o diagnóstico de autismo seguidos na Unidade de Neurodesenvolvimento e Autismo do Centro de Desenvolvimento da Criança do Hospital Pediátrico do Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra. Analisámos seis marcadores precoces do desenvolvimento psicomotor: idades de aquisição 'da marcha', 'das primeiras palavras', 'das primeiras frases', 'do controlo de esfíncter vesical diurno', 'do controlo de esfíncter vesical noturno' e de início das primeiras queixas. Posteriormente dividimos a amostra em três subgrupos de gravidade clínica segundo a escala Childhood Autism Rating Scale e pesquisamos diferenças significativas entre os três subgrupos relativamente aos seis marcadores definidos. Resultados: O marcador 'idade de aquisição das primeiras frases' foi, de entre os seis, aquele que se correlacionou mais fortemente com as variáveis da clínica de autismo, quocientes de desenvolvimento/inteligência e comportamento ou função adaptativa. Na divisão da amostra em subgrupos de gravidade clínica, foi o de maior gravidade que mostrou idades de aquisição dos marcadores do neurodesenvolvimento mais tardias e idades mais precoces de manifestação das primeiras queixas. Discussão: Este estudo vem demonstrar a

  16. Comparing the performance of the SF-6D and the EQ-5D in different patient groups.

    PubMed

    Ferreira, Lara N; Ferreira, Pedro L; Pereira, Luis N

    2014-01-01

    Introdução: O objectivo geral deste artigo consiste em comparar o desempenho do EQ-5D e do SF-6D em quatro grupos de doentes que sofrem de asma, doença pulmonar obstrutiva crónica, cataratas e artrite reumatóide. Em particular, este artigo tem dois objectivos específicos: 1) estudar o nível de concordância entre os índices e os sistemas descritivos das dimensões do SF-6D e EQ-5D, e 2) analisar a capacidade de discriminação dos instrumentos.Material e Métodos: Uma amostra de 643 doentes respondeu ao SF-36v2 e ao EQ-5D. Foram analisados a capacidade de discriminação dos instrumentos, bem como o nível de concordância entre os índices e os sistemas descritivos das dimensões do SF-6D e EQ-5D. O nível de concordância entre os instrumentos foi estudado com base em coeficientes de correlação e nos gráficos de Bland-Altman, enquanto a influência da condição médica e de outras variáveis de natureza sociodemográfica nos índices foi analisada com o recurso a testes não paramétricos. Utilizaram-se também testes para amostras emparelhadas para identificar diferenças entre osscores finais dos instrumentos.Resultados e Discussão: Verificou-se a existência de uma correlação forte e de uma concordância elevada entre os dois índices. Em termos globais, os índices diferem por condição médica e por grupo sociodemográfico e ambos os instrumentos demonstraram uma capacidade discriminativa semelhante entre grupos sociodemográficosConclusão: Confirmou-se a hipótese de que o SF-6D gera valores de utilidade superiores em populações com doenças. O SF-6D e o EQ-5D parecem comportar-se de forma diferente em cada uma das doenças analisadas, uma vez que as medidas descritivas diferem entre instrumentos e os coeficientes de correlação não são uniformes. Os resultados demonstraram que o EQ-5D e o SF-6D geram valores de utilidade diferentes, mas que existe uma concordância elevada entre os dois instrumentos. Pode-se concluir que os resultados

  17. [Serum Erythropoietin as Prognostic Marker in Myelodysplastic Syndromes].

    PubMed

    Cortesão, Emília; Tenreiro, Rita; Ramos, Sofia; Pereira, Marta; César, Paula; Carda, José P; Gomes, Marília; Rito, Luís; Magalhães, Emília; Gonçalves, Ana C; Silva, Nuno C E; Geraldes, Catarina; Pereira, Amélia; Ribeiro, Letícia; Nascimento Costa, José M; Ribeiro, Ana B Sarmento

    2015-01-01

    Introdução: A síndrome mielodisplásica é uma doença heterogénea caracterizada por displasia, medula hipercelular, citopenias e risco de evolução para leucemia aguda. Outros factores de prognóstico, nomeadamente, fibrose medular, elevação da enzima desidrogenase do lactato e 2-microglobulina têm sido descritos, contudo, a decisão terapêutica baseia-se no score do International Prognostic Scoring System. Material e Métodos: Este trabalho teve como objectivo analisar a relevãncia da eritropoietina sérica ao diagnóstico, em doentes com síndrome mielodisplásica de novo, avaliando o seu impacto na sobrevivência global e a sua implementação como factor de prognóstico. Recolhemos dados clínicos e laboratoriais de 102 doentes com síndrome mielodisplásica de novo diagnosticada entre outubro/2009 e março/2014. A análise de sobrevivência foi efectuada recorrendo à metodologia de Kaplan-Meier, de acordo com os valores de eritropoietina. Resultados: A amostra, de 102 doentes, apresenta uma mediana de idades de 74 anos e relação masculino/feminino igual a 0,8. Os doentes com o subtipo citopenia refratária com displasia unilinha apresentam, em média, valores de eritropoietina significativamente mais baixos, em oposição aos doentes com o subtipo 5q- que apresentam a média de eritropoietina sérica mais elevada (p < 0,05). Onze doentes evoluíram para leucemia aguda; estes têm, em média, eritropoietina sérica superior (p < 0,05). Adicionalmente, a eritropoietina sérica acima do limite superior da normalidade associa-se a menor sobrevivência (p = 0,0336). Após ajuste do modelo de regressão de Cox, o valor preditivo da eritropoietina para a sobrevivência global manteve-se (p < 0,001). Em análise multivariada, a eritropoietina sérica demonstrou ser um factor de prognóstico independente (p < 0,001). Discussão: A eritropoietina sérica é um factor preditivo de resposta à terapêutica com eritropoietina subcut'nea, sendo que os doentes

  18. [Birth rate and fertility: knowledge and expectations analysis of 3585 university students].

    PubMed

    Machado, Maria do Céu; Alves, Maria Isabel; Couceiro, Luísa; Silva, Francisco Goiana da; Morais de Almeida, Miguel; Alves, Isa

    2014-01-01

    Introdução: Em Portugal, a taxa de natalidade não é suficiente para assegurar a renovação de gerações. A licenciatura e participação no mercado de trabalho das mulheres e a actual instabilidade económica são alguns determinantes e têm como consequência, o adiamento da parentalidade e infertilidade condicionada ainda pela obesidade, tabagismo e álcool.Material e Métodos: Estudo epidemiológico transversal, analítico, através de questionários auto-preenchidos, online, divulgados pelas Associações de estudantes das Universidades Portuguesas. A análise estatística da amostra de 3585 estudantes foi desenvolvida em SPSS, Excel nas representações gráficas e ArcMap, para os mapas.Resultados: Predomínio de estudantes de Ciências de Saúde (40,6%), da Universidade de Lisboa (59,4%) e sexo feminino (76,9%), mediana de idades de 22 anos; tabagismo 18,4%, consumo de álcool 22,3% e excesso de peso e obesidade 15,4%; intenção de casamento/união de facto 71,0%, projecto de parentalidade 85,7%; o emprego (47,4%) e a vontade do parceiro (39,9%) foram considerados determinantes na probabilidade de ter filhos assim como a segurança financeira para boa educação (33,6%) e cuidados de saúde (38,6%); 53,6% consideram a hipótese de infertilidade. Encontrámos valores mais elevados e significativos para o tabagismo (p = 0,001) e consumo de álcool (p = 0,000) no sexo masculino.Discussão: Consideramos a amostra representativa, bem distribuída pelas áreas de estudo, a maioria jovem, predomínio feminino superior aos rácios das faculdades. Há mais estudantes com projectos de parentalidade do que de casamento/união de facto, o que está de acordo com a evolução em Portugal. No entanto, os mesmos estudantes identificam a família como prioritária relativamente ao emprego e carreira. A decisão da parentalidade é condicionada pelas condições socioeconómicas mas um factor importante a considerar é uma baixa fertilidade biológica devida ao

  19. [Abstract of Cochrane review].

    PubMed

    Carneiro, António Vaz; Costa, João

    2013-01-01

    Objectivos: Esta revisão sistemática destinou-se a determinar os efeitos sobre a mortalidade e morbilidade do rastreio do cancro da mama com mamografia em mulheres de risco baixo e em cuidados primários.Material e Métodos: Foram pesquisadas duas bases de dados - PubMed (Novembro 2012) e a World Health Organization’s International Clinical Trials Registry Platform (Novembro 2012) – para identificação de ensaios clínicos aleatorizados, prospectivos e controlados (Randomized Clinical trials – RCTs) comparando o rastreio com a não realização do rastreio. A extracção dos dados foi feita por dois investigadores que contactaram, quando necessário, os autores dos estudos para informação adicional.Resultados: Foram identificados 8 RCTs cujas amostras somaram 600 000 mulheres com idades entre 39-74 anos. Os resultados agregados dos ensaios de melhor qualidade metodológica (baixo risco de viés de selecção) não detectaram diferenças na mortalidade por cancro da mama aos 7 (risco relativo [RR] = 0,93; Intervalo de Confiança [IC] 95%: 0,79-1,09) ou aos 13 anos (RR = 0,90; IC 95%: 0,79-1,02). Os resultados agregados dos ensaios com maior risco de viés de selecção (por possível aleatorização inadequada) mostraram reduções significativas na mortalidade por cancro da mama aos 7 (RR = 0,71; IC95%: 0,61-0,83) e aos 13 anos (RR = 0,75; IC95%: 0,67-0,83). Não se verificou heterogeneidade entre os resultados dos estudos. Os resultados dos estudos de melhor epior qualidade metodológica foram semelhantes para as mulheres com menos e com mais de 50 anos de idade. Quer os resultados dos estudos de melhor qualidade, quer os resultados dos estudos com maior risco de viés, não encontraram diferenças na mortalidade oncológica (por todos os tipos de cancro) nem na mortalidade global, quer aos 7, quer aos 13 anos. Devido a deficiente classificação das causas de morte nas amostras dos RCTs, a mortalidade por cancro da mama revelou-se um resultado (outcome

  20. [Physical activity and respiratory function: corporal composition and spirometric values analysis].

    PubMed

    Paulo, Rui; Petrica, João; Martins, Júlio

    2013-01-01

    Objetivo: A presente investigação tem como principal objetivo verificar os efeitos da atividade física na composição corporal (índice de massa corporal e perímetro da cintura), nos valores espirométricos e relacionar esses indicadores com a função respiratória.Material e Métodos: A amostra, constituída por 86 indivíduos, alunos do ensino superior, com média de idade de 21,3 ± 2,4 anos, foi dividida em dois grupos: grupo de controlo constituído por 28 sujeitos sedentários (20,9 ± 1,3 anos), e grupo experimental constituído por 58 sujeitos (21,5 ± 2,8 anos) praticantes de exercício supervisionado. Para caraterizar a amostra quanto ao tipo de atividade física,aplicámos uma adaptação do questionário de Telama et al. Avaliaram-se os valores de espirometria (DEMI, VEF1 e CVF) com o espirómetro Microquark da Cosmed e os valores de índice de massa corporal e perímetro da cintura. Os dados obtidos foram tratados no S.P.S.S. 19.0, através do t-test, do teste de Levene, do teste Mann-Whitney e do teste de correlação de Spearman, adotando-se um nível de significância de 5%.Resultados: O grupo experimental obteve resultados significativamente melhores (p ≤ 0,05) nos valores de índice de massa corporal, do perímetro da cintura e em todos os valores avaliados pela espirometria (DEMI, VEF1 e CVF), comparativamente ao grupo de controlo. Verificámos também que há uma tendência para correlação negativa entre os valores da composição corporal e os valores espirométricos, apenas observável em algumas variáveis (DEMI, VEF1), ou seja, quanto maiores os valores da composição corporal, menores os valores espirométricos.Conclusão: Os alunos com prática de exercício supervisionado, apresentaram melhores índices de composição corporal e de função respiratória. Valores de índice de massa corporal e de perímetro da cintura desajustados poderão provocar disfunção respiratória, aonível da ventilação e respetivos volumes

  1. Estudo comparativo entre estrelas centrais de nebulosas planetárias deficientes em hidrogênio

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Marcolino, W. L. F.; de Araújo, F. X.

    2003-08-01

    Apresentamos neste trabalho o resultado de um estudo das principais características espectrais das estrelas centrais de nebulosas planetárias (ECNP) deficientes em hidrogênio. A origem e a evolução dessas estrelas ainda constitui um problema em aberto na evolução estelar. Geralmente esses objetos são divididos em [WCE], [WCL] e [WELS]. Os tipos [WCE] e [WCL] apresentam um espectro típico de uma estrela Wolf-Rayet carbonada de população I e as [WELS] apresentam linhas fracas de carbono e oxigênio em emissão. Existem evidências que apontam a seguinte sequência evolutiva : [WCL] = > [WCE] = > [WELS] = > PG 1159 (pré anã-branca). No entanto, tal cenário apresenta falhas como por exemplo a falta de ECNP entre os tipos [WCL] e [WCE]. Baseados em uma amostra de 24 objetos obtida no telescópio de 1.52m em La Silla, Chile (acordo ESO/ON), ao longo do ano 2000, apresentamos os resultados da comparação das larguras equivalentes de diversas linhas relevantes entre os tipos [WCL], [WCE] e [WELS]. Verificamos que nossos dados estão de acordo com a sequência evolutiva. Baseado nas linhas de C IV, conseguimos dividir pela primeira vez as [WELS] em dois grupos principais. Além disso, os dados reforçam a afirmação de que as [WCE] são as estrelas que possuem a maior temperatura entre as ECNP deficientes em hidrogênio. Discutimos ainda, a escassez de dados disponíveis na literatura e a necessidade da obtenção de parametros físicos para estes objetos.

  2. Determinação da composição química em nebulosas planetárias na direção do anticentro galáctico

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Costa, R. D. D.; Uchida, M. M. M.; Maciel, W. J.

    2003-08-01

    Existe um gradiente radial de abundâncias no disco galáctico, cujo comportamento é razoavelmente bem conhecido para distâncias galactocêntricas entre 3 e 10 kpc. Foi obtido a partir de resultados derivados de nebulosas planetárias, regiões HII e estrelas, como as estrelas quentes de tipo O, B e aglomerados abertos. Com o objetivo de investigar o comportamento deste gradiente radial na região externa do disco, conhecida como anticentro galáctico, reportamos aqui os resultados finais da análise de uma amostra de nebulosas planetárias na direção do anticentro, observadas no LNA e no ESO entre 1995 e 2000. O uso de nebulosas planetárias permite o cálculo das abundâncias de elementos traçadores da evolução química do disco como oxigênio, argônio e neônio com o uso de técnicas de espectroscopia nebular. Os resultados indicam uma distribuição de abundâncias distinta daquela encontrada na vizinhança solar, mostrando que o gradiente radial diminui sensivelmente para distâncias galactocêntricas maiores que 10 kpc. Este resultado está de acordo com os mais recentes modelos de evolução química do disco, que prevêem uma diminuição ou mesmo um desaparecimento do gradiente radial no bordo externo do disco galáctico. (FAPESP/CNPq)

  3. Trends in healthy life expectancy among older Brazilian women between 1998 and 2008

    PubMed Central

    Nepomuceno, Marília Regina; Turra, Cássio Maldonado

    2015-01-01

    OBJECTIVE To analyze conditional and unconditional healthy life expectancy among older Brazilian women. METHODS This cross-sectional study used the intercensal technique to estimate, in the absence of longitudinal data, healthy life expectancy that is conditional and unconditional on the individual’s current health status. The data used were obtained from the Pesquisa Nacional por Amostra de Domicílios (National Household Sample Survey) of 1998, 2003, and 2008. This sample comprised 11,171; 13,694; and 16,259 women aged 65 years or more, respectively. Complete mortality tables from the Brazilian Institute of Geography and Statistics for the years 2001 and 2006 were also used. The definition of health status was based on the difficulty in performing activities of daily living. RESULTS The remaining lifetime was strongly dependent on the current health status of the older women. Between 1998 and 2003, the amount of time lived with disability for healthy women at age 65 was 9.8%. This percentage increased to 66.2% when the women already presented some disability at age 65. Temporal analysis showed that the active life expectancy of the women at age 65 increased between 1998-2003 (19.3 years) and 2003-2008 (19.4 years). However, life years gained have been mainly focused on the unhealthy state. CONCLUSIONS Analysis of conditional and unconditional life expectancy indicated that live years gained are a result of the decline of mortality in unhealthy states. This pattern suggests that there has been no reduction in morbidity among older women in Brazil between 1998 and 2008. PMID:25741653

  4. Burden of physical inactivity and hospitalization costs due to chronic diseases

    PubMed Central

    Bielemann, Renata Moraes; da Silva, Bruna Gonçalves Cordeiro; Coll, Carolina de Vargas Nunes; Xavier, Mariana Otero; da Silva, Shana Ginar

    2015-01-01

    OBJECTIVE To evaluate the physical inactivity-related inpatient costs of chronic non-communicable diseases. METHODS This study used data from 2013, from Brazilian Unified Health System, regarding inpatient numbers and costs due to malignant colon and breast neoplasms, cerebrovascular diseases, ischemic heart diseases, hypertension, diabetes, and osteoporosis. In order to calculate the share physical inactivity represents in that, the physical inactivity-related risks, which apply to each disease, were considered, and physical inactivity prevalence during leisure activities was obtained from Pesquisa Nacional por Amostra de Domicílio (Brazil’s National Household Sample Survey). The analysis was stratified by genders and residing country regions of subjects who were 40 years or older. The physical inactivity-related hospitalization cost regarding each cause was multiplied by the respective share it regarded to. RESULTS In 2013, 974,641 patients were admitted due to seven different causes in Brazil, which represented a high cost. South region was found to have the highest patient admission rate in most studied causes. The highest prevalences for physical inactivity were observed in North and Northeast regions. The highest inactivity-related share in men was found for osteoporosis in all regions (≈ 35.0%), whereas diabetes was found to have a higher share regarding inactivity in women (33.0% to 37.0% variation in the regions). Ischemic heart diseases accounted for the highest total costs that could be linked to physical inactivity in all regions and for both genders, being followed by cerebrovascular diseases. Approximately 15.0% of inpatient costs from Brazilian Unified Health System were connected to physical inactivity. CONCLUSIONS Physical inactivity significantly impacts the number of patient admissions due to the evaluated causes and through their resulting costs, with different genders and country regions representing different shares. PMID:26487291

  5. Efeitos do binarismo não resolvido na determinação da função de massa de aglomerados

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Kerber, L. O.; Santiago, B. X.

    2003-08-01

    Através de simulações numéricas buscamos quantificar os efeitos que o binarismo não resolvido causa na determinação da função de massa (MF) de aglomerados estelares. Geramos diagramas cor-magnitude (CMDs) artificiais simulando uma população única, caracterizada por estrelas de mesma idade e composição quí mica, com uma fração de binárias não resolvidas e distribuição em massa das estrelas dada por uma MF do tipo lei de potência. A presença de pares de estrelas não resolvidos faz com que a MF obtida da função de luminosidade (LF) tenha a têndencia de ser mais plana do que a MF que gerou o CMD artificial. Propomos um tratamento de correção para tal efeito. Outro efeito relacionado diz respeito ao alargamento do CMD, que apresenta-se como um indicador do número total de estrelas no domí nio de baixas massas (m < 0.6M¤). Todos os resultados acima possuem uma forte dependência com os erros fotométricos e estão baseados na hipótese de que ambas estrelas do par não resolvido são sorteadas de uma mesma MF de forma independente. O objetivo final é aplicarmos o tratamento aqui desenvolvido para implementarmos a análise da nossa amostra de aglomerados ricos da Grande Nuvem de Magalhães.

  6. [Vertebral metrics: application of a new mechanical instrument to evaluate the spinal column].

    PubMed

    Quaresma, Cláudia; Dias, Inês; Forjaz Secca, Mário; Goyri-O'Neill, João; Branco, Jorge

    2013-01-01

    Objectivo: Apresentar os resultados da primeira aplicação da nova tecnologia – Métrica Vertebral – na análise da posição 3D do vértice de cada uma das apófises espinhosas, em mulheres grávidas.Material e Métodos: O Métrica Vertebral foi aplicado a mulheres, sem patologia associada, em quatro momentos da gravidez (12, 20, 32, 37 semanas de gestação). Aplicaram-se modelos lineares univariados.Resultados: Observou-se que as diferenças que ocorrem ao longo da gravidez são mais significativas ao nível da posição y (anteroposterior). Verificou-se, igualmente, que existe uma correlação biomecânica positiva entre a posição do vértice de cada uma das vértebras com a posição homóloga das restantes.Discussão/Conclusão: Através do Métrica Vertebral foi possível obter resultados inovadores na análise biomecânica da colunavertebral. É um dispositivo que tem diferentes aplicações podendo ser facilmente adoptado em áreas como ortopedia, neurocirurgia, pediatria e reabilitação. É de realçar ainda que este instrumento não se esgota na amostra da presente investigação pois pode ser futuramente aplicada à população em geral.

  7. [Strategy to control methicillin-resistant Staphylococcus aureus: the 5 year experience of a hospital].

    PubMed

    Peres, David; Neves, Isabel; Vieira, Fernanda; Devesa, Ilda

    2014-01-01

    Introdução: O Staphylococcus aureus resistente à meticilina é um dos microrganismos multirresistentes mais frequentemente implicados em infeções associadas a cuidados de saúde. Definiu-se como objetivo implementar uma estratégia multimodal para controlar este microrganismo num hospital.Material e Métodos: Procedimento baseado em rastreio ativo e medidas de isolamento numa população selecionada (doentes provenientes de outras instituições de saúde e lares ou com historial de internamento/ staphylococcus aureus resistente à meticilina; doentes dos cuidados intensivos e intermédios e, nos restantes serviços, rastreio aos contactos diretos se detetado um novo caso de staphylococcus aureus resistente à meticilina e, desde 2012, hemodialisados). Outras ações paralelas: (1) revisão das normas Precauções Básicas e Isolamento; (2) reforço dos pontos de desinfeção alcoólica das mãos; (3) sessões de esclarecimento aos profissionais de saúde; (4) folha ‘Alerta de staphylococcus aureus resistente à meticilina’ no processo dos doentes; (5) panfleto de informação aos doentes/ visitas; (6) monitorização do procedimento através de auditoria e (7) descolonização de doentes nos cuidados intensivos e intermédios, com rastreios de follow-up.Resultados: Entre 2007 e 2012 registou-se um decréscimo da proporção de staphylococcus aureus resistente à meticilina de 66% para 57% e da densidade de incidência de 1,80 para 0,68 casos por mil dias de internamento (p < 0,001; RR 0,38; IC95%: 0,29-0,49).Discussão/Conclusão: De acordo com dados europeus publicados, referentes a isolados no sangue e líquor, Portugal foi o país com maior proporção de staphylococcus aureus resistente à meticilina em 2011. Utilizando este critério de inclusão, o nosso hospital revelou uma proporção de staphylococcus aureus resistente à meticilina inferior à média nacional (34% versus 55%). A estratégia multimodal demonstrou ser eficaz na diminuição dos

  8. [The Portuguese Guidelines and Patients Values].

    PubMed

    Santos, Paulo; Nazaré, Isabel; Martins, Carlos; Sá, Luísa; Couto, Luciana; Hespanhol, Alberto

    2015-01-01

    ível na definição do diagnóstico, o que os coloca numa posição secundária no processo de decisão clínica com potenciais perdas na qualidade.

  9. Detection and Intervention Strategies by Primary Health Care Professionals in Suspected Elder Abuse.

    PubMed

    Ferreira, Mafalda; dos Santos, César Lares; Vieira, Duarte Nuno

    2015-01-01

    Introdução: Os profissionais dos cuidados de saúde primários encontram-se numa posição privilegiada para identificarem e orientarem casos de maus-tratos de idosos. Este estudo investigou o enquadramento destes profissionais nesta matéria. Material e Métodos: Elaborou-se um questionário posteriormente aplicado a Médicos e enfermeiros de 12 Unidades de Saúde de Coimbra. Estudaram-se par'metros relacionados com aspetos demográficos, perceção do abuso e estratégias de atuação, experiência pessoal e formação nesta área. Resultados: A taxa global de resposta foi de 67,9% com 127 questionários validados. Dos resultados obtidos destacam-se seguintes: verificou-se um contacto substancial entre os profissionais e a população idosa; a maioria dos profissionais (64,6%) consideram o abuso mais prevalente em contexto familiar e 32,3% indicaram a negligência como a forma mais frequente; 97,6% dos profissionais considera que tem um papel importante na deteção de casos de abuso; a incerteza no diagnóstico foi um dos principais fatores limitadores da denúncia; verificou-se incerteza a obrigatoriedade de reportar os casos às autoridades judiciais. Ainda se constatou que 87,4% destes profissionais se sentiriam mais confortáveis com protocolos de atuação e que esta problemática não havia sido abordada na sua formação básica em 70,9% dos casos. Discussão: O contato significativo entre a população idosa e os profissionais de saúde propicia o diagnóstico e intervenção precoces. Os profissionais revelaram conhecimentos sobre o tema em linha com os indicados por alguns estudos, nomeadamente, sobre o contexto e prevalência do abuso. A subsistência de dúvidas relativamente à melhor forma para gerir estes casos e conciliar as diferentes perspetivas poderia ser colmatado, na opinião veiculada pelos próprios, pela definição de protocolos de atuação e a formação específica deverá ser considerada como um dos pilares fundamentais para

  10. [Congenital adrenal hyperplasia due to 21-hydroxylase deficiency: genotype-phenotype correlation].

    PubMed

    Mendes, Catarina; Vaz Matos, Inês; Ribeiro, Luís; Oliveira, Maria João; Cardoso, Helena; Borges, Teresa

    2015-01-01

    Introdução: A hiperplasia congénita da suprarrenal por deficiência de 21-hidroxílase constitui uma das doenças hereditárias mais comuns. Resulta de diferentes mutações no gene CYP21A2 e, na maioria dos casos, a gravidade da doença correlaciona-se com a variação alélica do CYP21A2. O objetivo deste estudo foi descrever o espectro mutacional do CYP21A2 e avaliar a correlação genótipo-fenótipo numa coorte de doentes portugueses com deficiência de 21-hidroxílase. Material e Métodos: Estudo retrospetivo de 22 doentes com diagnóstico clínico de deficiência de 21-hidroxílase. Foi feita análise molecular do CYP21A2 e estabelecida a correlação genótipo-fenótipo. Resultados: Foi realizada genotipagem em 22 doentes não relacionados: 5 com a forma clássica perdedora de sal (idade média ao diagnóstico de 10,2 dias; mínimo 1, máximo 20 dias), 7 com a forma clássica virilizante simples (idade média ao diagnóstico de 3,5 anos; mínimo 0 dias, máximo 7 anos) e 10 com a forma não clássica (idade média ao diagnóstico de 5,7 anos; mínimo 4 anos, máximo 8 anos). Os defeitos genéticos mais frequentes nas formas clássicas foram o I2 splice (24%) e I172N (24%), seguindo-se o Q318X (16%) e deleções de genes (16%) e, na forma não clássica, o V281L (80%). Verificou-se uma concordância genótipo-fenótipo global de 81,8%. O genótipo permitiu prever adequadamente o fenótipo em 83,3%, 100% e 90% dos doentes com mutações compatíveis com a forma clássica perdedora de sal, clássica virilizante simples e não clássica, respectivamente. Discussão: A frequência de defeitos genéticos observados nos nossos doentes é comparável a estudos semelhantes. Observou-se, na maioria dos casos, uma boa correlação genótipo-fenótipo. Conclusões: A análise molecular do CYP21A2 fornece informação importante relativamente à gravidade da doença e no aconselhamento genético e pré-natal.

  11. [Esophageal cancer: surgical strategies].

    PubMed

    Costa, Paulo; Esteves, Rui; Lages, Patrícia; Ferreira, Filipa

    2014-01-01

    Introdução: A ressecção transmediastínica e a ressecção transtorácica têm mortalidade hospitalar (1,4% -14%) e sobrevivência (± 25% aos cinco anos) semelhantes. A terapêutica neo-adjuvante é opção em estádios avançados. A intenção deste trabalho é apresentar uma série consecutiva de 52 doentes - opção operatória baseada na localização anatómica: tumores infra-carinais e cervicais submetidos a ressecção transmediastínica e restantes ressecções transtorácicas.Material e Métodos: O estudo incluiu 52 doentes consecutivos, sete mulheres e 45 homens, mediana de idade: 64 anos [46- 85]. Localização: cervical – um; montante da carina - 22; jusante da carina -19; cárdia tipo I –10. Histologia: 19 adenocarcinomas, 32 carcinomas pavimento-celulares, um linfoma. Vinte doentes (40%) - terapêutica neoadjuvante. Abordagem tóraco-abdominal – três, tóraco-abdómino-cervical – 20, transhiatal – 27, toracotomia exploradora – dois. Transposição gástrica 49 (anastomose cervical – 46; torácica - três); esofagocoloplastia cervical - um.Resultados: Estadiamento patológico: regressão completa - 8; Ib – 3; IIa – 9; IIb - 4; IIa – 11; IIIb -2; IIIc – 10; IV – 1; linfoma - um; não classificáveis – três. Complicações major: 37%. Ressecabilidade: 96% (50/52). Mortalidade: quatro semanas - 6%; hospitalar - 14%. Sobrevida mediana 18 meses [3-80]. Curvas de sobrevida (Kaplan-Meier): dois anos - 47%; cinco anos - 19%.Discussão: Não tendo sido demonstrada vantagem oncológica para a ressecção transtorácica ou a ressecção transmediastínica,basear a opção operatória na localização do tumor permitiu-nos com segurança e eficácia, planear e executar as ressecções esofágicas desta série.Conclusão: As curvas de sobrevida foram sobreponíveis para ressecção transtorácica e ressecção transmediastínica e bastantefavoráveis numa população com 52 % de estádios p

  12. Endovascular Treatment of Aortic Aneurysms and Blood Transfusion. What do We Need?

    PubMed

    Machado, Rui; Loureiro, Luís; Antunes, Inês; Coutinho, Jorge; Almeida, Rui

    2016-05-01

    ções da British Society of Haematology baseiam-se numa relação unidades crossmatched/transfundidas de 2:1. Na nossa instituição, a relação unidades crossmatched/transfundidas foi de 10,1 até 2010 e 7,3 de 2011 a 2012. Conclusões: Os resultados mudaram o nosso Maximum Surgical Blood Orders Schedule para o tratamento endovascular dosaneurismas da aorta. Atualmente procedemos ao teste 'type and screen' para próteses aorto-bi-iliaca e aorto-uni-iliaca e a testes de crossmatch de duas unidades de glóbulos vermelhos para torácica, três para híbrida-torácica e quatro para híbrida-abdominal. Isto pode levar a menos gastos, aumento de eficácia e reduzir a sobrecarga no departamento de hematologia.

  13. Discontinuous Galerkin Method with Numerical Roe Flux for Spherical Shallow Water Equations

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Yi, T.; Choi, S.; Kang, S.

    2013-12-01

    In developing the dynamic core of a numerical weather prediction model with discontinuous Galerkin method, a numerical flux at the boundaries of grid elements plays a vital role since it preserves the local conservation properties and has a significant impact on the accuracy and stability of numerical solutions. Due to these reasons, we developed the numerical Roe flux based on an approximate Riemann problem for spherical shallow water equations in Cartesian coordinates [1] to find out its stability and accuracy. In order to compare the performance with its counterpart flux, we used the Lax-Friedrichs flux, which has been used in many dynamic cores such as NUMA [1], CAM-DG [2] and MCore [3] because of its simplicity. The Lax-Friedrichs flux is implemented by a flux difference between left and right states plus the maximum characteristic wave speed across the boundaries of elements. It has been shown that the Lax-Friedrichs flux with the finite volume method is more dissipative and unstable than other numerical fluxes such as HLLC, AUSM+ and Roe. The Roe flux implemented in this study is based on the decomposition of flux difference over the element boundaries where the nonlinear equations are linearized. It is rarely used in dynamic cores due to its complexity and thus computational expensiveness. To compare the stability and accuracy of the Roe flux with the Lax-Friedrichs, two- and three-dimensional test cases are performed on a plane and cubed-sphere, respectively, with various numbers of element and polynomial order. For the two-dimensional case, the Gaussian bell is simulated on the plane with two different numbers of elements at the fixed polynomial orders. In three-dimensional cases on the cubed-sphere, we performed the test cases of a zonal flow over an isolated mountain and a Rossby-Haurwitz wave, of which initial conditions are the same as those of Williamson [4]. This study presented that the Roe flux with the discontinuous Galerkin method is less

  14. Mumps Outbreak among Highly Vaccinated Teenagers and Children in the Central Region of Portugal, 2012-2013.

    PubMed

    Cordeiro, Eugénio; Ferreira, Muriel; Rodrigues, Fernanda; Palminha, Paula; Vinagre, Elsa; Pimentel, João Pedro

    2015-01-01

    Introdução: A vacina contra o sarampo, parotidite epidémica e rubéola foi introduzida no Programa Nacional de Vacinação em 1987, atingindo rapidamente uma cobertura vacinal > 92% para duas doses, com redução importante da incidência anual da doença. Reportamos um surto de parotidite na Região Centro de Portugal ocorrido entre outubro de 2012 e março de 2013. Material e Métodos: Foram investigados os casos de tumefação de glândulas salivares e sintomas compatíveis com parotidite. Para cada caso foram analisados dados demográficos, clínicos, laboratoriais e vacinais. Resultados: Ao longo de seis meses foram notificados 148 casos: 87,8% ocorreram em três dos 16 concelhos afetados e 78,4% tinham uma relação epidemiológica conhecida. A idade mediana foi de 14,5 anos (2-62) e 70,3% tinham entre 11 e 20 anos; 61,5% eram do sexo masculino. Na maioria dos casos a doença foi ligeira, com uma duração média de sete dias (2-20). A febre ocorreu em 80,4% e a glândula parótida apresentou envolvimento unilateral em 55,4%; sete casos tiveram orquite, um ooforite e uma nefrite. Dois doentes foram internados. A transmissão da doença ocorreu predominantemente em ambiente escolar, com taxas de ataque < 30%. A maioria dos casos ocorreu em indivíduos vacinados (92%), dos quais 86,8% com duas doses. Em 17,7% foi identificada uma dosede vacina contendo a estirpe Rubini. Foi identificado o genótipo G do vírus da parotidite em quatro casos. Discussão: Este surto de parotidite numa população com coberturas vacinais elevadas, atingindo principalmente adolescentes em meio escolar, poderá dever-se à efetividade parcial da vacina contra a doença (especialmente no grupo vacinado com a estirpe Rubini), à perda de imunidade ao longo do tempo ou ainda à discordância entre os genótipos vacinal e circulante causador de doença. Conclusões: O relato deste surto releva a importância da discussão sobre a necessidade de mais doses de reforço da vacina atual

  15. How can coastal parks contain the destructive impact of a tsunami? A numerical approach to the understanding of tsunami-triggered waves in the presence of coastal hills

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Marras, Simone; Suckale, Jenny; Lunghino, Brent; Giraldo, Francis X.; Constantinescu, Emil

    2016-04-01

    reducing it. Nevertheless, without a thorough understanding of the behavior of non-linear waves when they approach coastal configurations such as hills, coastal parks may still be far from a safe reality. References [1] P. Lynett (2007) "Effect of shallow water obstruction on long wave run-up and overland flow velocity" J. Waterway, Port, Coastal, Ocean Engrg. 136:455-462 [2] G. F. Carrier, T. T. Wu, H. Yeh (2003) "Tsunami run-up and draw-down on a plane beach" J. Fluid Mech. 475:79-99. [3] F. X. Giraldo and M. Restelli (2010) "High-order semi- implicit time-integrators for a triangular discontinuous Galerkin oceanic shallow water model" Int. J. Numer. Methods Fluids, 63:1077-1102. [4] F X. Giraldo, J F.. Kelly, and E. Constantinescu. "Implicit-explicit formulations of a three-dimensional Nonhydrostatic Unified Model of the Atmosphere (NUMA)" SIAM J. Sci. Comput., 35:1162-1194, 2013.

  16. [Long-term home oxygen therapy in children: evidences and open issues].

    PubMed

    Oliveira, Lia; Coelho, Joana; Ferreira, Rosário; Nunes, Teresa; Saianda, Ana; Pereira, Luisa; Bandeira, Teresa

    2014-01-01

    IntroduçÉo: Oxigenoterapia domiciliária de longa duraçÉo está indicada em doentes com hipoxémia crónica. Pretendemos descrever a populaçÉo em programa de oxigenoterapia domiciliária de longa duraçÉo acompanhada numa Unidade de Pneumologia Pediátrica de Hospital Terciário entre 2003-2012 e comparar com revisÉo de 1991-2000; verificar conformidade com orientações nacionais e internacionais, refletindo sobre necessidade de orientações nacionais especificamente pediátricas, inexistentes em Portugal.Material e Métodos: Estudo retrospetivo, descritivo e comparativo por consulta de processo clínico. Pesquisa de orientações sobre oxigenoterapia em idade pediátrica.Resultados: Incluímos 86 doentes (59,3% rapazes). A idade mediana de início da oxigenoterapia foi 0,0 (0,0-216,0) meses e a duraçÉo mediana de 15,0 (3,0-223,0) meses. O diagnóstico mais frequente foi displasia broncopulmonar (53,5%), seguindo-se bronquiolite obliterante (14,0%), doença neurológica (10,5%), fibrose quística (8,1%), síndromes polimalformativas (5,8%), doença de células falciformes (3,5%), outras doenças pulmonares neonatais (2,3%) e doenças pulmonares intersticiais (2,3%). Mantêm acompanhamento 53 (61,6%) doentes, 38 mantendo oxigenoterapia; 12 (13,9%) faleceram. O tempo mediano de seguimento foi 39,5 (1,0-246,0) meses, mínimo nas outras doenças pulmonares neonatais e máximo na fibrose quística. Comparativamente ao estudo anterior revela aumento relativo dos lactentes com bronquiolite obliterante e displasia broncopulmonar, aumento da duraçÉo nestes últimos e inclusÉode doentes neurológicos e hematológicos.DiscussÉo: A prescriçÉo de oxigenoterapia domiciliária de longa duraçÉo em pediatria ocorre sobretudo em doenças específicas dos lactentes e idade pré-escolar. Doentes neurológicos e hematológicos sÉo novos grupos de prescriçÉo, à semelhança da literatura internacional.ConclusÉo: O conhecimento da realidade nacional e orienta

  17. [Acute respiratory distress syndrome: case series, two years at an intensive care unit].

    PubMed

    Taborda, Lúcia; Barros, Filipa; Fonseca, Vitor; Irimia, Manuel; Carvalho, Ramiro; Diogo, Cláudia; Ramos, Armindo

    2014-01-01

    Introdução: A Síndrome de Dificuldade Respiratória Aguda apresenta incidência e mortalidade significativas em Cuidados Intensivos, justificando estudos adicionais, nomeadamente para definição de novas abordagens terapêuticas. Os autores propuseram-se caracterizaros casos duma Unidade de Cuidados Intensivos em dois anos.Material e Métodos: Procedeu-se a um estudo observacional retrospectivo dos casos admitidos numa Unidade de Cuidados Intensivos, cumprindo os critérios diagnósticos da American-European Consensus Conference on ARDS, tendo sido excluídos os não ventilados invasivamente. Pesquisados e submetidos a tratamento estatístico: dados demográficos, etiologia do Síndrome de Dificuldade Respiratória Aguda, comorbilidades, Índices de Gravidade, PaO2/FiO2, modalidades e parâmetros ventilatórios, compliance pulmonar, dias de ventilação mecânica invasiva, corticoterapia, terapêuticas de resgate, complicações, duração do internamento, óbitos.Resultados: Obtiveram-se 40 doentes, com uma mediana de 72,5 anos (amplitude interquartil 22) e um ratio feminino:masculino ≈1:1,86. Cinquenta e cinco por cento dos Síndrome de Dificuldade Respiratória Aguda tiveram etiologia pulmonar. A média do PaO2/ FiO2 mínimo foi 88mm Hg (IC 95%: 78,5-97,6). A média da PEEP máxima aplicada foi 12,4 cmH2O (Desvio Padrão 4,12) e a médiado Volume Corrente máximo utilizado foi 8,2 mL/Kg peso ideal (IC 95%: 7,7-8,6). A mediana dos dias de ventilação mecânica invasiva foi 10. Em 47,5% dos doentes foram administrados corticóides. Em 52,5% foi executado recrutamento alveolar. A complicação mais frequente foi a Pneumonia Associada a Ventilação (20%). A mediana da duração do internamento foi 10,7 dias (amplitude interquartil10,85). Faleceram 60% dos doentes. A probabilidade de outcome favorável ‘não óbito na Unidade de Cuidados Intensivos’ foi 4,4x superior nos doentes sob corticoterapia e 11x superior nos doentes com idade < 65 anos

  18. [Odds Ratio: review about the meaning of an epidemiological measure].

    PubMed

    Aguiar, Pedro; Nunes, Baltazar

    2013-01-01

    Introdução: É importante rever a validade do Odds Ratio como medida de associação e efeito, assim como, qual o viés introduzido pelo Odds Ratio quando este representa uma razão de riscos ou uma razão de prevalências em situação de doença mais frequente.Material e Métodos: Simulámos numa coorte de 200 indivíduos com 100 expostos e 100 não expostos a um fator de risco, um cenário de doença rara e outro de doença mais frequente, com razão de riscos igual em ambos os cenários. Determinaram-se o Odds Ratio e o Risco Relativo pelo método clássico (padrão) e respectivamente por regressão logística e regressão de Poisson. Introduziu-se de seguida uma variável de confundimento e determinaram-se o Odds Ratio e o Risco Relativo pelo método de Mantel-Hanszel (análise estratificada padrão) e respectivamente por regressão logística e regressão de Poisson. As análises estatísticas foram efectuadas em SPSS V20.Resultados: Para a doença rara, o Odds Ratio aproximou-se do Risco Relativo. Quando a doença foi mais frequente, o Odds Ratio sobrestimou o Risco Relativo. Nesta situação, e com a presença de uma variável de confundimento, o Risco Relativo ajustado por regressão de Poisson permitiu obter estimativas mais válidas da razão de riscos que o Odds Ratio ajustado por regressão logística. Os intervalos de confiança do Risco Relativo estimado por regressão de Poisson foram sempre mais largos que os determinados por análise de Mantel-Hanszel.Conclusões: O Odds Ratio e a regressão logística múltipla são procedimentos válidos em estudos caso-controlo e em estudosprospetivos e transversais de natureza exploratória. O Odds Ratio não deve ser interpretado como uma razão de riscos ou razão de prevalências se o resultado de saúde não é raro. A análise de regressão múltipla de Poisson deve ser considerada como alternativa válida à regressão logística múltipla, especialmente em estudos de uma exposição específica.

  19. [Risk Factors for Healthcare Associated Sepsis in Very Low Birth Weight Infants].

    PubMed

    Pereira, Helena; Grilo, Ema; Cardoso, Patrícia; Noronha, Natália; Resende, Cristina

    2016-04-01

    Introdução: As infeções associadas aos cuidados de saúde constituem uma importante causa de morbi-mortalidade neonatal, levando a um aumento do tempo de internamento e consequentemente dos seus custos. O objetivo deste estudo foi avaliar a taxa de incidência de infeções associadas aos cuidados de saúde e os seus principais fatores de risco em recém-nascidos de muito baixo peso. Material e Métodos: Estudo retrospetivo dos recém-nascidos de muito baixo peso internados numa maternidade com apoio perinatal diferenciado, durante um período de 10 anos (2005-2014). Foi analisada a existência de associação entre vários fatores de risco e a ocorrência de infeções associadas aos cuidados de saúde. Resultados: Foram internados 461 recém-nascidos de muito baixo peso. Houve 110 episódios de infeções associadas aos cuidados de saúde em 104 recém-nascidos e 53 episódios de sépsis associada a cateterismo venoso central. A densidade de sépsis foi 7,5/1 000 dias de internamento e a densidade de sépsis associada ao cateterismo venoso central 22,6/1 000 dias de utilização. Os recém-nascidos com infeções associadas aos cuidados de saúde apresentaram uma média de peso ao nascimento e idade gestacional inferior (959 ± 228 g vs 1191 ± 249 g) e (27,6 ± 2 vs 29,8 ± 2,2 semanas), p < 0,001. Após ajuste à idade gestacional e peso ao nascimento verificámos associação entre infeções associadas aos cuidados de saúde e antibioterapia em D1, duração de cateterismo venoso central e da nutrição parentérica. Após regressão logística, mantiveram-se como fatores de risco independentes com significância estatística, a idade gestacional e a duração da nutrição parentérica. Discussão: Os fatores de risco independentes para infeções associadas aos cuidados de saúde foram a idade gestacional e a duração da nutrição parentérica. Conclusão: Por cada semana a mais na idade gestacional o risco de infeções associadas aos cuidados de sa

  20. [Juvenile Pompe disease: retrospective clinical study].

    PubMed

    Loureiro Neves, Filipa; Garcia, Paula Cristina; Madureira, Núria; Araújo, Henriqueta; Rodrigues, Fidjy; Estêvão, Maria Helena; Lacerda, Lúcia; Diogo Matos, Luísa Maria

    2013-01-01

    Introdução: A doença de Pompe ou glicogenose tipo II é uma doença autossómica recessiva por deficiência de maltase ácida. É uma entidade rara, com prevalência de 1/40.000 nas populações holandesa e afro-americana e 1/46000 na população australiana. Embora se distingam três formas de apresentação (infantil, juvenil e do adulto), observa-se um amplo espectro clínico. Em Portugal está disponível terapêutica enzimática de substituição desde 2006.Material e Métodos: Fez-se o estudo retrospetivo de quatro doentes (duas das quais irmãs), baseado na revisão dos processos clínicos.Resultados: Em todas, a doença manifestou-se no segundo ano de vida. O tempo até ao diagnóstico variou entre dois e onze anos. Aquando do diagnóstico, todas apresentavam miopatia com atraso de aquisições motoras e em duas havia hipertrofia miocárdica. A suspeita clínica surgiu por insuficiência respiratória em contexto infeccioso em duas doentes. Em todas havia elevação da creatina quinase e das aminotransferases. Todas evoluíram com insuficiência respiratória crónica por síndrome restritiva. O diagnóstico foi baseado na diminuição da atividade da maltase ácida em fibroblastos (0 a 1,5% do limite inferior do normal). Na biópsia muscular, realizada em três doentes, demonstrou-se acumulação lisossómica de glicogénio. Todas apresentavam a mutação c.1064T > C no exão 6 do gene GAA (glucosidase-alpha-acid), em homozigotia numa delas, associada às mutações c.1666A > G no exão 12 e c.2065G > A no exão 15 nas duas irmãs e à mutação c.380G > T no exão 2 na doente mais nova. Todas iniciaram terapia enzimática de substituiçãologo que disponível, com boa tolerância. A doente mais jovem faleceu pouco depois. As outras mantêm medidas de suporteventilatório e fisioterapia, deslocando-se a mais velha, em cadeira de rodas, mantendo a irmã marcha independente e necessitando a mais nova de andarilho.Conclusão: Os nossos casos incluem

  1. Acute Ischemic Stroke on Cancer Patients, a Distinct Etiology? A Case-Control Study.

    PubMed

    Carrilho Romeiro, Ana; Valadas, Anabela; Marques, José

    2015-01-01

    Introdução: Actualmente ainda não se encontra claramente definido se a etiologia do acidente vascular cerebral isquémico agudo difere entre doentes com e sem cancro. O acidente vascular cerebral isquémico e o cancro apresentam factores de risco comuns. No entanto, a literatura sugere que os doentes com cancro apresentam condições específicas que aumentam o risco de acidente vascular cerebral. O nosso objectivo foi comparar a etiologia do acidente vascular cerebral isquémico entre doentes com cancro e sem cancro. Material e Métodos: Estudo de caso-controlo realizado em doentes internados numa Unidade de acidente vascular cerebral entre Janeiro de 2007 e Dezembro de 2012. Os casos foram definidos como doentes com o diagnóstico concomitante de acidente vascular cerebral isquémico agudo e cancro; os controlos apenas com o diagnóstico de acidente vascular cerebral. Foram comparados entre os grupos: idade, género, factores de risco vasculares e etiologia do acidente vascular cerebral. Resultados: Foram identificados 56 casos, 64,3% do género masculino, com idade média de 71 anos; 21 doentes apresentavam doença neoplásica activa. O cancro gastrointestinal (25,9%) foi o mais frequente. Foram incluídos 151 controlos, emparelhados para a idade e género. A comparação dos factores de risco vasculares entre casos e controlos não revelou diferenças estatisticamente significativas, excepto para a diabetes mellitus, mais frequente no grupo de controlo (16,1% vs 33,8%, p = 0,02). A presença de história de eventos trombóticos prévios foi mais frequente na coorte de doentes com doença neoplásica (8,9% vs 0,7%, p = 0,007). O subtipo de etiologia do acidente vascular cerebral (classificação TOAST) âoutra etiologiaâ foi mais frequente nos doentes com cancro (13,04% vs 0,83%, p < 0,01), e a presença de um estado pró-trombótico foi mais frequente nos doentes com neoplasia activa.Discussão: Os resultados obtidos no nosso estudo permitiram definir dois

  2. Use Computer-Aided Tools to Parallelize Large CFD Applications

    NASA Technical Reports Server (NTRS)

    Jin, H.; Frumkin, M.; Yan, J.

    2000-01-01

    Porting applications to high performance parallel computers is always a challenging task. It is time consuming and costly. With rapid progressing in hardware architectures and increasing complexity of real applications in recent years, the problem becomes even more sever. Today, scalability and high performance are mostly involving handwritten parallel programs using message-passing libraries (e.g. MPI). However, this process is very difficult and often error-prone. The recent reemergence of shared memory parallel (SMP) architectures, such as the cache coherent Non-Uniform Memory Access (ccNUMA) architecture used in the SGI Origin 2000, show good prospects for scaling beyond hundreds of processors. Programming on an SMP is simplified by working in a globally accessible address space. The user can supply compiler directives, such as OpenMP, to parallelize the code. As an industry standard for portable implementation of parallel programs for SMPs, OpenMP is a set of compiler directives and callable runtime library routines that extend Fortran, C and C++ to express shared memory parallelism. It promises an incremental path for parallel conversion of existing software, as well as scalability and performance for a complete rewrite or an entirely new development. Perhaps the main disadvantage of programming with directives is that inserted directives may not necessarily enhance performance. In the worst cases, it can create erroneous results. While vendors have provided tools to perform error-checking and profiling, automation in directive insertion is very limited and often failed on large programs, primarily due to the lack of a thorough enough data dependence analysis. To overcome the deficiency, we have developed a toolkit, CAPO, to automatically insert OpenMP directives in Fortran programs and apply certain degrees of optimization. CAPO is aimed at taking advantage of detailed inter-procedural dependence analysis provided by CAPTools, developed by the University of

  3. Off-Label and Unlicensed Drug Use in Neonatology: Reality in a Portuguese University Hospital.

    PubMed

    Silva, Joana; Flor-de-Lima, Filipa; Soares, Henrique; Guimarães, Hercília

    2015-01-01

    Introdução: Este estudo pretende caracterizar os medicamentos usados numa Unidade de Cuidados Intensivos Neonatais portuguesa, avaliar a frequência do uso de fármacos off-label ou não licenciados de acordo com a informação disponível no Resumo das Caraterísticas do Medicamento e comparar resultados entre recém-nascidos prematuros e de termo.Material e Métodos: Um estudo retrospetivo transversal foi conduzido na nossa Unidade de Cuidados Intensivos Neonatais no primeiro semestre de 2013. Os dados das prescrições realizadas foram comparados com a informação pediátrica contida nos Resumos das Caraterísticas do Medicamento.Resultados: Analisámos 1011 prescrições respeitantes a 84 substâncias ativas, feitas em 218 admissões. Em 42,9% dos casos, os fármacos foram usados de acordo com a informação do Resumo das Caraterísticas do Medicamento; 27,9% dos fármacos eram aprovados para o período neonatal mas usados de forma off-label; medicamentos off-label para a idade neonatal foram usados em 10,1%, enquanto aqueles com estado de aprovação indeterminado ou contraindicados foram usados em 6,0% e 8,7% dos casos, respetivamente. As prescrições não licenciadas representaram 4,4% do total. Os recém-nascidos pré-termo receberam uma taxa superiorde fármacos usados de acordo com o Resumo das Caraterísticas do Medicamento (p < 0,0001), enquanto os de termo receberam mais fármacos off-label para dose/frequência (p < 0,0001) e contraindicados para recém-nascidos (p < 0,012).Discussão: Os prematuros receberam um número mediano de fármacos superior, o que se relaciona com o seu internamento mais prolongado. A principal razão para prescrições off-label foi a utilização de doses/frequências de administração diferentes das referidas no Resumo das Caraterísticas do Medicamento, reforçando a necessidade de atualização destes documentos. A manipulação dosmedicamentos é uma das causas para o seu uso não licenciado, enfatizando a falta de

  4. [Pulmonary aspergilloma surgery: a mono-institutional experience].

    PubMed

    Correia, Sílvia da Silva; Pinto, Carlos; Bernardo, João

    2014-01-01

    Introdução: O aspergiloma ou micetoma é resultado da colonização saprofítica de uma cavidade pulmonar pelo Aspergillus. A cirurgia do aspergiloma é o único tratamento eficaz a longo prazo mas a alta incidência de complicações no intra e no pós-operatório fazem desta um tema controverso. Objetivos: Análise da experiência de um Centro de Cirurgia Cardiotorácica nos doentes com aspergiloma pulmonar e avaliação dos fatores que influenciaram o prognóstico após a terapêutica cirúrgica. Material e Métodos: Análise retrospetiva incluindo todos os doentes com diagnóstico de aspergiloma pulmonar sujeitos a cirurgia de ressecção durante um período de 10 anos numa instituição (Junho 2001- Junho 2011). Resultados: Foram incluídos 22 doentes (18 homens), com idade média de 51,0 + 17,4 anos. Destes, 46% dos doentes apresentavam hábitos tabágicos, 41% hábitos alcoólicos acentuados e 50% história pessoal de tuberculose. A maioria dos doentes apresentava um aspergiloma complexo (73%) e 17% um aspergiloma simples. A apresentação clínica mais frequente foi a hemoptise (50%). O procedimento cirúrgico consistiu em ressecção pulmonar atípica em 55%, lobectomia em 27% e pneumectomia em 9%. Dois doentes foram submetidos a toracoplastia. A mortalidade operatória foi de 5% (um doente). Em 36% dos doentes houve complicações no pós-operatório sendo as mais frequentes o pneumotórax (18%) e o empiema (18%). O follow-up médio foi de 52 meses (3 - 116) e a mortalidade aos cinco anos foi de 35%. Destes, quatro doentes faleceram por causas não relacionadas e três eram doentes imunodeprimidos. A mortalidade nos aspergilomas simples foi de 40% e 33% nos aspergilomas complexos. Discussão: A abordagem cirúrgica mais frequente foi a ressecção pulmonar atípica. A taxa de complicações foi sobreponível à da literatura. Conclusão: O tratamento cirúrgico do aspergiloma pulmonar apresenta uma baixa morbilidade e mortalidade pelo que permanece o

  5. [Prevalence of Pre-Obesity/Obesity in Pre and Basic School Children at Vila Nova de Gaia, Portugal].

    PubMed

    Camarinha, Bárbara; Graça, Pedro; Nogueira, Paulo Jorge

    2016-01-01

    Introdução: Mais de 30% das crianças portuguesas apresentam excesso de peso. Sendo um grave problema de saúde pública com múltiplas causas, só uma ação intersectorial e concertada poderá contribuir para a sua resolução. As autarquias possuem um conjunto de competências que as tornam ideais para uma intervenção eficaz na luta contra este problema. Para essa ação ser efetiva é necessária uma avaliação local da dimensão do problema e sua distribuição espacial. O objetivo deste estudo foi caracterizar, do ponto de vista da prevalência de excesso de peso, a população do pré-escolar e primeiro ciclo do ensino básico sob responsabilidade da autarquia de Vila Nova de Gaia, o terceiro município mais populoso do país. Material e Métodos: Avaliaram-se 8 974 crianças do pré-escolar e primeiro ciclo do ensino básico do município, no ano letivo 2013/14. A avaliação do estado nutricional da amostra foi feita com recurso às medidas antropométricas peso e altura. Na classificação do estado nutricional considerou-se os percentis ou z-scores do índice de massa corporal para a idade de acordo com os critérios definidos pela Organização Mundial de Saúde, Centers for Disease Control and Prevention e pela International Obesity Task Force. Resultados: A prevalência de excesso de peso pelo critério da Organização Mundial da Saúde foi de 37,4%. Identificaram-se disparidades na distribuição do excesso de peso nas escolas do concelho. Discussão: Os resultados encontrados foram ligeiramente superiores aos de outros estudos nacionais e internacionais, podendo a abrangência amostral justificar as diferenças encontradas. Conclusão: A prevalência encontrada é elevada e de distribuição aparentemente distinta a nível espacial, o que poderá contribuir para a identificação dos principais determinantes do problema a nível local.

  6. Prevalence of Late Preterm and Early Term Birth in Portugal.

    PubMed

    Barros, Joana G; Clode, Nuno; Graça, Luís M

    2016-04-01

    Introdução: Nos últimos anos, vários autores evidenciaram a morbilidade associada aos partos ocorridos entre as 34 e 36 semanas (pré-termo tardio) e entre as 37 e 38 semanas de gestação (termo precoce). Neste sentido, pretendemos realizar um estudo epide-miológico dos partos que ocorrem nestas idades gestacionais, em Portugal. Material e Métodos: Realizámos um inquérito, que foi aplicado a todos os hospitais públicos de Portugal, acerca da prevalência e via de parto nos partos pré-termo tardios e de termo precoce, e morbilidade e mortalidade neonatal associada. As questões referiam-se apenas a gestações de feto único e a partos ocorridos em 2013. Resultados: Incluímos 14 hospitais, correspondendo a 33,5% dos partos ocorridos em Portugal, em 2013. Verificámos que 5,4% dos partos ocorreram no período pré-termo tardio e 27% no termo precoce. Aproximadamente dois terços dos partos pré-termo tardio e três quartos dos partos de termo precoce foram espontâneos. A taxa de cesariana foi mais elevada entre as 34 e 36 semanas de gestação (39,1%) do que entre as 37 e 38 semanas (26,4%). As complicações neonatais foram mais frequentes após um parto pré-termo tardio (34,2%), quando comparadas com os de termo precoce (14,2%). Discussão: Na nossa amostra, a prevalência de parto pré-termo tardio e de termo precoce, ainda que ligeiramente inferior, é comparável à publicada em estudos anteriores. Conclusão: Á importante que a comunidade obstétrica nacional adote atitudes no sentido de limitar os partos antes das 39 semanas de gestação. Assim, nestas idades gestacionais os partos devem possuir uma indicação médica válida.

  7. Construção de um catálogo de aglomerados abertos para estudo da dinâmica da estrutura espiral da Galáxia

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Carlos, I. M.; Lépine, J. R. D.

    2003-08-01

    Os aglomerados abertos são objetos de grande valor para o estudo da dinâmica da Galáxia devido esses objetos terem uma faixa de idade relativamente ampla. O trabalho visa estudar a dinâmica da estrutura espiral da Galáxia principalmente através do uso desses aglomerados, uma vez que o estudo da cinemática desses objetos é fundamental para esse objetivo. Nosso grupo trabalha no sentido de construir uma base de dados de aglomerados abertos contendo coordenadas, distância, idade, movimentos próprios e velocidades radiais e já disponibiliza uma nova versão do catálogo de aglomerados abertos o qual é uma compilação de edições anteriores, principalmente Lynga (1987), Mermilliod (1995) e ESO-B (Lauberts 1982). Nossa amostra possui cerca de 1630 aglomerados, mas nem todos os parâmetros acima citados foram determinados em sua totalidade. Para determinarmos esses parâmetros, derivamos as cores intrínsecas das estrelas membro de cada aglomerado a partir de seus tipos espectrais (busca feita no SIMBAD) obtendo assim o excesso de cor individual. A distribuição dos excessos de cor foi então utilizada para derivarmos o avermelhamento médio para cada aglomerado. De maneira similar, os tipos espectrais foram usados para estimar as magnitudes absolutas, e com as magnitudes absolutas e aparentes determinamos a respectiva distribuição do módulo de distância e finalmente a distância. Para determinar as idades foram confeccionados os diagramas cor-magnitude das estrelas de cada aglomerado onde foram superpostas a Seqüência Principal de Idade Zero (ZAMS). Superpomos a ZAMS de Schmidt-Kaler e isócronas de composição solar. Essas isócronas foram usadas para determinação das idades dos aglomerados. Uma vez que não temos ainda resultados finais, apresentamos então alguns diagramas cor-magnitude os quais foram usados para determinação, principalmente, da distância e idade dos aglomerados.

  8. Abundâncias em estrelas de Bário

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Allen, D. M.

    2003-08-01

    Estrelas de Bário apresentam linhas intensas de elementos produzidos pelo processos (ex: Ba, Y, Sr, Zr) e bandas intensas de CN, C2 e CH. A hipótese mais aceita sobre a origem deste grupo peculiar é a de que essas estrelas façam parte de sistemas binários, tendo recebido material enriquecido em elementos pesados da companheira mais evoluída. Apresentamos neste trabalho uma análise detalhada de uma amostra de estrelas desta classe, incluindo determinação de parâmetros atmosféricos e cálculo de abundâncias. As temperaturas efetivas foram determinadas a partir de dados fotométricos obtidos com o Fotrap instalado no telescópio Zeiss do LNA (Laboratório Nacional de Astrofísica) (B-V, V-I, R-I, V-R), e coletados na literatura nos catálogos Hipparcos (B-V), 2MASS (Two Micron All Sky Survey) (V-K) e The General Catalogue Photometric Data (sistema Geneva). Obtivemos uma faixa de temperaturas de 4400 £ Tef £ 6500. As metalicidades foram determinadas a partir de linhas de Fe I e Fe II, estando os resultados no intervalo -1 £ [Fe/H] £ +0.1. O log g foi determinado pelo equilíbrio de ionização e pela relação com a magnitude bolométrica, a temperatura e a massa, sendo os resultados na faixa 1.5 £ log g £ 4.5. As distâncias utilizadas foram determinadas com o auxílio das paralaxes Hipparcos, e as massas determinadas por modelos de isócronas. Os espectros utilizados foram obtidos com o espectrógrafo FEROS no Telescópio de 1,5m do ESO (European Southern Observatory). As abundâncias foram calculadas por meio de síntese espectral de linhas individuais incluindo elementos alfa, pico do Fe, s e r. Encontramos um excesso de elementos pesados em relação ao Fe, como esperado para estrelas de Bário.

  9. [Development and Validation of the National Functionality Table for Chronic Diseases].

    PubMed

    Pereira, Carla Sandra; Banco, Jaime; Lopes, Manuel; Escoval, Ana; Nogueira, Paulo; Diniz, José Alexandre; Guerra, Fernando; Coelho, Anabela

    2016-02-01

    Introdução: A avaliação sistemática e registo da funcionalidade de pessoas adultas com doença crónica permite horizontalizar políticas de saúde, sociais e emprego de acordo com a funcionalidade; dotar os profissionais de saúde e sociais de um instrumento de recolha de informação, que complemente os registos de doença; medindo os ganhos de funcionalidade. O objetivo de estudo foi desenvolver uma Tabela Nacional de Funcionalidade para adultos em idade ativa com doença crónica, de acordo com a Classificação Internacional de Funcionalidade, Incapacidade e Saúde da Organização Mundial de Saúde. Material e Métodos: Recorremos a métodos quantitativos e qualitativos; revisão da literatura (17 artigos), grupo focal (nove peritos), painel de Delphi (16 peritos) e estudo exploratório (309 pessoas com doença crónica). Resultados: Na revisão da literatura, foram identificadas 67 atividades limitadas na população em estudo das quais foram selecionadas 40 atividades pelo grupo focal e 38 validadas pelo painel de Delphi. Discussão: Para testar as propriedades psicométricas comparamos o valor médio de todos os coeficientes possíveis do tipo consistência interna (split-half). Na análise da discriminação dos níveis de funcionalidade em amostras diferentes, verificou-se a igualdade de vari'ncias pelo teste de Levene e a igualdade de média por recurso ao teste t. De acordo com a observação e análise do coeficiente α de Cronbach, verificou-se que a Tabela Nacional de Funcionalidade proposta apresenta bons níveis de fiabilidade. Na análise de componentes principais, identificaram-se cinco dimensões. Conclusão: A referida tabela tem características psicométricas apropriadas no que diz respeito à consistência, fiabilidade e validade interna.

  10. Prevalence of tinnitus in elderly individuals with and without history of occupational noise exposure.

    PubMed

    Melo, Juliana Jandre; Meneses, Caroline Luiz; Marchiori, Luciana Lozza de Moraes

    2012-04-01

    Introdução: A variedade de alterações metabólicas e circulatórias relacionadas com o ruído pode causar o aparecimento de inúmeros sintomas auditivos, incluindo, zumbido.Objetivo: O objetivo do estudo foi avaliar a prevalência de queixa de zumbido, em idosos com e sem história de exposição ao ruído ocupacional.Método: Forma de estudo prospectivo foi realizado em uma amostra populacional com 502 indivíduos com idade superior a 60 anos, através de questionário padronizado e avaliação audiológica. As variáveis estudadas foram frequência de queixa de zumbido e de e história de ruído ocupacional. Foi usada regressão logística para controlar confusão ou modificação de efeito para as outras variáveis sobre as associações de interesse.Resultado e Discussão: A queixa de zumbido foi verificada em 50% dos idosos com história de exposição ao ruído ocupacional e em 40,43% dos idosos sem história de exposição ao ruído ocupacional. Uma alta frequência de queixa de zumbido foi detectada na população sob investigação, porém não houve significativa diferença estatística entre a queixa de zumbido e história de ruído ocupacional.Conclusão: O resultado desta pesquisa pode ter ocorrido devido à existência de outros fatores que podem ter contribuído para a presença de zumbido, como a própria idade, nos indivíduos sem história de exposição ao ruído ocupacional.

  11. [Suicidal Behavior among Portuguese Psychiatry Trainees: Comparison with the European Situation].

    PubMed

    Gama Marques, João; Roberto, Alice; Guerra, Cátia; Pinto da Costa, Mariana; Podlesek, Anja; Beezhold, Julian; Jovanovic, Nikolina; Moscoso, Ana

    2015-01-01

    Introdução: O objectivo deste trabalho foi avaliar a prevalência de ideação suicida e tentativas de suicídio nos médicos internos de psiquiatria de adultos e de psiquiatria da infância e da adolescência em Portugal, e comparar os resultados com a população geral portuguesa e de outros países europeus. Material e Métodos: Enviou-se um questionário estruturado e anónimo, por e-mail, aos 159 internos de psiquiatria de adultos e de psiquiatria da infância e da adolescência do país, questionando antecedentes pessoais de ideação suicida e tentativas de suícidio, bem como antecedentes familiares de tentativas de suicídio falhadas e consumadas. Estas questões fazem parte do Estudo BoSS (Burnout Syndrome Study) realizado em 21 países. A análise dos dados foi feita através do programa informático SPSS v. 19. Resultados: Responderam parcialmente ao questionário 62 internos (40,3%) e 46 (29%) responderam ao questionário na totalidade, constituindo assim a amostra. O ratio feminino:masculino foi de 2:1 e a média de idade de 29 anos. A ideação suicida estava presente na forma passiva em 44% dos inquiridos e na forma activa em 33%; 4,3% referiu tentativas de suicídio prévias. Em relação à história familiar, registou-se 22% de tentativas de suicídio e 13% de suicídio consumado.Discussão: Os resultados obtidos são preocupantes e podem estar associados a factores específicos a que esta população está exposta. Conclusão:ã necessária uma investigação mais aprofundada para se compreender melhor este fenómeno, respectivas causas e potenciais modificadores.

  12. Aquisição de Estreptococos Mutans e Desenvolvimento de Cárie Dental em Primogênitos

    PubMed Central

    NOCE, Erica; RUBIRA, Cassia Maria Fischer; da Silva ROSA, Odila Pereira; da SILVA, Salete Moura Bonifácio; BRETZ, Walter Antonio

    2011-01-01

    Objetivo Avaliar o momento de aquisição de estreptococos mutans (EM), desenvolvimento de cárie dental e as variáveis a eles associadas no decorrer de 23 meses, em primogênitos de famílias de baixo nível socioeconômico, desde os sete meses de idade. Método A amostra foi selecionada com base em mães densamente colonizadas por EM, incluindo todos os membros de 14 famílias que conviviam na mesma casa. Foram envolvidos no estudo 14 mães, pais e primogênitos e 8 parentes, na maioria avós. Exames clínicos e radiográficos iniciais determinaram os índices de cárie e condição periodontal dos adultos. Contagens de EM foram feitas em todos os adultos nas duas primeiras visitas. Nas crianças foram avaliados os níveis de EM, o número de dentes e de cáries, em quatro visitas. Resultados A prevalência de EM nos adultos foi alta, estando ausente em apenas um dos pais. EM foram detectados em 1, 2, 3 e 10 crianças, respectivamente nas visitas #1, 2, 3 e 4. A cárie dental foi detectada em apenas três crianças na última visita (aos 30 meses de idade), as quais apresentaram escores de EM significantemente maiores que as crianças sem cárie, na mesma visita. Conclusão Exclusivamente a condição social de baixa renda e mães densamente colonizadas por EM não são sinônimo de colonização precoce e alta atividade de cárie em crianças cuidadas em casa. O desenvolvimento de cárie está significantemente associado a escores elevados de EM nas crianças. PMID:22022218

  13. Nebulosas planetárias galácticas: idades e cinemática

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Lago, L. G.; Maciel, W. J.

    2003-08-01

    As nebulosas planetárias são formadas a partir de estrelas com massas entre 0.8 e 8 massas solares na sequência principal, formando um conjunto de objetos com idades e populações diferentes. Esse fato torna as nebulosas interessantes ao estudo da rotação galáctica, uma vez que as populações mais jovens devem estar claramente associadas ao disco fino da Galáxia, enquanto que as populações mais velhas estariam associadas ao disco espesso ou mesmo ao halo galáctico. Neste trabalho, utilizamos uma grande amostra de nebulosas com velocidades radiais conhecidas para determinar a curva de rotação da Galáxia. Para minimizar os erros decorrentes das incertezas nas distâncias, usamos quatro diferentes escalas estatísticas. Para a atribuição da idade dos objetos, utilizamos o método proposto recentemente por Maciel et al. (Astron. Astrophys. 397, 667, 2003), em um estudo da variação temporal dos gradientes de abundâncias. Com esse método, é possível obter uma classificação das nebulosas por grupos de idade, totalmente independente de outros sistemas de classificação, uma vez que as idades são estimadas individualmente, a partir das metalicidades das nebulosas. Nossos resultados são comparados com as previsões dos tipos de Peimbert, e mostram que os desvios médios das curvas obtidas são sensivelmente menores nos casos dos objetos mais jovens, associados ao disco fino, com relação aos objetos mais velhos do disco espesso, levando à determinação de uma curva de rotação semelhante à dos objetos de população I jovem. (CNPq)

  14. [Career Satisfaction of Medical Residents in Portugal].

    PubMed

    Martins, Maria João; Laíns, Inês; Brochado, Bruno; Oliveira-Santos, Manuel; Teixeira, Pedro Pinto; Brandão, Mariana; Cerqueira, Rui João; Castro-Ferreira, Ricardo; Bernardes, Carlos; Menezes, Miguel Nobre; Baptista, Bernardo Soares; Ladeiras-Lopes, Ricardo; Rei, Mariana Cruz; Rosa, Gilberto Pires da; Martins, José Luís; Mendonça Sanches, Maria; Ferreira-Pinto, Manuel J; Rato, Margarida; Costa e Silva, Miguel; Policiano, Catarina; Beato, João; Barbosa-Breda, João; Torres, João Pimentel; Leal, Inês; Rosa, Sílvia Aguiar; Ribeiro, Bárbara Carvalho; Costa, Francisco Rego; Palmela, Carolina; Gonçalves, Tiago Cúrdia; Morais, Luis; Marques, Tiago Reis

    2015-01-01

    Introdução: A satisfação com a profissão médica tem sido apontada como um fator essencial para a qualidade assistencial, o bemestar dos doentes e a estabilidade dos sistemas de saúde. Estudos recentes têm vindo a enfatizar um crescente descontentamento dos médicos, principalmente como consequência das alterações das relações laborais.Objetivos: Avaliar a perceção dos médicos de formação específica em Portugal, sobre as expectativas e grau de satisfação com a profissão, especialidade e local de formação; razões da insatisfação e intenção de emigrar.Material e Métodos: Estudo transversal. A colheita de dados foi efetuada entre Maio e Agosto de 2014 através de um Inquérito online sobre a âÄúSatisfação com a EspecialidadeâÄù.Resultados: De uma população total de 5788 médicos, foram obtidas 804 respostas (12,25% do total de médicos internos). Desta amostra, 77% das respostas correspondem a internos dos três primeiros anos de formação. Verificou-se que 90% dos médicos se encontram satisfeitos com a especialidade, tendo-se encontrado também níveis elevados de satisfação com a profissão (85%) e local de formação (86%). Por outro lado, constatou-se que estes diminuíam com a progressão ao longo dos anos de internato. A avaliação global sobre o panorama da prática médica foi negativa e 65% dos médicos responderam que consideram emigrar após conclusão do internato.Conclusão: Os médicos internos em Portugal apresentam níveis positivos de satisfação com a sua profissão. No entanto, a sua opinião sobre o panorama da Medicina e os resultados relativos à intenção de emigrar alertam para a necessidade de tomada de medidas para inverter este cenário.

  15. BUDDA (Bulge/Disk Decomposition Analysis) - um novo programa para análise estrutural de galáxias

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Gadotti, D. A.; de Souza, R. E.; Dos Anjos, S.

    2003-08-01

    Tem sido prática comum nos últimos anos estudar a distribuição de luminosidade em galáxias fazendo uso da informação contida em toda a imagem da galáxia, já que esta técnica tem se mostrado muito mais confiável do que o simples ajuste de perfis radiais de luminosidade. Através destes estudos bidimensionais, melhores resultados tem sido obtidos na análise e.g. do Plano Fundamental, de correlações entre os parâmetros estruturais de galáxias, de sub-estruturas como barras e anéis nucleares etc. Apresentamos um novo código bidimensional, o BUDDA, de análise estrutural de galáxias, que será disponibilizado para a comunidade. Desenvolvido por nós, o código determina os parâmetros estruturais de galáxias de forma prática e robusta, e pode ser aplicado genericamente em qualquer estudo sobre a formação, evolução e estrutura de galáxias. O programa ainda permite a avaliação direta de sub-estruturas, através de imagens residuais que são obtidas ao se subtrair, das imagens originais, bojo e disco sintéticos que melhor representam essas componentes da galáxia sob consideração. Será apresentada a forma de utilização do código, bem como séries de testes que atestam a sua funcionalidade. Além disso, os resultados da aplicação do código em uma amostra de 51 galáxias serão expostos como exemplo prático, e do seu enorme potencial de uso.

  16. Novas determinações dos parâmetros atmosféricos das estrelas anãs brancas DA

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Giovannini, O.; Costa, A. F. M.; Kepler, S. O.

    2003-08-01

    Nós temos selecionado uma amostra de estrelas anãs brancas DA (atmosfera de hidrogênio) a partir dos índices de Strömgren cujos valores estão próximos a região de instabilidade das estrelas anãs brancas DA variáveis, as chamadas estrelas DAV ou ZZ Ceti. O objetivo é determinar os parâmetros fundamentais (temperatura efetiva, Teff, aceleração da gravidade, log g, e massa) destas estrelas para verificar quais os parâmetros estelares estão envolvidos com o mecanismo de pulsação das estrelas DAV. Nós obtemos, até agora, mais de 120 espectros óticos de estrelas DA. Entre as estrelas selecionadas há 20 estrelas variáveis (DAV). Assim, podemos verificar se existem ou não estrelas não variáveis dentro da faixa de instabilidade das estrelas ZZ Ceti. Neste trabalho nós apresentamos a determinação dos parâmetros atmosféricos (temperatura efetiva, Teff, e aceleração da gravidade, log g) das estrelas anãs brancas DA usando os novos modelos de atmosfera ML2/a = 0.6. Estes modelos têm sido utilizados recentemente por fornecerem uma excelente consistência interna na determinação das temperaturas nas regiões do ultra-violeta e ótico. Os parâmetros atmosféricos são determinados espectroscopicamente através da comparação do fluxo de energia das linhas de Balmer (Hb à H9) entre os espectros observados e sintéticos (gerados pelos modelos de atmosfera). As temperaturas obtidas com os novos modelos são, em geral, menores (~ 1000 K menos) que as temperaturas determinadas anteriormente, com modelos ML1. Os valores de log g não mudaram significativamente (menos de 10%). A faixa de instabilidade das DAVs está entre 11000 e 13000 K, consistente com dados de outros autores.

  17. Vínculos observacionais para o processo-S em estrelas gigantes de Bário

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Smiljanic, R. H. S.; Porto de Mello, G. F.; da Silva, L.

    2003-08-01

    Estrelas de bário são gigantes vermelhas de tipo GK que apresentam excessos atmosféricos dos elementos do processo-s. Tais excessos são esperados em estrelas na fase de pulsos térmicos do AGB (TP-AGB). As estrelas de bário são, no entanto, menos massivas e menos luminosas que as estrelas do AGB, assim, não poderiam ter se auto-enriquecido. Seu enriquecimento teria origem em uma estrela companheira, inicialmente mais massiva, que evolui pelo TP-AGB, se auto-enriquece com os elementos do processo-s e transfere material contaminado para a atmosfera da atual estrela de bário. A companheira evolui então para anã branca deixando de ser observada diretamente. As estrelas de bário são, portanto, úteis como testes observacionais para teorias de nucleossíntese pelo processo-s, convecção e perda de massa. Análises detalhadas de abundância com dados de alta qualidade para estes objetos são ainda escassas na literatura. Neste trabalho construímos modelos de atmosferas e, procedendo a uma análise diferencial, determinamos parâmetros atmosféricos e evolutivos de uma amostra de dez gigantes de bário e quatro normais. Determinamos seus padrões de abundância para Na, Mg, Al, Si, Ca, Sc, Ti, V, Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, Sr, Y, Zr, Ba, La, Ce, Nd, Sm, Eu e Gd, concluindo que algumas estrelas classificadas na literatura como gigantes de bário são na verdade gigantes normais. Comparamos dois padrões médios de abundância, para estrelas com grandes excessos e estrelas com excessos moderados, com modelos teóricos de enriquecimento pelo processo-s. Os dois grupos de estrelas são ajustados pelos mesmos parâmetros de exposição de nêutrons. Tal resultado sugere que a ocorrência do fenômeno de bário com diferentes intensidades não se deve a diferentes exposições de nêutrons. Discutimos ainda efeitos nucleossintéticos, ligados ao processo-s, sugeridos na literatura para os elementos Cu, Mn, V e Sc.

  18. Biochemical and biophysical investigation of surfactant in neonatal gastric aspirate at birth.

    PubMed

    Bangyozova, Maya; Jordanova, Albena; Tsanova, Asya; Jekova, Neli; Chakarov, Decho; Doumanov, Jordan; Christova, Emilia; Lalchev, Zdravko

    2013-01-01

    Introdução: A melhor abordagem para detecção de deficiência de surfactante em recém-nascidos prematuros no nascimento permanece pouco clara e a decisão de aplicar surfactante exógeno é baseada principalmente no desenvolvimento de sinais clínicos e radiológicos da síndrome de angústia respiratória neonatal (NRDS). Objetivos: Estudamos as propriedades bioquímicas e biofísicas do aspirado gástrico (GA) de crianças nascidas prematuramente com NRDS e saudáveis nascidos a termo, com o objetivo de encontrar um método acessível para avaliação da maturidade do surfactante no nascimento. Material e Métodos: Quarenta e sete recém-nascidos, divididos em dois grupos foram incluídos no estudo. O primeiro grupo composto por 34 crianças saudáveis nascidas a termo (após 37 semanas de gestação). O segundo grupo incluiu 13 recém-nascidos prematuros (idade entre 26 - 32 semanas de gestação) desenvolveram sinais clínicos de NRDS para os quais foram tratados por ventilação assistida e surfactante exógeno. A análise bioquímica da proteína e lipídio da GA coletado no nascimento foi realizado. A composição de ácidos graxos das amostras GA foi determinada pelo detector de cromatografia de massa seletiva (GS-MSD) análise. As características da superfície (de equilíbrio, os valores máximo e mínimo de tensão de superfície) das amostras de AG foram medidos utilizando o método de gota pendente. Os dados foram comparados entre os grupos, utilizando o teste t de Student ou teste de Mann-Whitney análise. Os valores foram considerados significativamente diferentes se o valor de p ≤ 0,05. Resultados: A concentração média de fosfolipídeos em GA dos prematuros foi menor (295,7 g / ml vs 374,5 mg / ml) do que em crianças a termo e do conteúdo médio de proteína foi menor no GA dos bebês prematuros que o termo recém-nascidos (574,5 ng / ml vs 641,5 ug / ml). A medição das características de superfície dinâmicas da GA mostraram

  19. [Gonadal function in Turner syndrome].

    PubMed

    Alves, Márcia; Bastos, Margarida; Almeida Santos, Teresa; Carrilho, Francisco

    2013-01-01

    Introdução: A síndrome de Turner caracteriza-se pela ausência, parcial ou total, de um cromossoma X no sexo feminino, sendo uma das cromossomopatias mais frequentes. O diagnóstico é realizado através do cariótipo e as suas manifestações incluem o hipogonadismo primário, antes ou após a puberdade (disgenesia gonadal). O grau de disfunção e a extensão dos defeitos gonadais são variáveis.Objectivos: Pretendeu-se avaliar a clínica, cariótipo, função gonadal e características ecográficas do útero e ovários de mulheres com síndrome de Turner.Material e Métodos: Estudo retrospectivo de doentes com síndrome de Turner, seguidas nos Serviços de Endocrinologia ou Reprodução Humana dos Hospitais da Universidade de Coimbra - Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra, E.P.E. Avaliou-se toda a amostra e consideraram-se o grupo 1 (com puberdade e menarca espontânea) e grupo 2 (sem puberdade espontânea). Parâmetros avaliados: idade do estudo inicial, puberdade, cariótipo, FSH, ecografia pélvica inicial e pós-pubertária, celioscopia e indução pubertária. Estudo estatístico: SPSS (20.0).Resultados: Amostra: 79 doentes, 14,7 ± 6,6 anos. Ausência de sinais pubertários em 57,1%, amenorreia primária 67,1% e secundária 6,6%. Cariótipo: monossomia X-37,2%, mosaico-37,2%, alterações estruturais de X-25,6%. Mediana da FSH 59,5mUI/mL. Ecografia inicial: útero normal-34,2%, atrófico-65,8%; ovários normais-21,6%, atróficos-78,4%, com folículos-5,1%. Ecografia pós-pubertária: útero normal-67,9%, atrófico-32,1%; ovários normais-36,4%, atróficos-63,6%. A laparoscopia realizada em 16 (20,3%) doentes confirmou os achados ecográficos. Duas mulheres com puberdade induzida engravidaram: uma espontaneamente, sem evolução; outra pordoação de ovócitos, evolutiva. Grupo 1 (com puberdade e menarca espontânea): 20 (25,3%) doentes, 16,1 ± 8,9 anos. Puberdade na avaliação inicial: M1-22,2%, M2-33,3%, M3-16,7%, M4-16,7%, M5-11,1%. Cari

  20. Establishing the Empirical Relationship Between Non-Science Majoring Undergraduate Learners' Spatial Thinking Skills and Their Conceptual Astronomy Knowledge. (Spanish Title: Estableciendo Una Relación Empírica Entre el Razonamiento Espacial de los Estudiantes de Graduación de Carreras no Científicas y su Conocimento Conceptual de la Astronomía.) Estabelecendo Uma Relação Empírica Entre o RacioCínio Espacial dos Estudantes de Graduação EM Carreiras Não Científicas e Seu Conhecimento Conceitual da Astronomia

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Heyer, Inge; Slater, Stephanie J.; Slater, Timothy F.

    2013-12-01

    normalizadas, en el desempeño de los estudiantes en estos dos asuntos foram pequenas, 0.26 e 0.13 respectivamente. El razonamiento espacial de los estudiantes fue medido utilizando un instrumento específico desarrollado para este trabaljo. Las correlaciones entre los resultados de los tests astronómicos y este instrumento específico, antes y después del curso mostraron una relación entre moderada y fuerte, sugiriendo que la relación entre el razonamiento espacial y el conocimiento astronómico puede explicar hasta un 25% de la variación em el desempeño de los estudiantes. A comunidade da educação em astronomia tem suposto de forma implícita que o aprendizado da astronomia consiste em um domínio conceitual fundamentado no raciocínio espacial. Como um primeiro passo para identificar formalmente uma relação empírica entre estas duas coisas, utilizamos como amostra os estudantes de graduação de carreiras não científicas de um curso exploratório em uma universidade norte-americana do meio-oeste de médio porte com programa de Doutorado em andamento, onde estes estudantes foram submetidos a um diagnóstico de raciocino espacial e conceitos astronômicos antes e depois do mesmo. As ferramentas utilizadas foram o Test Of Astronomy Standards (TOAST) e o questionário What do you know? Utilizando somente dados completamente consistentes para esta análise, nossa amostra consistiu de 86 estudantes de graduação. As melhoras, depois de normalizadas, do desempenho dos estudantes nos dois quesitos foram pequenas, 0.26 e 0.13 respectivamente. O raciocínio espacial dos estudantes foi medido utilizando um instrumento específico desenhado para este trabalho. As correlações entre os resultados dos testes astronômicos e este instrumento específico antes e depois do curso mostraram uma relação entre moderada e forte, sugerindo que a relação entre o raciocínio espacial e o conhecimento astronômico pode explicar até um 25% na variação no desempenho dos

  1. Petascale Computing Enabling Technologies Project Final Report

    SciTech Connect

    de Supinski, B R

    2010-02-14

    simple initial model. Our investigations demonstrated that a poor default memory allocation mechanism degraded performance. We developed a prototype NUMA library to provide generic mechanisms to overcome these issues, resulting in significantly improved OpenMP performance. After additional testing, we will make this library available to all users, providing a simple means to improve threading on LLNL's production Linux platforms. We also made progress on developing new scalable algorithms that target multicore nodes. We designed and implemented a new AMG interpolation operator with improved convergence properties for very low complexity coarsening schemes. This implementation will also soon be available to LLNL's application teams as part of the hypre library. We presented results for both topics in an invited plenary talk entitled 'Efficient Sparse Linear Solvers for Multi-Core Architectures' at the 2009 HPCMP Institutes Annual Meeting/CREATE Annual All-Hands Meeting. The interpolation work was summarized in a talk entitled 'Improving Interpolation for Aggressive Coarsening' at the 14th Copper Mountain Conference on Multigrid Methods and in a research paper that will appear in Numerical Linear Algebra with Applications. In the area of code correctness, we significantly extended our behavior equivalence class identification mechanism. Specifically, we not only demonstrated it works well at very large scales but we also added the ability to classify MPI tasks not only by function call traces, but also by specific call sites (source code line numbers) being executed by tasks. More importantly, we developed a new technique to determine relative logical execution progress of tasks in the equivalence classes by combining static analysis with our original dynamic approach. We applied this technique to a correctness issue that arose at 4096 tasks during the development of the new AMG interpolation operator discussed above. This scale isat the limit of effectiveness of

  2. The Science Teachers and Their way of Thinking about Astronomy. (Spanish Title: Los Profesores de Ciencias y Sus Formas de Pensar la Astronomía.) Os Professores de Ciências e Suas Formas de Pensar a Astronomia

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Leite, Cristina; Hosoume, Yassuko

    2007-12-01

    ómicos y la estructura espacial del montaje del Universo son características fundamentales. Muchos indican Sol y estrellas como cosas distintas: el Sol es un objeto caliente y las estrellas son frías. Esos resultados nos preocupan y ciertamente señalan una urgencia de programas de formación continuada para profesores en el contenido de astronomía, pues los PCN's (Parámetros Curriculares Nacionales) recomiendan con énfasis la enseñanza de este contenido. O modo de pensar dos professores de Ciências do ensino fundamental sobre os elementos da Astronomia é o objeto de pesquisa presente neste artigo, cuja metodologia consiste em entrevistas semiestruturadas, filmadas em vídeo e centradas numa perspectiva tridimensional dos elementos astronômicos, possibilitando um mapeamento das concepções das formas e das dimensões da Terra, do Sol, da Lua, dos planetas e das estrelas, bem como da concepção de céu e de Universo como um todo. Os resultados indicam um Universo contendo: Sol, estrelas, planetas e Lua, onde o Sistema Solar é parte do todo. Algumas vezes o Universo é concebido como o próprio Sistema Solar. Os objetos estão no céu ou no Universo o qual, para muitos, se restringe ao espaço que está acima da Terra. A forma plana dos objetos astronômicos e a estrutura espacial da montagem do Universo são características marcantes. Muitos indicam Sol e estrelas como coisas diferentes: Sol é um objeto quente e as estrelas são frias. Esses resultados nos preocupam e certamente sinalizam uma urgência de programas de formação continuada para professores no conteúdo de astronomia, uma vez que os PCN's indicam fortemente o ensino desse conteúdo.

  3. Practical Astronomical Activities during Daytime. (Spanish Title: Actividades Astronómicas Prácticas Diurnas.) Atividades Astronômicas Práticas Diurnas

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Jackson, Eric

    2009-12-01

    aulas. Se a Astronomia ia ser introduzida, então era preciso encontrar uma forma de resolver essas dificuldades. Nosso grupo, trabalhando com professores e alunos numa abordagem construtivista, encontrou que os princípios da Astronomia podem ser descobertos durante o dia, enquanto os alunos estão na escola. Trabalhando de forma cooperativa os alunos mediram e registraram observações de suas próprias sombras causadas pelos movimentos da estrela mais próxima, o Sol, e nosso planeta Terra. Devido ao fato de os alunos se envolverem muito pessoalmente nas atividades, eles ficaram muito mais interessados nos resultados do estudo. A Astronomia passou a ser um desafio para o professor e seus alunos quando aplicaram suas experiências diurnas à observação noturna desde suas casas, relatada depois em sala de aula.

  4. [Epidemiology of Vertigo on Hospital Emergency].

    PubMed

    Roque Reis, Luis; Lameiras, Rita; Cavilhas, Pedro; Escada, Pedro

    2016-05-01

    Introdução: A vertigem é um dos motivos mais frequentes na procura de atendimento médico especializado na urgência. O objetivo deste estudo foi avaliar o peso real que as alterações do equilíbrio têm na urgência de Otorrinolaringologia, as suas características epidemiológicas e uma eventual sazonalidade por estações do ano. Usou-se uma amostra de doentes que utilizou o serviço de urgência desta especialidade de um hospital central universitário de Lisboa durante um período de quatro anos. Material e Métodos: O projeto foi concebido como um estudo epidemiológico descritivo de tipo populacional, retrospectivo, no período de 2010 a 2013. Incluiu uma população total de 40 173 atendimentos de doentes que nesse período utilizou o serviço de urgência de Otorrinolaringologia. As variáveis estudadas incluíram a idade, género, número anual de casos (total e percentual), data da crise de vertigem, distribuição sazonal por estações do ano e proporção anual de casos internados. Resultados: Um total de 4 347 doentes (10,8%) procurou atendimento médico devido a vertigem ou alterações do equilíbrio ao longo dos quatro anos do estudo. Verificou-se um aumento anual do número de casos entre 7,6% (em 2010) a 17% (em 2013). As mulheres foram mais frequentemente afetadas (68,3%) e as crises ocorreram mais frequentemente em indivíduos entre os 60 e 79 anos de idade (40%). Os casos distribuíram-se de forma heterogénea entre as estações do ano, havendo mais episódios de vertigem no verão e no outono e com uma tendência crescente entre 2010 e 2013. O número de internamentos aumentou anualmente nesse período. Discussão: A epidemiologia da vertigem e dos distúrbios vestibulares específicos é ainda um campo a estudar, pois pode ter utilidade para a tomada de decisões clínicas e para o planeamento dos cuidados de saúde. Conclusão: O estudo revelou que os casos de vertigem na urgência aumentaram anualmente e são mais frequentes no sexo

  5. População estelar jovem em galáxias irregulares próximas

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Guimarães, T. A.; Telles, E.

    2003-08-01

    A análise do conteúdo estelar de galáxias próximas através da fotometria das suas estrelas resolvidas nos fornece informações importantes sobre a história de formação estelar e os processos de formação estelar em galáxias, que estão diretamente ligados ao estudo de evolução de galáxias. Quando nenhuma estrela puder ser resolvida o método mais poderoso consiste na análise do conteúdo estelar integrado das galáxias através das suas cores integradas em conjunto com informação espectroscópica que combinados com modelos de síntese evolutiva podem restringir simultaneamente a função de massa inicial (IMF) e a taxa de formação estelar (SFR). Nesse contexto, galáxias do tipo tardio, em particular, irregulares, são relevantes por várias razões: elas são objetos relativamente simples, com alta atividade de formação estelar e são objetos relativamente jovens (geralmente apresentam baixas abundâncias de elementos pesados e grande quantidade de gás). Apresentamos uma análise fotométrica de uma amostra de 7 galáxias do tipo tardio do universo local (NGC 2366, NGC 4395, NGC 4656, NGC 4214, NGC 4236, HOII, IC2574) que foram observadas com uma boa resolução espacial nas bandas B, V e R no telescópio Isaac Newton de 2.5m de Roque de los Muchachos nas Ilhas Canárias, Espanha. A distribuição espacial da população estelar jovem dessas galáxias é discutida sobre os pontos de vista dos íindices de cor integrados e dos seus diagramas cor magnitude, que comparados com isócronas teóricas, nos fornecem informações sobre os eventos de formação estelar, como por exemplo, indicações sobre a idade dos mesmos. As principais conclusões do trabalho podem ser resumidas em: (i) As galáxias irregulares possuem formação estelar recente (FE) espalhada ocorrendo nos últimos 50 Manos; (ii) A formação estelar em galáxias irregulares não é auto-propagante em escalas globais ( > 100 pc) ; (iii) A FE pode ser auto-regulável em escalas

  6. [Fiability Study of Diabetes Empowerment Scale: Short Version].

    PubMed

    Aveiro, Marcelo; Santiago, Luiz Miguel; Ferreira, Pedro Lopes; Simões, José Augusto

    2015-01-01

    Objetivo: Avaliar a correlação entre o valor obtido pelo instrumento de medição Diabetes Empowerment Scale - Short Form e o controlo da pessoa com diabetes medido pelo valor da hemoglobina glicada A1c.Material e Métodos: Estudo observacional transversal pela aplicação do Diabetes Empowerment Scale - Short Form a pessoas com diabetes de três Unidades de Saúde Familiar da Região Centro de Portugal após realização de teste e reteste (primeiro por escrito e, passados cinco minutos, oralmente) para determinação da coerência interna através do valor de alfa de Cronbach em 20 elementos que não foram depois estudados. A aplicação a pacientes diabéticos foi feita após a consulta de enfermagem e antes da entrada na consulta médica. Foi realizada estatística descritiva e inferencial apos verificação da normalidade dos dados.Resultados: Na primeira fase o valor de alfa de Cronbach de 0,90 a 1,00 relativamente aos oito itens da escala. Na aplicação escrita, a média de resultados foi de 3,78 ± 0,71 e na aplicação oral de 3,79 ± 0,65, p = 0,629. A amostra da segunda fase foi de 81 pessoas com diabetes, sendo 55,6% do sexo masculino. A idade média foi de 68,5 ± 1,1 anos com uma HbA1c média de 6,8 ± 0,2 e um tempo de evolução desde o diagnóstico de 9,2 ± 0,9 anos. A média da pontuação final da escala foi de 4,1 ± 0,8. Verificou-se uma correlação significativa entre a pontuação final e os níveis de Hba1C (ÏÅ = -0,114; p = 0,312).Conclusão: A Escala de Capacidade de Controlo da Diabetes âÄì Versão Breve revelou ser uma escala fiável para medir a capacitação em doentes diabéticos em Portugal. Confirmou-se a presença de uma correlação estatisticamente significativa entre o resultado obtido no final da escala e o valor de HbA1c.

  7. Datação do disco galáctico pela nucleocosmocronologia do [Th/Eu

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    del Peloso, E. F.; da Silva, L.; Arany-Prado, L. I.

    2003-08-01

    A nucleocosmocronologia emprega abundâncias de nuclídeos radioativos na datação de escalas de tempo astrofísicas. O 232Th é um nuclídeo radioativo com meia-vida de 14 Gano, enquanto que os dois isótopos mais abundantes do Eu são estáveis. O decaimento radioativo do Th modifica as razões de abundâncias [Th/Eu], fornecendo assim um meio de sondar a escala de formação das populações estelares. O objetivo deste trabalho é averiguar a possibilidade de estimar uma idade para o disco Galáctico através da nucleocosmocronologia do [Th/Eu] e investigar o nível de incerteza associado a esta estimativa. Para tanto, foi selecionada uma amostra de 20 estrelas anãs ou subgigantes de tipos espectrais F5 a G9, com -1,00 £ [Fe/H] £ +0,30 e idade(Gano) £ 13. As abundâncias de Th e Eu foram obtidas por síntese espectral das linhas localizadas em 4019,1 Å e 4129,7 Å, respectivamente. Uma comparação destas abundâncias com outros resultados da literatura demonstra que nossos valores apresentam dispersão 2 a 3 vezes menor que qualquer trabalho anterior. Os parâmetros atmosféricos e abundâncias dos elementos que contaminam as regiões espectrais destas linhas foram determinados por nós, de maneira totalmente autoconsistente, através de análise espectral detalhada diferencial em relação ao Sol. As idades estelares individuais foram determinadas através de curvas isócronas teóricas no diagrama HR. Foi realizada, então, uma análise cronológica dos gráficos [Th/Eu] vs. [Fe/H] e [Th/Eu] vs. idade. Os dados estelares foram comparados a curvas calculadas para 3 idades do disco Galáctico - 9, 12, 15 Gano - e foi estudada a sensibilidade à idade assumida no cálculo do ajuste destas curvas aos dados. Estas curvas foram calculadas com base num modelo analítico de evolução química da Galáxia que leva em consideração a formação de refugos, que são compostos pelos remanescentes da evolução estelar, pelos resíduos da formação de estrelas de

  8. Attachment Strategies and Neuroendocrine Biomarkers in Obese Children.

    PubMed

    Pinto, Inês; Wilkinson, Simon; Virella, Daniel; Alves, Marta; Calhau, Conceição; Coelho, Rui

    2016-05-01

    Introdução: A qualidade da relação pais-filho influencia o desenvolvimento do sistema fisiológico de regulação do stress da criança. Exploraram-se eventuais associações entre estratégias de vinculação e o cortisol e a hormona estimulante da tiróide, respectivamente como possíveis mediador e variável interveniente na relação mãe-filho, na criança obesa. Material e Métodos: Foi recrutada na Consulta de Obesidade uma amostra de conveniência de 83 crianças obesas com 10,9 (1,8) anos de idade (46 rapazes). A obesidade foi definida pelo percentil do índice de massa corporal para idade e género e os biomarcadores neuroendócrinos foram medidos pelos métodos de rotina. As estratégias de vinculação foram avaliadas através dos questionários (IACA) para pais e crianças. O funcionamento familiar foi classificado através do preenchimento pelos pais do FACES-III. Foram analisados modelos multivariáveis de regressão linear. Resultados: As estratégias de vinculação insegura do tipo evitante (tipo A) apresentaram uma associação significativa positiva com os níveis de hormona estimulante da tiróide e negativa com os níveis de cortisol (R2 = 0,352). As estratégias de vinculação segura (tipo B) associaram-se positivamente ao hipotiroidismo e ao percentil de índice de massa corporal, ambas com significado estatístico (R2 = 0,541). As estratégias de vinculação insegura apresentaram alguma evidência de associação positiva com a hormona estimulante da tiróide (R2 = 0,250). Discussão: Estes achados sugerem a existência de factores comuns na regulação dos eixos hipotálamo-hipófise-adrenal e hipotálamo-hipófise-tiróide. Os processos envolvidos no desenvolvimento das estratégias de vinculação do tipo A parecem associar-se aos mecanismos regulatórios do eixo HPA. Conclusão: Diferentes estratégias de vinculação estão associadas a diferentes padrões metabólicos em crianças obesas. Desconhece-se qual a sua contribui

  9. Emissão de hidrogênio molecular e [FeII] em núcleos Seyfert

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Rodríguez-Ardila, A.; Pastoriza, M. G.; Viegas, S.

    2003-08-01

    Um dos problemas fundamentais em núcleos ativos de galáxias (AGN) é determinar os mecanismos de excitação dominantes do gás emissor de linhas estreitas, seja este excitado por mecanismos não-estelares (fotoionização por uma fonte central ou choques produzidos por um jato rádio no gás circumnuclear) ou estelares (fotoionização por estrelas OB ou choques originados por um remanescente de supernova em expansão). Essa ambiguedade se faz mais evidente ao intepretar o espectro de espécies tais como H2 e [FeII]. Na primeira, fluorescência UV, processos térmicos (choques e/ou aquecimento por fótons) ou illuminação por raios-x, podem ser responsáveis pelo espectro observado enquanto que na segunda, os dois últimos mechanismos seriam relevantes. Neste trabalho, utilizando espectroscópia JHK de média resolução para uma amostra de AGN encontramos que o H2 observado é gerado principalmente por processos térmicos associados à presença de episódios de formação estelar circumnuclear. No entanto, em galáxias tais como NGC4151 as observações mostram que o hidrogênio molecular origina-se, principalmente, da interação entre o jato radio e o gás da NLR. Esses resultados baseiam-se nos valores das razões de linhas H2 2.24/2.12 mm e H2 2.03/2.22 mm. H2 2.24/2.12 separa claramente processos não-térmicos dos térmicos enquanto H2 2.03/2.22 serve como indicador de temperatura da componente térmica, e portanto, discrimina entre choques e associações OB. Já para o [FeII], as observações são compatíveis com excitação produzida diretamente pela fonte central ou choques associados com o jato rádio. A comparação da largura dos perfis de linhas observados permite concluir que não há correlação entre a emissão de H2 e [FeII]. Em praticamente todos os casos analisados, os perfis das linhas de H2 são não-resolvidos, enquanto que os perfis de [FeII] indicam, em alguns casos, velocidades de até 600 km/s.

  10. Classificação geométrica de galáxias bianeladas através do metódo CART (Classification And Regression Trees)

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Ormeño, M. I.; Faúndez-Abans, M.; Cavada, G.

    2003-08-01

    A importância deste trabalho deve-se à seleção de objetos ainda não tratados particularmente como uma família e ao emprego de procedimento estatístico robusto que não precisa de pressupostos ou condições de contorno. Contribui, assim, ao melhor entendimento do cenário das Galáxias Aneladas do diagrama de Hubble via classificação e estudo de subclasses. Selecionaram-se 100 galáxias possuidoras de dois anéis do Catalog of Southern Ringed Galaxies compilado por Ronald Buta, de modo a construir uma amostra completa em termos de conhecimento dos semi-eixos dos anéis interno e externo projetados no plano do céu. Visando uma possível classificação destas galáxias aneladas normais em famílias de acordo com as características geométricas dos anéis, empregou-se primeiramente a Análise de Aglomerados (ferramenta de classificação: medições de semelhança em um espaço bidimensional) para explorar a possível existência de famílias. As variáveis analisadas foram: os diâmetros interiores menores d(I) e maiores D(I), os diâmetros exteriores menores d(E) e maiores D(E), e os ângulos de inclinação dos semi-eixos maiores interiores q(I) e exteriores q(E) dos anéis. Como metodologia de discriminação, empregou-se a construção de Árvores de Classificação. As árvores de classificação constituem um método de discriminação alternativo aos modelos clássicos, tais como a Análise Discriminante e a Regressão Logística, onde uma base de dados é dividida em partições (subgrupos) da árvore por ação de um predictor (variável específica). Os pacotes estatísticos utilizados para o processamento da informação foram: SAS versão 8.0 (Statistical Analisys System) e CART versão 3.6.3. Esta análise estatística sugere a existência de três possíveis famílias de galáxias bianeladas, com base apenas na geometria dos anéis. Como forma exploratória inicial deste resultado, a construção de um diagrama BT (magnitude total) versus o

  11. Populações estelares do bojo galáctico

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Escudero, A. V.; Costa, R. D. D.; Maciel, W. J.

    2003-08-01

    Os estudos mais recentes do bojo galáctico têm enfocado essencialmente as abundâncias químicas de elementos pesados, como o ferro, obtidos a partir das estrelas nas regiões centrais da galáxia. Elementos leves, como hélio, nitrogênio, oxigênio e argônio ainda são pouco estudados nestas regiões, devido à difícil determinação de suas abundâncias a partir de estrelas. Nestas condições as nebulosas planetárias desempenham um importante papel, pois permitem a determinação de abundâncias destes elementos usando técnicas de espectroscopia nebular. Neste trabalho, reportamos a análise das abundâncias químicas de uma nova amostra de nebulosas planetárias do bojo, bem como os resultados preliminares de um código numérico destinado a modelar a evolução química desta região. Usamos como vínculos observacionais os resultados obtidos das nebulosas planetárias, bem como de abundâncias estelares da região do bojo, obtidas da literatura. A partir deste modelo da evolução química e dos vínculos observacionais foi possível fazer um diagnóstico mais preciso das populações que constituem o bojo galáctico. O estudo destas populações que compõem a região central de nossa galáxia é de extrema importância para o maior entendimento da evolução química e dinâmica da galáxia como um todo. Por isto, verificamos a importância dos modelos de formação simples e mista utilizados para explicar características da população da região central da galáxia. Algumas destas características são: uma grande dispersão nos valores das abundâncias químicas e um grande espalhamento nas correlações entre as abundâcias de nitrogênio e oxigênio. Estas peculiaridades são dificilmente reproduzidas por modelos de formação simples, e portanto são importantes indícios da validade dos modelos de formação mista, tais como um rápido colapso do bojo seguido de uma evolução secular. (FAPESP, CNPq)

  12. Expectation as a factor of influence on the success of use of hearing aids in elderly individuals.

    PubMed

    Schuster, Larissa Cristina; Costa, Maristela Julio; Menegotto, Isabela Hoffmeister

    2012-04-01

    Introdução: Próteses auditivas destacam-se em função das tecnologias que as tornam cada vez menores, mais potentes e eficientes. O marketing pode gerar expectativas irreais quanto aos resultados com o uso de amplificação, principalmente em indivíduos inexperientes.Objetivo: Verificar a relação entre expectativas e sucesso do processo de seleção e adaptação de próteses auditivas em idosos.Método: Estudo clínico e experimental, 16 indivíduos idosos, inexperientes com o uso de amplificação, foram avaliados 15 dias antes e após a seleção e adaptação de próteses auditivas. Utilizou-se “Questionário para avaliação das expectativas do indivíduo adulto/idoso, novo usuário de próteses auditivas”, Hearing Handicap Inventory for the Elderly/Screening Version, para avaliação da percepção da restrição de participação e o Questionário Internacional - Aparelho de Amplificação Sonora Individual (QI-AASI), para verificar o benefício subjetivo com o uso das próteses auditivas. Determinou-se o Índice Percentual de Reconhecimento de Sentenças no Silêncio (IPRSS), por meio do teste Listas de Sentenças em Português para verificar o benefício objetivo da adaptação. Os dados foram analisados por meio de teste não-paramétrico, com nível de significância de 5%.Resultados: Toda a amostra apresentou expectativas positivas. Subjetivamente verificou-se benefício pela diminuição da percepção da restrição de participação e pela avaliação positiva da adaptação, evidenciada pelo QI-AASI. Objetivamente a melhora do IPRSS com o uso de próteses auditivas também evidenciou beneficio.Conclusão: a expectativa quanto aos resultados com o uso de amplificação, foi fator de influência negativa no sucesso do processo de seleção e adaptação de próteses auditivas, no âmbito subjetivo.

  13. Cystatin C: A Promising Marker of Renal Function in Patients with Systemic Lupus Erythematosus?

    PubMed

    Peixoto, Lígia; Aguiar, Patrício; de Bragança, Raquel; Martins, Joana Rosa; Acabado, Alba Janeiro; Ducla-Sores, José Luís

    2015-01-01

    , comparativamente à creatinina. A cistatina C revelou-se, neste estudo, um marcador de função renal promissor nos doentes com lupus, principalmente para taxas de filtrado glomerular mais baixas. A correlação da cistatina C com a idade para ser um factor confundente, na medida em que existe um declínio fisiológico da taxa de filtração glomerular com o envelhecimento.Conclusão: A cistatina C foi potencialmente superior à creatinina e nesta amostra a cistatina C pareceu detectar mais precocemente do que a creatinina alterações na taxa de filtrado glomerular, podendo ser um melhor método de rastreio de doença renal crónica no lúpus eritematoso sistémico.

  14. Composição química, evolução e cinemática de estrelas de tipo solar

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Silva, R. O.; Porto de Mello, G. F.; Milone, A. C.

    2003-08-01

    A composição química das estrelas de tipo solar é um diagnóstico extremamente valioso da evolução química do disco da Galáxia. Existe alguma evidência de que tal evolução tem sido heterogênea no espaço e ao longo do tempo e que a composição química do Sol pode não ser um padrão representativo de abundâncias. Neste trabalho, foram obtidas as abundâncias dos elementos químicos C, N, Na, Mg, Si, Ca, Sc, Ti, V, Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, Sr, Y, Zr, Ba, La, Ce, Nd e Sm em uma amostra de estrelas de tipo solar na vizinhança solar (distâncias £ 25 pc). A técnica empregada foi a análise espectroscópica diferencial em relação ao Sol, baseando-se em dados de alta resolução (R ~ 46.000) e alta razão sinal/ruído (S/R > 300), obtidos com o espectrógrafo échelle de bancada do telescópio de 1,5 m do CTIO. Adicionalmente, abundâncias de C e N foram obtidas através de síntese de bandas moleculares dos Sistemas Eletrônicos Swan do C2 e Vermelho do CN utilizando-se um programa de síntese espectral. Os parâmetros atmosféricos foram estabelecidos usando cores fotométricas, o equilíbrio de excitação e ionização de linhas do Fe e a análise da temperatura e da luminosidade estelares no diagrama HR. Os resultados de abundâncias químicas obtidos proporcionam uma melhor compreensão da relação das abundâncias conhecidas para o Sol com a das estrelas anãs de tipo G da população local, uma vez que as razões de abundâncias de diversos elementos (em relação ao ferro) obtidas para estrelas de metalicidade semelhante à solar diferem daquelas obtidas para o Sol. Tais resultados também contribuem para um melhor entendimento do processo de evolução química da vizinhança solar e do enriquecimento nucleossintético do disco galáctico.

  15. [Restraints to anticoagulation prescription in atrial fibrillation and attitude towards the new oral anticoagulants].

    PubMed

    Pereira-Da-Silva, Tiago; Souto Moura, Teresa; Azevedo, Luísa; Sá Pereira, Margarida; Virella, Daniel; Alves, Marta; Borges, Luís

    2013-01-01

    Introdução e Objetivos: Avaliar a taxa de prescrição de anticoagulantes orais na fibrilhação auricular, os fatores associados à não prescrição, os motivos referidos pelos clínicos para não prescrição de anticoagulantes incluindo os de nova geração e realizar estudo evolutivo a médio prazo. Material e Métodos: Estudo prospetivo sobre casos consecutivos de doentes com fibrilhação auricular com alta hospitalar. Registaram- se os scores CHA2DS2VASc e HASBLED, comorbilidades associadas e a medicação prévia e à data de alta. Na alta hospitalar, o médico assistente indicou em questionário o motivo de não prescrição de anticoagulantes orais e dos novos anticoagulantes orais. Exclusão: contra-indicação absoluta para anticoagulação, CHA2DS2VASc ≤ 1 e doença valvular. Os doentes foram reavaliados um ano após o recrutamento do primeiro doente. Resultados: Identificaram-se 103 candidatos a anticoagulação oral (79,6 ± 8,0 anos; CHA2DS2VASc 5,8 ± 1,4; HASBLED 2,6 ± 1,0; HASBLED ≥ 3 em 55,3%); os anticoagulantes foram prescritos em 34,0%. Fatores associados à não prescrição por ordem decrescente de relevância: uso prévio de antiagregantes, doente acamado e/ou demente, ausência de insuficiência cardíaca e número de fatores de risco hemorrágico. Razões invocadas para não prescrição por ordem decrescente de frequência: risco hemorrágico elevado, pequeno benefício, incapacidade de seguir o esquema terapêutico e dificuldade na monitorização da razão normalizada internacional (INR). Os novos anticoagulantes não foram prescritos e as razões invocadas foram, por ordem decrescente de frequência: informação insuficiente sobre estes fármacos, risco hemorrágico elevado, custo elevado e pequeno benefício. Aos 8,2 ± 2,5 meses de estudo evolutivo 33,3% dos doentes encontravam-se sob anticoagulação sem que os novos anticoagulantes tivessem sido prescritos. Conclusões: Nesta amostra, a taxa de prescrição de

  16. Difficulties of First Years Elementary School Teachers with the Teaching of Astronomy. (Breton Title: Dificuldades de Professores dos Anos Iniciais do Ensino Fundamental em Relação ao Ensino da Astronomia. ) Dificultades de LOS Profesores de los Primeros Años de la Escuela Primaria en Relación a la Enseñanza de la Astronomía

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Langhi, Rodolfo; Nardi, Roberto

    2005-12-01

    programa de formação continuada neste tema. O estudo se justifica mediante o fato de que planejamentos de cursos como estes só se adequarão à realidade do professor (e do aluno) se houver uma investigação antecipada sobre o que os docentes precisam saber e saber fazer a respeito da Astronomia, o que se concretizou em nosso caso pela interpretação dos discursos de uma amostra de professores coletados através de entrevistas semi-estruturadas, utilizando para interpretação os princípios e métodos da análise do discurso em sua linha francesa. Os resultados da pesquisa indicaram dificuldades de ordem pessoal, metodológica, de formação, de infra-estrutura e outras relacionadas às fontes de informações para docentes. Este artículo que relata las dificultades de los profesores en relación a la enseñanza da laAstronomía es parte de un estudio preliminar para la implantación dela Astrnomía enla formación de profesores de ls primeros años del ciclo primario.El estudio considera las concepciones alternativas de alumnos y profesores respecto a los fenómenos astronómicos, los errores conceptuales en los libros didácticos y las sugerencias de contenidos de Astronomía que constan en los Parámetros Curriculares Nacionales del Brasil. Caracterizar las dificultades de los profesores constituye la cuestión central de este texto, apuntando para el objetivo de contribuir para un futuro programa de educación contínua en este tema. El estudio se justifica mediante el hecho que la planificación de cursos de este tipo solo se adecuarán a la realidade del profesor (y del alumno) si existe una investigación anterior a respecto de lo que los docentes precisan saber y saber realizar en Astronomía, lo cual se concretó en nuestro caso por medio de la interpretación de los discursos de una muestra de profesores obtenidos através de entrevistas semiestructuradas, utilizand para esta interpretación los principios y métodos de análisis del discurso en su l

  17. Difficulties of First Years Elementary School Teachers with the Teaching of Astronomy. (Breton Title: Dificuldades de Professores dos Anos Iniciais do Ensino Fundamental em Relação ao Ensino da Astronomia. ) Dificultades de LOS Profesores de los Primeros Años de la Escuela Primaria en Relación a la Enseñanza de la Astronomía

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Langhi, Rodolfo; Nardi, Roberto

    2005-12-01

    programa de formação continuada neste tema. O estudo se justifica mediante o fato de que planejamentos de cursos como estes só se adequarão à realidade do professor (e do aluno) se houver uma investigação antecipada sobre o que os docentes precisam saber e saber fazer a respeito da Astronomia, o que se concretizou em nosso caso pela interpretação dos discursos de uma amostra de professores coletados através de entrevistas semi-estruturadas, utilizando para interpretação os princípios e métodos da análise do discurso em sua linha francesa. Os resultados da pesquisa indicaram dificuldades de ordem pessoal, metodológica, de formação, de infra-estrutura e outras relacionadas às fontes de informações para docentes. Este artículo que relata las dificultades de los profesores en relación a la enseñanza da laAstronomía es parte de un estudio preliminar para la implantación dela Astrnomía enla formación de profesores de ls primeros años del ciclo primario.El estudio considera las concepciones alternativas de alumnos y profesores respecto a los fenómenos astronómicos, los errores conceptuales en los libros didácticos y las sugerencias de contenidos de Astronomía que constan en los Parámetros Curriculares Nacionales del Brasil. Caracterizar las dificultades de los profesores constituye la cuestión central de este texto, apuntando para el objetivo de contribuir para un futuro programa de educación contínua en este tema. El estudio se justifica mediante el hecho que la planificación de cursos de este tipo solo se adecuarán a la realidade del profesor (y del alumno) si existe una investigación anterior a respecto de lo que los docentes precisan saber y saber realizar en Astronomía, lo cual se concretó en nuestro caso por medio de la interpretación de los discursos de una muestra de profesores obtenidos através de entrevistas semiestructuradas, utilizand para esta interpretación los principios y métodos de análisis del discurso en su l

  18. Mixed-Methods Study that Examines Nine Science Teachers' Perceptions of Slooh Robotic Telescope for Teaching Astronomy. (Breton Title: Métodos Mistos de Estudo que Examinam a Percepção de Nove Professores de Ciências sobre o Telescópio Robótico Slooh Para Ensino de Astronomia.) Métodos Mixtos de Estudio que Examinan la Percepcion de Nueve Profesores de Ciencias sobre EL Telescopio Robótico Slooh Para la Enseñanza de la Astronomía

    NASA Astrophysics Data System (ADS)

    Gershun, Daniel C.; Slater, Timothy F.; Berryhill, Katie J.

    2014-07-01

    Although previous studies show that robotic telescopes have the potential to enhance student learning, there is comparatively little research that focuses on teacher perceptions of this technology. This study investigates: "what is the academic merit of using SLOOH robotic telescopes to teach astronomy as perceived by science teachers?" Our sample consists of nine science teachers of students aged 13-18 years. Pre- and post-tests, interviews, and surveys were collected during two weeks of a summer online course about robotic telescopes. While pre and post-tests do not reveal a statistically significant gain in astronomy content knowledge, analysis of qualitative data reveals five themes which describe the most important aspects of using SLOOH according to participants: "Images," "Interface," "Classroom Application," "Instructor Impact," and "Logistical Issues." Analysis of these themes suggests that SLOOH can provide an interactive and social learning environment with capabilities to incorporate crossdisciplinary themes. Embora estudos anteriores mostram que os telescópios robóticos têm o potencial de melhorar a aprendizagem dos alunos, há relativamente pouca investigação focada nas percepções de professores a respeito desta tecnologia. Este estudo investiga: "qual é o mérito acadêmico da utilização de telescópios robóticos Slooh para ensinar astronomia, tal como percebido pelos professores de ciências?" Nossa amostra é composta por nove professores de ciências de estudantes com idades entre 13-18 anos pré e pós-testes, entrevistas, e levantamentos foram coletados durante duas semanas de um curso on-line de verão sobre telescópios robóticos. Enquanto os testes pré e pós não revelaram um ganho estatisticamente significativo no conhecimento do conteúdo astronomia, a análise de dados qualitativos revela cinco temas que descrevem os aspectos mais importantes da utilização Slooh de acordo aos participantes: "Imagens", "Interface", "Aplica